Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ПРОФИЛИ<.>)
Общее количество найденных документов : 10
Показаны документы с 1 по 10
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.03-04Б2.221

   
    Comparison of global transcription responses allows identification of Vibrio cholerae genes differentially expressed following infection [Text] / Saoumita Das [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 2000. - Vol. 190, N 1. - P87-91 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Сравнение общих транскрипционных ответов позволяет идентифицировать гены Vibrio cholerae, отличающиеся по экспрессии инфекции
Аннотация: Сравнение общих транскрипционных профилей Vibrio cholerae, растущих in vitro и in vivo, обнаружило, что 20% генома репрессировано и около 5% индуцировалось in vivo. Гибридизация клонированных генов выявила индукцию in vivo вирулентности ctx, toxR, toxT и tcpA. Разделение двух индуцированных космид идентифицировало другой набор трех генов, гомологичных cheY1, участвующему в подвижности и хемотаксисе, pnuC, кодирующему основной компонент никотинамидмононуклеотид транспортной системы и icmF, относящийся к кассете, участвующей в размножении внутри клеток хозяина. Сделан вывод, что анализ общих транскрипционных профилей может быть мощным инструментом для идентификации различно экспрессируемых транскриптов in vivo. Индия, Biophysics Division, Indian Inst. Of Chemical Biology? 4, Raja S. C. Mullick Road, Jadavpur, Calcutta 700 032
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ CTX
TOX R
TOX T
TCP A
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ПРОФИЛИ
КЛОНИРОВАНИЕ
ГИБРИДИЗАЦИЯ
АНАЛИЗ ПРОФИЛЕЙ ТРАНСКРИПЦИИ
VIBRIO CHOLERAE (BACT)
ТРАНСКРИПТЫ РАЗЛИЧНОЭКСПРЕССИРУЕМЫЕ

Доп.точки доступа:
Das, Saoumita; Chakrabortty, Amit; Banerjee, Rajat; Roychoudhury, Susanta; Chaudhuri, Keya

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 08.08-04Б4.126

   
    In vivo transcript profiling of Candida albicans identifies a gene essential for interepithelial dissemination [Text] / Katherina Zakikhany [et al.] // Cell. Microbiol. - 2007. - Vol. 9, N 12. - P2938-2954 . - ISSN 1462-5814
Перевод заглавия: Транскрипционное профилирование in vivo Candida albicans идентифицировало гены, важные для межэпителиальной диссеминации
Аннотация: Охарактеризовали клеточные и молекулярные механизмы взаимодействия между эпителием и патогенным грибом Candida albicans, используя реконструированный эпителий ротовой полости человека (RHE). Наблюдали, как образование гиф облегчает эпителиальную инвазию за счет как активного, так и пассивного процессов. Сравнили результаты транскрипционного профилирования на инфекции RHE и образцах от 11 пациентов с псевдомембранным кандидозом, чтобы идентифицировать гены, связанные с развитием болезни in vivo. Профили экспрессии отражали морфологическое переключение и адаптивный ответ на нейтральный pH, неглюкозные источники углерода и нитрозный стресс. Идентифицировали несколько новых генов, связанных с инфекцией. Один из них, названный EED1, важен для поддержания элонгации гиф на эпителиальной ткани. Мутанты с делецией этого гена могут пролиферировать как дрожжи или псевдогифы, но остаются внутри клетки, как в ловушке. Полученные результаты привели к заключению, что адаптивный ответ и морфология C. albicans играют специфическую роль во взаимодействиях патоген-хозяин во время инфекции. Германия, Division Mycol., Robert Koch Inst., Berlin
ГРНТИ  
34.27.29
ВИНИТИ 341.27.29.09
Рубрики: БОЛЕЗНИ
ПСЕВДОМЕМБРАННЫЙ КАНДИДОЗ
ВОЗБУДИТЕЛЬ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ГЕНЫ
ГЕНЫ МЕЖЭПИТЕЛИАЛЬНОЙ ДИССЕМИЛЯЦИИ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ПРОФИЛИ
CANDIDA ALBICANS (FUNGI)

Доп.точки доступа:
Zakikhany, Katherina; Naglik, Julian R.; Schmidt-Westhausen, Andrea; Holland, Gudrun; Schaller, Martin; Hube, Bernhard

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.02-04Б2.174

   
    New target genes controlled by the Bradyrhizobium japonicum two-component regulatory system RegSR [Text] / Andrea Lindemann [et al.] // J. Bacteriol. - 2007. - Vol. 189, N 24. - P8928-8943 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Новые гены-мишени, контролируемые двухкомпонентной регуляторной системой RegSR Bradyrhizobium japonicum
Аннотация: В Bradyrhizobium japonicum, факультативном симбионте соевых бобов, RegSR-подобные белки активируют транскрипцию регуляторного гена фиксации азота nifA, образуя затем каскад RegSR-NifA, являющийся частью сложной регуляторной сети генов, отвечающей на изменение концентрации кислорода. Использовали транскриптомное профилирование для оценки регуляторных границ RegSR. Сравнительный анализ клеток дикого типа и мутантов 'ДЕЛЬТА'regR, растущих при кислородных и микрокислородных условиях, показал, что экспрессия почти 250 генов зависит от RegR в Bradyrhizobium japonicum. Сравнение бактероидов дикого типа и мутантных 'ДЕЛЬТА'regR выявило изменение экспрессии почти 1200 генов в молодых и зрелых бактероидах. Многие из этих генов кодируют функции, связанные с симбиозом и фиксацией азота. Продемонстрировали RegR-опосредованный контроль в промоторных районах некоторых генов-мишеней и выявили 6 новых промоторов-мишеней RegR. Швейцария, Inst. of Microbiol., ETH, Zurich. Библ. 58
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: БОБОВО-РИЗОБИАЛЬНЫЙ СИМБИОЗ
ФИКСАЦИЯ АЗОТА
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
ДВУХКОМПОНЕНТНАЯ СИСТЕМА REGSR
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ РЕГУЛЯЦИИ КОНЦЕНТРАЦИИ КИСЛОРОДА
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ПРОФИЛИ
МОЛОДЫЕ БАКТЕРОИДЫ
ЗРЕЛЫЕ БАКТЕРОИДЫ
BRADYRHIZOBIUM JAPONICUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Lindemann, Andrea; Moser, Annina; Pessi, Gabriella; Hauser, Felix; Friberg, Markus; Hennecke, Hauke; Fischer, Hans-Martin

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 09.07-04К1.47

   
    Cutting edge: Tissue resident-memory CTL down-regulate cytolytic molecule expression following virus clearance [Text] / Justine D. Mintern [et al.] // J. Immunol. - 2007. - Vol. 179, N 11. - P7220-7224 . - ISSN 0022-1767
Перевод заглавия: В цитотоксических Т-клетках памяти, оседлых в тканях, снижается экспрессия цитолитических молекул после выведения вируса
Аннотация: Определили транскрипционные профили цитолитических белков в индивидуальных цитотоксических Т-лимфоцитах (ЦТЛ) мышей, отвечающих на вирус гриппа А (ВГА) и вирус простого герпеса типа 1 (ВПГ1). Во время острой инфекции ЦТЛ, специфичные к ВГА, которые находятся в селезенке и дыхательных путях, имеют высокий литический профиль. Подобным эффектом обладают ЦТЛ, специфичные к ВПГ1, находящиеся в селезенке, коже и корешках спинных ганглиев. Однако ЦТЛ памяти, локализованные в различных тканях, имеют низкую транскрипцию цитолитических молекул. Исключение составляют ЦТЛ памяти, локализованные в ганглиях. Австралия, Dep. of Microbiology and Immunology, University of Melbourne, Parkville, Victoria. Библ. 24
ГРНТИ  
34.43.29
ВИНИТИ 341.43.29.11
Рубрики: ЛИМФОЦИТЫ Т ЦИТОТОКСИЧЕСКИЕ
ЦИТОЛИТИЧЕСКИЕ БЕЛКИ
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ПРОФИЛИ
ВИРУСЫ
МЫШИ

Доп.точки доступа:
Mintern, Justine D.; Guillonneau, Carole; Carbone, Francis R.; Doherty, Peter C.; Turner, Stephen J.

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.08-04Б2.173

   
    aglF, aglG and aglI, novel members of a gene island involved in the N-glycosylation of the Haloferax volcanii S-layer glycoprotein [Text] / Sophie Yurist-Doutsch [et al.] // Mol. Microbiol. - 2008. - Vol. 69, N 5. - P1234-1245 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: aglF, aglG и aglI - новые члены генного острова, участвующего в N-гликозилировании гликопротеина S-слоя Haloferax volcanii
Аннотация: Белки всех трех отделов могут подвергаться N-гликозилированию. Для галофильного археона Haloferax volcanii продемонстрировали участие трех дополнительных генных продуктов в биосинтезе пентасахарида, декорирующего гликопротеин S-слоя. Установили, что гены, кодирующие AglF, AglG и AglI, находятся выше гена, кодирующего трансферазу олигосахаридов AglB. Показали, что AglF и AglI находятся в позиции три пентасахарида, а AglG - в позиции два. Анализ транскрипционных профилей привел к заключению, что только гены aglF и aglI имеют общий промотор, а транскрипция четырех генов aglF, aglB, aglG и aglI скоординирована при различных условиях роста Haloferax volcanii, что свидетельствует об адаптивной роли N-гликозилирования, как одного из видов посттрансляционной модификации белков в H. volcanii. Израиль, Dep. of Life Sciences, Ben Gurion Univ., Beersheva 84105. Библ. 29
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.09
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН AGLF
ГЕН ALGG
ГЕН AGLI
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ПРОФИЛИ
ГЛИКОПРОТЕИНЫ
ГЛИКОПРОТЕИНЫ S-СЛОЯ
БЕЛОК
БЕЛОК AGLF
БЕЛОК AGLI
БЕЛОК AGLG
ПОЗИЦИИ
ПЕНТАСАХАРИД
N-ГЛИКОЗИЛИРОВАНИЕ
ПОСТТРАНСЛЯЦИОННАЯ МОДИФИКАЦИЯ
HALOFERAX VOLCANII (BACT.)

Доп.точки доступа:
Yurist-Doutsch, Sophie; Abu-Qarn, Mehtap; Battaglia, Francesca; Morris, Howard R.; Hitchen, Paul G.; Dell, Anne; Eichler, Jerry

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 10.04-04И4.59

   
    Time-dependent transcriptional profiles of genes of the hypothalamic-pituitary-gonadal axis in medaka (Oryzias latipes) exposed to fadrozole an 17'бета'-trenbolone [Text] / Xiaowei Zhang [et al.] // Environ. Toxicol. and Chem. - 2008. - Vol. 27, N 12. - P2504-2511 . - ISSN 0730-7268
Перевод заглавия: Зависимые от времени транскрипционные профили генов оси гипоталамус-гипофиз-гонады у медаки, Oryzias latipes, под воздействием фадрозола и 17'бета'-тренболона
Аннотация: Дана оценка влияния ингибитора ароматазы фадрозола (ФАД) и анаболического андрогена 17'бета'-тренболона (ТРБ) на транскрипцию в оси гипоталамус-гипофиз-гонады (ГГГ) у медаки в зависимости от времени. Измеряли экспрессию 36 генов ГГГ с помощью ПЦР в реальном времени после 8 и 32 часов и 7 дней воздействия ФАД и ТРБ. Воздействие ФАД и ТРБ вызывало падение плодовитости медаки и даунрегуляцию транскрипции генов вителлогенина и хориогенина в печени 'VENUS'. Под действием ФАД через 8 часов происходило 8- и 71-кратная даунрегуляция экспрессии рецептора эстрогена 'альфа' и хориогенина L, соответственно, в печени 'VENUS'. ТРБ вызывал сходные изменения в этих генах. ФАД и ТРБ вызывали быструю даунрегуляцию рецептора лютеинезирующего гормона и рецептора липопротеинов низкой плотности в семенниках для компенсации избытка андрогенов. США, Dep. of Zool., Michigan State Univ., East Lansing, Michigan 48824. howard50003250@yahoo.com. Ил. 2. Табл. 2. Библ. 20
ГРНТИ  
34.33.33
ВИНИТИ 341.33.33.10.09
Рубрики: ГЕНЫ
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ПРОФИЛИ
ГИПОТАЛАМУС-ГИПОФИЗ-ГОНАДЫ СИСТЕМА
МЕДАКА
ФАДРОЗОЛ
ТРЕНБОЛОН-17'БЕТА'

Доп.точки доступа:
Zhang, Xiaowei; Hecker, Markus; Park, June-Woo; Tompsett, Amber R.; Jones, Paul D.; Newsted, John; Au, Doris W.T.; Kong, Richard; Wu, Rudolf S.S.; Giesy, John P.

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI16) 10.09-04В3.82

   
    Transcript profiling during fiber development identifies pathways in secondary metabolism and cell wall structure that may contribute to cotton fiber quality [Text] / Yves Al-Ghazi [et al.] // Plant and Cell Physiol. - 2009. - Vol. 50, N 7. - P1364-1381 . - ISSN 0032-0781
Перевод заглавия: Транскриптные профили при развитии волокон, идентифицирующие пути вторичного метаболизма и структуру клеточной стенки как возможный вклад в качество волокна хлопчатника
Аннотация: Значительная доля генов Gossypium hirsutum и G. barbadense проявляется при удлинении волокон и последующем утолщении вторичной клеточной стенки. Между этими 2 фазами происходит главный сдвиг в обилии транскриптов генной регуляции, организации клетки и метаболизма. Многие гены, экспрессирующие в волокнах, сходны с наблюдаемыми у других продуцирующих волокно растений, указывая на консервативный механизм удлинения клетки и утолщения стенки и разных родов растений. При удлинении отмечены существенные межвидовые различия вторичного метаболизма и пектинового синтеза, но генные профили стадии утолщения почти идентичны у 2 видов, т.е, все показатели итогового качества волокна определяются на ранних стадиях его развития. Австралия, CSIRO Plant Industry, Canberra, ACT 2601. Библ. 53
ГРНТИ  
34.31.27
ВИНИТИ 341.31.27.19
Рубрики: РАЗВИТИЕ
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ПРОФИЛИ
ВОЛОКНО
GOSSYPIUM SPP.
ГЕНЫ
КЛЕТОЧНЫЕ СТЕНКИ

Доп.точки доступа:
Al-Ghazi, Yves; Bourot, Stephane; Arioli, Tony; Dennis, Elizabeth S.; Llewellyn, Danny J.

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.11-04Б2.194

   
    A comprehensive proteomics and transcriptomics analysis of Bacillus subtilis salt stress adaptation [Text] / Hannes Hahne [et al.] // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 3. - P870-882 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Комплексная протеомика и транскрипционный анализ адаптации к солевому стрессу у Bacillus subtilis
Аннотация: С помощью микрочипов к полноразмерному геному, метаболическому мечению и тонких методов протеомики проведен детальный и поэтапный анализ формирования ответа на резкий и жесткий солевой стресс у Bacilus subtilis. Получены количественные данные для транскрипционных профилей 3961 мРНК, 590 профилей экспрессии белков цитозоля и 383 профилей экспрессии белков мембранной фракции. Выявлена хорошо сокоординированная индукция экспрессии генов, вызванная изменением осмотической силы среды, которая включает SigB, SigW, SigM и SigX регулоны. Также отмечено активация транскрипции большого числа генов, которые не принадлежат к этим регулонам. В целом, в условиях солевого стресса активируется экспрессия 500 генов B. subtilis. Германия, Inst. Mikrobiol., Ernst-Moritz-Arndt Univ., Greifswald. Библ. 68
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.23
Рубрики: СОЛЕВОЙ СТРЕСС
АДАПТАЦИЯ
ПРОТЕОМНЫЙ АНАЛИЗ
ГЕНЫ
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ПРОФИЛИ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Hahne, Hannes; Mader, Ulrike; Otto, Andreas; Bonn, Florian; Steil, Leif; Bremer, Erhard; Hecker, Michael; Becher, Dorte

9.
РЖ ВИНИТИ 68 (BI03) 11.05-04В4.292

   
    Transcript profiling during fiber development identifies pathways in secondary metabolism and cell wall structure that may contribute to cotton fiber quality [Text] / Yves Al-Ghazi [et al.] // Plant and Cell Physiol. - 2009. - Vol. 50, N 7. - P1364-1381 . - ISSN 0032-0781
Перевод заглавия: Транскриптные профили при развитии волокон, идентифицирующие пути вторичного метаболизма и структуру клеточной стенки как возможный вклад в качество волокна хлопчатника
Аннотация: Значительная доля генов Gossypium hirsutum и G. barbadense проявляется при удлинении волокон и последующем утолщении вторичной клеточной стенки. Между этими 2 фазами происходит главный сдвиг в обилии транскриптов генной регуляции, организации клетки и метаболизма. Многие гены, экспрессирующие в волокнах, сходны с наблюдаемыми у других продуцирующих волокно растений, указывая на консервативный механизм удлинения клетки и утолщения стенки и разных родов растений. При удлинении отмечены существенные межвидовые различия вторичного метаболизма и пектинового синтеза, но генные профили стадии утолщения почти идентичны у 2 видов, т.е, все показатели итогового качества волокна определяются на ранних стадиях его развития. Австралия, CSIRO Plant Industry, Canberra, ACT 2601. Библ. 53
ГРНТИ  
68.35.35
ВИНИТИ 681.35.35.15.17
Рубрики: РАЗВИТИЕ
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ПРОФИЛИ
ВОЛОКНО
GOSSYPIUM SPP.
ГЕНЫ
КЛЕТОЧНЫЕ СТЕНКИ

Доп.точки доступа:
Al-Ghazi, Yves; Bourot, Stephane; Arioli, Tony; Dennis, Elizabeth S.; Llewellyn, Danny J.

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 12.06-04Б2.166

   
    TAAPP: Tiling array analysis pipeline for prokaryotes [Text] / Ranjit Kumar [et al.] // Genomics, Proteomics and Bioinf. - 2011. - Vol. 9, N 1-2. - P56-62 . - ISSN 1672-0229
Перевод заглавия: ТААРР: tiling (крытие черепицей) - анализ информационного канала в прокариотах
Аннотация: Транскрипционный анализ высокой плотности (tiling array) обычно используют для исследования генома эукариот. Чтобы его применить для идентификации ранее неизвестных транскрипционных элементов, подобно малым РНК и антисмысловым РНК в прокариотах, существующие инструменты необходимо подстроить к архитектуре генома прокариот. В данной работе описали метод ТААРР на основе базы веб-данных, состоящий из двух модулей анализа данных. Модуль генерации транскриптов работает на нормализованных данных для генерирования транскрипционно активных районов (TAR). Аннотационный модуль картирует TAR для создания аннотации генома. Этот модуль далее делит по категориям транскрипционные профили в потенциально новой некодирующей РНК, антисмысловой РНК, и структурных оперонах. Веб-интерфейс доступен для академического использования по адресу: at http://lims.Isbi.mafes.msstste.edu/TAAPP-HTML. США, College of Veterinary Med., Mississipi State Univ., Mississippi 39762
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: МЕТОДЫ
МЕТОД ТААРР
ОСНОВА БАЗЫ ВЕБ-ДАННЫХ
МОДУЛЬ ГЕНЕРАЦИИ ТРАНСКРИПТОВ
ГЕНОМ
АННОТАЦИЯ
СОЗДАНИЕ
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ПРОФИЛИ
АНТИСМЫСЛОВАЯ РНК
СТРУКТУРНЫЕ ОПЕРОНЫ
ПРОКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
Kumar, Ranjit; Burgess, Shane C.; Lawrence, Mark L.; Nanduri, Bindu
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)