Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=СТЕПЕНЬ ГОМОЛОГИИ<.>)
Общее количество найденных документов : 10
Показаны документы с 1 по 10
1.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 13.01-04Б4.27

   

    СТЕПЕНЬ ГОМОЛОГИИ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ДНК БРУЦЕЛЛ [Текст] / А. В. Иванов [и др.] // Достиж. науки и техн. АПК. - 2012. - N 8. - С. 83-84 . - ISSN 0235-2451
Аннотация: В экспериментах были использованы, как стабильные S-формы (Brucella abortus 54,19, B.melitensis Rev-1, B.suis 117, B.rangiferi Г-221, B.rangiferiВ-307, B.ovis, B.canis), так и диссоцианты и трансформанты из S- в SR-формы (B.abortus82,82Пч и 82 Ц) и R-формы (B.abortus R-1096, B.rangiferi С-227, С-226) бруцелл. В работе использовали 3 варианта ПЦР(ПЦР-1, мультиплекс ПЦР-2 и ПЦР-3) и 6 видов праймеров (P1 - bsp31, P2 - IS711, P3 - IS711, P4 - R0952, P5 - BMEU 0635-0636 и P6 - A0504). Из испытанных праймеров оптимальным оказался P1 (bsp31), который позволяет идентифицировать различные виды бруцелл независимо от вирулентности и степени диссоциации культур (S-, SR-, R-формы). Кроме того, с использованием праймеров P1 и Р2 можно идентифицировать бруцеллы вида B.abortus, P1, Р3 - B.melitensis, Р1, P4 - B.suis (rangiferi), P1, P6 - B. ovis, P1, P4, P5 - B.canis. Полученные данные подтверждают такую характерную особенность микроорганизмов рода Brucella, как высокая гомологичность их ДНК. При этом изменчивость бруцелл (диссоциация, трансформация и др.) не ведет к заметной дивергенции генома. Следовательно, метод ДНК-ДНК гибридизации не только дополняет общепринятую систему тестов идентификации бруцелл, но и во многих случаях может служить единственно достоверным показателем принадлежности микроорганизмов к роду Brucella
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.03.43.05.11
Рубрики: ДНК
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

СТЕПЕНЬ ГОМОЛОГИИ

BRUCELLA (BACT.)


Доп.точки доступа:
Иванов, А.В.; Панкова, Е.В.; Ахмадеев, Р.М.; Плотникова, Э.М.


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.02-04Б2.167

   

    СТЕПЕНЬ ГОМОЛОГИИ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ДНК БРУЦЕЛЛ [Текст] / А. В. Иванов [и др.] // Достиж. науки и техн. АПК. - 2012. - N 8. - С. 83-84 . - ISSN 0235-2451
Аннотация: В экспериментах были использованы, как стабильные S-формы (Brucella abortus 54,19, B.melitensis Rev-1, B.suis 117, B.rangiferi Г-221, B.rangiferiВ-307, B.ovis, B.canis), так и диссоцианты и трансформанты из S- в SR-формы (B.abortus82,82Пч и 82 Ц) и R-формы (B.abortus R-1096, B.rangiferi С-227, С-226) бруцелл. В работе использовали 3 варианта ПЦР(ПЦР-1, мультиплекс ПЦР-2 и ПЦР-3) и 6 видов праймеров (P1 - bsp31, P2 - IS711, P3 - IS711, P4 - R0952, P5 - BMEU 0635-0636 и P6 - A0504). Из испытанных праймеров оптимальным оказался P1 (bsp31), который позволяет идентифицировать различные виды бруцелл независимо от вирулентности и степени диссоциации культур (S-, SR-, R-формы). Кроме того, с использованием праймеров P1 и Р2 можно идентифицировать бруцеллы вида B.abortus, P1, Р3 - B.melitensis, Р1, P4 - B.suis (rangiferi), P1, P6 - B. ovis, P1, P4, P5 - B.canis. Полученные данные подтверждают такую характерную особенность микроорганизмов рода Brucella, как высокая гомологичность их ДНК. При этом изменчивость бруцелл (диссоциация, трансформация и др.) не ведет к заметной дивергенции генома. Следовательно, метод ДНК-ДНК гибридизации не только дополняет общепринятую систему тестов идентификации бруцелл, но и во многих случаях может служить единственно достоверным показателем принадлежности микроорганизмов к роду Brucella
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ДНК
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

СТЕПЕНЬ ГОМОЛОГИИ

BRUCELLA (BACT.)


Доп.точки доступа:
Иванов, А.В.; Панкова, Е.В.; Ахмадеев, Р.М.; Плотникова, Э.М.


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI05) 89.11-04И8.762

   

    B2-подобная повторяющаяся последовательность в геноме американской норки [Текст] / М. В. Лаврентьева [и др.] // Докл. АН СССР. - 1989. - Т. 307, N 1. - С. 226-228 . - ISSN 0002-3264
Аннотация: Анализ одного из рекомбинантных фаговых клонов, выделенных из Х-хромосомной библиотеки американской норки (Mustela vison) выявил содержащуюся в нем В2-подобную повторяющуюся последовательность, названную Sau3А-повтором норки. Последовательность имеет длину 195 п. н., фланкирована короткими прямыми повторами по 14 п. н., содержит 2 бокса промотора РНК-полимеразы III и 3'-концевую А-богатую область, к-рая включает перекрывающиеся сигналы полиаденилирования (ААТААА), сигнал терминации транскрипции для РНК-полимеразы III (ТСТТТ) и завершается олиго (dA) последовательностью (А[8]). Интересной особенностью является наличие совершенного полипиримидинового тракта длиной 22 п. н., отсутствующего у известных Alu- и Alu-подобных последовательностей. Степень гомологии Sau3А-повтора норки с В2-повтором мыши составляет 55%. Sau3А-повтор представлен в геноме норки 1-2*10{5} копиями, распределен по всем хромосомам и обнаруживает тенденцию к скоплению в теломерных районах, наряду с относительно слабой представленностью у центромер. Дот-гибридизацией в жестких условиях показано, что близкие по структуре повторяющиеся последовательности распространены и в геномах других видов хищных. Библ. 14.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.23.59.02.11
Рубрики: ГЕНОМ
НОРКА

ДНК

СТРУКТУРА

В2-ПОВТОРЯЮЩАЯСЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

ЛОКАЛИЗАЦИЯ

СТЕПЕНЬ ГОМОЛОГИИ


Доп.точки доступа:
Лаврентьева, М.В.; Ривкин, М.И.; Шилов, А.Г.; Кобец, М.Л.; Рогозин, И.Б.; Серов, О.Л.


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 91.06-04Б1.32

    Shiu, Stephen Y. -W.

    Genomic sequence of the structural proteins of louping III virus: Comparative analysis with tick-borne encephalitis virus [Text] / Stephen Y. -W. Shiu, Martin D. Ayres, Ernest A. Gould // Virology. - 1991. - Vol. 180, N 1. - P411-415 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Геномные последовательности структурных белков вируса шотландского энцефаломиелита: сравнительный анализ с вирусом клещевого энцефалита
Аннотация: Проведено клонирование и секвенирование геномной РНК вируса шотландского энцефаломиелита (ВШЭ). При сравнении последовательностей с др. флавивирусами выявлена большая гомология по генам поверхностного белка с вирусами, переносимыми клещами, и с западным подтипом вируса клещевого энцефалита (ВКЭ). По генам внутренних белков степень гомологии между ВШЭ и западным подтипом ВКЭ была выше, чем между западным и дальневосточным подтипами ВКЭ. Предполагается, что ВШЭ и ВКЭ могут происходить от общего предшественника ВКЭ. Меньшая степень различий в аминокт-ных последовательностях среди представителей подгр. ВКЭ по сравнению с подгр. вирусов, переносимых комарами, предполагает разл. эволюционную иммуноселекцию у двух гр. вирусов. Великобритания, NERC Inst. of Virol. & Environ. Microbiol., Mansfield Road, Oxford OX1 3SR. Ил. 2. Табл. 1. Библ. 28.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ШОТЛАНДСКОГО ЭНЦЕФАЛОМИЕЛИТА
ВИРУС КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА

РНК

СЕКВЕНИРОВАНИЕ

СРАВНЕНИЕ

СТЕПЕНЬ ГОМОЛОГИИ


Доп.точки доступа:
Ayres, Martin D.; Gould, Ernest A.


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.06-04Б2.457

    Barkay, Tamar.

    Genes encoding mercuric reductases from selected gram-negative aquatic bacteria have a low degree of homology with merA of transposon Tn501 [Text] / Tamar Barkay, Mark Gillman, Cynthia Liebert // Appl. and Environ. Microbiol. - 1990. - Vol. 56, N 6. - P1695-1701 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Гены, кодирующие меркурииредуктазу у избранных грамотрицательных водных бактерий, имеют низкую степень гомологии с [геном] merA транспозона Tn501
Аннотация: При гибридизации в нестрогих условиях, допускающих образование гибридов между генами merA меркурийредуктазы (I) грамположительных и грамотрицательных бактерий, последовательности merA обнаружены в геномах 4 пресноводных и 4 морских бактерий, устойчивых к Hg{2}+. У всех 8 бактерий продемонстрирован индуцибельный переход Hg{2}+ в летучую форму. У 6 бактерий в неочищенных клеточных экстрактах содержится НАДФ-Н[2]-зависимая I. Эти данные позволяют предположить, что ген merA кодирует общий молекулярный механизм устойчивости к Hg{2}+ в аэробных гетеротрофных водных сообществах. Библ. 42. США, Microbial Ecology and Biotechnology Braanch, US Environmental Protection Agency, Gulf Breeze, FL 32561.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.23
Рубрики: PSEUDOMONAS (BACT.)
ТРАНСПОЗОНЫ

ТРАНСПОЗОН TN501

ЭВОЛЮЦИЯ

ГЕНЫ

ГЕН МЕРКУРИЙРЕДУКТАЗЫ MERA

ВОДНЫЕ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ

СТЕПЕНЬ ГОМОЛОГИИ

УСТОЙЧИВОСТЬ

РТУТЬ

ДНК-ДНК ГИБРИДИЗАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Gillman, Mark; Liebert, Cynthia


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 91.09-04Б1.110

   

    Structural homology among four nodaviruses as deduced by sequencing and X-ray crystallography [Text] / P. Kaesberg [et al.] // J. Mol. Biol. - 1990. - Vol. 214, N 2. - P423-435 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Структурная гомология у четырех нодавирусов, установленная с помощью секвенирования и рентгенокристаллографии
Аннотация: Геномные РНК2 нодавирусов кодируют один белок, являющийся предшественником вирионных белков 'бета' и 'гамма'. Сравнили нуклеотидные последовательности 4 нодавирусов насекомых: black beetle virus (вируса черного таракана; ВЧТ), flock house virus, boolarra virus и nodamura virus. Последовательности 4 РНК оказались похожими, что позволило идентифицировать гомологичные области, связанные с трансляцией и репликацией РНК. Эти вирусы, однако, различались по вторичной структуре их РНК. Картирование 4 белковых последовательностей на капсиде ВЧТ обнаружило значит. различия в аминокислотном составе на внешней поверхности. Картирование на внутренней поверхности капсида ВЧТ обнаружило высокую степень сохранения аминокислотных остатков, что указывает на то, что эта область почти идентична у всех 4 вирусов и обладает существенной ролью в созревании вириона. США, Inst. for Molecular Virol., Univ. of Wisconsin, Madison, WI 53706. Библ. 29.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: НОДАВИРУСЫ
НАСЕКОМЫЕ

ГЕНОМ

СТРУКТУРА

НЕУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

БЕЛКИ

АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

СТЕПЕНЬ ГОМОЛОГИИ


Доп.точки доступа:
Kaesberg, P.; Dasgupta, R.; Sgro, J.-Y.; Wery, J.-P.; Selling, B.H.; Hosur, M.V.; Johnson, J.E.


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 92.09-04Б1.407

    Eaton, W. D.

    Comparison of the DNA homologies of five salmonid herpesviruses [Text] / W. D. Eaton, W. H. Wingfield, R. P. Hedrick // Гебе кэнкю = Fish Pathol. - 1991. - Vol. 26, N 4. - P183-187
Перевод заглавия: Сравнение степени гомологии ДНК пяти герпесвирусов лососевых рыб
Аннотация: с помощью метода ДНК-ДНК гибридизации определяли степень гомологии последовательностей ДНК 5 изолятов герпесвирусов, поражающих лососевые рыбы. Использовали метод ДНК-ДНК гибридизации в р-ре с последующим гидролизом одноцепочечных молекул нуклеазой S1. {3}H-метку методом ник-трансляции вводили поочередно в каждую из 5 ДНК. Степень гомологии 5 исследуемых ДНК составляла от 90% до 45%. Авторы приходят к выводу, что 5 исследуемых герпесвирусов могут быть к двум типам одного вида. Авторы предлагают обозначать их как Herpesvirus salmonis тип 1 и тип 2. Канада, Malaspina College, 900 Fifth St., Nanaimo, British Columbia, V9R 5S5. Библ. 21.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.17.09
Рубрики: ВИРУСЫ РЫБ
ДНК ВИРУСНАЯ

ДНК-ДНК ГИБРИДИЗАЦИЯ

СТРУКТУРА

СТЕПЕНЬ ГОМОЛОГИИ

ГЕРПЕСВИРУСЫ

ЛОСОСЕВЫЕ РЫБЫ


Доп.точки доступа:
Wingfield, W.H.; Hedrick, R.P.


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 92.11-04Б1.391

   

    Host-independent evolution of the Hepadnavirus family [Text] / Yasuo Ina [et al.] // Annu. Rept/Nat. Inst. Genet., Jap. - 1990. - N 41. - P82 . - ISSN 0077-4995
Перевод заглавия: Независимая от хозяев эволюция в семействе гепаднавирусов
Аннотация: Для определения филогенетич. связей внутри семейства гепаднавирусов сравнивали последовательности нуклеотидов в геномных ДНК 25 изолятов вируса гепатита В и 10 изолятов других вирусов этой группы. Для сравнения использовали имеющиеся в лит-ре данные. На основании определения степеней гомологии ДНК гепаднавирусов построено филогенетич. древо, отражающее эволюцию вирусов этой группы. Эти данные показывают, что эволюция вирусов этого семейства не осуществлялась параллельно с эволюцией их хозяев. Показано, что у гепаднавирусов, как и у эукариотов наиболее частыми нуклеотидными заменами являются замены Ц на Т (и наоборот). В то же время у ретровирусов (к-рые как и гепаднавирусы используют стадию обратной транскрипции) наиболее частыми являлись замены между А и Г.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.21.07
Рубрики: ГЕПАДНАВИРУСЫ
ГЕНОМ

СТРУКТУРА

СТЕПЕНЬ ГОМОЛОГИИ

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВЯЗИ

ЭВОЛЮЦИЯ


Доп.точки доступа:
Ina, Yasuo; Mizokami, Masashi; Orito, Etsuro; Kameshima, Nobutoshi; Yamamoto, Masahiko; Moriyama, Etsuko N.; Gojobori, Takashi


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 93.03-04Б1.134

    Chen, Mei.

    Studies of the cloned 37-kDa subunit of activator 1 (replication factor C) of HeLa cells [Text] / Mei Chen, Z. -O. Pan, Jerard Hurwitz // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1992. - Vol. 89, N 12. - P5211-5215 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Изучение клонированной 37 кД-субъединицы активатора-1 (фактора репликации C) из клеток HeLa
Аннотация: Сообщается о выделении, клонировании, секвенировании и экспрессии в клетках E. coli гена, кодирующего 37 кД-субъединицу так называемого активатора-I из клеток HeLa. Этот активатор (называемый также фактором репликации С) необходим для репликации ДНК в клетках HeLa ДНК-полимеразами 'дельта' и 'эпсилон'. Этот активатор представляет собой фермент, состоящий из 5 типов субъединиц с мол. массой 145, 40, 38, 37 и 36,5 кД. В данной работе анализировали ген 37 кД-субъединицы и кодируемый этим геном белок. Обнаружено, что 37 кД-белок характеризуется значительной степенью гомологии последовательности с 40 кД-субъединицей активатора-I, а также некоторой гомологией с продуктом гена 44 фага Т4 и с 'тау' и 'гамма' субъединицами ДНК-полимеразы III E. coli. Несмотря на значительную гомологию 37 кД- и 40 кД-субъединиц, соответствующие поликлональные антитела не обладали перекрестной активностью. С помощью этих антител показано также, что для функционирования активатора-I необходима активность как 40 кД, так и 37 кД-субъединиц. США, Graduate Program in Molecular Biology, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, 1275 York Avenue, Box 97, NY 10021. Библ. 22.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ Т

ПРОДУКТЫ ГЕНА 44

ФАКТОР РЕПЛИКАЦИИ

АКТИВАТОР I

СТЕПЕНЬ ГОМОЛОГИИ


Доп.точки доступа:
Pan, Z.-O.; Hurwitz, Jerard


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 93.09-04Б1.314

   

    Genome affinities and epitope profiles of whitefly-transmitted geminiviruses from the Americas [Text] / M. M. Swanson [et al.] // Ann. Appl. Biol. - 1992. - Vol. 121, N 2. - P285-296 . - ISSN 0003-4746
Перевод заглавия: Степень сходства геномов и профили эпитопов переносимых белокрылками геминивирусов из Америки
Аннотация: Сравнивали степень сходства между собой и с аналогичными вирусами с других континентов у целой группы переносимых белокрылками двухкомпонентных геминивирусов из Сев., Юж. и Центр. Америки. Для сравнения использовали методы ДНК-ДНК гибридизации и иммуноферментные р-ции с использованием поли- и моноклональных антител. Сравнению подвергали 15 изолятов геминивирусов из Америки и 6 изолятов аналогич. вирусов из Европы, Африки и Азии. Обнаружено, что по всем исследованным параметрам американские геминивирусы оказывается в целом более близки между собой, чем с геминивирусами с др. континентов. Тем не менее, некоторые типы моноклональных антител к африканскому и индийскому вирусам мозаики кассавы не только реагировали с большинством изолятов американских геминивирусов, но и позволяли осуществлять их дифференциацию. Обсуждаются возможные пути эволюции этой группы вирусов. Великобритания, Scottish Crop Res. Inst., Invergowrie, Dundee DD2 5DA. Библ. 36.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.11
Рубрики: ГЕМИНИВИРУСЫ
БЕЛОКРЫЛКИ

ПЕРЕНОСЧИКИ

ГЕНОМ

СТЕПЕНЬ ГОМОЛОГИИ

ПРОФИЛИ ЭПИТОПОВ

АМЕРИКА


Доп.точки доступа:
Swanson, M.M.; Brown, J.K.; Poulos, B.T.; Harrison, B.D.


 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)