Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ<.>)
Общее количество найденных документов : 26
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-26 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 95.09-04Б4.131

   

    Molecular epidemiology of Legionella pneumophila serogroup 1 by ribotyping with a non-radioactive probe and PCR fingerprinting [Text] / Peggy Matsiota-Bernard [et al.] // FEMS Immunol. and Med. Microbiol. - 1994. - Vol. 9, N 1. - P23-27 . - ISSN 0928-8244
Перевод заглавия: Исследования по молекулярной эпидемиологии Legionella pneumophila серогруппы I при использовании риботипирования с нерадиоактивным зондом и ПЦР-фингерпринтов
Аннотация: Исследовали возможность использования риботипирования и ПЦР-фингерпринтирования в эпидемиологических исследованиях Legionella pneumophila серогруппы I. Для обнаружения полиморфизма ДНК среди изолятов L. pneumophila серогруппы I провели гибридизацию с 16+23S рРНК из Escherichia coli, меченной ацетиламинофлуореном. У изолятов, происходящих от больных, не являющихся родственниками, получили, по крайней мере, 4 различных образца рестрикции рРНК. В то же время для больных родственников получили только один такой образец. Для дальнейшего анализа изолятов провели амплификацию геномных районов с произвольными праймерами в ПЦР и получили 6 различных образцов амплификации для неродственных изолятов. Показали, что риботипирование и ПЦР-фингерпринтирование дополняют друг друга и могут быть использованы в эпидемиологических исследованиях L. pneumophila серогруппы I. Франция, Lab. de Microbiol., Hopital Raymond Poincare, 92380, Garches. Ил. 2. Табл. 1. Библ. 12
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.11
Рубрики: ГЕНОМ
РИБОТИПИРОВАНИЕ

МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ

ПЦР-ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ

LEGIONELLA PNEUMOPHILA (BACT.)

ЭПИДЕМИОЛОГИЯ


Доп.точки доступа:
Matsiota-Bernard, Peggy; Thierry, Dominique; Guesdon, Jean-Luc; Nauciel, Charles

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 96.01-04Б4.173

   

    Discrimination of Mycobacterium avium - Mycobacterium intracellulare strains by genomic DNA fingerprinting with a 16S rRNA gene probe [Text] / Rachel Peillon [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 1994. - Vol. 124, N 1. - P75-80 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Различение штаммов Mycobacterium avium - Mycobacterium intracellulare с помощью фингерпринтирования геномной ДНК при использовании в качестве зонда гена 16S рРНК
Аннотация: Авторы исследовали возможность использования риботипирования для различения 10 штаммов с различными серотипами и 7 эпидемиологически неродственных изолятов Mycobacteruim avium - Mycobacterium intracellulare. При этом в качестве зонда была использована меченая 16S рДНК. Из 13 проверенных эндонуклеаз рестрикции 2 (SacI и ClaD) дали возможность определить 10 риботипов у 17 штаммов с индексом дискриминации 0,897. Воспроизводимость метода составляла 100%. Авторы показали наличие полиморфизма RE фрагментов в пределах и вне гена 16S рРНК, к-рый может быть использован в эпидемиологических исследованиях. Франция, Unite d'infectiologie, Inst. Pasteur de Lyon, Avenue Tony-Garnier, 69365 Lyon Cedex 7. Табл. 1. Ил. 2. Библ. 18
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.25.09
Рубрики: ХРОМОСОМЫ
РИБОТИПИРОВАНИЕ

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ

MYCOBACTERIUM AVIUM (BACT.)

MYCOBACTERIUM INTRACELLULARE (BACT.)

ПАТОГЕННЫЕ БАКТЕРИИ


Доп.точки доступа:
Peillon, Rachel; Drouet, Emmanuel B.; Bruneau, Sylvie; Panteix, Gilles; Denoyel, Gerard-Antoine; Montclos, Henri P.De

3.
Патент 5244815 Соединенные Штаты Америки, МКИ G01N 33/545; G01N 33/94.

    Guirguis, Raouf A.
    Fingerprint test pad and method for fingerprinting using particle based immunoassay [Текст] / Raouf A. Guirguis ; LaMina Ltd. - № 759922 ; Заявл. 13.09.1991 ; Опубл. 14.09.1993
Перевод заглавия: Камера для теста фингерпринт и метод для фингерпринтирования с использованием иммунопроб с частицами
Аннотация: Предложен метод и прибор для выявления наличия веществ, напр., лекарств, в биологических жидкостях. Прибор состоит из абсорбционной камеры и мембраны, помещаемой в камеру, содержащей несколько разделенных областей, в к-рые помещают лиганды, имеющие специфические рецепторные сайты, присоединяющие или отталкивающие специфические антигены, возникающие под влиянием выявляемых лекарств. Метод включает несколько фаз определения, включая получение отпечатков меченных антител, внесенных в мембрану. По отпечаткам определяют наличие или отсутствие исходного вещества. США, LaMins Ltd., Rockville, MD
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.43.05.07
Рубрики: ОПРЕДЕЛЕНИЕ АНТИГЕНОВ
ЛЕКАРСТВА

НОВЫЙ МЕТОД

ПРИБОР

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
LaMina Ltd.
Свободных экз. нет

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.01-04Б2.212

    Hirsch, C. F.

    Use of polymerase chain reaction (PCR) fingerprinting to differentiate bacteria for microbial products screening [Text] / C. F. Hirsch, J. M. Sigmund // J. Ind. Microbiol. - 1995. - Vol. 15, N 2. - P85-93 . - ISSN 0169-4146
Перевод заглавия: Использование ПЦР-фингерпринтирования для разделения бактерий с помощью скрининга микробных продуктов
Аннотация: Авторы провели ПЦР-фингерпринтирование для разделения традиционных и нетрадиционных бактерий по продуктам скрининга. Для этого из бактериальных клеток экстрагировали ДНК, инкубируя их в воде при 95'ГРАДУС'C 30 мин. 1 мкл бесклеточного водного экстракта, затем использовали в качестве источника матричной ДНК для ПЦР. Продукты ПЦР разделяли с помощью электрофореза в ПАГ при окрашивании этидиум бромидом. Фингерпринты, полученные для каждой исследованной культуры, были уникальными, воспроизводились при повторных исследованиях и не зависели от условий культивирования. С помощью ПЦР-фингерпринтирования авторы разделяли актиномицеты, грамотрицательные и грамположительные почвенные бактерии, а также нек-рые из фотосинтезирующих бактерий. США, Dep. of Natural Products Discovery, Merck Res. Lab., Rahway, NJ 07065. Ил. 9. Библ. 21
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ФОТОСИНТЕЗИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ
АКТИНОМИЦЕТЫ

ПОЧВЕННЫЕ БАКТЕРИИ

ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ

ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ

РАЗДЕЛЕНИЕ

ДНК МАТРИЧНАЯ

ВОДНЫЙ ЭКСТРАКТ

ОТДЕЛЬНЫЕ КУЛЬТУРЫ

ПЦР-ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Sigmund, J.M.

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.06-04Б2.337

   

    Genetic diversity of Agrobacterium vitis as determined by DNA fingerprints of the 5'-end of the 23S rRNA gene and random amplified polymorphic DNA [Text] / E. A. Momol [et al.] // Vitis: Viticulat. and Enol. Absir. - 1999. - Vol. 38, N 3. - P20-21 . - ISSN 0175-8292
Перевод заглавия: Генетическое разнообразие Agrobacterium vitis, определенное путем фингерпринтирования ДНК 5'-конца гена 23S рРНК и случайно амплифицированных полиморфных ДНК
Аннотация: Тезисы. Получены геномные фингерпринты 69 штаммов Agrobacterium vitis путем фингерпринтирования ДНК 5'-конца гена 23S рРНК. Фрагмент этого региона был амплифицирован и расщеплен 5 различными эндонуклеазами. Путем кластерного анализа выявлены 2 кластера и 5 групп штаммов. Разделение на эти группы коррелирует со способностью штаммов усваивать нопалин или виолин. Для получения более разнообразных проб использовали метод RAPD-анализа случайно амплифицированных полиморфных ДНК. Выявлена хорошая корреляция полученного распределения штаммов и их способности к катаболизму опинов. Полученные данные могут быть использованы для контроля заболеваемости растений корончатыми галлами
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.31.02
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН 23SP РНК

5'-КОНЕЦ

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ

МЕТОД RAPD - АНАЛИЗ СЛУЧАЙНО АМПЛИФИЦИРОВАННЫХ ПОЛИМОРФНЫХ ДНК

AGROBACTERIUM

ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ

КОРРЕЛЯЦИЯ

КАТАБОЛИЗМ ОПИНОВ


Доп.точки доступа:
Momol, E.A.; Burr, T.J.; Reid, C.L.; Momol, M.T.; Hseu, S.H.; Otten, L.

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.156

   

    Genomic fingerprinting of shigatoxin-producing Escherichia coli (STEC) strains: Comparison of pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and fluorescent amplified-fragment-length polymorphism (FAFLP) [Text] / E. Heir [et al.] // Epidemiol. and Infec. - 2000. - Vol. 125, N 3. - P537-548 . - ISSN 0950-2688
Перевод заглавия: Геномное фингерпринтирование шига токсин-продуцирующих штаммов Escherichia coli (STEC): сравнение гель-электрофореза в пульсирующем поле (PFGE) и анализа полиморфизма длин амплифицированных фрагментов при флуоресценции (FAFLP)
Аннотация: 88 изолятов шига токсин-продуцирующих Escherichia coli (STEC) были исследованы с помощью фингерпринтирования амплифицированных фрагментов полиморфной длины при флуоресценции (FAFLP) или гель-электрофореза в пульсирующем поле (PFGE). Получен 51 образец PFGE и 24 FAFLP-профиля. Показали, что PFGE обладает большей дискринирующей способностью и остается методом выбора при эпидемиологических исследованиях STEC-инфекций. Норвегия, Dep. of Bacteriology, National Institute of Public Health, P.O. Box 4404 Torshov, N-0403 Oslo. Табл. 2. Ил. 5. Библ. 37
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШИГА-ТОКСИН ПРОДУЦИРУЮЩИЕ ШТАММЫ

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ

ПОЛИМОРФИЗМ ДЛИН АМПЛИФИЦИРОВАННЫХ ФРАГМЕНТОВ ПРИ ФЛУОРЕСЦЕНЦИИ

ГЕЛЬ-ЭЛЕКТРОФОРЕЗ В ПУЛЬСИРУЮЩЕМ ПОЛЕ


Доп.точки доступа:
Heir, E.; Lindstedt, B.-A.; Vardund, T.; Wasteson, Y.; Kapperud, G.

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 03.06-04Б4.136

    van, Loo Inge H. M.

    Changes in the Dutch Bordetella pertussis population in the first 20 years after the introduction of whole-cell vaccines [Text] / Loo Inge H. M. van, Frits R. Mooi // Microbiology. - 2002. - Vol. 148, N 7. - P2011-2018 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Изменения в голландской популяции Bordetella pertussis в первые 20 лет после введения клеточных вакцин
Аннотация: Несмотря на введение массовой вакцинации в Нидерландах в 1953 г. происходят регулярные вспышки заболеваний. Исследовали изменения в популяции Bordetella pertussis в первые 20 лет после введения вакцинации методом индексации IS1002 типов фингерпринтирования, фимбриальных серотипов и 15 генов, кодирующих поверхностные белки. Сравнили три периода - перед вакцинацией (1949-1952) и два последующих - (1953-1958) и (1965-1972). Между двумя первыми периодами различия отсутствовали, за исключением фимбриальных серотипов. Смертность уменьшилась в 5 раз во второй период и в 543 раза в 3-й по сравнению с 1-м периодом. Этому сопутствовали изменения в частотах фимбриальных серотипов и ptxS1 аллелей. В 50% изолятов периода 1965-1972 гг. наблюдали новый тип ft29, ассоциированный с новыми ptxS1 и ptxS1A аллелями. Сделано заключение о возникновении в популяции адаптивного ответа за период, прошедший после вакцинации. Нидерланды, Lab. for Infectious Diseases Res., National Inst. of Public Health and Environment, 3720 BA Bilthoven. Библ. 33
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.11
Рубрики: ПОПУЛЯЦИЯ
ГЕННЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ

АДАПТИВНЫЙ ОТВЕТ

PTXS АЛЛЕЛИ

ВАКЦИНАЦИЯ

МЕТОДЫ СЕРОТИПИРОВАНИЯ

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ

BORDETELLA PERTUSSIS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Mooi, Frits R.

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.03-04Б2.88

   

    Fingerprinting of prokaryotic 16S rRNA genes using oligodeoxyribonucleotide microarrays and virtual hybridization [Text] / Miguel Angel Reyes-Lopez [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 2. - P779-789 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Фингерпринтирование прокариотических генов 16S рРНК с использованием микропостроений и виртуальной гибридизации
Аннотация: Олигонуклеотидная микросистема гибридизации для дифференциации различных видов микробов была разработана и проверена. Исследовали 7 видов микробов, включая один штамм Bacillus и шесть штаммов Pseudomonas. Последовательности ДНК рядом с 5'-концом генов рРНК 16S были "выравнены", что привело к обнаружению 2-х соприкасающихся районов с высокой вариабельностью, фланкированные высоко консервативными последовательностями. Консервативные последовательности были использованы для конструирования 88-ми 9-ти мерных гибридных проб, которые наносили на стеклянные пластинки. Односпиральные флюоресцентно меченные продукты ПЦР гибридизовали в микросистеме при 15{'ГРАДУС'}C. Результаты экспериментов сравнили с значениями 'ДЕЛЬТА'G{0} для парных и непарных дуплексов, возможных между синтетическими пробами и последовательностью-мишенью 16S семи проверенных видов. Для расчетов использовали программу "виртуальной гибридизации". Хотя наблюдаемые образцы гибридизации отличались значительно от образцов, определенных исключительно на основании безупречных пар последовательностей, уникальные образцы гибридизации были получены для каждого вида, включая близкородственные виды Pseudomonas. Наблюдали корреляцию между интенсивностью сигналов гибридизации и подсчитанными значениями 'ДЕЛЬТА'G{0}. Делают вывод, что как идеальные, так и ошибочные пары могут вносить вклад в идентификацию микробов с помощью гибридизационного фингерпринтирования. США, Life Sci. Div., Oak Ridge Nat., Lab., Building 4500-S, MS 6123, Bethel Valley Road, PO Box 2008, Oak Ridge, TN 37831. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ РИБОСОМНОЙ РНК 16S

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ

МИКРОПОСТРОЕНИЯ

ВИРТУАЛЬНАЯ ГИБРИДИЗАЦИЯ

ГЕНОМ

РИБОТИПИРОВАНИЕ

МЕТОД

РАЗРАБОТКА

PSEUDOMONAS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Reyes-Lopez, Miguel Angel; Mendez-Tenorio, Alfonso; Maldonado-Rodriguez, Rogelio; Doktycz, Mitchel J.; Fleming, James T.; Beattie, Kenneth L.

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.10-04Б2.164

   

    Identification of Bifidobacterium species using rep-PCR fingerprinting [Text] / Liesbeth Masco [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2003. - Vol. 26, N 4. - P557-563 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Идентификация видов Bifidobacterium с помощью фингерпринтов rep-ПЦР
Аннотация: Оценили применимость rep-ПЦР фингерпринтирование для дифференциации широкого ряда бифидобактерий. Для этого сравнили несколько наборов праймеров для амплификации повторяющихся ДНК-последовательностей: BOX, ERIC, (GTG)[5] и REP. Показали, что BOXAIR - самый оптимальный праймер для установления таксономической структуры 80 типов бифидобактерий и референтных штаммов. Провели BOX-ПЦР-идентификацию 48 неизвестных бифидобактерий, выделенных из пробиотических продуктов и фекальных образцов. Авторы рассматривают rep-ПЦР-фингерпринтирование с использованием праймера BOXAIR, как перспективный инструмент для идентификации широкого ряда бифидобактерий. Бельгия, Lab. of Microbiol., Dep. of Biochemistry, Physiology and Microbiol., Ghent Univ., K. L. Ledeegancksraat 35, B-9000 Gent. Ил. 1. Библ. 28
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОТИП
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

МЕТОДЫ

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ REP-ПЦР

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

РАЗЛИЧНЫЕ ПРАЙМЕРЫ

РАЗРАБОТКА

BIFIDOBACTERIUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Masco, Liesbeth; Huys, Geert; Gevers, Dirk; Verbrugghen, Leen; Swings, Jean

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.10-04Б4.89

   

    Identification of Bifidobacterium species using rep-PCR fingerprinting [Text] / Liesbeth Masco [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2003. - Vol. 26, N 4. - P557-563 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Идентификация видов Bifidobacterium с помощью фингерпринтов rep-ПЦР
Аннотация: Оценили применимость rep-ПЦР фингерпринтирование для дифференциации широкого ряда бифидобактерий. Для этого сравнили несколько наборов праймеров для амплификации повторяющихся ДНК-последовательностей: BOX, ERIC, (GTG)[5] и REP. Показали, что BOXAIR - самый оптимальный праймер для установления таксономической структуры 80 типов бифидобактерий и референтных штаммов. Провели BOX-ПЦР-идентификацию 48 неизвестных бифидобактерий, выделенных из пробиотических продуктов и фекальных образцов. Авторы рассматривают rep-ПЦР-фингерпринтирование с использованием праймера BOXAIR, как перспективный инструмент для идентификации широкого ряда бифидобактерий. Бельгия, Lab. of Microbiol., Dep. of Biochemistry, Physiology and Microbiol., Ghent Univ., K. L. Ledeegancksraat 35, B-9000 Gent. Ил. 1. Библ. 28
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.25.99
Рубрики: ГЕНОТИП
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

МЕТОДЫ

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ REP-ПЦР

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

РАЗЛИЧНЫЕ ПРАЙМЕРЫ

РАЗРАБОТКА

BIFIDOBACTERIUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Masco, Liesbeth; Huys, Geert; Gevers, Dirk; Verbrugghen, Leen; Swings, Jean

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 05.01-04В2.99

    Kennedy, Nabla.

    Fingerprinting the fungal community [Text] / Nabla Kennedy, Nicholas Clipson // Mycologist. - 2003. - Vol. 17, N 4. - P158-164 . - ISSN 0269-915X
Перевод заглавия: Фингерпринтирование грибного сообщества
Аннотация: Грибы повсеместно распространены и играют важную роль в процессах, происходящих в экосистемах. Однако большинство грибов не удается выделить и идентифицировать. Предприняты успешные попытки использования метода фингерпринтирования, а также методов D/TGGE, SSCP, RISA T-RFLP. Эти методы обеспечивали быстрое выявление профилей грибных популяций в экосистеме без предварительного лабораторного культивирования и клонирования грибов. Ирландия, Dep. of Industrial Microbiology, Univ. College Dublin, Belfield, Dublin 4. Ил. 2. Табл. 1. Библ. 26
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.29.15.17.05
Рубрики: FUNGI
ИДЕНТИФИКАЦИЯ

МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Clipson, Nicholas

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.04-04Б2.292

    Baldy-Chudzik, Katarzyna.

    Rep-PCR fingerptinting as a tool for the analysis of genomic diversity in Escherichia coli strains isolated from an aqueous/freshwater environment [Text] / Katarzyna Baldy-Chudzik, Joanna Niedbach, Michal Stosik // Cell. and Mol. Biol. Lett. - 2003. - Vol. 8, N 3. - P793-798 . - ISSN 1425-8153
Перевод заглавия: Rep-ПЦР фингерпринтирование как инструмент для анализа геномного разнообразия штаммов Escherichia coli, выделенных из водной среды
Аннотация: Rep-ПЦР фингерпринтирование с праймерами ERIC и REP использовали для анализа геномного разнообразия 93 штаммов Escherichia coli, выделенных из водной среды на двух различных глубинах озера. Применение UPGMA для анализа ДНК не выявило геномного сходства между 48 штаммами E. coli, полученными с поверхности и 43 штаммами из глубины. Геномное разнообразие штаммов с поверхностной зоны отражено на дендрограмме в форме 8 групп штаммов. В глубине наблюдали меньшее геномное разнообразие (5 групп). Применение REP-праймеров приводило к более сложным фингерпринтам, что увеличивало разделяющую способность анализа, тогда как ERIC-праймеры давали менее сложные, но более легко интерпретируемые результаты. Польша, Inst. of Biotechnology and Environmental Sci., Univ. of Zielona Gora, Monte Cassino 21b, 65-561 Zielona Gora. Библ. 9
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.31.02
Рубрики: ЭКОЛОГИЯ
ОЗЕРНАЯ ВОДА

РАЗНЫЕ ГЛУБИНЫ

БАКТЕРИАЛЬНОЕ ЗАРАЖЕНИЕ

ГЕНОТИП

РАЗЛИЧНЫЕ ШТАММЫ

РАЗНООБРАЗИЕ

МЕТОДЫ

REP-ПЦР ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Niedbach, Joanna; Stosik, Michal

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 05.05-04В2.41

   

    Telomeric fingerprinting of the violet root rot fungus, Helicobasidium mompa: a useful tool for karyotype estimation [Text] / T. Aimi [et al.] // Mycol. Res. - 2003. - Vol. 107, N 9. - P1055-1059 . - ISSN 0953-7562
Перевод заглавия: Фингерпринтирование теломеров гриба фиолетовой гнили Helicobasidium mompa - пригодный инструмент для оценки кариотипа
Аннотация: Проведена гибридизация теломера pTe146, изолированного из Coprinus cinereus, с геномной ДНК H. mompa. Гибридные фрагменты оказались более чувствительными к нуклеазе Ba131, чем у негибридизированных, т. к. эти фрагменты располагались на концах хромосом у H. mompa. Этот метод может быть использован для подсчета числа хромосом у монобазидиальных изолятов, изучения полиморфизма и идентификации штаммов. Полученные в природе изоляты относились к одной группе вегетативной совместимости
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.29.15.17.05
Рубрики: HELICOBASIDIUM MOMPA (FUNGI)
ТЕЛОМЕРЫ

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Aimi, T.; Kano, S.; Iwasaki, Y.; Morinaga, T.

14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.04-04Б2.198

   

    BOX-PCR fingerprinting as a powerful tool to reveal synonymous names in the genus Streptomyces. Emended descriptions are proposed for the species Streptomyces cinereorectus, S.fradiae, S.tricolor, S.colombiensis, S.filamentosus, S. vinaceus and S.phaeopurpureus [Text] / Benjamin Lanoot [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2004. - Vol. 27, N 1. - P84-92 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: BOX-ПЦР фингерпринтирование - мощный инструмент для выяснения названий-синонимов в роде Streptomyces. Исправленные описания для видов Streptomyces cinereorectus, S. fradiae, S. tricolor, S. colombiensis, S. filamentosus, S. vinaceus и S. phaeopurpureus
Аннотация: Провели скрининг типичных штаммов 451 вида Streptomyces с помощью BOX-ПЦР фингерпринтинга. Наиболее отчетливые и воспроизводимые паттерны бэндов получили с использованием BOX-праймера. Большинство из исследованных видов (350) имели уникальные паттерны. Идентифицировали 30 кластеров с составе видов, при этом 4 из них были видами-синонимами. Показали высокую корреляцию между данными по BOX-фингерпринтингу и данными по гомологии ДНК-ДНК. Полученные данные привели к следующим исправлениям: S. cochleatus - синоним S. cineriorectus, S roseoflavus - S. fradiae, S. roseodiastaticus - S. tricolor, S. roseosporus - S. filamentosus, S. distallicus - S. colombiensis, S. arabicus - S. vinaceus и S. phacoviridis - S. phaeopurpureus. Бельгия, Benjamin Lanoot, Lab. voor Microbiol., Vakgroep Biochemie, Fysiologie en Microbiol., Univ. Gent, K.L. Ledeganckstraat 35, 9000 Gent. Ил. 2. Табл. 2. Библ. 29
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОТИП
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ГЕНОТИПИРОВАНИЕ

МЕТОДЫ

BOX-ПЦР-ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ

РАЗРАБОТКА

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

STREPTOMYCES CINEREORECTUS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Lanoot, Benjamin; Vancanneyt, Marc; Dawyndt, Peter; Cnockaert, Margo; Zhang, Jianli; Huang, Ying; Liu, Zhiheng; Swings, Jean

15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 08.03-04Б4.62

   

    Epidemiological tracing of Salmonella enterica serotype Abortusovis from Spanish ovine flocks by PFGF fingerprinting [Text] / S. Valdezate [et al.] // Epidemiol. and Infec. - 2007. - Vol. 135, N 4. - P695-702 . - ISSN 0950-2688
Перевод заглавия: Эпидемиологическое отслеживание Salmonella enterica серотип abortusovis в испанских стадах овец методом получения PFGE фингерпринтов
Аннотация: Используя XbaI-PFGE, исследовали Salmonella enterica серотип abortusovis, выделенные от овец в стадах из 11 провинций. Несмотря на то, что штаммы были географически и пространственно связанными, PFGE продемонстрировал эпидемиологически приемлемую различающую способность, идентифицировав 20 клонов (схожесть 52-96%). Клоны Sabv6, 1, 5 были определены в 7, 5 и 2 областях, соответственно, другие 17 клонов были обнаружены в отдельных местах. Клоны из близких географических регионов показали высокую схожесть (различие в одной полосе в профиле PFGE), что говорит об общем предке. Было зафиксировано одновременное выделение клонов (Sabv5-6, Sabv1-3, Sabv1-6) в одном и том же стаде. Исследование методом PFGE показало преобладание и широкую распространенность клона Sabv6, выделенного в 21 из 55 изолятов S. enterica серотип abortusovis, изученных в Испании. Испания, Spanish Reference Lab. for Salmonella and Shigella (LNRSSE), Servico de Bacteriologia, C. N. M. Inst. de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.59
Рубрики: SALMONELLA ENTERICA (BACT.)
СЕРОТИП ABORTUSOVIS

ЭПИДЕМИОЛОГИЯ

КЛОНЫ

РАЗЛИЧИЕ

СХОЖЕСТЬ

РАЗНЫЕ ГЕОГРАФИЧЕСКИЕ РАЙОНЫ

ИСПАНИЯ

МЕТОДЫ

PFGE ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ

ОВЦЫ


Доп.точки доступа:
Valdezate, S.; Astorga, R.; Herrera-Leon, S.; Perea, A.; Usera, M.A.; Huerta, B.; Echeita, A.

16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.04-04Б2.185

   

    Пороформирующие токсины Bacillus cereus гемолизин II и цитотоксин К: полиморфизм и распределение генов среди представителей цереусной группы [Текст] / А. М. Шадрин [и др.] // Микробиология. - 2007. - Т. 76, N 4. - С. 462-470 . - ISSN 0026-3656
Аннотация: С помощью BcREP-фингерпринтирования была установлена филогенетическая взаимосвязь 40 штаммов группы Bacillus cereus. Методом ПЦР показано, что частота встречаемости генов цитотоксина К (cytK) гемолизина II (hlyII) составляет 61 и 56% соответственно. При этом ген регулятора гемолизина II (hlyIIR) встречается совместно с hlyII. Сопоставление результатов фингерпринтирования, ПЦР и ПДРФ генов токсинов показало, что бактерии с генотипами hlyII{+} и cytK{+} не образовывали отдельных кластеров. Однако у микроорганизмов со сходными фингерпринтами обнаруживались однотипные гены токсинов. Предложенный вариант ПДРФ анализа позволил четко различать гены cytK1 и cytK2. Двадцать три штамма, обладающие генами cytK, не несли опасного для млекопитающих cytK1. Помимо этого, вся коллекция микроорганизмов была проверена на способность к росту при 4'ГРАДУС'C. таким свойством обладали 5 штаммов, которые, скорее всего, следует позиционировать как B. weihenstephanensis. Два из пяти психротолерантных микроорганизма несли однотипный по ПДРФ вариант гена гемолизина II. Ни один из пяти штаммов не обладал геном cytK. Эти штаммы не формировали близких групп при кластеризации использованным нами методом BcREP фингерпринтов. Россия, Ин-т биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г. К. Скрябина РАН, Пущино. Библ. 27
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН ЦИТОТОКСИНА К CYTK

ГЕН ГЕМОЛИЗИНА II HLYII

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

РЕГУЛЯЦИЯ

ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ РЕГУЛЯТОР HLGIIR

ПДРФ-ВАРИАНТЫ ГЕНОВ ТОКСИНОВ

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ

BACILLUS CEREUS (BACT.)

ТОКСИНЫ

ПОРОФОРМИРУЮЩИЕ


Доп.точки доступа:
Шадрин, А.М.; Шапырина, Е.В.; Сиунов, А.В.; Северинов, К.В.; Солонин, А.С.

17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 08.04-04Б4.86

   

    Пороформирующие токсины Bacillus cereus гемолизин II и цитотоксин К: полиморфизм и распределение генов среди представителей цереусной группы [Текст] / А. М. Шадрин [и др.] // Микробиология. - 2007. - Т. 76, N 4. - С. 462-470 . - ISSN 0026-3656
Аннотация: С помощью BcREP-фингерпринтирования была установлена филогенетическая взаимосвязь 40 штаммов группы Bacillus cereus. Методом ПЦР показано, что частота встречаемости генов цитотоксина К (cytK) гемолизина II (hlyII) составляет 61 и 56% соответственно. При этом ген регулятора гемолизина II (hlyIIR) встречается совместно с hlyII. Сопоставление результатов фингерпринтирования, ПЦР и ПДРФ генов токсинов показало, что бактерии с генотипами hlyII{+} и cytK{+} не образовывали отдельных кластеров. Однако у микроорганизмов со сходными фингерпринтами обнаруживались однотипные гены токсинов. Предложенный вариант ПДРФ анализа позволил четко различать гены cytK1 и cytK2. Двадцать три штамма, обладающие генами cytK, не несли опасного для млекопитающих cytK1. Помимо этого, вся коллекция микроорганизмов была проверена на способность к росту при 4'ГРАДУС'C. таким свойством обладали 5 штаммов, которые, скорее всего, следует позиционировать как B. weihenstephanensis. Два из пяти психротолерантных микроорганизма несли однотипный по ПДРФ вариант гена гемолизина II. Ни один из пяти штаммов не обладал геном cytK. Эти штаммы не формировали близких групп при кластеризации использованным нами методом BcREP фингерпринтов. Россия, Ин-т биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г. К. Скрябина РАН, Пущино. Библ. 27
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.21.07.09
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН ЦИТОТОКСИНА К CYTK

ГЕН ГЕМОЛИЗИНА II HLYII

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

РЕГУЛЯЦИЯ

ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ РЕГУЛЯТОР HLGIIR

ПДРФ-ВАРИАНТЫ ГЕНОВ ТОКСИНОВ

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ

BACILLUS CEREUS (BACT.)

ТОКСИНЫ

ПОРОФОРМИРУЮЩИЕ


Доп.точки доступа:
Шадрин, А.М.; Шапырина, Е.В.; Сиунов, А.В.; Северинов, К.В.; Солонин, А.С.

18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 08.09-04Б4.50

   

    Influence of geographical origin and flour type on diversity of lactic acid bacteria in traditional Belgian sourdoughs [Text] / Ilse Scheirlinck [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2007. - Vol. 73, N 19. - P6262-6269 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Влияние географического происхождения и типа муки на разнообразие молочнокислых бактерий в традиционной бельгийской закваске
Аннотация: Используя полифазный метод идентификации, изучали разнообразие молочнокислых бактерий (МКБ) в бельгийской традиционной закваске и оценивали влияние вида муки, окружающей среде пекарни, географического происхождения и технологических характеристик на таксономический состав этих сообществ МКБ. На 11 кустарных пекарнях была отобрана 21 закваска, из которой выделили 714 МКБ. Видовой состав микроорганизмов в традиционной закваске характеризовали, используя метод культивирования в сочетании с методами идентификации генотипов. Установлено,С что МКБ в бельгийской закваске принадлежали к родам Lactobacillus, Pediococcus, Leuconostoc, Weissella и Enterococcus. Наиболее часто выделяли L. paralimentarius, L. sanfranciscensis, L. plantarum и L. pontis. Статистический анализ данных идентификации показал, что на состав микроорганизмов в закваске в основном влияет окружающая среда пекарни, а не вид муки. Сделано заключение, что полифазный метод, основанный на быстром скрининге генотипа и основанная на последовательностях идентификация с высоким разрешением являются мощными инструментами для изучения разнообразия МКБ в традиционных ферментированных продуктах, таких как закваска. Бельгия, Lab. of Microbiology, Dep. of Biochemistry, Physiology and Microbiology, Ghent Univ., K-. Ledeganchstraat, 35, B-9000, Ghent. Библ. 39
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.49.13.09 + 341.27.29.07.23
Рубрики: ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА
ПЕКАРНИ

ВИД МУКИ

ГЕОГРАФИЧЕСКОЕ ПРОИСХОЖДЕНИЕ

ВЛИЯНИЕ НА

МОЛОЧНОКИСЛЫЕ БАКТЕРИИ

ТАКСОНОМИЯ

ЗАКВАСКА

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

МЕТОДЫ

ГЕНОТИПЫ

ОПРЕДЕЛЕНИЕ ПЦР

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Scheirlinck, Ilse; Van, der Meulen Roel; Van, Schoor Ann; Vancanneyt, Marc; De, Vuyst Luc; Vandamme, Peter; Huys, Geert

19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.02-04Б2.146

   

    Leuconostoc holzapfelii sp. nov., isolated from Ethiopian coffee fermentation and assessment of sequence analysis of housekeeping genes for delineation of Leuconostoc species [Text] / Bruyne Katrien De [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2007. - Vol. 57, N 12. - P2952-2959
Перевод заглавия: Leuconostoc holzapfelii sp. nov., выделенный из продуктов ферментации эфиопского кофе и анализ генов домашнего хозяйства для определения видов Leuconostoc
Аннотация: Выделили грамположительную молочнокислую бактерию штамм LMG 23990{T} из продуктов ферментации эфиопского кофе. Анализ последовательности генов 16S рРНК показал, что новый штамм относится к роду Leuconostoc вместе с Leuconostoc citreum и Leuconostoc lactis (99,6 и 99,0% сходства, соответственно). Методы генотипического фингерпринтирования, ПДРФ, электрофореза клеточных белков, ДНК-ДНК-гибридизации, сравнительный анализ генов pheS, rpoA, atpA, физиологические и биохимические тесты позволили дифференцировать штамм LMG 23990{T} от остальных видов Leuconostoc. Штамм LMG 23990{T} представляет новый вид, названный Leuconostoc holzapfelii sp. nov. Бельгия, Lab. of Microbiol., Glent Univ. Ledeganskstraat 35, B-9000 Glent
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ФЕРМЕНТАЦИЯ
ЭФИОПСКИЙ КОФЕ

МОЛОЧНОКИСЛЫЕ БАКТЕРИИ

ГЕНОМ

РИБОТИПИРОВАНИЕ

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ

ДИФФЕРЕНЦИРОВАНИЕ ШТАММОВ

LEUCONOSTOC HOLZAPFELII (BACT.)


Доп.точки доступа:
De, Bruyne Katrien; Schillinger, Ulrich; Caroline, Lily; Boehringer, Benjamin; Cleenwerck, Ilse; Vancanneyt, Marc; De, Vuyst Luc; Franz, Charles M.A.P.; Vandamme, Peter

20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 12.01-04В2.88

   

    Fluorescent AFLP fingerprinting of Monilinia fructicola [Text] / T. Gril [et al.] // J. Plant Diseases and Prot. - 2010. - Vol. 117, N 4. - P168-172 . - ISSN 1861-3829
Перевод заглавия: Флуоресцирующее AFLP-фингерпринтирование Monilia fructicola
Аннотация: Впервые метод AFLP был применен для изучения генетической вариабельности изолятов M. fructicola. Проведен анализ 1256 поддающихся оценке фрагментов AFLP, полученных с 20 парами праймеров; 462 фрагмента оказались полиморфными. Высокая степень сходства установлена для изолятов с Malus из США, тогда как другие изоляты с Prunus из Испании, Японии и Новой Зеландии образовывали более вариабельную группу. Сравнительный анализ данных AFLP-фингерпринтирования выявил полное различие между изолятами M. fructicola, M. laxa и показал пригодность системы маркеров AFLP для разделения видов грибов плодовой гнили
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.29.15.17.05
Рубрики: MONILINIA FRUTICOSA (FUNGI)
ИЗОЛЯТЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

МОЛЕКУЛЯРНЫЙ МЕТОД

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Gril, T.; Celar, F.; Javornik, B.; Jakse, J.

 1-20    21-26 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)