Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=SYBR<.>)
Общее количество найденных документов : 28
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-28 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.07-04Б2.52

   

    Analysis of bla[SHV] codon 238 and 240 allele mixtures using Sybr green high-resolution melting analysis [Text] / Patiyan Andersson [et al.] // Antimicrob. Agents and Chemother. - 2009. - Vol. 53, N 6. - P2679-2683 . - ISSN 0066-4804
Перевод заглавия: Анализ смеси аллелей bla[SHV] кодон 238 и 240 с помощью высокоразрешающего метода мелтинг-анализа с использованием Sybr зеленого
Аннотация: Изоляты Klebsiella pneumoniae часто содержат сложную смесь аллелей bla[SHV]. Разработали высоко-разрешающий метод мелтинг-анализа полиморфизма кодонов 238 и 240. Метод позволяет обнаруживать аллели, кодирующие бета-лактамазы с минорным спектром активности, оценивать соотношении аллелей и выявлять отличия между одиночными и двойными мутантами. Австралия, Menzises School of Health Research, Inst. of Advanced Studies, Charles Darvin Univ., Darvin, Nothern Territory. Библ. 16
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: АЛЛЕЛИ
ГЕНЫ

ГЕНЫ BLA[SHV]

СООТНОШЕНИЕ

СМЕСЬ

КОДОНЫ

238

240

ПОЛИМОРФИЗМ

АНАЛИЗ

МЕТОДЫ

МЕЛТИНГ-АНАЛИЗ

SYBR-ЗЕЛЕНЫЙ

KLEBSIELLA PNEUNONIAE (BACT.)


Доп.точки доступа:
Andersson, Patiyan; Harris, Tegan; Tong, Steven Y.C.; Giffard, Philip M.


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 13.06-04А2.65

    Popoviciu, Dan Razvan.

    Bacterial abundance, biomass and proportion of living cells in littoral sandy sediments on the Romanian Black Sea Coast [Text] / Dan Razvan Popoviciu, Ioan I. Ardelean // 11 International Multidisciplinary Scientific GeoConference and Expo "Surveying Geology and Mining Ecology Management" (SGEM 2011), Albena, 20-24 June, 2011. - Tokyo, 2011. - P14.01/995-14.01/1002
Перевод заглавия: Бактериальная плотность, биомасса и доля живых клеток в песчаных осадках литорали Чернорморского побережья Румынии
Аннотация: В 8 пробах, взятых с поверхности песчаного осадка (ОС) на Черноморском побережье Румынии, исследовали численность, биомассу, морфологич. характерстики методом флуоресцентной микроскопии SYBR зеленый I и физиологич. состояние бактерий (Б). Численность Б составляла 4,62-9,64 10{7} кл*см{-3} ОС и зависела от размеров частиц ОС. Биомасса (сухой вес) составляла 3,03-6,39 мкг*см{-3}. Среди Б доминировали палочки (57-65%), соотношение палочки:кокки коррелировало с гранулометрическим составом ОС. Значительная часть клеток характеризовались нарушенной мембраной, т.е. были мертвыми. Румыния, "Ovidius" Univ., Constanta
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.35.33.37.37.53.11
Рубрики: БАКТЕРИИ ПЕСЧАНЫХ ОСАДКОВ
ЛИТОРАЛЬ ЧЕРНОГО МОРЯ

БИОМАССА

МОРФОЛОГИЯ

ДОЛЯ ЖИВЫХ КЛЕТОК

ГРАНУЛОМЕТРИЯ ОСАДКОВ

ФЛУОРОХРОМ SYBR ЗЕЛЕНЫЙ I


Доп.точки доступа:
Ardelean, Ioan I.


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.06-04Б2.100

    Popoviciu, Dan Razvan.

    Bacterial abundance, biomass and proportion of living cells in littoral sandy sediments on the Romanian Black Sea Coast [Text] / Dan Razvan Popoviciu, Ioan I. Ardelean // 11 International Multidisciplinary Scientific GeoConference and Expo "Surveying Geology and Mining Ecology Management" (SGEM 2011), Albena, 20-24 June, 2011. - Tokyo, 2011. - P14.01/995-14.01/1002
Перевод заглавия: Бактериальная плотность, биомасса и доля живых клеток в песчаных осадках литорали Чернорморского побережья Румынии
Аннотация: В 8 пробах, взятых с поверхности песчаного осадка (ОС) на Черноморском побережье Румынии, исследовали численность, биомассу, морфологич. характерстики методом флуоресцентной микроскопии SYBR зеленый I и физиологич. состояние бактерий (Б). Численность Б составляла 4,62-9,64 10{7} кл*см{-3} ОС и зависела от размеров частиц ОС. Биомасса (сухой вес) составляла 3,03-6,39 мкг*см{-3}. Среди Б доминировали палочки (57-65%), соотношение палочки:кокки коррелировало с гранулометрическим составом ОС. Значительная часть клеток характеризовались нарушенной мембраной, т.е. были мертвыми. Румыния, "Ovidius" Univ., Constanta
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: БАКТЕРИИ ПЕСЧАНЫХ ОСАДКОВ
ЛИТОРАЛЬ ЧЕРНОГО МОРЯ

БИОМАССА

МОРФОЛОГИЯ

ДОЛЯ ЖИВЫХ КЛЕТОК

ГРАНУЛОМЕТРИЯ ОСАДКОВ

ФЛУОРОХРОМ SYBR ЗЕЛЕНЫЙ I


Доп.точки доступа:
Ardelean, Ioan I.


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 13.08-04Б3.124

    Popoviciu, Dan Razvan.

    Bacterial abundance, biomass and proportion of living cells in littoral sandy sediments on the Romanian Black Sea Coast [Text] / Dan Razvan Popoviciu, Ioan I. Ardelean // 11 International Multidisciplinary Scientific GeoConference and Expo "Surveying Geology and Mining Ecology Management" (SGEM 2011), Albena, 20-24 June, 2011. - Tokyo, 2011. - P14.01/995-14.01/1002
Перевод заглавия: Бактериальная плотность, биомасса и доля живых клеток в песчаных осадках литорали Чернорморского побережья Румынии
Аннотация: В 8 пробах, взятых с поверхности песчаного осадка (ОС) на Черноморском побережье Румынии, исследовали численность, биомассу, морфологич. характерстики методом флуоресцентной микроскопии SYBR зеленый I и физиологич. состояние бактерий (Б). Численность Б составляла 4,62-9,64 10{7} кл*см{-3} ОС и зависела от размеров частиц ОС. Биомасса (сухой вес) составляла 3,03-6,39 мкг*см{-3}. Среди Б доминировали палочки (57-65%), соотношение палочки:кокки коррелировало с гранулометрическим составом ОС. Значительная часть клеток характеризовались нарушенной мембраной, т.е. были мертвыми. Румыния, "Ovidius" Univ., Constanta
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.21
Рубрики: БАКТЕРИИ ПЕСЧАНЫХ ОСАДКОВ
ЛИТОРАЛЬ ЧЕРНОГО МОРЯ

БИОМАССА

МОРФОЛОГИЯ

ДОЛЯ ЖИВЫХ КЛЕТОК

ГРАНУЛОМЕТРИЯ ОСАДКОВ

ФЛУОРОХРОМ SYBR ЗЕЛЕНЫЙ I


Доп.точки доступа:
Ardelean, Ioan I.


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 99.11-04Б3.26

    Lebaron, Philippe.

    Comparison of blue nucleic acid dyes for flow cytometric enumeration of bacteria in aquatic systems [Text] / Philippe Lebaron, Nathalie Parthuisot, Philippe Catala // Appl. and Environ. Microbiol. - 1998. - Vol. 64, N 5. - P1725-1730 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Сравнение [использования] голубых красителей нуклеиновых кислот для подсчета бактерий в водных системах методом проточной цитометрии
Аннотация: Проведено сравнение 7 голубых красителей, производимых Корпорацией Молекулярных зондов (Molecular Probes Inc.) (SYTO-9, -11, -13, -16, -BC, SYBR-I, -II) с 4,6-диамидино-2-фенилиндолом для подсчета живых и фиксированных бактерий в водных системах методом проточной цитометрии. SYBR-II и SYTO-9 наиболее эффективны для достижения цели в несоленых водах, и их можно применять к живым и фиксированным бактериям. При использовании SYTO-9 для окраски живых бактерий в несоленой воде улучшено соотношение сигнал/шум. Для образцов морской воды (с фиксированными и нефиксированными клетками) более пригоден краситель SYBR-II. Франция, Lab. ARAGO, BP44, F-66651 Banyuls-sur-Mer Cedex. E-mail: lebaron
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.07.09
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ЗОНДЫ
SYTO

SYBR

DAPI

ЭФФЕКТИВНОСТЬ

СРАВНЕНИЕ

БАКТЕРИИ

ПОДСЧЕТ

ПРОТОЧНАЯ ЦИТОМЕТРИЯ


Доп.точки доступа:
Parthuisot, Nathalie; Catala, Philippe


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 99.11-04А2.10

    Lebaron, Philippe.

    Comparison of blue nucleic acid dyes for flow cytometric enumeration of bacteria in aquatic systems [Text] / Philippe Lebaron, Nathalie Parthuisot, Philippe Catala // Appl. and Environ. Microbiol. - 1998. - Vol. 64, N 5. - P1725-1730 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Сравнение [использования] голубых красителей нуклеиновых кислот для подсчета бактерий в водных системах методом проточной цитометрии
Аннотация: Проведено сравнение 7 голубых красителей, производимых Корпорацией Молекулярных зондов (Molecular Probes Inc.) (SYTO-9, -11, -13, -16, -BC, SYBR-I, -II) с 4,6-диамидино-2-фенилиндолом для подсчета живых и фиксированных бактерий в водных системах методом проточной цитометрии. SYBR-II и SYTO-9 наиболее эффективны для достижения цели в несоленых водах, и их можно применять к живым и фиксированным бактериям. При использовании SYTO-9 для окраски живых бактерий в несоленой воде улучшено соотношение сигнал/шум. Для образцов морской воды (с фиксированными и нефиксированными клетками) более пригоден краситель SYBR-II. Франция, Lab. ARAGO, BP44, F-66651 Banyuls-sur-Mer Cedex. E-mail: lebaron
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.35.33.05
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ЗОНДЫ
SYTO

SYBR

DAPI

ЭФФЕКТИВНОСТЬ

СРАВНЕНИЕ

БАКТЕРИИ

ПОДСЧЕТ

ПРОТОЧНАЯ ЦИТОМЕТРИЯ


Доп.точки доступа:
Parthuisot, Nathalie; Catala, Philippe


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.11-04Б2.4

    Lebaron, Philippe.

    Comparison of blue nucleic acid dyes for flow cytometric enumeration of bacteria in aquatic systems [Text] / Philippe Lebaron, Nathalie Parthuisot, Philippe Catala // Appl. and Environ. Microbiol. - 1998. - Vol. 64, N 5. - P1725-1730 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Сравнение [использования] голубых красителей нуклеиновых кислот для подсчета бактерий в водных системах методом проточной цитометрии
Аннотация: Проведено сравнение 7 голубых красителей, производимых Корпорацией Молекулярных зондов (Molecular Probes Inc.) (SYTO-9, -11, -13, -16, -BC, SYBR-I, -II) с 4,6-диамидино-2-фенилиндолом для подсчета живых и фиксированных бактерий в водных системах методом проточной цитометрии. SYBR-II и SYTO-9 наиболее эффективны для достижения цели в несоленых водах, и их можно применять к живым и фиксированным бактериям. При использовании SYTO-9 для окраски живых бактерий в несоленой воде улучшено соотношение сигнал/шум. Для образцов морской воды (с фиксированными и нефиксированными клетками) более пригоден краситель SYBR-II. Франция, Lab. ARAGO, BP44, F-66651 Banyuls-sur-Mer Cedex. E-mail: lebaron
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.05.07
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ЗОНДЫ
SYTO

SYBR

DAPI

ЭФФЕКТИВНОСТЬ

СРАВНЕНИЕ

БАКТЕРИИ

ПОДСЧЕТ

ПРОТОЧНАЯ ЦИТОМЕТРИЯ


Доп.точки доступа:
Parthuisot, Nathalie; Catala, Philippe


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI34) 00.10-04Т4.47

    Singer, Victoria L.

    Comparison of SYBR{R} Green I nucleic acid gel stain mutagenicity and ethidium bromide mutagenicity in the Salmonella/mammalian microsome reverse mutation assay (Ames test) [Text] / Victoria L. Singer, Timothy E. Lawlor, Stephen Yue // Mutat. Res. Genet. Toxicol. and Environ. Mutagen. - 1999. - Vol. 439, N 1. - P37-47 . - ISSN 1383-5718
Перевод заглавия: Сравнительное изучение мутагенной активности красителей SYBR Green I и этидиумбромида в тесте обратных мутаций Сальмонелла/микросомы млекопитающих (тесты Эймса)
Аннотация: Высокочувствительный метод окрашивания нуклеиновых кислот в геле с помощью SYBR Green I (I) имеет ряд преимуществ в сравнении с применением этидиум бромида (ЭБ), известного интеркалятора. Изучена мутагенная активность обоих красителей в тестах Эймса: Сальмонелла/микросомы. Как и ожидалось, ЭБ проявил очень высокую мутагенную активность по индукции мутаций различных типов. I характеризовался очень незначительной мутагенной активностью, и, по-видимому, не является интеркалятором. США, Molecular Probes, 4849 Pitchford Avenue, Eugene, OR. Библ. 43
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.47.03.19.17
Рубрики: КРАСИТЕЛИ
SYBR CREEN I

ЭТИДИУМБРОМИД

МУТАГЕННАЯ АКТИВНОСТЬ

ТЕСТЫ ЭЙМСА

САЛЬМОНЕЛЛЫ

МИКРОСОМЫ


Доп.точки доступа:
Lawlor, Timothy E.; Yue, Stephen


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.11-04Б2.305

    Singer, Victoria L.

    Comparison of SYBR{R} Green I nucleic acid gel stain mutagenicity and ethidium bromide mutagenicity in the Salmonella/mammalian microsome reverse mutation assay (Ames test) [Text] / Victoria L. Singer, Timothy E. Lawlor, Stephen Yue // Mutat. Res. Genet. Toxicol. and Environ. Mutagen. - 1999. - Vol. 439, N 1. - P37-47 . - ISSN 1383-5718
Перевод заглавия: Сравнительное изучение мутагенной активности красителей SYBR Green I и этидиумбромида в тесте обратных мутаций Сальмонелла/микросомы млекопитающих (тесты Эймса)
Аннотация: Высокочувствительный метод окрашивания нуклеиновых кислот в геле с помощью SYBR Green I (I) имеет ряд преимуществ в сравнении с применением этидиум бромида (ЭБ), известного интеркалятора. Изучена мутагенная активность обоих красителей в тестах Эймса: Сальмонелла/микросомы. Как и ожидалось, ЭБ проявил очень высокую мутагенную активность по индукции мутаций различных типов. I характеризовался очень незначительной мутагенной активностью, и, по-видимому, не является интеркалятором. США, Molecular Probes, 4849 Pitchford Avenue, Eugene, OR. Библ. 43
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.17.07.07
Рубрики: КРАСИТЕЛИ
SYBR CREEN I

ЭТИДИУМБРОМИД

МУТАГЕННАЯ АКТИВНОСТЬ

ТЕСТЫ ЭЙМСА

САЛЬМОНЕЛЛЫ

МИКРОСОМЫ


Доп.точки доступа:
Lawlor, Timothy E.; Yue, Stephen


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 99.10-04К1.22

    Myers, Mark A.

    Direct measurement of cell numbers in microtitre plate cultures using the fluorescent dye SYBR green I [Text] / Mark A. Myers // J. Immunol. Meth. - 1998. - Vol. 212, N 1. - P99-103 . - ISSN 0022-1759
Перевод заглавия: Прямое определение числа клеток в культуральных плашках для микротирования с применением флуоресцентного красителя SYBR-зеленого-1
Аннотация: В ячейках культуральных плашек клетки окрашивали связывающим ДНК флуоресцентным красителем SYBR-зеленым-1. Одностадийный метод обладает чувствительностью 1000 клеток в лунке при слабой флуоресценции фона (без ДНК) и близости спектров флуоресценции красителя со спектрами флуоресцеина. Метод позволяет нормировать данные соответственно результатам данным иммуноферментного анализа для цельных клеток. Метод применяется в отношении нефиксированных и фиксированных клеток; более высокая проницаемость для красителя фиксированных клеток увеличивает чувствительность метода. Австралия, Dep. Bioch. a. Mol. Biol., Monash Univ., Clayton, Victoria 3168. Библ. 7
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.43.05.11.11
Рубрики: БЕЛОК
РНК

ДНК

ЧИСЛО КЛЕТОК

ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ КРАСИТЕЛИ

SYBR-ЗЕЛЕНЫЙ-1



11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 99.09-04Я6.223

    Myers, Mark A.

    Direct measurement of cell numbers in microtitre plate cultures using the fluorescent dye SYBR green I [Text] / Mark A. Myers // J. Immunol. Meth. - 1998. - Vol. 212, N 1. - P99-103 . - ISSN 0022-1759
Перевод заглавия: Прямое определение числа клеток в культуральных плашках для микротирования с применением флуоресцентного красителя SYBR-зеленого-1
Аннотация: В ячейках культуральных плашек клетки окрашивали связывающим ДНК флуоресцентным красителем SYBR-зеленым-1. Одностадийный метод обладает чувствительностью 1000 клеток в лунке при слабой флуоресценции фона (без ДНК) и близости спектров флуоресценции красителя со спектрами флуоресцеина. Метод позволяет нормировать данные соответственно результатам данным иммуноферментного анализа для цельных клеток. Метод применяется в отношении нефиксированных и фиксированных клеток; более высокая проницаемость для красителя фиксированных клеток увеличивает чувствительность метода. Австралия, Dep. Bioch. a. Mol. Biol., Monash Univ., Clayton, Victoria 3168. Библ. 7
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.19.21.01
Рубрики: БЕЛОК
РНК

ДНК

ЧИСЛО КЛЕТОК

ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ КРАСИТЕЛИ

SYBR-ЗЕЛЕНЫЙ-1



12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 15.12-04Б2.26

    Kawaguchi, Yuko.

    Fluorescence imaging of microbe-containing particles shot from a two-stage light-gas gun into an aerogel [Text] / Yuko Kawaguchi, Tomohiro Sugino, Makoto Tabata // Orig. Life and Evol. Bios. - 2014. - Vol. 44, N 1. - P43-60 . - ISSN 0169-6149
Перевод заглавия: Обнаружение с помощью флуоресценции частиц, содержащих микробов, выстрелянных из духовного ружья в аэрогель
Аннотация: Моделировали захват микробов из космоса на Японском опытном модуле Международной космической станции (миссия Tanpopo). Кремниевый аэрогель Lucentite с частицами, содержащими устойчивую к облучениям бактерию Deinococcus radiodurans, выдерживали в космосе в течение года. Опыты проводили в аппарате LGG, движущемся со скоростью 4,2 км/с. После возвращения аэрогеля частицы, содержащие бактерии, выявляли с помощью флуоресцентной микроскопии после окрашивания специфическим к ДНК флуоресцентным красителем SYBR зеленый - I. Показали, что опробованный метод позволял обнаруживать микробов, находившихся на орбите. Были также разработаны методы, позволяющие выделить из аэрогеля микробную ДНК и провести определение их видов, анализируя 16S-рРНК. Япония, A. yamagishi, Dep. of Applied Life Scis. School of Life Scis., Tokyo Univ. of pharmacy and Life Sciences, Horinouchi, Hachioji, Tokyo 192-0392 (E-mail: yamagish@ls.toyaku.ac.jp
ГРНТИ  
,    34.27.21
ВИНИТИ 341.27.19.13.09 + 341.27.21.09.31.02
Рубрики: DEINOCOCCUS RADIODURANS (BACT.)
ПРЕБЫВАНИЕ В КОСМОСЕ

КРЕМНИЕВЫЙ АЭРОГЕЛЬ

ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЙ КРАСИТЕЛЬ SYBR ЗЕЛЕНЫЙ-I

ВЫДЕЛЕНИЕ МИКРОБНОЙ ДНК

АНАЛИЗ 16S-РРНК


Доп.точки доступа:
Sugino, Tomohiro; Tabata, Makoto


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 01.12-04К1.9

    Bon, Michelle A. M.

    Genotyping of HLA-B27 by real-time PCR without hybridization probes [Text] / Michelle A. M. Bon, Oeveren-Dybicz Arletta van, den Bergh Frank A. J.T.M. van // Clin. Chem. - 2000. - Vol. 46, N 7. - P1000-1002 . - ISSN 0009-9147
Перевод заглавия: Генотипирование HLA-B27 с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) в реальном времени без гибридизационных проб
Аннотация: Для типирования широко распространенного аллеля HLA-B27 использован метод включения избирательного для ДНК флуоресцентного красителя SYBR зеленого I, что позволяет обойтись без электрофоретической идентификации продуктов ПЦР, резко упростив и ускорив процедуру типирования с использованием аппарата LightCycler. Нидерланды, Dep. Clinical Chemistry, Medical Spectrum Twente, Hospital Group, Enschede. Библ. 8
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.43.05.07
Рубрики: ГКГС ЧЕЛОВЕКА
АЛЛЕЛЬ HLA-B27

МЕТОД ВЫЯВЛЕНИЯ

ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ

ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЙ КРАСИТЕЛЬ SYBR ЗЕЛЕНЫЙ

ВКЛЮЧЕНИЕ В ДНК


Доп.точки доступа:
van, Oeveren-Dybicz Arletta; van, den Bergh Frank A.J.T.M.


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 16.05-04Б3.10

   

    High-Throughput Screening of Multispecies Biofilm Formation and Quantitative PCR-Based Assessment of Individual Species Proportions, Useful for Exploring Interspecific Bacterial Interactions [Text] / Dawei Ren [et al.] // Microbial Ecol. - 2014. - Vol. 68, N 1. - P146-154 . - ISSN 0095-3628
Перевод заглавия: Успешный скрининг видового состава биопленок и количественная оценка содержания отдельных видов на основе количественной ПЦР, полезная для изучения взаимодействий между видами бактерий
Аннотация: В большинстве природных сред биопленки (БП) содержат многие виды, взаимодействующие как синергически, так и антагонистически. Взаимодействия в БП изучены мало. Предложен быстрый, чувствительный и воспроизводимый подход (I) к количественному выявлению видов бактерий в БП. I основан на Nunc-TSP lid-системе и окрашивании кристаллвиолетом. Относит. долю отдельных видов в составе БП, состоящей из 4 видов, оценивали, применив колич. ПЦР, основанную на флуоресценции SY BR Green I с избирательными затравками. Показали сильное синергистское взаимодействие в модельной 4-видовой БП. Наблюдали 3-кратное увеличение скорости формирования БП. Показали сильное преобладание 2 видов, Xanthomonas retroflexus и Paenibacillus amylolyticus. I может быть использован как стандартная процедура известного состава. I может иметь важное значение в колич. изучении микробного состава в микробных сообществах многовидовых БП как природных сред, так и при инфекционных заболеваниях. I может помочь в понимании мех-мов кооперации, конкуренции и приспособленности отдельных видов в смешанных по составу БП
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.07.09
Рубрики: МИКРОБНЫЕ БИОПЛЕНКИ
МОДЕЛИРОВАНИЕ

XANTHOMONAS RETROFLEXUS (BACT.)

PAENIBACILLUS AMYLOLYTICUS (BACT.)

ВЫЯВЛЕНИЕ ВИДОВОГО СОСТАВА

СИСТЕМА NUNC-TSP LID

КРИСТАЛЛВИОЛЕТ

ФЛУОРЕСЦЕНТНАЯ КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ПЦР

КРАСИТЕЛЬ SYBR GREEN I

МЕЖВИДОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ


Доп.точки доступа:
Ren, Dawei; Madsen, Jonas Stenlokke; Cruz-Perera, Claudia I; Bergmark, Lasse; Sorensen, Soren J.; Burmolle, Mette


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 15.12-04Б2.90

   

    High-Throughput Screening of Multispecies Biofilm Formation and Quantitative PCR-Based Assessment of Individual Species Proportions, Useful for Exploring Interspecific Bacterial Interactions [Text] / Dawei Ren [et al.] // Microbial Ecol. - 2014. - Vol. 68, N 1. - P146-154 . - ISSN 0095-3628
Перевод заглавия: Успешный скрининг видового состава биопленок и количественная оценка содержания отдельных видов на основе количественной ПЦР, полезная для изучения взаимодействий между видами бактерий
Аннотация: В большинстве природных сред биопленки (БП) содержат многие виды, взаимодействующие как синергически, так и антагонистически. Взаимодействия в БП изучены мало. Предложен быстрый, чувствительный и воспроизводимый подход (I) к количественному выявлению видов бактерий в БП. I основан на Nunc-TSP lid-системе и окрашивании кристаллвиолетом. Относит. долю отдельных видов в составе БП, состоящей из 4 видов, оценивали, применив колич. ПЦР, основанную на флуоресценции SY BR Green I с избирательными затравками. Показали сильное синергистское взаимодействие в модельной 4-видовой БП. Наблюдали 3-кратное увеличение скорости формирования БП. Показали сильное преобладание 2 видов, Xanthomonas retroflexus и Paenibacillus amylolyticus. I может быть использован как стандартная процедура известного состава. I может иметь важное значение в колич. изучении микробного состава в микробных сообществах многовидовых БП как природных сред, так и при инфекционных заболеваниях. I может помочь в понимании мех-мов кооперации, конкуренции и приспособленности отдельных видов в смешанных по составу БП
ГРНТИ  
,    34.27.21
ВИНИТИ 347.27.17.05 + 341.27.21.09.25
Рубрики: МИКРОБНЫЕ БИОПЛЕНКИ
МОДЕЛИРОВАНИЕ

XANTHOMONAS RETROFLEXUS (BACT.)

PAENIBACILLUS AMYLOLYTICUS (BACT.)

ВЫЯВЛЕНИЕ ВИДОВОГО СОСТАВА

СИСТЕМА NUNC-TSP LID

КРИСТАЛЛВИОЛЕТ

ФЛУОРЕСЦЕНТНАЯ КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ПЦР

КРАСИТЕЛЬ SYBR GREEN I

МЕЖВИДОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ


Доп.точки доступа:
Ren, Dawei; Madsen, Jonas Stenlokke; Cruz-Perera, Claudia I; Bergmark, Lasse; Sorensen, Soren J.; Burmolle, Mette


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 13.07-04Б3.7

   

    Quantification of Frankia in soils using SYBR Green based qPCR [Text] / Suvidha Samant [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2012. - Vol. 35, N 3. - P191-197 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Количественное определение Frankia в почвах с использованием количественной ПЦР, основанной на (красителе) SYBR зеленый
Аннотация: Разработан метод колич. ПЦР, основанный на SYBR зеленом, для количественного штамма кластеров 1 и 3 актиномицета Frankia в почвах. В качестве обратной затравки был создан праймер nifHr 158 в комбинации с прямым праймером nifHf1. При этом избирательно амплифицировался участок гена nifH у Frankia размером в 191 п.н. Это сочетание затравок было испытано на специфичность на отобранных чистых культурах. Кроме того, были проведены сравнительные анализы случайно отобранных клонов клоновой библиотеки, созданной с применением этих затравок к экстрактам почвенной ДНК. После выверки условий экстракции ДНК и определения эффективности экстракции, использованной для нормализации образцов, было определено число копий генов nifH, представляющих кластеры 1 и 3 Frankia в различных почвах. США, Texas State Univ., Dept. of Biology, San Marcos, TX 78666. E-mail:dh49@txstate.edu. Библ. 55
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.07.09
Рубрики: FRANKIA (ACTINOBACTERIA) (BACT.)
МЕТОД КОЛИЧЕСТВЕННОГО ОПРЕДЕЛЕНИЯ

ПОЧВЕННАЯ ДНК

ЗАТРАВКИ ДЛЯ NIFH

КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ПЦР

SYBR ЗЕЛЕНЫЙ


Доп.точки доступа:
Samant, Suvidha; Sha, Qiong; Iyer, Anita; Dhabekar, Priti; Hahn, Dittmar


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.04-04Б2.3

   

    Quantification of Frankia in soils using SYBR Green based qPCR [Text] / Suvidha Samant [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2012. - Vol. 35, N 3. - P191-197 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Количественное определение Frankia в почвах с использованием количественной ПЦР, основанной на (красителе) SYBR зеленый
Аннотация: Разработан метод колич. ПЦР, основанный на SYBR зеленом, для количественного штамма кластеров 1 и 3 актиномицета Frankia в почвах. В качестве обратной затравки был создан праймер nifHr 158 в комбинации с прямым праймером nifHf1. При этом избирательно амплифицировался участок гена nifH у Frankia размером в 191 п.н. Это сочетание затравок было испытано на специфичность на отобранных чистых культурах. Кроме того, были проведены сравнительные анализы случайно отобранных клонов клоновой библиотеки, созданной с применением этих затравок к экстрактам почвенной ДНК. После выверки условий экстракции ДНК и определения эффективности экстракции, использованной для нормализации образцов, было определено число копий генов nifH, представляющих кластеры 1 и 3 Frankia в различных почвах. США, Texas State Univ., Dept. of Biology, San Marcos, TX 78666. E-mail:dh49@txstate.edu. Библ. 55
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.05.07 + 341.27.21.09.31.99
Рубрики: FRANKIA (ACTINOBACTERIA) (BACT.)
МЕТОД КОЛИЧЕСТВЕННОГО ОПРЕДЕЛЕНИЯ

ПОЧВЕННАЯ ДНК

ЗАТРАВКИ ДЛЯ NIFH

КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ПЦР

SYBR ЗЕЛЕНЫЙ


Доп.точки доступа:
Samant, Suvidha; Sha, Qiong; Iyer, Anita; Dhabekar, Priti; Hahn, Dittmar


18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 08.09-04Б3.15

   

    Rapid estimation of microbial numbers in water using bulk fluorescence [Text] / Linda Wegley [et al.] // Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 10. - P1775-1782 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Быстрое определение числа микроорганизмов в воде с использованием широкоохватной флуоресценции
Аннотация: Задача исследования - разработать быстрый метод определения плотности микробных клеток в пресной, морской и воде эстуариев. Авторы применили окрашивание ДНК с помощью SYBR Gold. Примененный метод широкоохватной флуоресценции (ШФ) может быть сравнен с определением конц-ии клеток в культурах, опирающуюся на оптическую плотность, но ШФ дает возможность определять число клеток при более низких их конц-иях (10{5} кл/мл). Метод ШФ может быть использован во флуоресцентных спектрофотометрах, оборудованных одной ячейкой или же рассчитанных на 96 ячеек. Метод ШФ позволяет точность 'ЭКВИВ'10{5} кл/мл. Его точность превышает таковую эпифлуоресцентной микроскопии. Обработка ДНКазой I повышает чувствительность ШФ, снижая фоновый "шум", вызываемый свободной ДНК. Метод ШФ прост, быстр, дешев и приспособлен к автоматическому определению числа микроорганизмов в пробах воды
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.07.09
Рубрики: ПЛОТНОСТЬ МИКРООРГАНИЗМОВ
ВОДНЫЕ СРЕДЫ

ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЙ МЕТОД

КРАСИТЕЛЬ SYBR GOLD


Доп.точки доступа:
Wegley, Linda; Mosier-Boss, Pamela; Lieberman, Stephen; Andrews, John; Graff-Baker, Amanda; Rohwer, Forest


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.12-04Б2.8

   

    Rapid estimation of microbial numbers in water using bulk fluorescence [Text] / Linda Wegley [et al.] // Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 10. - P1775-1782 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Быстрое определение числа микроорганизмов в воде с использованием широкоохватной флуоресценции
Аннотация: Задача исследования - разработать быстрый метод определения плотности микробных клеток в пресной, морской и воде эстуариев. Авторы применили окрашивание ДНК с помощью SYBR Gold. Примененный метод широкоохватной флуоресценции (ШФ) может быть сравнен с определением конц-ии клеток в культурах, опирающуюся на оптическую плотность, но ШФ дает возможность определять число клеток при более низких их конц-иях (10{5} кл/мл). Метод ШФ может быть использован во флуоресцентных спектрофотометрах, оборудованных одной ячейкой или же рассчитанных на 96 ячеек. Метод ШФ позволяет точность 'ЭКВИВ'10{5} кл/мл. Его точность превышает таковую эпифлуоресцентной микроскопии. Обработка ДНКазой I повышает чувствительность ШФ, снижая фоновый "шум", вызываемый свободной ДНК. Метод ШФ прост, быстр, дешев и приспособлен к автоматическому определению числа микроорганизмов в пробах воды
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.05.07 + 341.27.23.09
Рубрики: ПЛОТНОСТЬ МИКРООРГАНИЗМОВ
ВОДНЫЕ СРЕДЫ

ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЙ МЕТОД

КРАСИТЕЛЬ SYBR GOLD


Доп.точки доступа:
Wegley, Linda; Mosier-Boss, Pamela; Lieberman, Stephen; Andrews, John; Graff-Baker, Amanda; Rohwer, Forest


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 04.04-04Б3.151

   

    Studying cyanobacteria in Finnish lakes by quantitative real-time PCR [Text] / Katrianna Halinen [et al.] // 5 European Workshop on the Molecular Biology of Cyanobacteria, Stockholm, June 9-12, 2002. - Stockholm, 2002. - P24
Перевод заглавия: Исследование цианобактерий в финских озерах с помощью количественной ПЦР в реальном времени
Аннотация: Для выявления "цветения" в водоемах токсичных цианобактерий оптимизировали систему Light Cycler O подсчета Anabaena с помощью количественной полимеразной р-ции в реальном времени (Quantitative Real-Time-PCR, QRT-ПЦР). Метод основан на мониторинге флуоресценции красителя SYBR зеленый I, связывающегося с ds-ДНК. Результаты подсчета цианобактерий с помощью QRT-ПЦР и под микроскопом показали положительную корреляцию. Порог чувствительности QRT-ПЦР при определении гена mcyE клеток Anabaena, образующих микроцистин, составлял 100 клеток при р-цию. Показали, что QRT-ПЦР является специфическим методом для количественного определения цианобактерий в озерной воде. Финляндия, Dep. of Appl. Chemistry and Microbiol., Univ. of Helsinki (E-mail: khainen@hotmail.com)
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.21
Рубрики: ANABAENA (BACT.)
КОЛИЧЕСТВЕННОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ

МИКРОЦИСТИН

ГЕН MCYE

ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ

ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЙ КРАСИТЕЛЬ SYBR ЗЕЛЕНЫЙ I

ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ

ЦВЕТЕНИЕ ВОДОЕМОВ


Доп.точки доступа:
Halinen, Katrianna; Vaitomaa, Jaana; Rouhiainen, Leo; Lepisto, Liisa; Sivonen, Kaarina


 1-20    21-28 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)