СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=СТЭКИНГ<.>)

Общее количество найденных документов : 8
Показаны документы с 1 по 8

РЖ ВИНИТИ 34 (BI16) 95.04-04В3.018

Yang, Chi-Ming.
Influence of variation of pigment-protein complexes on the thylakoid grana stacking in higher plants [Text] : abstr. Pap. Annu. Meet. Amer. Soc. Plant Physiologists, Portland, Ore, July 30 - Aug. 1994 / Chi-Ming Yang, Yung-Reui Chen // Plant Physiol. - 1994. - Vol. 105, N 1 Suppl. - P82 . - ISSN 0032-0889
Перевод заглавия: Влияние различия пигмент-белковых комплексов на стэкинг тилакоидов в гранах высших растений
Аннотация: Исследовали морфологию тилакоидных мембран хлоропластов у 16 различных видов высших растений, отличающихся отношением хлорофилл а/хлорофилл b (Хл а/b). Обнаружена связь между Хл а/b и морфологическими вариантами тилакоидов, позволившая разделить исследованные растения на 6 групп: I - Хл а/b 1 (незначительный и неправильный стэкинг в гранах), II - 2,5Хл а/b3,5 (нормальный стэкинг), III - 4,5 Хл а/b6 (меньше компактных гран и меньше тилакоидов на грану, отсутствуют концентрические тилакоиды), IV - 10Хл а/b15 (мало гран, мало тилакоидов в гране, высокая частота концентрических тилакоидов, появляются расширения и волнистость межгранальных тилакоидов), V - 15Хл а/b20 (потеря стэкинга в гранах, низкая частота концентрических тилакоидов, расшерения и волнистость межгранальных тилакоидов), VI - Хл а/b

ГРНТИ	34.31.17

ВИНИТИ 341.31.17.25
Рубрики: ХЛОРОФИЛЛЫ
СООТНОШЕНИЕ
ХЛОРОПЛАСТЫ
ТИЛАКОИДЫ
СТЭКИНГ

Доп.точки доступа:
Chen, Yung-Reui

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 01.04-04Б1.179

Chou, Shan-Ho.
Cross-strand purine-pyrimidine stack and sheared purine pyrimidine pairing in the human HIV-1 reverse transcriptase inhibitors [Text] / Shan-Ho Chou, Yu-Yu Tseng // J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 285, N 1. - P41-48 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Межнитевой стэкинг пурин-пиримидин и сдвинутое спаривание пурин-пиримидин у ингибиторов обратной транскриптазы ВИЧ-1
Аннотация: Обнаружены новые типы межнитевого стэкинга (МНС) пурин-пиримидин (А-Ц) и пурин-пурин (Г-А), к-рые устанавливаются из сдвинутой пары А*Ц, смежной со сдвинутой парой Г*A в последовательности 5'-АА/ГЦ-3'. Эта последовательность "внутренней петли" сохраняется в 2 семействах онДНК - ингибиторов обратной транскриптазы ВИЧ-1. Искаженный остов этих ингибиторов, являющийся результатом уникальных спиральных изгибов в последовательности 5'-АА/ГЦ-3' может отвечать за повышение сродства этих онДНК-ингибиторов по сравнению с правильными дуплексными субстратами B-формы ДНК. Предложены 2 простых правила, объясняющие все описанные МНС. Тайвань, Inst. Biochem., Nat. Chung-Hsing Univ., Taichung 40227. Библ. 42

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.17
Рубрики: ИНГИБИТОРЫ
ИНГИБИТОРЫ ОБРАТНОЙ ТРАНСКРИПТАЗЫ ВИЧ-1
МЕЖНИТЕВОЙ СТЭКИНГ
НОВЫЕ ТИПЫ

Доп.точки доступа:
Tseng, Yu-Yu

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 03.05-04Б1.58

Пышный, Д. В.
Термодинамические параметры коаксиального стэкинга при гибридизации олигодезоксирибонуклеотидов встык [Текст] : докл. [International Conference "RNA as Genomics and Therapeutic Target", Новосибирск, 29 авг. - 2 сент., 2001] / Д. В. Пышный, Е. М. Иванова // Изв. РАН. Сер. хим. - 2002. - N 7. - С. 1057-1066 . - ISSN 0002-3353
Аннотация: Методом термической денатурации в растворе исследована стэкинг-гибридизация олигодезоксирибонуклеотидов встык с предформированным стеблем минишпилечной структуры ДНК-матрицы. Впервые определены термодинамические параметры ('ДЕЛЬТА'H{o}, 'ДЕЛЬТА'S{o} и 'ДЕЛЬТА'G{o}[37]) образования всех 16 возможных типов коаксиальных стэкингов (или кооперативных контактов) {5'}X{*}pY{3'}/{5'}ZZ{'3'} ("*" - одноцепочечный разрыв) между концевыми комплементарными парами оснований двух прилегающих дуплексных участков, сформированных на общей ДНК-матрице. Максимальная эффективность 'ДЕЛЬТА'G{o}[37] коаксиального стэкинга (1 М NaCl, pH 7.4) наблюдается для контакта G{*}pC/GC (-2.76 ккал*моль{-1}), а минимальная - для контакта T{*}pA/TA (-0.85 ккал*моль{-1}). Эффективность кооперативного контакта на стыке X{*}pY/ZZ' в общем случае не коррелирует с энергией образования соответствующей унифицированной динуклеотидной пары XY/ZZ' в структуре нативной ДНК. Основной и определяющий вклад в энергию кооперативного контакта вносит формирование вертикальной стопки концевыми основаниями олигонуклеотидов при их гибридизации встык. Россия, Новосибирский ин-т биоорганической химии СО РАН, 630090 Новосибирск. Библ. 44

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ДНК
КОАКСИАЛЬНЫЙ СТЭКИНГ
КООПЕРАТИВНЫЙ КОНТАКТ
ГИБРИДИЗАЦИЯ ВСТЫК
ТЕРМОСТАБИЛЬНОСТЬ
ДНК-ДУПЛЕКСЫ

Доп.точки доступа:
Иванова, Е.М.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI24) 07.05-04М3.88

Захаров, Г. А.
Роль стэкинг-взаимодействий в механизме связывания антагонистов с глициновым сайтом NMDA-рецептора [Текст] / Г. А. Захаров, Б. Ф. Щеголев // 34 Неделя науки СПбГПУ. - СПб, 2006. - Физико-механический факультет. Физико-технический факультет. Факультет медицинской физики и биоинженерии, Ч. 4. - С. 7-8
Аннотация: Исследовали роль стэкинг-взаимодействия в связывании кинуреновой кислоты с глициновым сайтом NMDA-рецептора. Энергия стэкинг-взаимодействия хлорзамещенных производных кинуреновой кислоты зависит от положения, по которому произведено хлорирование. Энергетический выигрыш при хлорировании достигает 1-1.5 ккал/моль. Хлорирование кинуреновой кислоты приводит к изменению относительного сдвига между хинолиновым и бензольным кольцом. Относительный сдвиг колец может достигать 1.5-2 А. В связывающем сайте рецептора такой сдвиг может существенно сказаться на количестве и характере образуемых лигандом водородных связей. Библ. 5

ГРНТИ	34.39.15

ВИНИТИ 341.39.15.25.19
Рубрики: NMDA-РЕЦЕПТОРЫ
ГЛИЦИНОВЫЙ САЙТ
КИНУРЕНОВАЯ КИСЛОТА
СТЭКИНГ-ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

Доп.точки доступа:
Щеголев, Б.Ф.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI32) 07.06-04Т1.130

Захаров, Г. А.
Роль стэкинг-взаимодействий в механизме связывания антагонистов с глициновым сайтом NMDA-рецептора [Текст] / Г. А. Захаров, Б. Ф. Щеголев // 34 Неделя науки СПбГПУ. - СПб, 2006. - Физико-механический факультет. Физико-технический факультет. Факультет медицинской физики и биоинженерии, Ч. 4. - С. 7-8
Аннотация: Исследовали роль стэкинг-взаимодействия в связывании кинуреновой кислоты с глициновым сайтом NMDA-рецептора. Энергия стэкинг-взаимодействия хлорзамещенных производных кинуреновой кислоты зависит от положения, по которому произведено хлорирование. Энергетический выигрыш при хлорировании достигает 1-1.5 ккал/моль. Хлорирование кинуреновой кислоты приводит к изменению относительного сдвига между хинолиновым и бензольным кольцом. Относительный сдвиг колец может достигать 1.5-2 А. В связывающем сайте рецептора такой сдвиг может существенно сказаться на количестве и характере образуемых лигандом водородных связей. Библ. 5

ГРНТИ	34.45.21

ВИНИТИ 341.45.21.23.39
Рубрики: NMDA-РЕЦЕПТОРЫ
ГЛИЦИНОВЫЙ САЙТ
КИНУРЕНОВАЯ КИСЛОТА
СТЭКИНГ-ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

Доп.точки доступа:
Щеголев, Б.Ф.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI24) 08.03-04М3.99

Роль стэкинг-взаимодействий в механизмах связывания кинуреновой кислоты с NR2A- и GLUR2-субъединицами ионотропных рецепторов глутамата [Текст] / А. В. Журавлев [и др.] // Рос. физиол. ж. - 2007. - Т. 93, N 6. - С. 609-624 . - ISSN 0869-8139
Аннотация: Продукты кинуренинового пути обмена триптофана играют важную роль в модуляции нейродегенеративных процессов в ЦНС. Кинуреновая кислота (KYNA) является эндогенным антагонистом ионотропных рецепторов глутамата, проявляющим специфическое сродство к глициновому сайту NR1-субъединицы NMDA-рецептора. Механизмы избирательного взаимодействия KYNA и ее производных с другими подтипами глутаматных рецепторов изучены недостаточно. С целью исследования роли стэкинг-взаимодействий в связывании кинуреновой кислоты с NR2A-субъединицей NMDA-рецептора и GluR2-субъединицей AMPA-рецептора проведены неэмпирические квантово-химические расчеты димера KYNA-имидазол, моделирующего взаимодействие лиганда с His88 фрагментом NR2A-субъединицы, а также димера KYNA-фенол, моделирующего взаимодействие лиганда с Tyr61 фрагментом GluR2 субъединицы. Энергия стэкинг-взаимодействия KYNA-H88 составляет 3.0-5.0 ккал/моль для предполагаемой ориентации лиганда в связывающем сайте и 10.2 ккал/моль для оптимизированной геометрии димера KYNA-имидазол. Энергия стэкинг-взаимодействия KYNA-Tyr61 составляет 6.7-8.5 ккал/моль для предполагаемой ориентации лиганда в сайте связывания. Полученные значения по величине сопоставимы с энергией водородных связей. Таким образом, стэкинг-взаимодействие должно обязательно учитываться при рассмотрении механизмов связывания молекул с рецепторами глутамата. Стэкинг-взаимодействие важно, по-видимому, для первичной ориентации лиганда в связывающем сайте рецептора, вслед за которым осуществляется тонкая настройка паттерна водородных взаимодействий. С другой стороны, специфическое сродство производных KYNA к рецепторным субъединицам может объясняться различиями геометрии стэкинг-взаимодействия лиганда с ароматическими аминокислотами рецептора. Россия, Ин-т физиол. РАН, Санкт-Петербург. Библ. 51

ГРНТИ	34.39.15

ВИНИТИ 341.39.15.25.11
Рубрики: NMDA-РЕЦЕПТОРЫ
AMPA-РЕЦЕПТОРЫ
СТЭКИНГ-ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
КИНУРЕНОВАЯ КИСЛОТА

Доп.точки доступа:
Журавлев, А.В.; Щеголев, Б.Ф.; Савватеева-Попова, Е.В.; Попов, А.В.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI24) 08.07-04М3.94

Роль стэкинг-взаимодействий в механизмах связывания глицинового сайта NMDA-рецептора с антагонистами и 3-гидроксикинуренином [Текст] / Г. А. Захаров [и др.] // Биофизика. - 2008. - Т. 53, N 1. - С. 22-29 . - ISSN 0006-3029
Аннотация: С целью исследования роли стэкинг-взаимодействий в связывании агонистов и антагонистов глицинового сайта NR1 субъединицы NMDA-рецептора проведены неэмпирические квантово-химические расчеты димера бензола, димера бензола с хлорированием одного из ароматических колец по положениям 5,7, а также молекул 3-гидроксикинуренина и кинуреновой кислоты, расположенных над ароматическим кольцом Phe484 (фрагмент связывающего сайта рецептора). Все расчеты проводились с использованием программы GAMESS 6.4 с атомными гауссовыми базисными функциями 6-31G** при полной оптимизации всех геометрических параметров и учетом корреляции электронов по теории возмущений Мейлера-Плессета второго порядка. Результаты расчетов показали, что наиболее энергетически выгодной является параллельная смещенная конформация димера бензола. Последовательное замещение протонов одного ароматического кольца на хлор по положениям 7 и 5 приводит к увеличению взаимного смещения ароматических колец и увеличению энергии стекинг-взаимодействия. В случае кинуреновой кислоты и ее хлорпроизводных, являющихся антагонистами NMDA-рецептора, увеличение энергии стекинг-взаимодействия приводит к усилению ингибирования ионного канала, тогда как 3-гидроксикинуренин не является ни агонистом, ни антагонистом глицинового сайта NMDA-рецептора в силу стерических ограничений. Россия, Санкт-Петербургский ГУ. Библ. 19

ГРНТИ	34.39.15

ВИНИТИ 341.39.15.25.19
Рубрики: NMDA-РЕЦЕПТОРЫ
КИНУРЕНОВАЯ КИСЛОТА
3-ГИДРОКСИКИНУРЕНИН
СТЭКИНГ-ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

Доп.точки доступа:
Захаров, Г.А.; Попов, А.В.; Савватеева-Попова, Е.В.; Щеголев, Б.Ф.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI32) 08.10-04Т1.156

Роль стэкинг-взаимодействий в механизмах связывания клонидина [Текст] / Б. Ф. Щеголев [и др.] // Биофизика. - 2007. - Т. 52, N 6. - С. 972-977 . - ISSN 0006-3029
Аннотация: Исследовано стэкинг-взаимодействие ароматического кольца клонидина с ароматическим кольцом аминокислот Phe или Tyr 'альфа'[2]-адренорецептора и ароматическим кольцом Tyr поры тетродотоксин-сустойчивого канала. С помощью комплекса программ GAMESS в базисе 6-31G{**} с учетом эффектов корреляции электронов в рамках теории возмущений Меллера-Плесида второго порядка с полной оптимизацией геометрии без учета симметрии были проведены неэмпирические квантово-химические расчеты модельной системы, состоящей из двух расположенных параллельно друг над другом ароматических колец. Показано, что наиболее энергетически выгодной является их сдвинутая параллельная конформация. Хлорирование одного из бензольных колец по положениям 2', 6' приводит к усилению стэкинг-взаимодействия, некоторому увеличению относительного сдвига этих колец и возможному возрастанию как гипотензивной, так и анальгетической функции клонидина за счет увеличения энергии его связывания. Фторирование ароматического кольца клонидина по положению 4' способно усилить его анальгетическую функцию, однако практически исключает его гипотензивное действие. Россия, НИИ кардиол., Санкт-Петербург. Библ. 33

ГРНТИ	34.45.21

ВИНИТИ 341.45.21.23.15.02
Рубрики: КЛОНИДИН
СВЯЗЫВАНИЕ
СТЭКИНГ-ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
КВАНТОВО-ХИМИЧЕСКИЕ РАСЧЕТЫ

Доп.точки доступа:
Щеголев, Б.Ф.; Шляхто, Е.В.; Хрусталева, Р.С.; Катина, И.Е.; Цырлин, В.А.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска