Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА<.>)
Общее количество найденных документов : 11
Показаны документы с 1 по 11
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.10-04Б1.69

   
    Molecular clonning and analysis of functional envelope genes from human immunodeficiency virus type 1 sequence subtypes A through G [Text] / Feng Gao [et al.] // J. Virol. - 1996. - Vol. 70, N 3. - P1651-1667 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Молекулярное клонирование и анализ функциональных генов оболочки из последовательностей вируса иммунодефицита человека типа 1 субтипов A-G
Аннотация: Целые области env 35 независимых изолятов ВИЧ-1, выделенных в главных эпицентрах пандемии СПИД, амплифицированы методом ПЦР, клонированы и секвенированы. Анализ предсказанных аминокислотных последовательностей белка-предшественника gp160 (I) обнаружил ряд важных отличий от штаммов субтипа B, включая изменение числа и распределения остатков цис, значительные различия длины гипервариабельных областей и преждевременное укорачивание в домене gp41 (II). У I, образовавшихся при преходящей экспрессии, сильно варьируют содержание и размер углеводов. Филогенетический анализ полноразмерных последовательностей env показал, что изученные изоляты представляют все субтипы (A-G) ВИЧ-1 группы М, а также межсубтиповой рекомбинант F/B, выделенный в Бразилии. Все изоляты субтипа E и 3 изолята субтипа G, первично классифицированные на основе частичных последовательностей env, образуют в субтипе A кластер в 3'-половине области, кодирующей II, так что они также являются рекомбинантами. Анализ биологич. активности полученных с использованием ПЦР генов env позволил идентифицировать 20 клонов, в т. ч. по одному для каждого субтипа или рекомбинанта, экспрессирующих полностью функциональные гликопротеины оболочки. Один из этих клонов, происходящий из пациента со значительным уменьшением числа клеток CD4{+}, имеет замену Y721C в высококонсервативном сигнале эндоцитоза и укорачивание II на 17 остатков с C-конца. Несколько других конструкций env опосредуют вхождение ВИЧ-1 с очень низкой эффективностью, хотя не содержат изменений, к-рые должны повлиять на функции белков. Заключено, что гены env первичных изолятов ВИЧ-1, выделенных в разных странах, значительно отличаются друг от друга по генетич., филогенетич. и биологич. свойствам. США, Dep. of Med., Univ. of Alabama Birmingham, AL 35294. Библ. 104
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
СЕРОТИП 1
ИЗОЛЯТЫ
СУБТИПЫ
ГЕНЫ ENV
КЛОНИРОВАНИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА

Доп.точки доступа:
Gao, Feng; Morrison, Sandra G.; Robertson, David L.; Thornton, Charlotte L.; Craig, Stevenson; Karlsson, Gunilla; Sodroski, Joseph; Morgado, Mariza; Galvao-Castro, Bernardo; Von, Briesen Hagen; Beddows, Simon; Weber, Jonathan; Sharp, Paul M.; Shaw, George M.; Hahn, Batrice H.

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 97.10-04К1.363

   
    Molecular clonning and analysis of functional envelope genes from human immunodeficiency virus type 1 sequence subtypes A through G [Text] / Feng Gao [et al.] // J. Virol. - 1996. - Vol. 70, N 3. - P1651-1667 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Молекулярное клонирование и анализ функциональных генов оболочки из последовательностей вируса иммунодефицита человека типа 1 субтипов A-G
Аннотация: Целые области env 35 независимых изолятов ВИЧ-1, выделенных в главных эпицентрах пандемии СПИД, амплифицированы методом ПЦР, клонированы и секвенированы. Анализ предсказанных аминокислотных последовательностей белка-предшественника gp160 (I) обнаружил ряд важных отличий от штаммов субтипа B, включая изменение числа и распределения остатков цис, значительные различия длины гипервариабельных областей и преждевременное укорачивание в домене gp41 (II). У I, образовавшихся при преходящей экспрессии, сильно варьируют содержание и размер углеводов. Филогенетический анализ полноразмерных последовательностей env показал, что изученные изоляты представляют все субтипы (A-G) ВИЧ-1 группы М, а также межсубтиповой рекомбинант F/B, выделенный в Бразилии. Все изоляты субтипа E и 3 изолята субтипа G, первично классифицированные на основе частичных последовательностей env, образуют в субтипе A кластер в 3'-половине области, кодирующей II, так что они также являются рекомбинантами. Анализ биологич. активности полученных с использованием ПЦР генов env позволил идентифицировать 20 клонов, в т. ч. по одному для каждого субтипа или рекомбинанта, экспрессирующих полностью функциональные гликопротеины оболочки. Один из этих клонов, происходящий из пациента со значительным уменьшением числа клеток CD4{+}, имеет замену Y721C в высококонсервативном сигнале эндоцитоза и укорачивание II на 17 остатков с C-конца. Несколько других конструкций env опосредуют вхождение ВИЧ-1 с очень низкой эффективностью, хотя не содержат изменений, к-рые должны повлиять на функции белков. Заключено, что гены env первичных изолятов ВИЧ-1, выделенных в разных странах, значительно отличаются друг от друга по генетич., филогенетич. и биологич. свойствам. США, Dep. of Med., Univ. of Alabama Birmingham, AL 35294. Библ. 104
ГРНТИ  
34.43.41
ВИНИТИ 341.43.41.13.05
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
СЕРОТИП 1
ИЗОЛЯТЫ
СУБТИПЫ
ГЕНЫ ENV
КЛОНИРОВАНИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА

Доп.точки доступа:
Gao, Feng; Morrison, Sandra G.; Robertson, David L.; Thornton, Charlotte L.; Craig, Stevenson; Karlsson, Gunilla; Sodroski, Joseph; Morgado, Mariza; Galvao-Castro, Bernardo; Von, Briesen Hagen; Beddows, Simon; Weber, Jonathan; Sharp, Paul M.; Shaw, George M.; Hahn, Batrice H.

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 98.01-04Я6.220

    Park, J. H.
    Phylogenetic, structural and functional characteristics of the Na-K-Cl cotransporter family [Text] / J. H. Park, M. H. Saier // J. Membrane Biol. - 1996. - Vol. 149, N 3. - P161-168 . - ISSN 0022-2631
Перевод заглавия: Филогенетические, структурные и функциональные свойства семейства копереносчиков Na-K-Cl
Аннотация: Обзор. Приведены результаты исследований чувствительных к буметаниду копереносчиков Na-K-Cl и чувствительных к тиазиду копереносчиков Na-K, образующих семейство копереносчиков Na-K-Cl (KHKX). Результаты филогенетического анализа указывают на существование по крайней мере 6 изоформ КНКХ в клетках эукариот. Приведены результаты исследований структурных и функциональных св-в членов семейства КНКХ и отмечена нек-рая близость белков этого семейства с белками семейства переносчиков белков/полиаминов/холина. США, Dep. Biol., Univ. Carolina at San Diego, La Jolla, CA 92093-0116. Библ. 37
ГРНТИ  
34.19.19
ВИНИТИ 341.19.19.19
Рубрики: ТРАНСПОРТ СОВМЕСТНЫЙ
КОПЕРЕНОСЧИКИ NA-K-CL
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
СТРУКТУРНЫЕ СВОЙСТВА
ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ СВОЙСТВА

Доп.точки доступа:
Saier, M.H.

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 04.05-04Б3.18

    Wirth, Stephan.
    Cellulose-degrading potentials and phylogenetic classification of carboxymethyl-cellulose decomposing bacteria isolated from soil [Text] / Stephan Wirth, Andreas Ulrich // Syst. and Appl. Microbiol. - 2002. - Vol. 25, N 4. - P584-591 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Целлюлоза-деградирующий потенциал и филогенетическая классификация разрушающих карбоксиметилцеллюлозу бактерий, выделенных из почвы
ГРНТИ  
34.27.39
ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: STREPTOMYCES (BACT.)
ПОЧВЕННЫЕ ЦЕЛЛЮЛОЛИТИЧЕСКИЕ БАКТЕРИИ
ВЫДЕЛЕНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
ЦЕЛЛЮЛОЗА-ДЕГРАДИРУЮЩИЙ ПОТЕНЦИАЛ
КАРБОКСИМЕТИЛЦЕЛЛЮЛОЗА
БИОДЕГРАДАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Ulrich, Andreas

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 12.06-04Б2.151

   
    Isolation and identification of a pathogen of silkworm Bombyx mori [Text] / Heng-Ping Tao [et al.] // Curr. Microbiol. - 2011. - Vol. 62, N 3. - P876-883 . - ISSN 0343-8651
Перевод заглавия: Выделение и определение вида, патогенного для шелковичного червя Bombyx mori
Аннотация: Из заболевшего тутового шелкопряда выделили штамм бактерии-патогена, ST-1. Он был классифицирован на основе физиологических и биохимических признаков, а также анализа последовательностей в гене 16S-рРНК. Показано его теснейшее родство (99%) с Pseudomonas chlororaphis subsp. aurantica. ST-1 был представлен грамотрицательными палочками 0,7-0,9*1,3-1,5 мкм с закругленными концами. ST-1 мог использовать цитрат, малонат, D-глюкозу, сахарозу, D-фруктозу, D-маннозу и L-арабинозу. Патогенность ST-1 в отношении шелкопряда описывалась линейной регрессией логарифма (y) конц-ии ST-1 против вероятности (х) (y=0,4040+0,0600 x). Летальная конц-ия, LC[50], равнялась 2,12*10{4} КОЕ/мл. Подтверждается классификация ST-1 как Pseudomonas chlororaphis subsp. aurantica, впервые описанная в качестве патогена тутового шелкопряда
ГРНТИ  
34.27.23
ВИНИТИ 341.27.23.17 + 341.27.21.09.35
Рубрики: PSEUDOMONAS CHLORORAPHIS SUBSP. AURANTICA (BACT.)
БАКТЕРИЯ-ПАТОГЕН
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
АНАЛИЗ 16S-РРНК
ТУТОВЫЙ ШЕЛКОПРЯД BOMBYX MORI

Доп.точки доступа:
Tao, Heng-Ping; Sehn, Zhong-Yuan; Zhu, Feng; Xu, Xiao-Fang; Tang, Xu-Dong; Xu, Li

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 12.07-04Б2.81

    Дульцева, Н. М.
    Выделение бактерий рода Variovorax из матов Thioploca озера Байкал [Текст] / Н. М. Дульцева, С. М. Черницына, Т. И. Земская // Микробиология. - 2012. - Т. 81, N 1. - С. 72-83 . - ISSN 0026-3656
Аннотация: Из проб матов бесцветных серобактерий рода Thioploca (оз. Байкал) выделено три штамма грамотрицательных бактерий. Клетки новых штаммов подвижные, с перитрихальным жгутикованием. Микроорганизмы являются аэробами, облигатными хемоорганогетеротрофами, растущими в пределах значений рН 3.0-8.8 с оптиммумом при рН 8.3 и при температурах от 5 до 42'ГРАДУС'С с оптимумом при 28'ГРАДУС'С. Клетки содержат в основном менахином МК-8 Н2 и в незначительных количествах (менее 15%) МК-7 Н2, убихинона Q8 как минимум на порядок меньше. Уровень гибридизации ДНК между ними - от 80 до 94%, и, таким образом, все изоляты относятся к одному виду. Анализ нуклеотидных последовательностей гена 16S[p]PHK типового штамма (GenBank HQ400611) показал наличие близких гомологов среди известных видов рода Variovorax: 98% сходства с типовыми штаммами видов V. paradoxus, V. soli, V. ginsengisoli, V. boronicumulans и 96% сходства с типовым штаммом V. dokdonensis. В то же время выделенные штаммы существенно отличаются от ближайших соседей на филогенетическом дереве по составу жирных кислот и изопреноидных хинонов, что не позволяет безоговорочно отнести их к ранее известным видам. Россия, Учреждение РАН Ин-т микробиол. им. Виноградского С.Н. РАН, Москва
ГРНТИ  
34.27.23
ВИНИТИ 341.27.23.09 + 341.27.15.09
Рубрики: ВОДОЕМЫ
ОЗЕРО БАЙКАЛ
БАКТЕРИИ
THIOPLOCA (BACT.)
VARIOVORAX (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА

Доп.точки доступа:
Черницына, С.М.; Земская, Т.И.

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 12.12-04Б3.350

    Дульцева, Н. М.
    Выделение бактерий рода Variovorax из матов Thioploca озера Байкал [Текст] / Н. М. Дульцева, С. М. Черницына, Т. И. Земская // Микробиология. - 2012. - Т. 81, N 1. - С. 72-83 . - ISSN 0026-3656
Аннотация: Из проб матов бесцветных серобактерий рода Thioploca (оз. Байкал) выделено три штамма грамотрицательных бактерий. Клетки новых штаммов подвижные, с перитрихальным жгутикованием. Микроорганизмы являются аэробами, облигатными хемоорганогетеротрофами, растущими в пределах значений рН 3.0-8.8 с оптиммумом при рН 8.3 и при температурах от 5 до 42'ГРАДУС'С с оптимумом при 28'ГРАДУС'С. Клетки содержат в основном менахином МК-8 Н2 и в незначительных количествах (менее 15%) МК-7 Н2, убихинона Q8 как минимум на порядок меньше. Уровень гибридизации ДНК между ними - от 80 до 94%, и, таким образом, все изоляты относятся к одному виду. Анализ нуклеотидных последовательностей гена 16S[p]PHK типового штамма (GenBank HQ400611) показал наличие близких гомологов среди известных видов рода Variovorax: 98% сходства с типовыми штаммами видов V. paradoxus, V. soli, V. ginsengisoli, V. boronicumulans и 96% сходства с типовым штаммом V. dokdonensis. В то же время выделенные штаммы существенно отличаются от ближайших соседей на филогенетическом дереве по составу жирных кислот и изопреноидных хинонов, что не позволяет безоговорочно отнести их к ранее известным видам. Россия, Учреждение РАН Ин-т микробиол. им. Виноградского С.Н. РАН, Москва
ГРНТИ  
34.27.39
ВИНИТИ 341.27.39.21
Рубрики: ВОДОЕМЫ
ОЗЕРО БАЙКАЛ
БАКТЕРИИ
THIOPLOCA (BACT.)
VARIOVORAX (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА

Доп.точки доступа:
Черницына, С.М.; Земская, Т.И.

8.
РЖ ВИНИТИ 68 (BI13) 12.12-04Б3.398

   
    Isolation and identification of a pathogen of silkworm Bombyx mori [Text] / Heng-Ping Tao [et al.] // Curr. Microbiol. - 2011. - Vol. 62, N 3. - P876-883 . - ISSN 0343-8651
Перевод заглавия: Выделение и определение вида, патогенного для шелковичного червя Bombyx mori
Аннотация: Из заболевшего тутового шелкопряда выделили штамм бактерии-патогена, ST-1. Он был классифицирован на основе физиологических и биохимических признаков, а также анализа последовательностей в гене 16S-рРНК. Показано его теснейшее родство (99%) с Pseudomonas chlororaphis subsp. aurantica. ST-1 был представлен грамотрицательными палочками 0,7-0,9*1,3-1,5 мкм с закругленными концами. ST-1 мог использовать цитрат, малонат, D-глюкозу, сахарозу, D-фруктозу, D-маннозу и L-арабинозу. Патогенность ST-1 в отношении шелкопряда описывалась линейной регрессией логарифма (y) конц-ии ST-1 против вероятности (х) (y=0,4040+0,0600 x). Летальная конц-ия, LC[50], равнялась 2,12*10{4} КОЕ/мл. Подтверждается классификация ST-1 как Pseudomonas chlororaphis subsp. aurantica, впервые описанная в качестве патогена тутового шелкопряда
ГРНТИ  
68.03.07
ВИНИТИ 681.03.07.02
Рубрики: PSEUDOMONAS CHLORORAPHIS SUBSP. AURANTICA (BACT.)
БАКТЕРИЯ-ПАТОГЕН
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
АНАЛИЗ 16S-РРНК
ТУТОВЫЙ ШЕЛКОПРЯД BOMBYX MORI

Доп.точки доступа:
Tao, Heng-Ping; Sehn, Zhong-Yuan; Zhu, Feng; Xu, Xiao-Fang; Tang, Xu-Dong; Xu, Li

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.05-04Б2.4

    Корнеева, В. А.
    Детекция метаногенных архей в поверхностных водах Черного моря с применением молекулярно-биологических методов [Текст] / В. А. Корнеева // Ломоносов - 2012: 19 Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых, Москва, 9-13 апр., 2012. - М., 2012. - Секц. Биология. - С. 159 . - ISBN 978-5-317-04030-7
ГРНТИ  
34.27.05
ВИНИТИ 341.27.05.17
Рубрики: МЕТАНОГЕННЫЕ БАКТЕРИИ
ЧИСЛЕННОСТЬ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
ИЗУЧЕНИЕ
ПОВЕРХНОСТНЫЕ ВОДЫ
ЧЕРНОЕ МОРЕ
МЕТОДЫ
МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ
ПЦР

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 13.07-04Б3.121

    Корнеева, В. А.
    Детекция метаногенных архей в поверхностных водах Черного моря с применением молекулярно-биологических методов [Текст] / В. А. Корнеева // Ломоносов - 2012: 19 Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых, Москва, 9-13 апр., 2012. - М., 2012. - Секц. Биология. - С. 159 . - ISBN 978-5-317-04030-7
ГРНТИ  
34.27.39
ВИНИТИ 341.27.39.21
Рубрики: МЕТАНОГЕННЫЕ БАКТЕРИИ
ЧИСЛЕННОСТЬ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
ИЗУЧЕНИЕ
ПОВЕРХНОСТНЫЕ ВОДЫ
ЧЕРНОЕ МОРЕ
МЕТОДЫ
МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ
ПЦР

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 16.04-04Б4.141

   
    Способ отбора филогенетически близких штаммов Yersinia pestis, отличающихся по вирулентности для морских свинок [Текст] / А. П. Анисимов [и др.] // Инфекц. и иммунитет. - 2015. - Т. 5, N 4. - С. 373-376 . - ISSN 2220-7619
Аннотация: Сравнительный анализ близкородственных вирулентных и авирулентных штаммов микроорганизмов на уровне геномов, транскриптомов и/или протеомов лежит в основе поиска новых факторов патогенности - потенциальных молекулярных мишеней для этиотропного лечения, вакцинопрофилактики и иммунотерапии инфекционных болезней. Целью работы была апробация способа анимализации "полевочьих" штаммов чумного микроба, авирулентных для морских свинок при подкожном заражении, позволяющего отобрать филогенетически близкие пары штаммов, которые отличаются по степени патогенности для морских свинок. Анимализацию культур Y. pestis проводили на самцах морских свинок четырехкратными тестикулярными пассажами со снижением инфицирующей дозы. Отсутствовала взаимосвязь между способностью вызывать генерализованный инфекционный процесс (гибель) при тестикулярном и подкожном заражении морских свинок, но при тестикулярном пассировании в культуре бактерий было возможно накопление субпопуляции, обладающей высокой вирулентностью и при подкожном заражении этого вида животных. Использованный методический подход может быть успешно применен для подбора филогенетически близких пар бактериальных штаммов, принципиально отличающихся по степени их избирательной вирулентности.
ГРНТИ  
34.27.29
ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.25
Рубрики: YERSINIA PESTIS (BACT.)
ШТАММЫ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
ВИРУЛЕНТНОСТЬ
МОРСКИЕ СВИНКИ

Доп.точки доступа:
Анисимов, А.П.; Комбарова, Т.И.; Платонов, М.Е.; Иванов, С.А.; Сухова, М.А.; Дентовская, С.В.
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)