СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Kypr, Jaroslav$<.>)

Общее количество найденных документов : 6
Показаны документы с 1 по 6

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 96.09-04А3.577

Mrazek, Jan.
Middle-range clustering of nucleotides in genomes [Text] / Jan Mrazek, Jaroslav Kypr // Comput. Appl. Biosci. - 1995. - Vol. 11, N 2. - P195-199 . - ISSN 0266-7061
Перевод заглавия: Кластеризация среднего уровня нуклеотидов в геномах
Аннотация: Разработан относительно простой компьютерный алгоритм, позволяющий оценивать уровни кластеризации нуклеотидов и их сочетаний в геномах: в качестве исходного материала используются данные, включаемые в различные базы данных (при разработке метода использована база данных EMBL). В апробируемой модели анализируются уровни кластеризации каждого из 4 нуклеотидов на участках длиной до 100 п. н. Отмечен ряд отчетливых закономерностей: в частности, в геномах всех тестированных групп организмов отмечено, что в кластеры Ц реже всего "внедряется" А, а в кластерах T наиболее редок нуклеотид Г. Также имелись существенные различия в распространении некоторых кластеров в разных группах - в частности, в геномах позвоночных наиболее часто встречаются кластеризация пары ЦГ. Также полученные данные обсуждены в связи с поиском закономерностей расположения нуклеотидов и их кластеров в разных участках геномов - отмечено, что при расстояниях 1 т. п. н. такая связь не проявляется. Чехия, Inst. Biophys., Acad. Sci. Czech Rep., CZ-61265 Brno. Библ. 13

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: МЕТОДЫ
ГЕНОМЫ
НУКЛЕОТИДЫ
КЛАСТЕРИЗАЦИЯ
КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Kypr, Jaroslav

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.04-04Б2.209

Haring, David.
Escherichia coli genome is composed of two distinct types of nucleotide sequences [Text] / David Haring, Jaroslav Kypr // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 2000. - Vol. 272, N 2. - P571-575 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Геном Escherichia coli состоит из двух разных типов нуклеотидных последовательностей
Аннотация: Рассчитаны корреляции распределения 4 нуклеотидов в целом геноме Escherichia coli. Кластерный анализ распределений корреляции показал, что геном состоит из 2 качественно разных типов промоторных последовательностей. Первый тип проявляет сильные корреляции геномных распределений А*Т и Г*Ц и сильные антикорреляции для А*Ц и Г*Т. Для второго типа характерны слабые корреляции, типичные для случайных последовательностей. Оба типа последовательностей одинаково представлены в геноме E. coli, и их длина составляет от нескольких сот нуклеотидов до 70 т. н. Они не различаются по содержанию Г+Ц, но сильные корреляции и антикорреляции характерны для последовательностей, богатых А+Т. Обсуждаются причины мозаичной структуры генома E. coli. Чехия, Inst. Biophys., Acad. Sci., CZ-61265 Brno. Библ. 33

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМ
РАСПРЕДЕЛЕНИЕ НУКЛЕОТИДОВ
А*Т
Г*Ц
АНТИКОРРЕЛЯЦИЯ
А*Ц
Г*Ц
МОЗАИЧНАЯ СТРУКТУРА
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kypr, Jaroslav

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 90.07-04Б1.422

Kypr, Jaroslav.
Nucleotide composition bias and CpG dinucleotide content in the genomes of HIV and HTLV 1/2 [Text] / Jaroslav Kypr, Jan Mzek, Josef Reich // Biochim. et Biophys. acta. Gene. Struct. and Express. - 1989. - Vol. 1009, N 3. - P280-282 . - ISSN 0167-4781
Перевод заглавия: Нуклеотидный состав и содержание динуклеотида ЦфГ в геномах вирусов HIV и HTLV 1/2
Аннотация: Изучение нуклеотидного состава подсемейства HIV и HTLV 1 и 2 показало, что они различаются принципиально. Геном HIV обогащен по аденину и обеднен по цитозину, в то время как для HTLV имеет место обратная ситуация, т. е. обогащение по цитозину и обеднение по аденину. В дополнение к этому динуктеотиды ЦфГ фактически не выявляются в геномах HIV, но широко представлены в HTLV. Т. обр., имеется мимикрия геномов HIV и HTLV с (А+Т)обогащенными или (Г+Ц)-обогащенными участками генома хозяина соответственно. По-видимому, эти существенные различия между ретровирусами человека могут иметь значение для интеграции в специфический участок хромосомы человека. Чехословакия, Inst. of Biophysics, Brno CS-612. Библ. 17.

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.23.17
Рубрики: РЕТРОВИРУСЫ ЧЕЛОВЕКА
ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ВИРУСЫ ЛЕЙКОЗА Т-КЛЕТОЧНОГО ЧЕЛОВЕКА
ГЕНОМ
НУКЛЕОТИДНЫЙ СОСТАВ
РАЗЛИЧИЯ

Доп.точки доступа:
Mzek, Jan; Reich, Josef

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 91.02-04Б1.454

Kypr, Jaroslav.
Reading frames of HIV genes [Text] / Jaroslav Kypr, Jan Mrazek // J. Theor. Biol. - 1989. - Vol. 141, N 3. - P423-424 . - ISSN 0022-5193
Перевод заглавия: Рамки считывания генов ВИЧ
Аннотация: Изучение нуклеотидных последовательностей ДНК различного происхождения обнаружило наличие систематически возникающих ошибок в кодонах, что является результатом действия многочисленных факторов. Проанализировали кодоновую информацию в 5 участках HIV-генов. Обнаружено, что HIV-гены содержат поразительно высокое число кодонов с потенциальной возможностью дестабилизации третичной структуры кодируемых белков. Учитывая, что геном HIV генетически гипервариабелен, неясно, что при столь значительном кол-ве дестабилизирующих кодонов в HIV-генах осуществляется высокоэффективная трансляция белков HIV. Высказывается предположение, что достаточно одного единственного цикла репликации вируса, чтобы образовалось некоторое кол-во вирусных частиц с изменением антигенных детерминант. Эти частицы не узнаются АТ, возникшими против "их родителей", и именно они дают начало новой вирусной генерации. Чехо-Словакия, Inst. of Biophysics, Czechoslovak Academy of Sciences, 612 65 Brno.

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.23.17
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ДНК ВИРУСНАЯ
ОШИБКИ В КОДОНАХ
БЕЛКИ
ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА
ДЕСТАБИЛИЗАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Mrazek, Jan

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 93.09-04А3.491

Mrazek, Jan.
GLOBIC: a very fast microcomputer program for fingerprinting, characterization and comparison of long nucleotide sequences [Text] / Jan Mrazek, Jaroslav Kypr // Comput. Appl. Biosci. - 1992. - Vol. 8, N 1. - P29-34 . - ISSN 0266-7061
Перевод заглавия: GLOBIC - очень быстрая программа для микро-ЭВМ для выделения фингерпринтинга, получения характеристик и сравнения длинных последовательностей нуклеотидов
Аннотация: Разработана программа GLOBIC, дающая возможность сравнивать длинные (до 100 тыс. гетероциклических оснований) последовательности из нескольких минут на ЭВМ IBM AT. Вместо сравнения собственного нуклеотидных последовательностей программа сравнивает локальные нуклеотиды или короткие нуклеотидные структуры. На выход выдается 2-мерная карта контурных линий, соотв. сходным участкам 2-х последовательностей. Разработан словарь, позволяющий интерпретировать такие картины. Приведены примеры использования программы GLOBIC для анализа нуклеотидных последовательностей генома бактериофага Т7, аденовируса типа 2 и вируса Эпштейна - Барра. Чехия, Inst. of Biophysics, Czechoslovak Academy of Sci., CS-61265, Brno. Ил. 7. Библ. 13.

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: ОБРАБОТКА ДАННЫХ
ПРОГРАММЫ
GLOBIC
МИКРОЭВМ
ФИНГЕРПРИНТИНГ
ДЛИННЫЕ НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СРАВНЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Kypr, Jaroslav

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 94.03-04А3.493

Mrazek, Jan.
DNABIND: an interactive microcomputer program searching for nucleotide sequences that may code for conserved DNA-binding protein motifs [Text] / Jan Mrazek, Jaroslav Kypr // Comput. Appl. Biosci. - 1992. - Vol. 8, N 4. - P401-404 . - ISSN 0266-7061
Перевод заглавия: DNABINO - интерактивная программа на микро-ЭВМ для поиска нуклеотидных последовательностей, которые могут кодировать сохранившиеся связанные с ДНК белковые мотивы
Аннотация: Предложена программа DNABIND для интерактивного поиска нуклеотидных последовательностей, к-рые могут кодировать мотивы типа спираль-виток-спираль в белках. Метод анализа был описан ранее (Dodd I. B., Egan J. B. "J. Mol. Biol.", 1987, 194, 557-564); предложен ряд его модификаций, обеспечивающих расширение возможностей. Показано, что программа успешно обнаруживает все 4 известных мотива в генах бактериофага лямбда. Приведены примеры ее реальной работы. Чехия, Inst. of Biophysics, Czech Academy of Sci., Kralovopolska 135, CS-61265 Brno. Табл. 1. Библ. 15.

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: ПРОГРАММЫ
DNABIND
НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
БЕЛКОВЫЕ МОТИВЫ
ПОИСК

Доп.точки доступа:
Kypr, Jaroslav

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска