Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ПСЕВДОУЗЛЫ<.>)
Общее количество найденных документов : 15
Показаны документы с 1 по 15
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.02-04Б1.408

    Borman, Stu.
    AIDS virus predicted to have up to four unexpected new genes [Text] / Stu Borman // Chem. and Eng. News. - 1994. - Vol. 72, N 34. - P23-25 . - ISSN 0009-2347
Перевод заглавия: Предсказано, что вирус СПИДа имеет до четырех неожиданных новых генов
Аннотация: Обзор. Анализ распределения в геномной РНК ВИЧ-1 псевдоузлов, к-рые могут вызвать сдвиг рамки при трансляции, позволил предположить, что ВИЧ-1 может кодировать до 4 новых составных белков. Для экспрессии этих белков необходима супрессия стоп-кодонов УГА, к-рую может вызвать включение остатков селеноцистеина (I). Одним из таких потенциальных содержащих I белков ВИЧ-1 является белок, связывающийся с ДНК и способный служить репрессором транскрипции ВИЧ-1
ГРНТИ  
34.25.29
ВИНИТИ 341.25.29.17.23.17
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
РНК ГЕНОМНАЯ
ПСЕВДОУЗЛЫ
СТОП-КОДОНЫ
СУПРЕССИЯ
2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.03-04Б1.76

    Deiman, B. A.L.M.
    The role of the pseudoknot at the 3' end of turnip yellow mosaic virus RNA in minus-strand synthesis by the viral RNA-dependent RNA polymerase [Text] / B. A.L.M. Deiman, R. M. Kortlever, C. W.A. Pleij // J. Virol. - 1997. - Vol. 71, N 8. - P5990-5996 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Роль псевдоузла на 3'-конце РНК вируса желтой мозаики турнепса в синтезе минус-нити вирусной РНК-зависимой РНК-полимеразой
Аннотация: Изучена роль тРНК-подобной структуры (I) на 3'-конце РНК вируса желтой мозаики турнепса (ВЖМТ) в инициации синтеза (-)-нити РНК in vitro РНК-зависимой РНК-полимеразой ВЖМТ (II). Делеции в направлении 5''-'3' до структуры псевдоузла (ПУ) не понижают эффективность транскриции (ЭТ). ЭТ понижается в 2 раза при использовании в кач-ве матрицы фрагмента длиной 21 н., содержащего 3'-концевую шпильку. II не транскрибирует тРНК{фен} из дрожжей, рРНК 5S Escherichia coli и 3'-концевые 208 н. РНК вируса мозаики люцерна. Изучено влияние мутации различных участков ПУ РНК ВЖМТ: петель L1 и L2 и стебля S1. У мутантов, сохранивших стабильный ПУ, ЭТ такая же, как у ВЖМТ дикого типа, а разрушение ПУ понижает ЭТ в 2 раза. Не обнаружены специфические взаимодействия I с основаниями участков L1, L2 или S1 в ПУ. Нидерланды, Leiden Inst. Chem., Gorlaens Lab., 2300 RA Leiden. Библ. 23
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ЖЕЛТОЙ МОЗАИКИ ТУРНЕПСА
РНК ВИРУСНАЯ
ПСЕВДОУЗЛЫ
ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ РОЛЬ
МИНУС-НИТЬ
СИНТЕЗ

Доп.точки доступа:
Kortlever, R.M.; Pleij, C.W.A.
3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.12-04Б2.183

   
    A nickel complex cleaves uridine in folded RNA structures: Application ot E. coli tmRNA and related engineered molecules [Text] / Robyn P. Hickerson [et al.] // J. Mol. Biol. - 1998. - Vol. 279, N 3. - P577-587 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Комплекс никеля расщепляет уридин в свернутых структурах РНК: применение к tm-РНК E. coli и родственным сконструированным молекулам
Аннотация: Квадратный плоский макроциклический комплекс Ni(II) NiCR (I), взаимодействующий с атомом N7 остатков G, использован для уточнения вторичной структуры РНК 10Sa (tm-РНК; II) Escherichia coli. Найдено, что I вызывает не только щелочелабильную модификацию остатков G, но и прямое расщепление нити РНК по специфичным остаткам U. Сконструированы более короткие молекулы РНК, происходящие из псевдоузла PK4 II. Этот псевдоузел может сам сворачиваться в р-ре, и I вызывает в нем расщепление ожидаемых остатков U. Оказалось, что только локальная последовательность и/или структурный контекст требуются для расщепления. В II 5 сайтов расщепления U расположены в двунитевых областях. Эти сайты содержат расщепляемый остаток U с 3'-стороны от неканонической пары G*U. Изучено действие I на еще более короткие РНК из одного стебля PK4, в к-рых систематически изменены остатки в предполагаемом сайте узнавания. Показано, что: 1) расщепление не наблюдается при замене пары G*U на U*G; 2) перемещение мотива узнавания по стеблю РНК вызывает соотв. перемещение сайта расщепления; 3) если мотив узнавания изменен так, что пара G*U фланкирована 2 остатками U, расщепляется лишь 3'-остаток U. С использованием перехватчиков свободных радикалов показано, что за окисление U, как и за окисление G, отвечает сульфатный радикал. США, Dep. Chem., Univ. Utah, Salt Lake City, UT 84112. Библ. 33
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: РНК
ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА
ПСЕВДОУЗЛЫ
РАСЩЕПЛЕНИЕ
НИКЕЛЬ КОМПЛЕКСЫ
ОСТАТКИ УРИДИНА
TM-РНК
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Hickerson, Robyn P.; Watkins-Sims, Cristi D.; Burrows, Cynthia J.; Atkins, John F.; Gesteland, Raymond F.; Felden, Brice
4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.05-04Б1.65

    Jaeger, Joachim.
    The structure of HIV-1 reverse transcriptase complexed with an RNA pseudoknot inhibitor [Text] / Joachim Jaeger, Tobias Restle, Thomas A. Steitz // EMBO Journal. - 1998. - Vol. 17, N 15. - P4535-4542 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Структура обратной транскрипции ВИЧ-1 в комплексе с ингибиторным псевдоузлом РНК
Аннотация: Маленькие псевдоузлы РНК (ПУР), прочно связывающиеся с обратной транскриптазой ВИЧ-1 (I), являются сильными ингибиторами I. Кристаллическая структура комплекса I с ПУР длиной 33 н. (II) определена подгонкой II к 4-кратно усредненной карте электронной плотности I с разрешением 4,8 A. II изогнут между стеблями S1 и S2, что оптимизирует контакты II с субъединицами гетеродимера I. Сайт связывания II расположен вдоль щели между активными центрами полимеразы и РНКазы H в I. Он частично перекрывается с сайтом связывания днДНК и с частью сайта связывания тРНК. Стебель S2 и петля L1 стабилизируют "закрытую" конформацию I в результате обширных электростатических взаимодействий с несколькими основными остатками спирали-I домена большого пальца p66 и в домене пальцев p66. Вероятно, II ингибирует I, связываясь с сайтом связывания затравки-матрицы. США, Dep. Mol. Biophys. and Biochem., Yale Univ., New Haven, CT 06520-8114. Библ. 40
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1
ОБРАТНАЯ ТРАНСКРИПТАЗА
РНК
ПСЕВДОУЗЛЫ
ОБРАЗОВАНИЕ КОМПЛЕКСА
СТРУКТУРА

Доп.точки доступа:
Restle, Tobias; Steitz, Thomas A.
5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI36) 00.06-04А4.284

   
    Novel folding patterns in RNA NMR studies of an RNA hairpin and pseudoknot [Text] : abstr. 2nd Eur. Biophys. Congr., Orleans, July 13-17, 1997 / M. Kolk [et al.] // Eur. Biophys. J. - 1997. - Vol. 26, N 1. - P43 . - ISSN 0175-7571
Перевод заглавия: Новые типы укладки шпилек и псевдоузлов РНК по данным ЯМР спектроскопии
ГРНТИ  
34.49.33
ВИНИТИ 341.49.33.15.17
Рубрики: РНК
ШПИЛЕЧНЫЕ СТРУКТУРЫ
ПСЕВДОУЗЛЫ
НОВЫЕ ТИПЫ УКЛАДКИ
ЯМР СПЕКТРОСКОПИЯ

Доп.точки доступа:
Kolk, M.; Heus, H.A.; Wijmenga, S.S.; Hilbers, C.W.
6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.05-04Б1.55

   
    Mapping in solution shows the peach latent mosaic viroid to possess a new pseudoknot in a complex, branched secondary structure [Text] / F. Bussiere [et al.] // J. Virol. - 2000. - Vol. 74, N 6. - P2647-2654 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Картирование в растворе показывает, [что] вироид латентной мозаики сливы обладает новым псевдоузлом в комплексе разветвленной вторичной структуры
Аннотация: Вироиды являются маленькими ('ПРИБЛ='300 нуклеотидов), однонитиевыми, кольцевыми РНК, инфицирующими высшие растения, и вызывают значительные потери в с/х производстве. В работе представлены результаты изучения вторичной структуры вироида латентной мозаики сливы (PLMVd). Были продуцированы транскрипты PLMVd "+"-полярности с использованием внутренней вторичной структуры РНК на 5' и 3'-концах и изучены нуклеазным картированием и связыванием меняющихся проб с ДНК и РНК нуклеотидами. Показано, что PLMVd свертывается в комплекс с разветвленной вторичной структурой. Эта структура сходна с сообщенной ранее. Данные по структуре основывались на сравнении последовательностей и компьютерном моделировании. Структурная микрогетерогенность очевидна и ограничена маленькими областями. Более важно, что эта структура включает ранее неизвестный псевдоузел, образованный нуклеотидами. Он присутствовал во всех изолятах PLMVd и допускал свертывание в очень компактную форму. Такой псевдоузел найден в вироиде, вызывающем хлоротическую пятнистость хризантем. Это предполагает, что псевдоузел является уникальным признаком вироидов членов подгруппы PLMVd. Канада, J. P. Perreault, Dep. of Biochimie, Fac. de Med., Univ. de Sherbrooke, Quebec JIH 5N4. Библ. 14
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРОИДЫ
ВИРОИД ЛАТЕНТНОЙ МОЗАИКИ СЛИВ
ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА
ПСЕВДОУЗЛЫ

Доп.точки доступа:
Bussiere, F.; Ouellet, J.; Cote, F.; Levesque, D.; Perreault, J.P.
7.
РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 02.07-04В5.113

    Bodaghi, Sohrab.
    Heterogeneity in the 3'-terminal untranslated region of tobacco mild green mosaic tobamoviruses from Nicotiana glauca resulting in variants with three or six pseudoknots [Text] / Sohrab Bodaghi, Martin Ngon A. Yassi, J.Allan Dodds // J. Gen. Virol. - 2000. - Vol. 81, N 3. - P577-586 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Гетерогенность в 3'-терминальной нетранслируемой области тобамовирусов мягкой зеленой мозаики табака из Nicotiana glauca приводит к вариантам с тремя или шестью псевдоузлами
Аннотация: Из 58 растений Nicotiana glauca в южной Калифорнии получены изоляты вируса мягкой зеленой мозаики табака (ВМЗМТ). На основании длины субгеномной РНК для белка оболочки СР (I) они разбиты на 2 группы, названные малым и большим типами. I этих 2 типов различаются не более чем на один аминокислотный остаток. I малого типа идентичен опубликованной последовательности I ВМЗМТ. По профилю днРНК 36 изолятов совпадают с типовым ВМЗМТ. У 6 из этих изолятов нуклеотидная последовательность 3'-нетранслируемой области (3'-НТО) совпадает с опубликованной последовательностью. 22 изолята имеют более длинную днРНК для субгеномной РНК СР. Секвенирование 6 изолятов показало, что все они имеют повтор последовательности между положениями 147-165 в той части 3'-НТО, к-рая участвует в образовании псевдоузлов (ПУ). Эти новые изоляты имеют не 3, а 6 ПУ. Малый тип ВМЗМТ с 3 ПУ после очистки дает в 2 раза больше вирусов, чем большой тип. Большой (но не малый) тип вызывает системную инфекцию N. rustica, а малый (но не большой) тип - системный летальный некроз у N. clevelandii. Почти все изоляты ВМЗМТ первично были ассоциированы с сателлитным вирусом табачной мозаики (СВТМ). Оба типа ВМЗМТ поддерживают СВТМ. США, Dep. Plant Pathol., Univ. California, Riverside, CA 92521-0122. Библ. 29
ГРНТИ  
68.37.31
ВИНИТИ 681.37.31.15.07.35
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС МЯГКОЙ ЗЕЛЕНОЙ МОЗАИКИ ТАБАКА
ИЗОЛЯТЫ
РНК СУБГЕНОМНАЯ
ПРОТЯЖЕННОСТЬ
ВАРИАНТЫ
ПСЕВДОУЗЛЫ

Доп.точки доступа:
Yassi, Martin Ngon A.; Dodds, J.Allan
8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.07-04Б1.275

    Bodaghi, Sohrab.
    Heterogeneity in the 3'-terminal untranslated region of tobacco mild green mosaic tobamoviruses from Nicotiana glauca resulting in variants with three or six pseudoknots [Text] / Sohrab Bodaghi, Martin Ngon A. Yassi, J.Allan Dodds // J. Gen. Virol. - 2000. - Vol. 81, N 3. - P577-586 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Гетерогенность в 3'-терминальной нетранслируемой области тобамовирусов мягкой зеленой мозаики табака из Nicotiana glauca приводит к вариантам с тремя или шестью псевдоузлами
Аннотация: Из 58 растений Nicotiana glauca в южной Калифорнии получены изоляты вируса мягкой зеленой мозаики табака (ВМЗМТ). На основании длины субгеномной РНК для белка оболочки СР (I) они разбиты на 2 группы, названные малым и большим типами. I этих 2 типов различаются не более чем на один аминокислотный остаток. I малого типа идентичен опубликованной последовательности I ВМЗМТ. По профилю днРНК 36 изолятов совпадают с типовым ВМЗМТ. У 6 из этих изолятов нуклеотидная последовательность 3'-нетранслируемой области (3'-НТО) совпадает с опубликованной последовательностью. 22 изолята имеют более длинную днРНК для субгеномной РНК СР. Секвенирование 6 изолятов показало, что все они имеют повтор последовательности между положениями 147-165 в той части 3'-НТО, к-рая участвует в образовании псевдоузлов (ПУ). Эти новые изоляты имеют не 3, а 6 ПУ. Малый тип ВМЗМТ с 3 ПУ после очистки дает в 2 раза больше вирусов, чем большой тип. Большой (но не малый) тип вызывает системную инфекцию N. rustica, а малый (но не большой) тип - системный летальный некроз у N. clevelandii. Почти все изоляты ВМЗМТ первично были ассоциированы с сателлитным вирусом табачной мозаики (СВТМ). Оба типа ВМЗМТ поддерживают СВТМ. США, Dep. Plant Pathol., Univ. California, Riverside, CA 92521-0122. Библ. 29
ГРНТИ  
34.25.29
ВИНИТИ 341.25.29.11
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС МЯГКОЙ ЗЕЛЕНОЙ МОЗАИКИ ТАБАКА
ИЗОЛЯТЫ
РНК СУБГЕНОМНАЯ
ПРОТЯЖЕННОСТЬ
ВАРИАНТЫ
ПСЕВДОУЗЛЫ

Доп.точки доступа:
Yassi, Martin Ngon A.; Dodds, J.Allan
9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.05-04А3.674

   
    PseudoBase: A database with RNA pseudoknots [Text] / Batenburg F. H.D. van [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2000. - Vol. 28, N 1. - P201-204 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: PseudoBase: база данных, содержащая информацию о псевдоузлах РНК
Аннотация: PseudoBase является базой данных, содержащей информацию о пространственных структурах, функциях и последовательностях псевдоузлов РНК. Классификация основана на эволюционном подходе. База данных доступна в интернете по адресу: http://wwwbio.LeidenUniv.nl/'ЭКВИВ'Batenburg/PKB.html. Голландия, Grp Theoretical Biol. & Philogenetics, Inst. Evolutionary & Ecological Sci., Leiden Univ., 2311 GP Leiden. Библ. 10
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: РНК
ПСЕВДОУЗЛЫ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА
ФУНКЦИИ
КЛАССИФИКАЦИЯ
БАЗЫ ДАННЫХ
БАЗА ДАННЫХ PSEUDOBASE
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
van, Batenburg F.H.D.; Gultyaev, A.P.; Pleij, C.W.A.; Ng, J.; Oliehoek, J.
10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.08-04Б2.231

    Williams, Kelly P.
    The tmRNA Website: Invasion by an intron [Text] / Kelly P. Williams // Nucl. Acids Res. - 2002. - Vol. 30, N 1. - P179-182 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Web-сайт тмРНК: инвазия интроном
Аннотация: Сайт тмРНК (http://www.indiana.edu/'ЭКВИВ'tmrna) содержит информацию о последовательностях тмРНК и кодируемых ими пептидных метках, вызывающих протеолиз. тмРНК обычно содержит 4 псевдоузла, сведения о вариабельности к-рых включены в базу данных. В сентябре 2001 г. база данных содержала 227 последовательностей тмРНК и включала выравнивание последовательностей SmpB - кофактора тмРНК. Геномные данные для Clostridium botulinum обнаружили в Т-петле тмРНК вставку интрона подгруппы IA3. США, Dep. Biol., Indiana Univ., Bloomington, IN 47405. Библ. 29
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ТМРНК
WEB-САЙТ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
КОДИРУЕМЫЕ ПЕПТИДНЫЕ МЕТКИ
ПСЕВДОУЗЛЫ
ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ
Т-ПЕТЛЯ
ВСТАВКА
ИНТРОНЫ ПОДГРУППА IA3
CLOSTRIDIUM BOTULINUM (BACT.)
ТРАНСЛЯЦИЯ
11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI27) 09.01-04М6.52

   
    Tiroidite di Hashimoto e parametri di autoimmunita: Studio descrittivo [Text] / M. Fiducia [et al.] // Minerva med. - 2007. - Vol. 98, N 2. - С. 95-99 . - ISSN 0026-4806
Перевод заглавия: Тиреоидит Хасимото и показатели аутоиммунитета
Аннотация: Обследовали 32 б-ных с тиреоидитом Хасимото (ТХ) на предмет выявления др. аутоиммунных заболеваний; определяли антиядерные АТ. Выявили антиядерные АТ у 15 б-ных (47%); у 9 из них были АТ в титре 1:40, у 5 б-ных - в титре 1:80 и у одного - в титре 1:160. У 25 б-ных выявили АТ к митохондриям; у 7 б-ных были АТ к слизистой желудка, у 8 б-ных - АТ к кардиолипину. 25 б-ных во время обследования получали лечение левотироксина. Псевдоузловые изменения в щитовидной железе при УЗИ чаще были у б-ных с отсутствием антиядерных АТ, чем у б-ных с антиядерными АТ (соответственно у 71% и у 60%). В целом 72% б-ных с ТХ имели хотя бы один параметр, говорящий о др. аутоиммунных нарушениях. Данные указывают, что б-ные с ТХ должны рассматриваться как б-ные с аутоиммунными нарушениями. Необходимо проводить скрининг на антиядерные АТ у б-ных с впервые выявленным ТХ. Италия, Univ. degli Studi di Roma "La Sapienza". Библ. 28
ГРНТИ  
34.39.39
ВИНИТИ 341.39.39.21.37.39
Рубрики: ТЕРЕОИДИТ ХАСИМОТО
АУТОИММУНИТЕТ
АНТИТЕЛА
ПСЕВДОУЗЛЫ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Fiducia, M.; Lauretta, R.; L:unghi, R.; Kyanvash, S.; Pallotti, S.
12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 09.02-04К1.211

   
    Tiroidite di Hashimoto e parametri di autoimmunita: Studio descrittivo [Text] / M. Fiducia [et al.] // Minerva med. - 2007. - Vol. 98, N 2. - С. 95-99 . - ISSN 0026-4806
Перевод заглавия: Тиреоидит Хасимото и показатели аутоиммунитета
Аннотация: Обследовали 32 б-ных с тиреоидитом Хасимото (ТХ) на предмет выявления др. аутоиммунных заболеваний; определяли антиядерные АТ. Выявили антиядерные АТ у 15 б-ных (47%); у 9 из них были АТ в титре 1:40, у 5 б-ных - в титре 1:80 и у одного - в титре 1:160. У 25 б-ных выявили АТ к митохондриям; у 7 б-ных были АТ к слизистой желудка, у 8 б-ных - АТ к кардиолипину. 25 б-ных во время обследования получали лечение левотироксина. Псевдоузловые изменения в щитовидной железе при УЗИ чаще были у б-ных с отсутствием антиядерных АТ, чем у б-ных с антиядерными АТ (соответственно у 71% и у 60%). В целом 72% б-ных с ТХ имели хотя бы один параметр, говорящий о др. аутоиммунных нарушениях. Данные указывают, что б-ные с ТХ должны рассматриваться как б-ные с аутоиммунными нарушениями. Необходимо проводить скрининг на антиядерные АТ у б-ных с впервые выявленным ТХ. Италия, Univ. degli Studi di Roma "La Sapienza". Библ. 28
ГРНТИ  
34.43.55
ВИНИТИ 341.43.55.25.17
Рубрики: ТЕРЕОИДИТ ХАСИМОТО
АУТОИММУНИТЕТ
АНТИТЕЛА
ПСЕВДОУЗЛЫ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Fiducia, M.; Lauretta, R.; L:unghi, R.; Kyanvash, S.; Pallotti, S.
13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 89.04-04Б1.114

   
    Novel reactions of RNAse P with a tRNA-like structure in turnip yellow mosaic virus RNA [Text] / Cecilia Guerrier-Takada [et al.] // Cell. - 1988. - Vol. 53, N 2. - P267-272
Перевод заглавия: Новые реакции РНКазы P с тРНК-подобной структурой в РНК вируса желтой мозаики турнепса
Аннотация: Большинство вирусов растений с однонитевыми РНКгеномами имеют квазиспиральные структуры, к-рые содержат псевдоузлы вблизи их 3'-концов. Показано, что М1 РНК (каталитическая субъединица РНКазы Р из Escherichia coli), так и голоэнзим из E. coli, могут катализировать эффективное расщепление сегмента из 20 нуклеотидов с 3'конца РНК вируса желтой мозаики турнепса (ВЖМТ). Сегмент, высвобождаемый из РНК ВЖМТ, является частью псевдоузла. Сам псевдоузел является частью сегментированного структурного домена, похожего на мелкий модельный субстрат для РНКазы Р. Интактная псевдоузловая структура в субстрате не нуждается в р-ции, катализируемой одной М1 РНК, но ее присутствие значительно усиливала эффективность р-ции. Помимо своей неотъемлемой роли в биосинтезе тРНК РНКаза Р может обладать другой функцией in vivo, а именно в физиологии вирусных инфекций. США, Dept of Biol., Yale Univ., New Haven, Connecticut 06520.
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ЖЕЛТОЙ МОЗАИКИ ТУРНЕПСА
РНК-ОДНОНИТЕВАЯ
КВАЗИСПИРАЛЬНЫЕ СТРУКТУРЫ
ПСЕВДОУЗЛЫ
ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ

Доп.точки доступа:
Guerrier-Takada, Cecilia; van, Belkum Alex; Pleij, Cornelis W.A.; Altman, Sidney
14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.05-04Б2.263

    Schimmel, Paul.
    Rna pseudoknots that interact with components of the translation apparatus [Text] / Paul Schimmel // Cell. - 1989. - Vol. 58, N 1. - P9-12 . - ISSN 0092-8674
Перевод заглавия: Псевдоузлы РНК, взаимодействующие с компонентами трансляционного аппарата
Аннотация: В кратком обзоре рассматривается структура и функции особых элементов вторичной структуры одноцепочечных НК, называемых псевдоузлами. Псевдоузлы формируются в том случае, когда неспаренные нуклеотиды в петле на вершине двуцепочечной шпильки вступают в комплементарные взаимодействия с нуклеотидами, располагающимися вправо или влево от основания этой шпильки. В результате в пространстве формируется структура из двух коаксиальных двойных спиралей и одиночной цепи, пересекающей эту двойную спираль. Впервые возможность существования псевдоузлов была выявлена при рентгеноструктурном исследовании молекул тРНК. В других случаях существование псевдоузлов постулировалось на основании данных хим. модификации. Псевдоузлы были идентифицированы в 3'концевых участках ряда РНК вирусов растений, обладающих способностью акцептировать аминокислоты. Недавно было показано наличие псевдоузла в регуляторной области молекулы мРНК гена 32 фага Т4 и в регуляторной области так называемой 'альфа'-мРНК Escherichia coli (эта область взаимодействует с рибосомным белком S4-ингибитором трансляции 'альфа'-мРНК). Кроме того, псевдоузел идентифицирован в мРНК вируса саркомы Рауса в том участке, в к-ром в ходе трансляции происходит сдвиг рамки. Обсуждаются функциональные особенности псевдоузлов, обеспечивающие их использование в регуляторных последовательностях разных типов. Библ. 26.
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.02.15
Рубрики: РНК
СТРУКТУРА
ПСЕВДОУЗЛЫ
ФУНКЦИЯ
ТРАНСЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 26
МРНК АЛЬФА
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ФАГ T4
15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 94.03-04А3.500

    Chen, Jih-H.
    A procedure for RNA pseudornot prediction [Text] / Jih-H. Chen, Shu-Yun Le, Jacob V. Maizel // Comput. Appl. Biosci. - 1992. - Vol. 8, N 3. - P243-248 . - ISSN 0266-7061
Перевод заглавия: Процедура предсказания псевдоузлов в РНК
Аннотация: Предложен метод поиска и предсказания псевдоузлов РНК, включающих внутримолек. пары оснований в петле шпильки. Основные требования, предъявляемые к искомым структурам - статистическая обнаружимость и устойчивость. Приведено описание разработанного алгоритма. Представлены иллюстративные примеры, показывающие возможности его эффективного применения. Приведены результаты, полученные в ходе проведенного имитационного моделирования. США, Advanced Sci. Computer Lab., Program Resources, Inc. NCI/FCRF, Frederick, MD 21702. Ил. 3. Библ. 23.
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: ОБРАБОТКА ДАННЫХ
АЛГОРИТМЫ
НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ
РНК
ПСЕВДОУЗЛЫ
ПРЕДСКАЗАНИЕ

Доп.точки доступа:
Le, Shu-Yun; Maizel, Jacob V.
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)