Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>A=Harayama, Shigeaki$<.>)
Общее количество найденных документов : 63
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-60   61-63 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.05-04Б2.40

   

    Acanthopleuribacter pedis gen. nov., sp. nov., a marine bacterium isolated from a chiton, and description of Acanthopleuribacteraceae fam. nov., Acanthopleuribacterales ord. nov., Holophagaceae fam. nov., Holophagales ord. nov. and Holophagae classis nov. in the phylum 'Acidobacteria' [Text] / Yukiyo Fukunaga [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2008. - Vol. 58, N 11. - P2597-2601 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Acanthopleuribacter pedis gen. nov., sp. nov., морская бактерия, выделенная с хитона и описание Acanthopleuribacteraceae fam. nov., Acanthopleuribacterales ord. nov., Holophagaceae fam. nov., Holophagales ord. nov. и Holophagae classis nov. в филе `Acidobacteria'
Аннотация: Штамм FYK2218 выделен с панцирного моллюска Acanthopleura japonica на берегу полуострова Босо в Японии. Согласно филогенетическому анализу последовательностей 16S-рРНК штамм был отнесен к филе `Acidobacteria'. Штамм был наиболее близок к Holophaga foetida TMBS4 и Geothrix fermentans H-5 в подразделе 8 ацидобактерий. Штамм был представлен мезофильными, строго аэр. подвижными грамотрицательными палочками. Содержание Г+Ц составляло 56,7 мол% с главными изопреновыми хинонами MK-6 и MK-7 и характерным набором жирных к-т. Штамм классифицируется как Acanthopleuribacter pedis gen. nov., sp. nov. в составе новых семейства, порядка и класса. Описано также новое сем. Holopahaceae. Япония, Inst. of Molec. and Cellular Bioscis., Univ. of Tokyo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0032 (E-mail: fukunaga-yukiyo@nite.go.jp)
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: ACANTHOPLEURIBACTER PEDIS GEN. NOV. SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ПАНЦИРНОГО МОЛЛЮСКА

НОВЫЕ РОДЫ

НОВЫЕ ВИДЫ

HOLOPHAGACEAE FAM. NOV. (BACT.)

НОВЫЕ СЕМЕЙСТВА

ОПИСАНИЕ


Доп.точки доступа:
Fukunaga, Yukiyo; Kurahashi, Midori; Yanagi, kensuke; Yokota, Akira; Harayama, Shigeaki


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.09-04Б2.247

   

    Activity and population structure of nitrifying bacteria in an activated-sludge reactor containing polymer beads [Text] / Jun-ichi Tanaka [et al.] // Environ. Microbiol. - 2003. - Vol. 5, N 4. - P278-286 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Активность и строение популяции нитрифицирующих бактерий в реакторе с активным илом, содержащим полимерные бусинки
Аннотация: В лабораторный реактор с активным илом из муниципальных стоков добавляли бусинки, полученные полимеризацией на свету. Изучали влияние бусинок на степень нитрификации. Загрузка аммиаком обеспечивала начальную скорость образования N, равную 0,02 кг/м{3}/сут, к-рая постепенно возрастала. Если в реактор вносили бусинки, наблюдали почти полное окисление аммиака (95%) при скорости окисления 0,216 кг/м{3}/сут. В отсутствие бусинок скорость окисления составляла 0,096 кг/м{3}/сут. В различных условиях загрузки определяли возможности нитрификации как суспендированных, так и связанных с бусинками микроорганизмов (СБМ). Показали более высокую степень нитрификации при наличии в реакторе СБМ в сравнении с условиями, когда в тех же условиях присутствовали бусинки, не несущие микроорганизмов. Изучали изменения в популяциях в режимах с суспендированными бусинками и с СБМ. Применяли методы молекулярного анализа 16S-рРНК с помощью ЭФ в геле (DGGE), а также метод флуоресценции при гибридизации in situ с использованием группоспецифических праймеров. Среди известных нитрификаторов были выявлены окисляющие аммиак 'бета'-протеобактерии и организмы, родственные Nitrospira. Не исключается, что в условиях высокой загрузки реактора в нитрификацию вовлекаются и другие организмы
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.15 + 341.27.05.09
Рубрики: НИТРИФИЦИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ
АКТИВНОСТЬ

СТРОЕНИЕ ПОПУЛЯЦИИ

АКТИВНЫЙ ИЛ

МУНИЦИПАЛЬНЫЕ СТОКИ

ИММОБИЛИЗОВАННЫЕ КЛЕТКИ

БИОРЕАКТОРЫ


Доп.точки доступа:
Tanaka, Jun-ichi; Syutsubo, Kazuaki; Watanabe, Kazuya; Izumida, Hitoshi; Harayama, Shigeaki


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.03-04Б2.218

    Hara, Akihiro.

    Alcanivorax which prevails in oil-contaminated seawater exhibits broad substrate specificity for alkane degradation [Text] / Akihiro Hara, Kazuaki Syutsubo, Shigeaki Harayama // Environ. Microbiol. - 2003. - Vol. 5, N 9. - P746-753 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: [Бактерии] Alcanovorax, преобладающие в морских водах, загрязненных нефтью, проявляют широкую субстратную специфичность в расщеплении алканов
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.15 + 341.27.23.09
Рубрики: МОРСКАЯ ВОДА
НЕФТЯНЫЕ ЗАГРЯЗНЕНИЯ

ALCANIVORAX BORKUMENSIS (BACT.)

АЛКАНЫ

БИОДЕГРАДАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Syutsubo, Kazuaki; Harayama, Shigeaki


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 08.06-04Б3.118

    Hara, Akihiro.

    Alcanivorax which prevails in oil-contaminated seawater exhibits broad substrate specificity for alkane degradation [Text] / Akihiro Hara, Kazuaki Syutsubo, Shigeaki Harayama // Environ. Microbiol. - 2003. - Vol. 5, N 9. - P746-753 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: [Бактерии] Alcanovorax, преобладающие в морских водах, загрязненных нефтью, проявляют широкую субстратную специфичность в расщеплении алканов
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.21
Рубрики: МОРСКАЯ ВОДА
НЕФТЯНЫЕ ЗАГРЯЗНЕНИЯ

ALCANIVORAX BORKUMENSIS (BACT.)

АЛКАНЫ

БИОДЕГРАДАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Syutsubo, Kazuaki; Harayama, Shigeaki


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.07-04Б2.464

    Harayama, Shigeaki.

    Bacterial aromatic ring-cleavage enzymes are classified into two different gene families [Text] / Shigeaki Harayama, Monique Rekik // J. Biol. Chem. - 1989. - Vol. 264, N 26. - P15328-15333 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Ферменты расщепления ароматического кольца у бактерий классифицированы в два различных семейства генов
Аннотация: Диоксигеназы разделяются на 2 группы: экстра- и интрадиоловые ферменты, различающиеся по способу расщепления ароматич. кольца. Определена полная нуклеотидная последовательность гена nah C, кодирующего структурный ген 1,2-диоксинафталиндиоксигеназы (Д) и локализованного в плазмиде NAH 7 Pseudomonas putida. Мол. м. белка, соотв-щего данной нуклеотидной последовательности, равна 33,882. При изучении продукта гена nah C с помощью макси-клеток мол. м. данного белка была равна 36 000. При сравнении аминокислотных последовательностей Д с др. экстрадиоловыми диоксигеназами показано, что гомология с 2,3-диоксибифенилдиоксигеназой составляет 50%, а с катехол-2,3-диоксигеназой - 16%. Статистич. анализ подтвердил, что данные ферменты эволюционно родственны и относятся к одному суперсемейству. Аминокислотная последовательность данных экстрадиоловых диоксигеназ не имеет какого-либо значительного сходства с интрадиоловыми диоксигеназами. Ил. 7. Табл. 2. Библ. 34. Швейцария, Dep. of Medical Biochemistry, Univ. Medical Centerf, 1, rue Michel-Servet, 1211 Geneva 4.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ПЛАЗМИДА NAH7

ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ

ГЕН ДИОКСИНАФТАЛИНОКСИГЕНАЗЫ*1,2-NAHC

НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

ДИОКСИГЕНАЗЫ

ЭКСТРАДИОЛОВЫЕ

ИНТРАДИОЛОВЫЕ ФЕРМЕНТЫ

АМИНОКИСЛОТНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

ФУНКЦИИ

КЛАССИФИКАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Rekik, Monique


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.09-04Б2.118

    Iwabuchi, Tukuro.

    Biochemical and genetic characterization of trans-2'-carboxybenzalpyruvate hydratase-aldolase from a phenanthrene-degrading Nocardioides strain [Text] / Tukuro Iwabuchi, Shigeaki Harayama // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 4. - P945-949 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Биохимическая и генетическая характеристика транс-2'-карбоксибензальпируватгидратазы-альдолазы из разрушающего фенантрен штамма Nocardioides
Аннотация: Из разрушающего фенантрен штамма KP7 Nocardioides sp. выделен очищенный препарат транс-2'-карбоксибензальпируватгидратазы-альдолазы (I). Мол. масса I равна 38 кД при ЭФ в полиакриламидном геле в присутствии додецилсульфата Na и 113 кД при гель-фильтрации. Т. обр. активная I является тетрамером субъединицы с мол. м. 38 кД. I превращает транс-2'-карбоксибензальпируват в 2-карбоксибензальдегид и пируват с K[M]=50 мкМ и k[cat]=13 сек{-1}. Клонирован и секвенирован ген I длиной 996 п. н., продукт к-рого гомологичен I из Pseudomonas putida Pp67 и Pseudomonas sp. C18. Япония, Marine Biotechnol. Inst., Kamaishi Labs., Kamaishi, Iwate 026. Библ. 31
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ТРАНС-2'-КАРБОКСИБЕНЗАЛЬПИРУВАТГИДРАТАЗА-АЛЬДОЛАЗА
ВЫДЕЛЕНИЕ

ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА

ГЕНЫ

ГЕН ФЕРМЕНТА

КЛОНИРОВАНИЕ

СЕКВЕНИРОВАНИЕ

NOCARDIOIDES (BACT.)

SP. РАЗРУШЕНИЕ

ФЕНАНТРЕН


Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.10-04Б2.55

    Iwabuchi, Tokuro.

    Biochemical and molecular characterization of 1-hydroxy-2-naphthoate dioxygenase from Nocardioides sp. KP7 [Text] / Tokuro Iwabuchi, Shigeaki Harayama // J. Biol. Chem. - 1998. - Vol. 273, N 14. - P8332-8336 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Биохимическая и молекулярная характеристика 1-гидрокси-2-нафтоат-диоксигеназы из Nocardioides sp. KP7
Аннотация: Из клеток Nocardioides sp. KP7, деградирующих фенантрены, выделена 1-гидрокси-2-нафтоат-диоксигеназа (ОНД), катализирующая разрыв гидроксилированных ароматических колец. Очищенная ОНД имеет мол. м. 45 кД и 270 кД, по данным электрофореза в ПААГ-SDS и гель-фильтрации соответственно. Окисление 1 моля 1-окси-2-нафтоата в ОНД р-ции сопряжено с утилизацией 1 моля молекулярного кислорода. ОНД содержит 1 моль Fe(II)/моль субъединицы, инактивируется о-фенантролином и реактивируется FeSO[4] и аскорбиновой к-той. Из космидной библиотеки геномной ДНК штамма-продуцента ОНД выделен клон гена ОНД, имеющего длину 1161 п. н., и определена его нуклеотидная последовательность, к-рая не имеет сходства с другими генами, кодирующими ОНД-подобные диоксигеназы. Япония, Marine Biotechnol. Inst., Kamaishi Lab., Iwate 026. Библ. 16
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: 1-ГИДРОКСИ-2-НАФТОАТ-ДИОКСИГЕНАЗА
ОЧИСТКА

ЭЛЕКТРОФОРЕЗ

NOCARDIOIDES SP. KP7


Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI17) 96.12-04И1.350

   

    Biochemical characterization of a Ca{2+}-dependent lectin from the hemolymph of a photosymbiotic marine bivalve, Tridacna derasa (Roding) [Text] / Satoshi Odo [et al.] // J. Biochem. - 1995. - Vol. 117, N 5. - P965-973 . - ISSN 0021-924X
Перевод заглавия: Биохимическая характеристика Ca{2+}-зависимого лектина из гемолимфы фотосимбиотического морского двустворчатого Tridacna derasa
Аннотация: Из гемолимфы фотосимбиотического двустворчатого Tridacna derasa очищен Ca{2+}-зависимый лектин, к-рый составляет 80% от кол-ва белков гемолимфы. Мол. масса лектина в его нативной форме, проявляющей гемагглютинирующую активность, составляет 480 кДа. В денатурирующих условиях в присутствии 2-меркаптоэтанола лектин мигрирует при электрофорезе в виде двух полос с мол. массами 23 и 46 кДа. По-видимому, субъединицы связаны дисульфидными мостиками с образованием нативного лектина. Получены результаты, указывающие на то, что пептид с мол. массой 46 кДа является гомодимером субъединиц с мол. массой 26 кДа, к-рые связаны ковалентной связью, отличной от дисульфидной связи. Значение K[a] для кальция составляет 0,88 мМ, причем ионы кальция необходимы для активности лектина. Гемагглютинирующая активность лектина быстро уменьшается при рН ниже 6,5, но быстро повышается до начального уровня при нейтрализации р-ра. Определена последовательность 29 аминок-тных остатков N-конца. Обнаружена гомология с некоторыми Ca{2+}-зависимыми лектинами животных С-типа. Япония, Marine Biotechnol. Inst., Kamaishi Lab., 3-75-1 Heita, Kamaishi, Iwate 026. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.33.15.35.11.29
Рубрики: ЛЕКТИНЫ
КАЛЬЦИЙ-ЗАВИСИМЫЕ

ГЕМОЛИМФА

МОРСКИЕ ДВУСТВОРЧАТЫЕ


Доп.точки доступа:
Odo, Satoshi; Kamino, Kei; Kanai, Satoru; Maruyama, Tadashi; Harayama, Shigeaki


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 03.01-04Б3.188

    Dutta, Tapan K.

    Biodegradation of n-alkylcycloalkanes and n-alkylbenzenes via new pathways in Alcanivorax sp. strain MBIC 4326 [Text] / Tapan K. Dutta, Shigeaki Harayama // Appl. and Environ. Microbiol. - 2001. - Vol. 67, N 4. - P1970-1974 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Новые пути биодеградации n-алкилциклоалканов и n-алкилбензолов в Alcanivorax sp. штамм MBIC 4326
Аннотация: Изучена деградация длинноцепочечных n-алкилциклоалканов и n-алкилбензолов посредством Alcanivorax sp. штамм MBIC 4326. Главным образом 'бета'-окислению подвергается алкильная боковая цепь этих соединений. При деградации n-алкилциклоалканов в качестве интермедиата образуется циклогексанкарбоновая кислота. Далее это соединение трансформируется в бензойную кислоту через 1-циклогексен-1-карбоновую кислоту. Япония, Marine Biotechnol. Inst., 3-75-1 Heita, Kamaishi, Iwate 026-0001. Библ. 31
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.17.11
Рубрики: ОХРАНА ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ
УГЛЕВОДОРОДЫ

БИОДЕГРАДАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

N-АЛКИЛЦИКЛОАЛКАНЫ

N-АЛКИЛБЕНЗОЛЫ

ALCANIVORAX SP. (BACT.)

ШТАММ MBIC 4326

БИОКОНВЕРСИЯ


Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.179

    Iwabuchi, Tokuro.

    Biolochemical and genetic characterization of 2-carboxybenzaldehyde dehydrogenase, an enzyme involved in phenanthrene degradaion by Nocardioides sp. strain KP7 [Text] / Tokuro Iwabuchi, Shigeaki Harayama // J. Bacteriol. - 1997. - Vol. 179, N 20. - P6488-6494 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Биохимическая и генетическая характеристика 2-карбоксибензальдегиддегидрогеназы - фермента, участвующего в деградации фенантрена Nocardioides sp, штамм KP7
Аннотация: Очищена и изучена 2-карбоксибензальдегиддегидрогеназа (I) Nocardioides sp. KP7. I имеет мол. м. 53 кД при электрофорезе в денатурирующих условиях и 205 кД при гель-фильтрации, так что активная 1 является гомотетрамером. I имеет K[M] и k[cat], равные соотв. 100 мкМ и 39 сек{-1} для 2-карбоксибензальдегида и 83 мкМ и 32 сек{-1} для НАД{+}. Клонирован и секвенирован сегмент генома штамма КР7 длиной 10279 п. н., содержащий ген I (phdK) длиной 1455 п. н. Обнаружены 7 открытых рамок считывания: phdI (1-окси-2-нафтоатдиоксигеназа), phdJ (транс-2'-карбоксибензальпируватальдолаза), orf1, phdK I, orf2/orf3 и orf4. Продукт orf1 похож на продукт гена pcaK транспортера ароматич. углеводородов у Pseudomonas putida PRS2000, а продукт orf4 - на цитохром P-450. Гены orf2 и orf3 перекрываются на разных нитях и кодируют белки, не имеющие гомологов в банках данных. Япония, Marine Biotechnol. Inst., Kamaishi Labs., Kamaishi, Iwate 026. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ФЕНАНТРЕН
ДЕГРАДАЦИЯ

2-КАРБОКСИБЕНЗАЛЬДЕГИДДЕГИДРОГЕНАЗА

ОЧИСТКА

ХАРАКТЕРИСТИКА

ГЕНОМ

СЕГМЕНТ

КЛОНИРОВАНИЕ

СЕКВЕНИРОВАНИЕ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

ГЕН PHDK

NOCARDIOIDES (BACT.)

SP, ШТАММ KP7


Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.01-04Б2.31

   

    Calditerrivibrio nitroreducens gen. nov., sp. nov., a thermophilic, nitrate-reducing bacterium isolated from a terrestrial hot spring in Japan [Text] / Takao Iino [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2008. - Vol. 58, N 7. - P1675-1679 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Calditerrivibrio nitroreducens gen. nov., sp. nov., термофильная, нитратредуцирующая бактерия, выделенная из наземного горячего источника в Японии
Аннотация: Из горячего водного источника, Юмата, Нагано, Япония, выделили умеренно термофильную, нитратредуцирующую бактерию, штамм Yu37-1{T}. Клетки изолята строго анаэр., грамотрицательные, неспорообразующие, подвижные за счет единственного полярного жгутика, вибриоподобной формы и 1,4-2,0 мкм в длину. Т-ра и рН для оптимального роста были 55'ГРАДУС'C и рН 7,0-7,5, соответственно. Изолят рос лучше всего на основной среде без добавления NaCl. Приведены хемотаксономические признаки. Филогенетический анализ, основанный на последовательности 16S рРНК, показал, что изолят может быть отнесен к сем. Deferribacteraceae, и что его ближайшие соседи - члены пяти родов сем. Deferribacteraceae, а именно, Deferribacter, Denitrovibrio, Flexistipes, Geovibrio и Mucispirillum, со сходствами всего 83,2-86,2%. Т-ра роста и диапазон солености штамма отличались от таковых филогенетически родственных организмов. На основании фенотипических признаков и филогенетического положения предлагаются новый род и вид, Calditerrivibrio nitroreducens gen. nov., sp. nov. Типовой штамм Yu37-1{T}
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: CALDITERRIVIBRIO NITROREDUCENS GEN. NOV., SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ГОРЯЧЕГО ВОДНОГО ИСТОЧНИКА

СИСТЕМАТИКА

НОВЫЕ РОДЫ

НОВЫЕ ВИДЫ


Доп.точки доступа:
Iino, Takao; Nakagawa, Tatsunori; Mori, Koji; Harayama, Shigeaki; Suzuki, Ken-ichiro


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 10.04-04Б3.137

   

    Calditerrivibrio nitroreducens gen. nov., sp. nov., a thermophilic, nitrate-reducing bacterium isolated from a terrestrial hot spring in Japan [Text] / Takao Iino [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2008. - Vol. 58, N 7. - P1675-1679 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Calditerrivibrio nitroreducens gen. nov., sp. nov., термофильная, нитратредуцирующая бактерия, выделенная из наземного горячего источника в Японии
Аннотация: Из горячего водного источника, Юмата, Нагано, Япония, выделили умеренно термофильную, нитратредуцирующую бактерию, штамм Yu37-1{T}. Клетки изолята строго анаэр., грамотрицательные, неспорообразующие, подвижные за счет единственного полярного жгутика, вибриоподобной формы и 1,4-2,0 мкм в длину. Т-ра и рН для оптимального роста были 55'ГРАДУС'C и рН 7,0-7,5, соответственно. Изолят рос лучше всего на основной среде без добавления NaCl. Приведены хемотаксономические признаки. Филогенетический анализ, основанный на последовательности 16S рРНК, показал, что изолят может быть отнесен к сем. Deferribacteraceae, и что его ближайшие соседи - члены пяти родов сем. Deferribacteraceae, а именно, Deferribacter, Denitrovibrio, Flexistipes, Geovibrio и Mucispirillum, со сходствами всего 83,2-86,2%. Т-ра роста и диапазон солености штамма отличались от таковых филогенетически родственных организмов. На основании фенотипических признаков и филогенетического положения предлагаются новый род и вид, Calditerrivibrio nitroreducens gen. nov., sp. nov. Типовой штамм Yu37-1{T}
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.23
Рубрики: CALDITERRIVIBRIO NITROREDUCENS GEN. NOV., SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ГОРЯЧЕГО ВОДНОГО ИСТОЧНИКА

СИСТЕМАТИКА

НОВЫЕ РОДЫ

НОВЫЕ ВИДЫ


Доп.точки доступа:
Iino, Takao; Nakagawa, Tatsunori; Mori, Koji; Harayama, Shigeaki; Suzuki, Ken-ichiro


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.08-04Б2.288

   

    Characterization of five genes in the upper-pathway operon of TOL plasmid pWW0 from Pseudomonas putida and identificatio of the gene products [Text] / Shigeaki Harayama [et al.] // J. Bacteriol. - 1989. - Vol. 171, N 9. - P5048-5055 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Характеристика пяти генов в верхнем опероне TOL плазмиды pWWO из Pseudomonas putida и идентификация генных продуктов
Аннотация: Генетическая организация верхнего оперона (BO) TOL плазмиды pWWO Pseudomonas putida охарактеризовали с помощью клонирования ВО и идентификации их продуктов в максиклетках Escherichia coli. Этот анализ показал, что ВО содержит, по крайней мере, 5 генов в следующем порядке: xylC-xylM-xylA-xylB-xylN. Между промотором ВО и xylC находится промежуток ДНК в 1,7 т. п. н., для к-рого не обнаружили никакой генной функции. Между xylC и xylN большая часть ДНК содержит кодирующие последовательности. xylC, xylM и xylA кодируют полипептиды 57, 35 и 40 кД соответственно. xylN кодирует полипептид 52 кД с неизвестной функцией. Библ. 29. Табл. 1. Ил. 10. Швейцария, Dept of Medical Biochemistry, Faculty of Medicine, University of Geneva, 1211 Geneva 4.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ПЛАЗМИДЫ

ПЛАЗМИДА PWW0

СТРУКТУРА

ОПЕРОНЫ

ОПЕРОН ТOL

КЛОНИРОВАНИЕ

ХАРАКТЕРИСТИКА

ГЕНЫ

ГЕНЫ МЕТАБОЛИЗМА ТОЛУОЛА XYL

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

КАРТИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki; Rekiki, Monique; Wubbolts, Marcel; Rose, Keith; Leppik, Ray A.; Timmis, Kenneth N.


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.02-04Б2.148

   

    Cooperative effect of two surface amino acid mutations (Q252L and E170K) in glucose dehydrogenase from Bacillus megaterium IWG3 on stabilization of its oligomeric state [Text] / Sang-Ho Baik [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 71, N 6. - P3285-3293 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Совместный эффект двух мутаций поверхностных аминокислот (Q252L и E170K) в дегидрогеназе глюкозы Bacillus megaterium IWG3 на стабилизацию его олигомерного состояния
Аннотация: Охарактеризовали три мутанта Bacillus megaterium IWG3 по глюкозодегидрогеназе (GlcDH), несущие замены Q252L, E170K и Q252L/E170K в условиях с низким содержанием соли. Мутант, несущий двойную замену, был стабилен в отличие от мутантов с одиночной заменой при щелочном рН. Показали, что олигомерное состояние энзима Q252L/E170K стабильно, поскольку тетрамеры энзима, несущие одиночные замены Q252L или E170K, диссоциируют на димеры при щелочном рН. Полученные результаты привели к заключению, что замены Q252L и Е170К синергично усиливают взаимодействие между димерами. Исследование кристаллической структуры мутанта Q252L/E170K показало, что остатки 170 и 252 локализованы в гидрофобной полости взаимодействующих субъединиц. Эти остатки могут оказывать термодинамически неблагоприятное влияние, поскольку замены Q252L и Е170К усиливают взаимодействие между субъединицами, стабилизируя гидрофобную полость. Япония, Marine Biotechnology Inst., 3-75-1 Heita Kamaishi, Iwate 026-0001. Библ. 30
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.27.07
Рубрики: ФЕРМЕНТЫ
ГЛЮКОЗОИЗОМЕРАЗА

СТРУКТУРА

ПОВЕРХНОСТНЫЕ АМИНОКИСЛОТЫ

ФУНКЦИЯ

ОЛИГОМЕРНОЕ СОСТОЯНИЕ

МУТАЦИИ

МУТАЦИИ ПО ГЕНУ ГЛЮКОЗОИЗОМЕРАЗЫ

ПОЛУЧЕНИЕ

BACILLUS MEGATERIUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Baik, Sang-Ho; Michel, Fabrice; Aghajari, Nushin; Haser, Richard; Harayama, Shigeaki


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 16.04-04Б4.69

   

    Corrosion of Iron by Iodide-Oxidizing Bacteria Isolated from Brine in an Iodine Production Facility [Text] / Satoshi Wakai [et al.] // Microbial Ecol. - 2014. - Vol. 68, N 3. - P519-527 . - ISSN 0095-3628
Перевод заглавия: Коррозия железа бактериями, окисляющими йодид и выделенными из рассола, на установке по производству йода
Аннотация: Элементный I[2] в Японии получают из подземного рассола (древних соленых вод). Трубы для перекачки рассола на установке по производству йода, изготовленные из углеродистой стали (УС), корродировали быстрей, чем на других установках. Проверяли корродирующую активность рассола, содержащего йодид, на этой установке. Образцы УС выдерживали в "нативном" рассоле (I) и пропущенном через бактериальный фильтр (II). Растворение Fe в I было в 3-4 раза выше такового в II. С помощью ЭФ в денатурирующем геле 16S-рДНК показали в I присутствие бактерий, окисляющих йодид (IOB). Обнаружили IOB и в коррозионных отложениях на внутренней поверхности YC-труб. Подтвердилось участие IOB в коррозии УС-труб. Из 6 изолятов, полученных из рассола, 4 были способны окислять ион йодида (J{-}) до молекулярного йода (J[2]). Эти штаммы были филогенетически классифицированы как 2 группы. Была проверена Fe-корродирующая активность обеих групп. Оба штамма корродировали Fe в присутствии йодида калия, Kj, со скоростью, зависящей от конц-ии субстрата. Впервые показано прямое участие IOB в коррозии Fe. Обсуждаются возможные мех-мы коррозии этими бактериями
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.49.15
Рубрики: ОКИСЛЯЮЩИЕ ЙОДИД БАКТЕРИИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ 16S-РРНК

СОЛЕВОЙ РЕЛИКТОВЫЙ РАССОЛ

КОРРОЗИЯ УГЛЕРОДИСТОЙ СТАЛИ

УСТАНОВКА ПО ПРОИЗВОДСТВУ ЙОДА


Доп.точки доступа:
Wakai, Satoshi; Ito, Kimio; Iino, Takao; Tomoe, Yasuyoshi; Mori, Koji; Harayama, Shigeaki


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 16.01-04Б2.160

   

    Corrosion of Iron by Iodide-Oxidizing Bacteria Isolated from Brine in an Iodine Production Facility [Text] / Satoshi Wakai [et al.] // Microbial Ecol. - 2014. - Vol. 68, N 3. - P519-527 . - ISSN 0095-3628
Перевод заглавия: Коррозия железа бактериями, окисляющими йодид и выделенными из рассола, на установке по производству йода
Аннотация: Элементный I[2] в Японии получают из подземного рассола (древних соленых вод). Трубы для перекачки рассола на установке по производству йода, изготовленные из углеродистой стали (УС), корродировали быстрей, чем на других установках. Проверяли корродирующую активность рассола, содержащего йодид, на этой установке. Образцы УС выдерживали в "нативном" рассоле (I) и пропущенном через бактериальный фильтр (II). Растворение Fe в I было в 3-4 раза выше такового в II. С помощью ЭФ в денатурирующем геле 16S-рДНК показали в I присутствие бактерий, окисляющих йодид (IOB). Обнаружили IOB и в коррозионных отложениях на внутренней поверхности YC-труб. Подтвердилось участие IOB в коррозии УС-труб. Из 6 изолятов, полученных из рассола, 4 были способны окислять ион йодида (J{-}) до молекулярного йода (J[2]). Эти штаммы были филогенетически классифицированы как 2 группы. Была проверена Fe-корродирующая активность обеих групп. Оба штамма корродировали Fe в присутствии йодида калия, Kj, со скоростью, зависящей от конц-ии субстрата. Впервые показано прямое участие IOB в коррозии Fe. Обсуждаются возможные мех-мы коррозии этими бактериями
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.17.09.13
Рубрики: ОКИСЛЯЮЩИЕ ЙОДИД БАКТЕРИИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ 16S-РРНК

СОЛЕВОЙ РЕЛИКТОВЫЙ РАССОЛ

КОРРОЗИЯ УГЛЕРОДИСТОЙ СТАЛИ

УСТАНОВКА ПО ПРОИЗВОДСТВУ ЙОДА


Доп.точки доступа:
Wakai, Satoshi; Ito, Kimio; Iino, Takao; Tomoe, Yasuyoshi; Mori, Koji; Harayama, Shigeaki


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 92.04-04А1.103

    Harayama, Shigeaki.

    Divergent evolution of chloroplast-type ferredoxins [Text] / Shigeaki Harayama, Alessandra Polissi, Monique Rekik // FEBS Lett. - 1991. - Vol. 285, N 1. - P85-88 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Дивергентная эволюция ферредоксинов хлоропластного типа
Аннотация: ТОЛ плазмида pWWO Pseudomonas putida кодирует набор ферментов для окисления толуола в интермедиаты цикла Кребса. Структурные гены этих ферментов кодируются в двух оперонах, к-рые содержат соответственно гены xyl CMABN и xyl XYZLTEGFJQKIH. Функция гена xylT была неизвестна. Определена нуклеотидная последовательность xylT и вероятный продукт гена, к-рый содержит последовательность, характерную для ферредоксинов хлоропластного типа. Ген nahТ, гомолог xylT, присутствует в плазмиде NAH7, кодирующем фермент деградации нафталина. Он также секвенирован. Сходство последовательностей xylT и nahT подтверждает, что оба генных продукта имеют сходную физиол. функцию. Ферредоксины хлоропластного типа открыты у фотосинтезирующих организмов (растений, водорослей, цианобактерий, Rhodobacter) и видов Halobacterium. Последовательность этого типа найдены в оксигеназах цепи переноса электрона. Построено филогенетическое дерево 13 ферредоксинов хлоропластного типа. Швейцария, Univ. Med. Center 1211 Geneva 4. Библ. 22.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.03.17.27.17
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
ФЕРРЕДОКСИНЫ ХЛОРОПЛАСТНОГО ТИПА

ФИЛОГЕНЕТЧЕСКИЕ ДРЕВА


Доп.точки доступа:
Polissi, Alessandra; Rekik, Monique


18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 06.03-04В2.95

   

    Effects of chloramphenicol on photosynthesis, protein profiles and transketolase activity under extremely high CO[2] concentration in an extremely-high-CO[2]-tolerant green microalga, Chlorococcum littorale [Text] / Akira Satoh [et al.] // Plant and Cell Physiol. - 2004. - Vol. 45, N 12. - P1857-1862 . - ISSN 0032-0781
Перевод заглавия: Влияние хлорамфеникола на фотосинтез, белковые профили и активность транскетолазы при экстремально высокой концентрации CO[2] у толерантной к экстремальной высокому фону CO[2] микроводоросли Chlorococcum littorale
Аннотация: У C. littorale высокая квантовая эффективность фотосистемы II (Ф[п]) на свету при 40% CO[2] и 5% CO[2], но Ф[п] резко снижалась под действием хлорамфеникола (CAP) на фоне 40% CO[2], чего не было при 5% CO[2]. Циклогексимид не влиял на Ф[п] на обоих фонах. Объем полипептида с мол. м. 76 кД (р76) снижался в присутствии CAP при 40% CO[2], но не при 5% CO[2]. По последовательности аминокислотных остатков р76 на 71-100% идентичны транскетолазам (TKL) высших растений и цианобактерий. Активность TKL C. littorale снижалась САР при 40% CO[2], но не при 5% CO[2], и это снижение тесно коррелировало с снижением Ф[п]. САР прямо или косвенно влиял на стабильность TKL C. littorale, фотосинтетическая активность к-рой снижалась при снижении активности TKL. Япония, Marine Biotechnology Inst., 3-75-1 Heita, Kamaishi, Iwate, 026-0001. Библ. 35
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.29.15.15.19
Рубрики: CHLOROPHYTA (ALGAE)
CHLOROCOCCUM LITTORALE (ALGAE)

ФОТОСИНТЕЗ

ТРАНСКЕТОЛАЗА

АКТИВНОСТЬ

ДИОКСИД УГЛЕРОДА

КОНЦЕНТРАЦИЯ

ТОЛЕРАНТНОСТЬ


Доп.точки доступа:
Satoh, Akira; Kurano, Norihide; Harayama, Shigeaki; Miyachi, Shigetoh


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.01-04Б2.41

   

    Emended descriptions of the genus Lewinella and of Lewinella cohaerens, Lewinella nigricans and Lewinella persica, and description of Lewinella lutea sp. nov. and Lewinella marina sp. nov. [Text] / Shams Tabrez Khan [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2007. - Vol. 57, N 12. - P2946-2951
Перевод заглавия: Исправленные описания рода Lewinella и Lewinella cohaerens, Lewinella nigricans и Lewinella persica и описание Lewinella lutea sp. nov. и Lewinella marina sp. nov.
Аннотация: Из образца морских отложений и морской улитки, собранных на тихоокеанском побережье Японии, выделили два штамма, MKG-38{T} и FYK2402M69{T}, соответственно. Филогения этих новых изолятов, основанная на последовательностях 16S рРНК, показала, что они являются членами р. Lewinella. Были охарактеризованы морфологические, физиологические и биохимические св-ва этих 2 изолятов вместе с типовыми штаммами трех ранее описанных видов р. Lewinella. Новые изоляты были грамотрицательные, аэр. палочковидные, хемоорганотрофные и способны разлагать крахмал и карбоксиметил-целлюлозу. Сравнительное всестороннее изучение показало, что эти 2 изолята представляют 2 новых вида р. Lewinella, для к-рых предложены названия Lewinella marina sp. nov. (типовой штамм MKG-38{T}) и Lewinella lutea sp. nov. (типовой штамм, FYK2402M69{T}). Также даны исправленные описания р. Lewinella и L. cohaernes, L. nigricans и L. perscia. Япония, NITE Biol. Resource Center (NBRC), Nat. Inst. of Technology and Evaluation (NITE), Kisarazu, Chiba 292-0818. E-mail: shams-tabrez-khan@nite.go.jp
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: LEWINELLA COHAERENS (BACT.)
LEWINELLA NIGRICANS (BACT.)

LEWINELLA PERSICA (BACT.)

ИСПРАВЛЕННЫЕ ОПИСАНИЯ

LEWINELLA LUTEA SP. NOV. (BACT.)

LEWINELLA MARINA SP. NOV. (BACT.)

ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ МОРСКИХ ОТЛОЖЕНИЙ

СИСТЕМАТИКА

НОВЫЕ ВИДЫ


Доп.точки доступа:
Khan, Shams Tabrez; Fukunaga, Yukiyo; Nakagawa, Yasuyoshi; Harayama, Shigeaki


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 02.09-04Б3.183

   

    Enhanced mineralization of benzo[a]pyrene in the presence of nonaqueous phase liquids [Text] / Robert A. Kanaly [et al.] // Environ. Toxicol. and Chem. - 2001. - Vol. 20, N 3. - P498-501 . - ISSN 0730-7268
Перевод заглавия: Усиленная минерализация бензо['альфа']пирена в присутствии неводнофазных жидкостей
Аннотация: Бактериальная минерализация такого загрязнителя окружающей среды как [7-{14}C]бензо['альфа']пирен усиливалась в присутствии неводнофазных жидкостей. Минерализация [7-{14}C]бензо['альфа']пирена сильно зависела от различных неводнофазных жидкостей, усиление минерализации в их присутствии подобно происходящему при комбинации кометаболического и физического действия. Минерализация усиливалась в наивысшей степени, когда [7-{14}C]бензо['альфа']пирен был растворен в высоко кипящем дистилляционном продукте дизельного топлива. США, Dep. Biochem. and Microbiol., Cook Col., Rutgers Univ., New Brunswick, New Jersey 08903-0231. Библ. 17
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.17.21
Рубрики: ОХРАНА ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ
ЗАГРЯЗНЕНИЕ

ОЧИСТКА

МИНЕРАЛИЗАЦИЯ

БАКТЕРИАЛЬНАЯ МИНЕРАЛИЗАЦИЯ

НЕВОДНОФАЗНЫЕ ЖИДКОСТИ

ВЛИЯНИЕ

БЕНЗО['АЛЬФА']ПИРЕН


Доп.точки доступа:
Kanaly, Robert A.; Bartha, Richard; Watanabe, Kazuya; Harayama, Shigeaki


 1-20    21-40   41-60   61-63 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)