СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ<.>)

Общее количество найденных документов : 155
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.03-04Б1.67

Meissner, John.
Complete nucleotide sequencing of an HPV-1a variant and determination of extant errors in the prototype HPV-1a sequence [Text] / John Meissner // Virus Genes. - 1995. - Vol. 9, N 2. - P189-191 . - ISSN 0920-8569
Перевод заглавия: Полное нуклеотидное секвенирование варианта папилломавируса человека типа 1а (ВПЧ-1а) и определение существующих ошибок в прототипной последовательности ВПЧ-1А
Аннотация: Определена нуклеотидная последовательность варианта 3-3 ВПЧ-1а. Она более, чем на 99% совпадает с прототипной последовательностью ВПЧ-1а. 5 из 7 найденных точечных мутаций и делеция 15 п.н. у варианта 3-3 расположены в длинной контрольной области LCR. Исправлены ошибки в прототипной последовательности ВПЧ-1а. США, Transcription, Ltd., Durham, NC 27707. Библ. 13

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ПАПИЛЛОМАВИРУСЫ
ВАРИАНТЫ
ПРОТОТИПНЫЕ ШТАММЫ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.03-04Б1.401

Complete nucleotide sequences of the M and S segments of two hantavirus isolates from California: Evidence for reassortment in nature among viruses related to hantavirus pulmonary syndrome [Text] / Dexin Li [et al.] // Virology. - 1995. - Vol. 206, N 2. - P973-983 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Полные нуклеотидные последовательности сегментов M и S двух калифорнийских изолятов хантавируса: свидетельство происходящей в природе реассортации между вирусами, родственными хантавирусу легочного синдрома
Аннотация: Определены полные нуклеотидные последовательности геномных сегментов M и S и части сегмента L двух хантавирусов, выделенных от Peromyscus maniculatus, отловленных в восточной Калифорнии. Изоляты Convict Creek 107 и 74 (CC107 и CC74) генетически сходны с вирусами, вызывающими хантавирусный легочный синдром. Оба изолята имели сегмент М длиной 3 696 н. с кодирующим потенциалом в 1140 аминок-т. Сегменты S CC107 и CC74 содержали 2083 н. и 2047 н., соотв-но. Каждый имел открытую рамку считывания для кодирования белка в 428 аминок-т. Сегменты M двух изолятов имели лишь 1% различий в последовательности, сегменты S - 13%. По мнению авт., это свидетельствует о реассортации сегментов генома хантавирусов в популяциях грызунов в Калифорнии. Сравнение CC107 и CC74 с др. хантавирусами свидетельствует об одновременной циркуляции в природе генетически различающихся вирусов. США, Army Med. Res. Inst. of Infect. Dis., Fort Detrick, Frederick, Maryland 21702-5011. Библ. 51

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.31
Рубрики: ХАНТАВИРУСЫ
ХАНТАВИРУС ЛЕГОЧНОГО СИНДРОМА
КАЛИФОРНИЙСКИЕ ИЗОЛЯТЫ
ГЕНОМНЫЕ СЕГМЕНТЫ M, S И L
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
СРАВНЕНИЕ
РЕАССОРТАЦИЯ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Li, Dexin; Schmaljohn, Alan L.; Anderson, Kevin; Schmaljohn, Connie S.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.07-04Б1.418

comparison of the genomes of wild-type French viscerotropic strain of yellow fever virus with its vaccine derivative French neurotropic vaccine [Text] / Eryu Wang [et al.] // J. Gen. Virol. - 1995. - Vol. 76, N 11. - P2749-2755 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Сравнение геномов французского висцеротропного штамма вируса желтой лихорадки (ВЖЛ) дикого типа с производной от него французской нейротропной вакциной (FNV)
Аннотация: FNV широко использовалась в Африке для профилактики ВЖЛ. Будучи эффективной, эта вакцина, однако, с недопустимо высокой частотой вызывала у детей поствакцинальные осложнения, вследствие чего была заменена на вакцину 17D. Сравнение полной нуклеотидной последовательности французского висцеротропного ВЖЛ дикого типа (FVV) и производного от него аттенуированного вакцинного штамма из ин-та Пастера, Париж (FNV-IP) выявило различия по 77 нуклеотидам, ведущие к замене 35 аминокислот. Сравнение FNV-IP и 3 др. изолятов FNV с др. вакцинными штаммами ВЖЛ (17D-204 и 17DD), производными от дикого штамма Asibi) показало, что при двух разных процессах аттенуации (FVV пассировали в головном мозгу мышей, Asibi - в куриных фибробластах) имели место два одинаковых изменения нуклеотидов, ведущие к замене 2 аминокислот: в положении 35 мембранного белка (M-35) и в положении 95 неструктурного белка 4B (NS4B-95). Делается заключение, что эти 2 аминокислотные замены прямо или косвенно участвуют в аттенуации висцерального заболевания людей и обезьян и/или компетентности к комарам у ВЖЛ дикого типа. США, Center for Tropical Dis. and Dep. of Pathol., Univ. of Texas Med. Branch, Galveston, TX 77555-0605. Табл. 5. Библ. 29

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.28
Рубрики: ВИРУС ЖЕЛТОЙ ЛИХОРАДКИ
ВАКЦИННЫЕ ШТАММЫ
ШТАММ ДИКОГО ТИПА
ГЕНОМ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
СРАВНЕНИЕ
ЗАМЕНА АМИНОКИСЛОТ
РОЛЬ В АТТЕНУАЦИИ

Доп.точки доступа:
Wang, Eryu; Ryman, Kate D.; Jennings, Alan D.; Wood, David J.; Taffs, Frank; Minor, Philip D.; Sanders, Peter G.; Barrett, Alan D.T.

Патент 5428145 Соединенные Штаты Америки, МКИ A61K 39/29.

Okamoto, Hiroaki.
Non-A, non-B, hepatitis virus genome, polynucleotides, polypeptides, antigen, antibody and detection systems [Текст] / Hiroaki Okamoto, Minami Kawachi, Tetsuo Nakamura ; Immuno Japan, Inc. - № 925695 ; Заявл. 07.08.1992 ; Опубл. 27.06.1995 ; Приор. 09.08.1991, № 3-287402 (Япония)
Перевод заглавия: Геном вируса гепатита ни А ни В, полинуклеотиды, полипептиды, антиген, антитела и системы детекции
Аннотация: Патентуется РНК вируса гепатита ни А ни В, ее полипептид, антиген, антитела и системы для их обнаружения. Представлены полные нуклеотидные последовательности РНК штаммов HC-I6 и HC-I8, рекомбинантных кДНК этих штаммов и определенные на их основе аминокислотные последовательности соответствующих полипептидов. Выявлены отличия геномов HC-I6 и HC-I8 от последовательности вируса гепатита С, представленной Chiron Corp

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА НИ А НИ В
РНК ВИРУСНАЯ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ПОЛИПЕПТИД
АМИНОКИСЛОТНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
РЕКОМБИНАНТНАЯ КДНК
АНТИГЕНЫ
АНТИТЕЛА
СИСТЕМЫ ДЕТЕКЦИИ

Доп.точки доступа:
Kawachi, Minami; Nakamura, Tetsuo; Immuno Japan; Inc.
Свободных экз. нет

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.03-04Б1.319

Sequence analysis of the avirulent, demyelinating A7 strain of Semliki Forest virus [Text] / Catherine J. Tarbatt [et al.] // J. Gen. Virol. - 1997. - Vol. 78, N 7. - P1551-1557 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Анализ последовательности авирулентного демиелинизирующего штамма А7 вируса леса Семлики (SFV)
Аннотация: Сообщается об определении полной нуклеотидной последовательности авирулентного штамма А7 SFV. При сравнении с вирулентным штаммом SFV4 (полученным из инфекционного клона pSP6-SFV4) у штамма А7 выявлено в транслируемой области 226 изменений нуклеотидов (идентичность 98,2%), к-рые привели к замене 47 аминокислот (идентичность 98,7%). 5'-нетранслируемая область А7 содержит две нуклеотидные замены, а 3'-нетранслируемая область длиннее таковой SFV4 и несет дивергентные и повторяющиеся элементы. Сконструированы химеры, содержащие последовательности SFV4 и А7, а также инфекционный клон А7, pSP6-CA7. Тестирование их на вирулентность путем и/п и и/н инфицирования взрослых мышей BALB/c показало, что авирулентность фенотипа А7 определяется полигенно и требует аддитивного действия последовательностей как структурной, так и неструктурной областей генома SFV. Ирландия, Dep. of Microbiol., Moyne Inst., of Preventive Med., Trinity College, Dublin 2. Ил. 2. Табл. 2. Библ. 33

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.28
Рубрики: АЛЬФАВИРУСЫ
ВИРУС ЛЕСА СЕМЛИКИ
АВИРУЛЕНТНЫЙ ШТАММ А7
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ФЛАВИВИРУСЫ

Доп.точки доступа:
Tarbatt, Catherine J.; Glasgow, Gwendoline M.; Mooney, Dorothy A.; Sheahan, Brian J.; Atkins, Gregory J.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.05-04Б2.276

McCarthy, Michael.
Microbial genome sequencing opens door to new world [Text] / Michael McCarthy // Lancet. - 1997. - Vol. 349, N 9051. - P548 . - ISSN 0140-6736
Перевод заглавия: Секвенирование микробного генома открывает дверь в новый мир
Аннотация: С 1995 г., когда впервые группой J. Craig Venter из TIGR, Роквилл, США, была опубликована полная нуклеотидная последовательность Haemophilus influenzae, уже удалось секвенировать геномы Mycoplasma genitalium, M. pneumoniae, Saccharomyces cerevisiae и Escherichia coli. В процессе завершения находятся работы по секвенированию еще более 40 микроорганизмов. Знание полной нуклеотидной последовательности, в частности, патогенных бактерий позволяет целенаправленно искать гены, способные синтезировать антигенные факторы для производства вакцин, новые мишени для действия антибиотиков и т. д. Знание генома дрожжей значительно ускоряет изучение генетических болезней человека, т. к. из примерно 250 известных генов, ответственных за те или иные болезни, около 40% имеют специфич. гомологию с генами дрожжей. Чем дальше развиваются исследования бактериального генома, тем больше возникает новых вопросов. Так, даже у M. genitalium, имеющей около 500 генов, примерно треть не имеют гомологии с генами с известными функциями, и их роли пока неясны. Так что полное секвенирование геномов даже микроорганизмов имеет не только практическое приложение в медицине, но и открывает новые перспективы фундаментальных исследований

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: БАКТЕРИИ
ГЕНОМ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.01-04Б1.321

Complete nucleotide sequence of simian endogenous type D retrovirus with intact genome organization: Evidence for ancestry to simian retrovirus and baboon endogenous virus [Text] / der Kuyl Antoinette C. van [et al.] // J. Virol. - 1997. - Vol. 71, N 5. - P3666-3676 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Полная нуклеотидная последовательность эндогенного ретровируса обезьян типа D с интактной организацией генома: свидетельства того, что он является предком ретровируса обезьян и эндогенного вируса бабуинов
Аннотация: Сообщается о выделении из геномной библиотеки бабуина полного генома эндогенного вируса типа D. Провирус, эндогенный ретровирус обезьян (SERV), состоит из 8939 нуклеотидов. Он содержит два длинных концевых повтора с полными последовательностями для генов gag, pro, pol и env. Подобно лентививирусам, сайт, связывающийся с праймером, комплементарен тРНК{Лиз}[3]. Белок env GP70 высокогомологичен белку эндогенного вируса бабуинов (BaEV). ПЦР-анализ ДНК приматов выявил наличие родственных провирусных последовательностей у обезьян Старого Света подсемейства Cercopithecinae, но не у бесхвостых обезьян и человека. Анализ последовательностей вирусов и их хозяев показал, что провирусные геномы унаследованы от общего предка. Сравнение эволюции BaEV, эндогенных вирусов обезьян типов 1-3 (SRV-1, SRV2, SRV3) и SERV свидетельствует, что SERV является предком как для BaEV, так и для SRV-вирусов. Методом предельных разведений и двойной ПЦР кол-во копий генома SERV определено в 142-235 копий провируса на диплоидный геном бабуина. Нидерланды, Dep. of Human Retrovirol., Acad. Med. Centre, 1105 AZ Amsterdam. Библ. 48

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.23.07
Рубрики: РЕТРОВИРУСЫ
ЭНДОГЕННЫЙ РЕТРОВИРУС ОБЕЗЬЯН ТИПА D
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ГЕНОМНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
van, der Kuyl Antoinette C.; Mang, Rui; Dekerd, John T.; Goudsmit, Jaap

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.02-04Б2.128

O'Brien, C.
Entire E. coli genome sequenced - at last [Text] / C. O'Brien // Nature. - 1997. - Vol. 385, N 6616. - P472 . - ISSN 0028-0836
Перевод заглавия: Наконец секвенирован полный геном E. coli
Аннотация: Две группы, одна, возглавляемая Фредом Блаттнером из США, и другая, возглавляемая Такаши Хоруши в Японии, независимо друг от друга сделали заявления о секвенировании полного генома бактерии Escherichia coli. Каждая группа поместила свои результаты в общественные базы данных. В то время как Блаттнер описал полный геном только одной линии, последовательность, секвенированная в Японии - гибрид более чем из одной линии, причем 35%, по-видимому, взято из данных Блаттнера. До того как были начаты эти проекты (1989 г.), тысячи исследователей во всем мире уже секвенировали 10% генома благодаря высокой роли этой бактерии в биологических исследованиях. Работа Блаттнера зависела от методов, изобретенных им самим по необходимости. Предварительные (неопубликованные) результаты группы Блаттнера показывают, что последовательность содержит многие гены с неизвестной функцией. Профессор биохимии Гордон Дуган сказал, что детальная последовательность будет полезным руководством к изучению "эволюции вирулентности" в патогенных линиях E. coli

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.07
Рубрики: ГЕНОМ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
БАЗЫ ДАННЫХ

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.07-04Б1.272

Complete nucleotide sequence and molecular characterization of the temperate staphylococcal bacteriophage 'ФИ'PVL carrying Panton-Valentine leukocidin genes [Text] / Jun Kaneko [et al.] // Gene. - 1998. - Vol. 215, N 1. - P57-67 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Полная нуклеотидная последовательность и молекулярная характеристика умеренного бактериофага 'ФИ'PVL стафилококков, несущего гены лейкоцидина Пантона-Валентина
Аннотация: Определена полная нуклеотидная последовательность генома фага 'ФИ'PVL из Staphylococcus aureus V8. Установлены сайты attL, attR и attB для сайт-специфичной интеграции 'ФИ'PVL в хромосому хозяина. Линейная днДНК 'ФИ'PVL имеет длину 41401 п. н. с 3'-выступающими липкими концами cos длиной 9 н. и содержит 63 открытые рамки считывания. Идентифицированы гены регуляторных белков, участвующих в репликации ДНК, структурных белков, холина, лизина, интегразы (int) и дУТфазы. На сегменте длиной 4,0 т. п. н. в центре генома (на одинаковом расстоянии от правого и левого сайтов cos) расположены гены [lukS-PV-lukF-PV] лейкоцидина Пантона-Валентина, attP и int. Область attP содержит 5 прямых повторов, высокогомологичных сайтам связывания рекомбиназы нек-рых др. фагов S. aureus. Геном 'ФИ'PLV интегрируется в ген неизвестного клеточного белка длиной 725 остатков с 2 мотивами, похожими на лейциновую застежку. Япония, Dep. Appl. Biol. Chem., Fac. Agr., Tohoku Univ., Sendai 981-8555. Библ. 31

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.11
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
УМЕРЕННЫЙ ФАГ 'ФИ'PVL
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ
STAPHYLOCOCCUS AUREUS V8 (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kaneko, Jun; Kimura, Takahiro; Narita, Sachiko; Tomita, Toshio; Kamio, Yoshiyuki

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.08-04Б1.333

Li, Lingyun.
Measles virus (Nepal strain) hemagglutinin gene: Cloning, complete nucleotide sequence analysis and expression in COS cells [Text] / Lingyun Li, Yipeng Qi // Wuhan Univ. J. Natur. Sci. - 1998. - Vol. 3, N 3. - P377-382 . - ISSN 1007-1202
Перевод заглавия: Ген гемагглютинина вируса кори (штамм Непал): клонирование, анализ полной нуклеотидной последовательности и экспрессия в клетках COS
Аннотация: Сообщается о секвенировании после ОТ-ПЦР-амплификации гена гемагглютинина (H) штамма Непал, выделенного в 1997 г. из крови б-ного во время вспышки кори на юге Непала, унесшей жизни 50 детей. Ген клонирован в вектор экспрессии pCD-SR'альфа'296 и интродуцирован методом электропорации в клетки COS-7. Экспрессию и функцию клонированного гена H исследовали методом гемадсорбции. Сравнение нуклеотидной последовательности со стандартным штаммом Эдмонтон показало гомологию последовательности в 98,7%. Выявлено 3 важных мутации: замена аминокислотных остатков в позициях 169, 211 и 416, способная вызвать изменение в гликозилировании белка H, могла повлиять на иммунный ответ. С другой стороны, штамм Непал имеет те же мутации в остатках 211, 243, 252, 276, 284, 296, 302, 416 и 616, что и штаммы Chi-1, SanD и Chi-2. Т. обр., H-белки современных диких штаммов вируса кори имеют константные генетические изменения относительно вакцинного штамма 1954 г., следствием чего может быть снижение протективной способности вакцинного штамма и, как результат, новые вспышки заболевания. КНР, Coll. of Life Sci., Wuhan Univ., Wuhan 430072. Библ. 11

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.37
Рубрики: ВИРУС КОРИ
ГЕМАГГЛЮТИНИНЫ
ГЕНЫ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ЭКСПРЕССИЯ
КУЛЬТУРА КЛЕТОК

Доп.точки доступа:
Qi, Yipeng

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.08-04Б2.200

Karp, Peter D.
Computational prediction of metabolic pathways from genomic sequence [Text] : abstr. Annu. Fall Meet. Biomed. Eng. Soc., San Diego, Calif., Oct. 2-5, 1997 / Peter D. Karp // Ann. Biomed. Eng. - 1997. - Vol. 25, Suppl. n1. - P69 . - ISSN 0090-6964
Перевод заглавия: Компьютерное предсказание метаболических путей из геномной последовательности Haemophilus influenzae
Аннотация: Разработан метод предсказания метаболич. путей (МП) организма на основании его полной геномной последовательности и базы данных известных МП. Этот метод применен к геному Haemophilus influenzae. Получены сильные доказательства существования H. influenzae 46 из 81 известных МП Escherichia coli и частичные доказательства для еще 14 путей. Разработана электронная энциклопедия HinCya генов и МП H. influenzae. США, Artificial Intelligence Ctr., SRI Internat., Menlo Park, CA

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
МЕТАБОЛИЧЕСКИЕ ПУТИ
ПРЕДСКАЗАНИЕ
МЕТОД
РАЗРАБОТКА
HAEMOPHILUS INFLUENZAE (BACT.)

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.08-04Б2.207

Identification of genes in the complete genomic DNA sequence of a hyper-thermophilic archaeon, Pyrococcus sp. OT3 [Text] / Yuko Ohfuku [et al.] // Proc. Jap. Acad. B. - 1998. - Vol. 74, N 5. - P90-95 . - ISSN 0386-2208
Перевод заглавия: Идентификация генов в полной геномной последовательности ДНК гипертермофильного архея Pyrococcus sp. OT3
Аннотация: Для анализа полной геномной последовательности Pyrococcus sp. OT3 длиной 1 758 505 п. н. применен алгоритм идентификации транскрипц. единиц, т. е. независимо регулируемых открытых рамок считывания (ОРС) и оперонов, а также псевдогенов. Идентифицированы 1819 ОРС и 51 ген РНК. 42% ОРС гомологичны генам белков с известными функциями и 31% - известным ОРС с неизвестной функцией, а 27% ОРС не имеют гомологов. Япония, AIST-NIBHT, CREST Ctr. Structural Biol., Tsukuba 305-0046. Библ. 2

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ
ОПЕРОНЫ
ПСЕВДОГЕНЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
PYROCCOCUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Ohfuku, Yuko; Koike, Hideaki; Azuma, Yoshinao; Kawashima, Tsuyoshi; Kudo, Norio; Amano, Naoki; Kakinuma, Jun; Suckow, Jorg Michael; Suzuki, Masashi

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.134

A genome-based approach for the identification of essential bacterial genes [Text] / Fabrizio Arigoni [et al.] // Nature Biotecnol. - 1998. - Vol. 16, N 9. - P851-856 . - ISSN 1087-0156
Перевод заглавия: Основанный на [секвенировании] генома подход к идентификации важных бактериальных генов
Аннотация: У 12 видов бактерий выяснена полная нуклеотидная последовательность генома, и работы ведутся еще на 42 видах. Благодаря этому развивается новая научная дисциплина - биоинформатика, позволяющая для каждого гена делать предсказания о его функциях. Обнаружен ряд генов с неизвестными функциями, крайне консервативных у многих видов микроорганизмов. Сделано предположение, что среди них должны быть гены, необходимые для жизни клетки. У Escherichia coli идентифицировано 26 таких генов, высококонсервативных и у Mycoplasma genitalium. Конструирование делеций по этим генам и встраивание их в геном позволило выбрать из них гены, необходимые для выживания. Так было выбрано 6 генов, и их необходимость для жизни клетки подтверждена путем конструирования условно летальных мутаций. Ортологичные гены оказались также необходимы для выживания Bacillus subtilis. Т. обр., сочетая компьютерный анализ с молекулярной генетикой, удалось идентифицировать новые гены, необходимые для выживания бактерий в богатой среде, к-рые отвечают критериям подбора мишеней для действия антибиотиков. Германия, (Loferer H.), Genome Pharmaceut. Corp., Munich. Библ. 34

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМ
ГЕНЫ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Arigoni, Fabrizio; Talabot, Francois; Peitsch, Manuel; Edgerton, Michael D.; Meldrum, Eric; Allet, Elisabeth; Fish, Richard; Jamotte, Therese; Curchod, Marie-Laure; Loferer, Hannes

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.169

Complete nucleotide sequence of the Hsd plasmid pECO29 and identification of its functional regions [Text] / Marina V. Zakharova [et al.] // Biochim. et biophys. acta. Gene Struct. and Express. - 1998. - Vol. 1398, N 2. - P106-112 . - ISSN 0167-4781
Перевод заглавия: Полная нуклеотидная последовательность Hsd-плазмиды pECO29 и идентификация ее функциональных районов
Аннотация: Небольшая многокопийная плазмида pECO29 была выделена из клинического изолята Escherichia coli 29k и относится к плазмидам, определяющим ДНК-специфичность хозяина (Hsd), кодирующим гены эндонуклеазы и метилазы. Полная нуклеотидная последовательность pECO29 состоит из 3895 п. н. Она включает 4 гена и пять сайтов. Два гена, кодирующие рестрикционную эндонуклеазу и ДНК-метилтрансферазу были охарактеризованы ранее. Плазмида pECO29 имеет репликативную систему типа ColE1 и кодирует нетранслируемые гены РНКI и РНКII, содержит рекомбинационный сайт emr, включающий палиндромные последовательности, участвующие в стабильном поддержании плазмиды, два псевдо-oriT-сайта, гомологичные oriT плазмид R6K и F, а так же bom-локус плазмиды типа CofEI. Россия, Ин. Биохим., Физиол. Микроорг., РАН, Пущино, Моск. обл. 142292. Библ. 24

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА PECO29
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ РАЙОНЫ

Доп.точки доступа:
Zakharova, Marina V.; Pertzev, Alexander V.; Kravetz, Anatoly N.; Beletskaya, Irina V.; Shlyapnikov, Michael G.; Solonin, Alexander S.

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.10-04Б1.160

Molecular analysis of Methanobacterium phage 'пси'M2 [Text] / Peter Pfister [et al.] // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 30, N 2. - P233-244 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Молекулярный анализ фага 'ПСИ'M2 Methanobacterium
Аннотация: Определена полная нуклеотидная последовательность (26111 п. н.) геномной днДНК фага 'ПСИ'M2 из Methanobacterium thermoautotrophicum. Идентифицирована 31 открытая рамка считывания (ОРС). Все ОРС транскрибируются в одном направлении. Сравнение предсказанных аминок-тных последовательностей с известными белками и поиск консервативных мотивов позволили приписать функции продуктам 6 ОРС. Три ОРС кодируют белки упаковки ДНК в капсиды, две - структурные белки и одна - белок из семейства Int сайт-специфич. рекомбиназ. Анализ N-концевых аминок-тных последовательностей 3 фаговых белков идентифицировать 2 гена структурных белков и ген peiP псевдомуреинэндоизопептидазы (I). I участвует в лизисе клеток хозяина и относится к новому семейству ферментов. Ген peiP гиперэкспрессирован в Escherichia coli. Показано, что его продукт катализирует лизис in vitro клеток M. thermoautotrophicum. Сравнение последовательности ДНК 'ПСИ'M2 с частичной последовательностью ДНК фага 'ПСИ'M1 дикого типа показало, что 'ПСИ'M2 является делец. производным, образовавшимся в результате гомологич. рекомбинации между 2 копиями прямого повтора. Швейцария, Inst. Microbiol., Swiss Federal Inst. Technol. Zurich, CH-8092 Zurich. Библ. 64

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ ФИ M2
ГЕНОМ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ГЕНЫ
ГЕН ПСЕВДОМУРЕИНЭНДОИЗОПЕПТИДАЗЫ PEIP
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ФУНКЦИЯ
METHANOBACTERIUM THERMOAUTOTROPHICUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Pfister, Peter; Wasserfallen, Alain; Stettler, Rolf; Lesinger, Thomas

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.10-04Б1.202

The complete nucleotide sequence of 'фи'CTX, a cytotoxin-converting phage of Pseudomonas aeruginosa: Implications for phage evolution and horizontal gene transfer via bacteriophages [Text] / Keisuke Nakayama [et al.] // Mol. Microbiol. - 1999. - Vol. 31, N 2. - P399-419 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Полная нуклеотидная последовательность цитотоксин-конвертирующего фага 'ФИ'СТХ Pseudomonas aeruginosa: следствия для эволюции фагов и горизонтального переноса генов через бактериофаги
Аннотация: Определена полная нуклеотидная последовательность генома фага 'ФИ'СТХ Pseudomonas aeruginosa длиной 35538 п. н. с 5'-выступающими концами длиной 25 н. В геноме 'ФИ'СТХ идентифицированы 47 открытых рамок считывания (ОРС), включая известные гены ctx и int. Продукты 15 ОРС обнаружены в вирионах методом микросеквенирования белков. Геном 'ФИ'СТХ очень похож на геномы кодифага Р2 и родственных фагов: 25 ОРС на 28,9-65,8% идентичны генам Р2. Порядок генов в геноме у 'ФИ'СТХ и Р2 высококонсервативен, хотя у СТХ содержание ГЦ и частота использования кодонов такие же, как у Ps. aeruginosa. 'ФИ'СТХ похож на Р2 по морфологии, не индуцибелен и использует для связывания с клетками сердцевинный олигосахарид липополисахарида, причем связывание с рецептором требует Ca{2+}. Эти данные показали, что 'ФИ'СТХ является Р2-подобным фагом, хорошо адаптированным к Ps. aeruginosa, и подтвердили межродовое распространение в эволюции фагов. Сравнение структуры геномов 'ФИ'СТХ, Р2 и родственных Р2 фагов обнаружило несколько горячих точек встраивания чужеродных ДНК, включен ген цитотоксина. Япония, Dep. Bacteriol., Shinshu Univ. Sch. Med., Matsumoto 390-8621. Библ. 79

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ЦИТОТОКСИН-КОНВЕРТИРУЮЩИЙ ФАГ ФИ CTX
ГЕНОМ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
СТРУКТУРА
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Nakayama, Keisuke; Kanaya, Shigehiko; Ohnishi, Makoto; Terawaki, Yoshiro; Hayashi, Tetsuya

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.11-04Б2.117

Moszer, Ivan.
The complete genome of Bacillus subtilis: From sequence annotation to data management and analysis [Text] / Ivan Moszer // FEBS Lett. - 1998. - Vol. 430, N 1-2. - P28-36 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Целый геном Bacillus subtilis: от аннотации последовательностей к управлению данными и их анализу
Аннотация: Обзор. Описано применение методов биоинформатики к полностью секвенированному геному Bacillus subtilis длиной 4200 т. п. н.: 1) методы и стратегии аннотации генов и обнаружения ошибок секвенирования с использованием интегрированной кооперативной компьютерной среды Imagene; 2) создание специализированной базы данных для управления данными на сервере Subtidist в сети Интернет для извлечения данных; 3) анализ последовательности ДНК (состава оснований, олигонуклеотидных сдвигов, повторяющихся последовательностей и использования кодонов). Франция, Unite Regulation Expression Genetique, Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 48

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
АННОТАЦИЯ ГЕНОВ
СПЕЦИАЛИЗИРОВАННАЯ БАЗА ДАННЫХ
СОЗДАНИЕ
СТРУКТУРА ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 00.01-04В2.21

Kotani, H.
Lessons from sequencing of the genome of a unicellular cyanobacterium, Synechocystis sp. PCC6803 [Text] / H. Kotani, S. Tabata // Annu. Rev. Plant Physiol. and Plant Mol. Biol. - Palo Alto (Calif.), 1998. - Vol. 49. - P151-171 . - ISBN 0-8243-0649-X
Перевод заглавия: Уроки из секвенирования генома одноклеточной цианобактерии Synechocystis sp. PCC 6803
Аннотация: Обзор. Определена полная нуклеотидная последовательность генома Synechocystis sp. PCC 6803. Длина кольцевого генома равна 3573480 п. н. Компьютерный анализ генома идентифицировал 3168 генов, кодирующих белки. На основании гомологии последовательностей с известными генами удалось приписать определенные ф-ции 45% генов. Обсуждаются особые признаки генетич. информации у цианобактерий, филогенетически родственных как бактериям, так и растениям. Япония, Kazusa DNA Res. Inst., Kisarazu, Chiba 292. Библ. 74

ГРНТИ	34.29.15

ВИНИТИ 341.29.15.15.19
Рубрики: ГЕНОМ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ
ФУНКЦИИ
ГЕНЫ
SYNECHOCYSTIS (ALGAE)
ШТАММ РСС 6803
ЦИАНОБАКТЕРИИ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 74
CYANOPHYTA (ALGAE)

Доп.точки доступа:
Tabata, S.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 00.01-04Б4.179

Young, Douglas B.
Blueprint for the white plague [Text] / Douglas B. Young // Nature. - 1998. - Vol. 393, N 6685. - P515-516 . - ISSN 0028-0836
Перевод заглавия: План для белой чумы
Аннотация: Обзор. Полное секвенирование генома Mycobacterium tuberculosis открыло возможность для разработки новых стратегий борьбы с туберкулезом. Великобритания, Dep. Infections Diseases and Microbiol., Imperial Coll. Med., London W2 1PG. Библ. 12

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.25.09
Рубрики: ТУБЕРКУЛЕЗ
ЛЕЧЕНИЕ
ГЕНОМ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS (BACT.)
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 12

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.03-04Б1.69

Hashimoto, Yoshifumi.
DNA sequence analysis Plutella xylostella granulovirus [Text] / Yoshifumi Hashimoto, Tomonori Fujita, Yasumasa Ueno // RIKEN Rev. - 1999. - N 22. - P30-33 . - ISSN 0919-3405
Перевод заглавия: Анализ последовательности ДНК грануловируса Plutella xylostella
Аннотация: Определена полная нуклеотидная последовательность генома грануловируса Plutella xylostella (PxCV). Геном, состоящий из 100 999 п. н., содержит 120 открытых рамок считывания (ОРС), способных кодировать полипептиды в 50 и более аминокислот. 57 из этих ОРС являются общими с пятью другими бакуловирусами. Сравнительный анализ показал, что 19 ОРС, расположенные между 48,5 и 83,4 единицами карты, имеют много сходства с таковыми четырех вирусов ядерного полиэдроза. В геноме PxCV выявлены также 4 высококонсервативные гомологичные области, состоящие из повторяющейся последовательности. Япония, Dep. of Applied Biology, Kyoto Inst. of Technol. Библ. 6

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: БАКУЛОВИРУСЫ
ГРАНУЛОВИРУС PLUTELLA XYLOSTELLA
ДНК ГЕНОМНАЯ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ
ВЫСОКОКОНСЕРВАТИВНЫЕ ОБЛАСТИ
ПОВТОРЯЮЩИЕСЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

Доп.точки доступа:
Fujita, Tomonori; Ueno, Yasumasa

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска