Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=БИОИНФОРМАТИКИ<.>)
Общее количество найденных документов : 13
Показаны документы с 1 по 13
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.06-04А3.976

   
    The EBI SRS server- new features [Text] / Evgeny M. Zdobnov [et al.] // Bioinformatics. - 2002. - Vol. 18, N 8. - P1149-1150 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Сервер SRS Европейского Института Биоинформатики. Новые черты
Аннотация: Обсуждаются последние усовершенствования сервера SRS (http://srs.ebi.ac.uk). SRS стал интегрированной системой для поиска данных и анализа последовательностей. Через сервер SRS можно войти в главные молекулярно-биологические базы данных, поддерживаемые Европейским Институтом биоинформатики, и базы данных MEDLINE Национальной медицинской библиотеки США. Новые выпуски SRS содержат: концепцию виртуальных баз данных, интегрированные базы данных XML, подобно InterPro, онтологии генов GO, MEDLINE, Metabolic Pathways и т. п. Великобритания, EMBL Outstation - European Bioinformatics Inst., Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 1SD. Библ. 3
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БИОИНФОРМАТИКА
МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ БАЗЫ ДАННЫХ
MEDLINE
СЕРВЕР SRS
ЕВРОПЕЙСКИЙ ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ
ПОСЛЕДНИЕ УСОВЕРШЕНСТВОВАНИЯ
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Zdobnov, Evgeny M.; Lopez, Rodrigo; Apweiler, Rolf; Etzold, Thure

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 03.09-04Я6.79

    Bickmore, Wendy A.
    Addressing protein localization within the nucleus [Text] / Wendy A. Bickmore, Heidi G. E. Sutherland // EMBO Journal. - 2002. - Vol. 21, N 6. - P1248-1254 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Адресовка локализации белка внутри ядра
Аннотация: Краткий обзор. Имеется расхождение между числом последовательностей генов в базах данных и числом продуктов генов, функционально охарактеризованных тем или иным образом. Ключевой исходной характеристикой белков для выяснения их функции является их внутриклеточная локализация. Локализацию белков в клетках млекопитающих можно определить многими методами. Однако базы данных геномов теперь содержат последовательности большого числа до сих пор не исследованных белков, и эти последовательности сами по себе позволяют определить их внутриклеточную локализацию. Рассматривается вопрос о возможности методами биоинформатики проанализировать последовательности белков с известной внутриядерной локализацией и выявить особенности и признаки, позволяющие предсказать локализацию новых белков. Великобритания, MRC Human Genet. Unit, Edinburgh EH4 2XU. Библ. 30
ГРНТИ  
34.19.19
ВИНИТИ 341.19.19.01
Рубрики: БЕЛОК
ВНУТРИКЛЕТОЧНАЯ ЛОКАЛИЗАЦИЯ
МЕТОДЫ ОПРЕДЕЛЕНИЯ
ВНУТРИЯДЕРНЫЕ БЕЛКИ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ АМИНОКИСЛОТ
АНАЛИЗ
МЕТОДЫ БИОИНФОРМАТИКИ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 30

Доп.точки доступа:
Sutherland, Heidi G.E.

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.11-04А3.730

   
    The European Bioinformatics Institute's data resources [Text] / Catherine Brooksbank [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 1. - P43-50 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Ресурсы данных Европейского института биоинформатики
Аннотация: Европейский институт биоинформатики (EBI) поддерживает 6 основных баз данных, хранящих информацию о последовательностях ДНК (EMBL-Bank), последовательностях белков (SWISS-PROT и TrEMBL), структуре белков (MSD), целых геномах (Ensembl) и экспрессии генов (ArrayExpress). Разработан ряд средств, которые не только облегчают помещение и поиск биологической информации, но и позволяют пользователям осуществлять поиск взаимосвязей между разными видами информации. Все базы данных и средства доступны на сайте http://www.ebi.ac.uk. Великобритания, EMBL-European Bioinformatics Inst., Wellcome Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 1SD. Библ. 35
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
БЕЛОК
ДНК
ГЕНОМЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СТРУКТУРА
БАЗЫ ДАННЫХ
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ
ЕВРОПЕЙСКИЙ ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ

Доп.точки доступа:
Brooksbank, Catherine; Camon, Evelyn; Harris, Midori A.; Magrane, Michele; Martin, Maria Jesus; Mulder, Nicola; O'Donovan, Claire; Parkinson, Helen; Tuli, Mary Ann; Apweiler, Rolf

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.11-04А3.732

   
    E-MSD: The European Bioinformatics Institute Macromolecular Structure Database [Text] / H. Boutselakis [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 1. - P458-462 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: E-MSD - база данных о макромолекулярных структурах Европейского института биоинформатики
Аннотация: База данных E-MSD (http://www.ebi.ac.uk/msd) создана как единый сетевой ресурс, содержащий данные о структурах белков и нуклеиновых кислот и связанную с ними информацию. E-MSD создана на базе файлов базы белковых данных PDB. Для обеспечения единообразия представления данных по всему архиву использована технология сравнительных баз данных. Поисковая база данных содержит обширный набор свойств, показателей качества и связей с такими базами данных Европейского института биоинформатики, как InterPro, GO и SWISS-PROT, а также с базами данных SCOP, CATH, PFAM и PROSITE. Поисковая система связана с быстрым средством поиска доменов по вторичной структуре. Великобритания, EMBL - European Bioinformatics Inst., Wellcome Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 1SD. Библ. 32
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БЕЛОК
НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ
СТРУКТУРА
БАЗА ДАННЫХ E-MSD
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ
ЕВРОПЕЙСКИЙ ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ

Доп.точки доступа:
Boutselakis, H.; Dimitropoulos, D.; Fillon, J.; Golovin, A.; Henrick, K.; Hussain, A.; Ionides, J.; John, M.; Keller, P.A.; Krissinel, E.

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.03-04А3.465

   
    ExPASy: The proteomics server for in-depth protein knowledge and analysis [Text] / Elisabeth Gasteiger [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 13. - P3784-3788 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: ExPASy - сервер по протеомике для углубления знаний и анализа белков
Аннотация: Сетевой сервер ExPASy (http://www.expasy.org) поддерживается межотраслевой группой при Швейцарском институте биоинформатики. ExPASy обеспечивает доступ к разным базам данных и средствам анализа белков и протеомов, таким как SWISS-PROT, TrEMBL, SWISS-2DPAGE, PROSITE, ENZYME и SWISS-MODEL. Аналитические средства предназначены для специфических задач протеомики, поисков сходства, поисков шаблонов и профилей, предсказания посттрансляционной модификации, предсказания топологии, анализа первичной, вторичной и третичной структуры и сопоставления последовательностей. Помимо главного сайта, имеется 7 зеркальных сайтов, расположенных на разных континентах. Швейцария, Swiss Inst. Bioinformatics, Ctr. Med. Universitaire, 1211 Geneva 4. Библ. 27
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БЕЛОК
ПРОТЕОМИКА
АНАЛИЗ СТРУКТУРЫ
ПРЕДСКАЗАНИЕ
ШВЕЙЦАРСКИЙ ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ
СЕТЕВОЙ СЕРВЕР EXPASY
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Gasteiger, Elisabeth; Gattiker, Alexandre; Hoogland, Christine; Ivanyi, Ivan; Appel, Ron D.; Bairoch, Amos

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.10-04А3.928

   
    The European Bioinformatics Institute web site: A new view [Text] / Rodrigo Lopez [et al.] // Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 4. - P546-547 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Web-сайт Европейского института биоинформатики (EBI): новый дизайн
Аннотация: EBI и внешняя европейская лаборатория молекулярной биологии переделали свой web-сайт (http://www.ebi.ac.uk/) во второй раз с 1997 года из-за увеличившихся запросов пользователей, а также для обеспечения большей информативности и облегчения доступа к различным сервисам. Великобритания, УЬИД Outstation the European Bioinformatics Inst., Hinxton Hall, Cambrodge CB10 1SD. Библ. 13
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: КОМПЬЮТЕРНЫЕ МЕТОДЫ
WEB-САЙТ
ЕВРОПЕЙСКИЙ ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ

Доп.точки доступа:
Lopez, Rodrigo; Robinson, Stephen; Kibria, Asif; Harte, Nicola; Patel, Gulam; Harper, Rob; Quevillon, Emmanuel; Silventoinen, Ville; Kallio, Kimmo; Jokinen, Petteri

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.10-04А3.965

   
    Public services from the European Bioinformatics Institute [Text] / Rodrigo Lopez [et al.] // Brief. Bioinf. - 2003. - Vol. 4, N 4. - P332-340 . - ISSN 1467-5463
Перевод заглавия: Публичные службы Европейского института биоинформатики
Аннотация: Европейский институт биоинформатики поддерживает ряд бесплатных доступных служб по биоинформатике, которые можно подразделить на следующие категории: перекачка по ftp; обработка поступающей информации и формирование биологических баз данных; доступ по запросу; анализ и исправление систем и программ; поддержка пользователей; тренировка и обучение и поддержка промышленного применения с помощью программы SME. Все эти службы доступны в интернете. Великобритания, Eur. Inst. Bioinformatics, Wellcome Trust. Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 1SD. Библ. 54
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БИОИНФОРМАТИКА
ЕВРОПЕЙСКИЙ ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ
БЕСПЛАТНЫЕ ПУБЛИЧНЫЕ СЛУЖБЫ
БИОЛОГИЧЕСКИЕ БАЗЫ ДАННЫХ
ФОРМИРОВАНИЕ
ДОСТУП ПО ЗАПРОСУ

Доп.точки доступа:
Lopez, Rodrigo; Duggan, Karyn; Harte, Nicola; Kibria, Asif

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 05.05-04А3.962

   
    Анализ дифференциальной экспрессии EST в клетках гепатоклеточной карциномы методами биоинформатики [Text] / Xiangyu Chen [et al.] // Zhengzhou daxue xuebao. Yixueban = J. Zhengzhou Univ. Med. Sci. - 2004. - Vol. 39, N 2. - С. 238-241 . - ISSN 1671-6825
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
EST
ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ ЭКСПРЕССИЯ
ГЕПАТОКЛЕТОЧНАЯ КАРЦИНОМА
АНАЛИЗ МЕТОДАМИ БИОИНФОРМАТИКИ
КОМПЬЮТЕРНЫЕ ПРОГРАММЫ
ПОИСК НОВЫХ ГЕНОВ

Доп.точки доступа:
Chen, Xiangyu; Duan, Fangling; Li, Jiansheng; Zhu, Wuling; Han, Zeguang; Xue, Lexun

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI08) 06.06-04Я6.7

    Васьков, Ю. И.
    Сравнительный анализ ГТФ-связывающих сайтов тубулина [Текст] / Ю. И. Васьков, В. Е. Стефанов // Вестн. С.-Петербург. ун-та. Сер. 3. - 2004. - N 2. - С. 58-67, 126 . - ISSN 0321-186X
Аннотация: Методами биоинформатики (множественное выравнивание аминокислотных последовательностей, визуализация пространственной структуры молекулы и трехмерное выравнивание) проанализированы все полностью расшифрованные аминокислотные последовательности 'альфа'- и 'бета'-тубулинов из доступных банков данных. Использованы программы ClustalX и DeepView/Swiss-PdbViewer. Создана база данных аминокислотных последовательностей, представляющая 200 видов и включающая 162 последовательности 'альфа'-тубулинов и 256 последовательностей 'бета'-тубулинов. По трехмерной модели молекулы тубулина определены аминокислоты, удаленные от ГТФ не более чем на 6A, способные прямо или посредством связанной воды вступать с ним в контакт. Составлена таблица аминокислот, образующих активный центр, и возможных замен. По результатам пространственного выравнивания субъединиц - и 'бета'-тубулина, установлено, что аминокислоты, формирующие в них центры связывания ГТФ, практически идентичны и, следовательно, функциональная неэквивалентность субъединиц непосредственно не связана с особенностями структуры самих ГТФ-центров. В свете выявленных замен в 'альфа'-тубулине K254 на E, а в 'бета'-тубулине - E254 на K проанализирована гипотетическая роль перекрестных взаимодействий с участием обеих субъединиц в активности димера. Трехмерное выравнивание 'альфа'- и 'бета'-тубулина позволяет задать положение иона магния в активном центре -a-тубулина, что создает базу для последующих квантовохимических расчетов. Примененные методы анализа могут быть использованы для планирования и прогнозирования экспериментов по сайт-направленному мутагенезу. Россия, С.-Петерб. ун-т, С.-Петербург. Библ. 14
ГРНТИ  
34.19.05
ВИНИТИ 341.19.05.99
Рубрики: ТУБУЛИН 'АЛЬФА'
ТУБУЛИН 'БЕТА'
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЫРАВНИВАНИЕ
ГТФ-СВЯЗЫВАЮЩИЕ САЙТЫ
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ
МЕТОДЫ БИОИНФОРМАТИКИ

Доп.точки доступа:
Стефанов, В.Е.

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 06.06-04А3.900

    Одинець, К. О.
    Аналiз неструктурованих дiлянок цитоплазматичноi тирозил-тРНК синтетази людини методами бiоiнформатики [Текст] / К. О. Одинець, О. I. Корнелюк // Бiополiмери i клiтина. - 2005. - Vol. 21, N 5. - С. 446-453 . - ISSN 0233-7657
Перевод заглавия: Анализ неструктурированных участков цитоплазматической тирозил-тРНК-синтетазы человека методами биоинформатики
Аннотация: Проведено предсказание неструктурированных участков тирозил-тРНК-синтетазы млекопитающих методами биоинформатики с использованием 15 веб-серверов. Показана высокая вероятность неструктурированного состояния для подвижной "KMSKS"-петли каталитического центра (остатки Pro216-Lys231), приобретающей определенную конформацию во время каталитического акта. Для участка межмодульного линкера (остатки Asp343-Glu359) определена наибольшая возможность его неструктурированного состояния. Сравнение этих данных с величинами B-факторов C['альфа']-атомов кристаллографических структур N- и С-концевых модулей демонстрирует удовлетворительную корреляцию с результатами кристаллографического анализа. Наличие гибкого межмодульного линкера является характерной особенностью белков, содержащих EMAP II-подобный C-концевой модуль. Предложена гипотеза о том, что конформационные перестройки в линкерной области могут играть существенную роль при формировании комплексов этих белков с тРНК. Украина, Ин-т молек. биол. и генетики НАНУ, Киев. Библ. 27
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: ТИРОЗИЛ-ТРНК-СИНТЕТАЗА
ПЕТЛЯ АКТИВНОГО ЦЕНТРА
УЧАСТОК МЕЖМОДУЛЬНОГО ЛИНКЕРА
НЕСТРУКТУРИРОВАННЫЕ УЧАСТКИ
ПРЕДСКАЗАНИЕ
МЕТОДЫ БИОИНФОРМАТИКИ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Корнелюк, О.I.

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 06.07-04А3.2

   
    New trends in bioinformatics: from genome sequence to personalized medicine [Text] / R. Molidor [et al.] // Exp. Gerontol. - 2003. - Vol. 38, N 10. - P1031-1036 . - ISSN 0531-5565
Перевод заглавия: Новые тенденции в биоинформатике: от геномной последовательности к персонифицированной медицине
Аннотация: Молек. медицина требует интеграции и анализа геномных, молек., клеточных и клинических данных и ставит много задач биоинформатике, играющей существенную роль в таких интеграционных процессах. Эволюция биоинформатики началась с анализа последовательностей и дошла до генома в целом, расширяя обл. приложений и интеграции, в конце концов, до персонифицированной медицины. Очерчены основные и наиболее обещающие тенденции в биоинформатике, к-рые могут играть основную роль в будущих биол. открытиях и мед. приложениях.
ГРНТИ  
34.55.01
ВИНИТИ 341.55.01.21
Рубрики: ИНФОРМАТИКА
БИОИНФОРМАТИКИ
НОВЫЕ ТЕНДЕНЦИИ
ИНТЕГРАЦИЯ БИОЛОГИЧЕСКИХ ДАННЫХ
ПЕРСОНИФИЦИРОВАННАЯ МЕДИЦИНА

Доп.точки доступа:
Molidor, R.; Sturn, A.; Maurer, M.; Trajanoski, Z.

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 06.08-04А3.919

   
    Public web-based services from the European Bioinformatics Institute [Text] / Nicola Harte [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2004. - Vol. 32, прил. Web Serv. issue. - PW3-W9 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Публичные сетевые службы Европейского института биоинформатики
Аннотация: Задачей Европейского института биоинформатики (EBI) при Европейской лаборатории молекулярной биологии в Гейдельберге является публичное обеспечение информацией по молекулярной биологии и исследованию генома научного сообщества. Для этого EBI поддерживает различные бесплатные широко доступные службы, обеспечивающие в сети возможности обработки, запросов, систем анализа и поиска; возможности перекачки по ftp программ и баз данных; обучение и поддержку пользователей. Все эти службы доступны в интернете по адресу: http://www.ebi.ac.uk/services. В статье дано введение в системы интерактивного анализа и некоторые другие сетевые службы EBI. Запросы по адресу: ris@ebi.ac.uk. Библ. 32
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БИОИНФОРМАТИКА
ЕВРОПЕЙСКИЙ ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ
ПУБЛИЧНЫЕ СЕТЕВЫЕ СЛУЖБЫ
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Harte, Nicola; Silventoinen, Ville; Quevillon, Emmanuel; Robinson, Stephen; Kallio, Kimmo; Fustero, Xavier; Patel, Pravin; Jokinen, Petteri; Lopez, Rodrigo

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.04-04Б2.226

   
    Новая стратегия масштабной идентификации антисмысловых транскриптов Pseudomonas aeruginosa с использованием метода защиты от PHKазы I [Текст] / Zhaohui Yang [и др.] // Молекул. биол. - 2007. - Т. 41, N 4. - С. 640-646 . - ISSN 0026-8984
Аннотация: Природные антисмысловые транскрипты широко распространены в клетках и про-, и эукариот, где они участвуют в регуляции экспрессии генов-мишеней. Однако до настоящего времени эффективная идентификация природных антисмысловых транскриптов с высоким выходом была невозможна из-за отсутствия подходящей экспериментальной методики. На основе метода защиты от РНКазы I мы разработали стратегию, которая позволяет проводить широкомасштабную идентификацию природных антисмысловых транскриптов в клетках Pseudomonas aeruginosa. Кодируемые хромосомой природные антисмысловые транскрипты выделили из суммарной РНК штамма P. aeruginosa АТСС 6872 и клонировали их с использованием простого и эффективного метода. В результате получили клонотеку генов природных антисмысловых транскриптов. Определили нуклеотидные последовательности 78 выбранных случайным образом позитивных клонов и проанализировали их методами биоинформатики. Гены нескольких предполагаемых природных антисмысловых транскриптов точно локализованы в геноме P. aeruginosa АТСС 6872. Можно предположить, что в клетках P. aeruginosa АТСС 6872 существует механизм регуляции экспрессии генов, в котором участвуют природные антисмысловые транскрипты. КНР, Dep. of Microbiology, College of Medicine, The Third Military Medical Univ., Key Lab of Microbial Engineering Under the Educational Committee in Chongqing, ChongQing 400038. Библ. 15
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: АНТИСМЫСЛОВЫЕ ТРАНСКРИПТЫ
ПРИРОДНЫЕ
ШИРОКОМАСШТАБНАЯ ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ОСНОВА
ЗАЩИТА ОТ РНКАЗЫ
КЛОНОТЕКА
ГЕНЫ ПРИРОДНЫХ АНТИСМЫСЛОВЫХ ТРАНСКРИПТОВ
ПОЛУЧЕНИЕ
АНАЛИЗ
МЕТОД БИОИНФОРМАТИКИ
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Yang, Zhaohui; Jin, Xiaolin; Rao, Xiancai; Cheng, Xiaocing; Hu, Fuquan
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)