Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ<.>)
Общее количество найденных документов : 29
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-29 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.11-04Б2.20

    Blackall, Linda L.

    Phylogenetic analysis and taxonomic history of Nocardia pinensis and Nocardia amarae [Text] / Linda L. Blackall, Stephen C Barker, Philip Hugenholtz // Syst. and Appl. Microbiol. - 1995. - Vol. 17, N 4. - P519-525 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Филогенетический анализ и таксономическая история Nocardia pinensis и Nocardia amarae
Аннотация: Авторы исследовали актиномицеты Nocardia pinensis и Nocardia amarae, для к-рых трудно получить таксономические характеристики на основе хемотаксономических и нумерических данных. Секвенировали ген 16S рРНК (рДНК) типичных штаммов N. pinensis и N. amarae и сравнили полученные данные с таковыми для других актиномицетов. Показали, что N. amarae близкородственны Gordona terrae. N. pinensis тоже были наиболее близки G. terrae. Однако дальнейшие исследования показали, что N. pinensis могут не быть близко родственными роду Gordona. Австралия, Dep. of Microbiol., Univ. of Queensland, Brisbane, 4072. Ил. 1. Табл. 3. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.15.07
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ХАРАКТЕРИСТИКА

ХРОМОСОМЫ

СТРУКТУРА

РИБОТИПИРОВАНИЕ

ГЕН 16S РРНК

СТРУКТУРА

СРАВНЕНИЕ

NOCARDIA PINENSIS (BACT.)

NOCARDIA AMARAE (BACT.)


Доп.точки доступа:
Barker, Stephen C; Hugenholtz, Philip


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.12-04Б2.40

    Blackall, Linda L.

    Phylogenetic analysis and taxonomic history of Nocardia pinensis and Nocardia amarae [Text] / Linda L. Blackall, Stephen C Barker, Philip Hugenholtz // Syst. and Appl. Microbiol. - 1995. - Vol. 17, N 4. - P519-525 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Филогенетический анализ и таксономическая история Nocardia pinensis и Nocardia amarae
Аннотация: Авторы исследовали актиномицеты Nocardia pinensis и Nocardia amarae, для к-рых трудно получить таксономические характеристики на основе хемотаксономических и нумерических данных. Секвенировали ген 16S рРНК (рДНК) типичных штаммов N. pinensis и N. amarae и сравнили полученные данные с таковыми для других актиномицетов. Показали, что N. amarae близкородственны Gordona terrae. N. pinensis тоже были наиболее близки G. terrae. Однако дальнейшие исследования показали, что N. pinensis могут не быть близко родственными роду Gordona. Австралия, Dep. of Microbiol., Univ. of Queensland, Brisbane, 4072. Ил. 1. Табл. 3. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.15.07
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ХАРАКТЕРИСТИКА

ХРОМОСОМЫ

СТРУКТУРА

РИБОТИПИРОВАНИЕ

ГЕН 16S РРНК

СТРУКТУРА

СРАВНЕНИЕ

NOCARDIA PINENSIS (BACT.)

NOCARDIA AMARAE (BACT.)


Доп.точки доступа:
Barker, Stephen C; Hugenholtz, Philip


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.04-04Б2.118

   

    Polymorphism at the dnaK locus of Brucella species and identification of a Brucella melitensis species-specific marker [Text] / A. Cloeckaert [et al.] // J. Med. Microbiol. - 1996. - Vol. 45, N 3. - P200-205 . - ISSN 0022-2615
Перевод заглавия: Полиморфизм в локусе dnaK видов Brucella и идентификация видоспецифичного маркера Brucella melitensis
Аннотация: Ген dnaK и его фланговые области амплифицированы из типовых штаммов 6 видов Brucella методом ПЦР с праймерами, выбранными на основании известной последовательности гена dnaK B. ovis и изучен их полиморфизм с 9 рестрикц. эндонуклеазами. Полиморфизм обнаружен только в одном случае: у B. melitensis 16М имеется только один сайт EcoRV, а у остальных видов - 2 сайта. Отсутствие второго сайта EcoRV у B. melitensis подтверждено секвенированием ДНК. Второй сайт EcoRV у других видов Brucella расположен на сегменте длиной 12 п. н., отсутствующем в опубликованной последовательности гена dnaK B. ovis. Он расположен между стоп-кодоном гена dnaK и терминатором транскрипции. Различия между B. ovis 63/290 и B. melitensis 16М вызваны дополнительной парой нуклеотидов у B. melitensis. С использованием рестрикц. эндонуклеазы EcoRV изучен полиморфизм длины рестрикц. фрагмента локуса dnaK для 71 полевых, вакцинных и стандартных штаммов 6 видов Brucella. Подтверждено наличие уникального сайта EcoRV у штаммов B. melitensis. Саузерн-блот-гибридизация EcoRV-фрагментов геномной ДНК с зондом гена dnaK также указывает на особое положение B. melitensis. Эти методы могут быть применены для того, чтобы отличить штаммы B. melitensis от других видов Brucella. Франция, Lab. de Pathologie Infectiense et Immunol., INRA, 37380 Nouzilly. Библ. 23
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

СИСТЕМАТИКА

ГЕНОМ

СТРУКТУРА

ВИДОСПЕЦИФИЧНОСТЬ

ГЕН DNAK

ПОЛИМОРФИЗМ

BRUCELLA MELITENSIS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Cloeckaert, A.; Verger, J-M.; Grayon, M.; Grepinet, O.


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.04-04Б2.130

   

    Phylogeny of Bipolaris inferred from nucleotide sequences of Brn1, a reductase gene involved in melanin biosynthesis [Text] / Kiminori Shimizu [et al.] // J. Gen. and Appl. Microbiol. - 1998. - Vol. 44, N 4. - P251-258 . - ISSN 0022-1260
Перевод заглавия: Филогения Bipolaris, выведенная из нуклеотидных последовательностей гена редуктазы Brn1, участвующей в биосинтезе меланина
Аннотация: Секвенирован ген Brn1 редуктазы, участвующей в биосинтезе меланина, у 74 штаммов 22 видов р. Bipolaris. Область Brn1 высококонсервативна на нуклеотидном и аминок-тном уровнях. Филогенетич. анализ показал, что виды образуют кластеры, четко отделенные друг от друга, с 2 исключениями: 1) B. panici-mili-acei и B. setaria; 2) B. victoria и B. zeicola. Неидентифицированные штаммы попадают в известные виды или образуют независимые кластеры. Эти данные показали, что область Brn1 пригодна для видовой систематики p. Bipoliaris, и позволили предположить, что этот род состоит из 2 и более клейдов, что может отражать телеоморфные связи. Япония, Graduate Sch. Agr., Kyoto Univ., Kyoto 608-8502. Библ. 22
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

КЛАСТЕРЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

ГЕНЫ

ГЕН РЕДУКТАЗЫ BRN1

НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ

BIPOLARIS PANICI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Shimizu, Kiminori; Tanaka, Chihiro; Peng, You-Liang; Tsuda, Mitsuya


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 01.08-04В2.220

   

    Phylogeny of Bipolaris inferred from nucleotide sequences of Brn1, a reductase gene involved in melanin biosynthesis [Text] / Kiminori Shimizu [et al.] // J. Gen. and Appl. Microbiol. - 1998. - Vol. 44, N 4. - P251-258 . - ISSN 0022-1260
Перевод заглавия: Филогения Bipolaris, выведенная из нуклеотидных последовательностей гена редуктазы Brn1, участвующей в биосинтезе меланина
Аннотация: Секвенирован ген Brn1 редуктазы, участвующей в биосинтезе меланина, у 74 штаммов 22 видов р. Bipolaris. Область Brn1 высококонсервативна на нуклеотидном и аминок-тном уровнях. Филогенетич. анализ показал, что виды образуют кластеры, четко отделенные друг от друга, с 2 исключениями: 1) B. panici-mili-acei и B. setaria; 2) B. victoria и B. zeicola. Неидентифицированные штаммы попадают в известные виды или образуют независимые кластеры. Эти данные показали, что область Brn1 пригодна для видовой систематики p. Bipoliaris, и позволили предположить, что этот род состоит из 2 и более клейдов, что может отражать телеоморфные связи. Япония, Graduate Sch. Agr., Kyoto Univ., Kyoto 608-8502. Библ. 22
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.29.15.17.02
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

КЛАСТЕРЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

ГЕНЫ

ГЕН РЕДУКТАЗЫ BRN1

НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ

BIPOLARIS PANICI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Shimizu, Kiminori; Tanaka, Chihiro; Peng, You-Liang; Tsuda, Mitsuya


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI47) 03.02-04И7.60

    Seebass, Christian.

    Zum Vorkommen ausgewahlter Nagetier- und Spitzmausarten (Insectivora: Soricidae/Rodentia: Muridae, Arvicolidae) in Niedersachsen und Bremen [Text] / Christian Seebass // Abh. Naturwiss. Ver. Bremen. - 2001. - Vol. 45, N 1. - S83-98 . - ISSN 0340-3718
Перевод заглавия: Распространение отдельных видов грызунов и насекомоядных (Soricidae, Muridae, Arvicolidae) в Нижней Саксонии и Бремене
Аннотация: Данные о встречаемости отдельных видов мелких млекопитающих в Нижней Саксонии и Бремене, полученные на основе анализа погадок сов, по сведениям волонтеров и из последних публикаций. Выяснилось, что ареал Crocidura leucodon отодвинулся на С.-В. Наоборот С. russula и Sorex coronatus расширили ареал; на нек-рых участках обнаружена высокая численность последнего вида. Эти данные обсуждаются в связи с биотопическим предпочтением близких видов S. coronatus и S. araneus. Neomys fodiens, чувствительная к загрязнению воды и нарушениям местообитаний; тем не менее широко распространена на исследуемой территории. Сведения о Apodemus flavicollis сдвигают границы распространения этого вида в зап. направлении A. agrarius и Microtus subterraneus плохо прослеживаются в погадках. Эти виды были найдены в пределах их известных ареалов. Германия, FB Biol./Chemie, Abt. Ethol. Univ. Osnabruck Barbaarastr. 1, D-49069. Ил. 8. Табл. 2. Библ. 79
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.33.27.21.21
Рубрики: ГРЫЗУНЫ
НАСЕКОМОЯДНЫЕ

РАСПРОСТРАНЕНИЕ

ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ВСТРЕЧАЕМОСТЬ В ПОГАДХОХНОВ

НИЖНЯЯ САКСОНИЯ, БРЕМЕН



7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.06-04Б2.313

    Spiers, Andrew J.

    The causes of Pseudomonas diversity [Text] / Andrew J. Spiers, Angus Buckling, Paul B. Rainey // Microbiology. - 2000. - Vol. 146, N 10. - P2345-2350 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Причины разнообразия Pseudomonas
Аннотация: Обзор. Рассмотрены экологические (существование вакантных ниш и конструкция) и генетические (мутация и рекомбинация) причины разнообразия видов Pseudomonas. Великобритания, Dep. Plant Sci., Univ. Oxford, Oxford OX1 3RB. Библ. 50
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.31.99
Рубрики: ПОПУЛЯЦИИ
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

РАЗНООБРАЗИЕ

ПРИЧИНЫ

ВАКАНТНЫЕ НИШИ

КОНКУРЕНЦИЯ

МУТАЦИИ

ОБЗОРЫ

БИБЛ. 50

PSEUDOMONAS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Buckling, Angus; Rainey, Paul B.


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 03.06-04Б4.134

    Spiers, Andrew J.

    The causes of Pseudomonas diversity [Text] / Andrew J. Spiers, Angus Buckling, Paul B. Rainey // Microbiology. - 2000. - Vol. 146, N 10. - P2345-2350 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Причины разнообразия Pseudomonas
Аннотация: Обзор. Рассмотрены экологические (существование вакантных ниш и конструкция) и генетические (мутация и рекомбинация) причины разнообразия видов Pseudomonas. Великобритания, Dep. Plant Sci., Univ. Oxford, Oxford OX1 3RB. Библ. 50
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.11
Рубрики: ПОПУЛЯЦИИ
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

РАЗНООБРАЗИЕ

ПРИЧИНЫ

ВАКАНТНЫЕ НИШИ

КОНКУРЕНЦИЯ

МУТАЦИИ

ОБЗОРЫ

БИБЛ. 50

PSEUDOMONAS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Buckling, Angus; Rainey, Paul B.


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.06-04Б2.241

   

    Molecular characterisation of the species of the genus Zygosaccharomyces [Text] / Braulio Esteve-Zarzoso [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2003. - Vol. 26, N 3. - P404-411 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Молекулярная характеристика видов рода Zygosaccharomyces
Аннотация: При помощи методов RFLP митохондриальной ДНК и ПЦР-амплифицированных участков внутренних транскрибируемых спейсеров и 5,8 S рРНК, а также электрофоретического кариотипирования проведен анализ 40 штаммов, принадлежащих к 10 видам рода Zygosassharomyces, включая и новый вид Z. lentus. Были получены специфичные рестрикционные профили района ITS - 5,8 S для каждого из изучаемых видов дрожжей, за исключением Z. cidri и Z. fermentati. Электрофоретическое кариотипирование подтвердило различия между видами этого рода и позволило разделить филогенетически близкие виды Z. cidri и Z. fermentati. Испания, Dep. de Biotecnol., Inst. de Argoquimica y Tecnologia de Alimentos (CSIC), Burgassot, Valencia. Библ. 18
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.11.02
Рубрики: ГЕНОТИП
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ГЕНОТИПИРОВАНИЕ

КАРИОТИПИРОВАНИЕ

РИБОТИПИРОВАНИЕ

ZYGOSACCHAROMYCES LENTUS (FUNGI)


Доп.точки доступа:
Esteve-Zarzoso, Braulio; Zorman, Tina; Belloch, Carmela; Querol, Amparo


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.07-04Б2.168

   

    Identification and differentiation of species and strains of Arthrobacter and Microbacterium barkeri isolated from smear cheeses with amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) and pulsed field gel electrophoresis (PFGE) [Text] / T. S. Hoppe-Seyler [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2003. - Vol. 26, N 3. - P438-444 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Идентификация и дифференциация видов и штаммов Arthrobacter и Microbacterium barkeri, выделенных из слизи сыров посредством рестрикционного анализа амплифицированной рибосомной ДНК (ARDRA) и пульс-электрофореза (PFGE)
Аннотация: ARDRA (рестрикционный анализ амплифицированной рибосомной ДНК) был использован, чтобы дифференцировать виды Arthrobacter и Microbacteria и определить разницу между родами. Видоспецифические рестрикционные образцы ПЦР-продуктов были получены с помощью Nci I для Arthrobacter citreus (DSM 20133{T}), A. sulfureus (DSM 20167{T}), A. globiformis (DSM 20124{T}) и штаммов A. nicotianae (DSM 20123{T}, MGE 10D, CA 13, CA14, изолят 95 293, 95 294 и 95 299), A. rhombi CCUG 38813{T} и CCUS 38812 и для штаммов Microbacterium barkeri (DSM 30123{T}, MGE 10D, CA12 и CA15, изолят 95 292 и изолят 95 207). Все пигментированные желтого цвета коринеформы бактерий, изолированные из слизи поверхности созревающих сыров были идентифицированы либо как штаммы A. nicotianae или как штаммы M. barkeri. При использовании пульс-электрофореза (PFGE) и рестриктаз Asc I и Spe I были получены штаммоспецифические рестрикционные образцы для всех видов Arthrobacter и протестированных видов Microbacteria. Германия, Federal Dairy Res. Centre, Inst. of Microbiol., Kiel. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ПИТАНИЕ
СОЗРЕВАЮЩИЙ СЫР

СЛИЗЕВАЯ ПОВЕРХНОСТЬ

МИКРОФЛОРА

ГЕНОТИП

РИБОТИПИРОВАНИЕ

ОТДЕЛЬНЫЕ ШТАММЫ

ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

MICOBACTERIUM BARKERI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Hoppe-Seyler, T.S.; Jaeger, B.; Bockelmann, W.; Noordman, W.H.; Geis, A.; Heller, K.J.


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI47) 04.09-04И7.43

   

    Phylogenetic relatioships of Chinese antelopes (subfamily Antilopinae) based on mitochondrial ribosomal RNA gene sequences [Text] / Runhua Lei [et al.] // J. Zool. - 2003. - Vol. 261, N 3. - P227-237 . - ISSN 0952-8369
Перевод заглавия: Филогенетические взаимоотношения китайских антилоп (подсемейство Antilopinae) на основании анализа последовательностей генов митохондриальных рРНК
Аннотация: Получены последовательности фрагментов 2 митохондриальных генов (440 н. п. гена 12S рРНК и 590 н. п. гена 16S рРНК) для 5 видов подсем. Antilopinae (Procapra przewalskii, P. gutturosa, P. picticaudata, Gazella gutturosa, и Saiga tatarica) и 2 видов подсем. Caprinae - Pantholops hodgsoni, Hemitragus jemlahicus. Средняя вариабельность последовательностей 8,4% ('+-'0.7%), и варьировала от 0.5% до 13.3%. Вариабельность последовательностей между видами рода Procapra по гену 12S рРНК - 1.4% ('+-'0.5%) и по гену 16S рРНК-1.1% ('+-'0.6%). Филогенетический анализ поддерживает монофиллетическое происхождение рода Procapra и его включение подсем. Antilopinae, и большую близость дзерена Пржевальского к монгольскому дзерену (P. gutturosa), чем к тибетскому дзерену (P. picticaudata). Т. обр., дзерен Пржевальского должна трактоваться как отдельный вид, а не подвид тибетского дзерена. КНР, Inst. of Zool., Ch. Ac. of Sci., Beijing, 100080. Ил. 2. Табл. 2. Библ. 56
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.33.27.21.17
Рубрики: АНТИЛОПЫ
ANTILOPINAE (MAMM.)

МОЛЕКУЛЯРНАЯ ФИЛОГЕНИЯ

МИТОХОНДРИАЛЬНЫЕ РРНК

ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ГЕНОВ

СИСТЕМАТИКА

PROCAPRA GUTTUROSA (MAMM.)

PROCAPRA PICTICAUDATA (MAMM.)

ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ


Доп.точки доступа:
Lei, Runhua; Jiang, Zhigang; Hu, Zhiang; Yang, Wenlong


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.10-04Б2.164

   

    Identification of Bifidobacterium species using rep-PCR fingerprinting [Text] / Liesbeth Masco [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2003. - Vol. 26, N 4. - P557-563 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Идентификация видов Bifidobacterium с помощью фингерпринтов rep-ПЦР
Аннотация: Оценили применимость rep-ПЦР фингерпринтирование для дифференциации широкого ряда бифидобактерий. Для этого сравнили несколько наборов праймеров для амплификации повторяющихся ДНК-последовательностей: BOX, ERIC, (GTG)[5] и REP. Показали, что BOXAIR - самый оптимальный праймер для установления таксономической структуры 80 типов бифидобактерий и референтных штаммов. Провели BOX-ПЦР-идентификацию 48 неизвестных бифидобактерий, выделенных из пробиотических продуктов и фекальных образцов. Авторы рассматривают rep-ПЦР-фингерпринтирование с использованием праймера BOXAIR, как перспективный инструмент для идентификации широкого ряда бифидобактерий. Бельгия, Lab. of Microbiol., Dep. of Biochemistry, Physiology and Microbiol., Ghent Univ., K. L. Ledeegancksraat 35, B-9000 Gent. Ил. 1. Библ. 28
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОТИП
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

МЕТОДЫ

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ REP-ПЦР

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

РАЗЛИЧНЫЕ ПРАЙМЕРЫ

РАЗРАБОТКА

BIFIDOBACTERIUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Masco, Liesbeth; Huys, Geert; Gevers, Dirk; Verbrugghen, Leen; Swings, Jean


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.10-04Б4.72

    Kwok, Anita Y. C.

    Phylogenetic study of Staphylococcus and Macrococcus species based on partial hsp60 gene sequences [Text] / Anita Y. C. Kwok, Anthony W. Chow // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2003. - Vol. 53, N 1. - P87-92 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Филогенетическое исследование видов Staphylococcus и Macrococcus на основе частичных последовательностей гена hsp60
Аннотация: Провели ПЦР-амплификацию фрагмента (600 п. н.) гена hsp60 у 44-х референтных штаммов различных стафилококков и макрококков. На основе hsp60-последовательностей определили филогенетические связи у исследованных организмов и сравнили их с таковыми на основе 16Sp РНК-последовательностей. Обнаружили высокую степень конкордантности между дендрограммами, основанными на указанных последовательностях. Показали, что по сравнению с геном 16Sp РНК ген hsp60 более дивергентный и дискриминирующий при видовой дифференциации штаммов Staphylococcus и Macrococcus. Рассматривается возможность использования гена hsp60 в качестве альтернативной мишени для таксономических и филогенетических исследований членов этих родов. Канада, Division of Infectious Dis., Dep. of Med., Microbiol. and Immunology Univ. of British Columbia, Vancouver. Ил. 2. Библ. 32
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.19.09
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ДЕНДРОГРАММЫ

ГЕНОТИП

ГЕНОТИПИРОВАНИЕ

ГЕН HSP60 ТЕПЛОВОГО ШОКА

РИБОТИПИРОВАНИЕ

СРАВНЕНИЕ

STAPHYLOCOCCUS (BACT.)

MACROCOCCUS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Chow, Anthony W.


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.10-04Б4.89

   

    Identification of Bifidobacterium species using rep-PCR fingerprinting [Text] / Liesbeth Masco [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2003. - Vol. 26, N 4. - P557-563 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Идентификация видов Bifidobacterium с помощью фингерпринтов rep-ПЦР
Аннотация: Оценили применимость rep-ПЦР фингерпринтирование для дифференциации широкого ряда бифидобактерий. Для этого сравнили несколько наборов праймеров для амплификации повторяющихся ДНК-последовательностей: BOX, ERIC, (GTG)[5] и REP. Показали, что BOXAIR - самый оптимальный праймер для установления таксономической структуры 80 типов бифидобактерий и референтных штаммов. Провели BOX-ПЦР-идентификацию 48 неизвестных бифидобактерий, выделенных из пробиотических продуктов и фекальных образцов. Авторы рассматривают rep-ПЦР-фингерпринтирование с использованием праймера BOXAIR, как перспективный инструмент для идентификации широкого ряда бифидобактерий. Бельгия, Lab. of Microbiol., Dep. of Biochemistry, Physiology and Microbiol., Ghent Univ., K. L. Ledeegancksraat 35, B-9000 Gent. Ил. 1. Библ. 28
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.25.99
Рубрики: ГЕНОТИП
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

МЕТОДЫ

ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ REP-ПЦР

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

РАЗЛИЧНЫЕ ПРАЙМЕРЫ

РАЗРАБОТКА

BIFIDOBACTERIUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Masco, Liesbeth; Huys, Geert; Gevers, Dirk; Verbrugghen, Leen; Swings, Jean


15.
Патент 6747141 Соединенные Штаты Америки, МКИ C12Q 1/68.

    Brentano, Steven T.
    Methods and compositions for detection of mycobacterium avium complex species [Текст] / Steven T. Brentano, Roger L. Lankford ; Gen-Probe Inc. - № 09/738972 ; Заявл. 15.12.2000 ; Опубл. 08.06.2004
Перевод заглавия: Методы и реактивы, необходимые для определения видов комплекса Mycobacterium avium (патент США)
Аннотация: В патенте представлены методы для детекции видов комплекса Mycobacterium avium с использованием амплификации in vitro нуклеиновых кислот и олигонуклеотидов, специфичных для последовательностей 16S рРНК или последовательностей ДНК, кодирующих 16S рРНК. Описан набор химических соединений и реактивов, содержащий олигонуклеотиды для амплификации и детекции 16S рРНК или соответствующих ДНК. США, Gen-Probe Incorporated, San Diego, CA. Библ. 12
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.25.09
Рубрики: БОЛЕЗНИ
ТУБЕРКУЛЕЗ ПТИЦ

ВОЗБУДИТЕЛЬ

ДИАГНОСТИКА

ГЕНОТИП

ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

РИБОТИПИРОВАНИЕ

МЕТОД

РАЗРАБОТКА

ПАТЕНТЫ

США

2004 Г.

MYCOBACTERIUM AVIUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Lankford, Roger L.; Gen-Probe Inc.
Свободных экз. нет

16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.09-04Б2.287

   

    Identification of Lactobacillus alimentarius and Lactobacillus farciminis with 16S-23S rDNA intergenic spacer region polymorphism and PCR amplification using species-specific oligonucleotide [Text] / C. N. Rachman [et al.] // J. Appl. Microbiol. - 2003. - Vol. 95, N 6. - P1207-1216 . - ISSN 1364-5072
Перевод заглавия: Идентификация Lactobacillus alimentarius и Lactobacillus farciminis методом полиморфизма межгенного спейсерного района 16S-23S рДНК и ПЦР-амплификации с использованием видоспецифичных олигонуклеотидов
Аннотация: Использовали метод полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (RELP) для дифференциации видов Lactobacillus, имеющих высокую идентичность в межгенном спейсерном районе 16S-23S рДНК. Этот район амплифицировали с помощью праймеров tAla и 23S/p10, затем обработали рестриктазами Hin fl и Taq I проанализировали методом электрофореза. Обработка рестриктазой Taq I позволила выявить пять различных образцов и разделить виды, не удалось лишь отделить Lact. plantarum от Lact. paraplantarum. Спейсерный район 16S-23S рДНК L. farciminis и L. alimentarius амплифицировали, клонировали в векторе pCR{(R)} 2*1 и секвенировали. Проанализировали полученные последовательности и создали на их основе видо-специфичные праймеры. Специфичность была позитивно продемонстрирована, поскольку не получили ответа от 14 других протестированных видов. Следовательно, видо-специфичные праймеры могут использоваться для идентификации видов L. farciminis и L. alimentarius среди других лактобацилл. RELP-профили могут использоваться для разделения L. farciminis, L. alimentarius, L. sakei, L. curvatus и L. plantarum
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОТИП
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

МЕТОДЫ

ВИДОСПЕЦИФИЧНЫЕ ОЛИГОНУКЛЕОТИДЫ

СИНТЕЗ

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

ПЦР-АМПЛИФИКАЦИЯ

LACTOBACILLUS ALIMENTARIUS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Rachman, C.N.; Kabadjova, P.; Prevost, H.; Dousset, X.


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.09-04Б2.348

   

    Distinguishing Ophiostoma ips and Ophiostoma montium, two bark beetle-associated sapstain fungi [Text] / J. -J. Kim [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 2003. - Vol. 222, N 2. - P187-192 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Различие Ophiostoma ips и Ophiostoma monitium, двух грибов, связанных с жуками-короедами
Аннотация: Два похожих вида Ophiostoma ips и Ophiostoma monitium, связанные с Dendroctonus ponderosae и различными жуками-короедами, соответственно, дифференцировали на два отдельных вида по росту и молекулярным характеристикам. Анализ 32 изолятов двух видов из разных стран показал, что O. ips способен расти при 35'ГРАДУС'C, а O. montium нет. Это деление подтвердили данными по секвенированию внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS), 5,8 S и частично 28 S рДНК и генов b-тубулина. Данные по b-тубулину показывают, что эти два вида можно легко дифференцировать с помощью ПЦР
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.11.17.03
Рубрики: ГЕНОТИП
ГЕНОТИПИРОВАНИЕ

ГЕН ТУБУЛИНА B

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

УСТОЙЧИВОСТЬ

ТЕМПЕРАТУРНЫЙ ШОК

ТАКСОНОМИЯ

ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

OPHIOSTOMA IPS (FUNGI)


Доп.точки доступа:
Kim, J.-J.; Kim, S.H.; Lee, S.; Breuil, C.


18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.11-04Б2.329

   

    Organization of mitochondrial DNA in the basidiomycetous Dioszegia hungarica (Cryptococcus hungaricus) species [Text] / Attila Gacser [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 2002. - Vol. 212, N 1. - P1-6 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Организация митохондриальной ДНК в базидиомицетах Dioszegia hungarica (Cryptococcus hungaricus)
Аннотация: Исследовали организацию митохондриальной ДНК в коллекции из 6 штаммов базидиомицетов Dioszegia hungarica (Cryptococcus hungaricus). Построили физические и частично функциональные карты. Два штамма (CBS 6324 и 6576) были идентичными, а три других (CBS 4214, 5124, 6953) отличались не только по распределению сайтов рестрикции, но и по порядку генов. Шестой штамм CBS 6569 имел уникальную организацию митохондриального генома. Его mtДНК разделялась на 8 полос в агарозном геле без обработки энзимами. Эти молекулы несли митохондриальные гены. Показали, что они имеют высоко гомологичные последовательности. Подобная уникальная организация наблюдалась в штамме Cystofilobasidium capitatum, что свидетельствовало о том, что CBS 6569 относится к Cystofilobasidium. Венгрия, Dep. of Microbiol., Faculty of Sci., Univ. of Szeged, P.O. Box 533, H-6701 Szeged
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.11.17.11
Рубрики: ДНК МИТОХОНДРИАЛЬНАЯ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

ФИЗИЧЕСКОЕ КАРТИРОВАНИЕ

ФУНКЦИОНАЛЬНОЕ КАРТИРОВАНИЕ

ФИЛОГЕНИЯ

ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

DIOSZEGIA HUNGARICA (FUNGI)


Доп.точки доступа:
Gacser, Attila; Hamari, Zsuzsanna; Pfeiffer, Ilona; Litter, Judit; Kevei, Ferenc; Kucsera, Judit


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.12-04Б2.259

    Conejero, M. J.U.

    Isolation of partial toxR gene of Vibrio harveyi and design of toxR -targeted PCR primers for species detection [Text] / M. J.U. Conejero, C. T. Hedreyda // J. Appl. Microbiol. - 2003. - Vol. 95, N 3. - P602-611 . - ISSN 1364-5072
Перевод заглавия: Выделение части гена toxR Vibrio harveyi и создание toxR-специфичных ПЦР праймеров для выявлении данного вида
Аннотация: ПЦР с вырожденными праймерами удалось выделить 578 п. н. фрагмент гена toxR Vibrio harveyi. Сравнение нуклеотидной последовательности данного фрагмента и предсказанной аминокислотной последовательности его продукта с гомологичными участками гена toxR других вибрионов выявило присутствие в нем консервативных участков, определяющих активацию транскрипции и трансмембранный домен, а также дивергентный район, взаимодействующий с мембраной, который и было предложено использовать для конструирования видо-специфичных ПЦР праймеров. Показано, что продукт ПЦР с данным праймером - 390-членный ампликон присутствовал во всех изученных штаммах V. harveyi. Т. обр., по последовательности гена toxR можно отличить V. harveyi от других видов вибрионов
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ТАКСОНОМИЯ
ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

ГЕНЫ

ГЕН TOXR

ВИДО-СПЕЦИФИЧНЫЕ ПРАЙМЕРЫ

VIBRIO HARVEYI (BACT.)

БОЛЕЗНИ

БОЛЕЗНИ РЫБ

ВОЗБУДИТЕЛЬ

ДИАГНОСТИКА


Доп.точки доступа:
Hedreyda, C.T.


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.01-04Б2.192

    Konstantinidis, Konstantinos T.

    Genomic insights that advance the species definition for prokaryotes [Text] / Konstantinos T. Konstantinidis, James M. Tiedje // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2005. - Vol. 102, N 7. - P2567-2572 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Изучение состава генома для успешного определения видов прокариот
Аннотация: Для более успешного определения видов прокариот сравнили состав генов в 70 родственных и секвенированных бактериальных геномах, чтобы идентифицировать наличие возможных связей между видами и определить влияние экологии организмов на содержание генома. Установили, что средняя нуклеотидная идентичность (ANI) генов между двумя штаммами может служить для сравнения связи между штаммами, а значения ANI около 94% соответствуют традиционному 70% стандарту родства ДНК-ДНК при определении видов. Сходство между группами может достигать 98-99% ANI, показывая высокую идентичность на нуклеотидном уровне. Наличие большой фракции, имеющей до 65% различий в генном составе внутри видов, связано с бактериофагами и транспозонами, что свидетельствует о важной роли этих элементов для выделения бактериальных видов. Полученные результаты свидетельствуют, что определение видов должно включать более гомогенные наборы штаммов и учитывать экологию штаммов помимо их эволюционного расхождения. США, Center for Microbial Ecology, and Dep. of Crop and Soil Sci. and Microbiol. and Mol. Genetics, Michigan State Univ., East Lansing, MI 48824. Библ. 34
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

ОТДЕЛЬНЫЕ ВИДЫ

ОПРЕДЕЛЕНИЕ

ЭКОЛОГИЯ

СТРУКТУРА ГЕНОМА

ВЛИЯНИЕ

БАКТЕРИОФАГИ

ТРАНСПОЗОНЫ

SALMONELLA BOGNORI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Tiedje, James M.


 1-20    21-29 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)