СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ПЛАЗМИДА PWWO<.>)

Общее количество найденных документов : 15
Показаны документы с 1 по 15

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.03-04Б2.265

Catabolite repression of the toluene degradation pathway in Pseudomonas putida harboring pWW0 under various conditions of nutrient limitation in chemostat culture [Text] / Wouter A. Duetz [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 1996. - Vol. 62, N 2. - P601-606 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Катаболитная репрессия при разложении толуола Pseudomonas putida, несущим плазмиду pWWO, в различных условиях лимитирования неорганическим субстратом в хемостатной культуре
Аннотация: Описана катаболитная репрессия сукцинатом метаболического пути разложения толуола и м- и п-ксилола (путь TOL) в хемостате при скорости разбавления 0,05 ч в условиях лимитирования неорганическим субстратом. Активность дегидрогеназы бензилового спирта (ДБС) в экстрактах клеток использована в качестве меры экспрессии TOL-пути. При выращивании клеток в присутствии 10-15 мМ сукцината в условиях лимитирования фосфатом или сульфатом активность ДБС (в ответ на неметаболизируемый индуктор о-ксилол) составила 2% от активности клеток, выращенных в условиях лимитирования сукцинатом. Менее сильная репрессия наблюдалась в условиях лимитирования аммонием или кислородом (2-10% или 20-35% соответственно от уровня активности ДБС при лимитировании сукцинатом). Экспрессия ДБС довольно хорошо коррелирует с содержанием транскрипта мРНК с верхнего промотора пути TOL. Это указывает на то, что репрессия обусловлена блокировкой на уровне транскрипции. Путь мета-расщепления менее сильно подвержен катаболитной репрессии. Результаты свидетельствуют, что катаболитная репрессия скорее связана с высокоэнергетичным статусом клеток, чем с высокой скоростью роста или прямо с присутствием насыщающих конц-ий первичных источников углерода и энергии. Нидерланды, Lab. for Waste Materials and Emissions, Natl. Inst. Public Health and Environmental Protection. P.O. Box 1, 3720 BA Bilthoven. Библ. 35

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.15 + 341.27.19.09
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ШТАММ ATCC 33015
ПЛАЗМИДА PWWO
ТОЛУОЛ
РАЗЛОЖЕНИЕ
МЕТРАБОЛИЧЕСКИЕ ПУТИ
КАТАБОЛИТНАЯ РЕПРЕССИЯ
ХЕМОСТАТНОЕ КУЛЬТИВИРОВАНИЕ
ЛИМИТИРОВАНИЕ НЕОРГАНИЧЕСКИМ СУБСТРАТОМ

Доп.точки доступа:
Duetz, Wouter A.; Marques, Silvia; Wind, Bea; Ramos, Juan L.; Van, Andel Johan G.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 97.03-04Б3.224

Catabolite repression of the toluene degradation pathway in Pseudomonas putida harboring pWW0 under various conditions of nutrient limitation in chemostat culture [Text] / Wouter A. Duetz [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 1996. - Vol. 62, N 2. - P601-606 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Катаболитная репрессия при разложении толуола Pseudomonas putida, несущим плазмиду pWWO, в различных условиях лимитирования неорганическим субстратом в хемостатной культуре
Аннотация: Описана катаболитная репрессия сукцинатом метаболического пути разложения толуола и м- и п-ксилола (путь TOL) в хемостате при скорости разбавления 0,05 ч в условиях лимитирования неорганическим субстратом. Активность дегидрогеназы бензилового спирта (ДБС) в экстрактах клеток использована в качестве меры экспрессии TOL-пути. При выращивании клеток в присутствии 10-15 мМ сукцината в условиях лимитирования фосфатом или сульфатом активность ДБС (в ответ на неметаболизируемый индуктор о-ксилол) составила 2% от активности клеток, выращенных в условиях лимитирования сукцинатом. Менее сильная репрессия наблюдалась в условиях лимитирования аммонием или кислородом (2-10% или 20-35% соответственно от уровня активности ДБС при лимитировании сукцинатом). Экспрессия ДБС довольно хорошо коррелирует с содержанием транскрипта мРНК с верхнего промотора пути TOL. Это указывает на то, что репрессия обусловлена блокировкой на уровне транскрипции. Путь мета-расщепления менее сильно подвержен катаболитной репрессии. Результаты свидетельствуют, что катаболитная репрессия скорее связана с высокоэнергетичным статусом клеток, чем с высокой скоростью роста или прямо с присутствием насыщающих конц-ий первичных источников углерода и энергии. Нидерланды, Lab. for Waste Materials and Emissions, Natl. Inst. Public Health and Environmental Protection. P.O. Box 1, 3720 BA Bilthoven. Библ. 35

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.17.21
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ШТАММ ATCC 33015
ПЛАЗМИДА PWWO
ТОЛУОЛ
РАЗЛОЖЕНИЕ
МЕТРАБОЛИЧЕСКИЕ ПУТИ
КАТАБОЛИТНАЯ РЕПРЕССИЯ
ХЕМОСТАТНОЕ КУЛЬТИВИРОВАНИЕ
ЛИМИТИРОВАНИЕ НЕОРГАНИЧЕСКИМ СУБСТРАТОМ

Доп.точки доступа:
Duetz, Wouter A.; Marques, Silvia; Wind, Bea; Ramos, Juan L.; Van, Andel Johan G.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.06-04Б2.92

Gumley, Andrew W.
Cold shock proteins and cold acclimation proteins in the psychrotrophic bacterium Pseudomonas putida Q5 and its transconjugant [Text] / Andrew W. Gumley, William E. Inniss // Can. J. Microbiol. - 1996. - Vol. 42, N 8. - P798-803 . - ISSN 0008-4166
Перевод заглавия: Белки холодового шока и белки акклиматизации к холоду у психротрофной бактерии Pseudomonas putida Q5 и ее трансконъюганта
Аннотация: У психротрофной бактерии Pseudomonas putida Q5 и ее производного Q5T, содержащего TOL-плазмиду pWWO, определяли синтез белков холодового шока (csps) и белков акклиматизации к холоду (caps). При снижении т-ры от 30 до 0'ГРАДУС'С разницы в скорости роста у этих двух штаммов не наблюдалось. При снижении т-ры от 25 до 5'ГРАДУС'С или при постоянном росте при 5'ГРАДУС'C у обоих штаммов определялся синтез 16 белков. При постоянном росте при 25'ГРАДУС'С у шт. Q5T уровень синтеза ряда белков был ниже, чем у шт. Q5. При холодовом шоке или при постоянном росте при 5'ГРАДУС'С csps и caps синтезировались в шт. Q5T в больших кол-вах, чем в исходном штамме. Похоже, что сама плазмида pWWO детерминирует синтез белков холодового шока. Канада [Inniss W. E.], Dep. of Biol., Univ. of Waterloo, Waterloo, ON N2L 3G1. Библ. 26

ГРНТИ	34.27.19

ВИНИТИ 341.27.19.13.09
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ШТАММ Q5
ШТАММ Q5T
БЕЛОК
БЕЛКИ ХОЛОДОВОГО ШОКА
БЕЛКИ ХОЛОДОВОЙ АККЛИМАТИЗАЦИИ
СИНТЕЗ
ХРОМОСОМНАЯ ДЕТЕРМИНАЦИЯ
ПЛАЗМИДНАЯ ДЕТЕРМИНАЦИЯ
ПЛАЗМИДА PWWO

Доп.точки доступа:
Inniss, William E.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.10-04Б2.200

Bertoni, Giovanni.
Activation of the toluene-responsive regulator XylR causes a transcriptional switch between 'сигма'{54} and s{70} promoters at the divergent Pr/Ps region of the TOL plasmid [Text] / Giovanni Bertoni, Silvia Marques, Lorenzo Victor de // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 27, N 3. - P651-659 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Активация чувствительного к толуолу регулятора XylR переключает транскрипцию между промоторами 'сигма'{54} и 'сигма'{70} в промежуточной области Pr/Ps плазмиды TOL
Аннотация: Исследовали механизм, при помощи к-рого реагирующий на толуол XylR, активатор 'сигма'{54}-зависимых промоторов Pu и Ps из TOL-плазмиды pWWO Pseudomonas, переключается на свой собственный 'сигма'{70}-зависимый промотор Pr. Была разработана система транскрипции in vitro для воспроизведения репрессии Pr, наблюдаемой в присутствии и в отсутствие индуктора XylR, бензил-алкоголя. ДНК-матрицы, несущие 2 участка связывания РНК-полимеразы из Pr, к-рые перекрывали предшествующие, активирующие последовательности XylR в дивергентном промоторе 'сигма'{54} Ps, транскрибировались в присутствии конститутивно активного варианта XylR с делетированным N-концевым доменом. Добавление АТФ усиливало репрессию Pr при помощи XylR. Отмечена активация дивергентного промотора Ps во время регуляции Pr с помощью делетированного варианта XylR. Испания, Ctr. Nac. Biotech.-CSIC, Campus Cantoblanco, 28049 Madrid. Библ. 54

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА TOL
ПЛАЗМИДА PWWO
ТРАНСКРИПЦИЯ
ПРОМОТОРЫ 'СИГМА'{53}- И 'СИГМА'{70}-ЗАВИСИМЫЕ
ОБЛАСТЬ PR/PS
ПЕРЕКЛЮЧЕНИЕ
АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ XYLR
ТОЛУОЛ-ЧУВСТВИТЕЛЬНЫЙ
АКТИВАЦИЯ
PSEUDOMONAS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Marques, Silvia; de, Lorenzo Victor

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.03-04Б2.418

Marques, Silvia.
Role of 'сигма'{S} in transcription from the positively controlled Pm promoter of the TOL plasmid of Pseudomonas putida [Text] / Silvia Marques, M.Trinidad Gallegos, Juan L. Ramos // Mol. Microbiol. - 1995. - Vol. 18, N 5. - P851-857 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Роль [фактора] 'сигма'{s} в транскрипции с положительно контролирующегося промотора Pm TOL-плазмиды Pseudomonas putida
Аннотация: У Pseudomonas putida TOL-плазмида pWWO придает бактерии способность расти на 3-метилбензоате. Гены пути метаболизма 3-метилбензоата объединены в один оперон под контролем промотора Pm. Экспрессия его положительно регулируется белком XylS в присутствии исходных субстратов - 3- и 4-метилбензоата. TOL-плазмида экспрессирована в ряде мутантов Escherichia coli с различными нарушениями 'альфа'- и 'бета'-субъединиц РНК-полимеразы. Показано, что мутационные повреждения 'альфа'-субъединицы не влияют на транскрипцию с промотора Pm. У мутантов, дефектных по фактору 'сигма'{s}, высокий уровень транскрипции наблюдался в ранней логарифмич. фазе роста, а затем снижался, в отличие от дикаря, обладающего высоким уровнем экспрессии в течение всего роста. Этот дефект можно было устранить введением плазмиды с геном rpoS. Также, эффект падения экспрессия исчезал, если вводили определенные мутации в промотор Pm, или в ген-регулятор xylS. Похоже, что для транскрипции с промотора Pm необходимы по крайней мере 2 'сигма'-фактора: 'сигма'{70} - в ранней логарифмической фазе, и 'сигма'{s} - в последующих фазах. Испания, [Ramos J. L.], Consejo Super. de Invest. Cient'иота'ficas, Dep. of Biochem. and Mol. and Cell. Biol. of Plants, DOT Group, Estacion Experimental del Zaidin, Apartado Correos 419, E-18008 Granada. Библ. 29

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.31.09
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДЫ TOL
ПЛАЗМИДА PWWO
ПРОМОТОР PM
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РНК-ПОЛИМЕРАЗА
ФАКТОРЫ 'СИГМА'
ФАКТОР 'СИГМА'{S}

Доп.точки доступа:
Gallegos, M.Trinidad; Ramos, Juan L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.552

Two identical copies of IS1246, a 1275 base pair sequence related to other bacterial insertion sequences, enclose the xyl genes on TOL plasmid pWW0 [Text] / B.Rajasekhar Reddy [et al.] // Microbiology. - 1994. - Vol. 140, N 9. - P2305-2307 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Две идентичных копии IS1246, последовательности [длиной] 1275 пар оснований, родственной другим инсерционным последовательностям бактерий, фланкируют гены xyl на TOL-плазмиде pWW0
Аннотация: TOL-плазмида pWW0 Pseudomonas putida содержит 2 прилегающих друг к другу оперона xylCMABN и xylXYZLTEGFJQKIH, детерминирующие способность утилизировать толуол и нек-рые его алкилзамещенные производные. Обнаружено 2 идентичных прямых повтора размером 1275 н. п., ограничивающих район оперонов xyl. Эти повторы названы IS1246. В них найдены концевые инвертированные повторы по 12 н. п. и открытая рамка считывания размером 280 кодонов. Эта рамка в значительной степени гомологична генам, кодируемым различ. инсерционными последовательностями из Bacteroides, Neisseria и Escherichia coli. Великобритания, (Williams P. A.) School of Biol. Sci., Univ. of Wales, Bangor LL57 2UW. Библ. 15

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.31.09
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДЫ TOL
ПЛАЗМИДА PWWO
ИНСЕРЦИОННАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ IS1246
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ГОМОЛОГИЯ
ТОЛУОЛ
ДЕГРАДАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Reddy, B.Rajasekhar; Shaw, Linda E.; Sayers, Jon R.; Williams, Peter A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.07-04Б2.252

Carmona, Manuel.
Involvement of the FtsH (HflB) protease in the activity of 'сигма'{54} promoters [Text] / Manuel Carmona, Lorenzo Victor de // Mol. Microbiol. - 1999. - Vol. 31, N 1. - P261-270 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Участие протеазы FtsH (HflB) в активности промоторов E'сигма'{54}
Аннотация: Изучено влияние in vivo протеазы FtsH (I) на регуляцию зависящего от 'сигма'{54} (II) промотора Pu плазмиды pWWO. В клетках Escherichia coli, лишенных I, слияние Pu-lacZ не активируется связывающимся с энхансером белком XylR (III). Однако внутриклеточные конц-ии II и III и их физич. целостность одинаковы независимо от присутствия или отсутствия I. Утрата активности Pu в мутанте ftsH не вызвана нарушением баланса 'сигма'-факторов, обусловленным отсутствием I. Мутанты ftsH не могут использовать глутамин (IV) в кач-ве единственного источника N и у них не индуцируются зависящие от II промоторы PnifH и PpspA под действием NifA и PspF соотв. Эти дефекты полностью комплементируются плазмидой ftsH{+}. Т. обр. часть плейотропного фенотипа клеток, не имеющих I, соответствует отсутствию активности I. Гиперпродукция II восстанавливает активность промотора Pu и рост на IV мутанта ftsH. Эти данные позволили предположить, что активность H контролируется in vivo взаимодействием факторов, к-рые в конечном итоге определяют активность родственных промоторов в данных физиологич. условиях. Испания, Ctr. Nac. Biotechnol., CSIC, 28049 Madrid. Библ. 60

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПЛАЗМИДА PWWO
СТРУКТУРА
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
ПРОМОТОРЫ
ПЛАЗМИДНЫЙ ПРОМОТОР PU
АКТИВАЦИЯ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ФЕРМЕНТЫ
ПРОТЕАЗА FTSH
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
de, Lorenzo Victor

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.04-04Б2.245

Garmendia, Junkal.
The role of the interdomain B linker in the activation of the XylR protein of Pseudomonas putida [Text] / Junkal Garmendia, Lorenzo Victor de // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 38, N 2. - P401-410 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Роль междоменного B линкера в активации белка XylR Pseudomonas putida
Аннотация: В присутствии толуола и его структурных аналогов взаимодействующий с энхансером белок XylR активирует 'сигма'{54} промотор Pu плазмиды pWWO - TOL (деградация толуола) Pseudomonas putida. Аминокислотные замены Val-219Asp Ala-220Pro в области междоменного линкера B приводят к изменению функций XylR: практически утрачивается способность активировать промотор Pu в отсутствии ароматического эффектора, возрастает чувствительность к m-ксилену и увеличивается спектр ароматических индукторов. Эти изменения не являются следствием отклонений в уровне экспрессии белка-активатора или случайного возникновения нового промотора. Замена аминокислот A220-N221 на пептид HHHR приводит к усугублению вышеописанного фенотипа. Полученные данные подтверждают модель, в которой линкер B изменяет профиль эффекторов путем модификации на расстоянии оперативной формы области связывания эффектора и фиксации белка на промежуточной стадии процесса активации. Испания, Dep. Microbiol Biotech., Cent. Nac. Biotechnol. CSIC, Campus Cantoblanco, 28049 Madrid. Библ. 33

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ПРОМОТОР
PU
АКТИВАЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
БЕЛОК XYL R
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ПЛАЗМИДА PWWO

Доп.точки доступа:
de, Lorenzo Victor

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.04-04Б2.254

Evidence of multiple regulatory functions for the PtsN (IIA{Ntr}) protein of Pseudomonas putida [Text] / Ildefonso Cases [et al.] // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 3. - P1032-1037 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Доказательство множественных регуляторных функций белка PtsN (IIA{Ntr}) Pseudomonas putida
Аннотация: Ген ptsN Pseudomonas putida кодирует белок IIA{Ntr}, белок фосфоенолпируват:сахарофосфотрансферазной системы, которая требуется для ингибирования c 'сигма'{54}-зависимого промотора Pu TOL плазмиды (деградация толуата) pWWO. Используя двухмерный электрофорез, рассмотрели влияние разрушения гена ptsN на главный образец экспрессии P. putida. Клетки выращивали в присутствии или отсутствовали глюкозы и набор из 1,117 спотов протеомы P. putida был использован как референс для сравнения. Среди всех генных продуктов, чья экспрессия была уменьшена углеродным источником - [из 247 спотов (около 22%)] только 6 вели себя как при наличии Pu (т. е. были депрессированы на фоне ptsN). Таким образом доказали только минорную роль IIA{Ntr} в продолжительном ингибировании экспрессии генов P. putida, вызванном глюкозой. Однако те же самые эксперименты позволили обнаружить значительное падение глюкозонезависимых эффектов, вызванных мутацией ptsN. 108 спотов (9% проанализированных клеточных продуктов) находились под положительным или негативным влиянием потери IIA{Ntr}. При скрещивании этого образца со штаммом rpoN::'лямбда'Km P. putida, не имеющего белка 'сигма'{54}, показали, что большинство белков, чья экспрессия находилась под влиянием ptsN были неродственны альтернативному фактору 'сигма'. Эти данные позволяют предположить, что IIA{Ntr} играет роль главного регулятора, независящего от присутствия репрессивных углеродных источников и неограниченного 'сигма'{54}-зависимых генов. Испания, Ceptro Nacional de Biotechnol. Csil, 28049, Madrid. Библ. 31

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН БЕЛКА IIA{NTR} PTSN
РАЗРУШЕНИЕ
ВЛИЯНИЕ НА
'СИГМА'{54}-ЗАВИСИМЫЙ ПРОМОТОР PU
ПЛАЗМИДА PWWO
ЭКСПРЕССИЯ
БЕЛОК
IIA{NTR}
РЕГУЛЯТОРНАЯ РОЛЬ
МНОЖЕСТВЕННОСТЬ
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Cases, Ildefonso; Lopez, Juan-Antonio; Albar, Juan-Pablo; De, Lorenzo Victor

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.02-04Б2.290

Monitoring intracellular levels of XylR in Pseudomonas putida with a single-cahin antibody specific for aromatic-responsige enhancer-binding proteins [Text] / Sofia Fraile [et al.] // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 19. - P5571-5579 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Мониторинг внутриклеточного уровня XylR у Pseudomonas putida с одноцепочечным антителом, специфичным для белков связывающихся с отвечающим на ароматические соединения энхансером
Аннотация: Сегменты ДНК, кодирующие вариабельные V-домены иммуноглобулинов, экспрессируемых у мышей после иммунизации C-концевой половиной белка TouR (I) Pseudomonas stutzeri OX1, амплифицировали и перестроили in vitro в гены одноцепочечных антител scFv. Сконструированную библиотеку scFv экспрессировали в системе дисплея фага M13 и обогатили с использованием I. Выделили клон B7, имеющий высокое сродство к I и белку XylR (II) - регулятору верхнего оперона TOL плазмиды pWWO. Это антитело B7 (III) узнает пептид TPRAQATLLRLV, к-рый характерен для группы связывающихся с энхансером белов, отвечающих на ароматич. вещества (напр. на I и II), и расположен рядом с уокеровским мотивом B. III использовано для прямого измерения внутриклеточного уровня II экспрессируемого с природного промотора однокопийным геном у Ps. putida. На внутриклеточный фонд II влияют стадия роста, физич. форма белка и присутствие или отсутствие ароматич. индукторов в среде. Число молекул II составляет от 'ЭКВИВ'30 в экспоненциальной фазе роста в экспоненциальной фазе до 'ЭКВИВ'140 в стационарной фазе. Активация II ароматич. индукторов понижает внутриклеточную конц-ию II. Уровень конститутивно активного варианта II (XylR'ДЕЛЬТА'A) выше (от 'ЭКВИВ'90 до 'ЭКВИВ'570 молекул на клетку в зависимости от фазы роста). Эти данные согласуются с моделью транскрипционной авторегуляции II и позволяют предположить существование механизмов, контролирующих стабильность II in vitro. Испания, Ctr. Nac. Biotechnol., CSIC, Cantoblanco, 28949 Madrid. Библ. 43

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.31.09
Рубрики: БИОДЕГРАДАЦИЯ
ТОЛУОЛ
МЕХАНИЗМ
ПЛАЗМИДА PWWO
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ВЕРХНИЙ ОПЕРОН TOL
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ XYLR
ФУНКЦИЯ
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Fraile, Sofia; Roncal, Fernando; Fernandez, Louis A.; de, Lorenzo Victor

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.12-04Б2.120

Novel insights into the interplay between peripheral reactions encoded by xyl genes and the chlorocatechol pathway encoded by tfd genes for the degradation of chlorobenzoates by Ralstonia eutropha JMP134 [Text] / Thomas Ledger [et al.] // Microbiology. - 2002. - Vol. 148, N 11. - P3431-3440 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Новый взгляд на взаимодействие между периферическими реакциями, кодируемыми генами xyl и хлорокатехольным путем, кодируемым генами tfd, при деградации хлоробензоатов Ralstonia eutropha JMP134
Аннотация: Многие бактерии могут трансформировать хлорароматические соединения в хлорокатехолы, которые затем разрушаются ферментами специализированного пути ortho. Ralstonia eutropha JMP134 способна расти на 3-хлоробензоате, используя два pJP4-кодируемые ortho-разрезающие хлоркатехольные генных кластера (tfdC[I]D[I]E[I]F[I] и tfdD[II]C[II]E[II]F[II]). Исследовали влияние на катаболизм в R. eutropha JMP134 производных, которые получаются при действии генного локуса xylS-xylYZL, кодирующего плазмиды pWWO толуат 1,2-диоксигеназу (xylXYZ) и 1,2-дигидро 1,2-дигидрокситолуат дегидрогеназу (xylL), экспрессия которых регулируется геном xylS. Эти ферменты участвуют в трансформации 4-хлоробензоата в 4-хлорокатехол. Производный штамм рос на 3,5-дихлорбензоате, субстрате для XylXYZL, но не на индукторе регуляторного белка XylS. Наблюдения над другими производными штамма JMP134 показали, что хотя и происходит усиление катаболических свойств R. eutropha, эти новые свойства сильно зависят от дозы генов tfd, присутствия хромосомного xylS-подобного регуляторного элемента и различных вкладов генных кластеров tfd. Чили, Lab. de Microbiol., Dep. de Genetica Mol. Microbiologia, Facultad de Ciencias Biol., Pontificia Univ. Catolica de Chile, Casilla 114-D Santiago. Библ. 45

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.31.09
Рубрики: БИОДЕГРАДАЦИЯ
ХЛОРОБЕНЗОАТЫ
МЕХАНИЗМ
ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ПЛАЗМИДА PJP4
ГЕНЫ ХЛОРКАТЕХОЛЬНОГО КЛАСТЕРА TFD
ПЛАЗМИДА PWWO
ГЕНЫ ТРАНСФОРМАЦИИ 4-ХЛОРБЕНЗОАТА XYL
ФУНКЦИЯ
RALSTONIA EUTROPHA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Ledger, Thomas; Pieper, Dietmar H.; Perez-Pantoja, Danilo; Gonzalez, Bernardo

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.07-04Б2.194

Valls, Marc.
Transient XylR binding to the UAS of the Pseudomonas putida 'дельта'{54} promoter Pu revealed with high intensity UV footprinting in vivo [Text] / Marc Valls, Lorenzo Victor de // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 23. - P6926-6934 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Временное связывание XylR с UAS'дельта'{54} промотора Pu Pseudomonas putida, выявленное с помощью нового метода геномных отпечатков с применением УФ высокой интенсивности in vivo
Аннотация: Исследовали in vivo связывание транскрипционного регулятора с родственной последовательностью (UAS)'дельта'{54} - зависимого промотора Pu Pseudomonas putida. Применили новый метод футпринтирования, который использует короткие экспозиции бактериальных клеток под диффузным УФ-светом высокой интенсивности, вызывающим образование димеров ТТ в ТС. Показали, что белок XylR не постоянно связывается in vivo с сайтом - мишенью в Pu, в отличие от интегративного хозяйского фактора (IHF), связывающего Pu в стационарную фазу. Только сверхэкспрессия XylR, вызванная фотореактивацией соответствующего района ДНК, свидетельствует о стабильном связывании регулятора с UAS. Однако присутствие ароматических XylR-индукторов приводит к реверсии. Полученные данные привели к заключению о временном взаимодействии XylR с UAS. Испания, Dep. of Microbial Biotechnology, Centro Nacional de Biotecnologia del Consejo Superior de Investigaciones Cientificas (CSIC), Campus de Cantoblanco, 28049 Madrid. Библ. 57

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: БИОДЕГРАДАЦИЯ
ТОЛУОЛ
КСИЛЕН
МЕХАНИЗМ
ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ПЛАЗМИДА PWWO
ОПЕРОН MT-2 TOL
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ XYLR
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
de, Lorenzo Victor

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.02-04Б2.404

Williams, Peter A.
Loss of the toluene - xylene catabolic genes of TOL plasmid pWWO during growth of Pseudomonas putida on benzoate is due to a selective growth advantage of "Cured" sergegants [Text] / Peter A. Williams, Susan D. Taylor, Linda E. Gibb // J. Gen. Microbiol. - 1988. - Vol. 134, N 7. - P2039-2048
Перевод заглавия: Утрата генов, ответственных за катаболизм толуола - ксилола, TOL-плазмиды pWWO при росте Pseudomonas putida на бензоате происходит вследствие преимущественного селективного роста "излеченных" сегрегантов
Аннотация: При росте на минимальной среде с бензоатом P. putida mt2 (PaW1) образуются сегреганты, утратившие способность использовать катаболический путь, кодируемый плазмидой pWWO. Эксперименты с дериватами pWWO со вставкой Tn401 (устойчивость к карбенициллину) показали, что указанный "бензоатный" эффект связан с делецией участка pWWO (39 т.н.п.), содержащего катаболические гены. Этот эффект не возникал, если в качестве источников углерода были использованы сукцинат или пропионат, а также при одновременном использовании бензоата и сукцината. При росте шт. PaW174, который содержит pWWO без "катаболического" участка, не происходило утраты плазмиды. При совместном росте Кл PaW1 и PaW174 отмечался преимущественный рост PaW174 даже если первоначально Кл этого штамма составляли 1% от всех Кл. Сделан вывод, что описанный эффект связан с тем, что сегреганты, лишенные катаболических генов pWWO, растут быстрее, чем Кл дикого типа, которые не используют катаболич. механизмы, кодируемые хромосомой. Ил. 5. Табл. 3. Библ. 23. Великобритания, Dep. of Biochemistry & Soil Science, Univ. College of North Wales, Bangor, Gwynedd LL57 2UW.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ШТАММ MT - 2
СЕЛЕКТИВНЫЙ РОСТ
БЕНЗОАТ
ПЛАЗМИДА PWWO
ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ГЕН КАТАБОЛИЗМА ТОЛУОЛА - КСАЛОЛА
ПОТЕРЯ ГЕНОВ

Доп.точки доступа:
Taylor, Susan D.; Gibb, Linda E.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.12-04Б2.610

Harayama, Shigeaki.
The meta cleavage operon of TOL degradative plasmid pWWO comprises 13 genes [Text] / Shigeaki Harayama, Monique Rekik // Mol. and Gen. Genet. - 1990. - Vol. 221, N 1. - P113-120 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Оперон meta-расщепления плазмиды pWWO TOL-деградации состоит из 13 генов
Аннотация: Исследовали генетич. организацию оперона meta-расщепления плазмиды TOL pWWO Pseudomonas puticla методом клонирования в экспрессирующем векторе с идентификацией продуктов генов в макси-клетках Escherichia coli. Показали, что этот оперон состоит из 13 генов. Идентифицировали продукты этих генов. Показали, что большая часть ДНК в опероне состоит из кодирующих последовательностей. Ил. 3. Библ. 3.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ПЛАЗМИДА PWWO
ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН META-РАСЩЕПЛЕНИЯ
ОРГАНИЗАЦИЯ
ПРОДУКТЫ ГЕНОВ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Rekik, Monique

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.12-04Б2.599

Benjamin, Robert C.
Nucleotide sequence of xylE from the TOL pDK1 plasmid and structural comparison with isofunctional catechol-2,3-dioxygenase genes from TOL pWWO and NAH7 [Text] / Robert C. Benjamin, John A. Voss, Daniel A. Kunz // J. Bacteriol. - 1991. - Vol. 173, N 8. - P2724-2727 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Нуклеотидная последовательность xylE из TOL плазмиды pDK1 и сравнение структуры с изофункциональными генами катехол-2,3-диоксигеназы из TOL плазмид pWWO и NAH7
Аннотация: Определена нуклеотиднач последовательность гена xylE TOL плазмиды pDK1 Pseudomonas putida. Степень гомологии с генами xylE и nahH плазмид pWWO и NAH7 была равна 81,5 и 78% соотв. Наибольшая степень гомологии нуклеотидной последовательности 3 генов наблюдалась в области, состоящей из 264 нуклеотидов и кодирующей С-конец соответствующих катехол-2,3-диоксигеназ. При сравнении отдельных областей было показано, что гены xylE и xylE[1] более похожи в С-концевой области, а гены xylE[р] и nahH высокогомологичны в N-концевой области. Обсуждается эволюция генов катехол-2,3оксигеназы. Ил. 3. Табл. 1. Библ. 23. США, Dep. of Biol. Sci., Univ. of North Texas, Denton, TX, 76203.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.31.09
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ГЕН XYLE КАТЕХОЛ-2,3-ДИОКСИГЕНАЗЫ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
СРАВНЕНИЕ
ЭВОЛЮЦИЯ
ПЛАЗМИДЫ БИОДЕГРАДАЦИИ
ПЛАЗМИДА PWWO
ПЛАЗМИДА PDK1
ПЛАЗМИДА NAH7
ТОЛУОЛ
БИОДЕГРАДАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Voss, John A.; Kunz, Daniel A.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска