СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I<.>)

Общее количество найденных документов : 55
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-55

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 97.02-04Б4.105

Teixeira, P.
Methylene blue sensitizes E. coli cells to X-rays [Text] / P. Teixeira, S. Menezes // Int. J. Radiat. Biol. - 1996. - Vol. 69, N 3. - P345-350 . - ISSN 0955-3002
Перевод заглавия: Метиленовый синий повышает чувствительность клеток E. coli к X-лучам
Аннотация: Показано, что метиленовый синий повышает чувствительность клеток Escherichia coli к действию рентгеновских лучей. Интенсивность сенсибилизации зависит от концентрации красителя, температуры инкубации, мембранной проницаемости. Требуется также присутствие ДНК-полимеразы I. Предполагают, что использование красителей с целью сенсибилизации опухолевых клеток может дать возможность повысить эффективность радиотерапии. Ил. 4. Табл. 2. Библ. 12

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ
ПОВЫШЕНИЕ
РЕНТГЕНОВСКИЕ ЛУЧИ
МЕТИЛЕНОВЫЙ СИНИЙ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
РАДИОТЕРАПИЯ

Доп.точки доступа:
Menezes, S.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI36) 97.03-04А4.57

Teixeira, P.
Methylene blue sensitizes E. coli cells to X-rays [Text] / P. Teixeira, S. Menezes // Int. J. Radiat. Biol. - 1996. - Vol. 69, N 3. - P345-350 . - ISSN 0955-3002
Перевод заглавия: Метиленовый синий повышает чувствительность клеток E. coli к X-лучам
Аннотация: Показано, что метиленовый синий повышает чувствительность клеток Escherichia coli к действию рентгеновских лучей. Интенсивность сенсибилизации зависит от концентрации красителя, температуры инкубации, мембранной проницаемости. Требуется также присутствие ДНК-полимеразы I. Предполагают, что использование красителей с целью сенсибилизации опухолевых клеток может дать возможность повысить эффективность радиотерапии. Ил. 4. Табл. 2. Библ. 12

ГРНТИ	34.49.19

ВИНИТИ 341.49.19.33.13
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ
ПОВЫШЕНИЕ
РЕНТГЕНОВСКИЕ ЛУЧИ
МЕТИЛЕНОВЫЙ СИНИЙ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
РАДИОТЕРАПИЯ

Доп.точки доступа:
Menezes, S.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.02-04Б2.47

Селекция оснований ДНК-полимеразой I E. coli [Text] / Chang-De Lu [et al.] // Shengwuhuaxue yu shengwuwuli xuebao = Acta biochim. et biophys. sin. - 1995. - Vol. 27, N 6. - С. 593-601 . - ISSN 0582-9879
Аннотация: Исследовали нек-рые параметры связывания бактериальной ДНК-полимеразы I (ДП) с различными dNTP-субстратами и ddNTP-ингибиторами. Показано, что замена Mg{2+} среды на Mn{2+} сопровождается снижением K[1] ДП для ddNTP без изменений K[m] для dNTP. Комплексы матрица-праймер, терминированные включением ddNTP, ингибируют активность ДП только в том случае, когда ddNTP-концы ДНК комплементарны ДНК-матрице. Предполагается, что селекция нуклеотидов ДП зависит от структуры 3'-конца праймера и имеет в основе конформационные изменения ДП, последовательные во времени. КНР, Shanghai Inst. Biochem., Acad. Sinica, 200031. Библ. 15

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
DNTP-СУБСТРАТЫ
DDNTP-ИНГИБИТОРЫ
СВЯЗЫВАНИЕ
СЕЛЕКЦИЯ НУКЛЕОТИДОВ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Lu, Chang-De; El-Deiry, Wafik S.; Downey, Kathleen M.; So, Antero G.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.02-04Б2.156

Paz-Elizur, Tamar.
Mechanism of bypass synthesis through an abasic site analog by DNA polymerase I [Text] / Tamar Paz-Elizur, Masaru Takeshita, Zvi Livneh // Biochemistry. - 1997. - Vol. 36, N 7. - P1766-1773 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Механизм обходного синтеза [ДНК] ДНК-полимеразой I через аналог AP-сайт
Аннотация: Обходной синтез (ОС) ДНК-полимеразой I (I) Escherichia coli изучен с использованием днДНК длиной 40 п. н. с однонитевой брешью, содержащих аналог AP-сайта - остаток тетрагидрофурана (II). ОС идет в 2 стадии: быстрая полимеризация заканчивается напротив II, а затем идут медленная стадия ОС и полимеризация до конца матрицы. Расстояние от 3'-конца затравки до II (в диапазоне 1-5 н.) не влияет на ОС. ОС усиливается в 3 раза при увеличении расстояния между 5'-границей бреши и II в диапазоне 1-9 н. ОС сильно тормозится умеренными конц-иями солей. В присутствии 0,1 М KCl, т. е. в оптим. для I условиях, ОС полностью ингибирован. ОС стимулируется в 10-60 раз при устранении корректорской (3''-'5')-экзонуклеазной активности I. Измерение кинетики включения нуклеотидов напротив II показало, что I предпочитает дАМФ, для к-рого K[M] меньше, а k[cat] больше, чем у др. нуклеотидов. Скорость ОС увеличивается в отсутствие одного или двух из дНТФ, вероятно, из-за облегчения полимеризации в обход II. Израиль, Dep. Biochem., Weizmann Inst. Sci., Rehovot 76100. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ДНК
СИНТЕЗ
ОБХОДНОЙ СИНТЕЗ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
ОБХОДНЫЕ ПУТИ
AP-САЙТ
МЕХАНИЗМ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Takeshita, Masaru; Livneh, Zvi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.02-04Б2.158

Joyce, Catherine M.
Polymerase structures and function: Variations on a theme? [Text] / Catherine M. Joyce, Thomas A. Steitz // J. Bacteriol. - 1995. - Vol. 177, N 22. - P6321-6329 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Структуры и функция полимераз: вариации на одну тему?
Аннотация: Обзор. Сравнены аминокислотные последовательности, 3-мерные структуры доменов и механизмы полимеразной реакции для Кленовского фрагмента ДНК-полимеразы I Escherichia coli, обратной транскриптазы ретровирусов и РНК-полимеразы фага Т7, являющихся родственными друг другу, а также для негомологичной им ДНК-полимеразы 'бета'. Несмотря на отсутствие общего эволюционного происхождения этих 4 полимераз, субдомены ладони, пальцев и большого пальца во всех 4 ферментах выполняют аналогичные функции. Субдомен ладони содержит каталитический центр и отвечает за связывание конца затравки и 'альфа'-фосфата включающегося дНТФ. Субдомен большого пальца взаимодействует со стеблем затравка-матрица перед сайтом синтеза, а субдомен пальцев связывает однонитевую матрицу в сайте синтеза и позади него. США, Dep. of Mol. Biophys. and Biochem., Yale Univ., New Haven, CT 06520. Библ. 47

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ПОЛИМЕРАЗЫ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
ESCHERICHIA COLI
ОБРАТНАЯ ТРАНСКРИПТАЗА
РЕТРОВИРУСЫ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА
ФАГ T7
КЛЕНОВСКИЙ ФРАГМЕНТ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ДОМЕННАЯ СТРУКТУРА
МЕХАНИЗМЫ ПОЛИМЕРАЗНОЙ СТРУКТУРЫ
СРАВНЕНИЕ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 47

Доп.точки доступа:
Steitz, Thomas A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.06-04Б2.111

Shibutani, Shinya.
Transelsional synthesis on DNA templates containing a single abasic site. A mechanistic study of the "a rule" [Text] / Shinya Shibutani, Masaru Takeshita, Arthur P. Grollman // J. Biol. Chem. - 1997. - Vol. 272, N 21. - P13916-13922 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Синтез через повреждения на матрицах ДНК, содержащих одиночный АР-сайт. Механистическое изучение "правила А"
Аннотация: Сайт-специфически модифицированные олигодезоксирибонуклеотиды, содержащие один природный АР-сайт (ПАРС) или химически синтезированные модельные тетрагидрофурановый АР-сайт (ТАРС) или дезоксирибитольный АР-сайт (ДАРС), использованы в качестве матриц в реакциях элонгации затравки, катализируемых кленовским фрагментом ДНК-полимеразы I (I) Escherichia coli или ДНК-полимеразой 'альфа' (II) из тимуса теленка. I и II преимущественно включают дАМФ напротив ПАРС и ТАРС, но ДАРС с открытым кольцом ингибирует синтез и способствует зависящему от контекста образованию делеций. По частоте включения напротив 3 типов АРС дАМФдГМФдЦМФдТМФ. Частота элонгации также наиболее высока, если напротив ПАРС включается дАМФ. По частоте синтеза через повреждение ТАРСПАРСДАРС. I способствует добавлению дАМФ к тупым концам, но эта реакция гораздо менее эффективна, чем включение дАМФ напротив АРС. Эти данные показали, что: 1) по потенциалу ошибочного кодирования in vitro ПАРС похож на ТАРС; 2) ДАРС способствует образованию делеций; 3) II должна включать дАМФ на АРС в клетках млекопитающих. США, Dep. of Pharmacological Sci., State Univ. of New York, Stony Brook, NY 11794-8651. Библ. 45

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ПОВРЕЖДЕНИЕ МАТРИЦЫ
АР-САЙТЫ
ПРЕОДОЛЕНИЕ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗЫ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА АЛЬФА ТИМУСА ТЕЛЕНКА
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Takeshita, Masaru; Grollman, Arthur P.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.07-04Б2.370

Random mutagenesis of Thermus aquaticus DNA polymerase I: Concordance of immutable sites in vivo with the crystal structure [Text] / Motoshi Suzuki [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1996. - Vol. 93, N 18. - P9670-9675 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Случайный мутагенез ДНК-полимеразы I Thermus aquaticus: соответствие немутируемых сайтов кристаллической структуре
Аннотация: Экспрессия ДНК-полимеразы I (I) Thermus aquaticus в Escherichia coli комплементирует ростовой дефект, вызванный температурочувствительный мутацией polA12. Нуклеотидную последовательность, соответствующую остаткам 659-671 О-спирали I в сайте связывания субстрата, заменили олигонуклеотидом, содержащим случайные нуклеотиды. С использованием библиотеки с 9% случайных замен в каждом из 39 положений идентифицировали 61 активный мутант I, каждый из к-рых имеет от 1 до 4 аминокислотных замен. Некоторые остатки I (напр. ала[661] и тре[664]) толерантны к нескольким разным заменам. Для остатков арг[659], лиз[663] и тир[671] замены либо не обнаружены, либо являются консервативными. С использованием библиотеки с полностью случайными нуклеотидами в 5 кодонах (арг[659], арг[660], лиз[663], фен[667] и гли[668]) подтверждено, что арг[659] и лиз[663] немутируемы, а фен[667] можно заменить только на тир. Два немутируемых остатка и два остатка, допускающих только высококонсервативные замены, расположены на стороне О-спирали, направленной в сторону входящего ДНТФ, согласно данным рентгеноструктурного анализа. Т. обр. данные об активной конформации I, полученные методами анализа кристаллич. структуры и функции in vivo, согласуются друг с другом. США, Dep. of Pathol., Univ. of Washington, Seattle, WA 98195-7705. Библ. 45

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.27.07
Рубрики: ФЕРМЕНТЫ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
СТРУКТУРА
ФУНКЦИЯ
КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА
НЕМУТИРУЕМЫЕ САЙТЫ
СООТВЕТСТВИЕ
THERMUS AQUATICUS

Доп.точки доступа:
Suzuki, Motoshi; Baskin, Dale; Hood, Leroy; Loeb, Lawrence A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.09-04Б2.86

Shibutani, Shinya.
Transelsional synthesis on DNA templates containing a single abasic site. A mechanistic study of the "a rule" [Text] / Shinya Shibutani, Masaru Takeshita, Arthur P. Grollman // J. Biol. Chem. - 1997. - Vol. 272, N 21. - P13916-13922 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Синтез через повреждения на матрицах ДНК, содержащих одиночный АР-сайт. Механистическое изучение "правила А"
Аннотация: Сайт-специфически модифицированные олигодезоксирибонуклеотиды, содержащие один природный АР-сайт (ПАРС) или химически синтезированные модельные тетрагидрофурановый АР-сайт (ТАРС) или дезоксирибитольный АР-сайт (ДАРС), использованы в качестве матриц в реакциях элонгации затравки, катализируемых кленовским фрагментом ДНК-полимеразы I (I) Escherichia coli или ДНК-полимеразой 'альфа' (II) из тимуса теленка. I и II преимущественно включают дАМФ напротив ПАРС и ТАРС, но ДАРС с открытым кольцом ингибирует синтез и способствует зависящему от контекста образованию делеций. По частоте включения напротив 3 типов АРС дАМФдГМФдЦМФдТМФ. Частота элонгации также наиболее высока, если напротив ПАРС включается дАМФ. По частоте синтеза через повреждение ТАРСПАРСДАРС. I способствует добавлению дАМФ к тупым концам, но эта реакция гораздо менее эффективна, чем включение дАМФ напротив АРС. Эти данные показали, что: 1) по потенциалу ошибочного кодирования in vitro ПАРС похож на ТАРС; 2) ДАРС способствует образованию делеций; 3) II должна включать дАМФ на АРС в клетках млекопитающих. США, Dep. of Pharmacological Sci., State Univ. of New York, Stony Brook, NY 11794-8651. Библ. 45

ГРНТИ	34.27.21

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.09-04Б2.91

Base miscoding and strand misalignment errors by mutator Klenow polymerases with amino acid substitutions at tyrosine 766 in the O helix of the fingers subdomain [Text] / Juliette B. Bell [et al.] // J. Biol. Chem. - 1997. - Vol. 272, N 11. - P7345-7351 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Ошибки спаривания оснований и проскальзывания нитей, допускаемые мутаторными кленовскими полимеразами с аминокислотными заменами тирозина-766 в спирали O субдомена пальцев
Аннотация: С использованием метода оценки точности, основанном на ДНКа фага М13 mp2, изучена специфичность ошибок мутаторных вариантов фрагмента Кленова (I) ДНК-полимеразы I Escherichia coli с заменами Y766S (IA) или Y766A (IB). IA и IB вызывают повышение частоты замен оснований. Мутаторный эффект наиболее велик (в 60 раз) для ошибочного включения ТМФ напротив Г в матрице. Для IA и IB характерно и повышение частоты делеций 2 п. н. и делеции 276 п. н. между прямыми повторами. Однако частота мутаций сдвига рамки типа +1 в повторяющихся последовательностях не повышена. Такая специфичность ошибок позволяет предположить, что делеции, порождаемые мутаторными I, инициируются ошибочным включением, а не проскальзыванием нитей. США, Lab. of Molecular Genetics, NIEHS, NIH, Research Triangle Park, NC 27709. Библ. 34

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ДНК-ПОЛИМЕРАЗЫ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
ФРАГМЕНТ КЛЕНОВА
СТРУКТУРА
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
РЕПЛИКАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Bell, Juliette B.; Eckert, Kristin A.; Joyce, Catherine M.; Kunkel, Thomas A.

10.

Патент 5545552 Соединенные Штаты Америки, МКИ C12N 15/54.

Mathur, Eric J.
Purified thermostable pyrococcus furiosus DNA polymerase I [Текст] / Eric J. Mathur ; Stratagene. - № 424921 ; Заявл. 19.04.1995 ; Опубл. 13.08.1996
Перевод заглавия: Очищенная термостабильная ДНК-полимераза I из Pyrococcus furiosus
Аннотация: Очищенная термостабильная ДНК-полимераза I Pyrococcus furiosus мигрирует в неденатурированном ПААГ быстрее, чем фосфорилаза B и Taq-полимераза и медленнее, чем БСА. Мол. масса очищенной ДНК-полимеразы I составляет 90-93 кД

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
ВЫДЕЛЕНИЕ
ОЧИСТКА
ХАРАКТЕРИСТИКА
PYROCOCCUS FURIOSUS (BACT.)
ПАТЕНТЫ
США

Доп.точки доступа:
Stratagene
Свободных экз. нет

11.

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.07
Рубрики: ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
ВЫДЕЛЕНИЕ
ОЧИСТКА
ХАРАКТЕРИСТИКА
PYROCOCCUS FURIOSUS (BACT.)
ПАТЕНТЫ
США

Доп.точки доступа:
Stratagene
Свободных экз. нет

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.195

Kogoma, Tokio.
DNA polymerase I in constitutive stable DNA replication in Escherichia coli [Text] / Tokio Kogoma, Rina R. Maldonado // J. Bacteriol. - 1997. - Vol. 179, N 7. - P2109-2115 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: ДНК-полимераза I в конститутивной стабильной репликации ДНК в Escherichia coli
Аннотация: Изучено влияние мутаций polA и polB на индуцибельную (ис) и конститутивную (кс) репликацию ДНК в 2 альтернативных репликационных системах Escherichia coli. Мутация в polA25 резко инактивировала кс, в то время как в мутантах polA1 уровень кс был значительным. Для кс необходимы и полимеразная, и 5''-'3' экзонуклеазная активности ДНК-полимеразы I, при этом и кс и ис не требуют активности ДНК-полимеразы II. Мексика, Dep. of Cell Biology and Microbiology and Cancer Center, Univ. of New Mexico Health Sciences Center, Albuquerque, New Mexico 87131. Библ. 50

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНДУЦИБЕЛЬНАЯ
КОНСТИТУТИВНАЯ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
ФУНКЦИИ
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Maldonado, Rina R.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.35

A single side chain prevents Escherichia coli DNA polymerase I (Klenow fragment) from incorporating ribonucleotides [Text] / Mekbib Astatke [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol. 95, N 7. - P3402-3407 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Единственная боковая цепь фрагмента Кленова ДНК-полимеразы I Escherichia coli предотвращает включение рибонуклеотидов
Аннотация: Известно, что фрагмент Кленова (ФК) ДНК-полимеразы I характеризуется резко выраженной специфичностью включения дНТФ в ДНК-продукт р-ции (предпочтение по сравнению с НТФ в неск. тыс. раз). По данным сравнительного анализа ряда сайт-адресованных мутантов ФК, эта субстратная специфичность определяется боковой цепью остатка Glu710, к-рая стерически блокирует 2'-OH-группы субстратов НТФ. Мутационная замена этого остатка (E710A) повышает способность ФК к включению НТФ в ДНК-праймер, но при этом ФК не катализирует синтеза "чистой" РНК. США, Dep. Mol. Biophys., Biochem., Yale Univ., New Haven, CT 06520. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
ФРАГМЕНТ КЛЕНОВА
РИБОНУКЛЕОТИДЫ
ВКЛЮЧЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Astatke, Mekbib; Ng, Kimmie; Grindley, Nigel D.F.; Joyce, Catherine M.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.195

The proofreading domain of Escherichia coli DNA polymerase I and other DNA and/or RNA exonuclease domains [Text] / Michael J. Moser [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 24. - P5110-5118 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Корректорский домен ДНК-полимеразы I Escherichia coli и другие ДНК- и/или РНК-экзонуклеазные домены
Аннотация: (3''-'5')-экзорибонуклеазный домен РНКазы D Escherichia coli по структуре и механизму действия похож на корректорский (3''-'5')-экзодезоксирибонуклеазный домен ДНК-полимераз. Скрытая марковская модель и филогенетич. анализ использованы для индентификации этого экзонуклеазного домена (ЭД) в др. белках. Найдено, что ЭД имеется в семействе РНКазы Т, у иммунодоминантного антигена Р93 Borrelia burgdorferi; белка dexA фага Т4; экзонуклеазы I E. coli; геликазы dinG и пептид-синтазы I Bacillus subtilis; субъединицы PAN2 Pab1p-зависимой поли(А)-нуклеазы Saccharomyces cerevisiae; белка CAF1, ассоциированного с фактором транскрипции CCR4 Caenorhabditis elegans и Mus musculus; белка XPMC2 Xenopus laevis, гомологичного белку предотвращения митотич. катастрофы делящихся дрожжей; белков egalitarian и exuperantia Drosophila melanogaster, экспрессируемому в линиях раковых клеток и матке белку HEM45 человека и еще в продуктах 31 открытой рамки считывания, включая один ген из Methanococcus jannaschii. С использованием двух 3-мерных структур корректорских доменов и выравнивания последовательностей определены сердцевинная последовательность ЭД и его структурные и функциональные элементы. США, Life Sci. Division, Lawrence Berkeley Nat. Lab., Berkeley, CA 94720. Библ. 80

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ФЕРМЕНТЫ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
СТРУКТУРА
КОРРЕКТОРСКИЙ ДОМЕН
ФУНКЦИЯ
ГОМОЛОГИЯ
ДРУГИЕ ФЕРМЕНТЫ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Moser, Michael J.; Holley, William R.; Chatterjee, Aloke; Mian, I.Saira

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.12-04Б2.228

Astatke, Mekbib.
How E. coli DNA polymerase I (Klenow fragment) distinguishes between deoxy- and dideoxynucleotides [Text] / Mekbib Astatke, Nigel D. F. Grindley, Catherine M. Joyce // J. Mol. Biol. - 1998. - Vol. 278, N 1. - P147-165 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Как ДНК-полимераза I E. coli (кленовский фрагмент) различает дезокси- и дидезоксинуклеотиды
Аннотация: Кленовский фрагмент ДНК-полимеазы I (I) включает природные дНТФ (II) в 10{3}-10{4} раз более эффективно, чем дидезокси-НТФ (III). Выделены мутанты I, дефектные по дискриминации II и III. Замены Phe[762]/Ala (Tyr) вызывают драматическое уменьшение дискриминации, а замены Tyr[766] и Glu[710] вызывают меньший эффект. Определены предстационарные кинетические параметры включения II и III в р-циях, катализируемых I дикого типа и этими мутантами I. Показано, что дискриминация против III происходит в переходном состоянии с конформационным изменением, предшествующим переносу фосфата. Важная роль боковой цепи Phe[762], вероятно, состоит в установлении такого положения II, что 3{'}-OH-группа может взаимодействовать с др. группой в тройном комплексе. При введении Tyr в положение 762 такое позиционирование II сохраняется, но специфичность против III утрачивается, т. к. фенольная ОН-группа Tyr может компенсировать отсутствие 3{'}-OH в III. Замена на маленький остаток Ala вызывает утрату специфичности, т. к. II перестают правильно позиционироваться. Изучение зависимости скорости р-ции от Mg{2+} позволило предположить, что во взаимодействии с 3{'}-OH-группой II могут участвовать Mg{2+} и боковая цепь Glu[710] (вероятно, 3{'}-OH и карбоксильная группа Glu[710] являются лигандами одного и того же иона металла). США, Dep. Mol. Biophys. and Biochem., Yale Univ., New Haven, CT06520. Библ. 79

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
КЛЕНОВСКИЙ ФРАГМЕНТ
ДЕЗОКСИНУКЛЕОТИДЫ
ДИДЕЗОКСИНУКЛЕОТИДЫ
ДИСКРИМИНАЦИЯ
РЕПЛИКАЦИЯ
ДНК
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Grindley, Nigel D.F.; Joyce, Catherine M.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.12-04Б2.231

Interaction of DNA polymerase I (Klenow fragment) with DNA substrates containing extrahelical bases: Implications for proofreading of frameshift errors during DNA synthesis [Text] / Wai-Chung Lam [et al.] // Biochemistry. - 1999. - Vol. 38, N 9. - P2661-2668 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Взаимодействие ДНК-полимеразы I (кленовского фрагмента) с субстратами ДНК, содержащими внеспиральные основания: следствия для коррекции ошибок сдвига рамки во время синтеза ДНК
Аннотация: Методом разрешенной по времени флуоресцентной спектроскопии изучено взаимодействие между кленовским фрагментом ДНК-полимеразы I (I) и синтетич. затравками-матрицами ДНК, содержащими внеспиральные основания (ВСО) в определенных положениях матрицы. Данзильный зонд, прикрепленный к ДНК, использован для измерения относительной занятости полимеразного и (3''-'5')-экзонуклеазного активных центров (ЭАЦ) в I. Присутствие ВСО в первом положении на 3'-конце затравки увеличивает занятости ЭАЦ в 3-7 раз по сравнению с идеально спаренной затравкой-матрицей. По способности направлять ДНК в ЭАЦ различные ВСО можно расположить в ряд ГA'ПРИБЛ='ТЦ. С использованием матриц, у к-рых ВСО (аденин) находится в разных положениях, найдено, что ВСО узнается I на расстоянии до 5 н. от 3'-конца затравки. Наибольший эффект вызывает ВСО в положениях 3 и 4, когда уровень занятости ЭАЦ увеличивается соотв. в 8 и 18 раз. Изучение методом стационарной флуоресценции показало, что ВСО увеличивает степень расплетания ДНК на концах. Анализ удаления II из затравки-матрицы под действием I показал, что экзонуклеазная активность I коррелирует с увеличением уровня распределения в ЭАЦ ДНК, имеющей ВСО. Эти данные показали, что ошибочное выравнивание затравки и матрицы, порождающее ВСО, способствует переносу субстрата в (3''-'5'). ЭАЦ, так что предмутац. интермедиаты в мутагенезе со сдвигом рамки подвергаются коррекции I. США, Dep. Mol. Biol., Scripps Res. Inst., La Jolla, CA 92037. Библ. 27

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ФЕРМЕНТЫ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
РЕПЛИКАЦИЯ
СДВИГ РАМКИ
КОРРЕКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Lam, Wai-Chung; Van, der Schans Edwin J.C.; Sowers, Lawrence C.; Millar, David P.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.12-04Б2.232

dNTP, ковалентно присоединенные к ДНК-полимеразам через основание, активны в реакциях нуклеотидильного переноса [Текст] / О. И. Лаврик [и др.] // Молекул. биол. - 1998. - Т. 32, N 4. - С. 621-628 . - ISSN 0026-8984
Аннотация: Исследовано взаимодействие ДНК-полимераз - ДНК-полимеразы 'бета' млекопитающих и фрагмента Кленова ДНК-полимеразы 1 E. coli - с дезоксинуклеозид-5'-трифосфатами. В кач-ве фотоаффинных реагентов для каталитически компетентного мечения dNTP-связывающего участка ДНК-полимераз использованы 5-[N-(2-нитро-5-азидобензоил)-транс-3-аминопропенил-1] -дезоксиуридин-5'-трифосфат (NABdUTP), 4-тиотимидин-5'-трифосфат (sTTP) и 5-иододезоксиуридин-5'-трифосфат (1dUTP), являющиеся субстратами ДНК-полимераз. Фотореакционноспособные аналоги dNTP были ковалентно присоединены к ДНК-полимеразам с помощью УФ-света и использованы для элонгации праймера, меченного {32}P по 5'-концевому фосфату, в составе дуплексов, содержащих комплементарное и некомплементарное dNTP основание матрицы, и дуплекса с "тупыми концами" (без кодирующего матричного основания). Для эффективной элонгации праймера ковалентно присоединенным dNTP важна конформационная подвижность dNTP. Перенос нуклеотидильного остатка на тупой конец происходил только после ковалентной фиксации dNTP и был более эффективным в присутствии ионов Mn{2+}, чем Mg{2+}. Связывание dNTP ДНК-полимеразами, как и последующий нуклеотидильный перенос, могут происходить в отсутствие "кодирующего" основания матрицы. Основание матрицы определяет выбор dNTP, взаимодействуя с ДНК-полимеразами как кофактор, формирующий специфический комплекс для отбора dNTP на каждом этапе элонгации. Россия, НИБоХ, Новосибирск, 630090. Библ. 24

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ДНК-ПОЛИМЕРАЗА 'БЕТА'
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
ФРАГМЕНТ КЛЕНОВА
ДНТФ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ДНК
РЕПЛИКАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Лаврик, О.И.; Захаренко, А.Л.; Прасад, Р.; Власов, В.А.; Богачев, В.С.; Фавр, А.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.12-04Б2.323

Gupta, Radhey S.
Signature sequences in diverse proteins provide evidence of a close evolutionary relationship between the Deinococcus-Thermus group and cyanobacteria [Text] / Radhey S. Gupta, Vanessa Johari // J. Mol. Evol. - 1998. - Vol. 46, N 6. - P716-720 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: Сигнатурные последовательности у разнообразных белков служат доказательством эволюционного родства между группой Deinococcus-Thermus и цианобактериями
Аннотация: Идентифицировано несколько белков, содержащих четкие сигнатурные последовательности, общие для членов р. Deinococcus-Thermus и видов цианобактерий и отсутствующие у др. эубактерий и архебактерий. К этим белкам относятся семейство белков теплового шока DnaJ/Hsp40, ДНК-полимераза I и факторы элонгации трансляции EF-Tu и EF-Ts. Близкое родство Deinococcus-Thermus и цианобактерий подтверждают и филогенетич. деревья, основанные на последовательностях DnaJ и Hsp70. Канада, Dep. Biochem., Mc Master Univ., Hamilton, Ontario L8N 3Z5. Библ. 17

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.23
Рубрики: БЕЛОК
БЕЛКИ ТЕПЛОВОГО ШОКА DNAJ/HSP4O
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
ФАКТОРЫ ЭЛОНГАЦИИ ТРАНСЛЯЦИИ EF-TU
EF-TS
СИГНАТУРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ЭВОЛЮЦИЯ
РОДСТВО
DEINOCOCCUS-THERMUS
ЦИАНОБАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Johari, Vanessa

19.

Патент 5948663 Соединенные Штаты Америки, МКИ C12N 9/12.

Mathur, Eric J.
Purified thermostable Pyrococcus furiosus DNA polymerase I [Текст] / Eric J. Mathur ; Stratagene. - № 07/803627 ; Заявл. 02.12.1991 ; Опубл. 07.09.1999
Перевод заглавия: Очищенная термостабильная ДНК-полимераза I из Pyrococcus furiosus
Аннотация: Патентуется очищенная термостабильная ДНК-полимераза из Pyrococcus furiosus, к-рая мигрирует в неденатурирующем полиакриламидном геле быстрее, чем фосфорилаза B и Taq-полимераза, и медленнее, чем бычий сывороточный альбумин. Очищенная ДНК-полимераза имела мол. массу 90 000-93 000 Д. Мол. массу фермента определяли при использовании стандарта Taq-полимеразы с мол. массой 94 000 Д

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.07
Рубрики: ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
ОЧИЩЕННЫЙ ТЕРМОСТАБИЛЬНЫЙ ФЕРМЕНТ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ПАТЕНТЫ
США
PYROCOCCUS FURIOSUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Stratagene
Свободных экз. нет

20.

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I
ОЧИЩЕННЫЙ ТЕРМОСТАБИЛЬНЫЙ ФЕРМЕНТ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ПАТЕНТЫ
США
PYROCOCCUS FURIOSUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Stratagene
Свободных экз. нет

1-20 21-40 41-55

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска