СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=SINE<.>)

Общее количество найденных документов : 33
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-33

РЖ ВИНИТИ 34 (BI05) 96.05-04И8.284

Porcine SINE associated microsatellite markers: Evidence for new artiodactyl SINEs [Text] / L. J. Alexander [et al.] // Anim. Genet. - 1994. - Vol. 25, Suppl. n 2. - P44 . - ISSN 0268-9146
Перевод заглавия: Ассоциация SINE с микросателлитными маркерами у свиньи: подтверждение наличия новых [повторов] SINE, типичных для парнокопытных млекопитающих
Аннотация: Проанализирована взаимосвязь микросателлитных маркеров с диспергированной повторяющейся ДНК в геноме домашней свиньи. Показано, что 24% микросателлитов, маркируемых зондом (дГ/дТ)[n]*(дЦ/дА)[n], ассоциированы с основным семейством коротких диспергированных повторов - тип PRE-1 класса SINE. Однако для 5,6% микросателлитов установлена связь с отличающимся вариантом SINE: он обозначен ARE-1P, т. к. считается, что он характерен для представителей отряда парнокопытных млекопитающих - ранее сходная последовательность была обнаружена в геноме крупного рогатого скота (обозначена ARE-2B). Также отмечено, что у свиньи выделяется 2 подтипа новых SINE - ARE-1P и ARE-2P: обсуждаются вероятные пути их эволюции. США, U. S. Dep. Agricult. - ARS, R. L. Hruska U. S. Meat Animal Res. Center, Clay Center, NE

ГРНТИ	34.23.59

ВИНИТИ 341.23.59.02.07
Рубрики: ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ
SINE
МИКРОСАТЕЛЛИТЫ
СВИНЬИ
ГЕНОМ

Доп.точки доступа:
Alexander, L.J.; Rohrer, G.A.; Stone, R.T.; Beattie, C.W.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI05) 97.04-04И8.185

Spruell, P.
SINE sequences detect DNA fingerprints in salmonid fishes [Text] / P. Spruell, G. H. Thorgaard // Heredity. - 1996. - Vol. 76, N 4. - P317-324 . - ISSN 0018-067X
Перевод заглавия: Использование последовательностей SINE в методе фингерпринтинга ДНК лососевых рыб
Аннотация: Рассмотрена возможность использования в качестве зондов в методе фингерпринтинга ДНК коротких перемежающихся последовательностей, ранее выявленных в геноме радужной форели Oncorhynchus mykiss. ДНК для фингерпринтинга выделена из клеток 14 видов лососевых рыб - радужной форели, лосося Кларка O.clarki, кижуча O.kisutch, чавычи O.tshawytscha, нерки O.nerka, горбуши O.gorbuscha, семги Salmo salar, кумжи S.trutta, американского гольца Salvelinus fontinalis, арктического гольца S.alpinus, озерного гольца S.namaycush, форели-быка S.confluentus, мальмы S.malma, хариуса Thymallus arcticus, валька Prosopium williamsoni; в качестве представителей сторонних групп использована ДНК щуки Esox lucius, чукучана Catostomus columbianus и полосатого окуня Morone saxatilis. Во всех случаях выявляемые маркеры наследуются согласно менделевским законам. Показано присутствие тестируемых последовательностей SINE в геномах всех 14 видов лососевых, причем их параметры оказываются более сложными, чем это предполагалось ранее. Соотв., маркеры SINE могут быть не менее информативными маркерами в филогенезе рыб, чем Alu-маркеры в исследованиях млекопитающих. США, Div. Biol. Sci., Univ. Montana, Missoula, MT 59812. Библ. 29

ГРНТИ	34.23.59

ВИНИТИ 341.23.59.02.07
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
ДНК
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ SINE
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
РЫБЫ
ЛОСОСЕВЫЕ
ВИДОВОЕ СРАВНЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Thorgaard, G.H.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI51) 97.04-04И7.53

Kass, David H.
Sporadic amplification of ID elements in rodents [Text] / David H. Kass, Joomyeong Kim, Prescott L. Deininger // J. Mol. Evol. - 1996. - Vol. 42, N 1. - P7-14 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: Спорадическая амплификация элементов ID у грызунов
Аннотация: Исследованы параметры геномного распределения элементов ID (являются членами семейства SINE - коротких интерсперсных повторов) в геномах грызунов - крысы Rattus norvegicus, мыши Mus musculus, морской свинки Cavia porcellus, золотистого хомячка Mesocricetus auratus, нутрии Myocastor coypus, белки Sciurus carolinensis, песчанки Meriones unguiculatus и оленьих мышей Peromyscus maniculatus, P. polionotus, P. leucopus, P. californicus, P. truei, P. difficilis и P. gossypinus. Полученные данные подтвердили очень значительный уровень варьирования числа копий ID в геномах грызунов - от 200 копий в геномах морской свинки и нутрии, 1000 копий у хомячка и 1500 копий у песчанки до 25000 копий у P. maniculatus, 60000 копий у белки и 150000 копий у крысы. Эти данные подтверждают, что амплификация повторов ID в геномах носила спорадический характер и не была ассоциирована с филетической дивергенцией отдельных линий в отряде Rodentia. При этом только в некоторых группах (например, в роде Peromyscus) отмечены специфические варианты гена BC1, к-рый считается главным геном, "управляющим" процессом амплификации повторов ID. Полученные данные обсуждаются с точки зрения определения филетического и адаптивного значения вариабельности ID-повторов у грызунов. США, Dep. Biochem. & Mol. Biol., Louisiana St. Univ. Med. Center, 1901 Perdido str., New Orleans, LA 70112. Библ. 34

ГРНТИ	34.33.27

ВИНИТИ 341.33.27.21.19.19.27
Рубрики: ГЕННОЕ СЕМЕЙСТВО SINE
ID-ПОВТОРЫ
ГРЫЗУНЫ
ЭВОЛЮЦИЯ

Доп.точки доступа:
Kim, Joomyeong; Deininger, Prescott L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 97.12-04И4.43

DANA elements: A family of composite, tRNA-derived short interspersed DNA elements associated with mutational activities in zebrafish (Danio rerio) [Text] / Zsuzsanna Izsvak [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1996. - Vol. 93, N 3. - P1077-1081 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Элементы DANA: семейство сложных, производных от тРНК коротких перемежающихся элементов ДНК, ассоциированных с мутационной активностью у Danio rerio
Аннотация: Проведен скрининг генома данио-рерио Brachydanio rerio (аквариумная рыба из семейства карповых) на наличие повторяющихся последовательностей типа SINE - коротких перемежающихся повторов, - известных в геномах многих видов позвоночных. Идентифицировано первое для генома B. rerio семейство таких повторов, обозначенное DANA. Уникальным свойством этих последовательностей считается наличие отчетливой структурированности отдельных "кассет" элементов DANA. Рассмотрены молекулярные пути происхождения DANA - считается, что исходными были ретро-тРНК-элементы, в к-рые встраивались короткие дополнительные последовательности. Общее содержание элементов DANA в геноме B. rerio оценивается не менее чем в 10%. Предполагается, что нек-рые из элементов DANA приобретают способность к транспозициям и вовлечены в повышенную мутабильность, известную в нек-рых участках генома - например, в локусе гена no-tail. Отмечен высокий уровень изменчивости элементов DANA: показано, что полиморфные варианты, характерные для разных тестированных линий и популяций данио, могут быть эффективно идентифицированы с помощью метода ПЦР. США [P. B. Hackett], Dep. Genet. & Cell Biol., Univ. Minnesota, 1445 Gortner av., St. Paul, MN 55108-1095. Библ. 28

ГРНТИ	34.33.33

ВИНИТИ 341.33.33.10
Рубрики: ДНК
КОРОТКИЕ ПЕРЕМЕЖАЮЩИЕСЯ ЭЛЕМЕНТЫ
ТИП SINE
СЕМЕЙСТВО DANA
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
РЫБЫ
ДАНИО-РЕРИО
BRACHYDANIO RERIO

Доп.точки доступа:
Izsvak, Zsuzsanna; Ivics, Zoltan; Garcia-Estefania, David; Fahrenkrug, Scott C.; Hackett, Perry B.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 97.12-04И4.62

Mermaid, a family of short interspersed repetitive elements, is useful for zebrafish genome mapping [Text] / Nobuyoshi Shimoda [et al.] // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 1996. - Vol. 220, N 1. - P233-237 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Использование семейства коротких перемежающихся повторяющихся элементов mermaid в картировании генома данио
Аннотация: Идентифицировано новое семейство последовательностей типа SINE - короткие перемежающиеся повторяющиеся последовательности: согласно предварительным данным последовательности этого семейства (обозначенного mermaid) имеются в геномах рыб, земноводных и приматов. В геноме мыши (и по-видимому др. млекопитающих - не приматов) повторы mermaid отсутствуют. Проанализирована информативность фрагментов mermaid при их использовании в геномном картировании данио Brachydanio rerio (рыба из семейства карповых): для типирования вариантов применен метод ПЦР. Подтверждено, что у этого вида рыб повторы mermaid (как и в геноме человека) многочисленны, широко и практически равномерно диспергированы по геному и характеризуются высоким уровнем полиморфизма. Это делает их эффективными маркерами при картировании. Кроме того, фрагменты mermaid эффективны при маркировании геномных фрагментов данио в гибридных соматических клетках "данио * мышь". Полученные данные обсуждаются с точки зрения перспектив вовлечения последовательностей семейства mermaid в конкретные молекулярно-генетические эксперименты. Япония, [H. Okamoto], Div. Cell. Commun., Nat. Inst. Basic Biol., Nishigonaka 38, Myodaiji-cho, Okazaki, Aichi 444. Библ. 25

ГРНТИ	34.33.33

ВИНИТИ 341.33.33.10
Рубрики: ДНК
КОРОТКИЕ ПЕРЕМЕЖАЮЩИЕСЯ ПОВТОРЫ
ТИПА SINE
СЕМЕЙСТВО MERMAID
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ПРИМЕНЕНИЕ
BRACHYDANIO RERIO
ДАНИО
РЫБЫ

Доп.точки доступа:
Shimoda, Nobuyoshi; Chevrette, Mario; Ekker, Marc; Kikuchi, Yutaka; Hotta, Yoshiki; Okamoto, Hitoshi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 99.09-04И4.20

Detection of the ongoing sorting of ancestrally polymorphic SINEs toward fixation or loss in populations of two species of charr durirng speciation [Text] / Mitsuhiro Hamada [et al.] // Genetics. - 1998. - Vol. 150, N 1. - P301-311 . - ISSN 0016-6731
Перевод заглавия: Выявление предковых полиморфных SINE, сортируемых в сторону фиксации или утраты, в популяциях двух видов гольцов в процессе видообразования
Аннотация: С применением ПЦР выделяли элементы SINE (короткие перемежающиеся повторяющиеся мотивы) в геномах близких видов лососевых рыб - арктического гольца Salvelinus alpinus и мальмы S. malma; SINE маркировали рестриктазой FokI. Идентифицирован вариант Fok-223 общий для всех популяций исследованных видов гольцов - считается, что этот полиморфный вариант характерен для предковой формы видов S. alpinus/S. malma. Еще 2 варианта - Fok-211 и Fok-206 строго специфичны для S. alpinus, причем по обоим локусам отчетливо выражен межпопуляционный полиморфизм. Межпопуляционная изменчивость у обоих видов отмечена еще по 3 SINE-локусам - Fok-214, Fok-217 и Fok-600. Т. обр., элементы SINE у предковой формы были полиморфными, поэтому процессы их преобразования в ходе интенсивно видообразующего рода Salvelinus характеризуются дифференцированным "поведением", филогенетическое значение чего обсуждается. Япония, Fac. Biosci. & Biotechnol., Tokyo Inst. Technol., 4259 Nagatsuta-cho, Midori-ku, Yokohama 226-8501. Библ. 55

ГРНТИ	34.33.33

ВИНИТИ 341.33.33.10
Рубрики: ДНК
ПОВТОРЯЮЩИЕСЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ЭЛЕМЕНТЫ SINE
ПОЛИМОРФИЗМ
ЭВОЛЮЦИЯ
ГЕНЕТИКА ПОПУЛЯЦИЙ
ВИДООБРАЗОВАНИЕ
SALVELINUS ALPINUS
SALVELINUS MALMA

Доп.точки доступа:
Hamada, Mitsuhiro; Takasaki, Nobuyoshi; Reist, James D.; DeCicco, Alfred L.; Goto, Akira; Okada, Norihiro

РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 99.11-04И4.37

Fujiwara, Atushi.
Intragenomic distribgution of a SINE and LINE in salmonid fishes [Text] / Atushi Fujiwara, Syutiti Abe, Michihiro C. Yoshida // Chromosome Sci. - 1997. - Vol. 1, N 2-3. - P151
Перевод заглавия: Внутригеномное распределение SINE и LINE у лососевых рыб
Аннотация: С применением методов флуоресцентной гибридизации in situ и Саузерн-блотинга исследовано распределение в геномах - радужной форели Oncorhynchus mykiss и симы O. masou - 2 семейств повторов: HpaI (входит в состав SINE - коротких перемежающихся повторяющихся элементов) и RSg-1 (входит в LINE - длинные перемежающиеся повторы). Данные FISH указывают на почти равномерное распределение обоих повторов по всему геному, за исключением прицентромерных блоков и р-нов ядрышкового организатора. Крупные кластеры HpaI выявлены в теломерах примерно половины хромосом обоих видов, а также большой кластер RSg-1 - в центромерной области крупного метацентрика. Полученные данные подтверждают, что, как и в геномах млекопитающих, элементы SINE и LINE являются одними из основных мишеней при применении ПЦР со случайными затравками. Япония, Lab. Cytogenet., Grad. Sch. Environ. Earth Sci., Hokkaido Univ., Sapporo

ГРНТИ	34.33.33

ВИНИТИ 341.33.33.10
Рубрики: ДНК
ПОВТОРЯЮЩИЕСЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ПОВТОРЫ SINE
ПОВТОРЫ LINE
ВНУТРИГЕНОМНОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
ONCORHYNCHUS MYKISS
ONCORHYNCHUS MASOU
ЛОСОСЕВЫЕ РЫБЫ

Доп.точки доступа:
Abe, Syutiti; Yoshida, Michihiro C.

РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 00.04-04В5.150

Багирова, С. Ф.
Идентификация Sine - элементов а геномах фитопатогенных грибов [Текст] / С. Ф. Багирова, О. И. Лаврова // Проблемы экол. и физиол. микроорганизмов. - М., 2000. - С. 35 . - ISBN 5-89209-537-1
Аннотация: Грибы из родов Ascochyta sp. (отдел Deuteromycota), Botrytis sp. (отдел Deuteromycota), Phytophthora sp. (отдел Oomycota) являются возбудителями опасных заболеваний многих дикорастущих и культурных растений. Экологическая пластичность и высокая вариабельность популяций этих грибов затрудняют разработку эффективных мер защиты растений. Обнаружено быстрое изменение генотипического состава популяций у Ph. infestans и некоторых других фитопатогенных грибов. Методом ПЦР со специфическими праймерами установлено наличие зон гомологии генетическим элементам из семейства SINE в геномах Ascochyta sp., Botrytis sp., Ph. infestans. Ранее эти праймеры были использованы для изучения последовательности SINE в геноме организма Oncorhynchus gorbuscha. В результате работы на геноме Ph. infestans получено 3 фрагмента размером 0.1, 0.4 и 1 т. п. н., на геноме Ascochita sp. - 2 фрагмента - 0.08 т. п. н., 0.1 т. п. н., на геноме Botrytis sp. - 2 фрагмента - 0.1 т. п. н., 0.3 т. п. н. Т. обр., полученные результаты свидетельствуют о наличии в геномах таких филогенетически отдаленных групп грибов, как Deuteromycota и Oomycota SINE-подобных элементов. Эти данные открывают возможность изучения роли SINE-элементов в высокой изменчивости этих фитопатогенных грибов. Россия, МГУ им. М. В. Ломоносова, биол. ф-т, Москва

ГРНТИ	68.37.31

ВИНИТИ 681.37.31.19.09.41
Рубрики: ФИТОПАТОГЕННЫЕ ГРИБЫ
ГЕНОМЫ
SINE-ПОДОБНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ

Доп.точки доступа:
Лаврова, О.И.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.05-04Б2.74

Багирова, С. Ф.
Идентификация Sine - элементов а геномах фитопатогенных грибов [Текст] / С. Ф. Багирова, О. И. Лаврова // Проблемы экол. и физиол. микроорганизмов. - М., 2000. - С. 35 . - ISBN 5-89209-537-1
Аннотация: Грибы из родов Ascochyta sp. (отдел Deuteromycota), Botrytis sp. (отдел Deuteromycota), Phytophthora sp. (отдел Oomycota) являются возбудителями опасных заболеваний многих дикорастущих и культурных растений. Экологическая пластичность и высокая вариабельность популяций этих грибов затрудняют разработку эффективных мер защиты растений. Обнаружено быстрое изменение генотипического состава популяций у Ph. infestans и некоторых других фитопатогенных грибов. Методом ПЦР со специфическими праймерами установлено наличие зон гомологии генетическим элементам из семейства SINE в геномах Ascochyta sp., Botrytis sp., Ph. infestans. Ранее эти праймеры были использованы для изучения последовательности SINE в геноме организма Oncorhynchus gorbuscha. В результате работы на геноме Ph. infestans получено 3 фрагмента размером 0.1, 0.4 и 1 т. п. н., на геноме Ascochita sp. - 2 фрагмента - 0.08 т. п. н., 0.1 т. п. н., на геноме Botrytis sp. - 2 фрагмента - 0.1 т. п. н., 0.3 т. п. н. Т. обр., полученные результаты свидетельствуют о наличии в геномах таких филогенетически отдаленных групп грибов, как Deuteromycota и Oomycota SINE-подобных элементов. Эти данные открывают возможность изучения роли SINE-элементов в высокой изменчивости этих фитопатогенных грибов. Россия, МГУ им. М. В. Ломоносова, биол. ф-т, Москва

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.11 + 341.27.21.11.17.09
Рубрики: ФИТОПАТОГЕННЫЕ ГРИБЫ
ГЕНОМЫ
SINE-ПОДОБНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ

Доп.точки доступа:
Лаврова, О.И.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 00.09-04К1.222

Retroelements in the human MHC class II region [Text] / Goran Andersson [et al.] // Trends Genet. - 1998. - Vol. 14, N 3. - P109-114 . - ISSN 0168-9525
Перевод заглавия: Ретроэлементы в области MHC класса II человека
Аннотация: Обзор. Рассмотрена организация кластера генов MHC класса II человека в свете локализации в этом кластере генов различных типов ретроэлементов - SINE и LINE-повторов, ретротранспозонов семейства, THE, эндогенных ретровирусов. Особый интерес представляют входящие в состав кластера генов MHC класса II эндогенные ретровирусы, т. к. они могут быть связаны с развитием аутоиммунных заболеваний. Швеция, Dep. of Cell Research, Uppsala Genetic Center, Swedish Univ. of Agricultural Sciences, Box 7055. S-750 07 Uppsala. Библ. 47

ГРНТИ	34.43.35

ВИНИТИ 341.43.35.05.05
Рубрики: ГЕНОМ ЧЕЛОВЕКА
ОРГАНИЗАЦИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ MHC
КЛАСТЕР ГЕНОВ
КЛАСС II
РЕТРОВИРУСЫ
РЕТРОЭЛЕМЕНТЫ
ПОВТОРЫ SINE
ПОВТОРЫ LINE
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 47

Доп.точки доступа:
Andersson, Goran; Svensson, Ann-Cathrin; Setterblad, Niclas; Rask, Lars

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 00.11-04В2.170

Багирова, С. Ф.
Идентификация SiNE - элементов а геномах фитопатогенных грибов [Текст] / С. Ф. Багирова, О. И. Лаврова // Проблемы экол. и физиол. микроорганизмов. - М., 2000. - С. 35 . - ISBN 5-89209-537-1
Аннотация: Грибы из родов Ascochyta sp. (отдел Deuteromycota), Botrytis sp. (отдел Deuteromycota), Phytophthora sp. (отдел Oomycota) являются возбудителями опасных заболеваний многих дикорастущих и культурных растений. Экологическая пластичность и высокая вариабельность популяций этих грибов затрудняют разработку эффективных мер защиты растений. Обнаружено быстрое изменение генотипического состава популяций у Ph. infestans и некоторых других фитопатогенных грибов. Методом ПЦР со специфическими праймерами установлено наличие зон гомологии генетическим элементам из семейства SINE в геномах Ascochyta sp., Botrytis sp., Ph. infestans. Ранее эти праймеры были использованы для изучения последовательности SINE в геноме организма Oncorhynchus gorbuscha. В результате работы на геноме Ph. infestans получено 3 фрагмента размером 0.1, 0.4 и 1 т. п. н., на геноме Ascochita sp. - 2 фрагмента - 0.08 т. п. н., 0.1 т. п. н., на геноме Botrytis sp. - 2 фрагмента - 0.1 т. п. н., 0.3 т. п. н. Т. обр., полученные результаты свидетельствуют о наличии в геномах таких филогенетически отдаленных групп грибов, как Deuteromycota и Oomycota SINE-подобных элементов. Эти данные открывают возможность изучения роли SINE-элементов в высокой изменчивости этих фитопатогенных грибов. Россия, МГУ им. М. В. Ломоносова, биол. ф-т, Москва

ГРНТИ	34.29.15

ВИНИТИ 341.29.15.17.15
Рубрики: ФИТОПАТОГЕННЫЕ ГРИБЫ
ГЕНОМЫ
SINE-ПОДОБНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ

Доп.точки доступа:
Лаврова, О.И.

12.

РЖ ВИНИТИ 68 (BI13) 01.01-04Б3.295

Багирова, С. Ф.
Идентификация SiNE - элементов а геномах фитопатогенных грибов [Текст] / С. Ф. Багирова, О. И. Лаврова // Проблемы экол. и физиол. микроорганизмов. - М., 2000. - С. 35 . - ISBN 5-89209-537-1
Аннотация: Грибы из родов Ascochyta sp. (отдел Deuteromycota), Botrytis sp. (отдел Deuteromycota), Phytophthora sp. (отдел Oomycota) являются возбудителями опасных заболеваний многих дикорастущих и культурных растений. Экологическая пластичность и высокая вариабельность популяций этих грибов затрудняют разработку эффективных мер защиты растений. Обнаружено быстрое изменение генотипического состава популяций у Ph. infestans и некоторых других фитопатогенных грибов. Методом ПЦР со специфическими праймерами установлено наличие зон гомологии генетическим элементам из семейства SINE в геномах Ascochyta sp., Botrytis sp., Ph. infestans. Ранее эти праймеры были использованы для изучения последовательности SINE в геноме организма Oncorhynchus gorbuscha. В результате работы на геноме Ph. infestans получено 3 фрагмента размером 0.1, 0.4 и 1 т. п. н., на геноме Ascochita sp. - 2 фрагмента - 0.08 т. п. н., 0.1 т. п. н., на геноме Botrytis sp. - 2 фрагмента - 0.1 т. п. н., 0.3 т. п. н. Т. обр., полученные результаты свидетельствуют о наличии в геномах таких филогенетически отдаленных групп грибов, как Deuteromycota и Oomycota SINE-подобных элементов. Эти данные открывают возможность изучения роли SINE-элементов в высокой изменчивости этих фитопатогенных грибов. Россия, МГУ им. М. В. Ломоносова, биол. ф-т, Москва

ГРНТИ	68.03.07

ВИНИТИ 681.03.07.21
Рубрики: ФИТОПАТОГЕННЫЕ ГРИБЫ
ГЕНОМЫ
SINE-ПОДОБНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ

Доп.точки доступа:
Лаврова, О.И.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 01.01-04М1.183

Phylogenetic analysis of a retroposon family in African great apes [Text] / Heui-Soo Kim [et al.] // J. Mol. Evol. - 1999. - Vol. 49, N 5. - P699-702 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: Филогенетический анализ семейства ретропозонов больших африканских человекообразных обезьян
Аннотация: Семейство ретропозонов SINE-R обнаружено по его связи с длинными концевыми повторами (LTRs) эндогенного ретровируса человека класса К (HERV-K) как мобильный элемент (МЭ), недавно возникший в геноме человека. С помощью ПЦР геномной ДНК больших африканских человекообразных обезьян и филогенетического анализа, в том числе сравнения с родительской последовательностью (ПС) HERV-K10, исследована недавняя эволюция этого класса МЭ. С использованием праймеров на основе кДНК из мозга человека выявлены 27 ПС у шимпанзе и 16 у гориллы. Филогенетическое сравнение с ранее изученными ПС человека, орангутана и гиббона выявило широкое перекрывание МЭ между видами, что указывает на множественное происхождение в ходе эволюции гоминид. 2 МЭ человека, SINE-R.C2 и HS307, возникли из ПС HERV-K10 самыми последними, но эти 2 МЭ близкородственны 3 МЭ шимпанзе и 4 МЭ гориллы. Возможно, эта группа МЭ (кластеры 14 и 15) транспозировалась на позднем этапе эволюции гоминид. 1 МЭ (Ch-M16) обнаружил 99.1% идентичности ПС со специфичным для человека МЭ SINE-R.C2. Вероятно, сем. SINE-R оставалось транспозиционно активным на протяжении всей эволюции приматов. Великобритания, POWIC, Dep. Psychiat., Warneford Hosp., Univ. Oxford, Oxford OX3 7JX. Библ. 18

ГРНТИ	34.37.31

ВИНИТИ 341.37.31.15
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
ЭВОЛЮЦИЯ
РЕТРОПОЗОНЫ
СЕМЕЙСТВО SINE-R
ДНК КОМПЛЕМЕНТАРНАЯ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ОБЕЗЬЯНЫ
ЧЕЛОВЕКООБРАЗНЫЕ АФРИКАНСКИЕ

Доп.точки доступа:
Kim, Heui-Soo; Wadekar, Rekha V.; Takenaka, Osamu; Hyun, Byung-Hwa; Crow, Timothy J.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 01.02-04А1.69

Phylogenetic analysis of a retroposon family in African great apes [Text] / Heui-Soo Kim [et al.] // J. Mol. Evol. - 1999. - Vol. 49, N 5. - P699-702 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: Филогенетический анализ семейства ретропозонов больших африканских человекообразных обезьян
Аннотация: Семейство ретропозонов SINE-R обнаружено по его связи с длинными концевыми повторами (LTRs) эндогенного ретровируса человека класса К (HERV-K) как мобильный элемент (МЭ), недавно возникший в геноме человека. С помощью ПЦР геномной ДНК больших африканских человекообразных обезьян и филогенетического анализа, в том числе сравнения с родительской последовательностью (ПС) HERV-K10, исследована недавняя эволюция этого класса МЭ. С использованием праймеров на основе кДНК из мозга человека выявлены 27 ПС у шимпанзе и 16 у гориллы. Филогенетическое сравнение с ранее изученными ПС человека, орангутана и гиббона выявило широкое перекрывание МЭ между видами, что указывает на множественное происхождение в ходе эволюции гоминид. 2 МЭ человека, SINE-R.C2 и HS307, возникли из ПС HERV-K10 самыми последними, но эти 2 МЭ близкородственны 3 МЭ шимпанзе и 4 МЭ гориллы. Возможно, эта группа МЭ (кластеры 14 и 15) транспозировалась на позднем этапе эволюции гоминид. 1 МЭ (Ch-M16) обнаружил 99.1% идентичности ПС со специфичным для человека МЭ SINE-R.C2. Вероятно, сем. SINE-R оставалось транспозиционно активным на протяжении всей эволюции приматов. Великобритания, POWIC, Dep. Psychiat., Warneford Hosp., Univ. Oxford, Oxford OX3 7JX. Библ. 18

ГРНТИ	34.03.17

ВИНИТИ 341.03.17.27.11
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
МОЛЕКУЛЯРНАЯЯ ЭВОЛЮЦИЯ
РЕТРОПОЗОНЫ
СЕМЕЙСТВО SINE-R
ДНК КОМПЛЕМЕНТАРНАЯ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ОБЕЗЬЯНЫ
ЧЕЛОВЕКООБРАЗНЫЕ АФРИКАНСКИЕ

Доп.точки доступа:
Kim, Heui-Soo; Wadekar, Rekha V.; Takenaka, Osamu; Hyun, Byung-Hwa; Crow, Timothy J.

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI47) 01.02-04И7.48

Phylogenetic analysis of a retroposon family in African great apes [Text] / Heui-Soo Kim [et al.] // J. Mol. Evol. - 1999. - Vol. 49, N 5. - P699-702 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: Филогенетический анализ семейства ретропозонов больших африканских человекообразных обезьян
Аннотация: Семейство ретропозонов SINE-R обнаружено по его связи с длинными концевыми повторами (LTRs) эндогенного ретровируса человека класса К (HERV-K) как мобильный элемент (МЭ), недавно возникший в геноме человека. С помощью ПЦР геномной ДНК больших африканских человекообразных обезьян и филогенетического анализа, в том числе сравнения с родительской последовательностью (ПС) HERV-K10, исследована недавняя эволюция этого класса МЭ. С использованием праймеров на основе кДНК из мозга человека выявлены 27 ПС у шимпанзе и 16 у гориллы. Филогенетическое сравнение с ранее изученными ПС человека, орангутана и гиббона выявило широкое перекрывание МЭ между видами, что указывает на множественное происхождение в ходе эволюции гоминид. 2 МЭ человека, SINE-R.C2 и HS307, возникли из ПС HERV-K10 самыми последними, но эти 2 МЭ близкородственны 3 МЭ шимпанзе и 4 МЭ гориллы. Возможно, эта группа МЭ (кластеры 14 и 15) транспозировалась на позднем этапе эволюции гоминид. 1 МЭ (Ch-M16) обнаружил 99.1% идентичности ПС со специфичным для человека МЭ SINE-R.C2. Вероятно, сем. SINE-R оставалось транспозиционно активным на протяжении всей эволюции приматов. Великобритания, POWIC, Dep. Psychiat., Warneford Hosp., Univ. Oxford, Oxford OX3 7JX. Библ. 18

ГРНТИ	34.33.27

ВИНИТИ 341.33.27.21.17
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
ЭВОЛЮЦИЯ
РЕТРОПОЗОНЫ
СЕМЕЙСТВО SINE-R
ДНК КОМПЛЕМЕНТАРНАЯ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ОБЕЗЬЯНЫ
ЧЕЛОВЕКООБРАЗНЫЕ АФРИКАНСКИЕ

Доп.точки доступа:
Kim, Heui-Soo; Wadekar, Rekha V.; Takenaka, Osamu; Hyun, Byung-Hwa; Crow, Timothy J.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.02-04Б1.258

Deregon, J. -M.
La relation SINE/LINE: Un exemple de parasitisme moleculaire? [Text] / J. -M. Deregon // M/S: Med. sci. - 2001. - Vol. 17, N 1. - P103-106 . - ISSN 0767-0974
Перевод заглавия: Отношение SINE/LINE: пример молекулярного паразитизма
Аннотация: Многие человеческие заболевания связаны с перемещающимися элементами, играющими роль мутагенных агентов и являющимися результатом взаимодействия ретропозонов SINE и LINE. Среди элементов класса I эти ретропозоны считаются самыми примитивными. Они играют важную роль в геномах современных эукариотов. Так, 15% человеческого генома представлены элементами LINE L1 (10{5} копий) и 10% - SINE Alu (10{6}). Эти элементы отвечают за гомологию первичных последовательностей, других, чем хвостовые poly(A). Подробно обсуждается их участие в генетических механизмах млекопитающих. Статистический анализ сайтов интеграции SINE Alu и LINE L1 указывает на то, что они обладают сходными молекулярными характеристиками. Биохимический анализ эндонуклеазы, кодируемой LINE L1, продемонстрировал, что этот энзим одновременно обеспечивает интеграцию L1 и Alu. VLP (вирусоподобный комплекс) и LINE могут связывать клеточную mРНК, обеспечивать обратную транскрипцию кДНК. Считается, что LINE L1 участвует в перемещении SINE Alu. Гипотеза, согласно которой элементы SINE являются паразитами комплекса элементов LINE и VPL, достаточно правдоподобна, но пока еще имеет мало прямых доказательств. Франция, Cnrs UMR6547 et GDR2157, Biomove, Univ. Blaise-Pascal Clermont-Ferrand II, 63177 Aubiere Cedex. Библ. 15

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.23.02
Рубрики: РЕТРОТРАНСПОЗОНЫ
ЭЛЕМЕНТЫ SINE/LINE
ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
МОЛЕКУЛЯРНЫЙ ПАРАЗИТИЗМ

17.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI28) 02.06-04Н3.74

Rudin, Charles M.
Transcriptional activation of short interspersed elements by DNA-damaging agents [Text] / Charles M. Rudin, Craig B. Thompson // Genes, Chromosomes and Cancer. - 2001. - Vol. 30, N 1. - P64-71 . - ISSN 1045-2257
Перевод заглавия: Активация транскрипции коротких перемежающихся элементов под действием ДНК-повреждающих агентов
Аннотация: Механизмы, регулирующие транскрипцию, обратную транскрипцию и встраивание в геном SINE-элементов изучены недостаточно. Показано, что транскрипция SINEs как B1-, так и B2-классов сильно активируется у мыши при длительном воздействии цисплатина, этопозида и 'гамма'-облучения. В сходных условиях усиливается экспрессия Alu-элементов в клетках человека. Генотоксическая обработка клеток мыши также приводит к активации содержащихся в них экзогенных Alu-элементов. Параллельно в клетках наблюдается повышение активности обратной транскриптазы. США, Dep. Med., Univ. Chicago, Chicago, Illinois. Библ. 44

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.55.07.05
Рубрики: МОБИЛЬНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
SINE
АКТИВАЦИЯ
ДНК-ПОВРЕЖДАЮЩИЕ АГЕНТЫ
ВЛИЯНИЕ
МЫШИ

Доп.точки доступа:
Thompson, Craig B.

18.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 02.06-04Н1.164

Rudin, Charles M.
Transcriptional activation of short interspersed elements by DNA-damaging agents [Text] / Charles M. Rudin, Craig B. Thompson // Genes, Chromosomes and Cancer. - 2001. - Vol. 30, N 1. - P64-71 . - ISSN 1045-2257
Перевод заглавия: Активация транскрипции коротких перемежающихся элементов под действием ДНК-повреждающих агентов
Аннотация: Механизмы, регулирующие транскрипцию, обратную транскрипцию и встраивание в геном SINE-элементов изучены недостаточно. Показано, что транскрипция SINEs как B1-, так и B2-классов сильно активируется у мыши при длительном воздействии цисплатина, этопозида и 'гамма'-облучения. В сходных условиях усиливается экспрессия Alu-элементов в клетках человека. Генотоксическая обработка клеток мыши также приводит к активации содержащихся в них экзогенных Alu-элементов. Параллельно в клетках наблюдается повышение активности обратной транскриптазы. США, Dep. Med., Univ. Chicago, Chicago, Illinois. Библ. 44

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.19.11.07
Рубрики: МОБИЛЬНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
SINE
АКТИВАЦИЯ
ДНК-ПОВРЕЖДАЮЩИЕ АГЕНТЫ
ВЛИЯНИЕ
МЫШИ

Доп.точки доступа:
Thompson, Craig B.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI47) 03.01-04И7.51

Retroposon analysis of major cetacean lineages: The monophyly of toothed whales and the paraphyly of river dolphins [Text] / Masato Nikaido [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2001. - Vol. 98, N 13. - P7384-7389 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Анализ ретропозонов основных [таксономических групп] китообразных: монофилия зубатых китов и парафилия речных дельфинов
Аннотация: Для построения кладограмм охарактеризовали 25 информативных повторяющихся элементов SINE, встроенных в уникальные геномные локусы в ходе эволюции зубатых китов и дельфинов (подотряд Odontoceti) секвенировали последовательности, фланкирующие SINE (примерно 2,8 т. п. н. на таксон), для определения времени дивергенции отдельных таксономических групп. Установили, что: 1) зубатые киты представляют собой монофилетическую группу; 1) дивергенция от кашалотов проходила в следующей последовательности: речные дельфины Ганга, клюворылые дельфины и морские дельфины; 3) три других группы - дельфины Амазонки, Ла-Платы и Янцзы, образуют монофилетическую группу; 4) быстрая радиация сохранившихся до настоящего времени таксономических групп происходила 28-33 млн. лет назад, что согласуется с палеонтологическими данными. Комбинирование анализа SINE и фланкирующих последовательностей позволяет определить время дивергенции зубатых китов и дает альтернативное решение нескольких проблем эволюции китообразных. Новая Зеландия, Dep. Geology, Univ. Otago, P. O. Box 56, Dunedin. Библ. 57

ГРНТИ	34.33.27

ВИНИТИ 341.33.27.21.17
Рубрики: ЭВОЛЮЦИЯ
КИТООБРАЗНЫЕ
ЗУБАТЫЕ КИТЫ
ВРЕМЯ ДИВЕРГЕНЦИИ
ЭЛЕМЕНТЫ SINE
АНАЛИЗ
ФЛАНКИРУЮЩИЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

Доп.точки доступа:
Nikaido, Masato; Matsuno, Fumio; Hamilton, Healy; Brownell, Robert L.; Cao, Ying; Ding, Wang; Zuoyan, Zhu; Shedlock, Andrew M.; Fordyce, R.Ewan; Hasegawa, Masami; Okada, Norihiro

20.

РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 03.03-04В5.80

Багирова, С. Ф.
Идентификация SINE-элементов в геномах фитопатогенных грибов [Текст] / С. Ф. Багирова, О. И. Лаврова // Научная конференция "Проблемы экологии и физиологии микроорганизмов", Москва, 21 дек., 1999. - М., 2000. - С. 35 . - ISBN 5-89209-537-1
Аннотация: Методом ПЦР со специфическими праймерами было установлено наличие зон гомологии генетическим элементам из семейства SINE в геномах Ascochyta sp., Botrytis sp., Phytophthora infestans. Ранее эти праймеры были использованы для изучения последовательности SINE в геноме организма Oncorhynchus gorbuscha. В результате работы на геноме Phytophthora infestans было получено 3 фрагмента размером 0,1; 0,4 и 1 kb на геноме Ascochita sp. - 2 фрагмента -0.08 kb, 0,1 kb, на геноме Botrytis sp. - 2 фрагмента - 0,1 kb, 0,3 kb. Полученные результаты свидетельствуют о наличии в геномах таких филогенетически отдаленных групп грибов как Deuteromycota и Oomycota SINE-подобных элементов. Эти данные открывают возможность изучения роли SINE-элементов в высокой изменчивости этих фитопатогенных грибов. Россия, Московский гос. ун-т им. М. В. Ломоносова

ГРНТИ	68.37.31

ВИНИТИ 681.37.31.19.02
Рубрики: ФИТОПАТОГЕННЫЕ ГРИБЫ
ГЕНОМ
SINE-ЭЛЕМЕНТЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Лаврова, О.И.

1-20 21-33

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска