Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=САЙТ ВНУТРЕННЕГО ВХОЖДЕНИЯ РИБОСОМ<.>)
Общее количество найденных документов : 12
Показаны документы с 1 по 12
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.03-04Б1.56

    Klinck, Rosone.
    Structural characterization of three RNA hexanucleotide loops from the internal ribosoma entry site of polioviruse [Text] / Rosone Klinck, Tara Sprules, Kalle Gehring // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 11. - P2129-2137 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Структурная характеристика 3 гексануклеотидных петель РНК из сайта внутреннего вхождения рибосом вируса полиомиелита
Аннотация: Структурные характеристики 3 шпилек РНК, аналогичных петлям III и VI сайта внутреннего вхождения рибосом вируса полиомиелита, определены в растворе методом ЯМР. Полностью отождествлены резонансы протонов, P и C для 3 шпилек длиной 16 н. Петли 5' -AAUCCA, 5'-AAACCA и 5'-GAACCA существенны для трансляции вирусной РНК. Спектры NOESY для 3 олигомеров очень похожи, что указывает на общую 3-мерную структуру. Стебли шпилек являются дуплексами типа A с сахарным выступом C3'-эндо. В петлях обнаружены стэкинг-взаимодействия последовательных оснований, за исключением U8/A8-C9, что указывает на поворот фосфодиэфирного остова в этой точке. Только нуклеотид U8/A8 имеет сахарный выступ, заметно отличающийся от C3'-эндо. Последнее основание петли (A11) имеет необычный двугранный 'гамма'-угол gauche(-). Методом ограниченной молекулярной динамики рассчитан набор 10 структур для одной шпильки. Показано, что первые 3 основания петли экспонированы на внешней части молекулы, а остальные 3 основания имеют ориентацию, приблизительно продолжающую спираль стебля. Расчет структуры и измерение релаксации ЯМР показали, что для вершины петли характерна локальная динамика. Канада, Dep. of Biochem., McGill Univ., Montreal, QC H3G 1Y6. Библ. 45
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ПОЛИОМИЕЛИТА
ТРАНСЛЯЦИЯ
РНК
САЙТ ВНУТРЕННЕГО ВХОЖДЕНИЯ РИБОСОМ
ГЕКСАНУКЛЕОТИДНЫЕ ПЕТЛИ
СТРУКТУРА

Доп.точки доступа:
Sprules, Tara; Gehring, Kalle

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.08-04Б1.128

    Roberts, Lisa O.
    Complementation of defective picornavirus internal ribosome entry site (IRES) elements by the coexpression of fragments of the IRES [Text] / Lisa O. Roberts, Graham J. Belsham // Virology. - 1997. - Vol. 227, N 1. - P53-62 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Комплементация дефектных элементов сайта внутреннего вхождения рибосом (IRES) пикорнавируса коэкспрессией фрагментов IRES
Аннотация: Мутантные формы сайта внутреннего вхождения рибосом IRES вируса энцефаломиокардита (ВЭМК) не направляют внутреннюю инициацию транскрипции в клетках, использующих систему РНК-полимеразы фага Т7. Мутации в разных областях IRES комплементируются в транс-положении целым IRES ВЭМК, но не IRES вируса энцефаломиелита мышей Тейлера или вируса ящура. Различные укороченные области IRES ВЭМК, неспособные вызывать внутреннюю инициацию, также комплементируют дефектные элементы IRES ВЭМК. Комплементирующий фрагмент должен экспрессироваться в (+)-смысловой ориентации. Комплементация не связана с рекомбинацией. Эти данные позволяют предположить, что различные функциональные элементы в IRES имеют множественные функции во внутренней инициации трансляции, и нек-рые из этих функций могут выполняться разными молекулами в транс-положении. Великобритания, BBSRC Inst. for Animal Health, Pirbright, Woking, Surrey GU24 0NF. Библ. 44
ГРНТИ  
34.25.19
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ПИКОРНАВИРУСЫ
САЙТ ВНУТРЕННЕГО ВХОЖДЕНИЯ РИБОСОМ
ДЕФЕКТНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
КОМПЛЕМЕНТАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Belsham, Graham J.

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.08-04Б1.130

   
    Genetic analysis of internal ribosomal entry site on hepatitis C virus RNA: Implication for involvement of the highly ordered structure and cell type-specific transacting factors [Text] / Nobuhiko Kamoshita [et al.] // Virology. - 1997. - Vol. 233, N 1. - P9-18 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Генетический анализ сайта внутреннего вхождения рибосом РНК вируса гепатита С: указания на участие высокоупорядоченной структуры и специфичных для типа клеток трансдействующих факторов
Аннотация: Сконструированы бицистронные мРНК, содержащие между цистронами различные мутанты сайта внутреннего вхождения рибосом IRES вируса гепатита С (ВГС). IRES из ВГС генотипа 2b по меньшей мере в 2 раза более эффективен, чем IRES генотипа 1b. Отношение активностей этих IRES зависит от типа клеток, к-рые могут отличаться наборами хозяйских факторов, взаимодействующих с IRES. Рекомбинанты IRES этих штаммов ВГС имеют в бесклеточной системе такую же или более высокую активность, как IRES ВГС 2b, но в культурах клеток проявляют промежуточный уровень активности. IRES 2b и 1b отличаются друг от друга в области между положениями 176 и 224. Эти данные позволяют предположить, что высокоупорядоченная структура всей 5'-части РНК ВГС важна для активности IRES. Делеционный анализ показал, что 5'-граница IRES находится между положениями 28 и 45. Относительная активность делеционных мутантов IRES зависит от типа клеток. Япония, Dep. of Microbiol., Inst. of Med. Sci., Univ. of Tokyo, Tokyo 108. Библ. 47
ГРНТИ  
34.25.19
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА С
САЙТ ВНУТРЕННЕГО ВХОЖДЕНИЯ РИБОСОМ
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
ТРАНСДЕЙСТВУЮЩИЕ ФАКТОРЫ

Доп.точки доступа:
Kamoshita, Nobuhiko; Tsukiyama-Kohara, Kyoko; Kohara, Michinori; Nomoto, Akio

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.08-04Б1.273

   
    A tobamovirus genome that contains an internal ribosome entry site functional in vitro [Text] / P. A. Ivanov [et al.] // Virology. - 1997. - Vol. 232, N 1. - P32-43 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Геном тобамовируса, который содержит внутренний сайт вхождения рибосом, функциональный in vitro
Аннотация: Найдено, что у заражающего крестоцветные тобамовируса (ЗКТВ) трансляция 3'-проксимального гена белка оболочки СР происходит in vitro по механизму внутреннего вхождения рибосом. Изучена трансляция in vitro 3 синтетических дицистронных транскриптов РНК: 1) MP-CP-3'NTR, содержащего гены белка движения МР и СР и 3'-нетранслируемую область РНК ЗКТВ; 2) 'ДЕЛЬТА'NPT-CP, содержащего частично укороченный ген неомицинфосфотрансферазы-I и ген CP; 2) CP-GUS, содержащий ген CP и ген GUS 'бета'-глюкуронидазы E. coli на 3'-конце. Показано, что область длиной 148 н. перед геном СР в РНК ЗКТВ содержит внутренний сайт вхождения рибосом IRES[CP], направляющий внутреннюю инициацию трансляции. Содержащие IRES[CP] дицистронные химерные РНК с 5'-шпилькой, предотвращающей трансляцию первого гена (МР, 'ДЕЛЬТА'NTP или СР) экспрессируют 3'-гены СР или GUS. Наличие IRES[CP] отличает ЗКТВ от типового томбусвируса UI, у к-рого эквивалентная область длиной 148 н. не вызывает внутреннего вхожения рибосом. IRES[CP] ЗКТВ отличается от IRES пикорнавирусов. Россия, Кафедра вирусологии МГУ, Москва. Библ. 50
ГРНТИ  
34.25.29
ВИНИТИ 341.25.29.11
Рубрики: ТОБАМОВИРУСЫ
ГЕНОМ ВИРУСНЫЙ
САЙТ ВНУТРЕННЕГО ВХОЖДЕНИЯ РИБОСОМ
ФУНКЦИОНАЛЬНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Ivanov, P.A.; Karpova, O.V.; Skulachev, M.V.; Tomashevskaya, O.L.; Rodionov, N.P.; Dorokhov, Yu.L.; Atabekov, J.G.

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI05) 00.04-04И8.300

    Chon, Seung K.
    Genetic analysis of the internal ribosome entry segment of bovine viral diarrhea virus [Text] / Seung K. Chon, Daniel R. Perez, Ruben O. Donis // Virology. - 1998. - Vol. 251, N 2. - P370-382 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Генетический анализ сегмента внутреннего вхождения рибосом вируса диареи крупного рогатого скота
Аннотация: Для идентификации функционально важных элементов сайта внутреннего вхождения рибосом IRES вируса диареи крупного рогатого скота (ВДКРС) предпринят мутационный анализ 5'-нетранслируемой области (5'-НТО) ВДКРС, клонированный в межцистронную область бицистронной репортерской плазмиды. Функция IRES испытана в бицистронном транскрипте со вставкой 5'-области генома ВДКРС длиной 901 н. (385 н. 5'-НТО и 515 н. открытой рамки считывания, кодирующей N{p20} (I) и 4 остатка капсидного белка). Составной белок I-люцифераза (II), кодируемая 3'-цистроном, эффективно расщепляется с освобождением II. Анализ трансляции in vivo показал, что шпилечные структуры (ШC) Ia и Ib в 5'-НТО абсолютно не нужны для эффективной трансляции. ШС-IIIc и ШС-IIIb требуются лишь частично. Делеции или вставки в 4 др. ШС, включая домены ШС-II, ШС-IIIa, ШС-IIIc и ШС-IIIb, вызывают уменьшение активности IRES in vivo в 10 раз. 5'-граница IRES находится на 5'-конце ШС-II рядом с положением 75, а 3'-конец IRES захватывает 5'-конец открытой рамки считывания полипротеина, т. к. удаление области, кодирующей I, уменьшает трансляцию на 21%. США, Dep. Vet. and Biomed. Sci., Univ. Nebraska, Lincoln, NE 68583-0905. Библ. 50
ГРНТИ  
34.23.59
ВИНИТИ 341.23.59.02.25
Рубрики: ПЕСТИВИРУСЫ
ВИРУС ДИАРЕИ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА
САЙТ ВНУТРЕННЕГО ВХОЖДЕНИЯ РИБОСОМ
ЭЛЕМЕНТЫ
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Perez, Daniel R.; Donis, Ruben O.

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.04-04Б1.342

    Chon, Seung K.
    Genetic analysis of the internal ribosome entry segment of bovine viral diarrhea virus [Text] / Seung K. Chon, Daniel R. Perez, Ruben O. Donis // Virology. - 1998. - Vol. 251, N 2. - P370-382 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Генетический анализ сегмента внутреннего вхождения рибосом вируса диареи крупного рогатого скота
Аннотация: Для идентификации функционально важных элементов сайта внутреннего вхождения рибосом IRES вируса диареи крупного рогатого скота (ВДКРС) предпринят мутационный анализ 5'-нетранслируемой области (5'-НТО) ВДКРС, клонированный в межцистронную область бицистронной репортерской плазмиды. Функция IRES испытана в бицистронном транскрипте со вставкой 5'-области генома ВДКРС длиной 901 н. (385 н. 5'-НТО и 515 н. открытой рамки считывания, кодирующей N{p20} (I) и 4 остатка капсидного белка). Составной белок I-люцифераза (II), кодируемая 3'-цистроном, эффективно расщепляется с освобождением II. Анализ трансляции in vivo показал, что шпилечные структуры (ШC) Ia и Ib в 5'-НТО абсолютно не нужны для эффективной трансляции. ШС-IIIc и ШС-IIIb требуются лишь частично. Делеции или вставки в 4 др. ШС, включая домены ШС-II, ШС-IIIa, ШС-IIIc и ШС-IIIb, вызывают уменьшение активности IRES in vivo в 10 раз. 5'-граница IRES находится на 5'-конце ШС-II рядом с положением 75, а 3'-конец IRES захватывает 5'-конец открытой рамки считывания полипротеина, т. к. удаление области, кодирующей I, уменьшает трансляцию на 21%. США, Dep. Vet. and Biomed. Sci., Univ. Nebraska, Lincoln, NE 68583-0905. Библ. 50
ГРНТИ  
34.25.29
ВИНИТИ 341.25.29.17.28
Рубрики: ПЕСТИВИРУСЫ
ВИРУС ДИАРЕИ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА
САЙТ ВНУТРЕННЕГО ВХОЖДЕНИЯ РИБОСОМ
ЭЛЕМЕНТЫ
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Perez, Daniel R.; Donis, Ruben O.

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.07-04Б2.149

    de, Quinto Sonia Lopez.
    Parameters influencing translational efficiency in aphthovirus IRES-based bicistronic expression vectors [Text] / Quinto Sonia Lopez de, Encarnacion Martinez-Salas // Gene. - 1998. - Vol. 217, N 1-2. - P51-56 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Параметры, влияющие на эффективность трансляции у бицистронных экспрессионных векторов, основанных на афтовирусном IRES
Аннотация: Изучено влияние модификации последовательности в области между сайтом внутреннего вхождения рибосом IRES и аутентичным инициирующим кодоном второго гена на эффективность трансляции, направляемой IRES вируса ящура в бицистронных экспрессионных векторах. Встраивание различных последовательностей, содержащих дополнительные стартовые кодоны и/или способных образовывать шпильки, сразу за 3'-границей IRES сильно понижает эффективность трансляции второго гена в бицистронных РНК. Увеличение расстояния само по себе не оказывает вредного влияния на эффективность трансляции. Изученный бицистронный вектор допускает вставку 95 п.н. между 3'-границей IRES и аутентичным стартовым кодоном при условии, что кодируемый сегмент РНК не содержит кодонов АУГ в др. рамках считывания или шпилек. Испания, Ctr. Biol. Mol. "Severo Ochoa", CSIC-UAM, Cantoblanco, 28049 Madrid. Библ. 23
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: ВЕКТОРЫ
БИЦИСТРОННЫЕ ЭКСПРЕССИОННЫЕ ВЕКТОРА
СТРУКТУРА
ТРАНСЛЯЦИЯ
ЭФФЕКТИВНОСТЬ
ВИРУСЫ
ВИРУС ЯЩУРА
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
САЙТ ВНУТРЕННЕГО ВХОЖДЕНИЯ РИБОСОМ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
ЭУКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
Martinez-Salas, Encarnacion

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.08-04Б1.49

    de, Quinto Sonia Lopez.
    Parameters influencing translational efficiency in aphthovirus IRES-based bicistronic expression vectors [Text] / Quinto Sonia Lopez de, Encarnacion Martinez-Salas // Gene. - 1998. - Vol. 217, N 1-2. - P51-56 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Параметры, влияющие на эффективность трансляции у бицистронных экспрессионных векторов, основанных на афтовирусном IRES
Аннотация: Изучено влияние модификации последовательности в области между сайтом внутреннего вхождения рибосом IRES и аутентичным инициирующим кодоном второго гена на эффективность трансляции, направляемой IRES вируса ящура в бицистронных экспрессионных векторах. Встраивание различных последовательностей, содержащих дополнительные стартовые кодоны и/или способных образовывать шпильки, сразу за 3'-границей IRES сильно понижает эффективность трансляции второго гена в бицистронных РНК. Увеличение расстояния само по себе не оказывает вредного влияния на эффективность трансляции. Изученный бицистронный вектор допускает вставку 95 п.н. между 3'-границей IRES и аутентичным стартовым кодоном при условии, что кодируемый сегмент РНК не содержит кодонов АУГ в др. рамках считывания или шпилек. Испания, Ctr. Biol. Mol. "Severo Ochoa", CSIC-UAM, Cantoblanco, 28049 Madrid. Библ. 23
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВЕКТОРЫ
БИЦИСТРОННЫЕ ЭКСПРЕССИОННЫЕ ВЕКТОРА
СТРУКТУРА
ТРАНСЛЯЦИЯ
ЭФФЕКТИВНОСТЬ
ВИРУСЫ
ВИРУС ЯЩУРА
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
САЙТ ВНУТРЕННЕГО ВХОЖДЕНИЯ РИБОСОМ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
ЭУКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
Martinez-Salas, Encarnacion

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.10-04Б1.29

   
    Translation eukaryotic initiation factor 4G recognizes a specific structural element within the internal ribosome entry site of encephalomyocarditis virus RNA [Text] / Victoria Kolupaeva [et al.] // J. Biol. Chem. - 1998. - Vol. 273, N 29. - P18599-18604 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Эукариотический фактор инициации трансляции 4G узнает специфический структурный элемент в сайте внутреннего вхождения рибосом РНК вируса энцефаломиокардита
Аннотация: Фактор инициации трансляции eIF4G (I) вербует не кепированную мРНК вируса энцефаломиокардита (ВЭМК) на рибосомы без участия eIF4E, связываясь с сайтом внутреннего вхождения рибосом длиной 'ПРИБЛ='450 н. Химическое и ферментативное зондирование использовано для картирования сайта связывания I с внутренним элементом в домене J-K IRES ВЭМК, состоящим из петли олиго(А) (ПОА) на стыке 3 спиралей. Самой ПОА недостаточно для образования стабильных комплексов с I, т. к. изменение структурного контекста ПОА устраняет взаимодействие ПОА с I. Добавление eIF4A дикого типа или его транс-доминантных мутантных форм к комплексам I-IRES не изменяет картину химической и ферментативной модификации IRES. Ин-т физико-химической биологии МГУ, 119899 Москва. Библ. 40
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ЭНЦЕФАЛОМИОКАРДИТА
РНК МАТРИЧНАЯ
НЕКЕПИРОВАННАЯ
САЙТ ВНУТРЕННЕГО ВХОЖДЕНИЯ РИБОСОМ
СТРУКТУРНЫЙ ЭЛЕМЕНТ
ФАКТОРЫ ТРАНСЛЯЦИИ
ФАКТОР ИНИЦИАЦИИ EIF4G
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

Доп.точки доступа:
Kolupaeva, Victoria; Pestova, Tatyana V.; Hellen, Christopher U.T.; Shatsky, Ivan N.

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 01.12-04Б1.117

   
    Identification of elF2B'гамма' and elF2'гамма' as cofactors of hepatitis C virus internal ribosome entry site-mediated translation using a functional genomics approach [Text] / Martin Kruger [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2000. - Vol. 97, N 15. - P8566-8571 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Идентификация eIF2B'гамма' и eIF2'гамма' как кофакторов трансляции, опосредованной сайтом внутреннего вхождения рибосом вируса гепатита C, с использованием подхода функциональной геномики
Аннотация: Разработана система селекции для идентификации клеточных факторов, участвующих в ф-ции сайта внутреннего вхождения рибосом IRES вируса гепатита C (ВГС). Библиотеку рибозимов с рандомизированными последовательностями узнавания мишени на ретровирусном векторе вводили в клетки HeLa, стабильно экспрессирующие бицистронную конструкцию, кодирующую гигромицин-B-фосфотрансферазу и тимидинкиназу вируса простого герпеса, трансляция к-рой опосредована IRES ВГС. Клоны, экспрессирующие рибозимы, к-рые ингибируют опосредованную IRES трансляцию тимидинкиназы, становятся устойчивыми к ганцикловиру и гигромицину B. Отобраны 2 рибозима, воспроизводимо придающие устойчивость к ганцикловиру и ингибирующие опосредованную IRES трансляцию сердцевинного белка ВГС, но не влияющие на кеп-зависимую трансляцию белков и рост клеток. Показано, что функциональными мишенями для этих белков являются субъединицы eIF2B'гамма' и eIF2'гамма' эукариотич. факторов инициации трансляции. Участие eIF2B'гамма' и eIF2'гамма' в трансляции, опосредованной IRES, подтверждено с использованием рибозимов, нацеленных на др. сайты в мРНК этих генов. Эти рибозимы могут быть использованы для специфического ингибирования трансляции белков ВГС. США, Dep Med., Univ. California, San Diego Sch. Med., La Jolla, CA 92093-0665. Библ. 24
ГРНТИ  
34.25.19
ВИНИТИ 341.25.19.09
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА C
САЙТ ВНУТРЕННЕГО ВХОЖДЕНИЯ РИБОСОМ
ФАКТОРЫ ТРАНСЛЯЦИИ
КОФАКТОРЫ EIF2B'ГАММА' И EIF2'ГАММА'
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
КЛЕТКИ HELA

Доп.точки доступа:
Kruger, Martin; Beger, Carmela; Li, Qiang-Xin; Welch, Peter J.; Tritz, Rihard; Leavitt, Mark; Barber, Jack R.; Wong-Staal, Flossie

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.04-04Б1.64

    Ohlmann, Theophile.
    An internal ribosome entry segment promotes translation of the simian immunodeficiency virus genomic RNA [Text] / Theophile Ohlmann, Marcelo Lopez-Lastra, Jean-Luc Darlix // J. Biol. Chem. - 2000. - Vol. 275, N 16. - P11899-11906 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Сегмент внутреннего вхождения рибосом продвигает трансляцию геномной РНК вируса иммунодефицита обезьян
Аннотация: Присутствие стабильных вторичных структур в 5'-лидерной области (5'-ЛО) вируса иммунодефицита обезьян (ВИО) между кэпом и стартовым кодоном АУГ gag сильно ингибирует сканирование преинициирующим рибосомным комплексом 43S. Предпринят поиск альтернативного механизма инициации трансляции у ВИО. Встраивание 5'-ЛО ВИО-mac между 2 репортерными генами и анализ трансляции в бесклеточной системе из ретикулоцитов кролика показали, что 5'-ЛО содержит сайт внутреннего вхождения рибосом (IRES). Экспрессия генов, направляемая этим IRES, стимулируется при расщеплении фактора инициации трансляции eIF4G. Делеционный анализ показал, что для активности IRES требуется последовательность между главным донорным сайтом сплайсинга и кодоном АУГ в гене gag. Трансфекция и трансдукция клеток NIH-3Т3 и COS-7 подтвердили, что трансляция, направляемая 5'-ЛО ВМО, зависит от IRES и не чувствительна к иммуносупрессору рапамицину. Франция, LaboRetro, Ecole Normale Superieure Lyon, 69364 Lyon. Библ. 50
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ОБЕЗЬЯН
5'-ЛИДЕРНАЯ ОБЛАСТЬ
САЙТ ВНУТРЕННЕГО ВХОЖДЕНИЯ РИБОСОМ
ТРАНСЛЯЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Lopez-Lastra, Marcelo; Darlix, Jean-Luc

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.07-04Б1.133

    Rijnbrand, Rene.
    Mutational analysis of the GB virus B internal ribosome entry site [Text] / Rene Rijnbrand, Groffrey Abell, Stanley M. Lemon // J. Virol. - 2000. - Vol. 74, N 2. - P773-783 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Мутационный анализ сайта внутреннего вхождения рибосом GB-вируса B
Аннотация: Получены данные, показывающие, что синтез полипротеина GB-вируса B (GB-BB) инициируется на сайте внутреннего вхождения рибосом IRES. Анализ трансляционной активности в лизате ретикулоцитов кролика in vitro и в трансфицированных клетках BT7-H in vivo дицистронных фрагментов РНК, содержащих сегменты 5'-нетранслируемой области РНК GB-BB, помещенные между кодирующими последовательностями 2 репортерских белков, показал, что 5'-граница IRES расположена в структурном домене II. Мутационный анализ подтвердил структуру, предложенную для домена II РНК GB-BB, и показал, что оптимальная опосредованная IRES трансляция зависит от всех шпилек РНК в этом домене, включая две шпильки, отсутствующие в IRES вируса гепатита C (ВГC) и пестивирусов. Активность IRES GB-BB зависит также от: 1) филогенетически консервативных, содержащих аденозин выступающих петель в домене III; 2) первичной последовательности шпильки IIIе. Направляемая IRES трансляция устраняется точечными мутациями, стабилизирующими шпильку IV, к-рая содержит в петле инициирующий кодон АУГ. Репортерский ген транслируется наиболее эффективно при прямом слиянии с этим кодоном. Это показало, что инициирующий кодон АУГ является 3'-границей IRES GB-BB и что, в отличие от IRES ВГС, не требуются последовательности, кодирующие полипротеин. Таким образом, IRES GB-BB имеет такую же общую структуру, как и IRES других флавивирусов, но отличается от них структурно и функционально. США, Dep. Microbiol. and Immunol., Univ. Texas Med. Branch, Galveston, TX 77555-1019. Библ. 31
ГРНТИ  
34.25.19
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ФЛАВИВИРУСЫ
GB-ВИРУС B
САЙТ ВНУТРЕННЕГО ВХОЖДЕНИЯ РИБОСОМ
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Abell, Groffrey; Lemon, Stanley M.
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)