Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ<.>)
Общее количество найденных документов : 127
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 96.03-04Т2.267

   

    Fungal metabolites [Text]. Part 7. Solution structure of an antibiotic peptide, trichosporin B-V, from Trichoderma polysporum / Akira Iida [et al.] // J. Chem. Soc. Perkin Trans. 1. - 1993. - N 3. - P375-379 . - ISSN 0300-922X
Перевод заглавия: Метаболиты грибов. Часть 7. Структура в растворе антибиотического пептида трихоспорина B-V из Trichoderma polysporum
Аннотация: Методами двумерного {1}H-ЯМР и КД исследовали пространственное строение трихоспорина B-V (20 аминокислотных остатков) в р-ре CD[3]OH. Из анализа полученных спектральных характеристик установлено, что молекула обладает 'альфа'-спиральной конформацией, изогнутой на остатке Pro14. Представлен подробный анализ системы водородных связей, скоростей обмена пептидных NH-протонов на дейтерий растворителя, значений вицинальных КССВ и данных о ЯЭО. Полученные рез-ты свидетельствуют, что N-концевые остатки 1-3 образуют преимущественно 3[10]-спиральную конформацию. Япония, Fac. Pharm. Sci., Kyoto Univ., Kyoto 606. Библ. 20
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.45.21.95.11.45
Рубрики: ТРИХОСПОРИН
СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

КД

ЯМР

TRICHODERMA POLYSPORUM


Доп.точки доступа:
Iida, Akira; Uesato, Shinichi; Shingu, Tetsuro; Nagaoka, Yasuo; Kuroda, Yoshihiro; Fujita, Tetsuro


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI26) 96.01-04М4.66

   

    Solution structure of the SH3 domain of phospholipase C'гамма' [Text] : abstr. 5th Annu. Meet. Protein Eng. Soc. Jap., [Osaka, 1993] / D. Kohda [et al.] // Protein Eng. - 1993. - Vol. 6, N 8. - P1022 . - ISSN 0269-2139
Перевод заглавия: Структура в растворе домена SH3 фосфолипазы C['гамма']
Аннотация: Методами двумерного {1}H-ЯМР при 600 МГц и дистанционной геометрии исследовали пространственное строение рекомбинантного домена SH3, содержащего остатки 790-852 фосфолипазы C['гамма'] человека. Анализ трехмерной структуры проводили на основе данных ЯМР по программам DSPACE и XPLOR. Установлено, что молекула содержит 3 'бета'-листовых области из 3 и 2-х антипараллельных сегментов, имеющих специфическую относительную ориентацию в молекуле. Общая топология основной цепи домена SH3 фосфолипазы С['гамма'] подобна установленной ранее для SH3 спектрина и Sre SH3. Япония, Tokyo Inst. Metropol. Med. Sci., Tokyo
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.39.41.07.29.02
Рубрики: ФОСФОЛИПАЗА C[ГАММА]
ДОМЕН SH3

СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

ЯМР


Доп.точки доступа:
Kohda, D.; Hatanaka, H.; Odaka, M.; Mandiyan, V.; Ullrich, A.; Schlessinger, J.; Inagaki, F.


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 96.12-04К1.368

   

    Solution structure of human interleukin-1 receptor antagonist protein [Text] / Brian J. Stockman [et al.] // FEBS Lett. - 1994. - Vol. 349&(!&), N 1. - P79-83 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Структура в растворе белка антагониста рецептора интерлейкина-1 человека
Аннотация: Представлены результаты структурных исследований методами многомерной ЯМР спектроскопии белкового ингибитора рецептора интерлейкина-1 человека (153 аминокислотных остатка), однородно обогащенного изотопами {15}N и {13}C/{15}N. Для отнесения сигналов использовали серию экспериментов DQF COSY, NOESY, {1}H-{15}N NOESY, {1}H-{15}N HMQC-J, HMQC-NOESY и NOESY-HMQC при 600 МГц. Анализ пространственной структуры проводили на основе данных ЯМР методами дистанционной геометрии и минимизации энергии по программе DGII. Установлено, что м-ла содержит обширную структуру 'бета'-листка из 12 сегментов, имеющую сходную топологию с определенной ранее для интерлейкина-1'бета'. Отмечается также ряд конформационных различий ингибитора рецептора интерлейкина-1 и интерлейкина-1'бета', которые обсуждаются в связи с молекулярными механизмами их биологической активности. США, Upjohn Lab., Upjohn Co., Kalamazoo, MI 49007. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.43.37.05
Рубрики: РЕЦЕПТОР ИНТЕРЛЕЙКИНА-1
АНТАГОНИСТЫ

СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ


Доп.точки доступа:
Stockman, Brian J.; Scahill, Terrence A.; Strakalaitis, Nancy A.; Brunner, David P.; Yem, Anthony W.; Deibel, Matrin R.


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 97.02-04Т2.244

    Addess, Kenneth J.

    Sequence specificity of quinoxaline antibiotics [Text]. 1. Solution structure of a 1:1 complex between triostin a and [d(GACGTC)][2] and comparison with the solution structure of the [N-MeCys{3},N-MeCys{7}]TANDEM-[d(GATATC)][2] complex / Kenneth J. Addess, Juli Feigon // Biochemistry. - 1994. - Vol. 33, N 41. - P12386-12396 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Специфичность, обусловленная первичной структурой хиноксалиновых антибиотиков. 1. Структура в растворе комплекса 1:1 между триостином A и [d(GACGTC)][2] и сравнение со структурой в растворе комплекса [N-MeCys3, N-MeCys7]TANDEM-[d(GATATC)][2]
Аннотация: Методами двумерной {1}H-ЯМР спектроскопии исследовали структуру комплексов триостина A и его аналога, не содержащего N-метильных групп у остатков Val, с гексамерами ДНК. Для отнесения сигналов использовали серию экспериментов HOHAHA и NOESY при 500 МГц. Анализ пространственного строения комплексов проводили на основе данных ЯМР методами минимизации энергии, ограниченной молекулярной динамики и имитационной обработки по программе X-PLOR. Установлено, что триостатин A связывается с гексамером ДНК путем бис-интеркаляции по CpG-центру с расположением пептидной компоненты в малой бороздке ДНК. Аналог триостина A образует подобный комплекс по TpA-центру гексамера и имеет отличающуюся систему стабилизирующих его водородных связей. Полученные данные обсуждаются в связи с особенностями химического строения изученных хиноксалиновых антибиотиков. США, Dep. Chem., Biochem., Mol. Biol. Inst., Univ. California, Los Angeles, CA 90024-1569. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.45.21.95.11.45
Рубрики: ТРИОСТИН A
СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

ЯМР


Доп.точки доступа:
Feigon, Juli


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI36) 97.02-04А4.535

   

    Solution structures of active and inactive forms of the DP IV (CD26) inhibitor pro-boroPro determined by NMR spectroscopy [Text] / James L. Sudmeier [et al.] // Biochemistry. - 1994. - Vol. 33, N 41. - P12427-12438 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Структура в растворе активной и неактивной форм ингибитора Pro-бороPro DPIV (CD26), установленные спектроскопией ЯМР
Аннотация: Методами обычной и двумерной {1}H-ЯМР спектроскопии при 500 и 600 МГц исследовали конформационные характеристики диастереомеров борной кислоты Pro-L-бороPro и Pro-D-бороPro, один из к-рых, имеющий L-L-конфигурацию, является мощным ингибитором дипептидиламинопептидазы типа IV (DPIV), известный также как CD26. Из анализа спектральных характеристик сигналов {1}H, {13}C и {11}B и теоретических конформационных расчетов по программам LAOCOON 3, PSEUROT 5,4 и CHARMM установлены пространственные структуры указанных диастереомеров. Показано, что при низких значениях pH оба аналога имеют транс-конфигурацию пептидной связи. При нейтральных значениях pH аналоги претерпевают медленную обратимую инактивацию за счет транс-цис-конверсии и образования B-N связи с S-конфигурацией хиральных атомов азота. Возникающие при этом циклические дипептиды получили название цикло(Pro-L-бороPro) и цикло(Pro-D-бороPro). США, Dep. Biochem., Tufts Univ. Sch. Med., Boston, MA 02111. Библ. 60
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.49.33.15.17
Рубрики: ДИПЕПТИДИЛАМИНОПЕПТИДАЗА
ТИП IV

ИНГИБИТОРЫ

КОНФИГУРАЦИЯ

СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

ЯМР


Доп.точки доступа:
Sudmeier, James L.; Gunther, Ulrich L.; Gutheil, William G.; Coutts, Simon J.; Snow, Roger J.; Barton, Randall W.; Bachovchin, William W.


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI34) 97.01-04Т4.152

    Manoleras, Nick.

    Three-dimensional structure in solution of neurotoxin III from the sea anemone Anemonia sulcata [Text] / Nick Manoleras, Raymond S. Norton // Biochemistry. - 1994. - Vol. 33, N 37. - P11051-11061 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Трехмерная структура в растворе нейротоксина III из морской актинии Anemonia sulcata
Аннотация: Методами двумерной {1}H-ЯМР спектроскопии DQF COSY, E. COSY и NOESY при 500 МГц исследовали конформационные особенности нейротоксина III A. sulcata (27 аминокислотных остатков). Полученный набор спектральных характеристик сигналов использовали для установления пространственной структуры м-лы методами дистанционной геометрии и имитационной обработки по программе XPLOR. Полученные данные свидетельствуют, что токсин обладает компактной структурой, содержащей поворотные изгибы типа I (остатки 6-9, 8-11) и 'бета'-изгибы (12-14 и 15-17). Предложена молекулярная модель токсина III. Обсуждаются структурно-функциональные особенности токсинов различных типов из морских актиний. Австралия, NMR Lab., Biomol. Res. Inst., Parkville 3052. Библ. 56
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.47.21.29.13.13.99
Рубрики: ANEMONIA SULCATA
НЕЙРОТОКСИН III

СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

АКТИНИИ


Доп.точки доступа:
Norton, Raymond S.


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.02-04Б2.111

   

    Solution structure of bound trimethoprim in its complex with Lactobacillus casei dihydrofolate reductase [Text] / G. Martorell [et al.] // Biochemistry. - 1994. - Vol. 33, N 41. - P12416-12426 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Структура в растворе связанного триметоприма в его комплексе с дигидрофолатредуктазой Lactobacillus casei
Аннотация: Методами дву- и трехмерной ЯМР спектроскопии исследовали пространственную структуру однородно меченной изотопом {15}N дигидрофолатредуктазы L.casei (ДГФР, 162 аминокислотных остатка) в комплексе (1:1) с обогащенным {13}C и {15}N антибактериальным препаратом триметопримом. Использование серии экспериментов DQF COSY, TOCSY, HMQC, TOCSY-HMQC, NOESY-HMQC и HMQC-NOESY-HMQC при 500 и 600 МГц позволило достигнуть почти полного отнесения протонных сигналов комплекса и идентифицировать окружение лиганда. Для анализа структуры связанного триметоприма использовали методы дистанционной геометрии, минимизации энергии и имитационной обработки по программе XPLOR. Предложенная молекулярная модель связанного триметоприма и его белкового окружения обсуждается в связи с данными РСА для комплекса триметоприма с ДГФР цыпленка и тройного комплекса LГФР L.casei с метотрексатом и NADPH. Великобритания, Lab. Mol. Struct., Natl. Inst. Med. Res., London NW7 1AA. Библ. 60
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: ТРИМЕТОПРИМ
СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

КОМПЛЕКС

ДИГИДРОФОЛАТРЕДУКТАЗА

БАКТЕРИИ


Доп.точки доступа:
Martorell, G.; Gradwell, M.J.; Birdsall, B.; Bauer, C.J.; Frenkiel, T.A.; Cheung, H.T.A.; Polshakov, V.I.; Kuyper, L.; Feeney, J.


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 97.01-04Т2.60

   

    Transient hydrogen bonds identified on the surface of the NMR solution structure of hirudin [Text] / Thomas Szyperski [et al.] // Biochemistry. - 1994. - Vol. 33, N 31. - P9303-9310 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Временные водородные связи, идентифицируемые ЯМР на поверхности структуры гирудина в растворе
Аннотация: Методами двумерной {1}H-ЯМР спектроскопии P.COSY, TOCSY и NOESY при 500 МГц исследовали конформационные особенности десульфатогирудина-1 H.medicinalis (65 аминокислотных остатков) и мутантных форм гирудина E43Q, E35Q, D33N и E17A. Из сравнительного анализа pH-зависимости химических сдвигов сигналов определены значения pK[a] всех 13 карбоксильных групп в м-ле и идентифицированы водородные связи NH протонов Gly25, Ser32, Glu35 и Gys39 соответственно с COO{-} группами Glu43, Glu35, Asp33 и Clu17. Установление пространственной структуры проводили методами дистанционной геометрии по программе DIANA. Обсуждается предложенная молекулярная модель десульфатогирудина-1 в сравнении с установленной ранее для гирудина 1-51 и выявленная система поверхностных водородных связей. Швейцария, Inst. Mol. Biol. Biophys., ETH-Honggerberg, CH-8093 Zurich. Библ. 37
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.45.21.43.09.09
Рубрики: ГИРУДИН
СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

ЯМР


Доп.точки доступа:
Szyperski, Thomas; Antuch, Walfrido; Schick, Martin; Betz, Andreas; Stone, Stuart R.; Wuthrich, Kurt


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI34) 95.08-04Т4.204

   

    Solution structure of the variant-3 neurotoxin from Centruroides sculpturatus Ewing [Text] / Weontae Lee [et al.] // Eur. J. Biochem. - 1994. - Vol. 219, N 1-2. - P89-95 . - ISSN 0014-2956
Перевод заглавия: Структура в растворе нейротоксина вариант-3 из Centruroides sculpturatus Ewing
Аннотация: Методом двумерной (2D) {1}H-ЯМР спектроскопии исследовали конформационные характеристики нейротоксина V-3 скорпиона C.sculpturatus Ewing (65 аминокислотных остатков). Отнесение сигналов проводили с помощью 2D экспериментов DQF COSY, TOCSY и NOESY при 600 МГц. Для анализа пространственной структуры использовали методы дистанционной геометрии и динамической имитационной обработки по программе X-PLOR, учитывающей ограничения, налагаемые на межпротонные расстояния и двугранные углы данными ЯМР. Установлено, что молекула содержит 'альфа'-спиральную структуру 23-31, 'бета'-листовую конформацию 1-5, 45-50 и 36-42 с 'бета'-изгибом 42-45. Обсуждена также цис-пептидная связь Tyr58-Pro 59. Полученные данные обсуждаются совместно с результатами РСА и более ранних исследований др. токсинов скорпиона. США, Dep. Biochem., Univ. Alabama Birmingham, UAB Station, Birmingham, AL-39294. Библ. 49
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.47.21.29.13.15.15
Рубрики: НЕЙРОТОКСИНЫ
СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

КОНФОРМАЦИЯ

ЯМР

CENTRUROIDES SCULPTURATUS EWING


Доп.точки доступа:
Lee, Weontae; Moore, Carolynn; Watt, Dean D.; Krishna, N.Rama


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.08-04Б1.249

   

    Solution structure of RP 71955, a new 21 amino acid tricyclic peptide active against HIV-1 virus [Text] / D. Frechet [et al.] // Biochemistry. - 1994. - Vol. 33, N 1. - P42-50 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Структура в растворе RP71955, нового трициклического пептида из 21 аминокислотного остатка, активного против вируса ВИЧ-1
Аннотация: Методами ЯМР, КД, масс-спектрометрии и аминокислотного анализа исследовали структуру RP71955 Streptomyces. Отнесение сигналов {1}H в спектрах ЯМР проводили сочетанием двумерных экспериментов DQF COSY, HOHAHA и NOESY при 400 и 600 МГц. Анализ полученных спектральных характеристик проводили методами дистанционной геометрии и ограниченной молекулярной динамики по программам COPMA и DIANA. Установлено, что молекула имеет трициклич. структуру с 2 дисульфидными связями, является очень устойчивой к гидролизу и обладает высокой гидрофобностью. Предложена молекулярная модель RP71955 в р-ре, в рамках к-рой обсуждается ее подобие с нек-рыми функциональными доменами трансмембранного белка ВИЧ-1 gp41. Франция, Rhone-Poulenc Rorer S. A., 94400 Vitry-Sur-Seine. Библ. 34
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.17.07
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
АНТИВИРУСНЫЕ ВЕЩЕСТВА

ПЕПТИД RP71955

ТРИЦИКЛИЧЕСКИЙ

СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

ЯМР

КД

МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ


Доп.точки доступа:
Frechet, D.; Guitton, J.D.; Herman, F.; Faucher, D.; Helynck, G.; Monegier, du Sorbier B.; Ridoux, J.P.; James-Surcouf, E.; Vuilhorgne, M.


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 95.03-04К1.113

    Morton, Craig J.

    Solution structure of synthetic peptides corresponding to the C-terminal helix of interleukin-6 [Text] / Craig J. Morton, Richard J. Simpson, Raymond S. Norton // Eur. J. Biochem. - 1994. - Vol. 219, N 1-2. - P97-107 . - ISSN 0014-2956
Перевод заглавия: Структура в растворе синтетических пептидов, соответствующих C-концевой спирали интерлейкина-6
Аннотация: Методами двумерной (2D) {1}H-ЯМР спектроскопии при 500 и 600 МГц исследовали пространственную организацию синтетических пептидов с аминокислотной последовательностью 19 C-концевых остатков интерлейкина-6 человека и мыши. Для отнесения сигналов использовали сочетание 2D экспериментов DQF COSY, TOCSY, ROESY и NOESY в водных р-рах и их смесях с ТФЭ. Из анализа данных с ЯЭО, рН-зависимости хим. сдвигов сигналов и влияния конц-ии ТФЭ на спектральные характеристики сигналов установлено, что в 50% ТФЭ пептид интерлейкина-6 мыши содержит в центральной области 'альфа'-спиральную конформацию из 12 остатков и менее упорядоченные N- и C-концевые сегменты, что хорошо согласуется с результатами исследований интактной молекулы. Для др. пептида обнаружена менее устойчивая спиральная конформация. Австралия, NMR Lab., Biomol. Res. Inst. Parkville 3052. Библ. 70
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.43.37.05
Рубрики: ПЕПТИДЫ
СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

СООТВЕТСТВИЕ

ИНТЕРЛЕЙКИН 6

С-КОНЦЕВАЯ СПИРАЛЬ

ЯМР


Доп.точки доступа:
Simpson, Richard J.; Norton, Raymond S.


12.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 95.12-04Н1.101

   

    Solution structure of an R-styrene oxide adduct in an oligonucleotide containing the codon 12 sequence of the N-RAS protooncogene [Text] : program and Abstr. 38th Annu. Meet., New Orleans, La, March 6-10, 1994 / I. S. Zegar [et al.] // Biophys. J. - 1994. - Vol. 66, N 2. - P186 . - ISSN 0006-3495
Перевод заглавия: Структура в растворе олигонуклеотидного аддукта окиси R-стирена, содержащего последовательность кодона 12 протоонкогена N-ras
Аннотация: Двунитевой дезоксиолигонуклеотид GGCTGXTGGTG (X - аддукт окиси R-стирена на атоме N2 гуанина), анализировали методом ЯМР. Модификации кодона 12 N-ras приводят к активации онкогена. Молекула стирена при образовании аддукта располагается в малом желобке спирали, стиреновое кольцо направлено в 3'-сторону от сайта аддукта. Оценены предельные расстояния в аддукте, к-рые затем ввели в уравнение свободной энергии ассоциата в кач-ве параметров потенциала. Построена матрица взаимных контактов. Планируют сравнить структурные нарушения, вызванные R- и S-изомерами окиси стирена, а также аддуктами G[5] и G[6]. США, Dep. Chem., Ctr Mol. Toxicology, Vanderbilt Univ., Nashville, TN 37235
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.29.49.02.21
Рубрики: ПРОТООНКОГЕНЫ
ГЕН N-RAS

КОДОН 12

ОКСИД R-СТИРЕНА

АДДУКТЫ

СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ


Доп.точки доступа:
Zegar, I.S.; DeCorte, B.; Harris, C.M.; Harris, M.; Stone, m.P.


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 97.03-04М1.33

    Maurer, Till.

    Solution structure of seminal plasmin in the presence of micelles [Text] / Till Maurer, Heinz Ruterjans // Eur. J. Biochem. - 1994. - Vol. 220, N 1. - P111-116 . - ISSN 0014-2956
Перевод заглавия: Структура в растворе семенного плазмина в присутствии мицелл
Аннотация: Методами {1}H-ЯМР и КД исследовали пространственную структуру плазмина быка (47 аминокислотных остатков) в водном р-ре. Из анализа двумерных спектров COSY, TOCSY, ROESY и NOESY установлено, что в водном р-ре молекула не обладает упорядоченной конформацией, а в присутствии мицелл додецилфосфохолина белок образует 'альфа'-спиральные сегменты (остатки 21-27, 31-34 и 35-47), что хорошо согласуется с данными КД. Остатки 1-18 обладают неупорядоченной структурой, что подтверждается ЯМР экспериментами фото-CIDNP. Предполагается, что C-концевая область плазмина может быть ответственна за связывание с мембраной. Германия, Inst. Biophys. Chem., Biozentrum J. W. Goethe - Univ., Frankfurt Main, N 230, D-60439 Frankfurt. Библ. 13
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.21.15.11.21
Рубрики: ПЛАЗМИН
СЕМЕННАЯ ПЛАЗМА

СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

КД

ЯМР


Доп.точки доступа:
Ruterjans, Heinz


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI36) 98.10-04А4.443

   

    High-resolution structure of the oligomerization domain of p53 by multidimensional NMR [Text] / G.Marius Clore [et al.] // Science. - 1994. - Vol. 265, N 5170. - P386-391 . - ISSN 0036-8075
Перевод заглавия: Структура высокого разрешения домена олигомеризации p53, определенная многомерным ЯМР
Аннотация: Представлены результаты конформационных исследований методами многомерной гетероядерной ЯМР спектроскопии домена олигомеризации p53 (остатки 319-360). Установлено, что домен образует в растворе симметричный тетрамер из двух первичных димеров, каждый из которых содержит два антипараллельных 'альфа'-спиральных сегмента, связанных антипараллельной структурой 'бета'-листка. Каждая мономерная субъединица содержит 'бета'-изгибы (остатки 324-325 и 335-336), 'бета'-структурный сегмент 326-334 и 'альфа'-спиральную область 337-355. На основе полученных данных предложена молекулярная модель тетрамера домена p53, которая обсуждается в связи с механизмами его биологической активности. США, Lab. Chem. Phys., NIDDKD, NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 25
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.49.33.15.17
Рубрики: БЕЛОК P53
ДОМЕН ОЛИГОМЕРИЗАЦИИ

СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

ЯМР СПЕКТРОСКОПИЯ


Доп.точки доступа:
Clore, G.Marius; Omichinski, James G.; Sakaguchi, Kazuyasu; Zambrano, Nicola; Sakamoto, Hiroshi; Appella, Ettore; Gronenborn, Angela M.


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 97.12-04К1.190

   

    Solution structure determination of human interleukin 6 by heteronuclear multidimentional NMR [Text] : abstr. Keystone Symp. Front. NMR Mol. Biol.-IV, Keystone, Colo, Apr. 3-9, 1995 / Guang-Yi Xu [et al.] // J. Cell. Biochem. - 1995. - Sappl 21b. - P52 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Определение структуры в растворе интерлейкина-6 человека гетероядерным многомерным ЯМР
Аннотация: Методами многомерной ЯМР спектроскопии проведено отнесение сигналов {1}H, {13}C и {15}N однородно меченного {15}N и {15}N/{13}C интерлейкина-6 человека. На основе спектральных характеристик сигналов и данных о пространственной структуре родственных цитокинов предложена модель пространственного строения интерлейкина-6, главной особенностью которой является наличие 4-х спирального пучка, характерного для указанного класса белков. США, Small Mol. Drug Discavery, Gen. Inst. Inc., Cambridge, MA 02140
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.43.37.05
Рубрики: ИНТЕРЛЕЙКИН-6
МЕЧЕННЫЙ ИЗОТОПАМИ БЕЛОК

СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

ГЕТЕРОЯДЕРНАЯ ЯМР СПЕКТРОСКОПИЯ

МОЛЕКУЛЯРНАЯ МОДЕЛЬ

ЧЕЛОВЕК


Доп.точки доступа:
Xu, Guang-Yi; Stahl, Mark; Hong, Jin; McDonagh, Thomas; Seehra, Jasbir; Cumming, Dale


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI36) 98.01-04А4.382

    McKnight, C. James

    NMR structure of a highly thermostable subdomain within villin headpiece [Text] : abstr. Keystone Symp. Front. NMR Mol. Biol.-IV, Keystone, Colo, Apr. 3-9, 1995 / C.James McKnight, Paul T. Matsudaira, Peter S. Kim // J. Cell. Biochem. - 1995. - Sappl 21b. - P49 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Структура высокотермостабильного субдомена внутри головки виллина, установленная методом ЯМР
Аннотация: Методом многоядерного ЯМР исследовали структуру в растворе 35-остаточного субдомена виллина. Анализ полученных спектральных характеристик показал, что молекула содержит 3 коротких спиральных сегмента, образующих гидрофобное ядро. Субдомен не содержит дисульфидных связей, не образует агрегатов и имеет высокую термостабильность со средней точкой 70'ГРАДУС'C при pH 7,0. США, H. Hughes Med. Inst., Cambridge, MA 02142
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.49.33.15.17
Рубрики: ВИЛЛИН
ГОЛОВКА

ТЕРМОСТАБИЛЬНЫЙ СУБДОМЕН

СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

МНОГОЯДЕРНАЯ ЯМР СПЕКТРОСКОПИЯ


Доп.точки доступа:
Matsudaira, Paul T.; Kim, Peter S.


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 98.04-04В2.132

   

    Three-dimensional solution structure of the cyanide adduct of a Met80Ala variant of Saccharomyces cerevisiae iso-1-cytochrome c. Identification of lignad - residue interactions in the distal heme cavity [Text] / Lucia Banci [et al.] // Biochemistry. - 1995. - Vol. 34, N 36. - P11385-11398 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Трехмерная структура в растворе цианидного аддукта варианта Met80Ala изо-1-цитохрома c Saccharomyces cerevisiae. Идентификация взаимодействий лиганд-остаток в дистальной гемовой полости
Аннотация: Методами обычной и двумерной {1}H-ЯМР спектроскопии COSY, TOCSY и NOESY исследовали пространственную структуру цианидного аддукта тройного мутанта изо-1-цитохрома c His39Gln/Met80Ala/Cys102Ser в окисленном состоянии. Структурный анализ проводили методами дистанционной геометрии, ограниченной молекулярной динамики и минимизации энергии по программам DIANA, CALIBA, CARNAL. Установлено, что м-ла содержит 'альфа'-спиральные сегменты (остатки 4-15, 50-55, 61-68, 70-75 и 89-103). Полученные данные свидетельствуют, что обнаруженные элементы вторичной структуры и общая укладка мутантного белка полностью соответствуют установленным ранее для белка дикого типа методом РСА. Отмечается, что замена Met80'-'Ala создает в дистальной области обширную полость, а остаток Tyr67 образует водородную связь с цианидной группой. Италия, Dep. Chem., Univ. Florence, 50121 Florence. Библ. 83
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.29.15.17.17
Рубрики: ЦИТОХРОМ C
ИЗО-1-ЦИТОХРОМ C

МУТАНТНАЯ ФОРМА

ЦИАНИДНЫЙ АДДУКТ

СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

ЯМР СПЕКТРОСКОПИЯ

SACCHAROMYCES CEREVISIAE


Доп.точки доступа:
Banci, Lucia; Bertini, Ivano; Bren, Kara L.; Gray, Harry B.; Sompornpisut, Pornthep; Turano, Paola


18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI34) 98.07-04Т4.162

   

    Solution structure of 'омега'-conotoxin MVIIA using 2D NMR spectroscopy [Text] / Vladimir J. Basus [et al.] // FEBS Lett. - 1995. - Vol. 370, N 3. - P163-169 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Определение структуры в растворе 'омега'-конотоксина MVIIA с использованием 2D ЯМР-спектроскопии
Аннотация: Методами двумерной (2D) {1}H-ЯМР спектроскопии DQF COSY, HOHAHA и NOESY при 500 МГц достигнуто полное отнесение сигналов 'омега'-конотоксина MVIIA Conus magus (25 аминокислотных остатков). Анализ пространственной структуры проводили на основе полученных спектральных характеристик методами дистанционной геометрии и ограниченной молекулярной динамики по программам VEMBED и GROMOS-87. Установлено, что молекула содержит короткую 'бета'-листовую структуру (остатки 6-8, 20-21 и 24-25). Предложена молекулярная модель 'омега'-конотоксина MVIIA, которая имеет высокое подобие с ранее установленной для родственного 'омега'-конотоксина GVIA. США, Dep. Pharm. Chem., Univ. California, San Francisco, CA 94143. Библ. 46
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.47.21.29.13.13.99
Рубрики: 'ОМЕГА'-КОНОТОКСИН MVIIA
СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

МОЛЕКУЛЯРНАЯ МОДЕЛЬ

ЯМР СПЕКТРОСКОПИЯ

CONUS MAGUS


Доп.точки доступа:
Basus, Vladimir J.; Nadasdi, Laszlo; Ramachandran, J.; Miljanich, George P.


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.02-04Б1.190

   

    Solution structure of BMY-29303 (siamycin II), a peptide that inhibits HIV [Text] : abstr. Keystone Symp. Front. NMR Mol. Biol.-IV, Keystone, Colo, Apr. 3-9, 1995 / Keith L. Constantine [et al.] // J. Cell. Biochem. - 1995. - Sappl 21b. - P44 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Структура в растворе BMY-29303 (сиамицина II), пептида, который ингибирует ВИЧ
Аннотация: Методами {1}H-ЯМР спектроскопии исследовали пространственную структуру пептидов BMY-29303 и BMY-29304 (21 аминокислотный остаток) Streptomyces, различающихся остатками Val и Ile в положении 4. Анализ пространственной структуры проводили на основе данных о ЯЭО и значении КССВ методами дистанционной геометрии. Предложена молекулярная модель структуры пептидов, к-рая обсуждается в связи с механизмами их биологической (ВИЧ-1 ингибирующей) активности. США, Bristol-Myers Squibb Pharm. Res. Inst., Princeton, NJ 08543
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.17
Рубрики: СИАМИЦИН II
ВИЧ-1-ИНГИБИРУЮЩИЙ ПЕПТИД

АНАЛОГ

СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

ЯМР СПЕКТРОСКОПИЯ

МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Constantine, Keith L.; Friedrichs, Mark S.; Detlefsen, David; Nishio, Maki; Tsunakawa, Mitsuaki; Ohkuma, Hiroaki; Oki, Toshikazu; Hill, Susan; Bruccolen, Robert E.; Lin, Pin-Fang; Furumai, Tamotsu; Mueller, Luciano


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI36) 98.01-04А4.383

   

    Demonstration of positionally disordered water within a protein hydrophobic cavity by NMR [Text] : abstr. Keystone Symp. Front. NMR Mol. Biol.-IV, Keystone, Colo, Apr. 3-9, 1995 / James A. Ernst [et al.] // J. Cell. Biochem. - 1995. - Sappl 21b. - P71 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Демонстрация позиционно разупорядоченной воды внутри гидрофобной полости белка методом ЯМР
Аннотация: Показано, что метод ЯМР позволяет легко идентифицировать наличие молекул воды, позиционно разупорядоченных в гидрофобных областях белковых структур. Времена жизни таких молекул лежат в интервале 1-2 нс - 100-200 мкс. На примере исследований интерлейкина-1'бета' человека в растворе показано, что разупорядоченность молекул воды в гидрофобных областях белка не позволяет проводить их идентификацию методом РСА. Обсуждены факторы, влияющие на стабилизацию молекул воды внутри гидрофобных областей белков. США, NIH, Bethesda, MD 20892
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.49.33.15.17
Рубрики: ИНТЕРЛЕЙКИН-1'БЕТА'
СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ

ГИДРОФОБНЫЕ ОБЛАСТИ

РАЗУПОРЯДОЧЕННЫЕ МОЛЕКУЛЫ ВОДЫ

ЯМР СПЕКТРОСКОПИЯ

ЧЕЛОВЕК


Доп.точки доступа:
Ernst, James A.; Clubb, Robert T.; Zhou, Huan-Xiang; Gronenbom, Angela M.; Clore, G.Marius


 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)