СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Horak, Rita$<.>)

Общее количество найденных документов : 8
Показаны документы с 1 по 8

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.08-04Б2.220

Horak, Rita.
Expression of the transposase gene tnpA of Tn4652 is positively affected by integration host factor [Text] / Rita Horak, Maia Kivisaar // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 11. - P2822-2829 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: На экспрессию гена транспоназы tnpA Tn4652 положительно влияет хозяйский фактор интеграции
Аннотация: Секвенирован ген транспоназы (I) tnpA транспозона Tn4652. Его промотор картирован на правом конце транспозона. I Tn4652 на 96,2% идентична I Tn5041 и лишь на 20-24% др. I семейства Tn3. Это оказало, что Tn4652 и Tn5041 отдаленно родственны членам семейства Tn3. Промотор tnpA активен в Pseudomonas putida, но не в Escherichia coli. Его активность позитивно модулируется хозяйским фактором интеграции IHF (II), сайт связывания к-рого расположен с 5'-стороны от промотора tnpA. Усиление транскрипции tnpA сайтом связывания не наблюдается в мутанте ihfA Ps. patida (штамм А8759). Терминальные последовательности Tn4652 негативно влияют на транскрипцию с промотора tnpA в мутанте ihfA. В системе связывания in vitro найдено, что оба конца Tn4652 связывают II из лизата клеток E. coli. Эстония, Estonia Bioctr., Tartu Univ., EE2400 Tartu. Библ. 48

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСПОЗОНЫ
ТРАНСПОЗОН TN4652
ТРАНСПОЗИЦИЯ
ФЕРМЕНТЫ
ТРАНСПОНАЗА
СИНТЕЗ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕН ТРАНСПОНАЗЫ TNPA
РЕГУЛЯЦИЯ
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kivisaar, Maia

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.01-04Б2.230

Kallastu, Aili.
Identification and characterization of IS1411, a new insertion sequence which causes transcriptional acivation of the phenol degradation genes in Pseudomonas putida [Text] / Aili Kallastu, Rita Horak, Maia Kivisaar // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 20. - P5306-5312 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Идентификация и характеристика новой инсерционной последовательности IS1411, вызывающей транскрипционную активацию генов деградации фенола у Pseudomons putida
Аннотация: С 3'-стороны от генов pheBA деградации фенола на плазмиде из Psendomonas sp. EST1001 обнаружен новый инсерц. элемент IS1411. Секвенирование показало, что он относится к новому семейству ISL3 и содержит на концах инвертированные повторы 24 п. н., высокогомологичные повторам др. членов этого семейства. IS1411 порождает дупликацию 8 п. н. мишенной ДНК. IS1411 был обнаружен по транскрипц. активации беспромоторных генов pheBA в Ps. putida. На левом конце IS1411 имеются направленные наружу промоторы с консенсусной последовательностью для 'сигма'{70} Escherichia coli. IS1411 может образовывать кольца. Образование колец усиливается, если 2 полные копии элемента находятся на одной плазмиде. Эстония, Bioctr. and Inst. Mol. and Cell Biol., Tartu Univ., EE2400 Tartu. Библ. 47

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: МОБИЛЬНЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЭЛЕМЕНТЫ
ИНСЕРЦИОННАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ IS1411
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ВЛИЯНИЕ НА
ГЕНЫ
ГЕНЫ ДЕГРАДАЦИИ ФЕНОЛА PHEBA
ТРАНСКРИПЦИОННАЯ АКТИВАЦИЯ
PSEUDOMONAS (BACT.)
SP. ШТАММ EST1001

Доп.точки доступа:
Horak, Rita; Kivisaar, Maia

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.10-04Б2.260

Horak, Rita.
Regulation of the transposase of Tn4652 by the transposon-encoded protein TnpC [Text] / Rita Horak, Maia Kivisaar // J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 20. - P6312-6318 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Регуляция транспоназы Tn4562 белком TnpC, кодируемым транспозоном
Аннотация: Показано, что количество транспоназы Tn4562 в клетках Pseudomonas putida контролируется кодируемым транспозоном белком TnpC длиной 120 остатков. Ген tnpC расположен сразу за геном транспоназы tnpA. Белок TnpC очень похож на предполагаемый белок, кодируемый транспозоном Tn5041 устойчивости к Hg. Вестерн-блот показал, что кол-во транспоназы TnpA понижено в 10 раз на фоне tnpC{+}. C использованием транскрипционных и трансляционных слияний tnpA с репортерским геном gusA установлено, что TnpC участвует в регуляции транспоназы Tn4562 на посттранскрипционном уровне. Эстония, Dep. Genet., Tartu Univ., 51010 Tartu. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСПОНАЗА TN4562
КОЛИЧЕСТВО
РЕГУЛЯЦИЯ
БЕЛОК TNPC
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kivisaar, Maia

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.07-04Б2.281

Teras, Riho.
Transcription form fusion promoters generated during transposition of transposon Tn4652 is positively affected by integration host factor in Pseudomonas putida [Text] / Riho Teras, Rita Horak, Maia Kivisaar // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 3. - P589-598 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: На транскрипцию с составных промоторов, порожденных во время транспозиции транспозона Tn4652, позитивно влияет хозяйский фактор интеграции у Pseudomonas putida
Аннотация: Транспозон Tn4652 может активировать молчащие гены, создавая во время транспозиции составные промоторы из блока -35 в концевых инвертированных повторах Tn4652 и блоков -10 в мишенной ДНК. Для изучения механизма активации транскрипции использованы составные промоторы PRA1 и PLA1, к-рые содержат соотв. последовательности из правого и левого концов Tn4652. Методом сдвига ЭФ-подвижности обнаружено специфич. связывание хозяйского фактора интеграции IHF (I) с концами Tn4652. I повышает скорость транскрипции с промотора PRA1. Этот эффект наблюдается только тогда, когда клетки Pseudomonas putida достигают стационарной фазы роста. Высказано предположение, что для влияния I на транскрипцию с составных промоторов in vivo критична внутриклеточная конц-ия I. В случае промотора PLA1 механизм модуляции транскрипции под действием I не такой, как в случае PRA1. Эти данные показали, что транскрипция соседних генов из направленных вовне промоторов на концах мобильного элемента ДНК влияют те же факторы, к-рые контролируют транспозицию элемента. Эстония, Dep. Genet., Inst. Mol. and Cell Biol., Tartu Univ., 51010 Tartu. Библ. 46

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПРОМОТОРЫ
СОСТАВНОЙ ПРОМОТОР PRA1
СОСТАВНОЙ ПРОМОТОР PLA1
ТРАНСКРИПЦИЯ
АКТИВАЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
ХОЗЯЙСКИЙ ФАКТОР ИНТЕГРАЦИИ IHF
ФУНКЦИЯ
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Horak, Rita; Kivisaar, Maia

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.09-04Б2.105

Ilves, Heili.
Involvement of 'сигма'{S} in starvation-induced transposition of Pseudomonas putida transposon Tn4652 [Text] / Heili Ilves, Rita Horak, Maia Kivisaar // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 18. - P5445-5448 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Участие 'сигма'{S} в индуцированной голоданием транспозиции транспозона Tn4652 Pseudomonas putida
Аннотация: Показано, что транспозиция Tn4652 усиливается у Pseudomonas putida во время стационарной фазы и подавляется в изогенном мутанте, дефектном по 'сигма'-фактору стационарной фазы 'сигма'{S} (I). Показано, что I контролирует транскрипцию с промотора гена транспоназы Tn4652. Полученные данные подтвердили предположение, что активация транспозиции в стрессовых условиях может являться индуцибельным процессом. Эстония, Inst. Mol. and Cell Biol., Tartu Univ., 51010 Tartu. Библ. 24

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: ТРАНСПОЗОНЫ
ТРАНСПОЗОН TN 4652
ТРАНСПОЗИЦИЯ
МЕХАНИЗМ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
ФАКТОР СИГМА S
ФУНКЦИЯ
АКТИВАЦИЯ ТРАНСПОЗИЦИИ
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Horak, Rita; Kivisaar, Maia

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.11-04Б2.264

IHF is the limiting host factor in transposition of Pseudomonas putida transposon Tn4652 in stationary phase [Text] / Helli Lives [et al.] // Mol. Microbiol. - 2004. - Vol. 51, N 6. - P1773-1785 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: IHF является лимитирующим хозяйским фактором транспозиции транспозона Tn4652 Pseudomonas putida в стационарной фазе
Аннотация: Ранее показали, что транспозиция Tn4652 в клетках Pseudomonas putida является событием, специфичным для стационарной фазы, и нуждается в функциональной 'сигма'{s}. Авт. показано, что транспозиция Tn4652 в стационарной фазе существенно ограничивается количеством IHF. В штаммах, дефектных по ihfA, транспозиции не происходит. Сверхэкспрессия ihf приводит к значительно большей активности транспозиции, чем в клетках дикого типа. С помощью метода сдвига подвижности в геле и футпринтинга ДНКазой I показали, что IHF необходим для связывания транспозазы с обоими концами транспозона. Транспозаза in vitro может связываться с инвертированными повторами транспозона только после того, как свяжется с IHF. Полученные результаты показывают, что IHF является хозяйским фактором, участвующим в усилении транспозиции Tn4652 в стационарной фазе P. putida. Эстония, Estonian Bioctr Inst. Molec. Cell Biol., Tartu Univ., 51010 Tartu. Библ. 71

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ТРАНСПОЗОНЫ
TN4652
ТРАНСПОЗИЦИЯ
БЕЛОК
ХОЗЯЙСКИЙ ФАКТОР ИНТЕГРАЦИИ IHF
ЛИМИТИРУЮЩИЙ ХОЗЯЙСКИЙ ФАКТОР
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
СТАЦИОНАРНАЯ ФАЗА РОСТА

Доп.точки доступа:
Lives, Helli; Horak, Rita; Teras, Riho; Kivisaar, Maia

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.02-04Б2.295

The ColR-ColS two-component signal transduction system is involved in regulation of Tn4652 transposition in Pseudomonas putida under starvation conditions [Text] / Rita Horak [et al.] // Mol. Microbiol. - 2004. - Vol. 54, N 3. - P795-807 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Система двухкомпонентной сигнальной трансдукции ColR-ColS участвует в регуляции транспозиции Tn4652 в Pseudomonas putida в условиях голодания
Аннотация: Установили, что такой процесс реорганизации генома, как транспозиция, может контролироваться определенными внешними сигналами, улавливаемыми системой двухкомпонентной сигнальной трансдукции. Показали, что зависимое от транспозиции накопление фенол-утилизирующих мутантов несколько уменьшается в штаммах Pseudomonas putida, дефектных по двухкомпонентной системе colRS. Транслокация Tn4652 уменьшалась в colR и colS-дефектных штаммах, свидетельствуя, что сигнальная трансдукция от гистидинкиназы ColS к регулятору ответа ColR необходима для активации Tn4652 в бактериях, голодающих по фенолу. Однако, сверхэкспрессия ColR в colS-дефектных штаммах восстанавливала транспозицию Tn4652, подтвердив этим, что отсутствие сигнала от ColS может компенсироваться повышенным количеством ColR. Показали, что консервативный H221 может быть фосфорилакцепторным остатком в ColS, а остатки аспартата D8 и D51 ColR необходимы для фосфопереноса из ColS в ColR. Таким образом, Tn5652 - первый бактериальный транспозон, регулируемый двухкомпонентной системой. Эстония, Estonian Biocentre and Unst. of Mol. and Cell Biol., Tartu Univ. 51010

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: АДОПТАЦИЯ
ГОЛОДАНИЕ ПО ФЕНОМУ
МЕХАНИЗМ
ТРАНСПОЗОНЫ
TN4652
ТРАНСПОЗИЦИЯ
БЕЛОК
БЕЛКИ СИСТЕМЫ СИГНАЛЬНОЙ ТРАНСДУКЦИИ COLR-COLS
ФУНКЦИЯ
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Horak, Rita; Ilves, Hili; Pruunsild, Priit; Kuljus, Martin; Kivisaar, Maia

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.09-04Б2.244

Kivistik, Paula Ann.
Target site selection of Pseudomonas putida transposon Tn4652 [Text] / Paula Ann Kivistik, Maia Kivisaar, Rita Horak // J. Bacteriol. - 2007. - Vol. 189, N 10. - P3918-3921 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Отбор сайтов-мишеней транспозона Tn4652 Pseudomonas putida
Аннотация: Проанализировали предпочтительные мишени транспозона Tn4652 Pseudomonas putida из семейства транспозонов Tn3. Выравнивание 93 различных сайтов инсерции позволило выявить совокупность последовательностей, имеющих сходство с Tn3, и показывающее, что несмотря на низкую степень сходства между транспозазами Tn4652 и Tn3, их сайты-мишени консервативны. Эстония, Estonian Biocentre and Inst. of Molecular and Cell Biology, Tartu Univ., 51010 Tartu. Библ. 33

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: ТРАНСПОЗОНЫ TN4652
ВСТАВКА
СХОДСТВО
TN3
МИШЕНИ
САЙТЫ
КОНСЕРВАТИВНОСТЬ
ОТБОР
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kivisaar, Maia; Horak, Rita

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска