Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ<.>)
Общее количество найденных документов : 13
Показаны документы с 1 по 13
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.05-04Б1.64

    Kost, Rhonda G.
    Varicella-zoster virus gene 63: Transcript mapping and regulatory activity [Text] / Rhonda G. Kost, Helen Kupinsky, Stephen E. Straus // Virology. - 1995. - Vol. 209, N 1. - P218-224 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Ген 63 вируса ветряной оспы-герпеса зостер: картирование транскрипта и регуляторная активность
Аннотация: Предранний ген ORF63 вируса ветряной оспы-герпеса зостер (ВВОГЗ) гомологичен гену ICP22 вируса простого герпеса типа 1. Идентифицированы 2 транскрипта ORF 63, один из к-рых имеет длину 0,9 т. н. и содержит только ORF 63, а второй (1,8 т. н.) соответствует смежным генам ORF 63 и ORF 64. В положениях -88 и -157 относительного стартового кодона АТГ гена ORF 63 обнаружены 2 стартовых точки транскрипции. Идентифицированы 2 потенциальных ТАТА-элемента. При преходящей трансфекции промотор ORF 63 слабо активируется ORF 4 и ORF 62 ВВОГЗ под контролем собственных промоторов, более сильно активируется ORF 62 под контролем конститутивного промотора цитомегаловируса и синергично активируется при совместной экспрессии ORF 4 и ORF 62. Ген ORF 63 под контролем собственного промотора или промотора вируса SV 40 слабо влияет на предранние и ранние промоторы ВВОГЗ, не вызывает авторегуляции и не ингибирует промотор ORF 62. Эти данные показали, что ORF 63 играет ограниченную роль в экспрессии генов ВВОГЗ. США, Lab. of Clin. Investigation, NIAID, NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 32
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ВЕТРЯНОЙ ОСПЫ-ГЕРПЕСА ЗОСТЕР
ГЕНЫ
ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ
РЕГУЛЯТОРНАЯ АКТИВНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Kupinsky, Helen; Straus, Stephen E.
2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.02-04Б1.53

   
    Partial transcriptional mapping of the fowlpox virus genome and analysis of the EcoRI L fragment [Text] / Jennifer Zantinge [et al.] // J. Gen. Virol. - 1996. - Vol. 77, N 4. - P603-614 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Частичное транскрипционное картирование генома вируса чумы птиц и анализ фрагмента EcoRI-L
Аннотация: Методом дифференциальной гибридизации с кДНК транскриптов, синтезирующихся на ранней и/или поздней стадиях заражения клеток QT-35 вирусом чумы птиц (ВЧП), отобрано несколько фрагментов ДНК ВЧП с сильно транскрибируемыми генами. Фрагмент EcoRI-L содержит 3 таких гена: N-конец поздней открытой рамки считывания (ОРС) L1L (1452 п. н.), раннюю/позднюю ОРС L2R (522 п. н.) и позднюю ОРС L3R (948 п. н.). Продукты ОРС L1L, L2R и L3R гомологичны, соответственно, продуктам генов H4L (RAP94), H5R (Ag35) и H6R (топоизомераза) вируса осповакцины (ВОВ). 5{'}-некодирующие области L1L и L3R богаты АТ и содержат последовательность 5{'}-ТАААТГ-3{'}, перекрывающуюся со стартовым сайтом транскрипции. Стартовые сайты транскрипции ранней и поздней мРНК L2R картированы на расстоянии 14 п. н. с 3{'}-стороны от последовательности ААААТТГААААААААА, похожей на ранний промотор ВОВ. На расстоянии 20 п. н. перед стартовым кодоном АТГ L2R найден элемент ТАААТ, похожий на элемент поздней транскрипции ВОВ. Сконструирована плазмида, несущая слияние раннего промотора L2R с репортерским геном (кДНК гемагглютинина-нейраминидазы HN вируса болезни Ньюкасла). В клетках CEF, зараженных ВЧП и обработанных цитозинарабинозидом, она дает в 6 раз больше мРНК HN, чем плазмида с промоторами Р7.5 или Р11 ВОВ. С промотора L2R экспрессируется такое же кол-во мРНК HN, как и с промоторов ВОВ на поздней стадии заражения. Канада, Dep. of Vet. Microbiol. and Immunol., Univ. of Guelph, Ontario, N1G 2W1. Библ. 39
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ЧУМЫ ПТИЦ
ГЕНОМ ВИРУСНЫЙ
ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Zantinge, Jennifer; Krell, Peter J.; Derbyshire, Brian J.; Nagy, Eva
3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.09-04Б1.240

   
    Nucleotide sequence, insertional mutagenesis, and transcriptional mapping of a conserved region of the baculovirus Autographa californica nuclear polyhedrosis virus (map unit 64.8-66.9) [Text] / Albert Lu [et al.] // Can. J. Microbiol. - 1996. - Vol. 42, N 12. - P1267-1273 . - ISSN 0008-4166
Перевод заглавия: Нуклеотидная последовательность, инсерционный мутагенез и транскрипционное картирование консервативной области бакуловируса ядерного полиэдроза Autographa californica (64,8-66,9 единиц карты)
Аннотация: Секвенирована область генома варианта HR3 вируса ядерного полиэдроза (ВЯП) A. californica (ВЯП-Ас) длиной 2773 п. н. (64,4-68,2 ед. карты), расположенная между ранее изученными генами p6.9 и p80. Обнаружены 3 открытые рамки считывания, к-рые колируют белки с мол. м. 45000 (I), 40000 (II) и 12000 (III). 5'-концы транскриптов, кодирующих I и III, картированы в консенсусных стартовых сайтах поздней транскрипции (АТААГ), а главный 5'-конец транскрипта, кодирующего II, - на расстоянии 16 п. н. с 3'-стороны от другого стартового сайта поздней транскрипции (ГТААГ). Попытки получить рекомбинанты ВЯП-Ас со вставками в этих 3 генах оказались неудачными, так что гены существенны для репликации ВЯП-Ас в культуре клеток. По размеру и организации транскриптов эта область генома ВЯП-Ас очень похожа на описанную ранее гомологичную область ВЯП Orgiya pseudotsugata (ВЯП-Ор). I-III гомологичны соотв. белкам с мол. м. 48000, 45000 и 12000 ВЯП-Ор. Это указывает на высокую консервативность этой области у бакуловирусов. Канада, Dept. of Microbiol. and Immunol., Queen's Univ., Kingston, ON K7L 3N6. Библ. 26
ГРНТИ  
34.25.29
ВИНИТИ 341.25.29.17.11
Рубрики: БАКУЛОВИРУСЫ
ВИРУС ЯДЕРНОГО ПОЛИЭДРОЗА
ГЕНОМ
КОНСЕРВАТИВНАЯ ОБЛАСТЬ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ИНСЕРЦИОННЫЙ МУТАГЕНЕЗ
ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Lu, Albert; Craig, Andrew; Casselman, Richard; Carstens, Eric B.
4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.08-04Б1.274

   
    Transcription mapping of the Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (human herpesvirus 8) genome in a body cavity-based lymphoma cell line (BC-1) [Text] / Ronit Sarid [et al.] // J. Virol. - 1998. - Vol. 72, N 2. - P1005-1012 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Транскрипционное картирование генома ассоциированного с саркомой Капоши герпесвируса (герпесвируса человека типа 8) в линии клеток ВС-1 лимфомы, основанной на полости тела
Аннотация: Методом Нозерн-гибридизации с зондами ДНК герпесвируса человека типа 8 (ГВЧ-8), за исключением неклонируемой области длиной 3 т. п. н. на правом конце, изучена транскрипция генов ГВЧ-8 в линии клеток лимфомы ВС-1. Идентифицированы 3 главных класса транскриптов ГВЧ-8. Гены класса I (v-циклина, ассоциированного с латентностью ядерного антигена и v-FLIP) конститутивно транскрибируются в стандартных условиях роста независимо от обработки тетрадеканолилфорболацетатом (I). Их транскрипты являются латентными транскриптами ГВЧ-8. Гены класса II, кодирующие маленькие полиаденилированные РНК Т0.7 и Т1.1, большинство цитокинов и белков передачи сигнала, сгруппированы в консервативных областях генома. Эти гены транскрибируются и без обработки I, но уровень их транскрипции повышается после обработки I. Гены класса III являются генами структурных белков и белков репликации, транскрибируются только после обработки I и ответственны за литическую продукцию вирионов ГВЧ-8. Эти данные показали, что в неиндуцированных клетках ВС-1 транскрибируются многие гены ГВЧ-8, участвующие в клеточных путях передачи сигнала и регуляции. США, Dep. Pathol., Columbia Univ. Coll. Physicians and Surgeons, New York, NY 10032. Библ. 39
ГРНТИ  
34.25.29
ВИНИТИ 341.25.29.17.09
Рубрики: ГЕРПЕСВИРУСЫ
ГЕРПЕСВИРУС ЧЕЛОВЕКА ТИПА 8
ГЕНОМ ВИРУСНЫЙ
ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ
ЛИМФОИДНЫЕ КЛЕТКИ

Доп.точки доступа:
Sarid, Ronit; Flore, Ornella; Bohenzky, Roy A.; Chang, Yuan; Moore, Patrick S.
5.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 99.08-04Н1.300

   
    Transcription mapping of the Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (human herpesvirus 8) genome in a body cavity-based lymphoma cell line (BC-1) [Text] / Ronit Sarid [et al.] // J. Virol. - 1998. - Vol. 72, N 2. - P1005-1012 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Транскрипционное картирование генома ассоциированного с саркомой Капоши герпесвируса (герпесвируса человека типа 8) в линии клеток ВС-1 лимфомы, основанной на полости тела
Аннотация: Методом Нозерн-гибридизации с зондами ДНК герпесвируса человека типа 8 (ГВЧ-8), за исключением неклонируемой области длиной 3 т. п. н. на правом конце, изучена транскрипция генов ГВЧ-8 в линии клеток лимфомы ВС-1. Идентифицированы 3 главных класса транскриптов ГВЧ-8. Гены класса I (v-циклина, ассоциированного с латентностью ядерного антигена и v-FLIP) конститутивно транскрибируются в стандартных условиях роста независимо от обработки тетрадеканолилфорболацетатом (I). Их транскрипты являются латентными транскриптами ГВЧ-8. Гены класса II, кодирующие маленькие полиаденилированные РНК Т0.7 и Т1.1, большинство цитокинов и белков передачи сигнала, сгруппированы в консервативных областях генома. Эти гены транскрибируются и без обработки I, но уровень их транскрипции повышается после обработки I. Гены класса III являются генами структурных белков и белков репликации, транскрибируются только после обработки I и ответственны за литическую продукцию вирионов ГВЧ-8. Эти данные показали, что в неиндуцированных клетках ВС-1 транскрибируются многие гены ГВЧ-8, участвующие в клеточных путях передачи сигнала и регуляции. США, Dep. Pathol., Columbia Univ. Coll. Physicians and Surgeons, New York, NY 10032. Библ. 39
ГРНТИ  
76.29.49
ВИНИТИ 761.29.49.21.11.02
Рубрики: ГЕРПЕСВИРУСЫ
ГЕРПЕСВИРУС ЧЕЛОВЕКА ТИПА 8
ГЕНОМ ВИРУСНЫЙ
ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ
ЛИМФОИДНЫЕ КЛЕТКИ

Доп.точки доступа:
Sarid, Ronit; Flore, Ornella; Bohenzky, Roy A.; Chang, Yuan; Moore, Patrick S.
6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.01-04Б1.72

   
    Nucleotide sequence, genome organization, and transcription map of bovine adenovirus type 3 [Text] / P.Seshidhar Reddy [et al.] // J. Virol. - 1998. - Vol. 72, N 2. - P1394-1402 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Нуклеотидная последовательность, организация генома и транскрипционная карта бычьего аденовируса типа 3
Аннотация: Определена полная нуклеотидная последовательность ДНК бычьего аденовируса типа 3 (БАВ-3) длиной 34 446 п. н. (содержание ГЦ - 54%). Все гены ранней и поздней областей организованы в 7 сегментов, а не в 5, как у аденовирусов (АВ) человека. По предсказанным аминокислотным последовательностям продукты открытых рамок считывания (ОРС) в поздних областях, ранней области Е2 и в IVa2 высокогомологичны соответствующим белкам др. АВ. Высокая гомология отсутствует для продуктов ОРС в областях Е1, Е3 и Е4 и белков pIX, нити и 33 кД. Белок основания пентона не имеет мотива RGD связывания интегрина и содержит мотив LDV вместо MDV. Как и у др. АВ животных, у БАВ-3 гены РНК VAI отсутствуют в их ожидаемом положении. Секвенирование клонов кДНК генов ранних и поздних областей идентифицировало донорные и акцепторные сайты сплайсинга, сигналы и сайты полиоденилирования и 3-частные лидерные последовательности. Канада, VIDO, Univ. Saskatchewan, Saskatoon, Saskatchewan, S7N 5E3. Библ. 75
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: АДЕНОВИРУСЫ
АДЕНОВИРУС КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА
ГЕНОМ
ОРГАНИЗАЦИЯ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Reddy, P.Seshidhar; Idamakanti, Neeraja; Zakhartchouk, Alexandre N.; Baxi, Mohit Kumar; Lee, Joong Bok; Pyne, Caron; Babiuk, Lorne A.; Tikoo, Suresh Kumar
7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 01.07-04Б1.212

    Бидненко, Е. М.
    Транскрипционное картирование и изучение регуляции транскрипции фага-транспозона D3112 Pseudomonas aeruginosa [Текст] / Е. М. Бидненко, В. З. Ахвердян, В. Н. Крылов // Генетика. - 2000. - Т. 36, N 12. - С. 1645-1655 . - ISSN 0016-6758
Аннотация: Изучали регуляцию транскрипции фага-транспозона (ФТ) D3112 Pseudomonas aeruginosa дикого типа и его мутантов по различным генам. Для этого использовали {3}H-РНК-ДНК-гибридизацию с иммобилизованными на нитроцеллюлозных фильтрах денатурированными фрагментами ДНК D3112, представляющими различные области генома фага. На основании полученных данных представлена транскрипционная карта ФТ D3112, включающая шесть независимых транскрипционных единиц, соответствующих модульной организации генома фага. В лизогенном состоянии осуществляется транскрипция только гена репрессора cI. После термоинактивации репрессора происходит выключение транскрипции гена cI и транскрипция осуществляется в соответствии с порядком расположения генов (модулей) на генетической карте фага D3112 слева направо: cipI (негативный регулятор) и ранние гены А и В (контролирующие репликацию-транспозицию фага), несущественная область генома, гены С и локус, маркированный мутацией ts47 (позитивные регуляторы транскрипции поздних генов), гены морфогенеза головки, ген c91 (позитивный регулятор установления лизогенного состояния), гены морфогенеза хвостового отростка. Обсуждается сходство генетической организации и регуляции транскрипции негомологичных ФТ D3112 P. aeruginosa и Mu Escherichia coli. Россия, Гос. НИИ генетики и селекции промышленных микроорганизмов, Москва 113545. Библ. 29
ГРНТИ  
34.25.29
ВИНИТИ 341.25.29.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГИ-ТРАНСПОЗОНЫ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ
PSEUDOMONAS AERUGINOSA

Доп.точки доступа:
Ахвердян, В.З.; Крылов, В.Н.
8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 03.02-04Б1.50

   
    Nuckleotide sequence and transcription map of porcine adenovirus type 3 [Text] / P.Seshidhar Reddy [et al.] // Virology. - 1998. - Vol. 251, N 2. - P414-426 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Нуклеотидная последовательность и транскрипционная карта свиного аденовируса типа 3
Аннотация: Полностью секвенирована геномная ДНК аденовируса (АВ) свиней типа 3 (АВС-3) длиной 34 094 п. н., имеющая очень высокое содержание Г+Ц (63,7%). По общей организации генома АВС-2 похож на геномы других АВ, но имеет определенные отличия. Гены поздних областей организованы в 6 семейств, а не в 5, как у АВ-2 человека. В отличие от бычьего АВ-3 и АВ овец, не имеющих генов вирион-ассоциированных РНК, у АВС-3 имеется одна короткая РНК VA. За исключением белка нити и неструктурного белка 33 кД, белки поздних областей, области E2 и IVa2 имеют высокую гомологию, а белки областей E1, E3 и E4, а также pIX - менее высокую гомологию с соответствующими белки других АВ. Белки V, VII и IX являются необычайно длинными, а белок VII не имеет консенсусного сайта протеазного расщепления. Анализ геномной ДНК и кДНК идентифицировал промоторы, сайты кэпирования, интрон-экзонные границы, сигналы полиаденилирования и сайты полиаденилирования в геноме ABC-3. Канада, Vet. Infectious Diseases Organization. Univ. Saskatchewan, Saskatoon, Sask. S7N 5E3. Библ. 85
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: АДЕНОВИРУСЫ
СВИНОЙ АДЕНОВИРУС ТИПА 3
ДНК ГЕНОМНАЯ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Reddy, P.Seshidhar; Idamakanti, Neeraja; Song, Jae-Young; Lee, Joong-Bok; Hyun, Bang-Hun; Park, Jong-Hyeon; Cha, Sang-Ho; Bae, Yong-Tae; Tikoo, Suresh Kumar; Babiuk, Lorne A.
9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 05.03-04Б1.57

    Wood, Ann R.
    Transcript mapping of the "early" genes of Orf virus [Text] / Ann R. Wood, Colin J. McInnes // J. Gen. Virol. - 2003. - Vol. 84, N 11. - P2993-2998 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Транскрипционное картирование 'ранних' генов вируса Orf
Аннотация: Вирус Orf (ORFV) - прототипный вид рода Parapoxvirus. По мРНК, выделенным через 5 ч после инфицирования клеток ORFV in vitro, сконструировали кДНК-клонотеку. С использованием 12 неперекрывающихся зондов, соответствующих полному геному штамма Orf-11, выделили кДНК-клоны, соотв. отдельным генам, экспрессируемым на ранних стадиях инфекции. Идентифицировали 38 ранних генов, из которых 29 были ортологами др. поксвирусных генов или же были уже идентифицированы ранее как гены ORFV, тогда как 7 кДНК не имели гомологов в базах данных. Выделенные кДНК содержат полную или частичную последовательность 47 генов и в сумме занимают примерно 30 т.п.н. вирусного генома. Великобритания, Moredun Res. Inst., Pentlands Sci. Park, Bush Loan, Penicuk EH26 OPZ. Библ. 32
ГРНТИ  
34.25.19
ВИНИТИ 341.25.19.07 + 341.25.29.17.07
Рубрики: ВИРУС ORF
ПАРАПОКСВИРУСЫ
РАННИЕ ГЕНЫ
ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
McInnes, Colin J.
10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 05.05-04Б1.57

   
    Transcription mapping of human herpesvirus 8 genes encoding viral interferon regulatory factors [Text] / Charles Cunningham [et al.] // J. Gen. Virol. - 2003. - Vol. 84, N 6. - P1471-1483 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Транскрипционное картирование генов герпесвируса 8 человека, кодирующих вирусные, регулируемые интерфероном, факторы
Аннотация: Геном герпесвируса 8 человека (HHV8) содержит 4 тандемно расположенных гена, кодирующих регулируемые интерфероном факторы (VIRF-1-4). Картировали 5'- и 3'-концы мРНК, кодируемых этими генами. Транскрипция гена VIRF-3 не индуцируется, а 3 др. генов индуцируется при литическом развитии вируса. Каждый из генов содержит собственный промотор (или промоторы) и сайты полиаденилирования. Все гены, кроме VIRF-1, состоят их 2 экзонов. VIRF-1 транскрибируется в неиндуцированных и индуцированных клетках с одного сайта инициации, расположенного после TATA-бокса, и может использовать дополнительный TATA-бокс и сайт инициации транскрипции в неиндуцированных клетках. В индуцированных клетках VIRF-2 транскрибируется с одного основного сайта инициации, которому предшествует TATA-бокс, а VIRF-4 - с 2 сайтов инициации, также расположенных после TATA-боксов. В гене VIRF-3 нет TATA-бокса, а мРНК VIRF-3 гетерогенны по 5'-концу. Великобритания, MRC Virol. Unit, Inst. Biol. Life Sci., Univ. Glasgow, Glasgow G11 5JR. Библ. 15
ГРНТИ  
34.25.19
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ГАММАГЕРПЕСВИРУСЫ
ГЕРПЕСВИРУС 8 ЧЕЛОВЕКА
ГЕНЫ
VIRF-1-4
РЕГУЛИРУЕМЫЕ ИНТЕРФЕРОНОМ ФАКТОРЫ
ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Cunningham, Charles; Barnard, Suzanne; Blackbourn, David J.; Davison, Andrew J.
11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 05.08-04Б1.147

    D'Costa, S. M.
    Transcriptional mapping in Chilo iridescent virus infections [Text] / S. M. D'Costa, H. J. Yao, S. L. Bilimoria // Arch. Virol. - 2004. - Vol. 149, N 4. - P723-742 . - ISSN 0304-8608
Перевод заглавия: Транскрипционное картирование при вирусной инфекции радужности Chilo
Аннотация: Вирус радужности Chilo (CYV) относится к сем. Yridoviridae. Ранее авторами были показаны 3 временных класса на уровне транскрипции. В данной работе авторы расположили все определяемые вирусные транскрипты в соответствии с временными классами и картировали их, используя фрагменты рестрикции из геномной библиотеки. Более чем 90% генома оказалось транскрипционно активным с 4 главными группами предранней транскрипции и тремя - замедленно-ранней. Поздние транскрипты наблюдались по всему геному. Имеется по крайней мере один особый район в геноме для каждого из 3-х временных классов. Авторы коррелировали транскрибированные районы с ORF на геноме CYV и показали, что известные ORF в особых районах обычно согласуются с фазо-специфическими требованиями крупных ДНК-вирусов. Предполагается также присутствие 5' или 3' коконцевых транскриптов. Это - первая полная транскрипционная карта для члена рода Yridovirus
ГРНТИ  
34.25.29
ВИНИТИ 341.25.29.17.13
Рубрики: ИРИДОВИРУСЫ
ВИРУС РАДУЖНОСТИ CHILO
ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Yao, H.J.; Bilimoria, S.L.
12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 08.02-04Б1.28

    Li, X.
    Transcription mapping and characterization of proteis produced from early region 4 of porcine adenovirus type 3 [Text] / X. Li, L. A. Babiuk, S. K. Tikoo // Arch. Virol. - 2007. - Vol. 152, N 3. - P495-505 . - ISSN 0304-8608
Перевод заглавия: Транскрипционное картирование и характеристика протеинов, продуцированных из раннего региона 4 аденовируса типа 3 свиней
Аннотация: Ранний регион 4 аденовируса 3 свиньи (АВС-3) был изучен в Нозерн-блоте, быстрой амплификации кДНК концов (RACE), ОТ-ПЦР и анализе последовательностей (П) кДНК. В результате было обнаружено 3 класса транскриптов (ТК), появляющихся и достигавших пика в разное время после инфекции клеток, и 9 больших Е4 ТК, все из них обладали 107 п.о. 5' лидерной П и 126 п.о. 3' концом. В этих ТК 1-3 интрона были удалены. Из 9 больших ТК один был слитым ТК ORFp1 и ORFp7 (ORFp1/7), который кодировал протеин из 119 аминокислот. Все ТК инициировались на нуклеотиде 33 740 генома АВС-3. Для идентификации протеинов с помощью бактериального слитого протеина, кодирующего протеины р2, р3, р4 или р7, были приготовлены кроличьи антисыворотки. Сыворотки против р2, р3 и р4 иммунопреципитировали протеины 13,5, 13,6 и 15,3 кД соответственно in vitro и в инфицированных АВС-3 клетках транскрибировали и транслировали мРНК. Сыворотка против р7 иммунопреципитировала протеин 19,8 кД при транскрипции in vitro, и в трансляционном анализе в инфицированных клетках было выявлено два протеина - 19,8 кД, кодируемого ORFp7, и 14 кД, кодируемого слитым ТК ORF1/7. Протеин, кодируемый ORFp2, был локализован в ядре, протеины, кодируемые ORFp3 и ORFp7 или ORFp1/7 - в цитоплазме, а протеин ORFp4 - и в ядре и в цитоплазме. Канада, Vaccine and Infect. Dis. Organization, Univ. of Saskatchewan, Saskatoon
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: АДЕНОВИРУСЫ
СВИНОЙ АДЕНОВИРУС ТИПА 3
БЕЛКИ
ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКИ

Доп.точки доступа:
Babiuk, L.A.; Tikoo, S.K.
13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 94.08-04Б1.042

    Renshaw, Randall W.
    Transcriptional mapping of the 3' end of the bovine syncytial virus genome [Text] / Randall W. Renshaw, James W. Casey // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 2. - P1021-1028
Перевод заглавия: Транскрипционное картирование 3'-конца генома синцитиального вируса крупного рогатого скота
Аннотация: Анализ нуклеотидной последовательности генома синцитиального вируса крупного рогатого скота, относящегося к ретровирусам, выявил в 3'-области две перекрывающиеся открытые рамки считывания (ОРС). Внутри обеих ОРС и в прилегающей области идентифицировано несколько донорных и акцепторных сайтов сплайсинга, используемых для образования сложного массива многократно сплайсированных транскриптов. Каждый из этих транскриптов остается в ОРС и потенциально кодирует белковый продукт. США, Dept. of Microbiol., Immunol., and Parasitol., College of Vet. Med., Cornell Univ., Ithaca, NY 14853. Библ. 39.
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: РЕТРОВИРУСЫ
СИНЦИТИАЛЬНЫЙ ВИРУС КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА
ГЕНОМ
ТРАНСКРИПЦИОННОЕ КАРТИРОВАНИЕ
СПУМАВИРУСЫ

Доп.точки доступа:
Casey, James W.
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)