СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Harayama, Shigeaki$<.>)

Общее количество найденных документов : 63
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-63

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.05-04Б2.334

Involvement of Pseudomonas putida RpoN 'сигма' factor in regulation of various metabolic functions [Text] / Thilo Kohler [et al.] // J. Bacteriol. - 1989. - Vol. 171, N 8. - P4326-4333 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Роль RpoN 'сигма' фактора Pseudomonas putida в регуляции различных метаболических функций
Аннотация: Из геномной библиотеки Pseudomonas putida, клонированной в pLAFR 3-плазмиде, отобраны клоны, комплементирующие мутацию rpoN E. coli (ген, кодирующий 'сигма' фактор). Выделен фрагмент 2 т. п. н., достаточный для комплементации мутации, который кодирует белок с мол. м. 78 kD. Отобраны трансконьюганты, несущие мутантные инактивированный ген rpoN. Определено, что нарушения функции rpoN-гена приводит к нарушению множества метаболических р-ций. Мутанты не способны использовать нитраты и мочевину, аланин, глицин, изолейцин, лейцин, серин в кач-ве единственного источника азота; эти аминокислоты, а также лизин, С[4]-дикарбоксилаты и 'альфа'-кетоглутарат не могут быть использованы в кач-ве источника углерода. Мутантные клетки, в отличие от Кл дикого типа неподвижны, скорость деления у них ниже. Кроме того, определено, что продукт гена rpoN необходим для транскрипции промоторов генов деградации толуенов и ксиленов эндогенной плазмиды B. putida TOL. Обсуждаются возможные механизмы влияния продукта гена rpoN на регуляцию метаболических функций и причины различий его функций у различных организмов. Библ. 34.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.15
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ШТАММ КТ 2440
ГЕНЫ
ГЕН ФАКТОРА РЕГУЛЯЦИИ ТРАНСКРИПЦИИ RPON СИГМА RPON
КЛОНИРОВАНИЕ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
ФАКТОР СИГМА-RPON
ФУНКЦИИ
ГИБРИДНЫЕ ПЛАЗМИДЫ
БИБЛИОТЕКА ГЕНОВ
КОНЪЮГАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Kohler, Thilo; Harayama, Shigeaki; Ramos, Juan-Luis; Timmis, Kenneth N.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.08-04Б2.157

Physically associated enzymes produce and metabolize 2-hydroxy-2,4-dienoate, a chemically unstable intermediate formed in catechol metabolism via meta cleavage in Pseudomonas putida [Text] / Shigeaki Harayama [et al.] // J. Bacteriol. - 1989. - Vol. 171, N 11. - P6251-6258 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Физически ассоциированные ферменты образуют и метаболизируют 2-гидрокси-2,4-диеноат - химически нестабильный интермедиат, образуемый при метаболизме катехина через мета-расщепление у Pseudomonas putida
Аннотация: Очищены три фермента, участвующие в пути мета-расщепления катехина у P. putida и кодируемые TOL-плазмидой pWWO: 4-оксалокротонатизомераза (I), 4-оксалокротонатдекарбоксилаза (II) и 2-оксо-пент-4-еноатгидратаза (III). Очищ. I имеет Mr 28 кД и состоит из очень малых идентичных субъединиц с Mr по 3500. Очищ. II и III, имеющие Mr 27 и 28 кД соответственно, не разделялись при хр-фии на анионообменной, гидрофобной и гельфильтрационной колонках. Струкарные гены для II (xylI) и III (xylJ) были клонированы в Escherichia coli. Профили элюции при ИОХ II и III, выделенных из клонов E. coli XylI+ XylJи XylIXylJсоответственно, отличались от таковых для соотв. ферментов, выделенных из бактерий XylI+XylJ+. Судя по этим результатам, II и III образуют комплекс in vivo. Субстратом для II служила кето-форма 4-оксалокротоната, а продуктом декарбоксилирования был 2-гидроксипент-2,4-диеноат, а не его кето-форма. III действует только на первый изомер. Т. к. 2-гидроксипент-2,4-диеноат нестабилен, образование комплекса II с III может обеспечивать его эффективную трансформацию in vivo. Библ. 18. Швейцария, Dep. of Med. Biochem., Univ. Med. Center, Univ. of Geneva, 1211 Geneva 4.

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.11.21
Рубрики: КАТЕХИН
МЕТА-РАСЩЕПЛЕНИЕ
ОКСАЛОКРОТОНАТИЗОМЕРАЗА*4-
ОКСАЛОКРОТОНАТДЕКАРБОКСИЛАЗА*4-
ОКСО-ПЕНТ-4-ЕНОАТГИДРАТАЗА
ГИДРОКСИПЕНТ-2,4-ДИЕНОАТ*2-
БИОТРАНСФОРМАЦИЯ
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki; Rekik, Monique; Ngai, Ka-Leung; Ornston, L.Nicholas

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.07-04Б2.464

Harayama, Shigeaki.
Bacterial aromatic ring-cleavage enzymes are classified into two different gene families [Text] / Shigeaki Harayama, Monique Rekik // J. Biol. Chem. - 1989. - Vol. 264, N 26. - P15328-15333 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Ферменты расщепления ароматического кольца у бактерий классифицированы в два различных семейства генов
Аннотация: Диоксигеназы разделяются на 2 группы: экстра- и интрадиоловые ферменты, различающиеся по способу расщепления ароматич. кольца. Определена полная нуклеотидная последовательность гена nah C, кодирующего структурный ген 1,2-диоксинафталиндиоксигеназы (Д) и локализованного в плазмиде NAH 7 Pseudomonas putida. Мол. м. белка, соотв-щего данной нуклеотидной последовательности, равна 33,882. При изучении продукта гена nah C с помощью макси-клеток мол. м. данного белка была равна 36 000. При сравнении аминокислотных последовательностей Д с др. экстрадиоловыми диоксигеназами показано, что гомология с 2,3-диоксибифенилдиоксигеназой составляет 50%, а с катехол-2,3-диоксигеназой - 16%. Статистич. анализ подтвердил, что данные ферменты эволюционно родственны и относятся к одному суперсемейству. Аминокислотная последовательность данных экстрадиоловых диоксигеназ не имеет какого-либо значительного сходства с интрадиоловыми диоксигеназами. Ил. 7. Табл. 2. Библ. 34. Швейцария, Dep. of Medical Biochemistry, Univ. Medical Centerf, 1, rue Michel-Servet, 1211 Geneva 4.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ПЛАЗМИДА NAH7
ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ГЕН ДИОКСИНАФТАЛИНОКСИГЕНАЗЫ*1,2-NAHC
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ДИОКСИГЕНАЗЫ
ЭКСТРАДИОЛОВЫЕ
ИНТРАДИОЛОВЫЕ ФЕРМЕНТЫ
АМИНОКИСЛОТНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ФУНКЦИИ
КЛАССИФИКАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Rekik, Monique

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.08-04Б2.288

Characterization of five genes in the upper-pathway operon of TOL plasmid pWW0 from Pseudomonas putida and identificatio of the gene products [Text] / Shigeaki Harayama [et al.] // J. Bacteriol. - 1989. - Vol. 171, N 9. - P5048-5055 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Характеристика пяти генов в верхнем опероне TOL плазмиды pWWO из Pseudomonas putida и идентификация генных продуктов
Аннотация: Генетическая организация верхнего оперона (BO) TOL плазмиды pWWO Pseudomonas putida охарактеризовали с помощью клонирования ВО и идентификации их продуктов в максиклетках Escherichia coli. Этот анализ показал, что ВО содержит, по крайней мере, 5 генов в следующем порядке: xylC-xylM-xylA-xylB-xylN. Между промотором ВО и xylC находится промежуток ДНК в 1,7 т. п. н., для к-рого не обнаружили никакой генной функции. Между xylC и xylN большая часть ДНК содержит кодирующие последовательности. xylC, xylM и xylA кодируют полипептиды 57, 35 и 40 кД соответственно. xylN кодирует полипептид 52 кД с неизвестной функцией. Библ. 29. Табл. 1. Ил. 10. Швейцария, Dept of Medical Biochemistry, Faculty of Medicine, University of Geneva, 1211 Geneva 4.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА PWW0
СТРУКТУРА
ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН ТOL
КЛОНИРОВАНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ГЕНЫ
ГЕНЫ МЕТАБОЛИЗМА ТОЛУОЛА XYL
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
КАРТИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki; Rekiki, Monique; Wubbolts, Marcel; Rose, Keith; Leppik, Ray A.; Timmis, Kenneth N.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.12-04Б2.610

Harayama, Shigeaki.
The meta cleavage operon of TOL degradative plasmid pWWO comprises 13 genes [Text] / Shigeaki Harayama, Monique Rekik // Mol. and Gen. Genet. - 1990. - Vol. 221, N 1. - P113-120 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Оперон meta-расщепления плазмиды pWWO TOL-деградации состоит из 13 генов
Аннотация: Исследовали генетич. организацию оперона meta-расщепления плазмиды TOL pWWO Pseudomonas puticla методом клонирования в экспрессирующем векторе с идентификацией продуктов генов в макси-клетках Escherichia coli. Показали, что этот оперон состоит из 13 генов. Идентифицировали продукты этих генов. Показали, что большая часть ДНК в опероне состоит из кодирующих последовательностей. Ил. 3. Библ. 3.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ПЛАЗМИДА PWWO
ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН META-РАСЩЕПЛЕНИЯ
ОРГАНИЗАЦИЯ
ПРОДУКТЫ ГЕНОВ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Rekik, Monique

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.09-04Б2.587

Growth-phase-dependent expression of the Pseudomonas putida TOL plasmid pWWO catabolic genes [Text] / Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat [et al.] // J. Bacteriol. - 1990. - Vol. 172, N 12. - P6651-6660 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Зависимая от фазы роста экспрессия генов катаболизма TOL плазмиды pWWO Pseudomonas putida
Аннотация: Гены биодеградации TOL плазмиды pWWO Pseudomonas putida образуют 2 оперона, к-рые контролируются генами xylR и xylS; экспрессия xylS контролируется геном xylR. В P. putida и рекомбинантных Кл Escherichia coli опероны биодеградации индуцируются только в поздней лог-фазе роста, но не на ранних стадиях. Сконструированы рекомбинантные гены lacZ, находящиеся под контролем 4-х промоторов оперонов биодеградации TOL. В отсутствие регуляторных белов XylR и XylS экспрессия с промоторов Pm, Pu и Ps является конститутивной, тогда как XylS-зависимая экспрессия Pm и XylR-зависимая экспрессия Ps и Pu варьируют на разных стадиях роста. По-видимому, взаимодействие XylS и XylR с промоторами определяется фазой роста. Ил. 5. Табл. 1. Библ. 43. (S. Harayama). Швейцария, Dep. of Medical Biochemistry, Fac. of Medicine, Univ. of Geneva, 1211 Geneva 4.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.31.09
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ФАЗЫ РОСТА
ОПЕРОНЫ
ОПЕРОНЫ БИОДЕГРАДАЦИИ TOL
ТРАНСКРИПЦИЯ
ИНДУКЦИЯ
КОРРЕЛЯЦИЯ
ПЛАЗМИДЫ БИОДЕГРАДАЦИИ
TOL ПЛАЗМИДА PWWO
ДНКБЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
БЕЛОК XYLS
БЕЛОК XYLR
ПРОМОТОРЫ TOL

Доп.точки доступа:
Hugouvieux-Cotte-Pattat, Nicole; Kohler, Thilo; Rekik, Monique; Harayama, Shigeaki

РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 92.04-04А1.103

Harayama, Shigeaki.
Divergent evolution of chloroplast-type ferredoxins [Text] / Shigeaki Harayama, Alessandra Polissi, Monique Rekik // FEBS Lett. - 1991. - Vol. 285, N 1. - P85-88 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Дивергентная эволюция ферредоксинов хлоропластного типа
Аннотация: ТОЛ плазмида pWWO Pseudomonas putida кодирует набор ферментов для окисления толуола в интермедиаты цикла Кребса. Структурные гены этих ферментов кодируются в двух оперонах, к-рые содержат соответственно гены xyl CMABN и xyl XYZLTEGFJQKIH. Функция гена xylT была неизвестна. Определена нуклеотидная последовательность xylT и вероятный продукт гена, к-рый содержит последовательность, характерную для ферредоксинов хлоропластного типа. Ген nahТ, гомолог xylT, присутствует в плазмиде NAH7, кодирующем фермент деградации нафталина. Он также секвенирован. Сходство последовательностей xylT и nahT подтверждает, что оба генных продукта имеют сходную физиол. функцию. Ферредоксины хлоропластного типа открыты у фотосинтезирующих организмов (растений, водорослей, цианобактерий, Rhodobacter) и видов Halobacterium. Последовательность этого типа найдены в оксигеназах цепи переноса электрона. Построено филогенетическое дерево 13 ферредоксинов хлоропластного типа. Швейцария, Univ. Med. Center 1211 Geneva 4. Библ. 22.

ГРНТИ	34.03.17

ВИНИТИ 341.03.17.27.17
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
ФЕРРЕДОКСИНЫ ХЛОРОПЛАСТНОГО ТИПА
ФИЛОГЕНЕТЧЕСКИЕ ДРЕВА

Доп.точки доступа:
Polissi, Alessandra; Rekik, Monique

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.10-04Б2.183

Primary structure of xylene monooxygenase: Similarities to and differences from the alkane hydroxylation system [Text] / Masahiko Suzuki [et al.] // J. Bacteriol. - 1991. - Vol. 173, N 5. - P1690-1695 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Первичная структура ксилолмонооксигеназы: сходство и отличия от системы гидроксилирования алканов
Аннотация: Ксилолмонооксигеназа (I), кодируемая плазмидой TOL у Pseudomonas putida, катализирует окисление толуола и ксилолов и состоит из двух разных субъединиц, кодируемых генами xyl A и xyl M. На основании установленных нуклеотидных последовательностей этих генов определены аминокислотные последовательности их продуктов. Белок Xyl M имеет 25% гомологии с алкангидролазой, катализирующей 'омега'-гидроксилирование жирных к-т и концевое гидроксилирование алканов. Последовательность первых 90 аминокислот в белке Xyl A имеет большое сходство с последовательностями ферредоксинов хлоропластов, а остальная последовательность Xyl А напоминает таковую у ферредоксин-НАДФ-редуктаз. Xyl М, возможно, является каталитическим компонентом для гидроксилирования углеродного атома боковой цепи толуола и ксилолов подобно алкангидроксилазному белку, и м. б. мембраносвязанным белком, содержащим Fe{2}+ и простетическую группу. Xyl A может иметь два домена, состоящих из N-концевого р-на, близкого к ферредоксинам хлоропластов, и С-концевого р-на, близкого к ферредоксин-НАДФ-редуктазам. Ферредоксиновая часть Xyl A может содержать кластер [2Fe-2S] и восстанавливать окисленную форму Xyl M. Активность, определяемая С-концевой частью Xyl A, может состоять в восстановлении окисленной формы ферредоксина. Библ. 27. Швейцария (Harayama S.), Dep. of Med. Biochem., Fac. of Med., Univ. Med. Center, 1211 Geneva 4.

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: КСИЛОМОНООКСИГЕНАЗА
БЕЛОК XYL А
БЕЛОК XYL M
ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА
ГИДРОКСИЛИРОВАНИЕ
СИСТЕМЫ ГИДРОКСИЛИРОВАНИЯ
ГОМОЛОГИИ
ОТЛИЧИЯ
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Suzuki, Masahiko; Hayakawa, Takahiko; Shaw, Jeffrey P.; Rekik, Monique; Harayama, Shigeaki

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 93.04-04Б2.113

Shaw, Jeffrey P.
Purification and characterisation of the NADH: acceptor reductase component of xylene monooxygenase encoded by the TOL plasmid pWWO of Pseudomonas putida mt-2 [Text] / Jeffrey P. Shaw, Shigeaki Harayama // Eur. J. Biochem. - 1992. - Vol. 209, N 1. - P51-61 . - ISSN 0014-2956
Перевод заглавия: Очистка и характеристика НАДН: акцепторредуктазного компонента ксилолмонооксигеназы, кодируемой TOL-плазмидой pWWO Pseudomonas putida mt-2
Аннотация: Электрон-переносящий компонент (XylA) ксилолмонооксигеназы из P. putida кодируется геном xylA, расположенным на TOL-плазмиде pWWO. Выделение XylA, обладающего НАДН: цитохром С - редуктазной активностью, проведено из штамма Escherichia coli, содержащего ген xylA из P. putida на гибридной плазмиде под контролем промотера 'лямбда' P. Очистка до гомогенного состояния включала ИОХ на TSK ДЭАЭ-5РW, фракционирование сульфатом аммония и гидрофобную хр-фию на TSK фенил-5РW. Очищ. XylA имеет Mr 'ЭКВИВ'40 кД, содержит одну молекулу ФАД и один железо-серный кластер [2Fe-2S]. Окисленный XylA имеет максимумы поглощения при 457 и 390 нм, плечи при 350 и 550 нм. Эти максимумы исчезают после восстановления белка дитионитом или НАДН. XylA способен восстанавливать одно- и двухэлектронные акцепторы с оптимумом при рН 8,5. К для НАДН составляет 22 мкМ. Восстановительное титрование XylA дает три разных формы фермента. Потенциалы средней точки составили -171 мВ для кластера [2Fe-2S], -244 мВ для восстановления ФАД до ФАД и -297 мВ для восстановления ФАД до ФАД. Поток электронов в XylA происходит в направлении НАДН ФАД [2Fe-2S]. Ил. 13. Табл. 1. Библ. 34. Швейцария, Harayama S. Dept. de Biochim. Med. Centre Med. Univ., CH-1211 Geneve 4.

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: БЕЛКИ
ЭЛЕКТРОН-ПЕРЕНОСЯЩИЙ БЕЛОК XYLA
КОДИРОВАНИЕ ГЕНОМ XYLA
НАДН: ЦИТОХРОМ С-РЕДУКТАЗНАЯ АКТИВНОСТЬ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ПЛАЗМИДЫ
ГИБРИДНАЯ ПЛАЗМИДА
PSEUDOMONAS PUTIDA [BACT.)

Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 96.05-04Б2.282

Venkateswaran, Kasthuri.
Sequential enrichment of microbial populations exhibiting enhanced biodegradation of crude oil [Text] / Kasthuri Venkateswaran, Shigeaki Harayama // Can. J. Microbiol. - 1995. - Vol. 41, N 9. - P767-775 . - ISSN 0008-4166
Перевод заглавия: Последовательное обогащение микробных популяций, обнаруживающих усиленную биодеградацию сырой нефти
Аннотация: Из образцов прибрежных вод и осадков выделено несколько смешаных бактериальных культур, способных разрушать сырую нефть (I). Популяция одного из образцов разрушала 45% насыщенных и 20% ароматических углеводородов I в течение 10 дней. Выросшую культуру перенесли на свежую среду, содержащую оставшиеся неразрушенными компоненты I (экстрагированные хлороформом из культуральной жидкости). После роста в течение 10 дней оставшиеся углеводороды вновь экстрагировали и перенесли на свежую среду, к-рую засеяли бактериями из второй культуры. Всего произведено 6 последовательных пересевов; в культуральной жидкости последней культуры оставалось лишь 20% от кол-ва углеводородов, содержавшихся в исходной I. Оценка способности культур разрушать I показала, что с каждым пересевом эффективность биодеградации I увеличивалась; последняя популяция при росте на среде с I разрушала 70% насыщенных и 30% ароматических углеводородов. Показаны изменения в составе микрофлоры при пересевах, однако доминирующие компоненты популяций разрушали I менее эффективно, чем смешаная культура в целом. Япония, Biotechnol. Inst., Kamaishi Lab., Kamaishi City, Iwate 026. Библ. 21

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.15
Рубрики: БАКТЕРИИ
БАКТЕРИАЛЬНАЯ АССОЦИАЦИЯ
НЕФТЬ
НАСЫЩЕННЫЕ УГЛЕВОДОРОДЫ
АРОМАТИЧЕСКИЕ УГЛЕВОДОРОДЫ
БИОДЕГРАДАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 96.05-04Б3.115

Venkateswaran, Kasthuri.
Sequential enrichment of microbial populations exhibiting enhanced biodegradation of crude oil [Text] / Kasthuri Venkateswaran, Shigeaki Harayama // Can. J. Microbiol. - 1995. - Vol. 41, N 9. - P767-775 . - ISSN 0008-4166
Перевод заглавия: Последовательное обогащение микробных популяций, обнаруживающих усиленную биодеградацию сырой нефти
Аннотация: Из образцов прибрежных вод и осадков выделено несколько смешаных бактериальных культур, способных разрушать сырую нефть (I). Популяция одного из образцов разрушала 45% насыщенных и 20% ароматических углеводородов I в течение 10 дней. Выросшую культуру перенесли на свежую среду, содержащую оставшиеся неразрушенными компоненты I (экстрагированные хлороформом из культуральной жидкости). После роста в течение 10 дней оставшиеся углеводороды вновь экстрагировали и перенесли на свежую среду, к-рую засеяли бактериями из второй культуры. Всего произведено 6 последовательных пересевов; в культуральной жидкости последней культуры оставалось лишь 20% от кол-ва углеводородов, содержавшихся в исходной I. Оценка способности культур разрушать I показала, что с каждым пересевом эффективность биодеградации I увеличивалась; последняя популяция при росте на среде с I разрушала 70% насыщенных и 30% ароматических углеводородов. Показаны изменения в составе микрофлоры при пересевах, однако доминирующие компоненты популяций разрушали I менее эффективно, чем смешаная культура в целом. Япония, Biotechnol. Inst., Kamaishi Lab., Kamaishi City, Iwate 026. Библ. 21

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.17.11
Рубрики: БАКТЕРИИ
БАКТЕРИАЛЬНАЯ АССОЦИАЦИЯ
НЕФТЬ
НАСЫЩЕННЫЕ УГЛЕВОДОРОДЫ
АРОМАТИЧЕСКИЕ УГЛЕВОДОРОДЫ
БИОДЕГРАДАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI17) 96.12-04И1.350

Biochemical characterization of a Ca{2+}-dependent lectin from the hemolymph of a photosymbiotic marine bivalve, Tridacna derasa (Roding) [Text] / Satoshi Odo [et al.] // J. Biochem. - 1995. - Vol. 117, N 5. - P965-973 . - ISSN 0021-924X
Перевод заглавия: Биохимическая характеристика Ca{2+}-зависимого лектина из гемолимфы фотосимбиотического морского двустворчатого Tridacna derasa
Аннотация: Из гемолимфы фотосимбиотического двустворчатого Tridacna derasa очищен Ca{2+}-зависимый лектин, к-рый составляет 80% от кол-ва белков гемолимфы. Мол. масса лектина в его нативной форме, проявляющей гемагглютинирующую активность, составляет 480 кДа. В денатурирующих условиях в присутствии 2-меркаптоэтанола лектин мигрирует при электрофорезе в виде двух полос с мол. массами 23 и 46 кДа. По-видимому, субъединицы связаны дисульфидными мостиками с образованием нативного лектина. Получены результаты, указывающие на то, что пептид с мол. массой 46 кДа является гомодимером субъединиц с мол. массой 26 кДа, к-рые связаны ковалентной связью, отличной от дисульфидной связи. Значение K[a] для кальция составляет 0,88 мМ, причем ионы кальция необходимы для активности лектина. Гемагглютинирующая активность лектина быстро уменьшается при рН ниже 6,5, но быстро повышается до начального уровня при нейтрализации р-ра. Определена последовательность 29 аминок-тных остатков N-конца. Обнаружена гомология с некоторыми Ca{2+}-зависимыми лектинами животных С-типа. Япония, Marine Biotechnol. Inst., Kamaishi Lab., 3-75-1 Heita, Kamaishi, Iwate 026. Библ. 36

ГРНТИ	34.33.15

ВИНИТИ 341.33.15.35.11.29
Рубрики: ЛЕКТИНЫ
КАЛЬЦИЙ-ЗАВИСИМЫЕ
ГЕМОЛИМФА
МОРСКИЕ ДВУСТВОРЧАТЫЕ

Доп.точки доступа:
Odo, Satoshi; Kamino, Kei; Kanai, Satoru; Maruyama, Tadashi; Harayama, Shigeaki

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.179

Iwabuchi, Tokuro.
Biolochemical and genetic characterization of 2-carboxybenzaldehyde dehydrogenase, an enzyme involved in phenanthrene degradaion by Nocardioides sp. strain KP7 [Text] / Tokuro Iwabuchi, Shigeaki Harayama // J. Bacteriol. - 1997. - Vol. 179, N 20. - P6488-6494 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Биохимическая и генетическая характеристика 2-карбоксибензальдегиддегидрогеназы - фермента, участвующего в деградации фенантрена Nocardioides sp, штамм KP7
Аннотация: Очищена и изучена 2-карбоксибензальдегиддегидрогеназа (I) Nocardioides sp. KP7. I имеет мол. м. 53 кД при электрофорезе в денатурирующих условиях и 205 кД при гель-фильтрации, так что активная 1 является гомотетрамером. I имеет K[M] и k[cat], равные соотв. 100 мкМ и 39 сек{-1} для 2-карбоксибензальдегида и 83 мкМ и 32 сек{-1} для НАД{+}. Клонирован и секвенирован сегмент генома штамма КР7 длиной 10279 п. н., содержащий ген I (phdK) длиной 1455 п. н. Обнаружены 7 открытых рамок считывания: phdI (1-окси-2-нафтоатдиоксигеназа), phdJ (транс-2'-карбоксибензальпируватальдолаза), orf1, phdK I, orf2/orf3 и orf4. Продукт orf1 похож на продукт гена pcaK транспортера ароматич. углеводородов у Pseudomonas putida PRS2000, а продукт orf4 - на цитохром P-450. Гены orf2 и orf3 перекрываются на разных нитях и кодируют белки, не имеющие гомологов в банках данных. Япония, Marine Biotechnol. Inst., Kamaishi Labs., Kamaishi, Iwate 026. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ФЕНАНТРЕН
ДЕГРАДАЦИЯ
2-КАРБОКСИБЕНЗАЛЬДЕГИДДЕГИДРОГЕНАЗА
ОЧИСТКА
ХАРАКТЕРИСТИКА
ГЕНОМ
СЕГМЕНТ
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ
ГЕН PHDK
NOCARDIOIDES (BACT.)
SP, ШТАММ KP7

Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.06-04Б2.338

Population dynamics of phenol-degrading bacteria in activated sludge determined by gyrB-targeted quantitative PCR [Text] / Kazuya Watanabe [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 1998. - Vol. 64, N 4. - P1203-1209 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Динамика популяций разрушающих фенол бактерий в активированном иле, определенная количественной ПЦР, нацеленной на gyrB
Аннотация: Описан метод определения кол-ва бактериальных популяций, введенных в микробные сообщества активированного ила (АИ). Метод включает экстракцию ДНК из АИ, разбавление экстрагированной ДНК из контрольного АИ, ПЦР-амплификации фрагмента гена gyrB введенного штамма с набором штаммоспецифичных праймеров и измерения кол-ва продукта ПЦР методом ЭФ. Изучена динамика популяций 2 разрушающих фенол (1) бактерий: Pseudomonas putida ВН и Comamonas sp., штамм E6 -, введенных в разрушающий I АИ. Плотность обеих популяций, определенная методом ПЦР сразу после введения, согласуется с плотностью, оцененной титрованием инокулы. Методом ПЦР обнаружены различная динамика популяций 2 штаммов в АИ в условиях различной нагрузки I. Поведение обоих штаммов в АИ отражает кинетику их роста в лабораторных аксенич. культурах. Япония, Marine Biotechnol. Inst., Kamaishi Labs., Kamaishi, Iwate 026. Библ. 51

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.31.05
Рубрики: БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ПОПУЛЯЦИИ
КОЛИЧЕСТВО
ОПРЕДЕЛЕНИЕ
АКТИВИРОВАННЫЙ ИЛ
ГЕН GYRB
ПЦР-АМПЛИФИКАЦИЯ
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
COMAMONAS (BACT.)
SP.
ДИНАМИКА ПОПУЛЯЦИЙ

Доп.точки доступа:
Watanabe, Kazuya; Yamamoto, Satoshi; Hino, Sanae; Harayama, Shigeaki

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.10-04Б2.55

Iwabuchi, Tokuro.
Biochemical and molecular characterization of 1-hydroxy-2-naphthoate dioxygenase from Nocardioides sp. KP7 [Text] / Tokuro Iwabuchi, Shigeaki Harayama // J. Biol. Chem. - 1998. - Vol. 273, N 14. - P8332-8336 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Биохимическая и молекулярная характеристика 1-гидрокси-2-нафтоат-диоксигеназы из Nocardioides sp. KP7
Аннотация: Из клеток Nocardioides sp. KP7, деградирующих фенантрены, выделена 1-гидрокси-2-нафтоат-диоксигеназа (ОНД), катализирующая разрыв гидроксилированных ароматических колец. Очищенная ОНД имеет мол. м. 45 кД и 270 кД, по данным электрофореза в ПААГ-SDS и гель-фильтрации соответственно. Окисление 1 моля 1-окси-2-нафтоата в ОНД р-ции сопряжено с утилизацией 1 моля молекулярного кислорода. ОНД содержит 1 моль Fe(II)/моль субъединицы, инактивируется о-фенантролином и реактивируется FeSO[4] и аскорбиновой к-той. Из космидной библиотеки геномной ДНК штамма-продуцента ОНД выделен клон гена ОНД, имеющего длину 1161 п. н., и определена его нуклеотидная последовательность, к-рая не имеет сходства с другими генами, кодирующими ОНД-подобные диоксигеназы. Япония, Marine Biotechnol. Inst., Kamaishi Lab., Iwate 026. Библ. 16

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: 1-ГИДРОКСИ-2-НАФТОАТ-ДИОКСИГЕНАЗА
ОЧИСТКА
ЭЛЕКТРОФОРЕЗ
NOCARDIOIDES SP. KP7

Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.09-04Б2.118

Iwabuchi, Tukuro.
Biochemical and genetic characterization of trans-2'-carboxybenzalpyruvate hydratase-aldolase from a phenanthrene-degrading Nocardioides strain [Text] / Tukuro Iwabuchi, Shigeaki Harayama // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 4. - P945-949 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Биохимическая и генетическая характеристика транс-2'-карбоксибензальпируватгидратазы-альдолазы из разрушающего фенантрен штамма Nocardioides
Аннотация: Из разрушающего фенантрен штамма KP7 Nocardioides sp. выделен очищенный препарат транс-2'-карбоксибензальпируватгидратазы-альдолазы (I). Мол. масса I равна 38 кД при ЭФ в полиакриламидном геле в присутствии додецилсульфата Na и 113 кД при гель-фильтрации. Т. обр. активная I является тетрамером субъединицы с мол. м. 38 кД. I превращает транс-2'-карбоксибензальпируват в 2-карбоксибензальдегид и пируват с K[M]=50 мкМ и k[cat]=13 сек{-1}. Клонирован и секвенирован ген I длиной 996 п. н., продукт к-рого гомологичен I из Pseudomonas putida Pp67 и Pseudomonas sp. C18. Япония, Marine Biotechnol. Inst., Kamaishi Labs., Kamaishi, Iwate 026. Библ. 31

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ТРАНС-2'-КАРБОКСИБЕНЗАЛЬПИРУВАТГИДРАТАЗА-АЛЬДОЛАЗА
ВЫДЕЛЕНИЕ
ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА
ГЕНЫ
ГЕН ФЕРМЕНТА
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
NOCARDIOIDES (BACT.)
SP. РАЗРУШЕНИЕ
ФЕНАНТРЕН

Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 01.07-04Б3.13

Watanabe, Kazuya.
Rapid estimation of population densities of uncultured bacteria in the environment [Text] / Kazuya Watanabe, Shigeaki Harayama // Microb. and Environ. - 1998. - Vol. 13, N 3. - P123-127 . - ISSN 1342-6311
Перевод заглавия: Быстрая оценка плотности популяций некультивируемых бактерий в окружающей среде
Аннотация: Разработан метод, позволяющий осуществлять быструю оценку плотности некультивируемых бактерий в окружающей среде. Метод предусматривает использование PCR-анализа. Япония, Marine Biotechnol. Inst., Kamaishi Lab., 3-75-1 Heita, Kamaishi City, Iwate. Библ. 22

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.07.09
Рубрики: ОХРАНА ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ
МОНИТОРИНГ СОСТОЯНИЯ СРЕДЫ
БАКТЕРИИ
НЕКУЛЬТИВИРУЕМЫЕ БАКТЕРИИ
ОЦЕНКА ПЛОТНОСТИ ПОПУЛЯЦИИ
БЫСТРАЯ ОЦЕНКА ПЛОТНОСТИ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ПЦР

Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.07-04Б2.4

Watanabe, Kazuya.
Rapid estimation of population densities of uncultured bacteria in the environment [Text] / Kazuya Watanabe, Shigeaki Harayama // Microb. and Environ. - 1998. - Vol. 13, N 3. - P123-127 . - ISSN 1342-6311
Перевод заглавия: Быстрая оценка плотности популяций некультивируемых бактерий в окружающей среде
Аннотация: Разработан метод, позволяющий осуществлять быструю оценку плотности некультивируемых бактерий в окружающей среде. Метод предусматривает использование PCR-анализа. Япония, Marine Biotechnol. Inst., Kamaishi Lab., 3-75-1 Heita, Kamaishi City, Iwate. Библ. 22

ГРНТИ	34.27.05

ВИНИТИ 341.27.05.07
Рубрики: ОХРАНА ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ
МОНИТОРИНГ СОСТОЯНИЯ СРЕДЫ
БАКТЕРИИ
НЕКУЛЬТИВИРУЕМЫЕ БАКТЕРИИ
ОЦЕНКА ПЛОТНОСТИ ПОПУЛЯЦИИ
БЫСТРАЯ ОЦЕНКА ПЛОТНОСТИ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ПЦР

Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.01-04Б2.217

The gene pvaB encodes oxidized polyvinyl alcohol hydrolase of Pseudomonas sp. strain VM15C and forms an operon with the polyvinyl alcohol dehydrogenase gene pvaA [Text] / Masayuki Shimao [et al.] // Microbiology. - 2000. - Vol. 146, N 3. - P649-657 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Ген pvaB кодирует гидролазу окисленного поливинилового спирта у Pseudomonas sp., штамм VM15C, и образует оперон с геном pvaA дегидрогеназы поливинилового спирта
Аннотация: Клонирован и секвенирован SphI-фрагмент (5,7 т.п.н.) ДНК разрушающей поливиниловый спирт (I) бактерии Pseudomonas sp. VM15C, содержащий ген pvaA дегидрогеназы I (II) и 5'-фланговую область длиной 1,9 т.п.н. В этой области обнаружен ген pvaB, кодирующий гидролазу окисленного I (III). Секвенирование и анализ экспрессии показали, что гены II и III образуют оперон pvaBA. Ген pvaB кодирует белок длиной 379 остатков (мол. м. 40 610), имеющий липопротеиновую сигнальную последовательность и консенсусную липазную последовательность GXSXG, характерную для активного центра сериновых гидролаз (IV). III вместе с II образует ферментную систему для расщепления I. II вводит в I 'бета'-дикетоновые группы, а III гидролизует эти группы в окисленном I. III с низкой скорость. гидролизует также 4,6-нонадион, но не ацетилацетон и 5-нонанон. III полностью ингибируется фенилметилсульфонилфторидом и является IV. III не имеет высокой гомологии с белками в базах данных, но проявляет низкую гомологию с рядом IV, включая полиоксиалканоатдеполимеразы. Япония, Dep. Biotechnol., Tottori Univ., Tottori 680-8552. Библ. 21

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН PVABA
ГЕН ГИДРОЛАЗЫ ОКИСЛЕННОГО ПОЛИВИНИЛОВОГО СПИРТА PVAB
ГЕН ДЕГИДРОГЕНАЗЫ ПОЛИВИНИЛОВОГО СПИРТА PVAA
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ФУНКЦИИ
СЕРИНОВЫЕ ГИДРОЛАЗЫ
PSEUDOMONAS (BACT.)
SP.
ШТАММ VM15C

Доп.точки доступа:
Shimao, Masayuki; Tamogami, Tsuyoshi; Kishida, Shinsuke; Harayama, Shigeaki

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 03.01-04Б3.188

Dutta, Tapan K.
Biodegradation of n-alkylcycloalkanes and n-alkylbenzenes via new pathways in Alcanivorax sp. strain MBIC 4326 [Text] / Tapan K. Dutta, Shigeaki Harayama // Appl. and Environ. Microbiol. - 2001. - Vol. 67, N 4. - P1970-1974 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Новые пути биодеградации n-алкилциклоалканов и n-алкилбензолов в Alcanivorax sp. штамм MBIC 4326
Аннотация: Изучена деградация длинноцепочечных n-алкилциклоалканов и n-алкилбензолов посредством Alcanivorax sp. штамм MBIC 4326. Главным образом 'бета'-окислению подвергается алкильная боковая цепь этих соединений. При деградации n-алкилциклоалканов в качестве интермедиата образуется циклогексанкарбоновая кислота. Далее это соединение трансформируется в бензойную кислоту через 1-циклогексен-1-карбоновую кислоту. Япония, Marine Biotechnol. Inst., 3-75-1 Heita, Kamaishi, Iwate 026-0001. Библ. 31

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.17.11
Рубрики: ОХРАНА ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ
УГЛЕВОДОРОДЫ
БИОДЕГРАДАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
N-АЛКИЛЦИКЛОАЛКАНЫ
N-АЛКИЛБЕНЗОЛЫ
ALCANIVORAX SP. (BACT.)
ШТАММ MBIC 4326
БИОКОНВЕРСИЯ

Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki

1-20 21-40 41-60 61-63

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска