СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=КЛАСТЕР ГЕНОВ О-АНТИГЕНА<.>)

Общее количество найденных документов : 7
Показаны документы с 1 по 7

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.04-04Б2.175

Последовательность генного кластера O-антигена из Escherichia coli O141 и анализ его эволюционной истории [Text] / Qing-Ke Kong [et al.] // Yichuan xuebao = Acta genet. sin. - 2004. - Vol. 31, N 12. - С. 1448-1454 . - ISSN 0379-4172
Аннотация: Липополисахарид (ЛПС) является одним из главных компонентов внешней мембраны грамотрицательных бактерий. Эта амфипатическая молекула состоит из липида А, корового олигосахарида и O-специфического антигена. О-антиген, который является полисахаридом, состоящим из повторяющихся звеньев, вносит главный вклад в антигенную вариабельность бактериальной клеточной поверхности. Гены О-антигенного генного кластера кодируют синтез О-антигена. Генный кластер О-антигена Escherichia coli O141 был секвенирован. Обнаружили, что генный кластер O-антигена содержит гены rmlBDAC и manBC для биосинтеза нуклеотидных сахаров dTDP-рамнозы и GDF-маннозы, соответственно и гены, кодирующие O-единицу флиппазы (wzx), полимеразу O-антигена (wzy), и предполагаемые гены трансферазы. Возможный путь биосинтеза O-антигена E. coli O141 был предложен. Два гена, специфические для E. coli O141, были идентифицированы. В данной работе разработали основу для чувствительного ПЦР-теста для быстрого определения E. coli O141. Создали филогенетические деревья для генов rmlB, rmlD, rmlA и rmlC и генов manB, manC и провели сравнения среди различных штаммов. Обнаружили, что эти гены являются типичными генами E. coli и могут участвовать в рекомбинационных событиях между генными кластерами O-антигена. КНР, College of Life Science, Nankai Univ.; Center for TEDA Functional Genomics Research, Tianjin 300457. Библ. 15

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: КЛЕТОЧНАЯ ПОВЕРХНОСТЬ
О-АНТИГЕН
СИНТЕЗ
ГЕНЫ
КЛАСТЕР ГЕНОВ О-АНТИГЕНА
ГЕНЫ DTDP-РАМНОЗЫ RMLBDAC
ГЕНЫ GDF-МАННОЗЫ MANBC
ГЕНЫ ФЛИППАЗЫ WZX
ГЕНЫ ПОЛИМЕРАЗЫ D-АНТИГЕНА WZY
ГЕНЫ ТРАНСФЕРАЗЫ
ФИЛОГЕНИЯ
ГЕНЫ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММ 0141
ОПРЕДЕЛЕНИЕ
ПЦР-ТЕСТ

Доп.точки доступа:
Kong, Qing-Ke; Guo, Hong-Jie; Zhao, Guang; Guo, Xi; Cheng, Jian=Song; Wang, Lei

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.06-04Б2.175

DNA sequence of the Escherichia coli O103 O antigen gene cluster and detection of enterohemorrhagic E. coli O103 by PCR amplification of the wzx and wzy genes [Text] / Pina M. Fratamico [et al.] // Can. J. Microbiol. - 2005. - Vol. 51, N 6. - P515-522 . - ISSN 0008-4166
Перевод заглавия: Последовательность ДНК генного кластера О-антигена Escherichia coli O103 и определение энтерогеморагической E. coli O103 с помощью ПЦР амплификации генов wzx и wzy
Аннотация: Escherichia coli серогруппы O103 вызывает болезнь желудочно-кишечного тракта и обуславливает гемолитический уремический синдром. Для того, чтобы разработать методы ПЦР для определения и идентификации этой серогруппы определили последовательность области, содержащей генный кластер О-антигена E. coli размером 12033 н. п. Из 12 идентифицированных открытых рамок считывания ген wzx E. coli O103 (флиппаза О-антигена) и ген wzy (полимераза О-антигена) были выбраны в качестве мишеней для разработки как обычной ПЦР, так и ПЦР в реальном времени, специфичных для этой серогруппы. Кроме того мультиплексная ПЦР с использованием мишенирования генов Shiga токсина (Stx)1 (stx[1] ), Shiga токсина 2 (stx[2]), wzx и wzy была разработана, чтобы дифференцировать Stx-продуцирующую E. coli O103 и нетоксигенные штаммы. ПЦР может быть использована для идентификации E. coli серогруппы О103, что заменяет серотипирование. ПЦР позволяет определить организм в пищевых продуктах, фекалиях или образцах окружающей среды. США, Eastern Regional Res. Center, Agricultural Res. Service U. S. Department of Agriculture, 600 East Mermaid Lane, Wyndmoor, PA 19038. Библ. 30

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
КЛАСТЕР ГЕНОВ О-АНТИГЕНА
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
МИШЕННЫЕ ГЕНЫ
ГЕН ФЛИППАЗЫ WZX
ГЕН ТОКСИНОВ STX
ГЕН ПОЛИМЕРАЗЫ WZY
ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
СЕРОГРУППА 0103
ПРОДУЦИРУЮЩАЯ ТОКСИНЫ STX
НЕТОКСИГЕННЫЕ ШТАММЫ
ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Fratamico, Pina M.; DebRoy, Chitrita; Strobaugh, Terence P.; Chen, Chin-Yi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 06.06-04Б4.82

DNA sequence of the Escherichia coli O103 O antigen gene cluster and detection of enterohemorrhagic E. coli O103 by PCR amplification of the wzx and wzy genes [Text] / Pina M. Fratamico [et al.] // Can. J. Microbiol. - 2005. - Vol. 51, N 6. - P515-522 . - ISSN 0008-4166
Перевод заглавия: Последовательность ДНК генного кластера О-антигена Escherichia coli O103 и определение энтерогеморагической E. coli O103 с помощью ПЦР амплификации генов wzx и wzy
Аннотация: Escherichia coli серогруппы O103 вызывает болезнь желудочно-кишечного тракта и обуславливает гемолитический уремический синдром. Для того, чтобы разработать методы ПЦР для определения и идентификации этой серогруппы определили последовательность области, содержащей генный кластер О-антигена E. coli размером 12033 н. п. Из 12 идентифицированных открытых рамок считывания ген wzx E. coli O103 (флиппаза О-антигена) и ген wzy (полимераза О-антигена) были выбраны в качестве мишеней для разработки как обычной ПЦР, так и ПЦР в реальном времени, специфичных для этой серогруппы. Кроме того мультиплексная ПЦР с использованием мишенирования генов Shiga токсина (Stx)1 (stx[1] ), Shiga токсина 2 (stx[2]), wzx и wzy была разработана, чтобы дифференцировать Stx-продуцирующую E. coli O103 и нетоксигенные штаммы. ПЦР может быть использована для идентификации E. coli серогруппы О103, что заменяет серотипирование. ПЦР позволяет определить организм в пищевых продуктах, фекалиях или образцах окружающей среды. США, Eastern Regional Res. Center, Agricultural Res. Service U. S. Department of Agriculture, 600 East Mermaid Lane, Wyndmoor, PA 19038. Библ. 30

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: ГЕНЫ
КЛАСТЕР ГЕНОВ О-АНТИГЕНА
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
МИШЕННЫЕ ГЕНЫ
ГЕН ФЛИППАЗЫ WZX
ГЕН ТОКСИНОВ STX
ГЕН ПОЛИМЕРАЗЫ WZY
ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
СЕРОГРУППА 0103
ПРОДУЦИРУЮЩАЯ ТОКСИНЫ STX
НЕТОКСИГЕННЫЕ ШТАММЫ
ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Fratamico, Pina M.; DebRoy, Chitrita; Strobaugh, Terence P.; Chen, Chin-Yi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.10-04Б2.133

Молекулярная характеристика О-антигенного генного кластера референс-штамма Escherichia coli O23 и идентификация UDP-N-ацетилглюкозамина-4-эпимеразы [Text] / Jian-song Cheng [et al.] // Weishengwu xuebao = Acta microbiol. sin. - 2006. - Vol. 46, N 5. - С. 702-708 . - ISSN 0001-6209
Аннотация: О-антигенный генный кластер референс-штамма Escherichia coli O23 амплифицировали при помощи ПЦР и праймеров на основе генов galF и gnd, а затем секвенировали. Помимо генов galF и gnd идентифицировали семь открытых рамок считывания и определили их функции путем сравнения с подобными генами из базы данных. Семь генов включали ген UDP-N-ацетилглюкозамина-4-эпимеразы (gne), O-антиген полимеразы (wzy), O-антиген трансферазы (wzx) и 4 гена гликозилтрансферазы (orf2, orf4, orf5, orf6). Ген gne идентифицировали при помощи мутационных и комплементационных тестов. Структуру гена предсказали методом гомологичного моделирования и проанализировали активные сайты. Филогенетический и структурный анализ показал, что ген произошел от общего предка с геном Gne E. coli O23, а его продукт является UDP-N-ацетилглюкозамин-4-эпимеразой. Идентифицировали специфичную ДНК, используемую для быстрого молекулярного генотипирования E. coli O23. КНР, College of Life Sci., Nankai Univ., Tianjin 300071). Библ. 18

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
КЛАСТЕР ГЕНОВ О-АНТИГЕНА
ГЕН UDP-N-АЦЕТИЛГЛЮКОЗАМИНА-4-ЭПИМЕРАЗЫ GNE
КЛОНИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ФИЛОГЕНИЯ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ГЕНА GNE
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Cheng, Jian-song; Wang, Wei; Wang, Quan; Gao, Chun-xu; Wang, Lei

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 08.10-04Б4.69

Молекулярная характеристика О-антигенного генного кластера референс-штамма Escherichia coli O23 и идентификация UDP-N-ацетилглюкозамина-4-эпимеразы [Text] / Jian-song Cheng [et al.] // Weishengwu xuebao = Acta microbiol. sin. - 2006. - Vol. 46, N 5. - С. 702-708 . - ISSN 0001-6209
Аннотация: О-антигенный генный кластер референс-штамма Escherichia coli O23 амплифицировали при помощи ПЦР и праймеров на основе генов galF и gnd, а затем секвенировали. Помимо генов galF и gnd идентифицировали семь открытых рамок считывания и определили их функции путем сравнения с подобными генами из базы данных. Семь генов включали ген UDP-N-ацетилглюкозамина-4-эпимеразы (gne), O-антиген полимеразы (wzy), O-антиген трансферазы (wzx) и 4 гена гликозилтрансферазы (orf2, orf4, orf5, orf6). Ген gne идентифицировали при помощи мутационных и комплементационных тестов. Структуру гена предсказали методом гомологичного моделирования и проанализировали активные сайты. Филогенетический и структурный анализ показал, что ген произошел от общего предка с геном Gne E. coli O23, а его продукт является UDP-N-ацетилглюкозамин-4-эпимеразой. Идентифицировали специфичную ДНК, используемую для быстрого молекулярного генотипирования E. coli O23. КНР, College of Life Sci., Nankai Univ., Tianjin 300071). Библ. 18

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: ГЕНЫ
КЛАСТЕР ГЕНОВ О-АНТИГЕНА
ГЕН UDP-N-АЦЕТИЛГЛЮКОЗАМИНА-4-ЭПИМЕРАЗЫ GNE
КЛОНИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ФИЛОГЕНИЯ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ГЕНА GNE
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Cheng, Jian-song; Wang, Wei; Wang, Quan; Gao, Chun-xu; Wang, Lei

РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 11.07-04Б4.29

Escherichia coli serogroup O2 and O28as O-antigen gene cluster sequences and detection of pathogenic E.coli O2 and O28ac by PCR [Text] / Pina M. Fratamico [et al.] // Can. J. Microbiol. - 2010. - Vol. 56, N 4. - P308-316 . - ISSN 0008-4166
Перевод заглавия: Последовательности кластеров генов О-антигена Escherichia coli серогрупп О2 и О28ас и определение патогенных E. coli O2 и О28ас с помощью ПЦР
Аннотация: Были секвенированы последовательности кластеров генов О-антигена Escherichia coli серогрупп О2 и О28ас и разработан метод ПЦР для идентификации этих двух серогрупп. Шестнадцать и 8 открытых рамок считывания были картированы в этих локусах у E. coli O2:H4 U9-41 и E. coli O28ac:H25 96-3286, соотв. Гены wzx (флиппаза О-антигена) и wzy (полимераза О-антигена) в кластерах генов О-антигена E. coli O2 и О28ас были выбраны как цели для анализа ПЦР для их идентификации. Разработанный анализ ПЦР был специфичным для этих серогрупп за одним исключением. Штаммы E. coli O42 давали положительные результаты в анализе, нацеленном на О28ас, а антисыворотка против О42 перекрестно реагировала со штаммами серогруппы О28ас. Былa разработана мультиплексная ПЦР, нацеленная на ген wzx, гены stx1, stx2, hly, eae и saa E. coli O2, и wzx, ial, ipaC и ipaH E. coli O28ac для определения вырабатывающих шига-токсин штаммов E. coli O2 и энтероинвазивных E. coli O28ac, соотв. Сделан вывод, что гены wzx и wzy E. coli O2 и О28ас могут быть использованы как диагностические маркеры в анализе ПЦР для быстрой идентификации этих серогрупп как альтернатива серотипированию

ГРНТИ	76.03.43

ВИНИТИ 761.03.43.05.11
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ПАТОГЕННЫЕ БАКТЕРИИ
СЕРОГРУППА О2
СЕРОГРУППА О28АС
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ГЕНЫ
КЛАСТЕР ГЕНОВ О-АНТИГЕНА
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ДИАГНОСТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ
ПЦР

Доп.точки доступа:
Fratamico, Pina M.; Yan, Xianghe; Liu, Yanhong; DeRoy, Chitrita; Byrne, Brian; Monaghan, Aine; Fanning, Seamus; Bolton, Declan

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.08-04Б2.151

Escherichia coli serogroup O2 and O28as O-antigen gene cluster sequences and detection of pathogenic E.coli O2 and O28ac by PCR [Text] / Pina M. Fratamico [et al.] // Can. J. Microbiol. - 2010. - Vol. 56, N 4. - P308-316 . - ISSN 0008-4166
Перевод заглавия: Последовательности кластеров генов О-антигена Escherichia coli серогрупп О2 и О28ас и определение патогенных E. coli O2 и О28ас с помощью ПЦР
Аннотация: Были секвенированы последовательности кластеров генов О-антигена Escherichia coli серогрупп О2 и О28ас и разработан метод ПЦР для идентификации этих двух серогрупп. Шестнадцать и 8 открытых рамок считывания были картированы в этих локусах у E. coli O2:H4 U9-41 и E. coli O28ac:H25 96-3286, соотв. Гены wzx (флиппаза О-антигена) и wzy (полимераза О-антигена) в кластерах генов О-антигена E. coli O2 и О28ас были выбраны как цели для анализа ПЦР для их идентификации. Разработанный анализ ПЦР был специфичным для этих серогрупп за одним исключением. Штаммы E. coli O42 давали положительные результаты в анализе, нацеленном на О28ас, а антисыворотка против О42 перекрестно реагировала со штаммами серогруппы О28ас. Былa разработана мультиплексная ПЦР, нацеленная на ген wzx, гены stx1, stx2, hly, eae и saa E. coli O2, и wzx, ial, ipaC и ipaH E. coli O28ac для определения вырабатывающих шига-токсин штаммов E. coli O2 и энтероинвазивных E. coli O28ac, соотв. Сделан вывод, что гены wzx и wzy E. coli O2 и О28ас могут быть использованы как диагностические маркеры в анализе ПЦР для быстрой идентификации этих серогрупп как альтернатива серотипированию

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ПАТОГЕННЫЕ БАКТЕРИИ
СЕРОГРУППА О2
СЕРОГРУППА О28АС
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ГЕНЫ
КЛАСТЕР ГЕНОВ О-АНТИГЕНА
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ДИАГНОСТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ
ПЦР

Доп.точки доступа:
Fratamico, Pina M.; Yan, Xianghe; Liu, Yanhong; DeRoy, Chitrita; Byrne, Brian; Monaghan, Aine; Fanning, Seamus; Bolton, Declan

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска