СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=АНАЛИЗ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ<.>)

Общее количество найденных документов : 5
Показаны документы с 1 по 5

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 96.01-04Н1.518

Cloning and analysis of MAGE-1-related genes [Text] / Min Ding [et al.] // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 1994. - Vol. 202, N 1. - P549-555 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Клонирование и анализ MAGE-1-родственных генов
Аннотация: MAGE-1 является членом семейства генов (известно 14 представителей), к-рые экспрессируются только в опухолевых клетках, за исключением нормальных яичек; он кодирует опухоль-ассоциированный антиген. Из библиотеки кДНК клеточной линии DM150 меланомы человека с помощью полимеразной цепной р-ции и гибридизационного скрининга выделили 5 близкородственных клонов MAGE-1, -3, -12, -3b и X2. кДНК MAGE-3b и X2 кодируют новые последовательности гомологичные MAGE-1 на 69 и 77% соотв. Подобно MAGE-1, кодируемые этими клонами продукты содержат консенсусный мотив для связывания HLA-A1 пептида, что указывает на принадлежность этих продуктов к опухоль-ассоциированным антигенам. США, Clin. Res. Branch, NCI-FCRDC, Frederich, MD 21702. Библ. 14

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.23.07.17.02
Рубрики: ГЕНЫ
РОДСТВЕННЫЕ ГЕНУ MAGE-1
КЛОНИРОВАНИЕ
АНАЛИЗ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
ЭКСПРЕССИЯ
ЛИНИЯ DM150 КЛЕТОК МЕЛАНОМЫ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Ding, Min; Beck, Raymond J.; Keller, Christopher J.; Fenton, Robert G.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI45) 06.03-04И5.23

Генетический полиморфизм сибирского углозуба (Salamandrella keyserlingii, Caudata, Amphibia) в ареале и криптический вид углозуба S.Schrenckii из Приморья [Текст] / Д. И. Берман [и др.] // Докл. РАН. - 2005. - Т. 403, N 3. - С. 427-429 . - ISSN 0869-5652
Аннотация: Проанализировали изменчивость нуклеотидных последовательностей гена цитохрома b мтДНК у 86 сибирских углозубов из 5 регионов (Сахалин, Чукотка, Магаданская обл., Приморье и Урал (Свердловская обл.). Показана высокая степень генетических отличий (9,8-11,6% дивергенции мтДНК) углозубов из Приморья от углозубов из остальных частей ареала. Уровень различий соотв. межвидовому. Это дает основание считать, что при морфологической мономорфности сибирского углозуба существует 2 таксона: во всех названных точках сбора, кроме Ю.-В. России, распространен Salamandrella keyserlingii, в Приморье же обитает др. вид. В исследованной выборке зарегистрировано 15 гаплотипов гена цитохрома b, демонстрирующих географическую дифференциацию. Выявленные гаплотипы группируются в 2 крупных монофилетических кластера, один из к-рых сформирован вариантами мтДНК углозубов из Приморья, второй включает гаплотипы из остальных региональных выборок. Степень дивергенции нуклеотидных последовательностей меняется в диапазоне 0,1-11,6% (от 1 до 96 нуклеотидных различий), но основной вклад (от 9,8 до 11,6% дивергенции) вносят гаплотипы мтДНК углозубов из Приморья, отличающиеся от митохондриальных линий углозубов из др. регионов 81-96 мутациями. Приморские углозубы характеризуются и большей внутрипопуляционной изменчивостью (1,86%), значительно превышающей таковую в объединенной магаданской, сахалинской, чукотской и уральской выборках (0,38%). Значительные различия между гаплотипами гена цитохрома b углозубов из Приморья и остальных регионов соотв. межвидовым, что следует из рез-тов сравнительного анализа нуклеотидных последовательностей этого гена у представителей 16 видов различных родов Hynobiidae и Salamandridae. Так, межвидовым различиям в роде Batrachuperus (сравнение 6 видов) соотв. 4,4-9,3% дивергенции нуклеотидных последовательностей, в роде Pseudohynobius (2 вида) - 15,5%, в роде Hynobius (3 вида) 10,7-12,7%. На долю межвидовых различий в роде Euproctus (3 вида) приходится от 10,7 до 21% дивергенции. Филогенетические взаимоотношения таксонов Hynobiidae и Salamandridae, для к-рых известны последовательности гена цитохрома b, выявлены с помощью метода максимальной экономии и с оценкой статистической значимости кластеров методом бутстрэп-анализа. Рез-ты анализа подтверждают выделение Salamandrella в качестве самостоятельного рода. Представители Salamandrella обособляются от др. родов Hynobiidae дивергенцией в 15,5-18,8%, т. е. близких для др. родов этого же семейства значениях: Pseudohynobius 14,4-18,1%, Hynobius 14,4-20%, Batrachuperus 14,3-18,9%, Ranodon 20%, Liua 19,4% (по схеме род очень близок к Pseudohynobius). Виды рода Euproctus (Salamandridae) отличаются от родов Hynobiidae большой дивергенцией (18,9-25,7%). Исследованная выборка на этом дереве отчетливо подразделяется на 2 кластера, что свидетельствует о существовании в пределах рода Salamandrella 2-х видов, различающихся наборами гаплотипов. Соответствие низких уровней морфологической и генетической изменчивостей S. keyserlingii на огромном ареале может быть следствием относительно быстрого формирования ареала в голоцене. Возраст углозубов из Приморья составляет 2,4 млн. лет. При условности оценок возрастов видов и времени дивергенции можно заключить, что S. keyserlingii и приморской углозуб соотносятся не как "потомок-предок", а как 2 разновозрастных вида, предки к-рых отделились от общей ветви 'ЭКВИВ'14 млн. назад. Выявленные генетические различия S. keyserlingii и популяции углозубов из Приморья и совокупность всех материалов дает основание рассматривать приморских углозубов в качестве отдельного вида и восстановить для него название S. schrenckii, считавшееся младшим синонимом S. keyserlingii. Salamandrella schrenckii (Strauch, 1870), sp. dist. - углозуб Шренка. [Isodactylium schrenckii Strauch, 1870] S. schrenckii отличается от S. keyserlingii иным набором гаплотипов (11,6% дивергенции мтДНК), размером генома, средним числом позвонков и костальных борозд, формой кладки и нек-рыми др. биол. особенностями, отсутствием брачных танцев. Морфологически виды трудно различимы, и поэтому углозуб Шренка назван "криптическим видом". Т. обр., распространение углозуба Шренка к С. достоверно известно в бассейне Уссури почти вплоть до 48-й параллели. Вероятно присутствие этого углозуба и в бассейне р. Немта, правого притока Амура (севернее 48-й параллели). Россия, Ин-т биол. проблем Севера ДО РАН, Магадан. Ил. 2. Библ. 15

ГРНТИ	34.33.27

ВИНИТИ 341.33.27.17.15.19.15
Рубрики: УГЛОЗУБЫ
SALAMANDRELLA KEYSERLINGII (AMPH.)
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ
АНАЛИЗ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
ЦИТОХРОМ B МТДНК, ГАПЛОТИПЫ
ГЕОГРАФИЧЕСКАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ
SALAMANDRELLA SCHRENCKII (STRAUCH, 1870) SP. DIST.
ПРИМОРЬЕ, БАССЕЙН УССУРИ

Доп.точки доступа:
Берман, Д.И.; Деренко, М.В.; Малярчук, Б.А.; Гржибовский, Т.; Крюков, А.П.; Мишчицка-Шливка, Д.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.10-04Б2.1

Rosch, Christopher.
Improved assessment of denitrifying, N[2]-fixing, and total-community bacteria by terminal restriction fragment length polymorphism analysis using multiple restriction enzymes [Text] / Christopher Rosch, Hermann Bothe // Appl. and Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 71, N 4. - P2026-2035 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Усовершенствованная оценка денитрифицирующих, азотфиксирующих бактерий и суммарного сообщества бактерий с помощью анализа полиморфизма длины концевых рестрикционных фрагментов, используя множественные ферменты рестрикции
Аннотация: База данных концевых рестрикционных фрагментов (tRF) 16S рРНК была создана с использованием 13 ферментов рестрикции и 17 327 последовательностей из GenBank. Компьютерная программа, названная TReFID, была разработана с целью идентификации любой из 17 327 последовательностей с помощью полигонов, полученных из специфических tRF каждой бактерии. TReFID программа дополняет и выходит за пределы содержания данных о филогенетической оценке в компьютерной сети, недавно описанной. При существующей информации программное обеспечение tRF профилей расширяется, давая возможность провести скрининг генов, кодирующих азотфиксацию (nifH) и денитрификацию (nosZ) у любой бактерии или образца из окружающей среды. Разработали некоторое кол-во контролей, чтобы оценить реальность FReFID программы. Кроме того, эта программа, как оказалось, позволяет проанализировать структуру бактериальных популяций с помощью определения содержания их генов 16S рРНК, nifH и nosZ в окружающей среде, что и было подтверждено для образца из лесной почвы. Использование TReFID программы показывает, что некультивируемые денитрифицирующие и азотфиксирующие бактерии могут играть большую роль в почвах, чем думали до сих пор. Германия, Botanisches Inst., Univ. zu Koln, Cologne. Библ. 22

ГРНТИ	34.27.05

ВИНИТИ 341.27.05.07
Рубрики: ДЕНИТРИФИЦИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ
АЗОТФИКСИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ПОПУЛЯЦИИ
СТРУКТУРА
ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА
МЕТОДЫ ОПРЕДЕЛЕНИЯ
КОМПЬЮТЕРНАЯ БАЗА ДАННЫХ
АНАЛИЗ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

Доп.точки доступа:
Bothe, Hermann

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 07.02-04Б3.32

Rosch, Christopher.
Improved assessment of denitrifying, N[2]-fixing, and total-community bacteria by terminal restriction fragment length polymorphism analysis using multiple restriction enzymes [Text] / Christopher Rosch, Hermann Bothe // Appl. and Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 71, N 4. - P2026-2035 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Усовершенствованная оценка денитрифицирующих, азотфиксирующих бактерий и суммарного сообщества бактерий с помощью анализа полиморфизма длины концевых рестрикционных фрагментов, используя множественные ферменты рестрикции
Аннотация: База данных концевых рестрикционных фрагментов (tRF) 16S рРНК была создана с использованием 13 ферментов рестрикции и 17 327 последовательностей из GenBank. Компьютерная программа, названная TReFID, была разработана с целью идентификации любой из 17 327 последовательностей с помощью полигонов, полученных из специфических tRF каждой бактерии. TReFID программа дополняет и выходит за пределы содержания данных о филогенетической оценке в компьютерной сети, недавно описанной. При существующей информации программное обеспечение tRF профилей расширяется, давая возможность провести скрининг генов, кодирующих азотфиксацию (nifH) и денитрификацию (nosZ) у любой бактерии или образца из окружающей среды. Разработали некоторое кол-во контролей, чтобы оценить реальность FReFID программы. Кроме того, эта программа, как оказалось, позволяет проанализировать структуру бактериальных популяций с помощью определения содержания их генов 16S рРНК, nifH и nosZ в окружающей среде, что и было подтверждено для образца из лесной почвы. Использование TReFID программы показывает, что некультивируемые денитрифицирующие и азотфиксирующие бактерии могут играть большую роль в почвах, чем думали до сих пор. Германия, Botanisches Inst., Univ. zu Koln, Cologne. Библ. 22

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: ДЕНИТРИФИЦИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ
АЗОТФИКСИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ПОПУЛЯЦИИ
СТРУКТУРА
ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА
МЕТОДЫ ОПРЕДЕЛЕНИЯ
КОМПЬЮТЕРНАЯ БАЗА ДАННЫХ
АНАЛИЗ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

Доп.точки доступа:
Bothe, Hermann

РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 92.04-04А1.086

Чалей, М. Б.
Информационный подход к выявлению сходства генов тРНК и их глобальная классификация [Текст] / М. Б. Чалей, Е. В. Коротков // Изв. АН СССР. Сер. Биол. - 1991. - N 6. - С. 915-927 . - ISSN 0002-3329
Аннотация: На основе информационного подхода к сравнительному анализу последовательностей ДНК и теории нечетких множеств предложены новые классификационные схемы для 2-х множеств генов тРНК из банка данных EMBL-8, связывающих аминокислоты ТRP и ASP. Эти классификационные схемы представлены в виде дендрограммы и отражают возможные эволюционные связи между генами тРНК в обоих множествах. Эволюционные связи генов тРНК анализировались с учетом взаимосвязи последовательностей ДНК по всем четырем нуклеотидам; 2) с учетом возможного эволюционного давления на дивергенцию последовательностей ДНК в сторону транзиций. Рассмотрены сходство и различие дендрограмм, построенных в обоих случаях, для каждого множества генов. Показано, что анализ всех возможных направлений эволюционного давления на дивергенцию последовательностей ДНК и РНК дает новый подход к построению глобальной филогении тРНК.

ГРНТИ	34.03.17

ВИНИТИ 341.03.17.27.02
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
ТРНК
АНАЛИЗ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
ИНФОРМАЦИОННЫЙ ПОДХОД
ТЕОРИЯ НЕЧЕТКИХ МНОЖЕСТВ

Доп.точки доступа:
Коротков, Е.В.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска