СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Herdman, Michael$<.>)

Общее количество найденных документов : 19
Показаны документы с 1 по 19

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.02-04Б2.015

Herdman, Michael.
The 16S rRNA data base of the Pasteur culture collection [Text] / Michael Herdman, de Marsac Nicole Tandeau // 8th Int. Symp. Phototrophic Prokaryotes, Urbino, Sept. 10-15, 1994. - S. l., 1995. - P57
Перевод заглавия: База данных 16S рРНК Пастеровской коллекции культур
Аннотация: Впервые одновременно проанализированы полученные от разных исследователей данные о последовательности 16S рРНК 60 штаммов цианобактерий (Ц). На основании результатов филогенетического анализа авт. приходят к следующим заключениям: 1) Исследованные Ц генетически очень близки, эволюционные расстояния между различными родами Ц часто соответствуют эволюционым расстояниям между видами бактерий, принадлежащих одному роду, например, разными видами р. Rhodospirillum. 2) Только Ц, образующие гетероцисты, Ц, размножающиеся с помощью баеоцитов, а также представители р. Pseudoanabaena образуют когерентные кластеры; остальные кластеры, образуемые Ц, некогерентны. 3) Штаммы нитчатых Ц Leptolyngbya PCC 7375 и РСС 7376, известные ранее под названием Phormidium ectocarpi и Ph. fragile, генетически далеки друг от друга и более тесно связаны филогенетически с одноклеточными Ц группы Synechococcus (РСС 7335 и РСС 7002, соотв.), чем друг с другом. Следовательно, при классификации Ц морфологич. критерий не всегда является удовлетворительным, некоторые одноклеточные виды могли произойти от нитчатых и наоборот. 4) В основании построенного эволюционного дрена Ц находятся нитчатые безгетероцистные Ц, деление клеток у к-рых происходит без инвагинации внутриклеточных мембран. Клетки их не могут расходиться, и разрыв трихомов происходит только в результате гибели отдельных клеток. Такой же тип деления обнаружен у предполагаемого предшественника Ц, нефотосинтезирующей нитчатой бактерии Herpetosiphon aurantiacus и, видимо, может рассматриваться как древний признак. Франция, Physiologie Microbienne, Inst. Pasteur, 75724 Paris Cedex 15.

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.09
Рубрики: ЦИАНОБАКТЕРИИ
КОЛЛЕКЦИЯ КУЛЬТУР
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
16S РРНК
БАЗА ДАННЫХ
ФИЛОГЕНИЯ
ЭВОЛЮЦИЯ

Доп.точки доступа:
Tandeau, de Marsac Nicole

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.04-04Б2.005

The pasteur culture collection of cyanobacteria (РСС) [Text] / Rosmarie Rippka [et al.] // 8th Int. Symp. Phototrophic Prokaryotes, Urbino, Sept. 10-15, 1994. - S. l., 1994. - P98
Перевод заглавия: Коллекция культур цианобактерий пастеровского института (РСС)
Аннотация: Коллекция культур Института Пастера в Париже насчитывает сегодня около 550 аксеничных штаммов цианобактерий. Отмечены штаммы, наиболее интересные для будущих научных исследований. К ним относятся: 1) представители Microcystis aeruginosa, Nodularia spumigena и Anabaena flos-aquae, продуцирующие гепатотоксины или нейротоксины; 2) новые штаммы с подробно изученными морфологическими и генетическими особенностями (16spРНК, ДНК-гибридизация и т. д.); 3) полученные из др. коллекций штаммы, относящиеся к таксонам, к-рых не было раньше в коллекции Пастеровского института; Crinalium episommum, Arthronema africanum, Hormoscilla pringsheimii, Hapalosiphon welwitschii, Gloeotrichia ghosei. Однако для подтверждения таксономического положения этих микроорганизмов необходимы дальнейшие морфологические и генетические исследования. С другой стороны, в коллекции имеются новые изоляты, идентифицированные как Chroococcum, Cyanothece, Anabaenopsis, Cylindrospermum, Nodularia, Tolypothrix, Chlorogloeopsis и Fischerella. Франция, Physiol. Microbienne, Inst. Pasteur, 75724 Paris Cedex 15.

ГРНТИ	34.27.05

ВИНИТИ 341.27.05.13
Рубрики: ЦИАНОБАКТЕРИИ
КОЛЛЕКЦИИ МИКРООРГАНИЗМОВ
ИНСТИТУТЫ
ПАСТЕРОВСКИЙ ИНСТИТУТ
ФРАНЦИЯ

Доп.точки доступа:
Rippka, Rosmarie; Coursin, Therese; Herdman, Michael; Tandeau, de Marsac Nicole

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.10-04Б2.168

Prochlorococcus sp. PCC 9511, an axenic, marine, chlorophyll b-containing oxyphotobacterium [Text] / Rosmarie Rippka [et al.] // 9th Int. Symp. Phototroph. Prokaryotes, Vienna, Sept. 6-12, 1997. - [Vienna], 1997. - P189
Перевод заглавия: Prochlorococcus sp. PCC 9511, аксеничная морская оксифотобактерия, содержащая хлорофилл b
Аннотация: Представители p. Prochlorococcus - мелкие (0,6-0,8 мкм) одноклеточные бактерии, многочисленные в фотической зоне олиготрофного океана. Они отличаются от цианобактерий отсутствием (или низким уровнем) фикобилинов и наличием дивинил-хлорофиллов a и b в качестве основных светособирающих пигментов. Обнаружено также небольшое кол-во хлорофилла c-подобного пигмента и альфа-каротина. Штамм Prochlorococcus PCC 5911, выделенный из Саргассова моря, получен в аксеничном состоянии методом последовательных разведений. Обнаружено, что он имеет самое низкое содержание ГЦ в ДНК (32 мол. %) и самый маленький геном (1,3 гД) среди оксифотобактерий. Франция, Physiologie Microbienne (CNRS URA 1129), Inst. Pasteur, F-75724 Paris Cedex 15

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: PROCHLOROCOCCUS (BACT.)
ШТАММ PCC 9511
ХАРАКТЕРИСТИКА
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
САРГАССОВО МОРЕ

Доп.точки доступа:
Rippka, Rosmarie; Coursin, Therese; Lichtle, Christiane; Partensky, Frederic; Houmard, Jean; Herdman, Michael

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 00.10-04Б3.248

Prochlorococcus sp. PCC 9511, an axenic, marine, chlorophyll b-containing oxyphotobacterium [Text] / Rosmarie Rippka [et al.] // 9th Int. Symp. Phototroph. Prokaryotes, Vienna, Sept. 6-12, 1997. - [Vienna], 1997. - P189
Перевод заглавия: Prochlorococcus sp. PCC 9511, аксеничная морская оксифотобактерия, содержащая хлорофилл b
Аннотация: Представители p. Prochlorococcus - мелкие (0,6-0,8 мкм) одноклеточные бактерии, многочисленные в фотической зоне олиготрофного океана. Они отличаются от цианобактерий отсутствием (или низким уровнем) фикобилинов и наличием дивинил-хлорофиллов a и b в качестве основных светособирающих пигментов. Обнаружено также небольшое кол-во хлорофилла c-подобного пигмента и альфа-каротина. Штамм Prochlorococcus PCC 5911, выделенный из Саргассова моря, получен в аксеничном состоянии методом последовательных разведений. Обнаружено, что он имеет самое низкое содержание ГЦ в ДНК (32 мол. %) и самый маленький геном (1,3 гД) среди оксифотобактерий. Франция, Physiologie Microbienne (CNRS URA 1129), Inst. Pasteur, F-75724 Paris Cedex 15

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.17.02
Рубрики: PROCHLOROCOCCUS (BACT.)
ШТАММ PCC 9511
ХАРАКТЕРИСТИКА
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
САРГАССОВО МОРЕ

Доп.точки доступа:
Rippka, Rosmarie; Coursin, Therese; Lichtle, Christiane; Partensky, Frederic; Houmard, Jean; Herdman, Michael

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.04-04Б2.110

Molecular typing of cyanobacterial isolates in the PCC [Text] / Isabelle Iteman [et al.] // 10th Int. Symp. Phototroph. Prokaryotes, Barcelona, Aug. 26-31, 2000: ISPP 2000. - Barcelona, 2000. - P161
Перевод заглавия: Молекулярное типирование изолятов цианобактерий в PCG
Аннотация: Авторы амплифицировали внутренний транскрибируемый спейсер (ITS) рибосомного оперона у 320 изолятов цианобактерий, представляющих около 45 различных родов. Показали крайнюю вариабельность размеров ампликонов ITS и установили определенные корреляции между этими размерами и другими свойствами штаммов. Поскольку исследуемые штаммы не всегда можно было дискриминировать на основании полиморфизма ITS, ПЦР-продукты многих штаммов были исследованы методом анализа полиморфизма длины фрагментов рестрикции (RFLP). Показали, что этот метод важен для узнавания близко или отдаленно родственных цианобактерий

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: СПЕЙСЕРЫ
РИБОСОМНЫЕ ОПЕРОНЫ
ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ
ДЛИНА
КОРРЕЛЯЦИЯ
СВОЙСТВА ШТАММОВ
ЦИАНОБАКТЕРИИ
ИЗОЛЯТЫ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ ТИПИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Iteman, Isabelle; Romari, Khadidja; Filee, Jonathan; Via-Orderika, Lorena; Rippka, Rosmarie; Tandeau, de Marsac Nicole; Herdman, Michael

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.10-04Б2.332

Use of molecular tools for the study of genetic relationships of heterocystous cyanobacteria [Text] / Isabelle Iteman [et al.] // Bull. Inst. oceanogr., Monaco. - 1999. - Num. spec. 19. - P13-20 . - ISSN 0304-5722
Перевод заглавия: Использование молекулярных орудий для изучения генетических взаимоотношений образующих гетероцисты цианобактерий
Аннотация: 11 штаммов образующих гетероцисты цианобактерий изучены методами ПЦР-амплификации и секвенирования гена рРНК 16S и внутренних транскрибируемых спейсеров ITS и полиморфизма длины рестрикционных фрагментов. Эти планктонные цианобактерии образуют монофилетическую ветвь с 3 подгруппами: 1) Anabaena и Anarhanizomenon; 2) Anabaenopsis и Cyanospira; 3) Nodularia. Франция, Physiol. Microbienne, Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 23

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.23
Рубрики: ЦИАНОБАКТЕРИИ
ОБРАЗУЮЩИЕ ГЕТЕРОЦИСТЫ
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ВЗАИМООТНОШЕНИЯ
ANABAENA
ANARHANIROMENON
ANABAENOPSIS
CYANOSPIRA
NODULARIA
ПЦР-АМПЛИФИКАЦИЯ
ГЕНЫ РРНК 16S
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
СПЕЙСЕРЫ ITS
ПОЛИМОРФИЗМ ДЛИНЫ РЕСТРИКЦИОННЫХ ФРАГМЕНТОВ

Доп.точки доступа:
Iteman, Isabelle; Rippka, Rosmarie; Tandeau, de Marsac Nicole; Herdman, Michael

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.01-04Б2.25

In situ identification of unicellular cyanobacteria by hybridisation targeting the 16S rRNA [Text] / Wilhelm Schonhuber [et al.] // 10th Int. Symp. Phototroph. Prokaryotes, Barcelona, Aug. 26-31, 2000: ISPP 2000. - Barcelona, 2000. - P128
Перевод заглавия: Идентификация in situ одноклеточных цианобактерий методом гибридизации 16S рРНК
Аннотация: Приводятся результаты применения in situ гибридизации 16S рРНК для распознавания одноклеточных цианобактерий. Олигонуклеотидные зонды 16S рРНК, специфичные для разных родов цианобактерий были проверены на штаммах коллекции культур Института Пастера (PCC) с известной последовательностью 16S рРНК. Обсуждаются возможности молекулярной идентификации и перспективы ее применения в экологических исследованиях. Франция, CNRS URA 2172, Inst. Pasteur, 75724, Paris Cedex 15

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: ЦИАНОБАКТЕРИИ
ОДНОКЛЕТОЧНЫЕ ЦИАНОБАКТЕРИИ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ГИБРИДИЗАЦИЯ
16S РРНК

Доп.точки доступа:
Schonhuber, Wilhelm; Rippka, Rosmarie; Tandeau, de Marsac Nicole; Amann, Rudolf; Herdman, Michael

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 02.01-04Б3.33

In situ identification of unicellular cyanobacteria by hybridisation targeting the 16S rRNA [Text] / Wilhelm Schonhuber [et al.] // 10th Int. Symp. Phototroph. Prokaryotes, Barcelona, Aug. 26-31, 2000: ISPP 2000. - Barcelona, 2000. - P128
Перевод заглавия: Идентификация in situ одноклеточных цианобактерий методом гибридизации 16S рРНК
Аннотация: Приводятся результаты применения in situ гибридизации 16S рРНК для распознавания одноклеточных цианобактерий. Олигонуклеотидные зонды 16S рРНК, специфичные для разных родов цианобактерий были проверены на штаммах коллекции культур Института Пастера (PCC) с известной последовательностью 16S рРНК. Обсуждаются возможности молекулярной идентификации и перспективы ее применения в экологических исследованиях. Франция, CNRS URA 2172, Inst. Pasteur, 75724, Paris Cedex 15

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.07.09
Рубрики: ЦИАНОБАКТЕРИИ
ОДНОКЛЕТОЧНЫЕ ЦИАНОБАКТЕРИИ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ГИБРИДИЗАЦИЯ
16S РРНК

Доп.точки доступа:
Schonhuber, Wilhelm; Rippka, Rosmarie; Tandeau, de Marsac Nicole; Amann, Rudolf; Herdman, Michael

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.03-04Б2.173

Comparison of conserved structural and regulatory domains within divergent 16S rRNA-23S rRNA spacer sequences of cyanobacteria [Text] / Isabelle Iteman [et al.] // Microbiology. - 2000. - Vol. 146, N 6. - P1275-1286 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Сравнение консервативных структурных и регуляторных доменов в дивергентных спейсерных последовательностях рРНК 16S-рРНК 23S цианобактерий
Аннотация: При ПЦР-амплификации внутреннего транскрибируемого спейсера ITS между генами рРНК 16S и 23S у цианобактерии Nostoc PCC 7120 образуются 3 продукта, 2 из к-рых представляют истинные области ITS разных размеров, а третий является их гетеродуплексом. Более длинный спейсер ITS-L имеет длину 512 н. и содержит гены тРНК{иле} и тРНК{ала}, разделенные большой шпилечной структурой V2, к-рая состоит из коротких тандемных повторов. Короткий спейсер ITS-S почти идентичен длинному, но не содержит обоих генов тРНК и 5'-половины петли V2. Спейсеры Nostoc PCC 7120 сравнили с последовательностями ITS цианобактерий, цианелл Cyanophora paradoxa и Escherichia coli. Области ITS цианобактерий имеют длину 283-545 н. и могут содержать гены тРНК{иле} и тРНК{вал} либо только тРНК{иле} или не содержат обоих генов. Однако корреляция между размером ITS и способностью кодировать тРНК отсутствует. Сравнение предсказанных вторичных структур транскриптов оперонов rrn нескольких цианобактерий и E. coli позволило идентифицировать высококонсервативные мотивы для сворачивания и созревания и область, похожую на бактериальные антитерминаторы boxA и boxB. Консервативные и вариабельные области ITS цианобактерий могут быть использованы в кач-ве праймеров для ПЦР и олигонуклеотидных зондов для обнаружения и идентификации цианобактерий. Франция, Dep. Biochem. et Genet. Mol., Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 51

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ РРНК RRN
СПЕЙСОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ITS
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ДОМЕНЫ
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
ХАРАКТЕРИСТИКА
NOSTOC (BACT.)
ЦИАНОБАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Iteman, Isabelle; Rippka, Rosmarie; Tandeau, de Marsac Nicole; Herdman, Michael

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 02.07-04В2.59

Comparison of conserved structural and regulatory domains within divergent 16S rRNA-23S rRNA spacer sequences of cyanobacteria [Text] / Isabelle Iteman [et al.] // Microbiology. - 2000. - Vol. 146, N 6. - P1275-1286 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Сравнение консервативных структурных и регуляторных доменов в дивергентных спейсерных последовательностях рРНК 16S-рРНК 23S цианобактерий
Аннотация: При ПЦР-амплификации внутреннего транскрибируемого спейсера ITS между генами рРНК 16S и 23S у цианобактерии Nostoc PCC 7120 образуются 3 продукта, 2 из к-рых представляют истинные области ITS разных размеров, а третий является их гетеродуплексом. Более длинный спейсер ITS-L имеет длину 512 н. и содержит гены тРНК{иле} и тРНК{ала}, разделенные большой шпилечной структурой V2, к-рая состоит из коротких тандемных повторов. Короткий спейсер ITS-S почти идентичен длинному, но не содержит обоих генов тРНК и 5'-половины петли V2. Спейсеры Nostoc PCC 7120 сравнили с последовательностями ITS цианобактерий, цианелл Cyanophora paradoxa и Escherichia coli. Области ITS цианобактерий имеют длину 283-545 н. и могут содержать гены тРНК{иле} и тРНК{вал} либо только тРНК{иле} или не содержат обоих генов. Однако корреляция между размером ITS и способностью кодировать тРНК отсутствует. Сравнение предсказанных вторичных структур транскриптов оперонов rrn нескольких цианобактерий и E. coli позволило идентифицировать высококонсервативные мотивы для сворачивания и созревания и область, похожую на бактериальные антитерминаторы boxA и boxB. Консервативные и вариабельные области ITS цианобактерий могут быть использованы в кач-ве праймеров для ПЦР и олигонуклеотидных зондов для обнаружения и идентификации цианобактерий. Франция, Dep. Biochem. et Genet. Mol., Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 51

ГРНТИ	34.29.15

ВИНИТИ 341.29.15.15.19
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ РРНК RRN
СПЕЙСОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ITS
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ДОМЕНЫ
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
ХАРАКТЕРИСТИКА
NOSTOC (BACT.)
ЦИАНОБАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Iteman, Isabelle; Rippka, Rosmarie; Tandeau, de Marsac Nicole; Herdman, Michael

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 02.08-04Б3.107

Morphological and biochemical characterization of the exocellular investments of polysaccharide-producing Nostoc strains from the Pasteur Culture Collection [Text] / Philippis Roberto De [et al.] // World J. Microbiol. and Biotechnol. - 2000. - Vol. 16, N 7. - P655-661 . - ISSN 0959-3993
Перевод заглавия: Морфологические и биохимические характеристики внеклеточного вклада полисахарид-продуцирующих штаммов Nostoc из Pasteur Коллекции культур

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.21
Рубрики: NOSTOC (BACT.)
КОЛЛЕКЦИЯ КУЛЬТУР ИНСТИТУТА ПАСТЕРА
МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ
БИОХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
ПОЛИСАХАРИДЫ
ВНЕКЛЕТОЧНЫЕ ПОЛИСАХАРИДЫ
ПРОДУКЦИЯ

Доп.точки доступа:
De, Philippis Roberto; Faraloni, Cecilia; Margheri, Maria C.; Sili, Claudio; Herdman, Michael; Vincenzini, Massimo

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 02.08-04В2.86

Morphological and biochemical characterization of the exocellular investments of polysaccharide-producing Nostoc strains from the Pasteur Culture Collection [Text] / Philippis Roberto De [et al.] // World J. Microbiol. and Biotechnol. - 2000. - Vol. 16, N 7. - P655-661 . - ISSN 0959-3993
Перевод заглавия: Морфологические и биохимические характеристики внеклеточного вклада полисахарид-продуцирующих штаммов Nostoc из Pasteur Коллекции культур

ГРНТИ	34.29.15

ВИНИТИ 341.29.15.15.19
Рубрики: NOSTOC (BACT.)
КОЛЛЕКЦИЯ КУЛЬТУР ИНСТИТУТА ПАСТЕРА
МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ
БИОХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
ПОЛИСАХАРИДЫ
ВНЕКЛЕТОЧНЫЕ ПОЛИСАХАРИДЫ
ПРОДУКЦИЯ

Доп.точки доступа:
De, Philippis Roberto; Faraloni, Cecilia; Margheri, Maria C.; Sili, Claudio; Herdman, Michael; Vincenzini, Massimo

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 02.11-04В2.38

In situ identification of unicellular cyanobacteria by hybridisation targeting the 16S rRNA [Text] / Wilhelm Schonhuber [et al.] // 10th Int. Symp. Phototroph. Prokaryotes, Barcelona, Aug. 26-31, 2000: ISPP 2000. - Barcelona, 2000. - P128
Перевод заглавия: Идентификация in situ одноклеточных цианобактерий методом гибридизации 16S рРНК
Аннотация: Приводятся результаты применения in situ гибридизации 16S рРНК для распознавания одноклеточных цианобактерий. Олигонуклеотидные зонды 16S рРНК, специфичные для разных родов цианобактерий были проверены на штаммах коллекции культур Института Пастера (PCC) с известной последовательностью 16S рРНК. Обсуждаются возможности молекулярной идентификации и перспективы ее применения в экологических исследованиях. Франция, CNRS URA 2172, Inst. Pasteur, 75724, Paris Cedex 15

ГРНТИ	34.29.15

ВИНИТИ 341.29.15.15.05
Рубрики: ЦИАНОБАКТЕРИИ
ОДНОКЛЕТОЧНЫЕ ЦИАНОБАКТЕРИИ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ГИБРИДИЗАЦИЯ
16S РРНК

Доп.точки доступа:
Schonhuber, Wilhelm; Rippka, Rosmarie; Tandeau, de Marsac Nicole; Amann, Rudolf; Herdman, Michael

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.04-04Б2.163

Genotyping of axenic and non-axenic isolates of the genus Prochlorococcus and the OMF-"Synechococcus" clade by size, sequence analysis or RFLP of the internal Transcribed Spacer of the ribosomal operon [Text] / Wassila Laloui [et al.] // Microbiology. - 2002. - Vol. 148, N 2. - P453-465 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Генотипирование чистых и смешанных изолятов рода Prochlorococcus и клайда OMF-"Synechococcus" по размеру, анализу последовательности или RFLP внутреннего транскрибируемого спейсера рибосомного оперона
Аннотация: ПЦР ампликоны внутреннего транскрибируемого спейсера оперонов rrn трех однородных штаммов `Synechococcus' (WH7803, PCC 7001 и PCC 6307) заметно отличаются по длине от такового у Prochlorococcus marinus sub. sp. pastoris PCC 9511, хотя эти 4 цианобактерии образуют компактный кластер на филогенетическом древе 16S рРНК. Несмотря на большие различия в длине, последовательность и средний состав оснований ДНК, консервативные домены, важные для транскрипционной антитерминации и сворачивания транскриптов рРНК, были идентичны во всех 4 спейсерах. Сконструирован новый праймер, специфичный для рассматриваемой группы, с котором разрешена амплификация даже в случае смешанных культур, содержащих Prochlorococcus и OMF-`Synechococcus'. Кроме того, показано, что у изолятов Prochlorococcus, из клайда адаптированных к интенсивному освещению форм, длина транскрибируемого спейсера заметно отличается от такового у форм, адаптированных к росту при слабом освещении. Анализ полиморфизма длины фрагментов рестрикции рассматриваемых спейсеров выявил наличие трех субкластеров внутри группы, приспособленной к росту при слабом освещении. Перечисленные методы анализа указанного спейсера являются полезными маркерами для идентификации генотипов Prochlorococcus и выявления этой группы цианобактерий в различных экосистемах. Франция, Unit. Cyanobact., Dep. Biochimie & Gen. Mol., Inst. Pasteur, 28 Rue du Dr Roux, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 52

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОТИПИРОВАНИЕ
РИБОСОМНЫЕ ГЕНЫ
ВНУТРЕННИЙ ТРАНСКРИБИРУЕМЫЙ СПЕЙСЕР
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
СИНЕ-ЗЕЛЕНЫЕ ВОДОРОСЛИ
PROCHLOROCOCCUS (BACT.)
SYNECHOCOCCUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Laloui, Wassila; Palinska, Katarzyna A.; Rippka, Rosmarie; Partensky, Frederic; Tandeau, de Marsac Nicole; Herdman, Michael; Iteman, Isabelle

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.01-04Б2.52

Neurotoxins in axenic oscillatorian cyanobacteria: Coexistence of anatoxin-a and homoanatoxin-a determined by ligand-binding assay and GC/MS [Text] / Romulo Araoz [et al.] // Microbiology. - 2005. - Vol. 151, N 4. - P1263-1273 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Нейротоксины аксенических цианобактерий Oscillatoria: сосуществование анатоксина a и гомоанатоксина a по данным анализа связывания лиганда и газовой хроматографии/масс-спектрометрии
Аннотация: Два нейротоксичных алкалоида - анатоксин a и его гомолог гомоанатоксин a - выделены и очищены из нитчатой цианобактерии Oscillatoria sp. штамм 193 (PCC 9240) и Oscillatoria formosa NIVA CYA-92 (PCC 10111), соответственно, и охарактеризованы масс-спектрометрией. Биологическая активность определена путем проверки способности токсинов полностью ингибировать связывание радиоактивно меченного бунгаротоксина с ацетилхолиновыми рецепторами, с применением фракции постсинаптических мембран электрического органа Torpedo. Ингибирование зависело от конц-ии с K[i] 5,4'+-'1,1*10{-8} M для анатоксина и 7,4'+-'0,9*10{-8} M для гомоанатоксина a. Их высокое сродство к никотиновым холинергическим рецепторам было использовано для разработки радиоиммуноанализа в целях рутинного прямого анализа нейротоксинов этого класса в экстрактах низкомолекулярных в-в цианобактерий. Подтверждение результатов и идентификация токсинов достигалась сопряженным анализом газовой хроматографией/масс-спектрометрией. Обнаружено, что штаммы Oscillatoria PCC6407, 6412 и 9107 синтезируют исключительно анатоксин a, а штаммы PCC 9029 и 6506 - оба токсина, причем у последнего штамма их синтез зависит от условий роста. Франция, Unite Cyanobacteries (CNRS URA 2172) Inst. Pasteur, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 42

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.09.15
Рубрики: ТОКСИНЫ
НЕЙРОТОКСИЧНЫЕ АЛКАЛОИДЫ
АНАТОКСИН A
ГОАНАТОКСИН A
ВЫДЕЛЕНИЕ
ОЧИСТКА
БИОЛОГИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ
OSCILLATORIA (BACT.)
ГАЗОВАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ
МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ

Доп.точки доступа:
Araoz, Romulo; Nghiem, Hoang-Oanh; Rippka, Rosmarie; Palibroda, Nicolae; Tandeau, de Marsac Nicole; Herdman, Michael

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI34) 06.02-04Т4.184

Neurotoxins in axenic oscillatorian cyanobacteria: Coexistence of anatoxin-a and homoanatoxin-a determined by ligand-binding assay and GC/MS [Text] / Romulo Araoz [et al.] // Microbiology. - 2005. - Vol. 151, N 4. - P1263-1273 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Нейротоксины аксенических цианобактерий Oscillatoria: сосуществование анатоксина a и гомоанатоксина a по данным анализа связывания лиганда и газовой хроматографии/масс-спектрометрии
Аннотация: Два нейротоксичных алкалоида - анатоксин a и его гомолог гомоанатоксин a - выделены и очищены из нитчатой цианобактерии Oscillatoria sp. штамм 193 (PCC 9240) и Oscillatoria formosa NIVA CYA-92 (PCC 10111), соответственно, и охарактеризованы масс-спектрометрией. Биологическая активность определена путем проверки способности токсинов полностью ингибировать связывание радиоактивно меченного бунгаротоксина с ацетилхолиновыми рецепторами, с применением фракции постсинаптических мембран электрического органа Torpedo. Ингибирование зависело от конц-ии с K[i] 5,4'+-'1,1*10{-8} M для анатоксина и 7,4'+-'0,9*10{-8} M для гомоанатоксина a. Их высокое сродство к никотиновым холинергическим рецепторам было использовано для разработки радиоиммуноанализа в целях рутинного прямого анализа нейротоксинов этого класса в экстрактах низкомолекулярных в-в цианобактерий. Подтверждение результатов и идентификация токсинов достигалась сопряженным анализом газовой хроматографией/масс-спектрометрией. Обнаружено, что штаммы Oscillatoria PCC6407, 6412 и 9107 синтезируют исключительно анатоксин a, а штаммы PCC 9029 и 6506 - оба токсина, причем у последнего штамма их синтез зависит от условий роста. Франция, Unite Cyanobacteries (CNRS URA 2172) Inst. Pasteur, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 42

ГРНТИ	34.47.21

ВИНИТИ 341.47.21.29.15.99
Рубрики: ТОКСИНЫ
НЕЙРОТОКСИЧНЫЕ АЛКАЛОИДЫ
АНАТОКСИН A
ГОАНАТОКСИН A
ВЫДЕЛЕНИЕ
ОЧИСТКА
БИОЛОГИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ
OSCILLATORIA (BACT.)
ГАЗОВАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ
МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ

Доп.точки доступа:
Araoz, Romulo; Nghiem, Hoang-Oanh; Rippka, Rosmarie; Palibroda, Nicolae; Tandeau, de Marsac Nicole; Herdman, Michael

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 06.03-04Б3.87

Neurotoxins in axenic oscillatorian cyanobacteria: Coexistence of anatoxin-a and homoanatoxin-a determined by ligand-binding assay and GC/MS [Text] / Romulo Araoz [et al.] // Microbiology. - 2005. - Vol. 151, N 4. - P1263-1273 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Нейротоксины аксенических цианобактерий Oscillatoria: сосуществование анатоксина a и гомоанатоксина a по данным анализа связывания лиганда и газовой хроматографии/масс-спектрометрии
Аннотация: Два нейротоксичных алкалоида - анатоксин a и его гомолог гомоанатоксин a - выделены и очищены из нитчатой цианобактерии Oscillatoria sp. штамм 193 (PCC 9240) и Oscillatoria formosa NIVA CYA-92 (PCC 10111), соответственно, и охарактеризованы масс-спектрометрией. Биологическая активность определена путем проверки способности токсинов полностью ингибировать связывание радиоактивно меченного бунгаротоксина с ацетилхолиновыми рецепторами, с применением фракции постсинаптических мембран электрического органа Torpedo. Ингибирование зависело от конц-ии с K[i] 5,4'+-'1,1*10{-8} M для анатоксина и 7,4'+-'0,9*10{-8} M для гомоанатоксина a. Их высокое сродство к никотиновым холинергическим рецепторам было использовано для разработки радиоиммуноанализа в целях рутинного прямого анализа нейротоксинов этого класса в экстрактах низкомолекулярных в-в цианобактерий. Подтверждение результатов и идентификация токсинов достигалась сопряженным анализом газовой хроматографией/масс-спектрометрией. Обнаружено, что штаммы Oscillatoria PCC6407, 6412 и 9107 синтезируют исключительно анатоксин a, а штаммы PCC 9029 и 6506 - оба токсина, причем у последнего штамма их синтез зависит от условий роста. Франция, Unite Cyanobacteries (CNRS URA 2172) Inst. Pasteur, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 42

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.25
Рубрики: ТОКСИНЫ
НЕЙРОТОКСИЧНЫЕ АЛКАЛОИДЫ
АНАТОКСИН A
ГОАНАТОКСИН A
ВЫДЕЛЕНИЕ
ОЧИСТКА
БИОЛОГИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ
OSCILLATORIA (BACT.)
ГАЗОВАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ
МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ

Доп.точки доступа:
Araoz, Romulo; Nghiem, Hoang-Oanh; Rippka, Rosmarie; Palibroda, Nicolae; Tandeau, de Marsac Nicole; Herdman, Michael

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 06.03-04В2.69

Neurotoxins in axenic oscillatorian cyanobacteria: Coexistence of anatoxin-a and homoanatoxin-a determined by ligand-binding assay and GC/MS [Text] / Romulo Araoz [et al.] // Microbiology. - 2005. - Vol. 151, N 4. - P1263-1273 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Нейротоксины аксенических цианобактерий Oscillatoria: сосуществование анатоксина a и гомоанатоксина a по данным анализа связывания лиганда и газовой хроматографии/масс-спектрометрии
Аннотация: Два нейротоксичных алкалоида - анатоксин a и его гомолог гомоанатоксин a - выделены и очищены из нитчатой цианобактерии Oscillatoria sp. штамм 193 (PCC 9240) и Oscillatoria formosa NIVA CYA-92 (PCC 10111), соответственно, и охарактеризованы масс-спектрометрией. Биологическая активность определена путем проверки способности токсинов полностью ингибировать связывание радиоактивно меченного бунгаротоксина с ацетилхолиновыми рецепторами, с применением фракции постсинаптических мембран электрического органа Torpedo. Ингибирование зависело от конц-ии с K[i] 5,4'+-'1,1*10{-8} M для анатоксина и 7,4'+-'0,9*10{-8} M для гомоанатоксина a. Их высокое сродство к никотиновым холинергическим рецепторам было использовано для разработки радиоиммуноанализа в целях рутинного прямого анализа нейротоксинов этого класса в экстрактах низкомолекулярных в-в цианобактерий. Подтверждение результатов и идентификация токсинов достигалась сопряженным анализом газовой хроматографией/масс-спектрометрией. Обнаружено, что штаммы Oscillatoria PCC6407, 6412 и 9107 синтезируют исключительно анатоксин a, а штаммы PCC 9029 и 6506 - оба токсина, причем у последнего штамма их синтез зависит от условий роста. Франция, Unite Cyanobacteries (CNRS URA 2172) Inst. Pasteur, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 42

ГРНТИ	34.29.15

ВИНИТИ 341.29.15.15.19
Рубрики: ТОКСИНЫ
НЕЙРОТОКСИЧНЫЕ АЛКАЛОИДЫ
АНАТОКСИН A
ГОАНАТОКСИН A
ВЫДЕЛЕНИЕ
ОЧИСТКА
БИОЛОГИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ
OSCILLATORIA (BACT.)
ГАЗОВАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ
МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ

Доп.точки доступа:
Araoz, Romulo; Nghiem, Hoang-Oanh; Rippka, Rosmarie; Palibroda, Nicolae; Tandeau, de Marsac Nicole; Herdman, Michael

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI34) 10.07-04Т4.93

MALDI-TOF-MS detection of the low molecular weight neurotoxins anatoxin-a and homoanatoxin-a on lyophilized and fresh filaments of axenic Oscillatoria strains [Text] / Romulo Araoz [et al.] // Toxicon. - 2008. - Vol. 51, N 7. - P1308-1315 . - ISSN 0041-0101
Перевод заглавия: Детекция низкомолекулярных нейротоксинов анатоксина-а и гомоанатоксина-а на лиофилизированных и свежих филаментах аксенических штаммов Oscillatoria методом MALDI-TOF-MS
Аннотация: Анатоксин-а (I) и гомоанатоксин-а (II) - это низкомолекулярные нейротоксичные вторичные амины с мол. весом 165 и 179 Д, соответственно. Для детекции I и II непосредственно на лиофилизированных и свежих филаментах аксенических штаммов Oscillatoria был использован метод времяпролетной масс-спектрометрии с ионизацией методом лазерной десорбции из матрицы (MALDI-TOF-MS), с 2,5-дигидроксибензойной кислотой в качестве матрикса и очищенными I и II в качестве стандартов. Показано, что применение этого метода для детекции цианобактериальных анатоксинов в клональных и аксенических штаммах коллекций цианобактериальных культур может помочь оценить наличие I/II у цианобактерий

ГРНТИ	34.47.21

ВИНИТИ 341.47.21.29.11.11.99 + 341.47.21.29.15.99
Рубрики: OSCILLATORIA
НЕЙРОТОКСИНЫ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ
МЕТОДЫ

Доп.точки доступа:
Araoz, Romulo; Guerineau, Vincent; Rippka, Rosmarie; Palibroda, Nicolae; Herdman, Michael; Laprevote, Olivier; von, Dohren Hans; Tandeau, de Marsac Nicole; Erhard, Marcel

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска