Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>A=Пономаренко, М. П.$<.>)
Общее количество найденных документов : 17
Показаны документы с 1 по 17
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 99.01-04А3.948

   
    Функциональные сайты геномов про- и эукариот: Компьютерное моделирование и предсказание активности [Текст] / Н. А. Колчанов [и др.] // Молекул. биол. - 1998. - Т. 32, N 2. - С. 255-267 . - ISSN 0026-8984
Аннотация: Предложен подход к предсказанию активности функциональных сайтов ДНК и РНК, к-рый включает: 1) выявление контекстно-зависимых конформационных, физико-химических и статистических характеристик сайтов, значимых для их функционирования; 2) создание на их основе моделей для предсказания активности сайтов по их последовательностям; 3) автоматическую генерацию программ для предсказания активности сайтов на основе этих моделей. Этот подход реализован в компьютерной системе Activity, важными составными частями к-рой являются база данных по активности сайтов и база данных по конформационным, физико-химическим и статистическим свойствам ДНК и РНК. Activity доступна молекулярным биологам по Internet (http://www.bionet.nsc.ru/SRCG/Activity/) и позволяет в реальном времени анализировать экспериментальные данные по активности сайтов. Проанализированы 70 выборок сайтов, участвующих в различных молекулярно-биологических процессах. Выявлены статистические, конформационные и физико-химические характеристики, значимые для активности этих сайтов. Построены методы предсказания активности сайтов на основе их нуклеотидных последовательностей. Россия, Ин-т цитологии и генетики Сибирского отделения РАН, Новосибирск, 630090. Библ. 49
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: КОМПЬЮТЕРНЫЕ МЕТОДЫ
ДНК
РНК
ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ САЙТЫ
АКТИВНОСТЬ
ПРЕДСКАЗАНИЕ
ПРОГРАММА ACTIVITY

Доп.точки доступа:
Колчанов, Н.А.; Пономаренко, М.П.; Пономаренко, Ю.В.; Подколодный, Н.Л.; Фролов, А.С.

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 99.04-04А3.834

   
    Компьютерный анализ конформационных особенностей ДНК ТАТА-боксов промоторов эукариот [Текст] / М. П. Пономаренко [и др.] // Молекул. биол. - 1997. - Т. 31, N 4. - С. 733-740 . - ISSN 0026-8984
Аннотация: Разработан метод выявления локальных конформационных особенностей сайтов связывания транскрипционных факторов, основанный на использовании конформационных параметров гексануклеотидных дуплексов B-формы ДНК и компьютерной системы SITEVIDEO. Проведенный анализ содержащих TATA-бокс последовательностей выявил наличие участков в промоторах, на к-рых средние значения ряда конформационных параметров B-формы ДНК значимо отличаются от их значений для случайных последовательностей. Установлено, что ДНК TATA-боксов имеет более низкий по сравнению со случайными последовательностями угол спирального вращения, меньшее расстояние между соседними парами оснований вдоль оси спирали ДНК, более широкий минорный желобок и более узкий главный. Россия, Ин-т цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, 630090. Библ. 34
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.09.99
Рубрики: ДНК
B-ФОРМА
ПРОМОТОРЫ
TATA-БОКСЫ
КОНФОРМАЦИОННЫЕ ОСОБЕННОСТИ
КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ
ЭУКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
Пономаренко, М.П.; Пономаренко, Ю.В.; Кель, А.Э.; Колчанов, Н.А.; Карас, Х.; Вингендер, Э.; Скленар, Х.

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 99.06-04А3.9

   
    Компьютерное моделирование последовательностей ТАТА-боксов промоторов эукариот [Текст] / М. П. Пономаренко [и др.] // Докл. РАН. - 1997. - Т. 355, N 4. - С. 557-561 . - ISSN 0869-5652
Аннотация: К числу ключевых элементов промоторов эукариотических генов, транскрибируемых РНК-полимеразой II, относятся TATA-боксы, к-рые являются сайтами связывания TATA-связывающего белка (TBP). В работе с помощью технологии Site Video осуществлено исследование нуклеотидных последовательностей TATA-боксов и выявлены их контекстные особенности, определяющие эффективность TBP-TATA-связывания. На основе учета выявленных контекстных особенностей построен компьютерный метод оценки аффинности TBP к TATA-содержащему району промотора по его нуклеотидной последовательности. С помощью этого метода осуществлено компьютерное моделирование нуклеотидных последовательностей, обладающих максимальной аффинностью к TBP. Показано, что модельные последовательности достоверно сходны с TATA-содержащими районами природных промоторов по консенусам, по частотам нуклеотидов и по др. характеристикам. Россия, Ин-т цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск. Библ. 9
ГРНТИ  
34.55.15
ВИНИТИ 341.55.15.09
Рубрики: ДНК
ПРОМОТОР
TATA-БОКС
НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
TATA-СВЯЗЫВАЮЩИЙ БЕЛОК
АФФИННОСТЬ
КОМПЬЮТЕРНЫЙ МЕТОД ОЦЕНКИ
ЭУКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
Пономаренко, М.П.; Савинкова, Л.К.; Кель, А.Э.; Колчанов, Н.А.

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.12-04Б2.291

   
    Предпочтительность RecA-филамента к последовательностям ДНК коррелирует с генетическим кодом [Текст] / М. П. Пономаренко [и др.] // Докл. РАН. - 1998. - Т. 363, N 1. - С. 122-125 . - ISSN 0869-5652
Аннотация: С помощью компьютерной системы ACTIVITY исследованы данные о сродстве RecA-филамента к ДНК. Установлено, что это сродство убывает с ростом конц-ции тринуклеотидов DRV = {AAA, AAC, AGA, AGC, GAA, GAC, GGA, GGC, TAA, TGA, AAG, AGG, TAG, TGG, GAG, GGG, GGG, TAC, TGC}. Показано, что тринуклеотиды DRV кодируют аминокислоты, формирующие поверхности белковых глобул с их функциональными сайтами, и не кодируют аминок-ты из глобулярных ядер белков. Это согласуется с консервативностью функциональных сайтов белков и блочными перестройками ядер белковых глобул. Россия, ИЦиГ, Новосибирск. Библ. 10
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.13.03
Рубрики: НУКЛЕИНОВО-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ДНК
БЕЛОК RECA
СРОДСТВО
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОД
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Пономаренко, М.П.; Пономаренко, Ю.В.; Титов, И.И.; Колчанов, Н.А.; Мазин, А.В.; Ковальчивоски, С.Ч.

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 99.12-04А3.996

   
    Предпочтительность RecA-филамента к последовательностям ДНК коррелирует с генетическим кодом [Текст] / М. П. Пономаренко [и др.] // Докл. РАН. - 1998. - Т. 363, N 1. - С. 122-125 . - ISSN 0869-5652
Аннотация: С помощью компьютерной системы ACTIVITY исследованы данные о сродстве RecA-филамента к ДНК. Установлено, что это сродство убывает с ростом конц-ции тринуклеотидов DRV = {AAA, AAC, AGA, AGC, GAA, GAC, GGA, GGC, TAA, TGA, AAG, AGG, TAG, TGG, GAG, GGG, GGG, TAC, TGC}. Показано, что тринуклеотиды DRV кодируют аминокислоты, формирующие поверхности белковых глобул с их функциональными сайтами, и не кодируют аминок-ты из глобулярных ядер белков. Это согласуется с консервативностью функциональных сайтов белков и блочными перестройками ядер белковых глобул. Россия, ИЦиГ, Новосибирск. Библ. 10
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.09.99
Рубрики: НУКЛЕИНОВО-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ДНК
БЕЛОК RECA
СРОДСТВО
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОД
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Пономаренко, М.П.; Пономаренко, Ю.В.; Титов, И.И.; Колчанов, Н.А.; Мазин, А.В.; Ковальчивоски, С.Ч.

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 01.03-04А3.654

   
    GeneExpress: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот [Текст] / Н. А. Колчанов [и др.] // Биофизика. - 1999. - Т. 44, N 5. - С. 837-841 . - ISSN 0006-3029
Аннотация: Текущая версия интегратора GeneExpress включает 5 основных информационно-вычислительных систем: 1) базу данных TRRD по регуляторным районам транскрипции эукариотических генов с программой ScanGroup для распознавания и анализа сайтов связывания транскрипционных факторов; 2) базу данных ACTIVITY по количественной активности функциональных сайтов ДНК и РНК с базой знаний по программам их предсказания; 3) базу данных LeaderRNA по влиянию лидерных последовательностей мРНК на эффективность их транскрипции; 4) базу данных SAMPLES по выборкам нуклеотидных последовательностей экспериментально установленных функциональных сайтов ДНК и их множественным выравниваниям с программами распознавания этих сайтов по их консенсусам, частотным матрицам и статистически значимым особенностям конформации их B-спирали ДНК; 5) базу данных GeneNet по генным сетям и путям сигнальной трансдукции, к-рая осуществляет интеграцию всех остальных информационно-вычислительных систем на основе взаимосвязей между описываемыми в них биологическими процессами и явлениями, http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/systems/GeneExpress/. Россия, Ин-т цитологии и генетики СО РАН, 630090, Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева 10. Библ. 1
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.02
Рубрики: БАЗЫ ДАННЫХ
ИНТЕГРАТОР GENEEXPRESS
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

Доп.точки доступа:
Колчанов, Н.А.; Пономаренко, М.П.; Кель, А.Э.; Кондрахин, Ю.В.; Фролов, А.С.; Колпаков, Ф.А.; Горячковская, Т.Н.; Кель, О.В.; Ананько, Е.А.; Игнатьева, Е.В.

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 01.10-04А3.980

   
    Базы знаний по молекулярной биологии [Текст] / М. П. Пономаренко [и др.] // 2-й Съезд биофизиков России, Москва, 23-27 авг., 1999. - М., 1999. - Т. 3. - С. 970 . - ISBN 5-201-14417-9
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БАЗЫ ДАННЫХ
ДНК
АННОТАЦИИ
МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ

Доп.точки доступа:
Пономаренко, М.П.; Пономаренко, Ю.В.; Фролов, А.С.; Подколодный, Н.Л.; Кочетов, А.В.; Колчанов, Н.А.

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 02.06-04А3.777

    Валуев, В. П.
    База знаний о некоторых белковых доменах [Текст] / В. П. Валуев, Д. А. Куропатов, М. П. Пономаренко // 2-й Съезд биофизиков России, Москва, 23-27 авг., 1999. - М., 1999. - Т. 3. - С. 939-940 . - ISBN 5-201-14417-9
Аннотация: Делается попытка разработать гибкий метод для анализа первичной структуры белка, который учитывает большое число методов распознавания образов (построение консенсуса, частотные матрицы, персептрон, линейный дискриминант Фишера, нейронные сети, скрытые Марковские цепи) и, наряду со стандартным 20-буквенным представлением, различные физико-химические свойства аминокислот. Создана база знаний Samples Prot (доступная с помощью системы SRS http://sgi.sscc.ru/srs5/), которую составляют выборки аминокислотных последовательностей доменов, извлеченные из базы данных Swiss Prot (при ее составлении исключались вероятные или классифицированные по гомологии последовательности), и знания об этих доменах в виде текстов распознающих программ с оценкой их достоверности. Россия, Ин-т цитологии и генетики СО РАН, 630090 Новосибирск
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БЕЛКОВЫЕ ДОМЕНЫ
БАЗА ЗНАНИЙ

Доп.точки доступа:
Куропатов, Д.А.; Пономаренко, М.П.

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.03-04А3.954

    Пономаренко, М. П.
    База данных по активности функциональных сайтов ДНК [Текст] / М. П. Пономаренко // 2 Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, Санкт-Петербург, 1-5 февр., 2000. - СПб, 2000. - Т. 2. - С. 234-235 . - ISBN 5-7997-0179-8
Аннотация: Создана база данных ACTIVITY по активности функциональных сайтов (http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/systems/activity/), которая является важной характеристикой, т. к. различия в уровнях активности сайтов являются основой дифференциальной активности генов и их координированного функционирования. В настоящее время база содержит описание более 500 экспериментов, описанных в 225 научных статьях. Один документ базы описывает один эксперимент. База содержит данные о промоторах различных генов, сайтах связывания транскрипционных факторов, сайтов встраивания мобильных генетических элементов и многих других типов сайтов ДНК про- и эукариотических геномов. В частности, для мутантных вариантов TATA-бокса доступна транскрипционная активность, а также время жизни его комплекса с TBP-белком и угол изгиба ДНК в этом комплексе. Активность сайтов характеризуется в таких терминах, как кинетические, термодинамические и равновесные константы, эффективности разрезания ДНК. При этом различные варианты сайтов могут значительно различаться по уровню активности в десятки и даже в сотни раз. Для каждого типа сайтов в документ ACTIVITY включаются гиперссылки на другие ресурсы ИНТЕРНЕТ об этом сайте, что позволяет найти дополнительные сведения об этом сайте. Россия, Ин-т цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: ДНК
ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ САЙТЫ
БАЗА ДАННЫХ ACTIVITY
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

10.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 14.12-04Н1.109

   
    Оценка по технологии rSNP Guide SNPs промоторов генов APC и MLH1 человека, связанных с раком толстого кишечника [Текст] / Д. А. Рассказов [и др.] // Вавил. ж. генет. и селекции. - 2013. - Т. 17, N 4. - С. 589-598 . - ISSN 1814-554X
Аннотация: Каждый из 6 регуляторных SNPs (Single nucleotide polymorphisms) генов APC и NLH1 человека (rs75996864, rs76241113, rs78037487, rs80112297, rs80313086 и rs1800734) был оценен по созданной ранее технологии rSNP Gulde на значимость изменения связывания каждого из 40 факторов транскрипции с соответствующими районами ДНК. В результате для каждого SNP все анализируемые белки были ранжированы по убыванию уровня статистической значимости 'альфа' (t-тест Стьюдента) изменения их сродства к аллельным вариантам указанной ДНК. Установлено, что самыми вероятными проявлениями SNPs rs75996864, rs76241113, rs78037487, rs80112297, rs80313086 гена АРС, а также SNP rs1800734 гена MLHI человека являются изменения в связывании именно тех транскрипционных факторов (NF-Y, NFkB, c-Myb, RAR, YY-I, SP-I), для которых ранее было показано участие в развитии рака толстого кишечника. Россия, ФГБУН "Ин-т цитологии и генетики" СО РАН. Библ. 21
ГРНТИ  
76.29.49
ВИНИТИ 761.29.49.03.23
Рубрики: БИОИНФОРМАТИКА
ОЦЕНКА SNP
ГЕНЫ
APC И MLH1
ПОЛИМОРФИЗМ
РАК ТОЛСТОГО КИШЕЧНИКА

Доп.точки доступа:
Рассказов, Д.А.; Антонцева, Е.В.; Брызгалов, Л.О.; Матвеева, М.Ю.; Кашина, Е.В.; Пономаренко, П.М.; Орлова, Г.В.; Пономаренко, М.П.; Афонников, Д.А.; Меркулова, Т.И.

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 89.07-04А1.60

    Пономаренко, М. П.
    Эволюционная оптимизованность первичной структуры белков по эффективности их самоорганизации [Текст] / М. П. Пономаренко, И. Н. Шиндялов // Пробл. макроэволюции. - М., 1988. - С. 48-49
Аннотация: Исследована закономерность самоорганизации м-л глобулярных белков с помощью топологического подхода. Показано, что их первичная структура оптимизирована по числу разрешенных околонативных конформаций при минимизировании времени самоорганизации. СССР, Ин-т цитологии и генетики СО АН СССР.
ГРНТИ  
34.03.17
ВИНИТИ 341.03.17.27.02
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
БЕЛКИ
ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА
ОПТИМИЗАЦИЯ
ЭФФЕКТИВНОСТЬ САМООРГАНИЗАЦИИ

Доп.точки доступа:
Шиндялов, И.Н.

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 90.09-04А3.501

    Пономаренко, М. П.
    Экспертная система быстрой оценки полезности использования произвольных характеристик биополимеров для их классификации [Текст] / М. П. Пономаренко, Ю. Л. Орлов // Компьютер. анал. структуры. Функции и эволюции генет. макромолекул. - Новосибирск, 1989. - С. 197-220
Аннотация: Описывается экспертная система для быстрой автоматической оценки полезности использования заданных х-к для классификации биол. макромолекул. Принцип работы экспертной системы состоит в детальном анализе широкого спектра статистических св-в каждой рассматриваемой х-ки. Отличительной конструктивной особенностью системы является широкое использование нечетких эмпирических исчислений в рамках теории аддитивной полезности Сэвиджа (Фишберн П. Теория полезности для принятия решений. М.: Наука, 1978). Данное обстоятельство позволяет экспертной системе использовать в процессе рассмотрения каждой предложенной ей х-ки теор. и эвристические знания 2-х типов: а) априорные знания по теории распознавания образцов и мат. статистике (заложенные в ней в виде библиотеки подпрограммы на яз. фортран-7 для ПЭВМ IBM-PC), б) апостериорные знания о статистических св-вах рассматриваемой х-ки, приобретаемые системой в процессе работы и выраженные в колич. форме аддитивной полезности. ИЦиГ СО АН СССР, г. Новосибирск.
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.09.17
Рубрики: АВТОМАТИЗАЦИЯ ИССЛЕДОВАНИЙ
ЭКСПЕРТНЫЕ СИСТЕМЫ
МАКРОМОЛЕКУЛЫ
КЛАССИФИКАЦИЯ
ПОЛЕЗНОСТЬ ХАРАКТЕРИСТИК

Доп.точки доступа:
Орлов, Ю.Л.

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 90.09-04А3.505

   
    Компьютерная система для изучения ДНК (РНК) - взаимодействующих белков [Текст] / Д. Н. Бенюх [и др.] // Компьютер. анал. структурн. функции и эволюции генет. макромолекул. - Новосибирск, 1989. - С. 243-263
Аннотация: Описывается компьютерная система, предназначенная для изучения белков, взаимодействующих с ДНК (РНК), и содержащая базу знаний и комплекс программ, распознающих структурно-функциональные детерминанты. Под структурно-функциональной детерминантой понимается участок первичной структуры белка, обладающий специфическим составом аминокислотных остатков, характеризующихся определенной локализацией в первичной структуре, и имеющей отношение к определенной биол. ф-ции белка. Представлены результаты использования программы при сканировании Банка PIl, целью к-рого было установление обл. перехода N-концевого домена в центральный гидрофобный домен для: а) гистонов H1; б) гистонов всех имеющихся в банке семейств H1, .2АА, Н2В, Н3, Н4, Н5; с) всех ДНК (РНК) взаимодействующих белков Банка PIR. ИЦиГ СО АН СССР, г. Новосибирск. Библ. 10.
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.09.17
Рубрики: АВТОМАТИЗАЦИЯ ИССЛЕДОВАНИЙ
КОМПЬЮТЕРНЫЕ СИСТЕМЫ
ДНК (РНК)-ВЗАИМОДЕЙСТВУЮЩИЕ БЕЛКИ
БАЗА ЗНАНИЙ
ПРОГРАММЫ

Доп.точки доступа:
Бенюх, Д.Н.; Пономаренко, М.П.; Колчаков, Н.А.; Орлов, Ю.Л.

14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 90.09-04А3.508

   
    Компьютерная система анализа функциональных сайтов в полинуклеотидных последовательностях [Текст] / А. Э. Кель [и др.] // Компьютер. анал. структуры. функции и эволюции генет. макромолекул. - Новосибирск, 1989. - С. 221-242
Аннотация: Описывается 1-ая часть компьютерной системы, ориентированной на поиск закономерностей в распределении олигонуклеотидов и повторов различных типов в функциональных сайтах. На основе обучающей выборки функциональных сайтов в процессе работы системы производится вычисление большого кол-ва х-к, отражающих насыщенность определенными олигонуклеотидами и повторами функциональных сайтов. Информативность каждой х-ки оценивается с помощью комплекса программ статистического анализа. Из всего множества х-к выбирается набор информационно значимых. На их основе возможен поиск в нуклеотидных последовательностях функциональных сайтов определенного типа. Существенно, что в предлагаемом подходе производится автоматический выбор определенного набора информационно-значимых х-к без задания жесткого априорного предпочтения тем или иным х-кам и без формирования жесткой модели исследуемого функционального сайта. В качестве иллюстрации проводится анализ 2-х выборок функциональных сайтов прокариотических генов. ИЦиГ СО АН СССР, г. Новосибирск. Библ. 13.
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.09.17
Рубрики: АВТОМАТИЗАЦИЯ ИССЛЕДОВАНИЙ
КОМПЬЮТЕРНЫЕ СИСТЕМЫ
МАКРОМОЛЕКУЛЫ
ПОЛИНУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ САЙТЫ

Доп.точки доступа:
Кель, А.Э.; Пономаренко, М.П.; Орлов, Ю.Л.; Мищенко, Т.М.; Колчанов, Н.А.

15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 90.10-04А1.102

    Пономаренко, М. П.
    Взаимосвязь между первичными и топологическими структурами белков и ее эволюционная консервативность [Текст] / М. П. Пономаренко, И. Н. Шиндялов, Н. А. Колчанов // Молекул. механизмы генет. процессов. - М., 1990. - С. 98-99
Аннотация: На основании исследования первичной структуры 55 белков, имеющих топологию (Т) 5 типов, выделен набор х-к аминокислотных последовательностей, обеспечивающих предсказание Т. Определенный комплекс св-в первичной структуры, детерминирующий Т белковой глобулы, обнаруживает высокую эволюционную консервативность. Эта консервативность связана либо с монофилетичностью белков, имеющих одинаковую Т, либо с конвергентным возникновением сходных структурных детерминант в случае белков с одинаковой Т. СССР, Ин-т цитологии и генетики СО АН СССР, Новосибирск.
ГРНТИ  
34.03.17
ВИНИТИ 341.03.17.27.02
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
КОНСЕРВАТИВНОСТЬ
БЕЛКА
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ТОПОЛОГИЯ
КОНВЕРГЕНЦИЯ

Доп.точки доступа:
Шиндялов, И.Н.; Колчанов, Н.А.

16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 90.10-04А1.103

    Стрелец, В. Б.
    Относительная независимость конформационного и функционального редактирования первичных структур белков в ходе их эволюции [Текст] / В. Б. Стрелец, М. П. Пономаренко, Д. Н. Бенюх // Молекул. механизмы генет. процессов. - М., 1990. - С. 107
Аннотация: На примере 500 последовательностей белков, выполняющих 10 различных функций, показано, что при кодировании функций белков определяющую роль играют локальные и среднемасштабные особенности строения их первичных структур. Глобальные св-ва полипептидных цепей белков не столь важны, как это предполагалось ранее. Можно предположить, что функциональное редактирование белков в ходе эволюции не зависит от конформационного, что дает возможность коррекции биол. функций белков при сохранении их пространственных структур. СССР, Ин-т цитологии и генетики СО АН СССР, Новосибирск.
ГРНТИ  
34.03.17
ВИНИТИ 341.03.17.27.02
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
БЕЛКИ
ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА
БИОЛОГИЧЕСКИЕ ФУНКЦИИ

Доп.точки доступа:
Пономаренко, М.П.; Бенюх, Д.Н.

17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 91.02-04А3.571К

    Пономаренко, М. П.
    Банк пространственных структур биополимеров (для IBM-совместимых персональных ЭВМ) [Текст] / М. П. Пономаренко, И. Н. Шиндялов. - Препр. - Новосибирск : Ин-т цитол. и генет. СО АН СССР, 1990. - 57 с. : ил.
Аннотация: Содержание. 1) Введение. 2) Инструкция пользователю. 3) Ф-ции общего назначения. 4) Информация, доступная по номеру биополимера. 5) Информация, доступная по номеру субъединицы. 6) Информация, доступная по номеру фрагмента. 7) Структурно-функциональная организация белков. 8) Словари ключевых слов. 9) Каталоги мономерных единиц и гетерогруп. 10) Список кодов результатов работы. 11) Список функций банка пространственных структур биополимеров.
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29 + 341.05.17.07
Рубрики: БАНКИ ДАННЫХ
ПРОСТРАНСТВЕННЫЕ СТРУКТУРЫ БИОПОЛИМЕРОВ
IBM-СОВМЕСТИМЫЕ ПЕРСОНАЛЬНЫЕ ЭВМ

Доп.точки доступа:
Шиндялов, И.Н.
Свободных экз. нет
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)