СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ<.>)

Общее количество найденных документов : 28
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-28

РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 97.07-04И4.23

Осинов, А. Г.
"Атлантическая" и "дунайская" филогенетическая группы кумжи Salmo trutta complex: генетическая дивергенция, эволюция, охрана [Текст] / А. Г. Осинов, Л. Берначе // Вопр. ихтиол. - 1996. - Т. 36, N 6. - С. 762-786 . - ISSN 0042-8752
Аннотация: Проанализирована генетическая изменчивость по аллозимам и мтДНК в 18 популяциях кумжи Salmo trutta и у севанской форели S. ischchan на территории бывшего Советского Союза. Для кумжи характерен высокий уровень генетической изменчивости по ядерной и митохондриальной ДНК. Все популяции кумжи четко делятся на два кластера и представляют собой две из пяти ранее выделенных у кумжи филогенетических групп. Уровень генетической дивергенции двух групп значителен (среднее значение генетических дистанций Нея равно 0,102 и сред. значение оценок дивергенции нуклеотидных последовательностей - 0,0177). "Дунайская" группа представлена популяциями кумжи бассейнов Черного, Каспийского и Аральского морей. "Атлантическая" группа населяет бассейны Балтийского, Баренцева и Белого морей, однако выявлена и в одном притоке верхней Волги (Каспийский бассейн). Предполагается, что в ледниковое или послеледниковое время отдельные популяции "дунайской" и "атлантической" групп вступали во вторичный контакт. По имеющимся данным, последствия возможной интрогрессивной гибридизации минимальны. Уровень генетической дифференциации популяций внутри каждой филогенетической группы также высок. Рассматриваются вопросы, связанные с происхождением, эволюцией, послеледниковым расселением и таксономическим статусом отдельных групп популяций и форм в рамках S. trutta complex. Обсуждаются генетические аспекты природоохранных мероприятий. Россия, Биол. фак-т Мос. гос. ун-та, Москва. Ил. 4. Табл. 8. Библ. 104

ГРНТИ	34.33.33

ВИНИТИ 341.33.33.07
Рубрики: SALMO TRUTTA COMPLEX (PISCES)
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИВЕРГЕНЦИЯ
ЭВОЛЮЦИЯ
ФИЛОГЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Берначе, Л.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.07-04Б2.269

Incubation time and media requirements of culturable bacteria from different phylogenetic groups [Text] / Hisayuki Mitsui [et al.] // J. Microbiol. Meth. - 1997. - Vol. 30, N 2. - P103-110 . - ISSN 0167-7012
Перевод заглавия: Время инкубации и требования к средам культивируемых бактерий, относящихся к разным филогенетическим группам
Аннотация: Ранее временные параметры формирования колоний почвенных бактерий на агаровых чашках рассчитывали по кривым образования колоний (КОК) (Gorlach K. et al., // J. Gen. Appl. Microbiol. - 1994. - 40. - 507-517). Сообщается о результатах филогенетического анализа изолятов, выделенных из каждой группы, образующей колонии. В коллекцию включено большое кол-во разнообразных эубактерий. Штаммы, близко родственные Arthrobacter, выделялись из быстро растущих образующих колонии групп I или II, а штаммы из альфа-подгруппы протеобактерий - выделялись из групп III или IV, растущих медленнее. В некоторых филогенетических группах (фирмикуты с низким содержанием Г+Ц, цитофага/флексибактер/бактероиды и протеобактерии бета-подгруппы) наблюдалась гетерогенность в отношении группирования по КОК. По требованиям, предъявляемым к средам, изоляты, относящиеся к цитофага/флексибактер/бактероидам, протеобактериям альфа- и бета-подгрупп и фирмикутам с высоким содержанием Г+Ц, за исключением штаммов, родственных Arthrobacter, можно отнести к олиготрофным бактериям. Напротив, фирмикуты с низким содержанием Г+Ц, протеобактерии гамма-подгруппы и фирмикуты с высоким содержанием Г+Ц, родственные A. globiformis, нельзя отнести к олиготрофам. Япония, Inst. of Genetic Ecology, Tohoku Univ., Katahira, Aoba-ku, Sendai 980-77. Библ. 13

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.11
Рубрики: ПОЧВА
ПОЧВЕННЫЕ БАКТЕРИИ
КОЛОНИИ
СКОРОСТЬ ОБРАЗОВАНИЯ
ПИЩЕВЫЕ ПОТРЕБНОСТИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
РАЗНООБРАЗИЕ

Доп.точки доступа:
Mitsui, Hisayuki; Gorlach, Krystyna; Lee, Hyong-jin; Hattori, Reiko; Hattori, Tsutomu

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 98.07-04Б3.46

Incubation time and media requirements of culturable bacteria from different phylogenetic groups [Text] / Hisayuki Mitsui [et al.] // J. Microbiol. Meth. - 1997. - Vol. 30, N 2. - P103-110 . - ISSN 0167-7012
Перевод заглавия: Время инкубации и требования к средам культивируемых бактерий, относящихся к разным филогенетическим группам
Аннотация: Ранее временные параметры формирования колоний почвенных бактерий на агаровых чашках рассчитывали по кривым образования колоний (КОК) (Gorlach K. et al., // J. Gen. Appl. Microbiol. - 1994. - 40. - 507-517). Сообщается о результатах филогенетического анализа изолятов, выделенных из каждой группы, образующей колонии. В коллекцию включено большое кол-во разнообразных эубактерий. Штаммы, близко родственные Arthrobacter, выделялись из быстро растущих образующих колонии групп I или II, а штаммы из альфа-подгруппы протеобактерий - выделялись из групп III или IV, растущих медленнее. В некоторых филогенетических группах (фирмикуты с низким содержанием Г+Ц, цитофага/флексибактер/бактероиды и протеобактерии бета-подгруппы) наблюдалась гетерогенность в отношении группирования по КОК. По требованиям, предъявляемым к средам, изоляты, относящиеся к цитофага/флексибактер/бактероидам, протеобактериям альфа- и бета-подгрупп и фирмикутам с высоким содержанием Г+Ц, за исключением штаммов, родственных Arthrobacter, можно отнести к олиготрофным бактериям. Напротив, фирмикуты с низким содержанием Г+Ц, протеобактерии гамма-подгруппы и фирмикуты с высоким содержанием Г+Ц, родственные A. globiformis, нельзя отнести к олиготрофам. Япония, Inst. of Genetic Ecology, Tohoku Univ., Katahira, Aoba-ku, Sendai 980-77. Библ. 13

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: ПОЧВА
ПОЧВЕННЫЕ БАКТЕРИИ
КОЛОНИИ
СКОРОСТЬ ОБРАЗОВАНИЯ
ПИЩЕВЫЕ ПОТРЕБНОСТИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
РАЗНООБРАЗИЕ

Доп.точки доступа:
Mitsui, Hisayuki; Gorlach, Krystyna; Lee, Hyong-jin; Hattori, Reiko; Hattori, Tsutomu

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 99.07-04Б4.89

Shigella and enteroinvasive Escherichia coli strains are derived from distinct ancestral strains of E. coli [Text] / Karine Rolland [et al.] // Microbiology. - 1998. - Vol. 144, N 9. - P2667-2672 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Shigella и энтероинвазивные штаммы Escherichia coli происходят от различных штаммов E. coli
Аннотация: Дифференциация между подвидами Shigella и филогинетическим положением между клонами Escherichia coli была осуществлена путем анализа полиморфизма длин рестрикционного фрагмента ДНК (риботипирование). Исследовано 75 штаммов Shigella, принадлежащих к 4 подвидам, и 13 энтероинвазивных E. coli (ЭИЕК) в сравнении с 72 штаммами E. coli из ECOR коллекции, которые были разделены на 4 филогенетические группы (A, B1, B2, D). 17 риботипов Shigella dysenteriae, 12 риботипов Shigella flexneri, 23 риботипа Shigella bogdii, 12 риботипов Shigella sonnei и 13 риботипов ЭИЕК были дифференцированы. Анализ полученных результатов показал, что 13 штаммов серотипа S. bogdii отличались от других штаммов Shigella, а S. sonnei и S. flexneri отличались от S. bogdii и S. dysenteriae. Риботипы Shigella и штаммы из коллекции ECOR друг от друга не отличались, а S. sonnei, S. flexneri и большинство штаммов S. dysenteriae серотип I принадлежали к филогенетической группе B1. Штаммы S. bogdii поровну распределены между двумя группами. Штамм Shigella имел отдаленную связь с группой B2, к которой относятся штаммы E. coli, часто вызывающие внекишечную инфекцию у людей. В противоположность этому 13 штаммов ЭИЕК были широко распространены между филогенетическими группами B1, A и B2. Таким образом исходные виды Shigella и ЭИЕК штаммы происходят от штаммов различных родов. Ил. 3. Табл. 1. Библ. 37

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.09
Рубрики: SHIGELLA (BACT.)
ПОДВИДЫ
ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ
РИБОТИПИРОВАНИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ

Доп.точки доступа:
Rolland, Karine; Lambert-Zechovsky, Nicole; Picard, Bertrand; Denamur, Erick

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.05-04Б2.119

A phylogenetic approach to target selection for structural genomics: Solution structure of YciH [Text] / John R. Cort [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1999. - Vol. 27, N 20. - P4018-4027 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Филогенетический подход к выбору цели для структурной геномики: структура в растворе [белка] YciH
Аннотация: Для того, чтобы претендовать на полное понимание человеческого организма и других живых систем, недостаточно полностью отсеквенировать геномы. Хорошо бы еще установить биохимич. функции белков, чьи последовательности вычисляются на основании результатов секвенирования, и изучить их взаимодействия друг с другом. Для этого необходимо определять их третичную и четвертичную структуру. Чтобы сделать эту задачу решаемой, предложен подход, заключающийся в том, что на основании гомологий последовательностей белки объединяют в гомологические семейства, охватывающие широкий спектр филогенетических групп. Далее определяется трехмерная структура какого-нибудь представителя такого семейства, и делается вывод, что остальные белки семейства должны иметь такую же структуру. Если последовательность гена не является гомологичной какой-нибудь группе с известными функциями, то стоит построить трехмерную структуру продукта, и, возможно, это поможет определить функции. Для демонстрации такого подхода с помощью ЯМР построена структура белка YciH Escherichia coli, и классифицирован его тип сворачивания. Белок YciH - это предположительный фактор инициации трансляции. По типу сворачивания он является ортологом интегрального компонента комплекса инициации трансляции эукариот, хотя его последовательность негомологична этому компоненту. Подобный подход можно использовать и для идентификации новых суперсемейств гомологов в соответствии с их топологией. США [Kennedy M. A.], Environmen. Mol. Sci. Lab., Pacific Northwest Nat. Lab., Richland, WA 99352. Библ. 50

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: СТРУКТУРНАЯ ГЕНОМИКА
БЕЛКИ
БИОХИМИЧЕСКИЕ ФУНКЦИИ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ГОМОЛОГИЧЕСКИЕ СЕМЕЙСТВА
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ТРЕХМЕРНЫЕ СТРУКТУРЫ
БЕЛОК YCIH
СТРУКТУРА
ЯМР - ТИП СВОРАЧИВАНИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Cort, John R.; Koonin, Eugene V.; Bash, Paul A.; Kennedy, Michael A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.02-04Б2.230

Identification of sulfate-reducing, phylogenetic groups most capable of methylating mercury in pure culture and organic acid amended sediment slurries [Text] / J. K. King [et al.] // Abstr. 99th Gen. Meet. Amer. Soc. Microbiol., Chicago, Ill., May 30-June 3, 1999. - Washington (D.C.), 1999. - P475
Перевод заглавия: Выявление филогенетических групп сульфатредукторов, большая часть которых способна метилировать ртуть в чистой культуре, и в образцах илистых осадков, обогащенных органической кислотой
Аннотация: Исследовали филогенетические группы сульфатредуцирующих бактерий (СРБ), способные превращать Hg в метилртуть (MeHg). В присутствии неорганической ртути выращивали представителей СРБ: Desulfovibrio, Desulfobulbus, Desulfococcus, Desulfobacterium и Desulfobacter. Определяли кол-во восстановленного сульфата и образовавшейся MeHg на клетку. Наивысшей производительности в образовании MeHg достигала Desulfobacterium. Desulfovibrio и Desulfobulbus отставали от нее. Выращенные в условиях ферментации культуры СРБ образовывали минимальные кол-ва MeHg, причем возрастания конц-ии MeHg во времени не наблюдалось. В попытках повлиять на процесс к илистым осадкам с их специфическими микробными сообществами в качестве донора электронов добавляли органическую к-ту. Осадки инкубировали в течение 20 дней, до внесения Hg, с молочной или уксусной к-той. Филогенетические группы СРБ, присутствующие в осадках, выявляли методом определения специфичности 16S-pРНК. Образцы осадков подвергали количественному анализу на содержание MeHg, скорость восстановления сульфата, общую конц-ию Hg в воде осадков, конц-ию углеродных субстратов и плотность клеток в осадках. Данные на чистых культурах СРБ и илистых осадках с добавлением органических к-т показали своеобразие отдельных филогенетических групп СРБ по их удельной активности метилирования ртути. США, Georgia Inst. of Technol., Savannah, GA

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.15
Рубрики: СУЛЬФАТРЕДУЦИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ИЛ
ОРГАНИЧЕСКИЕ КИСЛОТЫ
ВНЕСЕНИЕ
РТУТЬ
МЕТИЛИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
King, J.K.; Frischer, M.E.; Kostka, J.E.; Saunders, F.M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 02.03-04Б3.39

Identification of sulfate-reducing, phylogenetic groups most capable of methylating mercury in pure culture and organic acid amended sediment slurries [Text] / J. K. King [et al.] // Abstr. 99th Gen. Meet. Amer. Soc. Microbiol., Chicago, Ill., May 30-June 3, 1999. - Washington (D.C.), 1999. - P475
Перевод заглавия: Выявление филогенетических групп сульфатредукторов, большая часть которых способна метилировать ртуть в чистой культуре, и в образцах илистых осадков, обогащенных органической кислотой
Аннотация: Исследовали филогенетические группы сульфатредуцирующих бактерий (СРБ), способные превращать Hg в метилртуть (MeHg). В присутствии неорганической ртути выращивали представителей СРБ: Desulfovibrio, Desulfobulbus, Desulfococcus, Desulfobacterium и Desulfobacter. Определяли кол-во восстановленного сульфата и образовавшейся MeHg на клетку. Наивысшей производительности в образовании MeHg достигала Desulfobacterium. Desulfovibrio и Desulfobulbus отставали от нее. Выращенные в условиях ферментации культуры СРБ образовывали минимальные кол-ва MeHg, причем возрастания конц-ии MeHg во времени не наблюдалось. В попытках повлиять на процесс к илистым осадкам с их специфическими микробными сообществами в качестве донора электронов добавляли органическую к-ту. Осадки инкубировали в течение 20 дней, до внесения Hg, с молочной или уксусной к-той. Филогенетические группы СРБ, присутствующие в осадках, выявляли методом определения специфичности 16S-pРНК. Образцы осадков подвергали количественному анализу на содержание MeHg, скорость восстановления сульфата, общую конц-ию Hg в воде осадков, конц-ию углеродных субстратов и плотность клеток в осадках. Данные на чистых культурах СРБ и илистых осадках с добавлением органических к-т показали своеобразие отдельных филогенетических групп СРБ по их удельной активности метилирования ртути. США, Georgia Inst. of Technol., Savannah, GA

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: СУЛЬФАТРЕДУЦИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ИЛ
ОРГАНИЧЕСКИЕ КИСЛОТЫ
ВНЕСЕНИЕ
РТУТЬ
МЕТИЛИРОВАНИЕ
СУЛЬФАТРЕДУЦИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ИЛ
ОРГАНИЧЕСКИЕ КИСЛОТЫ
ВНЕСЕНИЕ
РТУТЬ
МЕТИЛИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
King, J.K.; Frischer, M.E.; Kostka, J.E.; Saunders, F.M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.01-04Б2.102К

Павлова, О. Н.
Бактерии рода Pseudomonas в микробном сообществе озера Байкал [Текст] / О. Н. Павлова. - Иркутск : Иркут. гос. ун-т, 2004. - 20 с. : ил.
Аннотация: Впервые проведено всестороннее изучение большой группы бактерий - представителей рода Pseudomonas - в составе микробных сообществ оз. Байкал. Было выделено и определено 200 чистых изолятов рода Pseudomonas. В Байкале обнаружены 5 из 7 современных филогенетических групп псевдомонад. Изучены особенности сезонной и межгодовой динамики бактерий Pseudomonas, а также их физиологическая и биохимическая активность, особенно окисление углеводородов. Показано доминирование псевдомонад в водах Байкала. Их сезонная динамика характеризуется рядом особенностей. Природные штаммы Pseudomonas вод и осадков Байкала образуют экзоферменты, активность к-рых поддерживает чистоту озера. Полученные данные могут быть использованы в ходе мониторинга Байкала, а выделенные бактерии - найти применение при очистке природных и сточных вод

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: PSEUDOMONAS (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
СЕЗОННАЯ ДИНАМИКА
ОКИСЛЕНИЕ УГЛЕВОДОРОДОВ
ФЕРМЕНТЫ
ОЗЕРА
Свободных экз. нет

РЖ ВИНИТИ 34 (BI17) 05.02-04И1.93

Sequence analysis of mitochondrial 16S rRNA gene in Fenneropenaeus chinensis [Text] / Tian-xiang Gao [et al.] // Zhongguo shuichan kexue = J. Fish. Sci. China. - 2003. - Vol. 10, N 5. - P359-364 . - ISSN 1005-8737
Перевод заглавия: Анализ последовательности митохондриального гена рРНК 16S у Fenneropenaeus chinensis
Аннотация: Не найдено различий в последовательностях нуклеотидов у дикой и культурной популяций. По этому признаку выделены 2 филогенетические группы среди 12 видов пенеид. КНР, Key Lab. of Mariculture, Ministry of Education, Ocean Univ. of China, Qingdao 266003. Ил. 3. Табл. 2. Библ. 12

ГРНТИ	34.33.15

ВИНИТИ 341.33.15.31.25.41.09.11
Рубрики: ДЕСЯТИНОГИЕ
FENNEROPENAEUS CHINENSIS (DEC.)
ПОПУЛЯЦИИ
ГЕНЕТИКА
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
КИТАЙ

Доп.точки доступа:
Gao, Tian-xiang; Li, Jian; Wang, Qing-yin; Liu, Jin-xian

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 05.03-04А2.134К

Павлова, О. Н.
Бактерии рода Pseudomonas в микробном сообществе озера Байкал [Текст] / О. Н. Павлова. - Иркутск : Иркут. гос. ун-т, 2004. - 20 с. : ил.
Аннотация: Впервые проведено всестороннее изучение большой группы бактерий - представителей рода Pseudomonas - в составе микробных сообществ оз. Байкал. Было выделено и определено 200 чистых изолятов рода Pseudomonas. В Байкале обнаружены 5 из 7 современных филогенетических групп псевдомонад. Изучены особенности сезонной и межгодовой динамики бактерий Pseudomonas, а также их физиологическая и биохимическая активность, особенно окисление углеводородов. Показано доминирование псевдомонад в водах Байкала. Их сезонная динамика характеризуется рядом особенностей. Природные штаммы Pseudomonas вод и осадков Байкала образуют экзоферменты, активность к-рых поддерживает чистоту озера. Полученные данные могут быть использованы в ходе мониторинга Байкала, а выделенные бактерии - найти применение при очистке природных и сточных вод

ГРНТИ	34.35.33

ВИНИТИ 341.35.33.57.57.37.02
Рубрики: PSEUDOMONAS (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
СЕЗОННАЯ ДИНАМИКА
ОКИСЛЕНИЕ УГЛЕВОДОРОДОВ
ФЕРМЕНТЫ
ОЗЕРА
Свободных экз. нет

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 05.03-04Б3.142К

Павлова, О. Н.
Бактерии рода Pseudomonas в микробном сообществе озера Байкал [Текст] / О. Н. Павлова. - Иркутск : Иркут. гос. ун-т, 2004. - 20 с. : ил.
Аннотация: Впервые проведено всестороннее изучение большой группы бактерий - представителей рода Pseudomonas - в составе микробных сообществ оз. Байкал. Было выделено и определено 200 чистых изолятов рода Pseudomonas. В Байкале обнаружены 5 из 7 современных филогенетических групп псевдомонад. Изучены особенности сезонной и межгодовой динамики бактерий Pseudomonas, а также их физиологическая и биохимическая активность, особенно окисление углеводородов. Показано доминирование псевдомонад в водах Байкала. Их сезонная динамика характеризуется рядом особенностей. Природные штаммы Pseudomonas вод и осадков Байкала образуют экзоферменты, активность к-рых поддерживает чистоту озера. Полученные данные могут быть использованы в ходе мониторинга Байкала, а выделенные бактерии - найти применение при очистке природных и сточных вод

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.21
Рубрики: PSEUDOMONAS (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
СЕЗОННАЯ ДИНАМИКА
ОКИСЛЕНИЕ УГЛЕВОДОРОДОВ
ФЕРМЕНТЫ
ОЗЕРА
Свободных экз. нет

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.08-04Б2.32

Кондратьева, Т. Ф.
Штаммовая генотипическая гетерогенность ацидофильных хемолитотрофных микроорганизмов [Текст] / Т. Ф. Кондратьева, С. Н. Агеева // Труды института микробиологии им. С.Н. Виноградского. - М., 2004. - Юбилейный сборник к 70-летию института, Вып. 12. - С. 197-212 . - ISBN 5-02-03386-0
Аннотация: Обзор. В работе изучен штаммовый полиморфизм генотипических признаков ацидофильных хемолитотрофов. Показано, что штаммы Acidithiobacillus ferrooxidans, A. thiooxidans, Sulfobacillus thermosulfidooxidans, S. sibiricus, Acidianus brierleyi, Ferroplasma acidiphilum различаются по структуре хромосомной ДНК, расщепленной эндонуклеазами рестрикции и проанализированной методом пульс-электрофореза. Переключение метаболизма на окисление нового энергетического субстрата может вызвать как обратимые, так и необратимые изменения структуры хромосомной ДНК ацидофильных хемолитотрофов. Особое внимание уделено изучению изменчивости грамотрицательной бактерии A. ferrooxidans, доминирующей в мезофильных сообществах. У штаммов A. ferrooxidans отмечена значительная генетическая гетерогенность тотальных геномов при анализе методом ДНК-ДНК гибридизации. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей генов 16S рРНК выявил наличие нескольких филогенетических групп внутри единого филогенетического кластера. Показан штаммовый полиморфизм плазмидных профилей и роль энергетического субстрата и конц-ии ионов тяжелых металлов в их изменениях. Энергетический субстрат является одним из основных факторов, вызывающих изменчивость ацидофильных хемолитотрофных микроорганизмов. Показана роль IS-элементов и плазмид в микроэволюционных процессах, приводящих к штаммовому полиморфизму. Подчеркнуто значение аборигенных штаммов в биогидрометаллургических технологиях. Библ. 21

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.09.99
Рубрики: АЦИДОФИЛЬНЫЕ ХЕМОЛИТОТРОФНЫЕ БАКТЕРИИ
ACIDITHIOBACILLUS (BACT.)
SULFOBACILLUS (BACT.)
ACIDIANUS (BACT.)
FERROPLASMA (BACT.)
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ГЕТЕРОГЕННОСТЬ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ШТАММОВЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 21

Доп.точки доступа:
Агеева, С.Н.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 06.10-04Б1.164

Distribution and genetic analysis of TTV and TTMV major phylogenetic groups in French blood donors [Text] / Philippe Biagini [et al.] // J. Med. Virol. - 2006. - Vol. 78, N 2. - P298-304 . - ISSN 0146-6615
Перевод заглавия: Распределение и генетический анализ TTV и TTMV больших филогенетических групп у французских доноров крови
Аннотация: TTV и TTMV, относящиеся к роду Анелловирусов (Anellovirus), присутствуют в более 80% человеческой популяции. Они отличаются высокой генетической дивергенцией, но мало что известно о распределении анелловирусных генетических групп у людей. В работе было проанализировано распределение больших генетических групп TTV и TTMV у здоровых доноров крови, используя групповые зависимые и групповые независимые ПЦР-амплификационные системы, комбинированные с определением последовательностей при секвенировании и филогенетическим анализом. В результате при анализе анелловирусных групп был выявлен нерандомизированный тип группового распределения с преимущественным распространением TTV филогенетических групп 1, 3 и 5 и TTMV - группы 1. Вместе с тем, наблюдалась множественность коинфекций. Были также идентифицированы TTMV последовательности, обладающие при сравнении с контрольными последовательностями, высоким генетическим разнообразием. Представленное исследование было первым изучением генетического распределения больших филогенетических групп рода Анелловирусов в когорте французских доноров крови. Полученные данные можно взять как основу для проведения сравнительного изучения инфекций в когортах больных, инфицированных TTV и TTMV и другими возбудителями. Франция, Unite des Virus Emergents EA3292, Etablissement Francais du Sang Alpes-Mediterranee, 27, Bd. Jean Moulin, 13285 Marseille Cedex 05. Библ. 47

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.25
Рубрики: АНЕЛЛОВИРУСЫ
ВИРУС ТТ
ВИРУС ТТМ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ДОНОРЫ

Доп.точки доступа:
Biagini, Philippe; Gallian, Pierre; Cantaloube, Jean-Francois; Attoui, Houssam; de, Micco Philippe; de, Lamballerie Xavier

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.09-04Б4.82

Relationship between Escherichia coli strains causing urinary tract infection in women and the dominant faecal flora of the same hosts [Text] / E. Moreno [et al.] // Epidemiol. and Infec. - 2006. - Vol. 134, N 5. - P1015-1023 . - ISSN 0950-2688
Перевод заглавия: Взаимоотношение между штаммами Escherichia coli, вызывающими инфекции мочевого тракта у женщин, и доминирующей фекальной флорой у тех же хозяев
Аннотация: Проведено сравнение биотипа, филогенетической группы и генов вирулентности штаммов Escherichia coli из мочи 11 женщин с острыми инфекциями мочевого тракта (UTI) с соответствующими показателями доминирующих кишечных штаммов E. coli, для выяснения того, что является более важным в определении причины UTI - распространенность или частная патогенность. Идентифицирован двадцать один уникальный клон E. coli. Для трех женщин один идентифицированный фекальный клон также был клоном из мочи, в то время как для 8 женщин фекальные образцы дали 1 или 2 отличающихся не мочевых клона (всего n=10) с одновременными мочевыми клонами (n=3) или без них (n=5). Восемь клонов из мочи от последних 8 женщин проявили существенно более высокую подразумеваемую вирулентность в соответствие с содержанием генов вирулентности и филогенетическим фоном по сравнению с 10 соответствующими "только фекальными" клонами хозяев. В противоположность этому, три клона из мочи, которые были определены как единственный фекальный клон хозяина проявили существенно меньшую подразумеваемую вирулентность, чем другие восемь клонов из мочи и были статистически неотличимыми от 10 "только фекальных" клонов. Сделано заключение, что частная патогенность - это важный детерминант патогенеза UTI у женщин, хотя распространенность может иногда давать возможность менее вирулентным штаммам вызывать UTI. Испания, Microbiology Dept., Hospital Valld'Hebron, Univ. Autonoma de Barcelona, Barcelona. Библ. 35

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: ИНФЕКЦИИ
МОЧЕВОЙ ТРАКТ
ФЕКАЛИИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
БИОТОПЫ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
ЖЕНЩИНЫ

Доп.точки доступа:
Moreno, E.; Andreu, A.; Perez, T.; Sabate, M.; Johnson, J.R.; Prats, G.

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.01-04Б2.92

Ecological diversification in the Bacillus cereus Group [Text] / Marie-Helene Guinebretiere [et al.] // Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 10, N 4. - P851-865 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Экологическое разнообразие группы Bacillus cereus
Аннотация: Показана "экотипическая" структура популяций группы B. cereus с помощью 1) молекулярных данных, полученных от анализа типов амплифицированных флуоресцирующих фрагментов разной длины, последовательностей рибосомных генов, частичных последовательностей panC гена, 2) сигнатур фенотипических и наглядных данных из области ростовой т-ры, психротолерантности и термальных ниш. Затем были идентифицированы семь главных филогенетических групп (от I до VII), с экологическими отличиями, к-рые обеспечивали очевидность множественного проявления психротолерантности у группы B. cereus. Умеренно термотолерантная группа (VII) лежала в основе мезофильной группы I, из к-рой, в свою очередь, вышли две мезофильные группы (III, IV), промежуточная группа (V) и две психротолерантные группы (VI, II). Этот поэтапный эволюционный переход по направлению к психротолерантности был, в частности, хорошо проиллюстрирован относительным обилием "психротолерантных" копий rrs сигнатуры, накопленных у штаммов, к-рые различались в соответствии с филогенетической группой. "Психротолерантная" cspA сигнатура была специфична для группы VI, и она наметила подходящий путь к ее дифференциации от психротолерантной группы II. Данное исследование показывает, как адаптация к новым местообитаниям путем ограничений толерантности к т-ре сформировала исторические типы глобального разнообразия в группе B. cereus. Обсуждается значение для таксономии этой группы и для здоровья человека. Франция, Inst. Nat. de la Recherche Agronomique, UMR A408 Securite et Qualite des Produits d'Origine Vegetale, INRA, Domaine Saint-Paul, F-84914 Avignon Cedek 9. E-mail: guinebre@avignon. inra.fr

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.09
Рубрики: BACILLUS CEREUS (BACT.)
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ЭКОЛОГИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ
ПСИХРОТОЛЕРАНТНОСТЬ
АДАПТАЦИЯ К НОВЫМ МЕСТООБИТАНИЯМ

Доп.точки доступа:
Guinebretiere, Marie-Helene; Thompson, Fabiano L.; Sorokin, Alexei; Normand, Philippe; Dawyndt, Peter; Ehling-Schulz, Monika; Svensson, Birgitta; Sanchis, Vincent; Nguyen-The, Christophe; Heyndrickx, Marc; De, Vos Paul

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 09.04-04Б4.30

Ishii, Satoshi.
Relationship between phylogenetic groups, genotypic clusters, and virulence gene profiles of Escherichia coli strains from diverse human and animal sources [Text] / Satoshi Ishii, Katriya P. Meyer, Michael J. Sadowsky // Appl. and Environ. Microbiol. - 2007. - Vol. 73, N 18. - P5703-5710 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Связь между филогенетическими группами, генотипическими кластерами и профилями генов вирулентности штаммов Escherichia coli из разнообразных источников человеческого и животного происхождения
Аннотация: Штаммы Escherichia coli из разнообразных источников (человек и животные) в штатах Миннесота и Висконсин анализировали на присутствие генов, кодирующих факторы вирулентности, с помощью множественной ПЦР и биохимических реакций. Из 1531 исследованного штамма 31 (2%) - штаммы E. coli, продуцирующие Шига-токсин (STEC). Большинство из этих штаммов, выделенных из ряда домашних животных, имеют гены stx[1c], stx[2d], ehxA и saa и относятся к филогенетической группе B1 E. coli. 26 штаммов (1,7%) - вероятные энтеропатогенные штаммы E. coli (EPEG). Они подразделяются на несколько близких подтипов и обнаружены как у людей, так и у животных. Штаммы EPEC распределяются между 4 фимогенетическими группами E. coli. С помощью ПЦР показали, что STEC, возможные EPEC и неSTEC ehxA - позитивные штаммы E. coli различаются генотипически и образуют независимые кластеры. Однако некоторые возможные EPEC генотипически не различаются от непатогенных штаммов E. coli. Показали, что штаммы, предоставляющие возможную опасность для человека, варьируют у хозяев животного происхождения, при этом некоторые виды животных несут большее число патогенных штаммов E. coli, чем другие. США, Univ. of Minnesota, Dep. of Soil, Water, and Climate, 439 Borlaug Hall, St. Paul, MN 55108. Ил. 3. Табл. 1. Библ. 55

ГРНТИ	34.27.59

ВИНИТИ 341.27.59
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ПРОДУЦИРУЮЩИЕ ШИГА-ТОКСИН STEC
ГРУППА B1
ВЫДЕЛЕНИЕ
ЖИВОТНЫЕ
ЭНТЕРОПАТОГЕННЫЕ ШТАММЫ EPEC
ВЫДЕЛЕНИЕ
ЛЮДИ
ЖИВОТНЫЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ КЛАСТЕРЫ
ГЕНЫ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
ПРОФИЛИ

Доп.точки доступа:
Meyer, Katriya P.; Sadowsky, Michael J.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.10-04Б2.182

Baldy-Chudzik, Katarzyna.
Genetic structure and antimicrobial resistance in Escherichia coli isolated from waters of Lake Slawa [Text] / Katarzyna Baldy-Chudzik, Michal Stosik // Limnol. Pap. - 2007. - Vol. 2. - P121-129 . - ISSN 1896-835X
Перевод заглавия: Генетическая структура и антибиотикорезистентность у Escherichia coli, выделенной из воды озера Slawa
Аннотация: В данной работе осуществили анализ распространения резистентных штаммов из 4-х филогенетических групп Escherichia coli, выделенных из воды озера Slawa. 273 штамма были идентифицированы в образцах воды в 4-х участках озера в летнее время. Анализ генетической структуры E. coli позволил показать преобладание штаммов из филогенетической группы B1 (типичные комменсалы) и B2 (потенциальные кишечные патогены) и наличие незначительного количества штаммов из группы A (типичные комменсалы) и D (потенциальные кишечные патогены). Обнаружили зональное разнообразие генетической структуры штаммов в отдельных участках озера. Штаммы, принадлежащие к филогенетической группе B1, преобладали в субповерхностной зоне воды. Обнаружили, что генетическая структура штаммов была более разнообразной в донной зоне воды (с преобладанием штаммов из группы B2). В образцах воды из различных участков озера определили высокий процент штаммов E. coli, резистентных к 14 антибиотикам, которые применяют для борьбы с инфекциями. Штаммы, резистентные к более чем 3 антибиотикам преобладали в субповерхностной зоне. В данной зоне определили штаммы E. coli, резистентные к одному, двум, трем и более антибиотикам. Польша, Dep. of Microbiol. and Genetics, Inst. of Biotechnology and Environmental Science, Univ. of Zielona Gora

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.31.99
Рубрики: БАКТЕРИИ
ВОДНЫЕ БАКТЕРИИ
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
АНТИБИОТИКОУСТОЙЧИВОСТЬ
МНОЖЕСТВЕННАЯ УСТОЙЧИВОСТЬ
ESCHERCHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Stosik, Michal

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.11-04Б2.184

Genetic diversity of endophytic bacteria which could be find in the apoplastic sap of the medullary parenchym of the stem of healthy sugarcane plants [Text] / Encarna Velazquez [et al.] // J. Basic Microbiol. - 2008. - Vol. 48, N 2. - P118-124 . - ISSN 0233-111X
Перевод заглавия: Генетическое разнообразие бактерий-эндофитов, которых можно найти в апопластическом соке сердцевинной паренхимы ствола здоровых растений сахарного тростника
Аннотация: Проанализировали генетическое разнообразие 29 штаммов бактерий-эндофитов, выделенных из апопластического сока сердцевинной паренхимы ствола здоровых растений сахарного тростника. Использовали методы фингерпринтирования ДНК (TR-RAPD) и секвенирования гена 16S рРНК. Штаммы распределили в 17 групп на основе образцов TR-RAPD, и репрезентативный штамм из каждой группы подвергли секвенированию по генам 16S рРНК. Выявили широкое разнообразие филогенетических групп, тесно связанных с видами из родов Bacillus и Staphylococcus из Firmicutes, Microbacterium, Micrococcus и Kokuria из Actinobacteria, Rhizobium и Gluconocetobacter из 'альфа'-Proteobacteria, Comamonas и Xanthomonas из 'бета'-Proteobacteria. Полученные результаты свидетельствуют о сложном составе бактериальных популяций во внутренних тканях сахарного тростника. Испания, Dep. de Microbiol. y Genetica., Univ. de Salamanca, Salamanca. Библ. 38

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.31.05
Рубрики: БАКТЕРИИ
БАКТЕРИИ-ЭНДОФИТЫ
САХАРНЫЙ ТРОСТНИК
СЕРДЦЕВИННАЯ ПАРЕНХИМА СТВОЛА
АПОПЛАСТИЧЕСКИЙ СОК
ГЕНОТИП
ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
ACTINOBACTERIA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Velazquez, Encarna; Rojas, Marcia; Lorite, Maria Jose; Rivas, Raul; Zurdo-Pineiro, Jose Luis; Heydrich, Mayra; Bedmar, Eulogio J.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 09.11-04Б4.160

Baldy-Chudzik, Katarzyna.
Genetic structure and antimicrobial resistance in Escherichia coli isolated from waters of Lake Slawa [Text] / Katarzyna Baldy-Chudzik, Michal Stosik // Limnol. Pap. - 2007. - Vol. 2. - P121-129 . - ISSN 1896-835X
Перевод заглавия: Генетическая структура и антибиотикорезистентность у Escherichia coli, выделенной из воды озера Slawa
Аннотация: В данной работе осуществили анализ распространения резистентных штаммов из 4-х филогенетических групп Escherichia coli, выделенных из воды озера Slawa. 273 штамма были идентифицированы в образцах воды в 4-х участках озера в летнее время. Анализ генетической структуры E. coli позволил показать преобладание штаммов из филогенетической группы B1 (типичные комменсалы) и B2 (потенциальные кишечные патогены) и наличие незначительного количества штаммов из группы A (типичные комменсалы) и D (потенциальные кишечные патогены). Обнаружили зональное разнообразие генетической структуры штаммов в отдельных участках озера. Штаммы, принадлежащие к филогенетической группе B1, преобладали в субповерхностной зоне воды. Обнаружили, что генетическая структура штаммов была более разнообразной в донной зоне воды (с преобладанием штаммов из группы B2). В образцах воды из различных участков озера определили высокий процент штаммов E. coli, резистентных к 14 антибиотикам, которые применяют для борьбы с инфекциями. Штаммы, резистентные к более чем 3 антибиотикам преобладали в субповерхностной зоне. В данной зоне определили штаммы E. coli, резистентные к одному, двум, трем и более антибиотикам. Польша, Dep. of Microbiol. and Genetics, Inst. of Biotechnology and Environmental Science, Univ. of Zielona Gora

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.25.07
Рубрики: БАКТЕРИИ
ВОДНЫЕ БАКТЕРИИ
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
АНТИБИОТИКОУСТОЙЧИВОСТЬ
МНОЖЕСТВЕННАЯ УСТОЙЧИВОСТЬ
ESCHERCHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Stosik, Michal

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.02-04Б2.145

Assigning Escherichia coli strains to phylogenetic groups: Multi-locus seqience typing versus the PCR triplex method [Text] / David M. Gordon [et al.] // Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 10, N 10. - P2484-2496 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Распределение штаммов Escherichia coli на филогенетические группы: мультилокусное типирование нуклеотидной последовательности в сравнении с триплексным ПЦР-методом
Аннотация: Разработали метод на основе триплексной ПЦР для распределения штаммов Escherichia coli на фило-группы при использовании генов chuA и yjaA, а также фрагмента ДНК (TSPE4.C2). Точность распределения штаммов на правильные фило-группы не получила адекватной оценки. Кроме того, 662 штамма E. coli распределили на фило-группы на основе мультилокусного типирования нуклеотидной последовательности при использовании Clermont метода. Показали, что в этом случае 80-85% штаммов E. coli распределяются на правильные фило-группы. Австралия, Sch. of Botany and Zoology, Australian National Univ., Canberra ACT 0200

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММЫ
РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ
МЕТОДЫ
ПЦР ТРИПЛЕКСНАЯ ГЕНЫ CHUA
ГЕНЫ YJAA
СРАВНЕНИЕ
МУЛЬТИЛОКУСНОЕ ТИПИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Gordon, David M.; Clermont, Olivier; Tolley, Heather; Denamur, Erick

1-20 21-28

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска