СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ОБЛАСТЬ TAR<.>)

Общее количество найденных документов : 5
Показаны документы с 1 по 5

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.01-04Б1.41

Footprinting RNA - protein complexes following gel retardation assays: Application to the R-17-procoat - RNA and tat - TAR interactions [Text] / Lori Pearson [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1994. - Vol. 22, N 12. - P2255-2263 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Футпринтинг комплексов РНК-белок после [разделения методом] задержки в геле: применение к [изучению] взаимодействия покровного белка R17 с РНК и tat с TAR
Аннотация: В дополнение к предложенному ранее футпринтингу ДНК-белкового комплекса с 1.10-фенантролин-Cu{2+} (OP-Cu), к-рый проводили после разделения комплексов в геле, предложили вариант анализа РНК-белковых комплексов. Вместо OP-Cu использовали производные OP - комплексы Cu{2+} с 4,7-диметил-, 5,6-диметил- и 3,4,7,8-тетраметил-OP. На модельной области TAR РНК ВИЧ показали, что метильные пр-ные не только более эффективно расщепляют сайты, узнаваемые OP, но и реагируют с дополнительными участками РНК; для повышения активности в реакционную смесь добавляли перекись водорода. Для комплексов покровного белка R-17 с вирусной РНК и белка tat с TAR РНК ВИЧ определили сайты макс. защищенности от нуклеазного расщепления. У R-17 комплекса ими оказались C[16] и C[17], у ВИЧ - C[38]UC[40], оба сайта расположены напротив Pur-блока однонитевой петли. Обсуждают причины повышенной активности обнаруженных сайтов во взаимодействии с белком. США, Dep. Biol. Chem., Sch. Med., Univ. California, Los Angeles, CA 90024-1570. Библ. 32

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: РНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БЕЛОК R17
БЕЛОК TAT
ОБЛАСТЬ TAR
ФУТПРИНТИНГ
ЗАДЕРЖКА В ГЕЛЕ
ФЕНАНТРОЛИН-CU{2+} 1.10-
ПРОИЗВОДНЫЕ

Доп.точки доступа:
Pearson, Lori; Chen, C.-h.B.; Gaynor, Richard P.; Sigman, David S.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 96.11-04Н1.194

Kappen, Lizzy S.
Bulge-specific cleavage in transactivation response region RNA and its DNA analogue by neocarzinostatin chromophore [Text] / Lizzy S. Kappen, Irving H. Goldberg // Biochemistry. - 1995. - Vol. 34, N 17. - P5997-6002 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Специфическое к [несимметричному вздутию] расщепление РНК области трансактиваторного ответа и ее ДНК-аналога с помощью хромофора неокарциностатина
Аннотация: Хромофор неокарциностатина (NCS-c) в отсутствие тиола обладает расщепляющей активностью в отношении единственного сайта на 3'-стороне несимметричной петли (вздутия) в шпилечной области. Оценили расщепление с помощью NCS-c РНК области трансактиваторного ответа (TAR) ВИЧ-1, а также 2 ДНК гомологов - полного из 29 н. в отношении РНК TAR и дуплекса из 2 линейных олигомеров в 10 и 13 н. Сайтом расщепления в РНК TAR является U[24] в середине несимметричной петли из 3 н, аналогичными сайтами в обоих ДНК-гомологах служат T[25], расщепление зависит от pH среды и времени инкубации, р-ция ингибируется глутатионом, компонентом нативного NCS. Специфичность расщепления зависит как от непосредственной структуры петли (TTT, TTG или ATT), так и ближайшего нуклеотидного окружения. Хотя существует определенная специфичность расщепления TAR РНК, эффективность р-ции невысока, по сравнению с ДНК-аналогами; последние, в свою очередь, расщепляются хуже, чем изученные ранее субстраты. Считают, что для практического использования данной р-ции необходим поиск оптим. условий. США, Dep. Biol. Chem., Harvard Med. Sch., Boston, MA 02115. Библ. 27

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.19.11.07
Рубрики: НЕОКАРЦИНОСТАТИН
ХРОМОФОР
РНК
ОБЛАСТЬ TAR
ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ДНК-АНАЛОГ
РАСЩЕПЛЕНИЕ
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ К НЕСИММЕТРИЧНОМУ ВЗДУТИЮ
ПРОТИВООПУХОЛЕВЫЕ СРЕДСТВА

Доп.точки доступа:
Goldberg, Irving H.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 98.07-04Н1.332

Inhibition of transcription by the TAR RNA of HIV-1 in a nuclear extract of HeLa cells [Text] / Rika Yamamoto [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 17. - P3445-3450 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Ингибирование транскрипции под действием РНК TAR ВИЧ-1 в ядерном экстракте клеток HeLa
Аннотация: Изучено влияние РНК TAR (I) ВИЧ-1 на эффективность транскрипции в ядерном экстракте клеток HeLa матрицы с ранним промотором цитомегаловируса. Обнаружено, что I ингибирует транскрипцию на 60-70% независимо от взаимодействия I с белком Tat. С использованием вариантов I найдено, что за ингибирование транскрипции отвечает петля I, окружающие ее остатки, выступ YYY и "нижняя" часть стебля I. I может секвестрировать факторы транскрипции и ингибировать транскрипцию генов домашнего хозяйства, не имеющих отношения к функции Tat. Япония, Nat. Inst. Biosci. and Human Technol., AIST, MITI, Tsukuba, Ibaraki 305. Библ. 39

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.21.11.02
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1
РНК
ОБЛАСТЬ TAR
БЕЛОК TAT
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ПОДАВЛЕНИЕ
КЛЕТКИ ЛИНИИ HELA
ЯДЕРНЫЙ ЭКСТРАКТ

Доп.точки доступа:
Yamamoto, Rika; Koseki, Shiori; Ohkawa, Jun; Murakami, Kazuo; Nishikawa, Satoshi; Taira, Kazunari; Kumar, Penmetcha K.R.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.08-04Б1.146

Inhibition of transcription by the TAR RNA of HIV-1 in a nuclear extract of HeLa cells [Text] / Rika Yamamoto [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 17. - P3445-3450 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Ингибирование транскрипции под действием РНК TAR ВИЧ-1 в ядерном экстракте клеток HeLa
Аннотация: Изучено влияние РНК TAR (I) ВИЧ-1 на эффективность транскрипции в ядерном экстракте клеток HeLa матрицы с ранним промотором цитомегаловируса. Обнаружено, что I ингибирует транскрипцию на 60-70% независимо от взаимодействия I с белком Tat. С использованием вариантов I найдено, что за ингибирование транскрипции отвечает петля I, окружающие ее остатки, выступ YYY и "нижняя" часть стебля I. I может секвестрировать факторы транскрипции и ингибировать транскрипцию генов домашнего хозяйства, не имеющих отношения к функции Tat. Япония, Nat. Inst. Biosci. and Human Technol., AIST, MITI, Tsukuba, Ibaraki 305. Библ. 39

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.09
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1
РНК
ОБЛАСТЬ TAR
БЕЛОК TAT
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ПОДАВЛЕНИЕ
КЛЕТКИ ЛИНИИ HELA
ЯДЕРНЫЙ ЭКСТРАКТ

Доп.точки доступа:
Yamamoto, Rika; Koseki, Shiori; Ohkawa, Jun; Murakami, Kazuo; Nishikawa, Satoshi; Taira, Kazunari; Kumar, Penmetcha K.R.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.10-04Б1.92

Binding of Hoechst 33258 to the TAR RNA of HIV-1. Recohnition of a pyrimidine bulge-dependent structure [Text] / Laurent Dassonneville [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 22. - P4487-4492 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Связывание Hoechst 33258 с РНК TAR ВИЧ-1. Узнавание структуры, зависящее от присутствия пиримидинового выступа
Аннотация: Методами и абсорбционной спектроскопии, кругового дихроизма, электрического линейного дихроизма и футпринтинга РНКазой A сравнено связывание производного бензимидазола Hoechst 33258 (I) с РНК TAR (II) дикого типа и ее аналогом, не имеющем пиримидинового выступа (ПВ). Делеция выступа дестабилизирует свободную и связавшую I формы II и сильно влияет на ориентацию бензимидазольного хромофора (БХ) в комплексе с РНК. Как показал линейный дихроизм, БХ ориентирован более или менее перпендикулярно к оси спирали I. Эти данные согласуются с моделью, согласно к-рой БХ I встроен в полость, созданную ПВ. Футпринтинг показал, что I связывается с уникальным сайтом напротив неспаренных остатков V. Связывание I с последовательностью 5'-GCYCY, ограничивающей полость, отражает большую доступность этой области по сравнению с др. местами в II. Франция, Lab. de Pharmacol. Mol. Antitumorale de Ctr Oscar Lambret, 59045 Lille. Библ. 23

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1
РНК
ОБЛАСТЬ TAR
ПИРИМИДИНОВЫЙ ВЫСТУП
ПРОИЗВОДНОЕ БЕНЗИМИДАЗОЛА
СВЯЗЫВАНИЕ
УЗНАВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Dassonneville, Laurent; Hamy, Francois; Colson, Pierre; Houssier, Claude; Bailly, Christian

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска