СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ<.>)

Общее количество найденных документов : 21
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-21

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.07-04Б2.203

Riboswitches control fundamental biochemical pahways in Bacillus subtilis and other bacteria [Text] / Maumita Mandal [et al.] // Cell. - 2003. - Vol. 113, N 5. - P577-586 . - ISSN 0092-8674
Перевод заглавия: Контроль основных биохимических путей в Bacillus subtilis и других бактериях с помощью рибопереключателей
Аннотация: Рибопереключатели - метаболиты, связывающие домены с определенными мессенджер РНК, служащими как сенсоры для соответствующих мишеней. Аллостерическая перестройка структуры мРНК опосредована связыванием лиганда, что приводит к модуляции экспрессии генов. Идентифицировали класс рибопереключателей, которые селективно узнают гуанин и становятся насыщенными при концентрации 5 нМ. В Bacillus subtilis этот мотив локализован, по крайней мере, на 5 отдельных транскрипционных единицах, которые совместно кодируют 17 генов, участвующих в транспорте пуринов и биосинтезе пуриновых нуклеотидов. Получили экземпляры мРНК, узнающих метаболиты и контролирующих генную экспрессию без необходимости в белковых факторах. Показали, что рибопереключатели вносят вклад в регуляцию метаболических путей в определенных бактериях. США, Dep. of Mol., Cellular and Develop. Biol., Yale Univ. New Haven, Connecticut 06520. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ТРАНСПОРТА ПУРИНОВ
ГЕНЫ БИОСИНТЕЗА ПУРИНОВ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
ФУНКЦИЯ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Mandal, Maumita; Boese, Benjamin; Barrick, Jeffrey E.; Winkler, Wade C.; Breaker, Ronald R.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.07-04Б4.70

Riboswitches control fundamental biochemical pahways in Bacillus subtilis and other bacteria [Text] / Maumita Mandal [et al.] // Cell. - 2003. - Vol. 113, N 5. - P577-586 . - ISSN 0092-8674
Перевод заглавия: Контроль основных биохимических путей в Bacillus subtilis и других бактериях с помощью рибопереключателей
Аннотация: Рибопереключатели - метаболиты, связывающие домены с определенными мессенджер РНК, служащими как сенсоры для соответствующих мишеней. Аллостерическая перестройка структуры мРНК опосредована связыванием лиганда, что приводит к модуляции экспрессии генов. Идентифицировали класс рибопереключателей, которые селективно узнают гуанин и становятся насыщенными при концентрации 5 нМ. В Bacillus subtilis этот мотив локализован, по крайней мере, на 5 отдельных транскрипционных единицах, которые совместно кодируют 17 генов, участвующих в транспорте пуринов и биосинтезе пуриновых нуклеотидов. Получили экземпляры мРНК, узнающих метаболиты и контролирующих генную экспрессию без необходимости в белковых факторах. Показали, что рибопереключатели вносят вклад в регуляцию метаболических путей в определенных бактериях. США, Dep. of Mol., Cellular and Develop. Biol., Yale Univ. New Haven, Connecticut 06520. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.21
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ТРАНСПОРТА ПУРИНОВ
ГЕНЫ БИОСИНТЕЗА ПУРИНОВ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
ФУНКЦИЯ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Mandal, Maumita; Boese, Benjamin; Barrick, Jeffrey E.; Winkler, Wade C.; Breaker, Ronald R.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.12-04Б2.301

Luo, Ying-Feng.
Рибопереключатели: новый генный регуляторный элемент и потенциальный класс мишеней для лекарственных средств [Text] / Ying-Feng Luo, Yue-Lei Chen // Shengwuhuaxue yu shengwuwuli jinzhan = Progr. Biochem. and Biophys. - 2004. - Vol. 31, N 8. - С. 684-687 . - ISSN 1000-3282
Аннотация: Рибопереключатели - метаболит-связывающие структуры РНК, которые служат как новый генный регуляторный элемент для мРНК. Локализованные на определенной мРНК, они могут связывать небольшие метаболиты, но не белковые факторы и последовательно модулировать активность мРНК. Они регулируют широкий ряд основных путей метаболизма, включая биосинтез метионина и витамина B12 в бактериях, в связи с чем предполагается их использование в качестве мишеней для новых лекарственных препаратов. КНР, Coll. of life Sci., Zhejiang Univ., Hangzhou 310029. Библ. 20

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: БЕЛОК
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
РНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
НЕБОЛЬШИЕ МЕТАБОЛИТЫ
СВЯЗЫВАНИЕ
АМИНОКИСЛОТЫ
МЕТИОНИН
МЕТАБОЛИЗМ
РЕГУЛЯЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Chen, Yue-Lei

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.03-04Б2.300

Nahvi, Ali.
Coenzyme B[12] riboswitches are widespread genetic control elements in prokaryotes [Text] / Ali Nahvi, Jeffrey E. Barrick, Ronald R. Breaker // Nucl. Acids Res. - 2004. - Vol. 32, N 1. - P143-150 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Рибопереключатели коэнзима B[12] - широко распространенные генетические контрольные элементы в прокариотах
Аннотация: В более ранних исследованиях показали, что основные метаболические пути в бактериях регулируются рибопереключателями, находящимися внутри определенных мессенджер РНК. Они селективно связывают метаболиты и модулируют экспрессию генов в ответ на изменения концентраций лигандов. Установили, что btuB мРКН Escherichia coli и Salmonella typhimurium несет коэнзим B[12]-зависимый рибопереключатель, вызывающий репрессируемую трансляцию кодируемого кобаламин-транспортного белка при повышенных концентрациях коэнзима. В данной работе использовали филогенетический анализ для определения консенсусной поверхности и модель вторичной структуры для лиганд-связывающего домена этого класса рибопереключателей. Показали, что 5'-нетранслируемый район (5'-UTR) оперона биосинтеза кобаламина (cob) S. tiphymurium несет мотив РНК, определяющий консенсусную последовательность. Биохимическая и генетическая характеристики этого мотива подтвердили, что РНК прямо связывается с коэнзимом B[12] и служит генетическим контрольным элементом для регуляции экспрессии 25-генного оперона для продукции кобаламина этим патогеном. США, Dep. of Mol. Biophysics and Biochemistry, Yale Univ., P.O. Box 208103, New Haven, CT 06520-8103. Библ. 21

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН COB
СТРУКТУРА
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ СИНТЕЗА КОБЛАМИНА
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Barrick, Jeffrey E.; Breaker, Ronald R.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.08-04Б2.277

Batey, Robert T.
Structure of a natural guanine-responsive riboswitch complexed with the metabolite hypoxanthine [Text] / Robert T. Batey, Sunny D. Gilbert, Rebecca K. Montange // Nature. - 2004. - Vol. 432, N 7015. - P411-415 . - ISSN 0028-0836
Перевод заглавия: Структура природных рибопереключателей гуанинового ответа, связывающих метаболит гипоксантин
Аннотация: США, Dep. of Chemistry and Biochemistry, 215 UCB, Univ. of Colorado, Boulder, Colorado 80309

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.27.07
Рубрики: РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
ГУАНИНСВЯЗЫВАЮЩИЙ ДОМЕН
СВЯЗЫВАНИЕ
МЕТАБОЛИТ ГИПОКСАНТИН
СТРУКТУРА
X-ЛУЧИ КРИСТАЛЛОГРАФИЯ
БАКТЕРИИ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ГЕНЫ МЕТАБОЛИЗМА ПУРИНОВ
КОНТРОЛЬ

Доп.точки доступа:
Gilbert, Sunny D.; Montange, Rebecca K.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.03-04Б2.277

Laserson, Uri.
Predicting candidate genomic sequences that correspond to synthetic functional RNA motifs [Text] / Uri Laserson, Hin Hark Gan, Tamar Schlick // Nucl. Acids Res. - 2005. - Vol. 33, N 18. - P6057-6069 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Предсказанные кандидаты геномных последовательностей, соответствующие искусственным функциональным мотивам РНК
Аннотация: Рибопереключатели и интерференция РНК - важные механизмы, обнаруженные во многих организмах для контроля генной экспрессии. Многие простые функциональные мотивы РНК, созданные путем селекции in vitro, продуцируют искусственные аптамеры. Высказана гипотеза, что искусственные РНК могут иметь природные аналоги. Для ее проверки разработали и применили эффективный компьютерный подход для идентификации аптамер-подобных мотивов в геноме. Провели поиск таких мотивов в геномах и оценили их структурную стабильность и статистическую значимость. Такой подход к аптамерам стрептомицина, хлорамфеникола, неомицина В и АТФ позволил идентифицировать 37 последовательностей-кандидатов (в кодирующих и некодирующих районах). Последующий энергетический скрининг показал, что семь кандидатов проявляют энергетические свойства и образцы консервативности, характеризующие функциональные мотивы. США, Dep. of Chemistry, New York Univ., New York, NY 10012. Библ. 51

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
АПТАМЕР-ПОДОБНЫЕ МОТИВЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Gan, Hin Hark; Schlick, Tamar

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.03-04Б2.279

An intermolecular base triple as the basis of ligand specificity and affinity in the guanine- and adenine-sensing riboswitch RNAs [Text] / Jonas Noeske [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2005. - Vol. 102, N 5. - P1372-1377 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Межмолекулярный триплет оснований как основа лигандной специфичности и сродства в гуанин- и аденин-сенсорных рибопереключателях РНК
Аннотация: Рибопереключатели - высоко структурированные элементы РНК, контролирующие экспрессию многих бактериальных генов путем прямого связывания с малыми молекулами метаболитов с высокой специфичностью и сродством. В Bacillus subtilis описаны два класса рибопереключателей, сходных по первичной и вторичной структуре, но отличающиеся по гуанину и аденину. Идентифицировали межмолекулярный триплет оснований между двумя пуриновыми лигандами и соответствующие РНК-рибопереключатели при помощи ЯМР-спектроскопии. Специфичность опосредована образованием пары оснований Уотсона-Крика между гуаниновым лигандом и остатком U родственного рибопереключателя РНК. Второе взаимодействие, общее для пуриновых рибопереключающих комплексов, включает остаток уридина РНК и N3/N9 пуриновых лигандов. Наблюдаемые межмолекулярные водородные связи между пуриновыми лигандами и РНК дают объяснения ранее наблюдавшимся изменениям специфичности при мутации от C к U пуринового рибопереключателя и различиям в сродстве для ряда аналогов пурина. Германия, Inst. of Organic Chemistry and Chemical Biology, Center for Biomolecular Magnetic Resonance, Johann Wolfgang Goethe-Univ., D-60439 Frankfurt am Main. Библ. 35

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
МРНК
СТРУКТУРА
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Noeske, Jonas; Richter, Christian; Grundl, Marc A.; Nasiri, Hamid R.; Schwalbe, Harald; Wohnert, Jens

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.12-04Б2.223

Winkler, Wade C.
Regulation of bacterial gene expression by riboswitches [Text] / Wade C. Winkler, Ronald R. Breaker // Annual Review of Microbiology. - Palo Alto (Calif.), 2005. - 2005, Vol. 59. - P487-517 . - ISBN 0-8243-1159-0
Перевод заглавия: Регуляция экспрессии генов бактерий рибопереключателями
Аннотация: Обзор. Рибопереключатели представляют собой структурные домены, обычно расположенные в некодирующих районах мРНК и взаимодействующие со специфическими метаболитами за счет чего осуществляется контроль экспрессии генов. Подобно белковым регуляторам эти РНК-овые элементы, контролирующие гены, образуют зоны с высоко специфичным связыванием для определенных метаболитов, претерпевающие структурные аллостерические изменения. У бактерий обнаружено несколько классов рибопереключателей и они представляют собой единую и надежную систему узнавания метаболитов. США, Dep. Biochem., Univ. Texas Southwestern Med. Cent., Dallas, Texas 75390. Библ. 111

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
БАКТЕРИИ
РЕГУЛЯЦИЯ
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
УЗНАВАНИЕ
МЕТАБОЛИТЫ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 111

Доп.точки доступа:
Breaker, Ronald R.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.10-04Б2.161

Миронов, А. С.
Сенсорные РНК и их роль в регуляции экспрессии генов [Текст] / А. С. Миронов, К. В. Лобанов // 2 Бреслеровские чтения "Молекулярная генетика, биофизика и медицина сегодня". - СПб, 2007. - С. 278-298 . - ISBN 5-86763-197-4
Аннотация: Несколько лет назад был обнаружен новый тип регуляторных лидерных РНК, которые выступают в качестве сенсоров специфических метаболитов - малых молекул (витамины, аминокислоты, азотистые основания, ионы металлов) и напрямую без белковых посредников регулируют транскрипцию или трансляцию соответствующих мРНК. Такие сенсорные РНК представляют собой природные аптамеры и получили наименование рибопереключателей ("riboswitch"), так как способны формировать альтернативные вторичные структуры в зависимости от присутствия специфического метаболита и модулировать процесс элонгации транскрипции мРНК или инициации трансляции этих мРНК. Показано, что сенсорные РНК участвует в регуляции ряда оперонов Bacillus subtilis и Escherichia coli, контролирующих биосинтез витаминов, аминокислот, нуклеотидов, а также транспорт ионов металлов. В последнее время стало очевидным, что регуляция с помощью рибопереключателей широко распространена в мире бактерий: так, например, около 4% генов Bac. subtilis регулируются сенсорными РНК. Кроме того, появились данные, свидетельствующие о том, что сенсорные РНК принимают участие в регуляции экспрессии генов у эукариот. Наконец, совсем недавно были опубликованы результаты рентгеноструктурного анализа нескольких сенсорных РНК, позволившие расшифровать их третичную структуру. Показано, что для специфического связывания метаболита с сенсорной РНК решающее значение имеет взаимодействие петлевых структур внутри аптамерного модуля РНК. Связывание метаболита приводит к необратимым конформационным изменениям третичной структуры сенсорной РНК, что, в свою очередь, обусловливает изменение уровня экспрессии прилегающих генов. Т. обр., расшифровка механизма действия сенсорных РНК существенно расширяет представление о том спектре функций, которые выполняет РНК в живой клетке. Россия, Гос. НИИ генетики и селекции промышленных микроорганизмов, Москва. Библ. 90

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК СЕНСОРНЫЕ
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
СВЯЗЫВАНИЕ
МЕТАБОЛИТЫ
ВЛИЯНИЕ НА
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОПЕРОНЫ КОНТРОЛЯ СИНТЕЗА МЕТАБОЛИТОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Лобанов, К.В.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 10.02-04Т1.378

Blount, Kenneth F.
Riboswitches as antibacterial drug targets [Text] / Kenneth F. Blount, Ronald R. Breaker // Nature Biotechnol. - 2006. - Vol. 24, N 12. - P1558-1564 . - ISSN 1087-0156
Перевод заглавия: Рибопереключатели как мишени антибактериальных лекарств

ГРНТИ	34.45.21

ВИНИТИ 341.45.21.95.17.02
Рубрики: МРНК
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
АПТАМЕРЫ
РЕГУЛЯТОРЫ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ
МИШЕНИ ЛЕКАРСТВ
ЛЕКАРСТВЕННЫЕ СРЕДСТВА
РАЗРАБОТКА АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫХ СРЕДСТВ

Доп.точки доступа:
Breaker, Ronald R.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.07-04Б2.120

Sharma, Vandana.
Engineering complex riboswitch regulation by dual genetic selection [Text] / Vandana Sharma, Yoko Nomura, Yohei Yokobayashi // J. Amer. Chem. Soc. - 2008. - Vol. 130, N 48. - P16310-16315 . - ISSN 0002-7863
Перевод заглавия: Регуляция инженерного комплекса рибопереключателя при действии двойного генетического отбора
Аннотация: Недавнее открытие рибопереключателей у разных видов бактерий и некоторых эукариот добавило генную регуляцию к функциям РНК в биологии. Природные рибопереключатели имеют несколько искусственных аналогов, способных к регуляции генов в ответ на малые триггерные молекулы. В данной работе описали попытку создать инженерный комплекс рибопереключения, способный воспринимать и отвечать на две малые молекулы согласно Boolean logics AND и NAND. Два аптамера, узнающие теофиллин и тиаминпирофосфат внедрили в тандем в 5'UTR бактериальной мРНК, и рибопереключатели, функционирующие как ворота, были выделены при двойном генетическом отборе. Разные фенотипы инженерных ворот свидетельствовали о разнообразии генной регуляции. Дополнительно такой подход показал способность РНК программировать сложное поведение в бактериях без использования инженерных белков. США, Dep. of Biomed. Engineering, Univ. of California, Davis, 451 Health Sciences Drive, Davis California 95616

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК МАТРИЧНАЯ
5'UTR ТАНДЕМ
ВНЕДРЕНИЕ
АПТАМЕРЫ УЗНАЮЩИЕ
ТЕОФФИЛИН
ТИАМИНПИРОФОСФАТ
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
ДВОЙНОЙ ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ОТБОР
ВЫДЕЛЕНИЕ
ГЕНЫ
ЭКСПРЕССИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РНК
БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Nomura, Yoko; Yokobayashi, Yohei

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.09-04Б4.83

A trans-acting riboswitch controls expression of the virulence regulator PrfA in Listeria monocytogenes [Text] / Edmund Loh [et al.] // Cell. - 2009. - Vol. 139, N 4. - P770-779 . - ISSN 0092-8674
Перевод заглавия: Trans-активное рибопереключение контролирует экспрессию регулятора вирулентности PrfA в Listeria monocytogenes
Аннотация: Рибопереключатели - РНК-элементы, действующие в cis, контролирующие экспрессию нижерасположенных генов благодаря метаболит-индуцируемым изменениям вторичной структуры. Показали, что два S-аденозинметиониновых (SAM) рибопереключателя SreA и SreB могут также функционировать в trans и действовать как некодирующие РНК в Listeria monocytogenes. SreA и SreB контролируют экспрессию регулятора вирулентности PrfA путем связывания 5'-нетраслируемого района его мРНК. Отсутствие SAM рибопереключателей SreA и SreB повышало уровень PrfA и экспрессию гена вирулентности в Listeria monocytogenes. Такое влияние SAM рибопереключателей на экспрессию PrfA проливает свет на связь между вирулентностью бактерий и доступностью питания. Полученные результаты свидетельствуют о новой роли рибопереключателей и регуляторных некодирующих РНК в бактериях. Швеция, Dep. of Molecular Biology, Laboratory for Molecular Infection Med. Sweden, Umea Univ. 90187 Umea. Библ. 30

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.21.07.99
Рубрики: РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
РЕГУЛЯТОР ВИРУЛЕНТНОСТИ PRFA
ЭКСПРЕССИЯ
КОНТРОЛЬ
5'-НЕТРАНСПИРУЕМАЯ ОБЛАСТЬ МРНК
СВЯЗЫВАНИЕ
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
НЕКОДИРУЮЩИЕ РНК
ФУНКЦИИ
ТРАНС-ПОЛОЖЕНИЕ
LISTERIA MONOCYTOGENES (BACT.)
ВИРУЛЕНТНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Loh, Edmund; Dussurget, Olivier; Gripenland, Jonas; Vaitkevicius, Karolis; Tiensuu, Teresa; Mandin, PierreRepola Francis; Buchrieser, Carmen; Cossart, Pascale; Johansson, Jorgen

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.08-04Б2.157

Verhounig, Andreas.
Inducible gene expression from the plastid genome by a synthetic riboswitch [Text] / Andreas Verhounig, Daniel Karcher, Ralph Bock // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2010. - Vol. 107, N 14. - P6204-6209 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Индуцибельная генная экспрессия с пластидного генома с помощью синтетических рибопереключателей
Аннотация: Рибопереключатели - природные РНК сенсоры, регулирующие генную экспрессию в ответ на связывание лиганда. Их идентифицировали в прокариотах и эукариотах, но неизвестно об их наличии в митохондриях и пластидах. В данной работе протестировали возможности инженерных рибопереключателей в пластидах (хлоропластах), в которых контроль генной экспрессии осуществляется на уровне трансляции. Использовали бактериальные рибопереключатели и модифицировали их in silico согласно требованиям трансляционной регуляции в пластидах. Протестировали in vivo путем стабильной трансформации хлоропластного генома табака. Идентифицировали синтетич. рибопереключатель, функционирующий как эффективный трансляционный регулятор генной экспрессии в пластидах в ответ на экзогенно введенный лиганд теофиллин. Этот рибопереключатель - новый инструмент для пластидной инженерии, облегчающий индуцибельную экспрессию хлоропластных генов и трансгенов. Германия, Max-Planck-Inst. fur Moleculare Pflanzenphysiologie, Am Muhlenberg 1, D-14476 Potsdam-Golm

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
СИНТЕТИЧЕСКИЕ
ПОЛУЧЕНИЕ
БАКТЕРИИ
ВЛИЯНИЕ НА
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ХЛОРОПЛАСТОВ
ПЛАСТИДЫ
РЕГУЛЯЦИЯ
ТРАНСЛЯЦИОННЫЙ РЕГУЛЯТОР
РНК-СЕНСОРЫ
СВЯЗЫВАНИЕ
ТЕОФИЛЛИН

Доп.точки доступа:
Karcher, Daniel; Bock, Ralph

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.08-04Б2.170

Henkin, Tina M.
Riboswitch RNAs: Sensing metabolic signals with RNA transcripts [Text] : докл.[International Symposium on Metabolism and Bacterial Pathogenesis "Metabolism Meets Virulence", Hohenkammer, 4-7 Apr., 2009] / Tina M. Henkin // Nova acta Leopoldina. - 2010. - Vol. 111, N 378. - P51-56 . - ISSN 0369-5034
Перевод заглавия: Рибопереключатели РНК: сенсорные метаболические сигналы с РНК транскриптов
Аннотация: Непосредственное восприятие эффекторной молекулы транскриптом РНК считается общим механизмом генной экспрессии в бактериях. РНК этого типа, названные переключателями, специфично отвечают на родственный регуляторный сигнал. Это взаимодействие модулирует структуру транскрипта, которая может определять, удерживается ли РНК в спирали внутреннего терминатора, что ведет к окончанию транскрипции. Подобные перестройки РНК опосредуют трансляционную регуляцию путем секвестирования сайта связывания рибосомы. Каждый класс рибопереключателей узнает свой сигнал с высокой специфичностью и сродством in vivo к пулу эффекторов. Характеристика РНК-эффекторного взаимодействия в этих системах обеспечивает новую информацию о том, как узнаются различные классы сигналов, и как регуляторные механизмы влияют на клетку. Германия, Internat. Symposium jn Metabilism and Bacterial Pathogenesis "Metanbolism Meet Virulence", Hohenkammer

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
РНК-ЭФФЕКТОРНЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ВЛИЯНИЕ НА
ТРАНСКРИПТЫ
СТРУКТУРА
БАКТЕРИИ

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.09-04Б2.126

Narberhaus, Franz.
Regulatory RNAs in prokaryotes: Here, there and everywhere [Text] / Franz Narberhaus, Jorg Vogel // Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 74, N 2. - P261-269 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Регуляторные РНК у прокариот: здесь, там и везде
Аннотация: Представлены материалы совещания "Регуляторные РНК у прокариот", отражающие растущий интерес к исследованиям в данной области. На совещании обсуждались вопросы, связанные с идентификацией, структурой, функциями и механизмом действия регуляторных РНК у бактерий и архей. Темы докладов включили малые регуляторные РНК, рибопереключатели, РНК термосенсоры и CRISOR (собранные в кластеры, регуляторные межcпейсерные короткие палиндромные повторы). Германия, Microbial Bioligy, Ruh Univ. Dochum. Ил.1. Библ. 65

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.02
Рубрики: РНК РЕГУЛЯТОРНЫЕ
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
МАЛЫЕ РЕГУЛЯТОРНЫЕ РНК
РНК ТЕРМОСЕНСОРЫ
CRISPR
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ФУНКЦИИ
МЕХАНИЗМЫ
БАКТЕРИИ
АРХЕИ
МАТЕРИАЛЫ СОВЕЩАНИЯ

Доп.точки доступа:
Vogel, Jorg

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.09-04Б2.132

The SAM-responsive S[MK] box is a reversible riboswitch [Text] / Angela M. Smith [et al.] // Mol. Microbiol. - 2010. - Vol. 78, N 6. - P1393-1402 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Реагирующий на SAM S[MK]-бокс является обратимым рибопереключателем
Аннотация: У многих членов отряда Lactobacillales в 5'-нетранслируемом участке генов metK, кодирующих синтетазы S-аденозилметионина (SAM), находится S[MK]-бокс (SAM-III). Показано, что он является SAM-зависимым молекулярным переключателем - "рибосвичем". Присоединение SAM к S[MK]-боксу вызывает структурные перестройки РНК, приводящие к спариванию последовательности Шайна-Дальгарно (SD) с комплементарной анти-SD-последовательностью. Это ингибирует связывание 30S-субъединицы рибосом и мешает инициации трансляции. В клетках Enterococcus faecalis создана нехватка SAM, и наблюдалось возрастание времени полужизни транскрипта metK, хотя изменения уровня транскрипции в целом не наблюдалось. Похоже, что данный рибопереключатель оказывает действие на уровне инициации трансляции. Время полужизни комплекса SAM-S[MK]-РНК in vitro короче, чем таковое транскрипта metK in vivo, что указывает на возможность обратимого связывания SAM. С помощью флюоресцентных методов удалось прямо показать переходы от SAM-связанной к SAM-свободной конформации. Сделан вывод, что SAM-зависимый обратимый рибопереключатель позволяет клетке быстро реагировать на изменения пула SAM и модулировать экспрессию гена SAM-синтетазы. США, (Henkin T.M.) Dep. of Microbiol. and Center for RNA Biol., The Ohio State Univ., Columbus, OH 43210

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
S[MK]-БОКС
ЗАВИСИМОСТЬ ОТ
СИНТЕТАЗА S-АДЕНОЗИЛМЕТИОНИН
ГЕНЫ
ГЕН SAM-СИНТЕТАЗЫ METK
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
МОДУЛЯЦИЯ
LACTOBACILLALES (BACT.)

Доп.точки доступа:
Smith, Angela M.; Fuchs, Ryan T.; Grundy, Frank J.; Henkin, Tina M.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.12-04Б2.104

Transcription of integron-harboured gene cassette impacts integration efficiency in class 1 integron [Text] / Quhao Wei [et al.] // Mol. Microbiol. - 2011. - Vol. 80, N 5. - P1326-1336 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Новый взгляд на механизмы регуляции рибопереключения
Аннотация: Рибопереключатели - генетические элементы, локализованные в некодирующих районах некоторых информационных РНК (мРНК), к-рые представлены во всех трех основных царствах жизни. Связывание лигандов с рибопереключателями индуцирует конформационные изменения в молекуле мРНК, приводя к модуляции транскрипции генов или сплайсинга РНК, трансляции или стабильности. Этот механизм регуляции особенно распространен в бактериях и допускает прямой отклик на различные метаболические изменения. Большое число рибопереключателей обнаружили в последние несколько лет, что привело к заключению о наличии большого разнообразия регуляторных лигандов и генетических механизмов регуляции. Данный обзор сфокусирован на недавних открытиях регуляторных механизмов рибопереключения. Канада, Dep. de biologie, Faculte des Sciences, Groupe ARN/RNA Group, Univ. de Sherbrooke, Sherbrooke, Quebec, Canada, J1K 2R1

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.02
Рубрики: РНК МАТРИЧНАЯ
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
ТРАНСКРИПЦИЯ
МОДУЛЯЦИЯ
БАКТЕРИИ
ОБЗОРЫ

Доп.точки доступа:
Wei, Quhao; Jiang, Xiaofei; Li, Min; Chen, xiaoyun; Li, Gang; Li, Ru; Lu, Yuan

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.12-04Б2.105

Маланин, С. Ю.
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ - НОВЫЙ КЛАСС РЕГУЛЯТОРОВ ГЕННОЙ АКТИВНОСТИ [Текст] / С. Ю. Маланин // Учен. зап. Казан. гос. ун-та. Сер. Естеств. н. - 2011. - Т. 153, N 2. - С. 73-88 . - ISSN 1815-6169
Аннотация: Представлены данные о регуляции генной активности с помощью рибопереключателей (riboswitch). Рибосвичи представляют собой некодирующие элементы мРНК, которые способны связывать низкомолекулярные лиганды и тем самым регулировать транскрипцию, трансляцию, стабильность и альтернативный сплайсинг РНК транскриптов. Контроль экспрессии в данном случае происходит без участия факторов белковой природы. Рибопереключатели состоят из двух доменов: высоко-консервативного аптамера, ответственного за связывание лиганда, и экспрессионной платформы, которая регулирует экспрессию гена, изменяя вторичную структуру РНК. У грамотрицательных бактерий изменение вторичной структуры РНК в большинстве случаев приводит к экранированию последовательности Шайн - Дальгарно и блокированию инициации трансляции, тогда как у грамположительных бактерий - к аттенуации транскрипции. Рибопереключатели являются широко распространенным механизмом регуляции генной активности. Данные риборегуляторы обнаружены не только в бактериях и археях, но и в эукариотических организмах (некоторых видах грибов и растений). Рибопереключатели принимают участие в регуляции метаболизма витаминов, аминокислот, пуринов и некоторых других молекул

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.02
Рубрики: РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
СТРУКТУРА
ФУНКЦИИ
МЕХАНИЗМЫ ДЕЙСТВИЯ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
АКТИВНОСТЬ
РЕГУЛЯЦИЯ
ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ
ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 14.06-04Б2.232

Single-molecule studies of the lysine riboswitch reveal effector-dependent conformational dynamics of the aptamer domain [Text] / L. R. Fiegland [et al.] // Biochemistry. - 2012. - Vol. 51, N 45. - P9223-9233 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Изучение единичных молекул лизинового рибопереключателя выявляет эффектор-зависимую динамику конформации аптамерного домена
Аннотация: Лизиновый рибопереключатель - цис-действующий элемент, обнаруженный в лидерных последовательностях бактериальных мРНК, кодирующих белки, связанные с биосинтезом или транспортом лизина. Показано, что лизин-связывающий аптамерный домен этих РНК полностью инкапсулирует лиганд и может при взаимодействии с лигандом переходить из открытой в закрытую форму. Разработана модельная FRET-система для характеристики констант диссоциации лизина, а также скоростей открытия/закрытия аптамерного домена lysC Bacillus subtilis

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН LYSC
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ
ЛИЗИНОВЫЙ
ЛИЗИН
КОНСТАНТЫ ДИССОЦИАЦИИ
БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Fiegland, L.R.; Garst, A.D.; Batey, R.T.; Nesbitt, D.J.

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 14.10-04Б2.189

Лиманська, О. Ю.
Потенцiйнi температурно-чутливi рибоперемикачi в геномi сальмонел [Текст] / О. Ю. Лиманська, Л. О. Муртазаева, О. П. Лиманський // Цитол. и генет. - 2013. - Vol. 47, N 5. - С. 12-21 . - ISSN 0564-3783
Перевод заглавия: Потенциальные термочувствительные рибопереключатели в геноме сальмонелл
Аннотация: Известен ряд температурочувствительных элементов - РНК-термометров, к-рые контролируют разнообразие биологических процессов бактерий, включая вирулентность. РНК-термометры - структуры, представляющие или одну протяженную шпилечную структуру, или несколько шпилек, к-рые могут быть как совершенными, так и несовершенными. Установлены алгоритмы и критерии поиска потенциальных РНК-термометров Salmonella enterica, что позволит провести поиск потенциальных РНК-термометров в геноме др. социально значимых патогенов. Украина, Ин-т микробиологии и иммунол. им. И.И. Мечникова НАМН Украины, Киев

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.09
Рубрики: SALMONELLA ENTERICA (BACT.)
РИБОПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ

Доп.точки доступа:
Муртазаева, Л.О.; Лиманський, О.П.

1-20 21-21

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска