СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ИНСЕРЦИОННЫЕ<.>)

Общее количество найденных документов : 291
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.170

A complex insertion sequence cluster at a point of interaction between the linear plasmid SCP1 and the linear chromosome of Streptomyces coelicolor A3(2) [Text] / Masayuki Yamasaki [et al.] // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 11. - P3104-3110 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Сложный кластер инсерционных последовательностей в точке взаимодействия между линейной плазмидой SCP1 и линейной хромосомой Streptomyces coelicolor
Аннотация: Гигантская линейная плазмида SCP1 может интегрироваться в центральную область линейной хромосомы Streptomyces coelicolor A3(2). Секвенирование области мишенного сайта интеграции SCP1 у штамма М145 обнаружило 5 копий 4 инсерционных последовательностей IS на участке ДНК длиной 6,5 т. п. н. Три из этих элементов (IS468, IS469 и IS470) являются новыми IS-элементами, а четвертый идентичен IS466. Все эти элементы содержат одну открытую рамку считывания, к-рая кодирует белок, похожий на транспоназу. Две копии IS468 (А и В) расположены тандемно на левом конце кластера. За ними в ориентации "хвост к хвосту" находятся IS469 и IS466, на 69,3% идентичные друг другу. На правом конце кластера расположен IS470. Активность IS466 и IS468 продемонстрирована соотв. в опытах по транспозиции и при сравнении последовательностей нескольких копий. Япония, Dep. Mol. Biotechnol., Hiroshima Univ., Higashi-Hiroshima 739-8527. Библ. 40

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ЛИНЕЙНАЯ ПЛАЗМИДА SCP1
УЧАСТОК ИНТЕГРАЦИИ
ХРОМОСОМА ЛИНЕЙНАЯ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ИНСЕРЦИОННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ TS
ОБНАРУЖЕНИЕ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
STREPTOMYCES CODICOLOR (BACT.)

Доп.точки доступа:
Yamasaki, Masayuki; Miyashita, Kivotaka; Cullum, John; Kinashi, Haruyasu

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.10-04Б2.224

A global repressor (Mlc) is involved in glucose induction of the ptsG gene encoding major glucose transporter in Escherichia coli [Text] / Keiko Kimata [et al.] // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 29, N 6. - P1509-1519 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Глобальный репрессор (Mlc) участвует в индукции глюкозой гена ptsG, кодирующего основной глюкозный переносчик у Escherichia coli
Аннотация: У Escherichia coli экспрессия гена ptsG, кодирующего мембранный компонент глюкозной транспортной системы, стимулируется в несколько раз глюкозой. Удалось получить инсерционные мутанты с конститутивной экспрессией гена ptsG. Инсерция локализована в гене mlc, ранее известном, как ген репрессора транскрипции ряда генов, участвующих в утилизации углеводов. Белок Mlc был суперпродуцирован и очищен. Эксперименты in vitro продемонстрировали, что транскрипция гена ptsG стимулируется комплексом цАМФ-белок CRP (цАМФ-CRP) и репрессируется белком Mlc. Действие Mlc доминирует над действием комплекса цАМФ-CRP. Обнаружены сайты связывания белка Mlc с промотором гена ptsG, отличные от сайтов связывания комплекса. Связывание комплекса цАМФ-CRP стимулирует посадку РНК-полимеразы на промотор, а связывание белка Mlc - мешает связыванию РНК-полимеразы, но не комплекса. Показано, что глюкоза не влияет на связывание белка Mlc с промотором гена ptsG. Так что глюкоза снимает репрессию промотора гена ptsG, воздействуя на белок Mlc каким-то пока неясным образом. Япония, (Aiba H.) Dep. of Mol. Biol., Graduate School of Sci., Nagoya Univ., Chikusa, Nagoya 464-8601. Библ. 48

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ГЕНЫ
ГЕН MLC
ГЕН ГЛОБАЛЬНОГО РЕПРЕССОРА ТРАНСКРИПЦИИ
ИНСЕРЦИОННЫЕ МУТАЦИИ
БЕЛОК
БЕЛОК MLC
СУПЕРЭКСПРЕССИЯ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ С ПРОМОТОРОМ
РЕПРЕССИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
МЕХАНИЗМ
ГЕН PTS
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
СТИМУЛЯЦИЯ
ГЛЮКОЗА

Доп.точки доступа:
Kimata, Keiko; Inada, Toshifumi; Tagami, Hideaki; Aiba, Hiroji

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.07-04Б2.196

A natural large chromosomal inversion in Lactococcus lactis is mediated by homologous recombination between two insertion sequences [Text] / Marie-Line Daveran-Mingot [et al.] // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 18. - P4834-4842 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Природная большая хромосомная инверсия у Lactococcus lactis опосредована гомологической рекомбинацией между двумя инсерционными последовательностями
Аннотация: Сравнительный анализ хромосомного макрорестрикционного полиморфизма 2 близкородственных штаммов Lactococcus lactis gubsp. cremoris MG1363 и NCDO 763 обнаружил инверсию, составляющую половину генома. Клонированы и секвенированы стыки инверсии у штаммов MG1363 и NCDO 763. Найдено, что каждый стык ДНК содержит одну копию инсерц. элемента IS905. Все эти копии имеют одну и ту же замену п.н., инактивирующую транспоназу. Сравнение последовательностей, окружающих IS905, показало, что большая инверсия возникла в результате одностадийного события гомологич. рекомбинации между 2 дефектными копиями IS905. Инверсия не придает избирательного преимущества штамму NCDO 763, т. к. она не нарушает симметрию oriC-terC в хромосоме и локальное генетическое окружение. Франция, Lab. Microbiol. et Genet. Mol. CNRS, Univ. Paul Sabatier, 31062 Toulouse. Библ. 61

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: ХРОМОСОМА
СТРУКТУРА
ПРИРОДНАЯ ИНВЕРСИЯ
ИНСЕРЦИОННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ IS905
ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
LACTOCOCCUS LACTIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Daveran-Mingot, Marie-Line; Campo, Nathalie; Pitzenthaler, Paul; Le, Bourgeois Pascal

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.06-04Б2.182

A new insertion sequence, IS14999, from Corynebacterium glutamicum [Text] / Yota Tsuge [et al.] // Microbiology. - 2005. - Vol. 151, N 2. - P501-508 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Новая инсерционная последовательность IS14999 из Corynebacterium glutamicum
Аннотация: Изолировали и охарактеризовали новую инсерционную последовательность из Corynebacterium glutamicum ATCC 14999. Этот IS-элемент, обозначенный IS 14999, включает 1149 н.п. с несовершенными терминальными инвертированными повторами размером 22 н.п. IS 14999 содержит одиночную открытую рамку считывания из 345 аминокислот, кодирующую предполагаемую транспозазу, которая, по-видимому, характеризуется наличием фрагмента с частичной гомологией с IS642, элементом суперсемейства IS630/Tc1, в C-концевой области аминокислотной последовательности. Этот факт указывал, что IS14999 принадлежал к суперсемейству IS630/Tc1, которое было впервые идентифицировано у C. glutamicum IS14999 характеризуется наличием уникального расстояния из 38 аминокислотных остатков между второй и третьей аминокислотами в звене DDE, которое известно как каталитический центр транспозазы. Этот факт позволяет предположить, что IS14999 входит в состав нового подсемейства суперсемейства IS630/Tc1. Филогенетическое дерево, сконструированное на основе аминокислотных последовательностей транспозаз, позволило обнаружить, что этот новый транспозируемый элемент был более сходным с элементами эукариотического семейства Tc1/mariner, чем с элементами прокариотического семейства IS630. Кроме факта, что IS14999 был представлен только в нескольких штаммах C. glutamicum, этот факт позволяет предположить, что IS14999 был, вероятно, приобретен с помощью недавнего латерального переноса из эукариотических клеток. Анализ инсерционного сайта у C. glutamicum R позволил обнаружить, что IS14999, по-видимому, транспозируется случайно и всегда вызывает мишеневую дупликацию 4'-TA-3' динуклеотида рядом с инсерцией, подобно другим элементам семейства IS630/Tc1. Эти находки показали, что IS 14999 мог являться мощным инструментом для генетических манипуляций коринебактерий и родственных видов. Япония, Res. Inst. of Innovative Technology for the Earth (RITE), 9-2 Kizugawadai, Kizu-cho Soraku-gun, Kyoto 619-0292. Библ. 40

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: ИНСЕРЦИОННЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
IS14999
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ФЕРМЕНТЫ
ТРАНСПОЗАЗА
СИНТЕЗ
ФУНКЦИЯ
CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Tsuge, Yota; Ninomiya, Kana; Suzuki, Nobuaki; Inui, Masayuki; Yukawa, Hideaki

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.12-04Б2.196

A new insertion variant, IS231I, isolated from a mosquito-specific strain of Bacillus thuringiensis [Text] / Akira Ohgushi [et al.] // Curr. Microbiol. - 2005. - Vol. 51, N 2. - P95-99 . - ISSN 0343-8651
Перевод заглавия: Новый инсерционный вариант, IS23II, выделенный из специфичного для комаров штамма Bacillus thuringiensis
Аннотация: Из штамма Bacillus thuringiensis серовар sotto, поражающего личинки комаров, выделен новый инсерционный элемент, принадлежащий к семейству IS231, обозначенный как IS231I. IS231I состоит из 1653 п.н., включает 2 инвертированных повтора по 20 п.н. каждый с одной ошибкой спаривания, и ограничен 11-членными прямыми повторами. Инсерционный элемент содержит единственную рамку считывания, кодирующую белок из 478 аминокислот и пять консервативных доменов - N1, N2, N3, C1 и С2. Пять некодирующих районов перед ORF способны образовать стабильную структуру "стебель-петля". Величина предсказанной свободной энергии конформации вторичной структуры IS231I составляет 17,2 Ккал/мол. Сравнение последовательности IS231I таковыми 10 известных вариантов IS231 выявило 81% идентичности с IS231A и IS231B, 65-66% c IS231M и IS231S и 38% c IS231W. Япония, Graduaet Sch. Agriculture, Kyushu Univ., Fukuoka 812-8581

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ИНСЕРЦИОННЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
IS231I
СТРУКТУРА
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ГОМОЛОГИИ
BACILLUS THURINGIENSIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Ohgushi, Akira; Saitoh, Hiroyuki; Wasano, Naoya; Ohba, Michio

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.04-04Б2.188

A new IS4 family insertion sequence, IS4Bsu1, responsible for genetic instability of poly-'гамма'-glutamic acid production in Bacillus subtilis [Text] / Toshiro Nagai [et al.] // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 9. - P2387-2392 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Новая инсерционная последовательность IS4Bsu1 семейства IS4, ответственная за нестабильность продукции поли-'гамма'-глутаминовой кислоты у Bacillus subtilis
Аннотация: У Bacillus subtilis natto синтез поли-'гамма'-глутаминовой кислоты (I) контролируется 2-компонентной системой ComP-ComA и индуцируется в начале стационарной фазы роста. У спонтанного мутанта Bac. subtilis natto NAF4, не продуцирующего I, в гене comP обнаружена новая инсерционная последовательность, названная IS4Bsu1. Она имеет длину 1406 п. н. и кодирует транспоназу (II) длиной 374 остатка (мол. м. 34 895), похожую на II семейства IS4. В хромосоме штаммов Bac. subtilis natto, включая NAF4, 3 коммерч. стартерных сайта для ферментации соевых бобов и 3 продуцирующих I штамма, обнаружены 6-11 копий IS4Bsu1, в т. ч. 6 копий в одних и тех же локусах. Все 8 спонтанных не продуцирующих I мутантов, выделенных из независимых культур штамма NAF4, имеют новую дополнительную копию IS4Bsu1 в 6 разных положениях в пределах 600 п. н. 5'-концевой области comP. Мишенными сайтами для IS4Bsu1 являются AT-богатые последовательности длиной 3 п. н. Полученные данные показали, что: 1) IS4Bsu1 транспонируется по репликативному, а не по консервативному механизму, как другие члены IS4; 2) большинство спонтанных не продуцирующих I мутантов образуется в результате интеграции IS4Bsu1 в ген comP, являющийся горячей точкой инсерции. Это объясняет высокую частоту спонтанных мутаций, блокирующих продукцию I и обусловленных IS4Bsu1. Япония, Nat. Food Res. Inst., Ministry Agr., Forestry and Fisheries, Tsukuba 305-8642. Библ. 49

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ СИНТЕЗА ПОЛИ-ГАММА-ГЛУТАМИНОВОЙ КИСЛОТЫ
НЕСТАБИЛЬНОСТЬ
ИНСЕРЦИОННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ IS4BSU1
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ФУНКЦИЯ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Nagai, Toshiro; Tran, Lam-Son Phan; Inatsu, Yasuhiro; Itoh, Yoshifumi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 09.03-04Б4.210

A novel insertion sequence, ISPa26, in oprD of Pseudomonas aeruginosa is associated with carbapenem resistance [Text] // Antimicrob. Agents and Chemother. - 2007. - Vol. 51, N 10. - P3776-3777 . - ISSN 0066-4804
Перевод заглавия: Новая инсерционная последовательность, ISPa 26, в opr D Pseudomonas aeruginosa связана с резистентностью к карбапенему
Аннотация: Карбапенемы часто используют, чтобы лечить людей с инфекциями, вызываемыми Pseudomonas aeruginosa. Резистентность к карбапенемам появилась быстро. Мутации или делеции в oprD обычно обуславливают потерю экспрессии, блокируя вход имипенема в клетки, что приводит к появлению резистентности к этому лекарственному препарату. Анализ данных секвенирования ПЦР продукта одного из штаммов показал, что oprD был разрушен в нуклеотиде 35 посредством встраивания последовательности с размером 1193 н. п., имеющей характеристики IS элемента. Этот новый IS-элемент обозначили ISPa26. Определили число копий ISPa26 в P. aeruginosa. В изоляте, который подвергли анализу, инсерционная инактивация oprD посредством ISPa26 была связана с резистентностью. Южная Африка, Division of Med. Microbiol., Inst. of Infectious Dis. and Mol. Med., Univ. of Cape Town, Anzio Road Observatory 7925, Cape Town. Библ. 9

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.25.07
Рубрики: АНТИБИОТИКОУСТОЙЧИВОСТЬ
КАРБАПИНЕМ
ИНСЕРЦИОННЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
ISPA26
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕН АНТИБИОТИКОУСТОЙЧИВОСТИ OPRD
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.02-04Б2.217

A rare 920-kilobase chromosome inversion mediated by IS1 transposition causes constitutive expression of the yiaK-S operon for carbohydrate utilization in Escherichia coli [Text] / Josefa Badia [et al.] // J. Biol. Chem. - 1998. - Vol. 273, N 14. - P8376-8381 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Редкая хромосомная инверсия 920 т. п. н., опосредованная транспозицией IS1, вызывает конститутивную экспрессию оперона yiaK-S использования углеводов у Escherichia coli
Аннотация: Регулятор оперона yiaK-S, участвующего в использовании углеводов у Escherichia coli, инактивируется при перестройке генома, приводящей к конститутивной экспрессии оперона. Конститутивные по yaiK-S клетки приобретают способность использовать редкую пентозу - L-ликсозу. Рестрикц. анализ и секвенирование регуляторного гена показали, что он разрушен вставкой чужеродной ДНК, состоящей из большого инвертированного фрагмента ДНК длиной 920 т. п. н., фланкированного 2 элементами IS1 в противоположной ориентации. Один элемент соответствует природному IS1 на 0,4 мин, а второй является новой копией IS1, транспонированной в регуляторный ген на 80,6-ой мин. Эта инверсия-вставка может являться результатом внутримолекулярной транспозиции IS1 или же гомологич. рекомбинации между IS1 на 0,4-ой мин и IS1, транспонированным межмолекулярно в регуляторный ген yiaK-S. Т. обр. обнаружено участие редкой, опосредованной IS1 инверсии в эволюции стабильного фенотипа. Испания, Dep. Biochem., Sch. Pharmacy, Univ. Barcelona 08028 Barcelona. Библ. 38

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.17.03
Рубрики: МУТАЦИИ
ИНВЕРСИЯ 920 Т. П. Н.
ВОЗНИКНОВЕНИЕ
ИНСЕРЦИОННЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
IS1
ТРАНСПОЗИЦИЯ
ФУНКЦИЯ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОПЕРОН YIAK-S
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Badia, Josefa; Ibanez, Ester; Sabate, Montserrat; Baldoma, Laura; Aguilar, Juan

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.11-04Б2.342

Acid- and multistress-resistant mutants of Lactococcus lactis: Identification of intracellular stress signals [Text] / Fabien Rallu [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 35, N 3. - P517-528 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Кислото- и мультистресс-устойчивые мутанты Lactococcus lactis: идентификация внутриклеточных стрессовых сигналов
Аннотация: Для изучения механизмов адаптации к кислым средам у лактококков в Lactococcus lactis MG1363 получен ряд инсерционных мутаций, приводящих к кислотоустойчивости. 21 независимая мутация локализована в 18 локусах. Часть этих локусов детерминирует транспортные системы или основной метаболизм. Получ. мутации разделены на 4 фенотипич. класса, 2 из к-рых проявляли резистентность ко многим стрессам. Показано, что у L. lactis сигналом, определяющим уровень индукции ответа на стресс, является внутриклеточ. кол-во фосфатов и (p)ppGpp. Получ. рез-ты указывают на связь между физиологич. состоянием клетки и степенью ее устойчивости к стрессам, а также на роль строгого контроля в регуляции ответа на кислотный стресс. Франция [Maguin E.], Genet. Microb., URLGA, INRA, Domaine de Vilvert, 78352 Jouy en Josas Cedex. Библ. 82

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: LACTOCOCCUS LACTIS (BACT.)
ШТАММ MG1363
ГЕНЫ
ИНСЕРЦИОННЫЕ МУТАЦИИ
КИСЛОТОУСТОЙЧИВЫЕ МУТАЦИИ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
КИСЛОТНЫЙ СТРЕСС
ВНУТРИКЛЕТОЧНЫЙ СИГНАЛ
СТРОГИЙ КОНТРОЛЬ
(P)PPGPP

Доп.точки доступа:
Rallu, Fabien; Gruss, Alexandra; Ehrlich, S.Dusko; Maguin, Emmanuelle

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 98.01-04Я6.326

Activation of line by radiation: Induction of reverse transcriptase resulting in insertion mutations [Text] / K. Servomaa [et al.] // 25th Annu. Meet. Eur. Soc. Radiat. Biol., Stockholm, June 10-14, 1993. - Stockholm, 1993. - P295
Перевод заглавия: Активация элемента LINE при облучении. Индукция обратной транскриптазы приводит к инсерционным мутациям
Аннотация: Показали, что облучение приводит к активации гена LINE, кодирующего белок с консенсусной последовательностью обратной транскриптазы, и к появлению летальных инсерционных мутаций in vivo и in vitro. Провели клонирование и секвенирование гена LINE из библиотек кДНК семенников и клеток хориолейкоза крыс. Показали, что один из клонов полученных кДНК экспрессирует полипептид с мол. м. 50 кД и получили антитела к консервативному для обратной транскриптазы домену этого полипептида. Планируется изучить функциональную активность полученных антител. Финляндия, Dep. Res., Finnish Ctr. Radiat. and Nuclear Safety, 00101 Helsinki

ГРНТИ	34.19.23

ВИНИТИ 341.19.23.07.11
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН LINE
АКТИВАЦИЯ
ОБРАТНАЯ ТРАНСКРИПТАЗА
МУТАЦИИ
ЛЕТАЛЬНЫЕ ИНСЕРЦИОННЫЕ

Доп.точки доступа:
Servomaa, K.; Luokkamaki, M.; Leszczynski, D.; Rytomaa, T.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI36) 97.06-04А4.21

Activation of line by radiation: Induction of reverse transcriptase resulting in insertion mutations [Text] / K. Servomaa [et al.] // 25th Annu. Meet. Eur. Soc. Radiat. Biol., Stockholm, June 10-14, 1993. - Stockholm, 1993. - P295
Перевод заглавия: Активация элемента LINE при облучении. Индукция обратной транскриптазы приводит к инсерционным мутациям
Аннотация: Показали, что облучение приводит к активации гена LINE, кодирующего белок с консенсусной последовательностью обратной транскриптазы, и к появлению летальных инсерционных мутаций in vivo и in vitro. Провели клонирование и секвенирование гена LINE из библиотек кДНК семенников и клеток хориолейкоза крыс. Показали, что один из клонов полученных кДНК экспрессирует полипептид с мол. м. 50 кД и получили антитела к консервативному для обратной транскриптазы домену этого полипептида. Планируется изучить функциональную активность полученных антител. Финляндия, Dep. Res., Finnish Ctr. Radiat. and Nuclear Safety, 00101 Helsinki

ГРНТИ	34.49.19

ВИНИТИ 341.49.19.15.23
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН LINE
АКТИВАЦИЯ
ОБРАТНАЯ ТРАНСКРИПТАЗА
МУТАЦИИ
ЛЕТАЛЬНЫЕ ИНСЕРЦИОННЫЕ

Доп.точки доступа:
Servomaa, K.; Luokkamaki, M.; Leszczynski, D.; Rytomaa, T.

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.09-04Б2.292

An insertion sequence unique to Frankia strain ArI5 [Text] / Theodore R. John [et al.] // Plant and Soil. - 2003. - Vol. 254, N 1. - P107-113 . - ISSN 0032-079X
Перевод заглавия: Инсерционная последовательность, уникальная для штамма Frankia Ar15
Аннотация: На генетическом уровне понимание механизма фиксации азота Frankia ограничено недостаточно изученной функцией гена nif, распространенного среди всех организмов. Охарактеризовали 4 т. п. н. сегмент ДНК из Frankia штамм Ar15, имевший мобильный генетический элемент, инвертированные повторы, фланкирующие ген, кодирующий транспозазу. Обнаружено 6 копий этого элемента в штамме Ar15, но ни одного в штаммах CcI3 или CpI1. Инвертированные повторы были разделены 2156 п. н. фрагментом. Внутри района имелись две перекрывающиеся рамки считывания, кодирующие транспозазу. Результаты исследовали экспрессии гена транспозазы с помощью ПЦР показали, что оба гена могут транскрибироваться. Сконструировали клон, содержащий IS в E. coli, а затем модифицировали инсерцией гена устойчивости к канамицину из Tn5. Фрагмент ДНК, включающий инвертированные повторы, гена транспозазы и ген KAN перенесли в суицидальный вектор pJBSD1. Полученной конструкцией трансформировали E. coli для поиска событий транспозиции

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: АЗОТФИКСАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ГЕНЫ
ГЕНЫ АЗОТФИКСАЦИИ NIF
ФУНКЦИЯ
ИНСЕРЦИОННЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
FRANKIA (BACT.)

Доп.точки доступа:
John, Theodore R.; Wiggington, James; Bock, Joyce V.; Klemt, Ryan; Johnson, Jerry D.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.12-04Б2.430

Analysis of insertion mutants reveals two new genes in the pNRC100 gas vesicle gene cluster of Halobacterium halobium [Text] / Jeffrey G. Jones [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1989. - Vol. 17, N 19. - P7785-7793 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Анализ инсерционных мутантов обнаруживает два новых гена в кластере генов газовых пузырьков Halobacterium halobium на плазмиде pNRC100
Аннотация: Среди 18 дефектных по газовым пузырькам мутантов Halobacterium halobium 4 имеют вставки IS-элементов на расстоянии 200-2000 п.н. с 5' - стороны от плазмидного гена gvpA главного структурного белка газовых пузырьков. Чтобы объяснить фенотип этих мутантов, изучена 5' - фланговая область гена gvpA. Секвенирование обнаружило 2 открытых рамки считывания gvpD и gvpE, к-рые транскрибируются в направлении, противоположном gvpA (порядок генов gvpA- D-Е). Ген gvpD начинается на расстоянии 201 п.н. от gvpA и имеет длину 1608 п.н., а ген gvpE начинается на расстоянии 2 п.н. от 3' - конца gvpD и имеет длину 573 п.н. В межгенной области gvpA-gvpD имеются противонаправленные промоторы со стартовыми сайтами транскрипции, находящимися на расстоянии 109 п.н. друг от друга. 3 вставки IS - элементов у мутантов gvp картированы в гене gvpE, а четвертая вставка - около N - конца гена gvpD. Методом Саузерн-гибридизации обнаружена гомология между областью gvpDE и хромосомным сайтом у H. halobium NRC-1 и у нескольких других штаммов Halobacterium. Библ. 43.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: HALOBACTERIUM HALOBIUM (BACT.)
ПЛАЗМИДА PNRC100
МУТАНТЫ
ИНСЕРЦИОННЫЕ МУТАНТЫ ПО КЛАСТЕРУ ГЕНОВ ГАЗОВЫХ ПУЗЫРЬКОВ GVP
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ГЕНЫ ГАЗОВЫХ ПУЗЫРЬКОВ GVPDE
ИДЕНТИФИКАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Jones, Jeffrey G.; Hackett, Neil R.; Halladay, John T.; Scothorn, Douglas J.; Yang, Chin-fen; Ng, Wai-lap; DasSarma, Shiladitya

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.06-04Б2.264

Analysis of separate isolates of Bordetella pertussis repeated DNA sequences [Text] / William L. McPheat [et al.] // J. Gen. Microbiol. - 1989. - Vol. 135, N 6. - P1515-1520 . - ISSN 0022-1287
Перевод заглавия: Анализ повторяющихся последовательностей из различных участков ДНК Bordetella pertussis
Аннотация: Секвенированы повторяющиеся элементы ДНК из 2 различных участков генома Bordetella pertussi: один в области расположения аденилатциклазы (IS 481 v 1) и второй в области агшютиногена 2 (IS 481 v 2). Показано, что они являются IS-элементами, различающимися 5-10 нуклеотидами. Рассматриваемые последовательности имеют длину 1053 п. н. и включают терминальный почти полный инвертированный повтор из 28 п. н., кроме того, в них входит по 3 открытые рамки считывания, каждая из к-рых содержит на конце короткие прямые повторы. Исследуемые последовательности в значительной степени гомологичны 2 другим повторяющимся последовательностям B. pertussis, опубликованным ранее - IS 481 и а 530 п. н. Вставочные последовательности B. pertussis, очевидно, представляют собой группу близко родственных последовательностей, различающихся в основном структурой фланкирующих участков. Библ. 20. Великобритания, National Inst. for Biological Standards and Control, South Mimms, Hertfordshire EN6 3QG.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: BORDETELLA PERTUSSIS (BACT.)
ГЕНОМ
ПОВТОРЯЮЩИЕСЯ ЭЛЕМЕНТЫ
ИНСЕРЦИОННЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ IS
СТРУКТУРА
ГОМОЛОГИЯ
МОБИЛЬНЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЭЛЕМЕНТЫ

Доп.точки доступа:
McPheat, William L.; Hanson, Jennifer H.; Livey, Ian; Robertson, James S.

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.06-04Б2.438

Analysis of the chromosomal location of two copies of a Bordetella pertussis insertion sequence [Text] / W. L. McPheat [et al.] // Mol. Microbiol. - 1989. - Vol. 3, N 7. - P985-989
Перевод заглавия: Изучение расположения в хромосоме двух копий инсерционных элементов Bardetella pertussis
Аннотация: IS481v1 и IS481v2 - это 2 представителя семейства близкородственных повторяющихся последовательностей ДНК у Bordetella pertussis. IS 481v1 картирован во фрагменте ДНК размером 3 т. п. н. выше стартового кодона гена аденилатциклазы. IS481v2 расположен сразу за геном агглютиногена 2 и выполняет функции сайта терминации транскрипции данного гена. IS 481v1 и IS 481V2 обнаружены у 9 штаммов B. pertussis, включая 3 штамма Phase I, в которых ген агглютиногена 2 не экспрессируется, и 2 штамма Phase IV, не образующих агглютиноген 2 и аденилатциклазу. У данных штаммов не обнаружено каких-либо перестроек ДНК около IS 481v1 и IS 481v2. Т. обр. отсутствие экспрессии генов аденилатциклазы и агглютиногена 2 у B. pertussis не связано с перестройкой ДНК в сайтах IS 481v1 и IS 481v2. Ил. 3. Библ. 35. Великобритания, Division of Bacteriology National Inst. for Biological Standards and Control, South Mimms, Hertfordshire EN6 3Q6.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.07
Рубрики: BORDETELLA PERTUSSIS (BACT.)
ШТАММ PHASE I
ШТАММ PHASE IV
ГЕНЫ
ГЕН АГГЛЮТИНОГЕНА 2
ГЕН АДЕНИЛАТЦИКЛАЗЫ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
ИНСЕРЦИОННЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
IS 481V1 ЭЛЕМЕНТ
IS'U81V2
КАРТИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
McPheat, W.L.; Hanson, J.H.; Livey, I.; Robertson, J.S.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.140

Anatomy of a preferred target site for the bacterial insertion sequence IS903 [Text] / Wen-Yuan Hu [et al.] // J. Mol. Biol. - 2001. - Vol. 306, N 3. - P403-416 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Анатомия предпочтительных сайтов-мишеней инсерционной последовательности IS903 бактерий
Аннотация: С использованием генетических и статистических подходов определены наиболее часто используемые сайты инсерции IS903 (84%). Показано, что лучшая мишень состоит из палиндрома длиной 21 п. н., расположенного в центре дуплицированной мишени из 9 п. н., образующейся при транспозиции. Мишень можно разделить на 4 компонента: фланкирующие последовательности из 5 п. н., наиболее важные участки, необходимые для сайт-специфической инсерции; палиндромный кор из 7 п. н., расположенный в дуплицированной мишени; динуклеотид, локализованный в месте контакта транспозон-мишень; локальный контекст ДНК. С использованием субстратов со множественными сайтами-мишенями показано, что IS903, вероятно, находит мишень посредством локального связывания-скольжения, но не длительного прохождения ДНК. США, Division Infectious Disease, Dep. Biomed. Sci., Sch. Public Hlth, SUNY @Albany, Albany, NY 12201. Библ. 53

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ДНК
ИНСЕРЦИОННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
JS903
САЙТЫ-МИШЕНИ
ПРЕДПОЧТИТЕЛЬНЫЕ
СТРУКТУРА
БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Hu, Wen-Yuan; Thompson, William; Lawrence, Charles E.; Derbyshire, Keith M.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 11.02-04Б4.244

Association of the extended-spectrum 'бета'-lactamase gene bla[TLA-1] with a novel ISCR element, ISCR20 [Text] / Beatrice Bercot [et al.] // Antimicrob. Agents and Chemother. - 2010. - Vol. 54, N 9. - P4026-4028 . - ISSN 0066-4804
Перевод заглавия: Ассоциация гена бета-лактамазы расширенного спектра действия bla[TLA-1] с новым ISCR элементом, ISCR20
Аннотация: Ген bla[TLA-1], кодирующий бета-лактамазу расширенного спектра действия, идентифицировали в 11 энтеробактериальных изолятах из Мехико. Ген был локализован на различных плазмидах разного размера и разных групп несовместимости. Ген связан с новой инсерционной последовательностью ISCR20, кодирующей предполагаемую транспозазу, имеющую только 20% аминокислотную идентифичность с наиболее родственной транспозазой ISCR1. Элемент ISCR20 обеспечивал специфичные промоторные последовательности для экспрессии гена bla[TLA-1]. Франция, Service de Bacteriologie-Virologie, INSERM U914 "Emerging Resistance to Antibiotics", Hopital de Bicetre, Assistance Publique-Hopitaux de Paris, Faculte de Med. et Univ. Paris-Sud, Le Kremlin-Bicetre. Библ. 10

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.25.07
Рубрики: ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ГЕН 'БЕТА'-ЛАКТАМАЗЫ BLA[TLA-1]
СВЯЗЬ
ИНСЕРЦИОННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ISCR2O
ЭНТЕРОБАКТЕРИИ
МЕХИКО

Доп.точки доступа:
Bercot, Beatrice; Porel, Laurent; Silva-Sanchez, Jesus; Nordmann, Patrice

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.08-04Б2.511

Bancroft, Ian.
Characterization of an Insertion Sequence (IS891) of Novel Structure from the Cyanobacterium Anabaena sp. Strain M-131 [Text] / Ian Bancroft, C.Peter Wolk // J. Bacteriol. - 1989. - Vol. 171, N 11. - P5949-5954 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Характеристика инсерционной последовательности (IS 891) новой структуры из цианобактерий Anabaena линии М-131
Аннотация: Инсерционная последовательность (IS 891) из Anabaena линии М-131 представляет открытую рамку считывания, к-рая может кодировать пептид из 310 аминокислот. Последовательность, гомологичная IS-элементу линии М-131, была найдена в ДНК Anabaena линии РСС 7120, но с другим числом копий и другой хромосомной локализацией. Библ. 18. Ил. 4. США, MSU-DOE Plant Res. Lab., Michigan State Univ., East Lansing, MI 48824-1312.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.07
Рубрики: ANABAENA (BACT.)
ШТАММ М-131
ИНСЕРЦИОННЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
IS 891
СТРУКТУРА
САЙТЫ ИНТЕГРАЦИИ

Доп.точки доступа:
Wolk, C.Peter

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.03-04Б2.156

Bartosik, Dariusz.
Identification and characterization of transposable elements of Paracoccus pantotrophus [Text] / Dariusz Bartosik, Marta Sochacka, Jadwiga Baj // J. Bacteriol. - 2003. - Vol. 185, N 13. - P3753-3763 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Идентификация и характеристика транспозибельных элементов Paracoccus pantotrophus
Аннотация: Исследовали разнообразие и распределение остатков транспозибельных элементов в различных штаммах (DSM 11072, DSM 11073, DSM 65 и LMD 82,5) почвенной бактерии Paracoccus pantotrophus ('альфа'-Proteobacteria). С помощью челночного вектора pMEC1 идентифицировали несколько новых инсерционных последовательностей (IS) и транспозонов (Tn), секвенировали их и провели сравнительный анализ, позволивший охарактеризовать гены транспозазы, терминальные инвертированные повторы и классифицировать IS и Tn по семействам. Частота транспозиции этих элементов варьировала от 10{-6} до 10{-3} в зависимости от штамма. Проанализировали число копий, локализацию и распределение этих элементов в P. pantotrophus, P. denitrificans, P. methylutens, P. solventivorans, и P. versutus, что позволило разделить элементы на общие для паракокков и штаммо-специфичные. Поскольку ранее был описан только один элемент (IS1248 P. denitrificans), вновь обнаруженные элементы могут послужить новым генетическим инструментом для изучения паракокков. Польша, Wfrsaw Univ., Inst. of Microbiol., Dep. of Bacterial Genetics, 02-096 Warsaw. Библ. 17

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: ПОЧВЕННЫЕ БАКТЕРИИ
ГЕНОМ
СТРУКТУРА
ТРАНСПОЗОНЫ
ИНСЕРЦИОННЫЕ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
PARACCOCUS PANTOTROPHUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Sochacka, Marta; Baj, Jadwiga

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.08-04А3.611

BayGenomics: A resource of insertional mutations in mouse embryonic stem cells [Text] / Doug Stryke [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 1. - P278-281 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: BayGenomics: ресурс инсерционных мутаций в стволовых эмбриональных клетках мышей
Аннотация: BayGenomics (http://baygenomics.ucsf.edu) является интернетовской базой данных по инсерционным мутациям в стволовых клетках мышей. Примерно 75% клеточных линий данной организации содержат инсерционные мутации известных генов мыши или генов, которые обнаруживают строгое сходство последовательностей с генами, идентифицированными у др. организмов. США [T.E.Ferrin] Univ. of California San Francisco, 513 Parnassus Ave., San Francisco, CA 94143. Библ. 10

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БАЗЫ ДАННЫХ
СТВОЛОВЫЕ КЛЕТКИ
ИНСЕРЦИОННЫЕ МУТАЦИИ
МЫШИ

Доп.точки доступа:
Stryke, Doug; Kawamoto, Michiko; Huang, Conrad C.; Johns, Susan J.; King, Leslie A.; Harper, Courtney A.; Meng, Elaine C.; Lee, Roy E.; Yee, Alice; L'italien, Larry

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска