Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>A=Roncarati, Davide$<.>)
Общее количество найденных документов : 10
Показаны документы с 1 по 10
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.02-04Б2.202

   

    Dual control of Helicobacter pylori heat shock gene transcription by HspR and HrcA [Text] / Gunther Spohn [et al.] // J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, N 10. - P2956-2965 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Двойной контроль транскрипции генов теплового шока у Helicobacter pylori [белками] HspR и HrcA
Аннотация: Репрессор HspR регулирует транскрипцию оперонов groESL, hrcA-grpE-dnaK и cbpA-hspR-orf у Helicobacter pylori. Показано, что опероны groESL и dnaK, кодирующие главные клеточные чаперонные механизмы также регулируются гомологом репрессора HrcA. Подобно мутациям hspR, делеции в гене hrcA приводят к полной дерепрессии промоторов P[gro] и P[hrc]. Иными словами, регулируемая транскрипция с этих промоторов возможна только в присутствии обоих белков HspR и HrcA. Показано, что HrcA связывается непосредственно с P[gro] и P[hrc] промоторами, возможно, взаимодействуя с 2 инвертированными повторами, содержащими CIRCE мотив. Установлено, что регуляция HrcA зависит от связывания белка HspR, так как делеция HspR-связывающего сайта в P[gro] промоторе приводит к утрате его чувствительности к тепловому шоку. Также продемонстрирована способность HspR к образованию олигомеров. Обсуждаются системы регуляции экспрессии генов теплового шока. Италия, Biochem. & Mol. Biol. Unit., IRIS, 53100, Siena. Библ. 44
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ ТЕПЛОВОГО ШОКА

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

РЕПРЕССОР HSPR

РЕПРЕССОР HRCA

КО-РЕПРЕССИЯ

HELICOBACTER PYLORI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Spohn, Gunther; Danielli, Alberto; Roncarati, Davide; Delany, Isabel; Rappuoli, Rino; Scarlato, Vincenzo


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.12-04Б2.120

   

    Transcriptional regulation of stress response and motility functions in Helicobacter pylori is mediated by HspR and HrcA [Text] / Davide Roncarati [et al.] // J. Bacteriol. - 2007. - Vol. 189, N 20. - P7234-7243 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Транскрипционная регуляция стрессового ответа и функции подвижности у Helicobacter pylori осуществляется HspR и HrcA
Аннотация: С помощью фут-принтинга установлено, что не только HspR, но и HrcA (негативные транскрипционные регуляторы экспрессии groES-groEL и hrcA-grpE-dnaK оперонов) связывается с CIRCE-подобными операторными элементами, перекрывающими промоторы обеих оперонов. Связывание HspR и HrcA происходит независимо, однако, ДНК-связывающая активность HrcA возрастает в присутствие чаперонной системы GroESL. Сравнительный транскриптомный анализ индивидуальных и двойного hrcA- и hspR-мутантов выявил 14 генов, негативно регулируемых одним или обеими регуляторами, и 29 генов, экспрессия которых усиливается HspR и HrcA. Для двух генов с помощью РНК-праймер-экстеншен-анализа было продемонстрировано как положительное, так и отрицательное воздействие на их транскрипцию HspR и/или HrcA, но одновременное связывание двух регуляторов с промоторами этих генов не установлено. Полагают, что регуляция экспрессии в данном случае включает непрямые механизмы. Кроме того, показано, что 14 из 29 генов, положительно регулируемых HspR и HrcA, кодируют биосинтез жгутиков, что объясняет утрату подвижности у hrcA- и hspR-мутантов. Обсуждается возможное пересечение регуляции ответа на тепловой шок и сборку жгутика. Италия, Dep. Biol., Univ. Bologna, Bologna. Библ. 37
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТЕПЛОВОЙ ШОК
ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯТОРЫ

HSPR

HRCA

ДНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

ТРАНСКРИПТОМНЫЙ АНАЛИЗ

ЖГУТИКИ

СБОРКА

HELICOBACTOR PYLORI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Roncarati, Davide; Danielli, Alberto; Spohn, Gunther; Delany, Isabel; Scarlato, Vincenzo


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.02-04Б2.174

   

    Growth phase and metal-dependent transcriptional regulation of the fecA genes in Helicobacter pylori [Text] / Alberto Danielli [et al.] // J. Bacteriol. - 2009. - Vol. 191, N 11. - P3717-3725 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Зависимая от фазы роста и от металлов транскрипционная регуляция генов fecA Helicobacter pylori
Аннотация: Регуляция поглощения металлов важна для поддержания их внутриклеточной концентрации. Исследовали транскрипционный контроль, осуществляемый двумя регуляторами Helicobacter pylori Fur (регулятор железа) и NikR (регулятор никеля), или тремя копиями генов fecA, представленными в этом виде. С помощью мониторинга образцов транскрипции установили, что экспрессия трех генов fecA регулируется во времени путем ответа на металл различными путями и селективно контролируется одним из двух регуляторов. fecA1 экспрессируется на постоянном уровне во время роста, и его экспрессия чувствительна к железу, экспрессия fecA2, в основном, выключена, наблюдается минимальная экспрессия в позднюю экспоненциальную фазу. Экспрессия fecA3 максимальная в раннюю экспоненциальную фазу, постепенно уменьшается во времени и репрессируется никелем. Картировали сайты каждого регулятора в промоторных районах с помощью футпринтирования с ДНК-азой I и с помощью праймерного анализа транскриптов fecA в делеционных fur и nikR штаммах. Показали, что экспрессия каждого гена fecA регулируется доступностью металла и зависит от фазы роста, что позволило сделать заключение о специфичных функциях трех различных гомологов FecA. Италия, Dep. of Biology, Univ. of Bologna, Bologna. Библ. 33
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ FECA

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

ФАЗА РОСТА

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

РЕГУЛЯТОР ЖЕЛЕЗА FUR

РЕГУЛЯТОР НИКЕЛЯ NIKR

HELICOBACTER PYLORI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Danielli, Alberto; Romagnoli, Simona; Roncarati, Davide; Costantino, Lorenzo; Delany, Isabel Scarlato Vincenzo


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.07-04Б2.168

   

    OxyR tightly regulates catalase expression in Neisseria meningitidis through both repression and activation mechanisms [Text] / Raffaele Ieva [et al.] // Mol. Microbiol. - 2008. - Vol. 70, N 5. - P1152-1165 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: OxyR усиленно регулирует экспрессию каталазы в Neisseria meningitides через механизмы как репрессии, так и активации
Аннотация: Механизмы перекрывания окислительного стресса важны для выживания патогенных Neisseria meningitides в организме человека. Исследовали механизм, в котором OxyR полностью регулирует ген каталазы в Neisseria meningitides. Детальный транскрипционный анализ показал, что каталаза транскрибируется с единственного промотора, индуцируемого перекисью водорода OxyR-зависимым образом. Два ключевых остатка цистеина важны для этого. OxyR также репрессирует промотор kat: экспрессия kat в нуль-мутанте на конститутивном уровне выше, чем в не индуцированном, но ниже, чем на индуцированных перекисью уровнях в штамме дикого типа. Полученные результаты соответствуют модели, согласно которой OxyR связывается с промотором kat и влияет: 1 - на репрессию транскрипции в отсутствии сигнала окислительного стресса (OS); 2 - на активацию промотора в ответ на сигнал (OS). Этот двойной механизм может осуществлять контроль экспрессии kat, поскольку каталаза синтезируется только, когда она необходима. Полученные данные могут объяснить парадоксальное изменение фенотипов устойчивости в мутантах Neisseria, где мутанты oxyR более устойчивы, чем штаммы дикого типа к действию окислителей. Италия, Dep. of Microbial Molecular Biology, Novartis Vaccines, Via Fiorentina 1, 53100 Siena. Библ. 5
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ КАТАЛАЗЫ

ТРАНСКРИПЦИЯ

ПРОМОТОР KAT

РЕПРЕССИЯ

АКТИВАЦИЯ

СТРЕСС

H[2]O[2]

ЗАВИСИМОСТЬ

БЕЛОК OXYR

УСТОЙЧИВОСТЬ

ОКИСЛИТЕЛИ

МУТАНТЫ OXYR

NEISSERIA MENINGITIDIS (BACT.)

ВЫЖИВАНИЕ

ЧЕЛОВЕК


Доп.точки доступа:
Ieva, Raffaele; Roncarati, Davide; Metruccio, Matteo M.E.; Seib, Kate L.; Scarlato, Vincenzo; Delany, Isabel


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.07-04Б4.89

   

    OxyR tightly regulates catalase expression in Neisseria meningitidis through both repression and activation mechanisms [Text] / Raffaele Ieva [et al.] // Mol. Microbiol. - 2008. - Vol. 70, N 5. - P1152-1165 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: OxyR усиленно регулирует экспрессию каталазы в Neisseria meningitides через механизмы как репрессии, так и активации
Аннотация: Механизмы перекрывания окислительного стресса важны для выживания патогенных Neisseria meningitides в организме человека. Исследовали механизм, в котором OxyR полностью регулирует ген каталазы в Neisseria meningitides. Детальный транскрипционный анализ показал, что каталаза транскрибируется с единственного промотора, индуцируемого перекисью водорода OxyR-зависимым образом. Два ключевых остатка цистеина важны для этого. OxyR также репрессирует промотор kat: экспрессия kat в нуль-мутанте на конститутивном уровне выше, чем в не индуцированном, но ниже, чем на индуцированных перекисью уровнях в штамме дикого типа. Полученные результаты соответствуют модели, согласно которой OxyR связывается с промотором kat и влияет: 1 - на репрессию транскрипции в отсутствии сигнала окислительного стресса (OS); 2 - на активацию промотора в ответ на сигнал (OS). Этот двойной механизм может осуществлять контроль экспрессии kat, поскольку каталаза синтезируется только, когда она необходима. Полученные данные могут объяснить парадоксальное изменение фенотипов устойчивости в мутантах Neisseria, где мутанты oxyR более устойчивы, чем штаммы дикого типа к действию окислителей. Италия, Dep. of Microbial Molecular Biology, Novartis Vaccines, Via Fiorentina 1, 53100 Siena. Библ. 5
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.19.99
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ КАТАЛАЗЫ

ТРАНСКРИПЦИЯ

ПРОМОТОР KAT

РЕПРЕССИЯ

АКТИВАЦИЯ

СТРЕСС

H[2]O[2]

ЗАВИСИМОСТЬ

БЕЛОК OXYR

УСТОЙЧИВОСТЬ

ОКИСЛИТЕЛИ

МУТАНТЫ OXYR

NEISSERIA MENINGITIDIS (BACT.)

ВЫЖИВАНИЕ

ЧЕЛОВЕК


Доп.точки доступа:
Ieva, Raffaele; Roncarati, Davide; Metruccio, Matteo M.E.; Seib, Kate L.; Scarlato, Vincenzo; Delany, Isabel


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.11-04Б2.128

   

    Growth phase and metal-dependent transcriptional regulation of the fecA genes in Helicobacter pylori [Text] / Alberto Danielli [et al.] // J. Bacteriol. - 2009. - Vol. 191, N 11. - P3717-3725 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Зависимая от фазы роста и от металлов транскрипционная регуляция генов fecA Helicobacter pylori
Аннотация: Регуляция поглощения металлов важна для поддержания их внутриклеточной концентрации. Исследовали транскрипционный контроль, осуществляемый двумя регуляторами Helicobacter pylori Fur (регулятор железа) и NikR (регулятор никеля), или тремя копиями генов fecA, представленными в этом виде. С помощью мониторинга образцов транскрипции установили, что экспрессия трех генов fecA регулируется во времени путем ответа на металл различными путями и селективно контролируется одним из двух регуляторов. fecA1 экспрессируется на постоянном уровне во время роста, и его экспрессия чувствительна к железу, экспрессия fecA2, в основном, выключена, наблюдается минимальная экспрессия в позднюю экспоненциальную фазу. Экспрессия fecA3 максимальная в раннюю экспоненциальную фазу, постепенно уменьшается во времени и репрессируется никелем. Картировали сайты каждого регулятора в промоторных районах с помощью футпринтирования с ДНК-азой I и с помощью праймерного анализа транскриптов fecA в делеционных fur и nikR штаммах. Показали, что экспрессия каждого гена fecA регулируется доступностью металла и зависит от фазы роста, что позволило сделать заключение о специфичных функциях трех различных гомологов FecA. Италия, Dep. of Biology, Univ. of Bologna, Bologna. Библ. 33
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ FECA

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

ФАЗА РОСТА

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

РЕГУЛЯТОР ЖЕЛЕЗА FUR

РЕГУЛЯТОР НИКЕЛЯ NIKR

HELICOBACTER PYLORI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Danielli, Alberto; Romagnoli, Simona; Roncarati, Davide; Costantino, Lorenzo; Delany, Isabel Scarlato Vincenzo


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 14.04-04Б2.174

    Roncarati, Davide.

    CbpA acts as modulator of HspR repressor DNA binding activity in Helicobacter pylori [Text] / Davide Roncarati, Alberto Danielli, Vincenzo Scarlato // J. Bacteriol. - 2011. - Vol. 193, N 20. - P5629-5636 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: CbpA действует как модулятор ДНК-связывающей активности репрессора HspR у Helicobacter pylori
Аннотация: У Helicobacter pylori экспрессия основных белков теплового шока (Hsp) регулируется репрессорами трансркипции HspR и HrcA. Сродство HrcA к ДНК, в свою очередь, регулируется на посттранскрипционном уровне зависимым от GroESL образом. Показано, что шаперон CbpA также участвует в посттранскрипционном контроле регуляторной сети тепловго шока по механизму обратной связи. CbpA специфически модулирует ДНК-связывающую активность HspR in vitro, не влияя на активность HrcA. CbpA прямо взаимодействует с HspR, предотвращая связывание репрессора с его мишенями. Взаимодействие возможно лишь со свободным HspR, но не со связанным с ДНК репрессором. Италия, Dep. Biol., Univ. Bologna, 40126 Bologna. Библ. 33
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.09
Рубрики: HELICOBACTER PYLORI (BACT.)
ТЕПЛОВОЙ ШОК

ШАПЕРОНЫ

CBPA

ПОСТТРАНСКРИПЦИОННЫЙ КОНТРОЛЬ


Доп.точки доступа:
Danielli, Alberto; Scarlato, Vincenzo


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 14.04-04Б4.112

    Roncarati, Davide.

    CbpA acts as modulator of HspR repressor DNA binding activity in Helicobacter pylori [Text] / Davide Roncarati, Alberto Danielli, Vincenzo Scarlato // J. Bacteriol. - 2011. - Vol. 193, N 20. - P5629-5636 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: CbpA действует как модулятор ДНК-связывающей активности репрессора HspR у Helicobacter pylori
Аннотация: У Helicobacter pylori экспрессия основных белков теплового шока (Hsp) регулируется репрессорами трансркипции HspR и HrcA. Сродство HrcA к ДНК, в свою очередь, регулируется на посттранскрипционном уровне зависимым от GroESL образом. Показано, что шаперон CbpA также участвует в посттранскрипционном контроле регуляторной сети тепловго шока по механизму обратной связи. CbpA специфически модулирует ДНК-связывающую активность HspR in vitro, не влияя на активность HrcA. CbpA прямо взаимодействует с HspR, предотвращая связывание репрессора с его мишенями. Взаимодействие возможно лишь со свободным HspR, но не со связанным с ДНК репрессором. Италия, Dep. Biol., Univ. Bologna, 40126 Bologna. Библ. 33
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.09
Рубрики: HELICOBACTER PYLORI (BACT.)
ТЕПЛОВОЙ ШОК

ШАПЕРОНЫ

CBPA

ПОСТТРАНСКРИПЦИОННЫЙ КОНТРОЛЬ


Доп.точки доступа:
Danielli, Alberto; Scarlato, Vincenzo


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 14.05-04Б4.103

   

    A convenient and robust in vivo reporter system to monitor gene expression in the human pathogen Helicobacter pylori [Text] / Andrea Vannini [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2012. - Vol. 78, N 18. - P6524-6533 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Удобная и устойчивая in vivo репортерная система мониторирования экспрессии генов в патогене человека Helicobacter pylori
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.09
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
АНАЛИЗ IN VIVO

РЕПОРТЕРНАЯ СИСТЕМА

КАССЕТА LUXCDABE

HELICOBACTER PYLORI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Vannini, Andrea; Agriesti, Francesca; Mosca, Flaviana; Roncarati, Davide; Scarlato, Vincenzo; Danielli, Alberto


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 16.12-04Б2.147

    Roncarati, Davide.

    The HrcA repressor is the thermosensor of the heat-shock regulatory circuit in the human pathogen Helicobacter pylori [Text] / Davide Roncarati, Alberto Danletll, Vincenzo Scarlato // Mol. Microbiol. - 2014. - Vol. 92, N 5. - P910-920 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Репрессор HrcA является термосенсором регуляторной цепи теплового шока патогена человека Helicobacter pylori
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: СТРЕСС
ТЕПЛОВОЙ ШОК

ГЕНЫ

РЕГУЛЯТОРНАЯ ЦЕПЬ

РЕПРЕССОРЫ

HRCA

HELICOBACTER PYLORI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Danletll, Alberto; Scarlato, Vincenzo


 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)