Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=БЕЛОК VPG<.>)
Общее количество найденных документов : 15
Показаны документы с 1 по 15
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.04-04Б1.88

   
    Three-dimensional model of the potyviral genome-linked protein [Text] / Danuta Plochocka [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1996. - Vol. 93, N 22. - P12150-12154 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Трехмерная модель белка, связанного с геномом потивируса
Аннотация: Определена полная нуклеотидная последовательность цистрона, локализованного в центральной части генома Y-вируса картофеля и кодирующего белок VPg, к-рый прочно связан с геномом. Этот белок состоит из 188 аминок-т и имеет существенную гомологию с VPg-белками других потивирусов. На основании распределения гидрофобных и гидрофильных аминок-тных остатков сконструирована трехмерная модель этого белка, связанного с геномной РНК. В соответствии с этой моделью 5'-конец вирусной РНК контактирует с экспонированной OH-группой Tyr64 белка VPg, и образует по-видимому фосфодиэфирную связь [5'-(O{4}-тирозилфосфо)аденилат], типичную для этой группы вирусов. На основании модели комплекса белок-РНК обсуждается хим. мех-зм связывания вирусной РНК с белком VPg. Польша, Inst. Biochem., Biophys., Polish Acad. Sci., 02-106 Warsaw. Библ. 40
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: БЕЛОК VPG
ГЕН
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ГОМОЛОГИЯ
КОМПЛЕКС БЕЛОК-РНК
ТРЕХМЕРНАЯ МОДЕЛЬ
Y-ВИРУС
КАРТОФЕЛЬ

Доп.точки доступа:
Plochocka, Danuta; Welnicki, Marek; Zielenkiewicz, Piotr; Ostoja-Zagorski, Wlodzimierz

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.08-04Б1.72

   
    The genome-linked protein of potato leafroll virus is located downstream of the putative protease domain of the ORF1 product [Text] / der Wilk F. van [et al.] // Virology. - 1997. - Vol. 234, N 2. - P300-303 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Связанный с геномом белок вируса скручивания листьев картофеля расположен с 3'-стороны от предполагаемого протеазного домена продукта ORF1
Аннотация: Определена последовательность 32 N-концевых остатков белка VPg (I), ковалентно связанного с РНК вируса скручивания листьев картофеля (ВСЛК). Эта последовательность I картирована в положениях 400-431 продукта гена ORF1 ВСЛК, с 3'-стороны от протеазного домена и перед РНК-зависимой РНК-полимеразой. Сравнение с другими вирусными последовательностями обнаружило значительную гомологию с продуктами ORF1 вируса западного пожелтения свеклы, передаваемого тлями вируса cururbit и вируса мягкого пожелтения свеклы. Нидерланды, Dep. of Virol., LPO-DLO, 6700 GW Wageningen. Библ. 26
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС СКРУЧИВАНИЯ ЛИСТЬЕВ КАРТ ТОФЕЛЯ
БЕЛОК VPG
N-КОНЦЕВЫЕ ОСТАТКИ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ 32
КАРТИРОВАНИЕ
ГОМОЛОГИЯ
ПРОДУКТ ORF1

Доп.точки доступа:
van, der Wilk F.; Verbeek, M.; Dullemans, A.M.; van, den Heuvel J.F.J.M.

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.09-04Б1.77

   
    Sequencing, genomic localization and initial characterization of the VPg of pea enation mosaic enamovirus [Text] / Christiane E. Wobus [et al.] // J. Gen. Virol. - 1998. - Vol. 79, N 8. - P2023-2025 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Секвенирование, геномная локализация и начальная характеристика VPg энамовируса мозаики гороха
Аннотация: Определена аминок-тная последовательность связанного с геномом белка VPg (I) вируса мозаики гороха. I кодируется остатками 1811-1894 открытой рамки считывания ORF1 РНК 1 с 3'-стороны от мотива протеазы. Прямое N-концевое секвенирование целого и расщепленного эндопротеазой Asp-N I и анализ методом масс-спектрометрии подтвердили, что I имеет длину 28 остатков и мол. м. 3138. Контекст N- и C-концевых остатков и положение и размер I позволили предположить, что I образуется в рез-те протеолитического процессинга полипротеинового набора мембранный якорный белок-I-полимераза, кодируемого ORF1 и ORF2. Не обнаружено гомологии I с др. белками, включая VPg родственных лютеовирусов группы II. США, Dep. Botany and Plant Pathol., Michigan State Univ., MI 48824. Библ. 21
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС МОЗАИКИ ГОРОХА
БЕЛОК VPG
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ГЕНОМНАЯ ЛОКАЛИЗАЦИЯ
СВОЙСТВА

Доп.точки доступа:
Wobus, Christiane E.; Skaf, Jihad S.; Schultz, Marilou H.; de, Zoeten Gustaaf A.

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.09-04Б1.78

   
    In vitro interactions between a potyvirus-encoded, genome-linked protein and RNA-dependent RNA polymerase [Text] / John Fellers [et al.] // J. Gen. Virol. - 1998. - Vol. 79, N 8. - P2043-2049 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Взаимодействия in vitro между кодируемым потивирусом сцепленным с геномом белком и РНК-зависимой РНК-полимеразой
Аннотация: Изучено взаимодействие между связанным с вирусной РНК белком VPg(I) и РНК-зависимой РНК-полимеразой (II) вируса пятнистости жилок табака (ВПЖТ) in vitro. I задерживается на колонке из глутатионсефарозы в присутствии составного белка глутатион-S-трансфераза-II, что указывает на физическое взаимодействие I с II. Однако мутация Y1860S, устраняющая инфекционность ВПЖТ и взаимодействие I-II в клетках дрожжей, не влияет на это взаимодействие in vitro. I и белок NIa (III) стимулируют полимеразную активность II. Стимуляция сохраняется и после удаления протеазного домена III, так что I является частью III, ответственной за стимуляцию полимеразной активности. Мутация Y1860S не влияет на эту стимуляцию. I может стимулировать мутант II с измененным мотивом GDD. США, Dep. Agr., Univ. Kentucky, Lexington, KY 40546-0091. Библ. 28
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ПОТИВИРУСЫ
ВИРУС ПЯТНИСТОСТИ ЖИЛОК ТАБАКА
БЕЛОК VPG
РНК-ЗАВИСИМАЯ РНК-ПОЛИМЕРАЗА
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

Доп.точки доступа:
Fellers, John; Wan, Jinrong; Hong, Yiling; Collins, Glenn B.; Hunt, Arthur G.

5.
РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 02.07-04В5.90

   
    Mutational evidence that the VPg is involved in the replication and not the movement of Pea enation mosaic virus-1 [Text] / Jihad S. Skaf [et al.] // J. Gen. Virol. - 2000. - Vol. 81, N 4. - P1103-1109 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Мутационное доказательство того, что VPg участвует в репликации, а не в движении вируса мозаики энации гороха типа 1
Аннотация: В болезни энации гороха участвуют ассоциированные энамовирус - вирус мозаики энации гороха типа 1 (ВМЭГ-1) и умбравирус ВМЭГ-2. Инкапсидированные РНК-1 и -2 ковалентно связаны с белком VPg1 (I; мол. м. 3138), кодируемым РНК ВМЭГ-1. Изучены клоны ВМЭГ (ВМЭГ-1 + ВМЭГ-2) с мутациями ключевых остатков I. Методом количественной обратной транскрипции-ПЦР в реальном времени показано, что неспособность некоторых мутантов заражать растения, связана с дефектом по репликации, а не по движению. Мутантные клоны, вызывающие задержанную и менее тяжелую инфекцию, накапливают в 10-100 раз меньше РНК-1 в растениях и протопластах, чем ВМЭГ дикого типа. Тяжесть симптомов, вызываемых ВМЭГ дикого типа, пропорциональна кол-ву РНК-1, накапливающейся в зараженных растениях, и не зависит от кол-ва РНК-2. Предложена двойная роль I в патогенности ВМЭГ. США, Dep. Botany and Plant Pathol., Michigan State Univ., East Lancing, MI 48824. Библ. 35
ГРНТИ  
68.37.31
ВИНИТИ 681.37.31.15.02
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС МОЗАИКИ ГОРОХА
БЕЛОК VPG
РЕПЛИКАЦИЯ
ДВИЖЕНИЕ
ПАТОГЕННОСТЬ

Доп.точки доступа:
Skaf, Jihad S.; Schultz, Marilou H.; Hirata, Hisae; de, Zoeten Gustaaf A.

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.07-04Б1.270

   
    Mutational evidence that the VPg is involved in the replication and not the movement of Pea enation mosaic virus-1 [Text] / Jihad S. Skaf [et al.] // J. Gen. Virol. - 2000. - Vol. 81, N 4. - P1103-1109 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Мутационное доказательство того, что VPg участвует в репликации, а не в движении вируса мозаики энации гороха типа 1
Аннотация: В болезни энации гороха участвуют ассоциированные энамовирус - вирус мозаики энации гороха типа 1 (ВМЭГ-1) и умбравирус ВМЭГ-2. Инкапсидированные РНК-1 и -2 ковалентно связаны с белком VPg1 (I; мол. м. 3138), кодируемым РНК ВМЭГ-1. Изучены клоны ВМЭГ (ВМЭГ-1 + ВМЭГ-2) с мутациями ключевых остатков I. Методом количественной обратной транскрипции-ПЦР в реальном времени показано, что неспособность некоторых мутантов заражать растения, связана с дефектом по репликации, а не по движению. Мутантные клоны, вызывающие задержанную и менее тяжелую инфекцию, накапливают в 10-100 раз меньше РНК-1 в растениях и протопластах, чем ВМЭГ дикого типа. Тяжесть симптомов, вызываемых ВМЭГ дикого типа, пропорциональна кол-ву РНК-1, накапливающейся в зараженных растениях, и не зависит от кол-ва РНК-2. Предложена двойная роль I в патогенности ВМЭГ. США, Dep. Botany and Plant Pathol., Michigan State Univ., East Lancing, MI 48824. Библ. 35
ГРНТИ  
34.25.29
ВИНИТИ 341.25.29.11
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС МОЗАИКИ ГОРОХА
БЕЛОК VPG
РЕПЛИКАЦИЯ
ДВИЖЕНИЕ
ПАТОГЕННОСТЬ

Доп.точки доступа:
Skaf, Jihad S.; Schultz, Marilou H.; Hirata, Hisae; de, Zoeten Gustaaf A.

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 03.05-04Б1.79

   
    Characterization of VPg and the polyprotein processing of Cocksfoot mottle virus (genus Sobemovirus) [Text] / Kristiina Makinen [et al.] // J. Gen. Virol. - 2000. - Vol. 81, N 11. - P2783-2789 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Характеристика белка VPg и процессинг полипротеина вируса пятнистости ежи сборной (род Sobemovirus)
Аннотация: Полипротеин (I) вируса мозаики ежи сборной (ВМЕС) транслируется из 2 перекрывающихся открытых рамок считывания (ОРС) 2a и 2b по механизму рибосомного сдвига рамки типа - 1. Из происходящих из РНК ВМЕС образцов очистили белок с мол. м. 12 кД, к-рый идентифицировали как связанный с геномной РНК ВМЕС белок VPg (II). N-концевое аминокислотное секвенирование показало, что домен II расположен между мотивами сериновой протеиназы и репликазы (III) и что при образовании N-конца II происходит расщепление I между остатками глу и асн. Вестерн-блот материала из зараженных ВМЕС растений обнаружил процессинг I в еще нескольких сайтах. Антисыворотка к продукту ОРС 2а узнает 6 разных белков, из к-рых только белок 24 кД узнается антисывороткой к II. Это показало, что полностью процессированный II является минорным продуктом в зараженных растениях. Антисыворотка к продукту ОРС 2b узнает белок 58 кД. Это позволило предположить, что полностью процессированная III целиком кодируется ОРС 2b. Предложена модель процессинга I ВМЕС. Финляндия, Inst. Biotechnol., Viikki Bioctr., FIN-00014 Univ. of Helsinki. Библ. 29
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
СОБЕМОВИРУС ПЯТНИСТОСТИ ЕЖИ СБОРНОЙ
БЕЛОК VPG
ПОЛИПРОТЕИН
ПРОЦЕССИНГ

Доп.точки доступа:
Makinen, Kristiina; Makelainen, Katri; Arshava, Natalya; Tamm, Tiina; Merits, Andres; Truve, Erkki; Zavriev, Sergei; Saarma, Mart

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 03.12-04Б1.92

   
    Mutations in the virus protein genome-linked (VPg) of Potato virus Y(PVY) determine virulence towards recessive resistances in pepper and in Lycopersicon hirsutum [Text] : тез. [1 Joint Conference of the International Working Groups on Legume Viruses (16 Meeting of IWGLV) and Vegetable Viruses (10 Meeting of IWGVV), Bonn, Aug. 4-9, 2002] / Moury Moury [et al.] // Z. Pflanzenkrankh. und Pflanzenschutz. - 2003. - Vol. 110, N 1. - P87-88 . - ISSN 0340-8159
Перевод заглавия: Мутации в геном-связанном вирусном белке (VPg) определяют вирулентность по отношению к рецессивной устойчивости у перца и у Lycopersicon hirsutum
Аннотация: Рециссивная устойчивость, контролирующая потивирусные инфекции, встречается достаточно часто и вирусный VPg является главной детерминантой вирулентности. Приводится 5 примеров такой устойчивости. В перце и L. hirsutum гены рецессивной устойчивости локализуются в ортологичных геномных районах и контролируют ранние этапы в инфекционном цикле PVY. Устойчивость, определяемая pvr-2, быстро снималась в культиварах перца, в котором реализовались устойчивые аллели. Вирулентные в отношении резистентных растений перца и L. hirsutum штаммы PVY секвенировались и клонировались. Для генерации инфекционных молекул ДНК из этих клонов применялись 2 стратегии. Первая заключалась во введении трех коротких интронов в последовательности PVY для стабилизации полноразмерного клона. Вторая стратегия состояла в клонировании последовательности PVY в двух участках, ограниченных рестрикционным сайтом Bst XI. После переваривания обоих клонов Bst XI были получена полноразмерная последовательность PVY. Оба клона кДНК вызывали инфекцию инокуляцией непосредственно молекул кДНК. Генерация химерных вирусов между двумя клонированными штаммами показала, что VPg является детерминантой вирулентности PVY в отношении рецессивной устойчивости у обоих видов растений. Франция, INRA Station de Pathologie Vegetale, F 84143 Montfavet
ГРНТИ  
34.25.29
ВИНИТИ 341.25.29.11
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ПОТИВИРУСЫ
ВИРУЛЕНТНОСТЬ
ДЕТЕРМИНАНТЫ
БЕЛОК VPG
МУТАЦИИ

Доп.точки доступа:
Moury, Moury; Morel, C.; Johansen, E.; Guilbaud, L.; Souche, S.; Jacquemond, M.; Marchoux, G.

9.
РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 04.01-04В5.22

   
    Mutations in the virus protein genome-linked (VPg) of Potato virus Y(PVY) determine virulence towards recessive resistances in pepper and in Lycopersicon hirsutum [Text] : тез. [1 Joint Conference of the International Working Groups on Legume Viruses (16 Meeting of IWGLV) and Vegetable Viruses (10 Meeting of IWGVV), Bonn, Aug. 4-9, 2002] / Moury Moury [et al.] // Z. Pflanzenkrankh. und Pflanzenschutz. - 2003. - Vol. 110, N 1. - P87-88 . - ISSN 0340-8159
Перевод заглавия: Мутации в геном-связанном вирусном белке (VPg) определяют вирулентность по отношению к рецессивной устойчивости у перца и у Lycopersicon hirsutum
Аннотация: Рециссивная устойчивость, контролирующая потивирусные инфекции, встречается достаточно часто и вирусный VPg является главной детерминантой вирулентности. Приводится 5 примеров такой устойчивости. В перце и L. hirsutum гены рецессивной устойчивости локализуются в ортологичных геномных районах и контролируют ранние этапы в инфекционном цикле PVY. Устойчивость, определяемая pvr-2, быстро снималась в культиварах перца, в котором реализовались устойчивые аллели. Вирулентные в отношении резистентных растений перца и L. hirsutum штаммы PVY секвенировались и клонировались. Для генерации инфекционных молекул ДНК из этих клонов применялись 2 стратегии. Первая заключалась во введении трех коротких интронов в последовательности PVY для стабилизации полноразмерного клона. Вторая стратегия состояла в клонировании последовательности PVY в двух участках, ограниченных рестрикционным сайтом Bst XI. После переваривания обоих клонов Bst XI были получена полноразмерная последовательность PVY. Оба клона кДНК вызывали инфекцию инокуляцией непосредственно молекул кДНК. Генерация химерных вирусов между двумя клонированными штаммами показала, что VPg является детерминантой вирулентности PVY в отношении рецессивной устойчивости у обоих видов растений. Франция, INRA Station de Pathologie Vegetale, F 84143 Montfavet
ГРНТИ  
68.37.07
ВИНИТИ 681.37.07.13
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ПОТИВИРУСЫ
ВИРУЛЕНТНОСТЬ
ДЕТЕРМИНАНТЫ
БЕЛОК VPG
МУТАЦИИ

Доп.точки доступа:
Moury, Moury; Morel, C.; Johansen, E.; Guilbaud, L.; Souche, S.; Jacquemond, M.; Marchoux, G.

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 08.03-04Б1.55

   
    Nucleotide channel of RNA-dependent RNA polymerase used for intermolecular uridylylation of protein primer [Text] / Andres B. Tellez [et al.] // J. Mol. Biol. - 2006. - Vol. 357, N 2. - P665-675 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Нуклеазный канал РНК-зависимой РНК-полимеразы используется для внутримолекулярного уридилирования белкового праймера
Аннотация: VPg полиовируса - это пептид из 22 аминокислот, который служит белковым праймером для репликации вирусной геномной РНК. VPg связывается с РНК-зависимой РНК-полимеразой 3D и подвергается ковалентному уридилированию с образованием VPg-PU и VPg-pUp4, которые затем удлиняются. Провели компьютерное моделирование связывания VPg с полимеразой 3D. Идентифицировали потенциальные вторичные структуры VPg, представляющие собой 'бета'-шпилечные структуры. Методами молекулярной динамики предсказали аминокислотные остатки VPg, влияющие на связывание с 3D и проверили эти предсказания как компьютерными, так и биохимическими методами. Опыты с мутантными VPg и мутантной полимеразой подтвердили, что сайт связывания VPg находится на обратной стороне молекулы полимеразы по отношению к сайту связывания удлиняющегося праймера. США, Dep. Biomed. Inform., Stanford Univ. Sch. Med., Stanford CA 94305. Библ. 33
ГРНТИ  
34.25.19
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУС ПОЛИОМИЕЛИТА
РНК-ЗАВИСИМАЯ РНК-ПОЛИМЕРАЗА
НУКЛЕАЗНЫЙ КАНАЛ
БЕЛКОВЫЙ ПРАЙМЕР
УРИДИЛИРОВАНИЕ
ВНУТРИМОЛЕКУЛЯРНОЕ
ПОЛИМЕРАЗА 3D
БЕЛОК VPG
СВЯЗЫВАНИЕ
КОМПЬЮТЕРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Tellez, Andres B.; Crowder, Scott; Spagnolo, Jeannie F.; Thompson, Aaron A.; Peersen, Olve B.; Brutlag, Douglas L.; Kirkegaard, Karla

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 08.08-04Б1.43

   
    Образование комплекса между рекомбинантным белком VPg вируса картофеля Y и гетерологичными эукариотическими факторами инициации трансляции eIF4E [Текст] / Л. И. Строковская [и др.] // Укр. бiохiм. ж. - 2007. - Т. 79, N 1. - С. 85-93 . - ISSN 0201-8470
Аннотация: Геномы некоторых РНК-содержащих вирусов не имеют кэп-структуры, вместо этого их 5'-конец ковалентно связан с вирусным белком VPg. Комплексообразование между VPg и клеточными факторами инициации трансляции (eIF) интенсивно изучается в контексте модели, согласно которой этот комплекс вовлечен в инициацию трансляции вирусных мРНК и одновременное блокирование трансляции собственных белков инфицированной клетки. В исследовании VPg вируса картофеля Y был проэкспрессирован в бактериальной и бакуловирусной системе с целью изучения его способности связываться с eIF4E (и его изоформой) пшеницы. Очищенные рекомбинантные eIF4E и eIF(iso)4E были идентифицированы как партнеры по связыванию с очищенным рекомбинантным VPg в эксперименте in vitro с использованием метода аффинной хроматографии, а также в эксперименте in vivo, когда рекомбинантный VPg и изоформы eIF4E экспрессировали одновременно в клетках насекомых с последующей очисткой комплекса при помощи аффинной хроматографии. Показано, что VPg вируса картофеля Y также формировал комплекс с эндогенным eIF4E клеток насекомых. Взаимодействие VPg вируса картофеля Y с eIF4E пшеницы (непермиссивного растения для вируса картофеля) и, в особенности, взаимодействие с таким эволюционно отдаленным белком, как eIF4E насекомых, свидетельствует о консервативности общих структурных элементов eIF4E, вовлеченных в формирование комплекса с VPg. Украина, Ин-т мол. биол. и генет. НАНУ, Киев. Библ. 19
ГРНТИ  
34.25.17
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: БЕЛОК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
БЕЛОК VPG
ФАКТОР ИНИЦИАЦИИ ТРАНСЛЯЦИИ EIF4E

Доп.точки доступа:
Строковская, Л.И.; Гржела, Р.; Хробочек, Я.; Кихно, И.М.; Чащина, Л.И.; Соломко, А.П.

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 10.05-04Б1.50

   
    Структурно-функциональный анализ комплексов мутантных РНК-зависимых РНК-полимераз с VPg [Текст] / Гу Чаоцзян [и др.] // Биохимия. - 2009. - Т. 74, N 10. - С. 1388-1399 . - ISSN 0320-9725
Аннотация: Репликация генома вируса ящура полностью зависит от активности кодируемой вирусом РНК-зависимой РНК-полимеразы (RdRp). Четыре мутантных RdRp вируса ящура выделены из фракции частиц вируса, обработанного рибавирином. Два мутантных фермента несли одиночные замены (L123F и T381A) и два - двойные (T291I/T381I и L123F/F244L). Мутантные белки экспрессировали в Esherichia coli и очищали металл-аффинной хроматографией. Для определения полимеразной активности использовали ПЦР в реальном времени с обратной транскриптазой в комбинации с системой РНК репликации in vitro с применением геномной РНК VPg в качестве праймеров и матрицы. Мутантный фермент L123F продемонстрировал 0,6-кратное уменьшение (p0,001) полимеразной активности в сравнении с RdRp дикого типа, в то время как активность L123F/F244L и T381A не проявилась. Против ожидания, активность Т291I/T381I возросла в 0,7 раза (p0,001) по сравнению с диким типом. Для изучения структурно-функциональных отношений RdRp все структуры комплексов RdRp-РНК-матрица-праймер получили гомологичным моделированием и молекулярным докингом. Ориентацию VPg1 в комплексах RdRp-VPg1 определяли и анализировали при помощи математических методов. Показано, что ориентация VPg после связывания с полимеразой определяет каталитическую активность RdRp вируса ящура, что предлагает основу для рационального подхода к созданию новых антивирусных препаратов. КНР, Coll. Life Sci., Wuhan Univ. Библ. 28
ГРНТИ  
34.25.19
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: РНК-ЗАВИСИМАЯ РНК-ПОЛИМЕРАЗА
МОДЕЛИРОВАНИЕ
МОЛЕКУЛЯРНЫЙ ДОПИНГ
БЕЛОК VPG
ВИРУС ЯЩУРА

Доп.точки доступа:
Чаоцзян, Гу; Цзэн, Тао; Ли, Юн; Сюй, Чженьхуэй; Мо, Чжунси; Чжэн, Цуни

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 15.01-04Б1.47

    Khan, Mateen A.
    Poly(A)-binding protein increases the binding affinity and kinetic rates of interaction of viral protein linked to genome with translation initiation factors eIFiso4F and eIFiso4F*4B complex [Text] / Mateen A. Khan, Dixie J. Goss // Biochemistry. - 2012. - Vol. 51, N 7. - P1388-1395 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Поли(А)-связывающий белок повышает аффинность связывания и скорости взаимодействия с факторами инициации трансляции eIFiso4F и комплексом eIFiso4F*4B вирусного белка, сцепленного с геномом
Аннотация: Согласно ранним данным авт., белок VPg (I) вируса мозаики турнепса взаимодействует с eIFiso4F(i4F) и существенен для инициации трансляции (IT), в частности, для промоцирования кеп-независимой IT. В продолжение работы тестировали влияние РАВР и/или eIF4B(4B) на равновесность и кинетику связывания I с i4F. Добавление РАВР и/или 4В к i4F повышает аффинность для I в 'ЭКВИВ'3,5 раза. Связывание I с i4F в присутствии РАВР/4В управляется энтальпией и предпочтительнее в терминах энтропии - РАВР/4В снижают на 'ЭКВИВ'67% энтропийный вклад за счет формирования комплекса i4F*4B*PABP*I. Данные кинетики контакта i4F-I в присутствии РАВР/4В указывают на 'ЭКВИВ'3-кратное ускорение ассоциации и 'ЭКВИВ'3-кратное снижение скорости диссоциации, при этом РАВР/4В 2-кратно снижают энергию активации i4F c I. Обсуждают критичность обоих белков, РАВР и I, для быстрого формирования стабильных комплексов в привлечении к мРНК IT-факторов. США, Dep. Chem., Hunter Coll. City Univ., New York, NY 10065
ГРНТИ  
34.25.19
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС МОЗАИКИ ТУРНЕПСА
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ ТРАНСЛЯЦИИ
ФАКТОРЫ
EIFISO4F
БЕЛОК VPG
КОМПЛЕКС EIFISO4FX4B
КИНЕТИКА
СВЯЗЫВАНИЕ С МРНК
ВЛИЯНИЕ ПОЛИ(А)-СВЯЗЫВАЮЩЕГО БЕЛКА (PABP)

Доп.точки доступа:
Goss, Dixie J.

14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 89.04-04Б1.246

   
    Mutational analysis of the genome-linked protein VPg of poliovirus [Text] / Richard J. Kuhn [et al.] // J. Virol. - 1988. - Vol. 62, N 11. - P4207-4215
Перевод заглавия: Мутационный анализ связанного с геномом белка VPg полиовируса
Аннотация: Методом Kuhn и др. (Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1988, 85, 519 - 523) получали мутантов с одинаковыми и множественными заменами и одиночными вставками аминок-т в белке VPg, ковалентно связанном с геномом полиовируса. Сконструированы также три различных мутанта со вставками 5 аминок-т в области С-конца 3А, вирусного полипептида, чьи кодирующие последовательности прилегают к VPg. Трансфекция Кл HeLa синтезированной in vitro РНК была использована для анализа влияния мутаций на вирусную репродукцию. Мутации были или летальными или нелетальными. ts фенотип не наблюдался. Arg в положении 17 VPg не м. б. заменен никакой др. аминок-той без потери жизнеспособности вируса, тогда как Lys в положении 20 (аминок-та консервативная для всех известных полиовирусов, коксакивирусов и эховирусов) м. б. заменена несколькими нейтральными аминок-тами и даже Glu. Замена VPg полиовируса на 9 VPg эховирусов приводит к нарушению свойств репродукции вируса. Т. обр., полученные результаты предполагают значительную гибкость в аминок-тных последовательностях функционального VPg. Все вставки в полипептид 3А были летальными. Трансляция in vitro мутированных вирусных РНК дает картины протеолитического процессинга, к-рый в некоторых случаях является аберрантным, даже если мутация не является летальной. США, State Univ. New York at Stony Brook, Stony Brook, N. Y. 11794. Библ. 43.
ГРНТИ  
34.25.21
ВИНИТИ 341.25.21.11 + 341.25.29.17.35
Рубрики: ПОЛИОВИРУС
БЕЛОК VPG
МУТАЦИИ
РНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ПОЛИОВИРУСЫ

Доп.точки доступа:
Kuhn, Richard J.; Tada, Hiroomi; Ypma-Wong, Ypma-Wong; Mary, Frances; Semler, Bert L.; Wimmer, Eckard

15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 90.11-04Б1.591

    Tobin, Gregory J.
    Selfcatalyzed linkage of poliovirus terminal protein VPg to poliovirus RNA [Text] / Gregory J. Tobin, Dorothy C. Young, James B. Flanegan // Cell. - 1989. - Vol. 59, N 3. - P511-519 . - ISSN 0092-8674
Перевод заглавия: Самокатализируемое связывание концевого белка Vpg полиовируса с РНК вируса полиомиелита
Аннотация: Концевой белок полиовируса Vpg способен ковалентно связываться с полиовирусной РНК в присутствии синтетического Vpg, Mg{2}+ и репликационного интермедиата, синтезированного in vitro. Р-ция связывания не требует вирусной полимеразы, факторов хозяина или рибонуклеозидтрифосффатов и является специфической для связанной с матрицей минус-нитью РНК, синтезированной на вирионной РНК. Ковалентная природа связи между Vpg и РНК показана путем выделения Vpg-pUp из комплекса Vpg-РНК. Предложена модель, по к-рой остаток тирозина в Vpg образует фосфодиэфирную связь с 5'-УМФ в минус-нити РНК в самокатализируемой трансэфирной р-ции. По-видимому или РНК, или Vpg или их комбинация формируют каталитический центр для этой р-ции. Библ. 38. США, Univ. of Florida, Gainesville, Florid 32610.
ГРНТИ  
34.25.29
ВИНИТИ 341.25.29.17.35
Рубрики: ПОЛИОВИРУСЫ
БЕЛОК VPG
СВЯЗЫВАНИЕ
РНК ВИРУСНАЯ

Доп.точки доступа:
Young, Dorothy C.; Flanegan, James B.
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)