СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ<.>)

Общее количество найденных документов : 28
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-28

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.08-04Б2.32

Кондратьева, Т. Ф.
Штаммовая генотипическая гетерогенность ацидофильных хемолитотрофных микроорганизмов [Текст] / Т. Ф. Кондратьева, С. Н. Агеева // Труды института микробиологии им. С.Н. Виноградского. - М., 2004. - Юбилейный сборник к 70-летию института, Вып. 12. - С. 197-212 . - ISBN 5-02-03386-0
Аннотация: Обзор. В работе изучен штаммовый полиморфизм генотипических признаков ацидофильных хемолитотрофов. Показано, что штаммы Acidithiobacillus ferrooxidans, A. thiooxidans, Sulfobacillus thermosulfidooxidans, S. sibiricus, Acidianus brierleyi, Ferroplasma acidiphilum различаются по структуре хромосомной ДНК, расщепленной эндонуклеазами рестрикции и проанализированной методом пульс-электрофореза. Переключение метаболизма на окисление нового энергетического субстрата может вызвать как обратимые, так и необратимые изменения структуры хромосомной ДНК ацидофильных хемолитотрофов. Особое внимание уделено изучению изменчивости грамотрицательной бактерии A. ferrooxidans, доминирующей в мезофильных сообществах. У штаммов A. ferrooxidans отмечена значительная генетическая гетерогенность тотальных геномов при анализе методом ДНК-ДНК гибридизации. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей генов 16S рРНК выявил наличие нескольких филогенетических групп внутри единого филогенетического кластера. Показан штаммовый полиморфизм плазмидных профилей и роль энергетического субстрата и конц-ии ионов тяжелых металлов в их изменениях. Энергетический субстрат является одним из основных факторов, вызывающих изменчивость ацидофильных хемолитотрофных микроорганизмов. Показана роль IS-элементов и плазмид в микроэволюционных процессах, приводящих к штаммовому полиморфизму. Подчеркнуто значение аборигенных штаммов в биогидрометаллургических технологиях. Библ. 21

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.09.99
Рубрики: АЦИДОФИЛЬНЫЕ ХЕМОЛИТОТРОФНЫЕ БАКТЕРИИ
ACIDITHIOBACILLUS (BACT.)
SULFOBACILLUS (BACT.)
ACIDIANUS (BACT.)
FERROPLASMA (BACT.)
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ГЕТЕРОГЕННОСТЬ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ШТАММОВЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 21

Доп.точки доступа:
Агеева, С.Н.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.02-04Б2.230

Identification of sulfate-reducing, phylogenetic groups most capable of methylating mercury in pure culture and organic acid amended sediment slurries [Text] / J. K. King [et al.] // Abstr. 99th Gen. Meet. Amer. Soc. Microbiol., Chicago, Ill., May 30-June 3, 1999. - Washington (D.C.), 1999. - P475
Перевод заглавия: Выявление филогенетических групп сульфатредукторов, большая часть которых способна метилировать ртуть в чистой культуре, и в образцах илистых осадков, обогащенных органической кислотой
Аннотация: Исследовали филогенетические группы сульфатредуцирующих бактерий (СРБ), способные превращать Hg в метилртуть (MeHg). В присутствии неорганической ртути выращивали представителей СРБ: Desulfovibrio, Desulfobulbus, Desulfococcus, Desulfobacterium и Desulfobacter. Определяли кол-во восстановленного сульфата и образовавшейся MeHg на клетку. Наивысшей производительности в образовании MeHg достигала Desulfobacterium. Desulfovibrio и Desulfobulbus отставали от нее. Выращенные в условиях ферментации культуры СРБ образовывали минимальные кол-ва MeHg, причем возрастания конц-ии MeHg во времени не наблюдалось. В попытках повлиять на процесс к илистым осадкам с их специфическими микробными сообществами в качестве донора электронов добавляли органическую к-ту. Осадки инкубировали в течение 20 дней, до внесения Hg, с молочной или уксусной к-той. Филогенетические группы СРБ, присутствующие в осадках, выявляли методом определения специфичности 16S-pРНК. Образцы осадков подвергали количественному анализу на содержание MeHg, скорость восстановления сульфата, общую конц-ию Hg в воде осадков, конц-ию углеродных субстратов и плотность клеток в осадках. Данные на чистых культурах СРБ и илистых осадках с добавлением органических к-т показали своеобразие отдельных филогенетических групп СРБ по их удельной активности метилирования ртути. США, Georgia Inst. of Technol., Savannah, GA

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.15
Рубрики: СУЛЬФАТРЕДУЦИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ИЛ
ОРГАНИЧЕСКИЕ КИСЛОТЫ
ВНЕСЕНИЕ
РТУТЬ
МЕТИЛИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
King, J.K.; Frischer, M.E.; Kostka, J.E.; Saunders, F.M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 02.03-04Б3.39

Identification of sulfate-reducing, phylogenetic groups most capable of methylating mercury in pure culture and organic acid amended sediment slurries [Text] / J. K. King [et al.] // Abstr. 99th Gen. Meet. Amer. Soc. Microbiol., Chicago, Ill., May 30-June 3, 1999. - Washington (D.C.), 1999. - P475
Перевод заглавия: Выявление филогенетических групп сульфатредукторов, большая часть которых способна метилировать ртуть в чистой культуре, и в образцах илистых осадков, обогащенных органической кислотой
Аннотация: Исследовали филогенетические группы сульфатредуцирующих бактерий (СРБ), способные превращать Hg в метилртуть (MeHg). В присутствии неорганической ртути выращивали представителей СРБ: Desulfovibrio, Desulfobulbus, Desulfococcus, Desulfobacterium и Desulfobacter. Определяли кол-во восстановленного сульфата и образовавшейся MeHg на клетку. Наивысшей производительности в образовании MeHg достигала Desulfobacterium. Desulfovibrio и Desulfobulbus отставали от нее. Выращенные в условиях ферментации культуры СРБ образовывали минимальные кол-ва MeHg, причем возрастания конц-ии MeHg во времени не наблюдалось. В попытках повлиять на процесс к илистым осадкам с их специфическими микробными сообществами в качестве донора электронов добавляли органическую к-ту. Осадки инкубировали в течение 20 дней, до внесения Hg, с молочной или уксусной к-той. Филогенетические группы СРБ, присутствующие в осадках, выявляли методом определения специфичности 16S-pРНК. Образцы осадков подвергали количественному анализу на содержание MeHg, скорость восстановления сульфата, общую конц-ию Hg в воде осадков, конц-ию углеродных субстратов и плотность клеток в осадках. Данные на чистых культурах СРБ и илистых осадках с добавлением органических к-т показали своеобразие отдельных филогенетических групп СРБ по их удельной активности метилирования ртути. США, Georgia Inst. of Technol., Savannah, GA

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: СУЛЬФАТРЕДУЦИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ИЛ
ОРГАНИЧЕСКИЕ КИСЛОТЫ
ВНЕСЕНИЕ
РТУТЬ
МЕТИЛИРОВАНИЕ
СУЛЬФАТРЕДУЦИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ИЛ
ОРГАНИЧЕСКИЕ КИСЛОТЫ
ВНЕСЕНИЕ
РТУТЬ
МЕТИЛИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
King, J.K.; Frischer, M.E.; Kostka, J.E.; Saunders, F.M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.10-04Б2.182

Baldy-Chudzik, Katarzyna.
Genetic structure and antimicrobial resistance in Escherichia coli isolated from waters of Lake Slawa [Text] / Katarzyna Baldy-Chudzik, Michal Stosik // Limnol. Pap. - 2007. - Vol. 2. - P121-129 . - ISSN 1896-835X
Перевод заглавия: Генетическая структура и антибиотикорезистентность у Escherichia coli, выделенной из воды озера Slawa
Аннотация: В данной работе осуществили анализ распространения резистентных штаммов из 4-х филогенетических групп Escherichia coli, выделенных из воды озера Slawa. 273 штамма были идентифицированы в образцах воды в 4-х участках озера в летнее время. Анализ генетической структуры E. coli позволил показать преобладание штаммов из филогенетической группы B1 (типичные комменсалы) и B2 (потенциальные кишечные патогены) и наличие незначительного количества штаммов из группы A (типичные комменсалы) и D (потенциальные кишечные патогены). Обнаружили зональное разнообразие генетической структуры штаммов в отдельных участках озера. Штаммы, принадлежащие к филогенетической группе B1, преобладали в субповерхностной зоне воды. Обнаружили, что генетическая структура штаммов была более разнообразной в донной зоне воды (с преобладанием штаммов из группы B2). В образцах воды из различных участков озера определили высокий процент штаммов E. coli, резистентных к 14 антибиотикам, которые применяют для борьбы с инфекциями. Штаммы, резистентные к более чем 3 антибиотикам преобладали в субповерхностной зоне. В данной зоне определили штаммы E. coli, резистентные к одному, двум, трем и более антибиотикам. Польша, Dep. of Microbiol. and Genetics, Inst. of Biotechnology and Environmental Science, Univ. of Zielona Gora

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.31.99
Рубрики: БАКТЕРИИ
ВОДНЫЕ БАКТЕРИИ
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
АНТИБИОТИКОУСТОЙЧИВОСТЬ
МНОЖЕСТВЕННАЯ УСТОЙЧИВОСТЬ
ESCHERCHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Stosik, Michal

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.04-04Б2.115

Shinkai, Takumi.
Ecological characterization of three different phylogenetic groups belonging to the cellulolytic bacterial species Fibrobacter succinogenes in the rumen [Text] / Takumi Shinkai, Nobuya Matsumoto, Yasuo Kobayashi // Anim. Sci. J. - 2007. - Vol. 78, N 5. - P503-511 . - ISSN 1344-3941
Перевод заглавия: Экологическая характеристика трех филогенетически различающихся групп у целлолитической бактерии Fibrobacter succinogenes, обитательницы рубца
Аннотация: Были разработаны методы выявления филогенетических групп 2 и 3 у Fibrobacter succinogenes в пробах содержимого рубца. Метод основан на ПЦР в отношении 16S рДНК. Он применим в широких пределах содержания 16S рДНК (10{4}-10{9} и 10{2}-10{9} копий молекул с извлечением 96,9 и 98,0% материала соответственно). Представителей группы 1 F. succinogenes количественно выявляли, вычитая величины конц-ий групп 2 и 3. На твердой фракции содержимого рубца преобладали группы 1 и 2. На непереработанных стеблях сена в течение 48 ч доминировала группа 1. Эта группа, в отличие от двух других, росла даже на стеблях, обработанных целлюлазой. Подчеркивается весомый вклад группы 1 F. succinogenes в переваривание волокон в рубце даже в случае плохо перерабатываемых материалов. Япония, Graduate School of Agriculture, Hokkaido Univ., Kita, Sapporo (E-mail: kyas@anim.agr.hokudai.ac.jp)

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.17
Рубрики: FIBROBACTER SUCCINOGENES (BACT.)
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ВЫЯВЛЕНИЕ
РУБЦОВЫЕ МИКРООРГАНИЗМЫ

Доп.точки доступа:
Matsumoto, Nobuya; Kobayashi, Yasuo

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.11-04Б2.184

Genetic diversity of endophytic bacteria which could be find in the apoplastic sap of the medullary parenchym of the stem of healthy sugarcane plants [Text] / Encarna Velazquez [et al.] // J. Basic Microbiol. - 2008. - Vol. 48, N 2. - P118-124 . - ISSN 0233-111X
Перевод заглавия: Генетическое разнообразие бактерий-эндофитов, которых можно найти в апопластическом соке сердцевинной паренхимы ствола здоровых растений сахарного тростника
Аннотация: Проанализировали генетическое разнообразие 29 штаммов бактерий-эндофитов, выделенных из апопластического сока сердцевинной паренхимы ствола здоровых растений сахарного тростника. Использовали методы фингерпринтирования ДНК (TR-RAPD) и секвенирования гена 16S рРНК. Штаммы распределили в 17 групп на основе образцов TR-RAPD, и репрезентативный штамм из каждой группы подвергли секвенированию по генам 16S рРНК. Выявили широкое разнообразие филогенетических групп, тесно связанных с видами из родов Bacillus и Staphylococcus из Firmicutes, Microbacterium, Micrococcus и Kokuria из Actinobacteria, Rhizobium и Gluconocetobacter из 'альфа'-Proteobacteria, Comamonas и Xanthomonas из 'бета'-Proteobacteria. Полученные результаты свидетельствуют о сложном составе бактериальных популяций во внутренних тканях сахарного тростника. Испания, Dep. de Microbiol. y Genetica., Univ. de Salamanca, Salamanca. Библ. 38

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.31.05
Рубрики: БАКТЕРИИ
БАКТЕРИИ-ЭНДОФИТЫ
САХАРНЫЙ ТРОСТНИК
СЕРДЦЕВИННАЯ ПАРЕНХИМА СТВОЛА
АПОПЛАСТИЧЕСКИЙ СОК
ГЕНОТИП
ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ACTINOBACTERIA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Velazquez, Encarna; Rojas, Marcia; Lorite, Maria Jose; Rivas, Raul; Zurdo-Pineiro, Jose Luis; Heydrich, Mayra; Bedmar, Eulogio J.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 09.11-04Б4.160

Baldy-Chudzik, Katarzyna.
Genetic structure and antimicrobial resistance in Escherichia coli isolated from waters of Lake Slawa [Text] / Katarzyna Baldy-Chudzik, Michal Stosik // Limnol. Pap. - 2007. - Vol. 2. - P121-129 . - ISSN 1896-835X
Перевод заглавия: Генетическая структура и антибиотикорезистентность у Escherichia coli, выделенной из воды озера Slawa
Аннотация: В данной работе осуществили анализ распространения резистентных штаммов из 4-х филогенетических групп Escherichia coli, выделенных из воды озера Slawa. 273 штамма были идентифицированы в образцах воды в 4-х участках озера в летнее время. Анализ генетической структуры E. coli позволил показать преобладание штаммов из филогенетической группы B1 (типичные комменсалы) и B2 (потенциальные кишечные патогены) и наличие незначительного количества штаммов из группы A (типичные комменсалы) и D (потенциальные кишечные патогены). Обнаружили зональное разнообразие генетической структуры штаммов в отдельных участках озера. Штаммы, принадлежащие к филогенетической группе B1, преобладали в субповерхностной зоне воды. Обнаружили, что генетическая структура штаммов была более разнообразной в донной зоне воды (с преобладанием штаммов из группы B2). В образцах воды из различных участков озера определили высокий процент штаммов E. coli, резистентных к 14 антибиотикам, которые применяют для борьбы с инфекциями. Штаммы, резистентные к более чем 3 антибиотикам преобладали в субповерхностной зоне. В данной зоне определили штаммы E. coli, резистентные к одному, двум, трем и более антибиотикам. Польша, Dep. of Microbiol. and Genetics, Inst. of Biotechnology and Environmental Science, Univ. of Zielona Gora

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.25.07
Рубрики: БАКТЕРИИ
ВОДНЫЕ БАКТЕРИИ
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
АНТИБИОТИКОУСТОЙЧИВОСТЬ
МНОЖЕСТВЕННАЯ УСТОЙЧИВОСТЬ
ESCHERCHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Stosik, Michal

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.02-04Б2.145

Assigning Escherichia coli strains to phylogenetic groups: Multi-locus seqience typing versus the PCR triplex method [Text] / David M. Gordon [et al.] // Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 10, N 10. - P2484-2496 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Распределение штаммов Escherichia coli на филогенетические группы: мультилокусное типирование нуклеотидной последовательности в сравнении с триплексным ПЦР-методом
Аннотация: Разработали метод на основе триплексной ПЦР для распределения штаммов Escherichia coli на фило-группы при использовании генов chuA и yjaA, а также фрагмента ДНК (TSPE4.C2). Точность распределения штаммов на правильные фило-группы не получила адекватной оценки. Кроме того, 662 штамма E. coli распределили на фило-группы на основе мультилокусного типирования нуклеотидной последовательности при использовании Clermont метода. Показали, что в этом случае 80-85% штаммов E. coli распределяются на правильные фило-группы. Австралия, Sch. of Botany and Zoology, Australian National Univ., Canberra ACT 0200

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММЫ
РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
МЕТОДЫ
ПЦР ТРИПЛЕКСНАЯ ГЕНЫ CHUA
ГЕНЫ YJAA
СРАВНЕНИЕ
МУЛЬТИЛОКУСНОЕ ТИПИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Gordon, David M.; Clermont, Olivier; Tolley, Heather; Denamur, Erick

РЖ ВИНИТИ 34 (BI05) 10.07-04И8.52

Shinkai, Takumi.
Ecological characterization of three different phylogenetic groups belonging to the cellulolytic bacterial species Fibrobacter succinogenes in the rumen [Text] / Takumi Shinkai, Nobuya Matsumoto, Yasuo Kobayashi // Anim. Sci. J. - 2007. - Vol. 78, N 5. - P503-511 . - ISSN 1344-3941
Перевод заглавия: Экологическая характеристика трех филогенетически различающихся групп у целлолитической бактерии Fibrobacter succinogenes, обитательницы рубца
Аннотация: Были разработаны методы выявления филогенетических групп 2 и 3 у Fibrobacter succinogenes в пробах содержимого рубца. Метод основан на ПЦР в отношении 16S рДНК. Он применим в широких пределах содержания 16S рДНК (10{4}-10{9} и 10{2}-10{9} копий молекул с извлечением 96,9 и 98,0% материала соответственно). Представителей группы 1 F. succinogenes количественно выявляли, вычитая величины конц-ий групп 2 и 3. На твердой фракции содержимого рубца преобладали группы 1 и 2. На непереработанных стеблях сена в течение 48 ч доминировала группа 1. Эта группа, в отличие от двух других, росла даже на стеблях, обработанных целлюлазой. Подчеркивается весомый вклад группы 1 F. succinogenes в переваривание волокон в рубце даже в случае плохо перерабатываемых материалов. Япония, Graduate School of Agriculture, Hokkaido Univ., Kita, Sapporo (E-mail: kyas@anim.agr.hokudai.ac.jp)

ГРНТИ	34.39.57

ВИНИТИ 341.39.57.53.05
Рубрики: FIBROBACTER SUCCINOGENES (BACT.)
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ВЫЯВЛЕНИЕ
РУБЦОВЫЕ МИКРООРГАНИЗМЫ

Доп.точки доступа:
Matsumoto, Nobuya; Kobayashi, Yasuo

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI50) 90.12-04И9.495

Guerrero, R.
A phylogenetical approach to Neotropical Streblidae batflies (Diptera:Pupipara) [Text] / R. Guerrero // Bull. Soc. fr. parasitol. - 1990. - Vol. 8, Suppl. N1. - P217
Перевод заглавия: Филогенетический подход [к изучению] неотропических видов мух семейства Streblidae
Аннотация: В неотропич. регионе представлены 3 из 5 подсемейств, 25 из 31 рода и 145 из 221 вида сем. Streblidae мировой фауны. Проведен сравнительный анализ этих 25 родов и особо 8 видов p. Trichobius и представителей сестринских систематич. групп - p. Basilia (Nycteribiidae) и p. Crataerina (Hippoboscidae). Использовано 75 признаков строения головы, груди, брюшка, крыльев и ног. Кладистич. анализ с применением компьютерных программ выявил среди неотропич. стреблид 3 филогенетич. группы: Trichobiinae s. s., Nycterophiliinae и Streblinae s. l. Группа Nycterophilinae обнаруживает большое сходство с p. Basilia и, по-видимому, должна рассматриваться скорее в сем. Nycteribiidae, нежели Streblidae. Группа Streblinae s. l. эволюционировала обособленно от 2 др. групп; в нее должны быть включены pp. Eldunia и Strizostrebla. В филогенетич. аспекте обсуждены паразито-хозяинные отношения стреблид. Венесуэла, Inst. Zool. Tropical, Fac. Cie, U. C. V., Apdo. 47058, Caracas 1041-А.

ГРНТИ	34.33.23

ВИНИТИ 341.33.23.19.09.25.02
Рубрики: STREBLIDAE (DIPT.)
ФАУНА
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
НЕОТРОПИЧЕСКИЕ ВИДЫ
ДВУКРЫЛЫЕ

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI51) 94.10-04И7.048

Wojcik, Jan M.
Chromosome races of the common shrew Sorex araneus in Poland: a model of karyotype evolution [Text] / Jan M. Wojcik // Acta theriol. - 1993. - Vol. 38, N 3. - P315-338 . - ISSN 0001-7051
Перевод заглавия: Хромосомные расы обыкновенной бурозубки в Польше: модель кариотипической эволюции
Аннотация: В Польше найдены 5 хромосомных рас обыкновенной бурозубки Sorex araneus, включая различные метацентрики с монобрахиальной гомологией. Полиморфность кариотипов исследованных бурозубок заключалась в различных комбинациях плеч и различном числе акроцентрических хромосом. Филогенетические взаимоотношения между польскими и др. европейскими расами обыкновенной бурозубки устанавливали по рез-там парзимониального анализа. 5 филогенетических групп обыкновенных бурозубок, 2 из к-рых состоят из одной расы, могут быть дифференцированы на территории Европы. Польские расы относятся к 2-м филогенетическим группам: западноевропейской и восточно-европейской. Предлагается модель хромосомной эволюции S. a., включающая 2 компоненты: аллопатрическую и парапатрическую, или стасипатрическую. Эта модель основана на распространении различных хромосомных рас и различных метацентриков в кариотипах бурозубок Польши и центр. Европы. Польша, Mammal Res. Inst., Polish Acad. of Sci., 17-230 Bialowiera. Табл. 3. Ил. 6. Библ. 68.

ГРНТИ	34.33.27

ВИНИТИ 341.33.27.21.19.19.15
Рубрики: БУРОЗУБКИ
SOREX ARANEUS (MAMM.)
ХРОМОСОМНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
КАРИОТИПЫ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 15.10-04Б4.97

Association between the presence of Class 1 integrons, virulence genes, adn phylogenetic groups of Escherichia coli isolates from river water [Text] / Ryszard Koczura [et al.] // Microbial Ecol. - 2013. - Vol. 65, N 1. - P84-90 . - ISSN 0095-3628
Перевод заглавия: Связь между присутствием интегронов 1 класса, генами вирулентности и филогенетическими группами у Escherichia coli, выделенных из речной воды
Аннотация: Из воды реки Варты (Польша) выделено 96 изолятов Escherichia coli, несущих интегроны класса 1, и 96 интегрон-отрицательных изолятов. Они были филогенетически охарактеризованы, и у них определялось наличие генов, связанных с вирулентностью. Показано, что большинство штаммов принадлежит к филогенетической группе А, но принадлежность к той или иной группе не соотносится с наличием интегронов. Присутствие генов вирулентности (гена термостабильного токсина, гена sfaA, кодирующий субъединицу S-фимбрий, генов рецепторов сидерофоров fyuA и iutA) связано с присутствием интегронов класса 1. Более того, общее кол-во генов вирулентности в группах коррелирует с наличием в них интегронов. Получ. рез-ты позволяют по-новому взглянуть на связи между наличием интегронов в E. coli и вирулентностью, а также на филогенетическое распределение групп

ГРНТИ	34.27.49

ВИНИТИ 341.27.49.07
Рубрики: ИНТЕГРОНЫ 1 КЛАССА
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
СВЯЗЬ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ
РЕЧНАЯ ВОДА
РЕКА ВАРТА
ПОЛЬША

Доп.точки доступа:
Koczura, Ryszard; Mokracka, Joanna; Barczak, Agata; Krysiak, Natalia; Kaznowski, Adam

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.08-04Б2.163

Assigning Escherichia coli strains to phylogenetic groups: Multi-locus seqience typing versus the PCR triplex method [Text] / David M. Gordon [et al.] // Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 10, N 10. - P2484-2496 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Распределение штаммов Escherichia coli на филогенетические группы: мультилокусное типирование нуклеотидной последовательности в сравнении с триплексным ПЦР-методом
Аннотация: Разработали метод на основе триплексной ПЦР для распределения штаммов Escherichia coli на фило-группы при использовании генов chuA и yjaA, а также фрагмента ДНК (TSPE4.C2). Точность распределения штаммов на правильные фило-группы не получила адекватной оценки. Кроме того, 662 штамма E. coli распределили на фило-группы на основе мультилокусного типирования нуклеотидной последовательности при использовании Clermont метода. Показали, что в этом случае 80-85% штаммов E. coli распределяются на правильные фило-группы. Австралия, Sch. of Botany and Zoology, Australian National Univ., Canberra ACT 0200

ГРНТИ	34.27.21

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 90.05-04А1.83

Takahata, Naoyuki.
On the overdispersed molecular clock [Text] / Naoyuki Takahata ; Nat. Inst. Genet. // Annu. Rept. - 1987(1988). - N 38. - P95-96 . - ISSN 0077-4995
Перевод заглавия: О сверхвариабельных молекулярных часах
Аннотация: Дисперсия скоростей молек. эволюции в некоторых локусах выше, чем следовало бы ожидать, исходя из распределения Пуассона. Разные таксономические группы и филетические линии могут сильно отличаться друг от друга по уровню вариабельности темпов молек. эволюции. Предложена модель, согласно к-рой сверхвариабельность эволюционных скоростей объясняется вариациями степени селективных ограничений, к-рые вызываются последовательными нуклеотидными замещениями в эволюирующем гене. Однако модель не включает гипотезу о положит. дарвиновском отборе как основной движущей силе молек. эволюции.

ГРНТИ	34.03.17

ВИНИТИ 341.03.17.27.02 + 341.23.03.02
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
ТЕМПЫ ЭВОЛЮЦИИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
СВЕРХВАРИАБЕЛЬНОСТЬ
НУКЛЕОТИДНЫЕ ЗАМЕЩЕНИЯ
ЭВОЛЮИРУЮЩИЕ ГЕНЫ
ГИПОТЕЗА

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 90.12-04Б4.215

A single clone of Staphylococcus aureus causes the majority of cases of toxic shock syndrome [Text] / James M. Musser [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1990. - Vol. 87, N 1. - P225-229 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Единственный клон Staphylococcus aureus вызывает большинство случаев синдрома токсического шока
Аннотация: Исследованы генетические связи среди 315 шт. S. aureus (S. a.), продуцирующих токсин-1 синдрома токсического шока (TSST-1) и выделенных в 5 странах двух континентов. Штаммы были выделены от б-ных синдромом токсического шока (СТШ) с урогенитальной (60,5%) и неурогенитальной (15,2%) локализацией заболевания, а также от б-ных другими формами стафилококковой инфекции, здоровых носителей и домашних животных, страдающих маститом. Связи устанавливали на основании анализа 20 хромосомных аллельных генов, контролирующих продукцию 20 ферментов, ответственных за клеточный метаболизм. Полиморфизм ферментов определяли путем электрофореза клеточного содержимого в крахмальном геле. Выявлены 49 различных электрофоретических типов (ЭТ), представляющих мультилокусные энзимные генотипы. При проведении кластерного анализа ЭТ выделены 2 главные филогенетические группы штаммов с генетической дистанцией между ними, равной 0,35 (различие в 7 из 20 исследованных локусов). При уровне генетического различия 0,2 внутри этих групп идентифицированы 7 кластеров (5 в первой и 2 во второй). Установлено, что 88% штаммов-возбудителей урогенитального СТШ и 53% шт., ответственных за неурогенитальный СТШ, относились к ЭТ 41 (кластер F второй группы). Предполагается, что эти штаммы, независимо от региона выделения, представляют собой один клон S. a., особенно хорошо адаптировавшийся к колонизации урогенитальной области. Продукция TSST-1 штаммами, к-рые были далеки друг от друга по генотипу, дает основание считать, что ген TSST-1 эволюционно является довольно старым. Библ. 45. США, Mueller Laboratory, Pennsylvania State University, University Park, PA 16802.

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.19.09
Рубрики: STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
КЛАСТЕРЫ
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ТОКСИНЫ
ТОКСИН-1 СИНДРОМА ТОКСИЧЕСКОГО ШОКА
СИНДРОМ ТОКСИЧЕСКОГО ШОКА
ЭТИОЛОГИЯ

Доп.точки доступа:
Musser, James M.; Schlievert, Patrick M.; Chow, Anthony W.; Ewan, Pauline; Kreiswirth, Barry N.; Rosdahl, Vibeke T.; Naidu, A.Satyanarayan; Witte, Wolfgang; Selander, Robert K.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 09.04-04Б4.30

Ishii, Satoshi.
Relationship between phylogenetic groups, genotypic clusters, and virulence gene profiles of Escherichia coli strains from diverse human and animal sources [Text] / Satoshi Ishii, Katriya P. Meyer, Michael J. Sadowsky // Appl. and Environ. Microbiol. - 2007. - Vol. 73, N 18. - P5703-5710 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Связь между филогенетическими группами, генотипическими кластерами и профилями генов вирулентности штаммов Escherichia coli из разнообразных источников человеческого и животного происхождения
Аннотация: Штаммы Escherichia coli из разнообразных источников (человек и животные) в штатах Миннесота и Висконсин анализировали на присутствие генов, кодирующих факторы вирулентности, с помощью множественной ПЦР и биохимических реакций. Из 1531 исследованного штамма 31 (2%) - штаммы E. coli, продуцирующие Шига-токсин (STEC). Большинство из этих штаммов, выделенных из ряда домашних животных, имеют гены stx[1c], stx[2d], ehxA и saa и относятся к филогенетической группе B1 E. coli. 26 штаммов (1,7%) - вероятные энтеропатогенные штаммы E. coli (EPEG). Они подразделяются на несколько близких подтипов и обнаружены как у людей, так и у животных. Штаммы EPEC распределяются между 4 фимогенетическими группами E. coli. С помощью ПЦР показали, что STEC, возможные EPEC и неSTEC ehxA - позитивные штаммы E. coli различаются генотипически и образуют независимые кластеры. Однако некоторые возможные EPEC генотипически не различаются от непатогенных штаммов E. coli. Показали, что штаммы, предоставляющие возможную опасность для человека, варьируют у хозяев животного происхождения, при этом некоторые виды животных несут большее число патогенных штаммов E. coli, чем другие. США, Univ. of Minnesota, Dep. of Soil, Water, and Climate, 439 Borlaug Hall, St. Paul, MN 55108. Ил. 3. Табл. 1. Библ. 55

ГРНТИ	34.27.59

ВИНИТИ 341.27.59
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ПРОДУЦИРУЮЩИЕ ШИГА-ТОКСИН STEC
ГРУППА B1
ВЫДЕЛЕНИЕ
ЖИВОТНЫЕ
ЭНТЕРОПАТОГЕННЫЕ ШТАММЫ EPEC
ВЫДЕЛЕНИЕ
ЛЮДИ
ЖИВОТНЫЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ КЛАСТЕРЫ
ГЕНЫ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
ПРОФИЛИ

Доп.точки доступа:
Meyer, Katriya P.; Sadowsky, Michael J.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 99.07-04Б4.89

Shigella and enteroinvasive Escherichia coli strains are derived from distinct ancestral strains of E. coli [Text] / Karine Rolland [et al.] // Microbiology. - 1998. - Vol. 144, N 9. - P2667-2672 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Shigella и энтероинвазивные штаммы Escherichia coli происходят от различных штаммов E. coli
Аннотация: Дифференциация между подвидами Shigella и филогинетическим положением между клонами Escherichia coli была осуществлена путем анализа полиморфизма длин рестрикционного фрагмента ДНК (риботипирование). Исследовано 75 штаммов Shigella, принадлежащих к 4 подвидам, и 13 энтероинвазивных E. coli (ЭИЕК) в сравнении с 72 штаммами E. coli из ECOR коллекции, которые были разделены на 4 филогенетические группы (A, B1, B2, D). 17 риботипов Shigella dysenteriae, 12 риботипов Shigella flexneri, 23 риботипа Shigella bogdii, 12 риботипов Shigella sonnei и 13 риботипов ЭИЕК были дифференцированы. Анализ полученных результатов показал, что 13 штаммов серотипа S. bogdii отличались от других штаммов Shigella, а S. sonnei и S. flexneri отличались от S. bogdii и S. dysenteriae. Риботипы Shigella и штаммы из коллекции ECOR друг от друга не отличались, а S. sonnei, S. flexneri и большинство штаммов S. dysenteriae серотип I принадлежали к филогенетической группе B1. Штаммы S. bogdii поровну распределены между двумя группами. Штамм Shigella имел отдаленную связь с группой B2, к которой относятся штаммы E. coli, часто вызывающие внекишечную инфекцию у людей. В противоположность этому 13 штаммов ЭИЕК были широко распространены между филогенетическими группами B1, A и B2. Таким образом исходные виды Shigella и ЭИЕК штаммы происходят от штаммов различных родов. Ил. 3. Табл. 1. Библ. 37

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.09
Рубрики: SHIGELLA (BACT.)
ПОДВИДЫ
ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ
РИБОТИПИРОВАНИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ

Доп.точки доступа:
Rolland, Karine; Lambert-Zechovsky, Nicole; Picard, Bertrand; Denamur, Erick

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.05-04Б2.119

A phylogenetic approach to target selection for structural genomics: Solution structure of YciH [Text] / John R. Cort [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1999. - Vol. 27, N 20. - P4018-4027 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Филогенетический подход к выбору цели для структурной геномики: структура в растворе [белка] YciH
Аннотация: Для того, чтобы претендовать на полное понимание человеческого организма и других живых систем, недостаточно полностью отсеквенировать геномы. Хорошо бы еще установить биохимич. функции белков, чьи последовательности вычисляются на основании результатов секвенирования, и изучить их взаимодействия друг с другом. Для этого необходимо определять их третичную и четвертичную структуру. Чтобы сделать эту задачу решаемой, предложен подход, заключающийся в том, что на основании гомологий последовательностей белки объединяют в гомологические семейства, охватывающие широкий спектр филогенетических групп. Далее определяется трехмерная структура какого-нибудь представителя такого семейства, и делается вывод, что остальные белки семейства должны иметь такую же структуру. Если последовательность гена не является гомологичной какой-нибудь группе с известными функциями, то стоит построить трехмерную структуру продукта, и, возможно, это поможет определить функции. Для демонстрации такого подхода с помощью ЯМР построена структура белка YciH Escherichia coli, и классифицирован его тип сворачивания. Белок YciH - это предположительный фактор инициации трансляции. По типу сворачивания он является ортологом интегрального компонента комплекса инициации трансляции эукариот, хотя его последовательность негомологична этому компоненту. Подобный подход можно использовать и для идентификации новых суперсемейств гомологов в соответствии с их топологией. США [Kennedy M. A.], Environmen. Mol. Sci. Lab., Pacific Northwest Nat. Lab., Richland, WA 99352. Библ. 50

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: СТРУКТУРНАЯ ГЕНОМИКА
БЕЛКИ
БИОХИМИЧЕСКИЕ ФУНКЦИИ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ГОМОЛОГИЧЕСКИЕ СЕМЕЙСТВА
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ТРЕХМЕРНЫЕ СТРУКТУРЫ
БЕЛОК YCIH
СТРУКТУРА
ЯМР - ТИП СВОРАЧИВАНИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Cort, John R.; Koonin, Eugene V.; Bash, Paul A.; Kennedy, Michael A.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 98.07-04Б3.46

Incubation time and media requirements of culturable bacteria from different phylogenetic groups [Text] / Hisayuki Mitsui [et al.] // J. Microbiol. Meth. - 1997. - Vol. 30, N 2. - P103-110 . - ISSN 0167-7012
Перевод заглавия: Время инкубации и требования к средам культивируемых бактерий, относящихся к разным филогенетическим группам
Аннотация: Ранее временные параметры формирования колоний почвенных бактерий на агаровых чашках рассчитывали по кривым образования колоний (КОК) (Gorlach K. et al., // J. Gen. Appl. Microbiol. - 1994. - 40. - 507-517). Сообщается о результатах филогенетического анализа изолятов, выделенных из каждой группы, образующей колонии. В коллекцию включено большое кол-во разнообразных эубактерий. Штаммы, близко родственные Arthrobacter, выделялись из быстро растущих образующих колонии групп I или II, а штаммы из альфа-подгруппы протеобактерий - выделялись из групп III или IV, растущих медленнее. В некоторых филогенетических группах (фирмикуты с низким содержанием Г+Ц, цитофага/флексибактер/бактероиды и протеобактерии бета-подгруппы) наблюдалась гетерогенность в отношении группирования по КОК. По требованиям, предъявляемым к средам, изоляты, относящиеся к цитофага/флексибактер/бактероидам, протеобактериям альфа- и бета-подгрупп и фирмикутам с высоким содержанием Г+Ц, за исключением штаммов, родственных Arthrobacter, можно отнести к олиготрофным бактериям. Напротив, фирмикуты с низким содержанием Г+Ц, протеобактерии гамма-подгруппы и фирмикуты с высоким содержанием Г+Ц, родственные A. globiformis, нельзя отнести к олиготрофам. Япония, Inst. of Genetic Ecology, Tohoku Univ., Katahira, Aoba-ku, Sendai 980-77. Библ. 13

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: ПОЧВА
ПОЧВЕННЫЕ БАКТЕРИИ
КОЛОНИИ
СКОРОСТЬ ОБРАЗОВАНИЯ
ПИЩЕВЫЕ ПОТРЕБНОСТИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
РАЗНООБРАЗИЕ

Доп.точки доступа:
Mitsui, Hisayuki; Gorlach, Krystyna; Lee, Hyong-jin; Hattori, Reiko; Hattori, Tsutomu

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 97.07-04И4.23

Осинов, А. Г.
"Атлантическая" и "дунайская" филогенетическая группы кумжи Salmo trutta complex: генетическая дивергенция, эволюция, охрана [Текст] / А. Г. Осинов, Л. Берначе // Вопр. ихтиол. - 1996. - Т. 36, N 6. - С. 762-786 . - ISSN 0042-8752
Аннотация: Проанализирована генетическая изменчивость по аллозимам и мтДНК в 18 популяциях кумжи Salmo trutta и у севанской форели S. ischchan на территории бывшего Советского Союза. Для кумжи характерен высокий уровень генетической изменчивости по ядерной и митохондриальной ДНК. Все популяции кумжи четко делятся на два кластера и представляют собой две из пяти ранее выделенных у кумжи филогенетических групп. Уровень генетической дивергенции двух групп значителен (среднее значение генетических дистанций Нея равно 0,102 и сред. значение оценок дивергенции нуклеотидных последовательностей - 0,0177). "Дунайская" группа представлена популяциями кумжи бассейнов Черного, Каспийского и Аральского морей. "Атлантическая" группа населяет бассейны Балтийского, Баренцева и Белого морей, однако выявлена и в одном притоке верхней Волги (Каспийский бассейн). Предполагается, что в ледниковое или послеледниковое время отдельные популяции "дунайской" и "атлантической" групп вступали во вторичный контакт. По имеющимся данным, последствия возможной интрогрессивной гибридизации минимальны. Уровень генетической дифференциации популяций внутри каждой филогенетической группы также высок. Рассматриваются вопросы, связанные с происхождением, эволюцией, послеледниковым расселением и таксономическим статусом отдельных групп популяций и форм в рамках S. trutta complex. Обсуждаются генетические аспекты природоохранных мероприятий. Россия, Биол. фак-т Мос. гос. ун-та, Москва. Ил. 4. Табл. 8. Библ. 104

ГРНТИ	34.33.33

ВИНИТИ 341.33.33.07
Рубрики: SALMO TRUTTA COMPLEX (PISCES)
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИВЕРГЕНЦИЯ
ЭВОЛЮЦИЯ
ФИЛОГЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Берначе, Л.

1-20 21-28

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска