Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА<.>)
Общее количество найденных документов : 52
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-52 
1.
РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 95.12-04В5.11

   

    Genetic diversity of Xanthomonas oryzae pv. Oryzae in Asia [Text] : abstr. APS Annu. Meet., Albuquerque, N.M., Aug. 6-10, 1994 / J. Leach [et al.] // Phytopathology. - 1994. - Vol. 84, N 10. - P1069 . - ISSN 0331-949X
Перевод заглавия: Генетическое разнообразие Xanthomonas oryzae pv. oryzae в Азии
Аннотация: Коллекция изолятов Xanthomonas oryzae pv. oryzae, выделенных в различных странах Азии, изучена методом полиморфизма длины рестрикц. фрагментов. Исследовано также наличие 2 систем рестрикции-модификации (XorI и XorII). Генетич. разнообразие изолятов сильно зависит от страны выделения. Большинство генетич. линий состоит из штаммов, выделенных в одной и той же среде. Фенотипы XorI{+}/XorII{+}, XorI{+}/XorII{-}, XorI{-}/XorII{+} и XorI{-}/XorII{-} встречаются с частотами 1:2:2:2. Вероятно, система XorI произошла в северовосточной, а система XorII - в юго-восточной Азии. Анализ вирулентности для 5 культиваров риса обнаружил корреляцию между патотипом и страной происхождения. Большинство штаммов из южной Азии совместимо с геном устойчивости риса xa-5, а большинство штаммов из других стран несовместимо с xa-5. США, Kansas State Univ., Manhattan, KS 66506-5502
ГРНТИ  
ВИНИТИ 681.37.05.23
Рубрики: ХРОМОСОМЫ
СТРУКТУРА

ХАРАКТЕРИСТИКА

ПОЛИМОРФИЗМ ДЛИНЫ РЕСТРИКТОВ

РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА

СИСТЕМА XORI/XORII

СПЕЦИФИЧНОСТЬ

XANTHOMONAS ORYZAE (BACT.)


Доп.точки доступа:
Leach, J.; Adhikari, T.; Choi, S.; Cruz, C.Vera; Zhang, Q.; Skinner, D.; Nelson, R.; New, T.


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.02-04Б2.133

   

    Cloning and sequence comparison of Aval and BsoBl restriction-modification systems [Text] / Hong Ruan [et al.] // Mol. and Gen. Genet. - 1996. - Vol. 252, N 6. - P695-699 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Клонирование и сравнение последовательностей систем рестрикции - модификации AvaI и BsoBI
Аннотация: Рестрикционные эндонуклеазы AvaI (I) и BsoBI (II) узнают и расщепляют симметричные последовательности 5'-ЦY'- ВНИЗ'ЦГRГ-3'. Гены I (avaIR) и метилазы AvaI (III; avaIM) клонированы в Escherichia coli с использованием метода селекции метилаз. Ген II (bso BIR) и часть гена bso BIM метилазы BsoBIM (IV) клонированы методом, основанным на индукции SOS-системы. Остальная часть гена bso BIM клонирована с помощью обратной ПЦР. Определены нуклеотидные последовательности генов этих 2 систем рестрикции-модификации (СРМ). I (мол. м. 35600) и II (мол. м. 37000) идентичны на 55%, а III (мол. м. 56500) и IV (мол. м. 62300) - на 41%. Организация генов СРМ не одинакова: avaIM-avaIR в СРМ AvaI и bsoBIR-bsoBIM в СРМ BsoBI. III и IV содержат мотивы, консервативные среди N{4}-цитозин-ДНК-метилаз. США, New England Biolabs., Inc., Beverley, MA 01915. Библ. 39
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
РЕСТРИКЦИОННЫЕ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ

МЕТИЛАЗЫ

СЕЛЕКЦИЯ

ГЕНЫ

ГЕН ЭНДОНУКЛЕАЗЫ AVAIR

ГЕН МЕТИЛАЗЫ AAVAIM

ГЕН ЭНДОНУКЛЕАЗЫ BSOB1R

ГЕН МЕТИЛАЗЫ BSOBIM

КЛОНИРОВАНИЕ

НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

МЕТОД ИНДУКЦИЙ SOS'-СИСТЕМЫ ОБРАТНАЯ ПЦР

БАКТЕРИИ


Доп.точки доступа:
Ruan, Hong; Lunnen, Keith D.; Scott, Melissa E.; Moran, Laurie S.; Slatko, Barton E.; Pelletier, John J.; Hess, Emma Jean; Benner, Jack; Wilson, Geoffrey G.; Xu, Shuang-yong


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.03-04Б2.222

   

    Characterization of a restriction-modification system of the thermotolerant methylotroph Bacillus methanolicus [Text] / David Cue [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 1996. - Vol. 62, N 3. - P1107-1111 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Характеристика системы рестрикции-модификации термотолерантного метилотрофа Bacillus methanolicus
Аннотация: Из Bacillus methanolicus выделена рестрикционная эндонуклеаза BlcTI, являющаяся изошизомером BclI и узнающая последовательность 5'-ТГА-ТЦА-3'. Показано, что сайт BlcTI модифицируется метилированием центрального остатка А - 6. Эти данные позволяют разработать стратегии, предотвращающие рестрикцию BlcTI любой ДНК, введенной в Bac. methanolicus. США, Inst. for Advanced Studies in Biol. Process Technol., Univ. of Minnesota, St. Paul MN 55108. Библ. 12
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
ЭНДОНУКЛЕАЗА BLCI

ВЫДЕЛЕНИЕ

СПЕЦИФИЧНОСТЬ ДЕЙСТВИЯ

ДНК

РЕСТРИКЦИЯ

ПРЕДОТВРАЩЕНИЕ

BACILLUS METHANOLICUS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Cue, David; Lam, Hong; Hanson, Richard S.; Flickinger, Michael C.


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.04-04Б2.113

   

    Specific binding of SsoII DNA methyltransferase to its promoter region provides the regulation of SsoII restriction-modification gene expression [Text] / Anna Karyagina [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 11. - P2113-2120 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Специфическое связывание ДНК-метилтрансферазы SsoII с ее промоторной областью обеспечивает регуляцию генов рестрикции-модификации SsoII
Аннотация: Регуляция системы рестрикции-модификации (СРМ) SsoII у Shigella sonnei изучена in vivo и in vitro. В опытах с использованием слияния с lacZ найдено, что ДНК-метилтрансфераза M. SsoII (I) репрессирует синтез I, но стимулирует экспрессию рестрикц. эндонуклеазы SsoII (II). N-концевые 72 остатка I, образующие мотив спираль-поворот-спираль (НТН), ответственны за специфич. связывание с ДНК и регуляторную функцию I. Аналогичные мотивы НТН имеются на N-конце ряда 5-метилцитозин-метилтрансфераз, в частности, M. EcoRII, M. dam и M. MspI, способных к авторегуляции. Связывание I с мишенной ДНК in vitro изучено методом сдвига электрофоретич. подвижности. Найдено, что I образует специфич. стабильный комплекс (K[d]=1,5*10{-8} М) с фрагментом ДНК промоторной области СРМ SsoII. ДНК-азый футпринтинг показал, что I защищает область длиной 48-52 п.н. перед кодирующей последовательностью I, к-рая содержит блок -10 промотора гена I и блоки -10 и -35 промотора гена II. Ин-т биомедицинской химии, 119832 Москва. Библ. 25
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
СИСТЕМА SSOII

РЕГУЛЯЦИЯ

ДНК-МЕТИЛТРАНСФЕРАЗА SSOII

ФУНКЦИЯ

SHIGELLA SONNEI


Доп.точки доступа:
Karyagina, Anna; Shilov, Ilya; Tashlitskii, Vadim; Khodoun, Marat; Vasil'ev, Sergey; Lau, Peter C.K.; Nikolskaya, Irene


5.
Патент 5470740 Соединенные Штаты Америки, МКИ C12N 15/55.

    Longo, Mary C.
    Cloned NsiI restriction-modification system [Текст] / Mary C. Longo, Michael D. Smith ; Life Technologies, Inc. - № 145518 ; Заявл. 04.11.1993 ; Опубл. 28.11.1995
Перевод заглавия: Клонирование системы рестрикции-модификации NsiI
Аннотация: Настоящее изобретение описывает клонирование и экспрессию в Escherichia coli системы рестрикции-модификации NsiI из Neisseria sicca. Эндонуклеаза NsiI узнает и расщепляет последовательность 5' ATGCAT 3', специфичность метилазы NsiI неизвестна. Несмотря на то, что гены рестриктазы и метилазы NsiI на хромосоме N. sicca сцеплены, их не удалось клонировать в составе одного фрагмента ДНК из-за нестабильности рекомбинантной плазмиды. Клонирование было осуществлено в два этапа. Первоначально был клонирован ген метилазы, а затем в клетках E. coli, экспрессирующих метилазу NsiI и защищенных таким образом от рестрикции, был клонирован ген эндонуклеазы. Получен штамм E. coli, суперпродуцирующий эндонуклеазу NsiI
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.07
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
NSII

ГЕНЫ

КЛОНИРОВАНИЕ

ХАРАКТЕРИСТИКА

ФЕРМЕНТЫ

МЕТИЛАЗА NSII

ЭНДОНУКЛЕАЗА NSII

ГЕТЕРОЛОГИЧНЫЙ СИНТЕЗ

NEISSERIA SICCA


Доп.точки доступа:
Smith, Michael D.; Life Technologies; Inc.
Свободных экз. нет

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.06-04Б2.180

    O'Sullivan, Daniel J.

    Control of expression of LlaI restriction in Lactococcus lactis [Text] / Daniel J. O'Sullivan, T. R. Klaenhammer // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 27, N 5. - P1009-1020 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Контроль экспрессии [системы] рестрикции LlaI у Lactococcus lactis
Аннотация: Плазмидная система рестрикции-модификации LlaI из Lactococcus lactis состоит из двухдоменной метилазы, эволюционно родственной метилазам IIS, и трехсубъединичного рестрикционного комплекса. Все эти компоненты кодирует полицистронный оперон 6,9 т. п. н. Показано, что 5'-конец полицистронного транскрипта отстоит от первого известного гена llaM на 254 п. н. Делеция этой промоторной области прекращала LlaI-рестрикцию в L. lactis. Перед llaIM обнаружена открытая рамка считывания, обозначенная llaC, кодирующая белок из 72 аминокислотных остатков с доменом "спираль-поворот-спираль", с консервативным участком связывания рибосом. Суперэкспрессия llaC в Escherichia coli в векторе экспрессии Т7 привела к образованию белка 8,2 кД. С помощью мутаций и комплементации in trans показано, что C*LlaI усиливает рестрикционную активность LlaI in vivo. При этом C*LlaI не влиял на транскрипцию оперона llaI. Сравнительный анализ базы данных выявил значительную гомологию LlaC с Rop-регуляторным и мРНК-стабилизирующим белком. Изучение влияния C*LlaI на LlaI-рестрикции в L. lactis показало, что индукция рестрикционной активности полностью прекращалось при повышенной т-ре (40'ГРАДУС'C). США, Dep. Food Sci., South. Dairy Foods Res. Ctr., North Carolina St. Univ., Raleigh, NC 27695-7624. Библ. 62
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
СИСТЕМА LLAI

СТРУКТУРА

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

ПЛАЗМИДЫ

LACTOCOCCUS LACTIS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Klaenhammer, T.R.


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.03-04Б2.331

    O'Sullivan, Daniel J.

    Control of expression of LlaI restriction in Lactococcus lactis [Text] / Daniel J. O'Sullivan, T. R. Klaenhammer // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 27, N 5. - P1009-1020 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Контроль экспрессии [системы] рестрикции LlaI у Lactococcus lactis
Аннотация: Плазмидная система рестрикции-модификации LlaI из Lactococcus lactis состоит из двухдоменной метилазы, эволюционно родственной метилазам IIS, и трехсубъединичного рестрикционного комплекса. Все эти компоненты кодирует полицистронный оперон 6,9 т. п. н. Показано, что 5'-конец полицистронного транскрипта отстоит от первого известного гена llaM на 254 п. н. Делеция этой промоторной области прекращала LlaI-рестрикцию в L. lactis. Перед llaIM обнаружена открытая рамка считывания, обозначенная llaC, кодирующая белок из 72 аминокислотных остатков с доменом "спираль-поворот-спираль", с консервативным участком связывания рибосом. Суперэкспрессия llaC в Escherichia coli в векторе экспрессии Т7 привела к образованию белка 8,2 кД. С помощью мутаций и комплементации in trans показано, что C*LlaI усиливает рестрикционную активность LlaI in vivo. При этом C*LlaI не влиял на транскрипцию оперона llaI. Сравнительный анализ базы данных выявил значительную гомологию LlaC с Rop-регуляторным и мРНК-стабилизирующим белком. Изучение влияния C*LlaI на LlaI-рестрикции в L. lactis показало, что индукция рестрикционной активности полностью прекращалось при повышенной т-ре (40'ГРАДУС'C). США, Dep. Food Sci., South. Dairy Foods Res. Ctr., North Carolina St. Univ., Raleigh, NC 27695-7624. Библ. 62
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
СИСТЕМА LLAI

СТРУКТУРА

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

ПЛАЗМИДЫ

LACTOCOCCUS LACTIS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Klaenhammer, T.R.


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.04-04Б2.197

    Cao, Weiguo.

    Nucleotide sequences and gene organization of TaqI endonuclease isoschizomers from Thermus sp. SM32 and Thermus filiformis Tok6A1 [Text] / Weiguo Cao, Jing Lu, Francis Barany // Gene. - 1997. - Vol. 197, N 1-2. - P205-214 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Нуклеотидные последовательности и строение генов изошизомеров эндонуклеазы TaqI Thermus sp. SM32 и Thermus filiformis Tok6A1
Аннотация: У бактерий все системы рестрикции-модификации II типа содержат метилтрансферазу и эндонуклеазу. Эндонуклеаза TaqI была впервые выделена из термофильной бактерии Thermus aquaticus YT1 в йеллоустоунском национальном парке. У рестриктазы TaqI известны изошизомеры - ферменты, распознающие те же последовательности ДНК, что и TaqI. У 8 штаммов Thermus, собранных по всему миру, гены изошизомеров TaqI амплифицированы и секвенированы. Сравнение их последовательностей продемонстрировало, что у изолятов из близко расположенных районов аминокислотные последовательности ферментов идентичны, или почти идентичны, а у изолятов из географически удаленных районов гомология последовательностей ферментов колебалась от 54% до 75%. В итоге удалось разделить рестриктазы на 4 географич. группы: США, Япония, Новая Зеландия и Португалия. Обсуждаются эволюционные взаимоотношения этих 4 групп. США, (Barany F.) Dep. of Microbiol., Hearst Microbiol. Res. Center, Cornell Univ. Med. College and Strang Cancer Prevention Center, New York, NY 10021. Библ. 40
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
ЭНДОНУКЛЕАЗА TAQ1

ГЕНЫ

ГЕНЫ ИЗОШИЗОМЕРЫ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ TAQ1

НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ПРОДУКТЫ

АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

СРАВНЕНИЕ

ЭВОЛЮЦИЯ

THERMUS (BACT.)

SP. ШТАММ SM32

ШТАММ TOK6A1


Доп.точки доступа:
Lu, Jing; Barany, Francis


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.07-04Б2.178

   

    KpnAI, a new type I restriction-modification system in Klebsiella pneumoniae [Text] / Nan Sook Lee [et al.] // J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 271, N 3. - P342-348 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Новая система рестрикции-модификации I типа KpnAI Klebsiella pneumoniae
Аннотация: В штамме M5a1 Klebsiella pneumoniae идентифицирована новая система рестрикции-модификации KpnAI. Гены, детерминирующие эту систему, клонированы и секвенированы. Всего обнаружено 3 открытых рамки считывания - hsdR, hsdM и hsdS. Они оказались на 95%, 98% и 44% гомологичны соответственным генам недавно описанной системы рестрикции-модификации типа ID - StyBLI. Похоже, что система KpnAI относится к типу ID, и это - первая система I типа, идентифицированная у рода Klebsiella. США, (Ryu J.) Dep. of Microbiol. and Mol. Genet., School of Med., Loma Linda Univ., Loma Linda CA 92350. Библ. 27
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
KPNA1

ТИП ID

ГЕНЫ

КЛОНИРОВАНИЕ

СЕКВЕНИРОВАНИЕ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

KLEBSIELLA PNEUMONIAE (BACT.)


Доп.точки доступа:
Lee, Nan Sook; Rutebuka, Obed; Arakawa, Takeshi; Bickle, Thomas A.; Ryu, Junichi


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.07-04Б2.181

    Makovets, Svetlana.

    ClpX and ClpP are essential for the efficient acquisition of genes specifying type IA and IB restriction systems [Text] / Svetlana Makovets, Annette J. B. Titheradge, Noreen E. Murray // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 28, N 1. - P25-35 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: ClpX и ClpP существенны для приобретения генов, кодирующих системы рестрикции типов IA и IB
Аннотация: Показано, что у Escherichia coli компоненты ClpX (IX) и ClpP (IP) протеазы ClpXP (I) необходимы и достаточны для эффективной передачи генов, кодирующих системы рестрикции-модификации EcoKI и EcoAI типов IA и IB. Это указывает на участие I в модуляции рестрикционной активности. Утрата IX вызывает больший барьер для приобретения этих систем, чем утрата IP. Это согласуется с двойной ролью IX как шаперона и компонента I. Передача генов EcoKI сильнее зависит от IX и IP, чем передача генов EcoAI. Конъюгативный перенос и трансформация сильнее зависят от I, чем трансдукция. Отсутствие IX или IP сильнее влияет на передачу при трансдукции фагом PI генов EcoKI, чем генов EcoAI. Великобритания, Inst. Cell and Mol. Biol., Univ. Edinburgh, Edinburgh EH9 3JR. Библ. 50
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
СИСТЕМА ECOK1

СИСТЕМА ECOA1

ПЕРЕДАЧА ГЕНОВ

МЕХАНИЗМ

ФЕРМЕНТЫ

ПРОТЕАЗА CLPXP

СТРУКТУРА

КОМПОНЕНТ CLPX

КОМПОНЕНТ CLPP

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Titheradge, Annette J.B.; Murray, Noreen E.


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.114

    Wayne, Jay.

    The Tsp451 restriction-modification system is plasmid-borne within its thermophilic host [Text] / Jay Wayne, Megan Holden, Shuang-yong Xu // Gene. - 1997. - Vol. 202, N 1-2. - P83-88 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Система рестрикции-модификации Tsp451 в термофильном хозяине находится на плазмиде
Аннотация: Thermus ssp. YS45 содержит 2 маленькие криптические плазмиды 5,8 (pTsp45s) и 12 (pTsp451) т. п. н. Определение и анализ нуклеотидной последовательности pTsp45s выявили 3 открытые рамки считывания. Помимо гена репликативного белка, идентифицированного ранее, авт. показали наличие генов метилтрансферазы M. Tsp451 и рестрикционной эндонуклеазы Tsp451. Оба гена транскрибируются в разные стороны и перекрываются на четыре нуклеотида в области стоп-кодонов. M.Tsp451, состоящая из 413 аминокислотных остатков с мол. м. 47 кД, узнает последовательность 5'-GTSAC-3' и имеет высокую гомологию с др. m{6}A-метилтрансферазами, в первую очередь, с M. EcaI, узнающей 5'-GGTNACC-3'. Tsp451 включает 332 аминокислотных остатков, расщепляет последовательность 5'-'- ВНИЗ'GTSAC-3', не гомологична M. Tsp451 и др. рестрикционным эндонуклеазам. Рекомбинантная Tsp451 стабильно продуцировалась в Escherichia coli и расщепляла ДНК при 65'ГРАДУС'С со специфичностью нативного фермента. США, New England Biolabs Inc., 32 Tozer Road, Beverly, MA 01915. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
ПЛАЗМИДНАЯ ЛОКАЛИЗАЦИЯ

СПЕЦИФИЧНОСТЬ

ПЛАЗМИДА PTS45S

ГЕНЫ

ГЕН МЕТИЛТРАНСФЕРАЗЫ M.TSP451

ГЕН РЕСТРИКЦИОННОЙ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ TSP451

ЛОКАЛИЗАЦИЯ

ТРАНСКРИПЦИЯ

THERMUS (BACT.)

SSP. YS45


Доп.точки доступа:
Holden, Megan; Xu, Shuang-yong


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.115

   

    Combinational variation of restriction modification specificities in Lactococcus lactis [Text] / Catherine Schouler [et al.] // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 28, N 1. - P169-178 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Комбинационная вариация специфичности рестрикции-модификации в Lactococcus lactis
Аннотация: На хромосоме Lactococcus lactis IL1403 идентифицированы 3 гена, кодирующие систему рестрикции-модификации типа I. Обнаружены плазмиды, кодирующие только субъединицу HsdS, изменяющую специфичность рестрикции-модификации. Наличие этих плазмид в клетках IL1403 сообщало новый фенотип рестрикции-модификации хозяину, что указывало на взаимодействие плазмидной HsdS с хромосомными субъединицами HsdR и HsdM. Такое комбинационное разнообразие систем рестрикции-модификации типа I способствует эволюции их специфичности и усилению бактериальной резистентности против инвазивной чужеродной неметилированной ДНК. Франция, INRA, Lab. Genet. Microb., 78352, Jouy-en-Josas. Библ. 72
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
СПЕЦИФИЧНОСТЬ

КОМБИНАЦИОННАЯ ВАРИАЦИЯ

ГЕНЫ

ГЕНЫ СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ

ОБНАРУЖЕНИЕ

БЕЛОК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

ПЛАЗМИДНАЯ СУБЪЕДИНИЦА HSDS

ХРОМОСОМНАЯ СУБЪЕДИНИЦА HSDR

HSDM

LACTOCOCCUS LACTIS (BACT.)

ШТАММ IL1403


Доп.точки доступа:
Schouler, Catherine; Gautier, Michel; Ehrlich, S.Dusko; Chopin, Marie-Christine


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.162

   

    Cloning and sequence analysis of the plasmid-borne genes encoding the Eco29kI restriction and modification enzymes [Text] / Marina V. Zakharova [et al.] // Gene. - 1998. - Vol. 208, N 2. - P177-182 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Клонирование и анализ последовательностей плазмидных генов, кодирующих ферменты рестрикции и модификации Eco29kI
Аннотация: Клонированы и секвенированы гены системы рестрикции-модификации (СРМ) Eco29kI плазмиды pECO29 - изошизомера SacII, узнающего последовательность CCGCGG. Гены eco29kIR и eco29kIM эндонуклеазы и ДНК-метилтрансферазы (I), разделенные 2 п. н., кодируют белки длиной соотв. 214 и 382 остатков (мол. м. 24556 и 43007). I содержит 4 мотива, характерных для 5-метилцитозин-ДНК-метилтрансфераз. Вариабельная область I гомологична части домена узнавания специфичных последовательностей TRD мультиспецифичной 5-метилцитозин-ДНК-метилтрансферазы MBsoHII, к-рая узнает в ДНК 5 разных сайтов (HaeII, MluI, Cfr10I, SacII и BssHII). Сравнение нуклеотидных последовательностей вариабельных областей позволило определить предполагаемый домен TRD в I. Россия, ИБФМ РАН, Пущино, Московская обл. 142292. Библ. 19
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
ДНК-МЕТИЛТРАНСФЕРАЗА ECO29KIR

ЭНДОДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕАЗА ECO29KIM

ГЕНЫ

ПЛАЗМИДНЫЕ

КЛОНИРОВАНИЕ

СЕКВЕНИРОВАНИЕ

СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ

ESCHERICHIA COLI 29K (BACT.)


Доп.точки доступа:
Zakharova, Marina V.; Beletskaya, Irina V.; Kravetz, Anatoly N.; Pertzev, Alexander V.; Mayorov, Sergey G.; Shlyapnikov, Michael G.; Solonin, Alexander S.


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.11-04Б2.100

    Dybvig, Kevin.

    A family of phase-variable restriction enzymes with differing specificities generated by high-frequency gene rearrangements [Text] / Kevin Dybvig, Ramakrishnan Sitaraman, C.Todd French // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol. 95, N 23. - P13923-13928 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Семейство фазовариабельных рестрикционных ферментов с разной специфичностью, порожденное идущими с высокой частотой перестройками генов
Аннотация: Гены hsd Mycoplasma pulmonis кодируют ферменты системы рестрикции-модификации (СРМ), высокогомологичные ферментам СРМ типа I кишечных бактерий. В хромосоме M. pulmonis содержатся 2 локуса hsd, каждый из к-рых содержит 2 гена hsdS, кодирующих ответственные за узнавание специфич. последовательностей ДНК субъединицы S (I) СРМ. В кодирующей области каждого гена hsdS имеются по меньшей мере 3 сайта, в к-рых происходит инверсия ДНК, порождающая вариацию аминок-тных последовательностей I. Полиморфные гены hsdS кодируют семейство функциональных I с разной специфичностью. Инверсия регулирует также фазовариабельную продукцию рестрикц. активности, т. к. требующиеся для нее гены hsdR и hsdM экспрессируются только из локусов, к-рые правильно ориентированы в хромосоме относительно промотора hsd. Эти данные показали, что в большой субпопуляции клеток M. palmonis гены hsdR и hsdM не экспрессируются, так что локусы hsd неэффективны как барьеры против вторжения чужеродной ДНК. США, Dep. Comparative Med., Univ. Alabama, Birmingham, AL 35294-0019. Библ. 20
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
ФАЗОВАРИАБЕЛЬНЫЕ ФЕРМЕНТЫ РЕСТРИКЦИИ

ХАРАКТЕРИСТИКА

ГЕНЫ

ГЕНЫ РЕСТРИКТАЗ HSD R

СТРУКТУРА

ФУНКЦИЯ

MYCOPLASMA PULMONIS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Sitaraman, Ramakrishnan; French, C.Todd


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.02-04Б2.156

    Madsen, Annette.

    Cloning and characterization of the lactococcal plasmid-encoded type II restriction/modification system, LlaDII [Text] / Annette Madsen, Jytte Josephsen // Appl. and Environ. Microbiol. - 1998. - Vol. 64, N 7. - P2424-2431 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Клонирование и характеристика системы рестрикции-модификации типа II LlaDII, кодируемой плазмидой лактококков
Аннотация: В составе плазмиды pHW393 Lactococcus lactis обнаружена LlaDII система модификации-рестрикции. Гены, кодирующие ее компоненты, расположены на PstI-EcoRI фрагменте и в составе шатл-вектора pCI3340 определяют устойчивость молочнокислых кокков к наиболее распространенным фагам лактококков - 936, P335 и c2. Определена последовательность, узнаваемая эндонуклеазой LlaDII - 5'GCNGC-3'. Определена нуклеотидная последовательность фрагмента PstI-EcoRI, показано, что в нем содержится 2 ORF, разделенные 105 п. н. Предсказанные аминокислотные последовательности компонентов LlaDII-системы в высокой степени гомологичны составляющим Dsp61-системы Bacillus sp. Метилазы из обеих систем узнают последовательности - 5'-GCGGC-3'. Сравнение их аминокислотных последовательностей с таковыми у известных цитозиновых ДНК-метилаз указывает на общие черты организации. Дания, Dep. Dairy&Food Sci., Royal Vet.& Aft. Univ., DK-1958 Fredderiksgerg C. Библ. 67
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
LLADII-СИСТЕМА

ГЕНЫ

ГЕНЫ LLADII СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ

НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

ГОМОЛОГИИ

LACTOCOCCUS LACTIS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Josephsen, Jytte


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.02-04Б2.131

    Merkiene, E.

    Coexistence of single-strand and double-strand DNA cytosine-N{4}-methyltransferases in the BcnI restriction-modification system [Text] : pap. 1st Conf. Young Biochemists and Mol. Biologists Lithuania, Vilnius, 18 Dec., 1996 / E. Merkiene, G. Vilkaitis, S. Klimasauskas // Biologija. - 1997. - N 1. - P5-8 . - ISSN 1392-0146
Перевод заглавия: Одновременное присутствие в системе рестрикции-модификации BcnI двух цитозин-N{4}-метилтрансфераз, метилирующих одно- и двунитевую ДНК
Аннотация: Анализ нуклеотидной последовательности BcnI выявил присутствие третьей ORF; кроме известных генов эндонуклеазы рестрикции (bcnIR) и цитозин-N{4} метилтрансферазы(bcnIB) обнаружен ген еще одной цитозин-N{4}-метилазы (bcnIA). Субклонированный в Escherichia coli ген bcnIA обеспечивает защиту от рестрикции эндонуклеазой BcnIR по сайту узнавания данной системы 5'-CC(C/G)GG-3'. Проведена неполная очистка обеих метилаз и изучена их субстратная специфичность in vitro. Оба фермента метилировали сайт 5'-CC(C/G)GG-3' на двунитевой ДНК, но BcnIA может модифицировать тот же сайт и на однонитевой ДНК. Литва, Inst. Biotechnol., V. Graiciuno 8, 2028 Vilnius. Библ. 11
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
BCNI

ГЕНЫ ЦИТОЗИН-N{4}-МЕТИЛТРАНСФЕРАЗЫ BCNIB

BCNIA

СУБСТРАТНАЯ СПЕЦИФИЧНОСТЬ

ОЧИСТКА

МЕТИЛИРОВАНИЕ

ДВУНИТЕВАЯ ДНК

ОДНОНИТЕВАЯ ДНК


Доп.точки доступа:
Vilkaitis, G.; Klimasauskas, S.


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.04-04Б2.99

   

    The Ecl/18kI restriction-modification system: Cloning, expression, properties of the purified enzymes [Text] / M. M. Denjumakhametov [et al.] // FEBS Lett. - 1998. - Vol. 433, N 3. - P233-236 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Система рестрикции-модификации EclI8kI: клонирование, экспрессия, свойства очищенных ферментов
Аннотация: Система рестрикции-модификации EclI8kI, выделенная из Enterobacter cloaceae, относится к системам II типа. Гены кодирующие эндонуклеазу рестрикции (R. EclI8kI) и метилазу (M. EclI8kI) были клонированы и экспрессированы в Escherichia coli. Эти ферменты узнают последовательность 5'CCNGG3'. Эти ферменты были выделены и очищены до состояния близкого к гомогенному. Рестриктаза присутствует в растворе как тетрамер, а метилаза является мономером. Изучено их взаимодействие с ДНК, содержащей 1,2-дидезокси-D-рибофуранозу. Корректный гидролиз этого субстрата сопровождается неканоническим гидролизом модифицированной цепи. Россия, Belozersky Inst. Phis.-Chem. Biol., MSU, 119899 Moskow. Библ. 10
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
ТИП II ECL18K1

ГЕНЫ

ГЕН МЕТИЛАЗЫ ECL18K1

ГЕН ЭНДОНУКЛЕАЗЫ ECL18K1

КЛОНИРОВАНИЕ

ФЕРМЕНТЫ

ВЫДЕЛЕНИЕ

СУБСТРАТНАЯ СПЕЦИФИЧНОСТЬ

ENTEROBACTER CLOACEAE (BACT.)


Доп.точки доступа:
Denjumakhametov, M.M.; Brevnov, M.G.; Zakharova, M.V.; Repyk, A.V.; Solonin, A.S.; Petrauskene, O.V.; Gromova, E.S.


18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.04-04Б2.275

   

    Novel type I restriction specificities through domain shuffling of HsdS subunits in Lactococcus lactis [Text] / David O'Sullivan [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 35, N 6. - P866-875 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Новые специфичности рестрикции типа I в результате перетасовки доменов субъединиц HsdS у Lactococcus lactis
Аннотация: Изучена новая система рестрикции-модификации типа I (СРМ-I) у Lactococcus lactis, в которой субъединица специфичности, кодируемая плазмидой pAH33 (6159 п. н.), изменила специфичность СРМ-I, кодируемой плазмидой pAH82 (20,3 т. п. н.). Новая специфичность обнаружена при фенотипич. и молекулярном анализе плазмиды pAH90 (26,5 т. п. н.), - коинтеграте pAH33 и pAH82, образовавшемся при заражении фагом родительского штамма. Показано, что в результате события коинтеграции образовались 2 новых гибридных гена hsdS. Химеры HsdS обменялись C- и N-концевыми вариабельными доменами родительских субъединиц, что породило 2 новые специфичности СРМ-I. Показано, что область генов hsdS, ответственная за событие коинтеграции, очень консервативна в детерминантах hsdS СРМ-I лактококков. Т. к. эти детерминанты широко распространены в р. Lactococcus, новые специфичности СРМ-I могут быстро появляться после гомологической рекомбинации между этими генами. Ирландия, Food Quality Dep., Teagasc, Dairy Products Res. Ctr., Fermoy, Cork. Библ. 38
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.11.02
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
ТИП I

СУБЪЕДИНИЦЫ HSDS

ДОМЕНЫ

ПЕРЕТАСОВКА

НОВЫЕ СПЕЦИФИЧНОСТИ РЕСТРИКЦИИ

LACTOCOCCUS LACTIS (BACT.)


Доп.точки доступа:
O'Sullivan, David; Twomey, Denis P.; Coffey, Aidan; Hill, Colin; Fitzgerald, Gerald F.; Ross, R.Paul


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.03-04Б2.170

   

    The HaeIV restriction modification system of Haemophilus aegyptius is encoded by a single polypeptide [Text] / Andrwej Piekarowicz [et al.] // J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 293, N 5. - P1055-1065 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Система рестрикции-модификации HaeIV Haemophilus aegyptius кодируется единственным полипептидом
Аннотация: Из Haemophilus aegyptius в pUC19 клонирован ген, кодирующий эндонуклеазу рестрикции HaeIV, гидролизующую двуцепочечную ДНК с обеих сторон от сайта узнавания. Ген кодирует белок с M[r]=110 кД, который был выделен из рекомбинантного штамма Escherichia coli и очищен до гомогенности. Белок обладает как эндонуклеазной, так и метилазной активностями; его предсказанная аминокислотная последовательность содержит несколько консервативных мотивов, характерных для ДНК-метилаз. Фермент узнает прерванную палиндромную последовательность - 5'GAPyNNNNNPuTC-3' и выщепляет фрагмент 33 п.н., включающий сайт узнавания. Эндонуклеаза HaeIV Mg{+2}-зависима, а АТФ не влияет ни на эндонуклеазную, ни на метилазную активности. Показано, что метилазная активность проявляется при образовании молекулами полипептида димера. Польша, Inst. Microbiol., Univ. Warsaw, Nowy Swiat 67, 00-046, Warsaw. Библ. 23
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
HAEIV

ГЕНЫ

ГЕН ЭНДОНУКЛЕАЗЫ РЕСТРИКЦИИ HAEIV

КЛОНИРОВАНИЕ

ЭНДОНУКЛЕАЗА РЕСТРИКЦИИ HAEIV

БИФУНКЦИОНАЛЬНОСТЬ

HAEMOPHILUS AEGYPTIUS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Piekarowicz, Andrwej; Golaszewska, Monika; Sunday, Awotunde Olubunmi; Siwinska, Maria; Sein, Daniel C.


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.05-04Б2.157

   

    Distribution of the SsuDAT1I restriction-modification system among different serotypes of Streptococcus suis [Text] / Tsutomu Sekizaki [et al.] // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 18. - P5436-5440 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Распределение системы рестрикции-модификации SsuDAT1I среди различных серотипов Streptococcus suis
Аннотация: В полевом изоляте Streptococcus suis серотип 2 впервые обнаружили систему рестрикции-модификации SsuDAT1I (R-M), которая содержит 2 метилтрансферазы и 2 рестрикционные эндонуклеазы с последовательностью узнавания 5'-GATC-3'. Обнаружили изошизомеры R-M системы в том же самом локусе между purH и purD в полевом изоляте серотипа 1/2 и референс штаммах серотипов 3, 7, 23 и в 26 штаммах среди 29 штаммов различных серотипов, рассмотренных в этом исследовании. Последовательности гена R-M в серотипах 1/2, 3, 7 и 23 были очень сходны с таковой для гена SsuDAT1I, тогда как последовательность гена R-M в серотипе 26 была менее похожей на ген SsuDAT1I. Результаты указывают на внутривидовую рекомбинацию среди видов и генетическую дивергенцию в процессе эволюции. Япония, National Institute of Animal Health, Tsukuba, Obaraki. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ СИСТЕМА
SSUDAT1I

ОБНАРУЖЕНИЕ

ИЗОШИЗОМЕРЫ

ЛОКАЛИЗАЦИЯ

ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

РАСПРЕДЕЛЕНИЕ

СЕРОТИПЫ

STREPTOCOCCUS SUIS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Sekizaki, Tsutomu; Osaki, Makoto; Takamatsu, Daisuke; Shimoji, Yoshihiro


 1-20    21-40   41-52 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)