СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ<.>)

Общее количество найденных документов : 15
Показаны документы с 1 по 15

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.06-04Б2.004

Hartung, John S.
Nested-PCR for the specific and sensitive detection of Xanthomonas campestris pv. citri [Text] / John S. Hartung, Oliver Pruvost // Phytopathology. - 1994. - Vol. 84, N 10. - P1086
Перевод заглавия: Гнездовая ПЦР для специфического чувствительного обнаружения Xanthomonas campestris pv. citri
Аннотация: Усовершенствован метод ПЦР для обнаружения Xanthomonas campestris pv. citri. Чувствительность метода усилена благодаря введению второго цикла ПЦР с использованием праймеров, внутренних по отношению к первому набору праймеров. Этот подход исключает необходимость Саузерн-блот-гибридизации и позволяет обнаруживать менее 10 КОЕ/образец. Если у одной из пар праймеров пометить 5'-конец биотином, а другой 5'lac-операторной последовательностью из E. coli, можно применить твердофазный ИФА на основе коммерческих препаратов гибридного белка lac-оператор/'бета'-галактозидаза. США, USDA ARS Beltsville, MD.

ГРНТИ	34.27.05

ВИНИТИ 341.27.05.07
Рубрики: XANTHOMONAS CAMPESTRIS (BACT.)
PV. CITRI
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
ИФА

Доп.точки доступа:
Pruvost, Oliver

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.07-04Б2.9

Hartung, John S.
Nested-PCR for the specific and sensitive detection of Xanthomonas campestris pv. citri [Text] : abstr. APS Annu. Meet., Albuquerque, N.M., Aug. 6-10, 1994 / John S. Hartung, Olivier Pruvost // Phytopathology. - 1994. - Vol. 84, N 10. - P1086 . - ISSN 0331-949X
Перевод заглавия: Гнездовая ПЦР для специфического чувствительного обнаружения Xanthomonas campestris pv. citri
Аннотация: Усовершенствован метод ПЦР для обнаружения Xanthomonas campestris pv. citri. Чувствительность метода усилена благодаря введению второго цикла ПЦР с использованием праймеров, внутренних по отношению к первому набору праймеров. Этот подход исключает необходимость Саузерн-блот-гибридизации и позволяет обнаруживать менее 10 КОЕ/образец. Если у одной из пар праймеров пометить 5'-конец биотином, а другой 5'-lac-операторной последовательностью из E. coli, можно применить твердофазный ИФА на основе коммерческих препаратов гибридного белка lac-оператор/'бета'-галактозидаза. США, USDA ARS Beltsville, MD

ГРНТИ	34.27.05

ВИНИТИ 341.27.05.07
Рубрики: XANTHOMONAS CAMPESTRIS
PV. CITRI
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
ИФА

Доп.точки доступа:
Pruvost, Olivier

РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 95.11-04В5.157

Hartung, John S.
Nested-PCR for the specific and sensitive detection of Xanthomonas campestris pv. citri [Text] : abstr. APS Annu. Meet., Albuquerque, N.M., Aug. 6-10, 1994 / John S. Hartung, Olivier Pruvost // Phytopathology. - 1994. - Vol. 84, N 10. - P1086 . - ISSN 0331-949X
Перевод заглавия: Гнездовая ПЦР для специфического чувствительного обнаружения Xanthomonas campestris pv. citri
Аннотация: Усовершенствован метод ПЦР для обнаружения Xanthomonas campestris pv. citri. Чувствительность метода усилена благодаря введению второго цикла ПЦР с использованием праймеров, внутренних по отношению к первому набору праймеров. Этот подход исключает необходимость Саузерн-блот-гибридизации и позволяет обнаруживать менее 10 КОЕ/образец. Если у одной из пар праймеров пометить 5'-конец биотином, а другой 5'-lac-операторной последовательностью из E. coli, можно применить твердофазный ИФА на основе коммерческих препаратов гибридного белка lac-оператор/'бета'-галактозидаза. США, USDA ARS Beltsville, MD

ГРНТИ	68.37.31

ВИНИТИ 681.37.31.05
Рубрики: XANTHOMONAS CAMPESTRIS
PV. CITRI
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
ИФА

Доп.точки доступа:
Pruvost, Olivier

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.03-04Б2.230

Damgaard, Hyldebrink.
Development and application of a primer set for specific detection of Bacillus thuringiensis and Bacillus cereus in soil using magnetic capture hybridization and PCR amplification [Text] / Hyldebrink Damgaard, Carsten Suhr Jacobsen, Jan Sorensen // Syst. and Appl. Microbiol. - 1996. - Vol. 19, N 3. - P436-441 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Разработка и применение набора праймеров для специфического обнаружения Bacillus thuringiensis и Bacillus cereus в почве с использованием гибридизации магнитным захватом и амплификации ПЦР
Аннотация: Для того, чтобы отличить штаммы Bacillus thuringiensis и Bacillus cereus от различных почвенных Bacillus spp. и других грамотрицательных бактерий, для праймера выбрана мишень, направленная на ген фосфатидилинозит-специфичной фосфолипазы C (PI-PLC). С использованием гибридизации магнитным захватом (MCH-PCR) можно обнаружить эндогенные популяции B. thuringiensis и B. cereus в полевых образцах почв ризосферы. Высокая специфичность набора праймеров для B. thuringiensis и B. cereus указывает на то, что ген PI-PLC можно использовать как специфическую мишень для обнаружения посредством MCH-PCR в почве. Дания, Microbiol. Section, Dep. Ecology and Mol. Biol., Royal Veterinary and Agricultural Univ., Thorvaldsensvej 40, DK-1870 Frederiksberg C. Библ. 27

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: BACILLUS THURINGIENSIS (BACT.)
BACILLUS CEREUS (BACT.)
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
НАБОР ПРАЙМЕРОВ
ГИБРИДИЗАЦИЯ С МАГНИТНЫМ ЗАХВАТОМ
ПЦР
ПОЧВА
РИЗОСФЕРА
ФОСФОЛИПАЗА C
ГЕНЫ

Доп.точки доступа:
Jacobsen, Carsten Suhr; Sorensen, Jan

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.117

Microbial species- and strain-specific detection by PCR using minor differences in the 16S rRNA gene sequences [Text] : abstr. Annu. Meet. Environ. Mutagen Soc., New Orleans, La, Apr. 8-13, 2000 / R. A. Tapp [et al.] // Environ. and Mol. Mutagenes. - 2000. - Vol. 35, Suppl. 31. - P60 . - ISSN 0893-6692
Перевод заглавия: Специфическое обнаружение видов и штаммов микроорганизмов с помощью ПЦР при использовании минорных различий в последовательностях генов рРНК 16S
Аннотация: На основе вариабельных районов генной последовательности рРНК 16S сконструировали ПЦР-праймеры для селективного обнаружения видов и штаммов бактерий рода Batonella. Были разработаны 3 ряда праймеров для идентификации. B. henselae тип I, B. henselae тип II и B. clarridgeae. Вариация в одном из двух праймеров в каждом ряду составляет 3 основания. Анализ образцов крови здоровых кошек и кошек, инфицированных Batonella, показал, что разработанный метод позволяет идентифицировать виды и штаммы микроорганизмов. Авторы считают возможным использование данного метода для исследования мутантных штаммов микроорганизмов. США, Inst. for Environmental Studies, Louisiana State Univ., Baton Rouge, LA 70803

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: РНК РИБОСОМНАЯ
РРНК 16S
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВАРИАБЕЛЬНЫЕ РАЙОНЫ
ПЦР-ПРАЙМЕРЫ
ПРИМЕНЕНИЕ
BATONELLA (BACT.)
ВИДЫ
ШТАММЫ
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Tapp, R.A.; Roy, A.; Corstvet, R.; Wilson, V.L.

РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 03.05-04В5.96

Pastrik, K. -H.
Detection of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus in potato tubers by multiplex PCR with coamplification of host DNA [Text] / K. -H. Pastrik // Eur. J. Plant Pathol. - 2000. - Vol. 106, N 2. - P155-165 . - ISSN 0929-1873
Перевод заглавия: Обнаружение Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus в клубнях картофеля с помощью сложной (множественной) ПЦР с одновременной амплификацией ДНК хозяина
Аннотация: Анализ сочетает в себе два различных теста в одной реакционной смеси. Во-первых, высокоспецифичное и чувствительное обнаружение патогена и, во-вторых, индикатор успешной амплификации (внутренний контроль ПЦР), позволяющий следить за ложноотрицательными результатами ПЦР, обусловленными ингибированием ПЦР. Для одновременной амплификации двух разных мишеней в одной реакционной среде используется смесь двух разных наборов праймеров. Для обнаружения Cl. michiganensis subsp. sepedonicus используется набор праймеров PSA-1/PSA-R, специфичный для патогена и основанный на межгенном спейсерном районе генов 16S-23S рРНК Cl. michiganensis subsp. sepedonicus. Для одновременной амплификации внутреннего контроля ПЦР используется набор праймеров NS-7-F/NS-8-R, специфичный для растения, позволяющий амплифицировать последовательность-мишень растительной ДНК, присутствующую в экстрактах ДНК из сока картофеля. Пригодность сложной ПЦР проверена на 3500 образцов 200 посевных клубней картофеля из 143 различных культиваров на предмет обнаружения Cl. michiganensis subsp. sepedonicus с параллельным тестированием с применением иммунофлуоресценции, биологическим анализом проростков баклажанов и множественной ПЦР. Германия, Pflanzenschutzamt Hannover, 30453 Hannover Fax: +49 511 400 5120 E-mail: Pastrik@Lawikhan.de. Библ. 42

ГРНТИ	68.37.31

ВИНИТИ 681.37.31.05
Рубрики: CLAVIBACTER MICHIGANENSIS (BACT.)
SUBSP. SEPEDONICUS
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
СЛОЖНАЯ (МНОЖЕСТВЕННАЯ) ПЦР
ДНК ХОЗЯИНА
ОДНОВРЕМЕННАЯ АМПЛИФИКАЦИЯ
НАБОРЫ ПРАЙМЕРОВ
БОЛЕЗНИ РАСТЕНИЙ
КЛУБНИ КАРТОФЕЛЯ

РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 03.05-04В5.97

Adachi, Naoto.
PCR-mediated detection of Xanthomonas oryzae pv. oryzae by amplification of the 16S-23S rDNA spacer region sequence [Text] / Naoto Adachi, Takashi Oku // J. Gen. Plant Pathol. - 2000. - Vol. 66, N 4. - P303-309 . - ISSN 1345-2630
Перевод заглавия: Обнаружение с помощью ПЦР Xanthomonas oryzae pv. oryzae амплификацией последовательности спейсерного района 16S-23S рДНК
Аннотация: Описан способ обнаружения Xanthomonas oryzae pv. oryzae - патогена, вызывающего увядание и загнивание растений риса. Способ основан на ПЦР. Определена нуклеотидная последовательность спейсерного района 16S-23S рДНК длиной 580 п.н. из геномов микроорганизмов X. oryzae pv. oryzae, X. campestris pv. alfalfae, X. campestris pv. campestris, X. campestris pv. cannabis, X. campestris pv. citri, X. campestris pv. cucurbitae, X. campestris pv. pisi, X. campestris pv. pruni, X. campestris pv. vitians. Определенные последовательности оказались на 95% идентичными. Создана пара праймеров XOR-F(5'-GCATGACGTCATCGTCCTGT-3') и XOR-R2 (5'-CTCGGAGCTATATGCCGTGC-3'), к-рая позволяет проводить специфическую амплификацию фрагмента 470 п.н. всех штаммов X. oryzae pv. oryzae, выделенных в различных районах Японии. Никаких продуктов амплификации из геномов X. campestris патоваров alfalfae, campestris, cannabis, carotae, cucurbitae, dieffenbachiae, glycines, pisi, pruni, vitians или zantedeschiae, за исключением патоваров citri, incanae, zinniae не обнаружено. Этим способом можно обнаружить патоген в инфицированных листьях риса за 3 ч с пределом обнаружения 4*10{1} КОЕ/мл. Япония, Ishikawa Agric. Res. Center, Kanazawa 920-3198. Библ. 10

ГРНТИ	68.37.31

ВИНИТИ 681.37.31.05
Рубрики: XANTHOMONAS ORYZAE PV.ORYZAE (BACT.)
РАСТИТЕЛЬНЫЙ ПАТОГЕН
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
16S-23S РДНК СПЕЙСЕРНЫЙ РАЙОН
АМПЛИФИКАЦИЯ
ПРАЙМЕРЫ

Доп.точки доступа:
Oku, Takashi

РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 03.05-04В5.123

Immunofluorescence colony-staining (IFC) for detection and quantification of Ralstonia (Pseudomonas) solanacearum biovar 2 (race 3) in soil and verification of positive results by PCR and dilution plating [Text] / der Wolf J. M. van [et al.] // Eur. J. Plant Pathol. - 2000. - Vol. 106, N 2. - P123-133 . - ISSN 0929-1873
Перевод заглавия: Иммунофлуоресцентное окрашивание колоний (IFC) с целью обнаружения и подсчета Ralstonia (Pseudomonas) solanacearum биовар 2 (раса 3) в почве и подтверждение положительных результатов методами ПЦР и разведения на чашках
Аннотация: Разработана процедура специфического и чувствительного количественного обнаружения Ralstonia (Pseudomonas) solanacearum биовар 2 (раса 3) в почве. Она основана на иммунофлуоресцентном окрашивании колоний (IFC) и последующей идентификации флуоресцирующих колоний амплификацией ПЦР или разведением на чашках на полуселективной среде SMSA. Добавление сахарозы и антибиотика циклогексимида и кристаллического фиолетового к неселективному агару на триптиказном соевом бульоне привело к увеличению размера колоний и усилению интенсивности окраски R. solanacearum методом IFC. Подтверждение результатов IFC путем отбора клеток из IFC-положительных колоний с последующим высевом путем разведения на чашках клеток, суспендированных в SMSA, оказалось очень эффективным. Степень достоверности составила 92%-96%. Некоторые другие виды бактерий, обнаружившие перекрестную р-цию с поликлональными антителами в IFC, тоже росли на SMSA и их было трудно отличить от R. solanacearum, поэтому в этих случаях потребовалось подтверждение результатов. Прямое подтверждение с применением ПЦР с праймерами D2/B, специфичными к отделу 2 R. solanacearum оказалось достоверным на 86-96% для разных почв. Праймеры D2/B реагировали со всеми штаммами отдела 2 R. solanacearum, со штаммами R. syzygii и бактерией, вызывающей заболевание банана, но не с сапрофитами, дающими перекрестную р-цию с антителами к R. solanacearum. IFC позволило обнаружить 'ЭКВИВ'100 КОЕ в 1 г почвы, т. е. предел обнаружения оказался близким к порогу прямого чашечного метода на SMSA, но IFC отличается меньшей трудоемкостью. Нидерланды, DLO Res. Inst. for Plant Protection (IPO-DLO), P. O. Box 9060, 6700 GW Wageningen, Fax: 31 317 410113 E-mail: j.m.vanderwolf@plant.wag-ur.nl. Библ. 28

ГРНТИ	68.37.31

ВИНИТИ 681.37.31.17.02
Рубрики: RALSTONIA SOLANACEARUM (BACT.)
БИОВАР 2 (РАСА 3)
ИММУНОФЛУОРЕСЦЕНТНОЕ ОКРАШИВАНИЕ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ ФЛУОРЕСЦИРУЮЩИХ КОЛОНИЙ
ПЦР
РАЗВЕДЕНИЕ НА ЧАШКАХ
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
КОЛИЧЕСТВЕННЫЙ МЕТОД

Доп.точки доступа:
van, der Wolf J.M.; Vriend, S.G.C.; Kastelein, P.; Nijhuis, E.H.; van, Bekkum P.J.; van, Vuurde J.W.L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.05-04Б2.82

Pastrik, K. -H.
Detection of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus in potato tubers by multiplex PCR with coamplification of host DNA [Text] / K. -H. Pastrik // Eur. J. Plant Pathol. - 2000. - Vol. 106, N 2. - P155-165 . - ISSN 0929-1873
Перевод заглавия: Обнаружение Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus в клубнях картофеля с помощью сложной (множественной) ПЦР с одновременной амплификацией ДНК хозяина
Аннотация: Анализ сочетает в себе два различных теста в одной реакционной смеси. Во-первых, высокоспецифичное и чувствительное обнаружение патогена и, во-вторых, индикатор успешной амплификации (внутренний контроль ПЦР), позволяющий следить за ложноотрицательными результатами ПЦР, обусловленными ингибированием ПЦР. Для одновременной амплификации двух разных мишеней в одной реакционной среде используется смесь двух разных наборов праймеров. Для обнаружения Cl. michiganensis subsp. sepedonicus используется набор праймеров PSA-1/PSA-R, специфичный для патогена и основанный на межгенном спейсерном районе генов 16S-23S рРНК Cl. michiganensis subsp. sepedonicus. Для одновременной амплификации внутреннего контроля ПЦР используется набор праймеров NS-7-F/NS-8-R, специфичный для растения, позволяющий амплифицировать последовательность-мишень растительной ДНК, присутствующую в экстрактах ДНК из сока картофеля. Пригодность сложной ПЦР проверена на 3500 образцов 200 посевных клубней картофеля из 143 различных культиваров на предмет обнаружения Cl. michiganensis subsp. sepedonicus с параллельным тестированием с применением иммунофлуоресценции, биологическим анализом проростков баклажанов и множественной ПЦР. Германия, Pflanzenschutzamt Hannover, 30453 Hannover Fax: +49 511 400 5120 E-mail: Pastrik@Lawikhan.de. Библ. 42

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.11
Рубрики: CLAVIBACTER MICHIGANENSIS (BACT.)
SUBSP. SEPEDONICUS
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
СЛОЖНАЯ (МНОЖЕСТВЕННАЯ) ПЦР
ДНК ХОЗЯИНА
ОДНОВРЕМЕННАЯ АМПЛИФИКАЦИЯ
НАБОРЫ ПРАЙМЕРОВ
БОЛЕЗНИ РАСТЕНИЙ
КЛУБНИ КАРТОФЕЛЯ

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.05-04Б2.84

Immunofluorescence colony-staining (IFC) for detection and quantification of Ralstonia (Pseudomonas) solanacearum biovar 2 (race 3) in soil and verification of positive results by PCR and dilution plating [Text] / der Wolf J. M. van [et al.] // Eur. J. Plant Pathol. - 2000. - Vol. 106, N 2. - P123-133 . - ISSN 0929-1873
Перевод заглавия: Иммунофлуоресцентное окрашивание колоний (IFC) с целью обнаружения и подсчета Ralstonia (Pseudomonas) solanacearum биовар 2 (раса 3) в почве и подтверждение положительных результатов методами ПЦР и разведения на чашках
Аннотация: Разработана процедура специфического и чувствительного количественного обнаружения Ralstonia (Pseudomonas) solanacearum биовар 2 (раса 3) в почве. Она основана на иммунофлуоресцентном окрашивании колоний (IFC) и последующей идентификации флуоресцирующих колоний амплификацией ПЦР или разведением на чашках на полуселективной среде SMSA. Добавление сахарозы и антибиотика циклогексимида и кристаллического фиолетового к неселективному агару на триптиказном соевом бульоне привело к увеличению размера колоний и усилению интенсивности окраски R. solanacearum методом IFC. Подтверждение результатов IFC путем отбора клеток из IFC-положительных колоний с последующим высевом путем разведения на чашках клеток, суспендированных в SMSA, оказалось очень эффективным. Степень достоверности составила 92%-96%. Некоторые другие виды бактерий, обнаружившие перекрестную р-цию с поликлональными антителами в IFC, тоже росли на SMSA и их было трудно отличить от R. solanacearum, поэтому в этих случаях потребовалось подтверждение результатов. Прямое подтверждение с применением ПЦР с праймерами D2/B, специфичными к отделу 2 R. solanacearum оказалось достоверным на 86-96% для разных почв. Праймеры D2/B реагировали со всеми штаммами отдела 2 R. solanacearum, со штаммами R. syzygii и бактерией, вызывающей заболевание банана, но не с сапрофитами, дающими перекрестную р-цию с антителами к R. solanacearum. IFC позволило обнаружить 'ЭКВИВ'100 КОЕ в 1 г почвы, т. е. предел обнаружения оказался близким к порогу прямого чашечного метода на SMSA, но IFC отличается меньшей трудоемкостью. Нидерланды, DLO Res. Inst. for Plant Protection (IPO-DLO), P. O. Box 9060, 6700 GW Wageningen, Fax: 31 317 410113 E-mail: j.m.vanderwolf@plant.wag-ur.nl. Библ. 28

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.11 + 341.27.05.07
Рубрики: RALSTONIA SOLANACEARUM (BACT.)
БИОВАР 2 (РАСА 3)
ИММУНОФЛУОРЕСЦЕНТНОЕ ОКРАШИВАНИЕ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ ФЛУОРЕСЦИРУЮЩИХ КОЛОНИЙ
ПЦР
РАЗВЕДЕНИЕ НА ЧАШКАХ
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
КОЛИЧЕСТВЕННЫЙ МЕТОД

Доп.точки доступа:
van, der Wolf J.M.; Vriend, S.G.C.; Kastelein, P.; Nijhuis, E.H.; van, Bekkum P.J.; van, Vuurde J.W.L.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.05-04Б2.87

Adachi, Naoto.
PCR-mediated detection of Xanthomonas oryzae pv. oryzae by amplification of the 16S-23S rDNA spacer region sequence [Text] / Naoto Adachi, Takashi Oku // J. Gen. Plant Pathol. - 2000. - Vol. 66, N 4. - P303-309 . - ISSN 1345-2630
Перевод заглавия: Обнаружение с помощью ПЦР Xanthomonas oryzae pv. oryzae амплификацией последовательности спейсерного района 16S-23S рДНК
Аннотация: Описан способ обнаружения Xanthomonas oryzae pv. oryzae - патогена, вызывающего увядание и загнивание растений риса. Способ основан на ПЦР. Определена нуклеотидная последовательность спейсерного района 16S-23S рДНК длиной 580 п.н. из геномов микроорганизмов X. oryzae pv. oryzae, X. campestris pv. alfalfae, X. campestris pv. campestris, X. campestris pv. cannabis, X. campestris pv. citri, X. campestris pv. cucurbitae, X. campestris pv. pisi, X. campestris pv. pruni, X. campestris pv. vitians. Определенные последовательности оказались на 95% идентичными. Создана пара праймеров XOR-F(5'-GCATGACGTCATCGTCCTGT-3') и XOR-R2 (5'-CTCGGAGCTATATGCCGTGC-3'), к-рая позволяет проводить специфическую амплификацию фрагмента 470 п.н. всех штаммов X. oryzae pv. oryzae, выделенных в различных районах Японии. Никаких продуктов амплификации из геномов X. campestris патоваров alfalfae, campestris, cannabis, carotae, cucurbitae, dieffenbachiae, glycines, pisi, pruni, vitians или zantedeschiae, за исключением патоваров citri, incanae, zinniae не обнаружено. Этим способом можно обнаружить патоген в инфицированных листьях риса за 3 ч с пределом обнаружения 4*10{1} КОЕ/мл. Япония, Ishikawa Agric. Res. Center, Kanazawa 920-3198. Библ. 10

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.11 + 341.27.05.07 + 341.27.21.09.31.05
Рубрики: XANTHOMONAS ORYZAE PV.ORYZAE (BACT.)
РАСТИТЕЛЬНЫЙ ПАТОГЕН
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
16S-23S РДНК СПЕЙСЕРНЫЙ РАЙОН
АМПЛИФИКАЦИЯ
ПРАЙМЕРЫ

Доп.точки доступа:
Oku, Takashi

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 03.05-04Б3.29

Immunofluorescence colony-staining (IFC) for detection and quantification of Ralstonia (Pseudomonas) solanacearum biovar 2 (race 3) in soil and verification of positive results by PCR and dilution plating [Text] / der Wolf J. M. van [et al.] // Eur. J. Plant Pathol. - 2000. - Vol. 106, N 2. - P123-133 . - ISSN 0929-1873
Перевод заглавия: Иммунофлуоресцентное окрашивание колоний (IFC) с целью обнаружения и подсчета Ralstonia (Pseudomonas) solanacearum биовар 2 (раса 3) в почве и подтверждение положительных результатов методами ПЦР и разведения на чашках
Аннотация: Разработана процедура специфического и чувствительного количественного обнаружения Ralstonia (Pseudomonas) solanacearum биовар 2 (раса 3) в почве. Она основана на иммунофлуоресцентном окрашивании колоний (IFC) и последующей идентификации флуоресцирующих колоний амплификацией ПЦР или разведением на чашках на полуселективной среде SMSA. Добавление сахарозы и антибиотика циклогексимида и кристаллического фиолетового к неселективному агару на триптиказном соевом бульоне привело к увеличению размера колоний и усилению интенсивности окраски R. solanacearum методом IFC. Подтверждение результатов IFC путем отбора клеток из IFC-положительных колоний с последующим высевом путем разведения на чашках клеток, суспендированных в SMSA, оказалось очень эффективным. Степень достоверности составила 92%-96%. Некоторые другие виды бактерий, обнаружившие перекрестную р-цию с поликлональными антителами в IFC, тоже росли на SMSA и их было трудно отличить от R. solanacearum, поэтому в этих случаях потребовалось подтверждение результатов. Прямое подтверждение с применением ПЦР с праймерами D2/B, специфичными к отделу 2 R. solanacearum оказалось достоверным на 86-96% для разных почв. Праймеры D2/B реагировали со всеми штаммами отдела 2 R. solanacearum, со штаммами R. syzygii и бактерией, вызывающей заболевание банана, но не с сапрофитами, дающими перекрестную р-цию с антителами к R. solanacearum. IFC позволило обнаружить 'ЭКВИВ'100 КОЕ в 1 г почвы, т. е. предел обнаружения оказался близким к порогу прямого чашечного метода на SMSA, но IFC отличается меньшей трудоемкостью. Нидерланды, DLO Res. Inst. for Plant Protection (IPO-DLO), P. O. Box 9060, 6700 GW Wageningen, Fax: 31 317 410113 E-mail: j.m.vanderwolf@plant.wag-ur.nl. Библ. 28

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09
Рубрики: RALSTONIA SOLANACEARUM (BACT.)
БИОВАР 2 (РАСА 3)
ИММУНОФЛУОРЕСЦЕНТНОЕ ОКРАШИВАНИЕ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ ФЛУОРЕСЦИРУЮЩИХ КОЛОНИЙ
ПЦР
РАЗВЕДЕНИЕ НА ЧАШКАХ
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
КОЛИЧЕСТВЕННЫЙ МЕТОД

Доп.точки доступа:
van, der Wolf J.M.; Vriend, S.G.C.; Kastelein, P.; Nijhuis, E.H.; van, Bekkum P.J.; van, Vuurde J.W.L.

13.

РЖ ВИНИТИ 68 (BI13) 03.05-04Б3.230

Pastrik, K. -H.
Detection of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus in potato tubers by multiplex PCR with coamplification of host DNA [Text] / K. -H. Pastrik // Eur. J. Plant Pathol. - 2000. - Vol. 106, N 2. - P155-165 . - ISSN 0929-1873
Перевод заглавия: Обнаружение Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus в клубнях картофеля с помощью сложной (множественной) ПЦР с одновременной амплификацией ДНК хозяина
Аннотация: Анализ сочетает в себе два различных теста в одной реакционной смеси. Во-первых, высокоспецифичное и чувствительное обнаружение патогена и, во-вторых, индикатор успешной амплификации (внутренний контроль ПЦР), позволяющий следить за ложноотрицательными результатами ПЦР, обусловленными ингибированием ПЦР. Для одновременной амплификации двух разных мишеней в одной реакционной среде используется смесь двух разных наборов праймеров. Для обнаружения Cl. michiganensis subsp. sepedonicus используется набор праймеров PSA-1/PSA-R, специфичный для патогена и основанный на межгенном спейсерном районе генов 16S-23S рРНК Cl. michiganensis subsp. sepedonicus. Для одновременной амплификации внутреннего контроля ПЦР используется набор праймеров NS-7-F/NS-8-R, специфичный для растения, позволяющий амплифицировать последовательность-мишень растительной ДНК, присутствующую в экстрактах ДНК из сока картофеля. Пригодность сложной ПЦР проверена на 3500 образцов 200 посевных клубней картофеля из 143 различных культиваров на предмет обнаружения Cl. michiganensis subsp. sepedonicus с параллельным тестированием с применением иммунофлуоресценции, биологическим анализом проростков баклажанов и множественной ПЦР. Германия, Pflanzenschutzamt Hannover, 30453 Hannover Fax: +49 511 400 5120 E-mail: Pastrik@Lawikhan.de. Библ. 42

ГРНТИ	68.03.07

ВИНИТИ 681.03.07.21
Рубрики: CLAVIBACTER MICHIGANENSIS (BACT.)
SUBSP. SEPEDONICUS
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
СЛОЖНАЯ (МНОЖЕСТВЕННАЯ) ПЦР
ДНК ХОЗЯИНА
ОДНОВРЕМЕННАЯ АМПЛИФИКАЦИЯ
НАБОРЫ ПРАЙМЕРОВ
БОЛЕЗНИ РАСТЕНИЙ
КЛУБНИ КАРТОФЕЛЯ

14.

РЖ ВИНИТИ 68 (BI13) 03.05-04Б3.261

Adachi, Naoto.
PCR-mediated detection of Xanthomonas oryzae pv. oryzae by amplification of the 16S-23S rDNA spacer region sequence [Text] / Naoto Adachi, Takashi Oku // J. Gen. Plant Pathol. - 2000. - Vol. 66, N 4. - P303-309 . - ISSN 1345-2630
Перевод заглавия: Обнаружение с помощью ПЦР Xanthomonas oryzae pv. oryzae амплификацией последовательности спейсерного района 16S-23S рДНК
Аннотация: Описан способ обнаружения Xanthomonas oryzae pv. oryzae - патогена, вызывающего увядание и загнивание растений риса. Способ основан на ПЦР. Определена нуклеотидная последовательность спейсерного района 16S-23S рДНК длиной 580 п.н. из геномов микроорганизмов X. oryzae pv. oryzae, X. campestris pv. alfalfae, X. campestris pv. campestris, X. campestris pv. cannabis, X. campestris pv. citri, X. campestris pv. cucurbitae, X. campestris pv. pisi, X. campestris pv. pruni, X. campestris pv. vitians. Определенные последовательности оказались на 95% идентичными. Создана пара праймеров XOR-F(5'-GCATGACGTCATCGTCCTGT-3') и XOR-R2 (5'-CTCGGAGCTATATGCCGTGC-3'), к-рая позволяет проводить специфическую амплификацию фрагмента 470 п.н. всех штаммов X. oryzae pv. oryzae, выделенных в различных районах Японии. Никаких продуктов амплификации из геномов X. campestris патоваров alfalfae, campestris, cannabis, carotae, cucurbitae, dieffenbachiae, glycines, pisi, pruni, vitians или zantedeschiae, за исключением патоваров citri, incanae, zinniae не обнаружено. Этим способом можно обнаружить патоген в инфицированных листьях риса за 3 ч с пределом обнаружения 4*10{1} КОЕ/мл. Япония, Ishikawa Agric. Res. Center, Kanazawa 920-3198. Библ. 10

ГРНТИ	68.03.07

ВИНИТИ 681.03.07.21
Рубрики: XANTHOMONAS ORYZAE PV.ORYZAE (BACT.)
РАСТИТЕЛЬНЫЙ ПАТОГЕН
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
16S-23S РДНК СПЕЙСЕРНЫЙ РАЙОН
АМПЛИФИКАЦИЯ
ПРАЙМЕРЫ

Доп.точки доступа:
Oku, Takashi

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 12.04-04Б2.149

Specific detection of Aspergillus carbonarius by SYBR{R} green and TaqMan{R} quantitative PCR assays based on the multicopy ITS2 region of the rRNA gene [Text] / Amaia Gonzalez-Salgado [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 2009. - Vol. 295, N 1. - P57-66 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Специфическое обнаружение Aspergillus carbonarius с помощью SYBR{R} Зеленого и TaqMan{R} количественной ПЦР на основе мультикопийного района HS2 гена рРНК
Аннотация: Aspergillus carbonarius - один из наиболее важных видов, продуцирующих охратоксин А (ОТА), представляющий опасность для человека и животных. Разработали высоко эффективный метод специфического обнаружения A. carbonarius на основе количественной ПЦР с использованием SYBR Зеленого I и TaqMan-метода. Праймеры и TaqMan-зонд сконструировали на основе внутреннего транскрибируемогом ультикопийного района 2 (внутренний район 2 гена рРНК). Показали, что оба метода сравнимы по чувствительности и специфичности обнаружения A. carbonarius (порядка 0,4 пг ДНК г{-1} в ягодах винограда), но более низкая стоимость SYBR Зеленого может быть аргументом в пользу его применения в рутинных скринингах. Испания, Departamento de Genetica, Facultad de Biologia, Universidad Complutense de Madrid

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: ASPERGILLUS CORBONARIUS (FUNGI)
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ
ОХРАТОКСИН
ПРОДУКЦИЯ
МЕТОДЫ
SVBR{R} ЗЕЛЕНЫЙ
TAQMAN{R} КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ПЦР
ITS2 ГЕНА РРНК

Доп.точки доступа:
Gonzalez-Salgado, Amaia; Patino, Belen; Gil-Serna, Jessica; Vazquez, Covadonga; Gonzalez-Jaen, Maria Teresa

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска