Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ДЕГРАДОСОМА<.>)
Общее количество найденных документов : 11
Показаны документы с 1 по 11
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.06-04Б2.159

   
    Polyphosphate kinase is a component of the Escherichia coli RNA degradosome [Text] / Erwin Blum [et al.] // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 26, N 2. - P387-398 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Полифосфаткиназа является компонентом деградосомы РНК
Аннотация: Показано, что деградосома РНК (ДСР) Escherichia coli, кроме РНК-азы Е, полинуклеотидфосфорилазы, РНК-геликазы RhlB и енолазы, содержит полифосфаткиназу (I), к-рая катализирует обратимую полимеризацию 'гамма'-фосфата АТФ в полифосфат (II). Мутант E. coli с делецией гена I (ppk) имеет повышенную стабильность мРНК ompA. Очищенная I связывается с РНК. Связывание ингибируется гидролизуемым АТФ. Не обнаружена химич. модификация РНК под действием I, напр. добавление или удаление 3'- или 5'-концевых фосфатов. II ингибирует деградацию РНК под действием ДСР in vitro. Это ингибирование преодолевается при добавлении АДФ, к-рый требуется для деградации II и регенерации под действием I АТФ в ДСР. Великобритания, ICR Fund Labs., Inst. of Molecular Med., John Radcliffe Hospital, Oxford, OX3 9DS. Библ. 27
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК
ДЕГРАДАЦИЯ
ДЕГРАДОСОМА
КОМПОНЕНТЫ
ПОЛИФОСФАТКИНАЗА
ФУНКЦИИ
МЕХАНИЗМ ДЕЙСТВИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

Доп.точки доступа:
Blum, Erwin; Py, Beatrice; Carpousis, Agamemnon J.; Higgins, Christopher F.

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.11-04Б2.131

   
    Polyphosphate kinase is a component of the Escherichia coli RNA degradosome [Text] / Erwin Blum [et al.] // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 26, N 2. - P387-398 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Полифосфаткиназа является компонентом деградосомы РНК
Аннотация: Показано, что деградосома РНК (ДСР) Escherichia coli, кроме РНК-азы Е, полинуклеотидфосфорилазы, РНК-геликазы RhlB и енолазы, содержит полифосфаткиназу (I), к-рая катализирует обратимую полимеризацию 'гамма'-фосфата АТФ в полифосфат (II). Мутант E. coli с делецией гена I (ppk) имеет повышенную стабильность мРНК ompA. Очищенная I связывается с РНК. Связывание ингибируется гидролизуемым АТФ. Не обнаружена химич. модификация РНК под действием I, напр. добавление или удаление 3'- или 5'-концевых фосфатов. II ингибирует деградацию РНК под действием ДСР in vitro. Это ингибирование преодолевается при добавлении АДФ, к-рый требуется для деградации II и регенерации под действием I АТФ в ДСР. Великобритания, ICR Fund Labs., Inst. of Molecular Med., John Radcliffe Hospital, Oxford, OX3 9DS. Библ. 27
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК
ДЕГРАДАЦИЯ
ДЕГРАДОСОМА
КОМПОНЕНТЫ
ПОЛИФОСФАТКИНАЗА
ФУНКЦИИ
МЕХАНИЗМ ДЕЙСТВИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

Доп.точки доступа:
Blum, Erwin; Py, Beatrice; Carpousis, Agamemnon J.; Higgins, Christopher F.

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.08-04Б2.229

   
    Ribonuclease E organizes the protein interactions in the Escherichia coli RNA degradosome [Text] / Nathalie F. Vanzo [et al.] // Genes and Dev. - 1998. - Vol. 12, N 17. - P2770-2781 . - ISSN 0890-9369
Перевод заглавия: Рибонуклеаза E организует белковые взаимодействия в деградосоме РНК Escherichia coli
Аннотация: Взаимодействия между различными белками в деградосоме РНК (ДСР) Escherichia coli, участвующей в процессинге и разрушении РНК, изучены методами фар-Вестерн-блота, коиммунопреципитации и 2-гибридной системы дрожжей. Показано, что С-концевая половина (СКП) РНКазы E (I) содержит сайты связывания 3 др. белков ДСР: РНК-геликазы RhlB (II) с блоком DEAD, енолазы и полинуклеотидфосфорилазы. СКП I играет в комплексе роль строительных лесов, на к-рых собираются остальные компоненты ДСР. В N-концевой и центральной областях I обнаружены домены олигомеризации. Полипептиды, содержащие сильно заряженную область I с сайтом связывания II, стимулируют активность II в 15 раз при стехиометрии 1:1. Предложена модель регуляции РНК-геликазной активности II. Полученные данные показали, что I состоит из N-концевого каталитического домена, центрального домена связывания с РНК и С-концевой области с сайтами связывания главных компонентов ДСР. Франция, Lab. Microbiol. et Genet. Mol., CNRS, 31062 Toulouse. Библ. 52
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.02
Рубрики: РНК
ПРОЦЕССИНГ
ДЕГРАДАЦИЯ
БЕЛОК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ДЕГРАДОСОМА
РИБОНУКЛЕАЗА E
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Vanzo, Nathalie F.; Li, Yeun Shan; Py, Beatrice; Blum, Erwin; Higgins, Christopher F.; Raynal, Lelia C.; Krisch, Henry M.; Carpousis, Agamemmon J.

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.08-04Б2.243

   
    RNA components of Escherichia coli degradosome: Evidence for rRNA decay [Text] / Dmitri A. Bessarab [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol. 95, N 6. - P31757-3161 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: РНК-компоненты деградосомы Escherichia coli: доказательство распада рРНК
Аннотация: Деградосома РНК (ДСР) у Escherichia coli, кроме белковых компонентов, включая РНКазу E (I), содержит также РНК. РНК, найденная в ДСР, состоит из фрагментов рРНК 16S и 23S с дискретными размерами в диапазоне 100-2800 н. Деградация рРНК в ДСР вызвана расщеплением (A+Y) - богатых однонитевых областей в рРНК 16S и 23S под действием I. В ДСР содержится и рРНК 5S, к-рая образуется в результате процессинга I предшественника 9S. Однако в ДСР отсутствуют тРНК, к-рые не расщепляются I in vitro. Эти данные доказали, что в растущих клетках E. coli распад зрелых рРНК происходит в ДСР при участии I. Тайвань, Inst. Mol. Biol., Acad. Sinica, Nankang, Taipei 115. Библ. 47
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК РИБОСОМНАЯ
РРНК 16S
РРНК 23S
(A+Y) - БОГАТЫЕ ОБЛАСТИ
ДЕГРАДАЦИЯ
РНКАЗА E
ДЕГРАДОСОМА
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Bessarab, Dmitri A.; Kaberdin, Vladimir R.; Wei, Chia-Li; Liou, Gunn-Guang; Lin-Chao, Sue

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.09-04Б2.107

   
    A DEAD-box RNA helicase in the Escherichia coli RNA degradosome [Text] / Beatrice Py [et al.] // Nature. - 1996. - Vol. 381, N 6578. - P169-172 . - ISSN 0028-0836
Перевод заглавия: РНК-хеликаза, [содержащая] DEAD-бокс, в РНК-деградосомах Escherichia coli
Аннотация: РНК-деградосомы (РДС) Escherichia coli - это мультиферментные комплексы, содержащие экзорибонуклеазу типа полинуклеотидфосфорилазы (ПНФ) и эндорибонуклеазу - РНКазу E. В работе проведено детальное исследование фракционного состава РДС, обнаружившее два дополнительных белка - компонента РДС. Один из них - это гликолитический фермент енолаза, функции к-рого в метаболизме РНК неизвестны. Другой белок (RhIB) идентифицирован как РНК-хеликаза (РХ) - член сем-ва АТФ-зависимых РХ, содержащих DEAD-мотивы, к-рые обнаружены у про- и эукариот. РДС обладают АТФ-зависимой активностью ПНФазы, катализирующей деградацию структурированных РНК. Эта р-ция подавляется при инкубации РДС с антителами к очищенной РХ. Предполагается, что РХ - компонент РДС расплетает структуры РНК, препятствующие ее процессивному гидролизу, к-рый катализируется ПНФ. Великобритания, Nuffield Dep. Clinical Biochem., Imperial Cancer Res. Fund Lab., Inst. Mol. Med., John Radcliffe Hosp., Univ., Oxford OX3 9DU. Библ. 30
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: РНК-ДЕГРАДОСОМА
МУЛЬТИФЕРМЕНТНЫЙ КОМПЛЕКС
ЭКЗОРИБОНУКЛЕАЗА
ЭНДОРИБОНУКЛЕАЗА
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Py, Beatrice; Higgins, Christopher F.; Krisch, Henry M.; Carpousis, Agamemnon J.

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.09-04Б2.273

   
    Reconstitution of a minimal RNA degradosome demonstrates functional coordination between a 3' exonuclease and a DEAD-box RNA helicase [Text] / Glen A. Coburn [et al.] // Genes and Dev. - 1999. - Vol. 13, N 19. - P2504-2603 . - ISSN 0890-9369
Перевод заглавия: Реконструкция минимальной деградосомы РНК демонстрирует функциональную координацию между 3'-экзонуклеазной и РНК-геликазой с DEAD-блоком
Аннотация: Разработан метод реконструкции минимальной деградосомы (ДС) Escherichia coli из очищенных белков. Показано, что ДС-подобный комплекс, содержащий РНКазу E (I), полинуклеотидфосфорилазу и геликазу RhlB (II) с блоком DEAD, может образовываться in vitro в отсутствие всех др. клеточных компонентов. Минимальная ДС не отличается от ДС, выделенных из целых клеток, и вызывает АТФ-зависимую деградацию REP-ДНК mal EF. В процессе реконструкции I играет роль существенного белка строительных лесов и не требуется РНКазная активность I. I координирует активацию II, зависящую от однонитевого 3'-удлинения в субстратных РНК. Предложена модель опосредованной ДС деградации структурированных РНК и рассмотрены ее следствия для распада мРНК у E. coli. Канада, Dep. Biochem. and Mol. Biol., Univ. British Columbia, Vancouver BC V6T 1Z3. Библ. 40
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.29
Рубрики: ДЕГРАДОСОМА
МЕТОД РЕКОНСТРУКЦИИ
ОЧИЩЕННЫЕ БЕЛКИ
РНКАЗА E
ПОЛИНУКЛЕОТИДФОСФОРИЛАЗА
ГЕЛИКАЗА RHLB
БЛОК DEAD
ОБРАЗОВАНИЕ IN VITRO
РНК
СТРУКТУРИРОВАННАЯ
ДЕГРАДАЦИЯ
МРНК
РАСПАД
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
3'-ЭКЗОНУКЛЕАЗА
РНК-ГЕЛИКАЗА

Доп.точки доступа:
Coburn, Glen A.; Miao, Xin; Briant, Douglas J.; Mackie, George A.

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.08-04Б2.288

    Carpousis, Agamemnon J.
    mRNA degradation. A tale of poly(A) and multiprotein machines [Text] / Agamemnon J. Carpousis, Nathalie F. Vanzo // Trends Genet. - 1999. - Vol. 15, N 1. - P24-28 . - ISSN 0168-9525
Перевод заглавия: Деградация мРНК. История о поли(А) и мультипротеиновых комплексах
Аннотация: Обзор. Деградосома РНК у Escherichia coli является мультипротеиновым комплексом, содержащим эндорибонуклеазу, полинуклеотидфосфорилазу и РНК-геликазу с блоком DEAD. Родственный комплекс обнаружен в протопластах шпината, а у дрожжей и, вероятно, в клетках животных имеются эндосома и комплекс mtEXO. Геликазы с блоком DEAD в деградосоме расплетают области вторичной структуры РНК, мешающие деградации в направлении 3''-'5'. Полиаденилирование 3'-концов РНК способствует посадке аппарата деградации у E. coli. В регуляции стабильности мРНК у бактерий и эукариотов могут участвовать многие контрольные точки. Франция, Lab. Microbiol. et Genet. Mol., CNRS, 31062 Toulouse. Библ. 43
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК МАТРИЧНАЯ
ДЕГРАДАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
БЕЛОК
ДЕГРАДОСОМА
СТРУКТУРА
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Vanzo, Nathalie F.

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.08-04Б2.306

    Rauhut, Reinhard.
    mRNA degradation in bacteria [Text] / Reinhard Rauhut, Gabriele Klug // FEMS Microbiol. Rev. - 1999. - Vol. 23, N 3. - P353-370 . - ISSN 0168-6445
Перевод заглавия: Деградация мРНК у бактерий
Аннотация: Обзор. Деградация мРНК у Escherichia coli является высокоорганизованным процессом, в котором участвуют не только нуклеазы, но и другие белки. Эти белки организованы в высокомолекулярный комплекс - деградосому. Ключевым ферментом для нескольких стадий деградации мРНК и сборки деградосомы является эндорибонуклеаза E. Обсуждаются другие компоненты деградосомы (полинуклеотидфосфорилаза, полифосфаткиназа и геликазы), механизм их действия и структура деградосомы. Германия, Inst. Mikro- und Molekularbiol., Justus-Liebig-Univ. Giessen, 30392 Giessen. Библ. 113
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК МАТРИЧНАЯ
ДЕГРАДАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ФЕРМЕНТЫ
ДЕГРАДОСОМА
СТРУКТУРА
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Klug, Gabriele

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.04-04Б2.252

    Spickler, Catherine.
    Preferential cleavage of degradative intermediates of rpsT mRNA by the Escherichia coli RNA degradosome [Text] / Catherine Spickler, Victoria Stronge, George A. Mackie // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 3. - P1106-1109 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Предпочтительный разрыв деградируемых промежуточных веществ мРНК rpsT деградосомой РНК Escherichia coli
Аннотация: РНК-аза Е обладает способностью инициировать распад мРНК, предпочтительно атакуя 5'-монофосфорилированные субстраты по сравнению с 5'-трифосфорилированными субстратами. Сайт-специфический разрыв in vitro мРНК rpsT РНК-азой H, направляемой химерными 2'-O-метилолигонуклеотидами был использован, чтобы получить укороченные РНК, которые являлись идентичными аутентичным деградируемым промежуточным продуктам. Скорости разрыва двух таких промежуточных продуктов РНК-азой Е в РНК деградосоме значительно больше (в 2,5-8 раз), чем скорость разрыва интактной РНК. Это подтверждает предпочтение РНК-азы Е для деградируемых промежуточных продуктов и может объяснять частое поведение матричных рибонуклеиновых кислот по принципу "все или ничего" в процессе распада. Канада, Dep. of Biochemistry and Molecular Biology, Univ. of British Columbia, Vancouver, British Columbia, Canada V6T 1Z3. Библ. 23
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК МАТРИЧНАЯ
МРНК RPST
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКИЙ РАЗРЫВ
IN VITRO
РНК-АЗОЙ Н
ДЕГРАДИРУЕМЫЕ ПРОМЕЖУТОЧНЫЕ ПРОДУКТЫ
РНК-ДЕГРАДОСОМА
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Stronge, Victoria; Mackie, George A.

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 08.06-04Б4.134

    Jasiecki, Jacek.
    Localization of Escherichia coli poly(A) polymerase I in cellular membrane [Text] / Jacek Jasiecki, Grzegorz Wegrzyn // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 2005. - Vol. 329, N 2. - P598-602 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Локализация поли(A)-полимеразы I Escherichia coli в клеточной мембране
Аннотация: Обнаружено, что поли(A)-полимераза I (PAPI) Escherichia coli - продукт гена penB - локализована как в цитоплазме, так и в мембранной фракции клеток. Предполагается, что PAPI прямо взаимодействует с РНК-деградосомой, которая связана с клеточными мембранами. Показано, что эффективность адсорбции и внутриклеточного развития фагов MS2 и Q'бета', геномы которых представлены линейной однонитевой РНК, намного выше на клетках с мутацией penB, чем на клетках изогенного штамма penB{+}. Эта зависимость не наблюдается в случае фага M13, содержащего кольцевую однонитевую ДНК. Обсуждается физиологическая роль PAPI. Польша, Dep. Mol. Biol., Univ. Gdansk, 80-822 Gdansk. Библ. 27
ГРНТИ  
34.27.29
ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: ПОЛИ(A)-ПОЛИМЕРАЗА I
ПРОДУКТ ГЕНА PENB
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
РНК-ДЕГРАДОСОМА
ФИЗИОЛОГИЧЕСКАЯ РОЛЬ
КЛЕТОЧНАЯ МЕМБРАНА
ЦИТОПЛАЗМА
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Wegrzyn, Grzegorz

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.09-04Б2.163

   
    Reconstitution and analysis of the multienzyme Escherichia coli RNA degradosome [Text] / Jonathan A. R. Worrall [et al.] // J. Mol. Biol. - 2008. - Vol. 382, N 4. - P870-883 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Реконструкция и анализ мультиферментной РНК-деградосомы из Escherichia coli
Аннотация: РНК-деградосома из Escherichia coli является мультиферментным комплексом, который функционирует при осуществлении транскрипции и созревании предшественников мРНК. В данной работе разработали метод, чтобы реконструировать РНК-деградосому из рекомбинантных компонентов при использовании модулирующих коэкспрессирующих векторов. Реконструированный комплекс был очищен в определенном масштабе, необходимом для бихимического и биофизического анализов и было осуществлено сравнение свойств рекомбинантной РНК-деградосомы и РНК-деградосомы, экстрагированной из клеток Escherichia coli. Представили доказательство, что вспомогательные белковые комплексы могут быть набраны из "суперпромоторного" кора комплекса через динамическое равновесное участие промежуточных РНК. Обсуждают участие этих вспомогательных белков для регуляции функций РНК-деградосомы in vivo. Великобритания, Department of Biochemistry, University of Cambridge, 80 Tennis Court Road, Cambridge CD2 1GA. Библ. 56
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК-ДЕГРАДОСОМА
РЕКОМБИНАНТНАЯ
МУЛЬТИФЕРМЕНТНЫЙ КОМПЛЕКС
РЕКОНСТРУКЦИЯ
ВСПОМОГАТЕЛЬНЫЕ БЕЛКИ
ФУНКЦИИ IN VIVO
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Worrall, Jonathan A.R.; Gorna, Maria; Crump, Nicholas T.; Phillips, Lara G.; Tuck, Alex C.; Price, Amanda J.; Bavro, Vassiliy N.; Luisi, Ben F.
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)