СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Bartosik, Dariusz$<.>)

Общее количество найденных документов : 6
Показаны документы с 1 по 6

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.05-04Б2.185

Bartosik, Dariusz.
Molecular and functional analysis of pTAV320, a repABC-type replicon of the Paracoccus versutus composite plasmid pTAV1 [Text] / Dariusz Bartosik, Jadwiga Baj, Miroslawa Wlodarczyk // Microbiology. - 1998. - Vol. 144, N 11. - P3149-3157 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Молекулярный и функциональный анализ pTAV320 - репликона типа repABC составной части плазмиды pTAV1 Paracoccus versutus
Аннотация: Идентифицирована вторая репликативная область (РО) природной плазмиды pTAV1 Paracoccus versutus, что доказало составную природу этого репликона. Клонирован и секвенирован минимальный репликон pTAV320 (4,3 т. п. н.), к-рый кодирует 3 белка: RepA (I), RepB (II) и RepC (III). Эта РО очень похожа структурно и функционально на репликоны типа repABC Agrobacterium и Rhizobium. Область начала репликации расположена в кодирующей последовательности гена repC. III необходим для репликации, a I и II - для стабильного сохранения плазмиды, т. е. для активного распределения. Присутствие полной последовательности pTAV320 (в ее нерепликативной форме) может стабилизировать в цис-положении минирепликон pTAV202, полученный из второй РО pTAV1. Делеции в гене repC устраняют "стабилизирующую" способность pTAV320. Это позволило предположить, что в гене repC расположена центромероподобная последовательность, необходимая для распределения. Две РО pTAV1 (pTAV320 и pTAV202) несовместимы с родительской плазмидой, но совместимы друг с другом в клетках P. versutus. Репликон pTAV320 может сохраняться также в нескольких штаммах Paracoccus, Agrobacterium, Rhizobium и Rhodobacter. Польша, Dep. Bacterial Genet., Inst. Microbiol., Warsaw Univ. 00-046 Warsaw. Библ. 34

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ПЛАЗМИДА PTAV320
МОЛЕКУЛЯРНЫЙ АНАЛИЗ
ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ
РЕПЛИКОНЫ
РЕПЛИКОН ТИПА REPABC
ФУНКЦИИ
ПЛАЗМИДА PTAV1
PARACOCCUS VERSUTUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Baj, Jadwiga; Wlodarczyk, Miroslawa

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.11-04Б2.142

Characterization of the replicator region of megaplasmid pTAV3 of Paracoccus versutus and search for plasmid-encoded traits [Text] / Dariusz Bartosik [et al.] // Microbiology. - 2002. - Vol. 148, N 3. - P871-881 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Характеристика ориджина репликации мегаплазмиды pTAV3 Paracoccus versutus и исследование плазмидкодируемых характеристик
Аннотация: Локализовали репликон мегаплазмиды рTAV3 'ПРИБЛ='400 т.п.н. из Paracoccus versutus на EcoR I рестрикционном фрагменте размером 4,3 т.п.н и определили его полную нуклеотидную последовательность. G+C содержание последовательности равнялось величине 66 мол.%, что попадало внутрь области (62-66 мол. %) прежде определенной для общей ДНК из Paracoccus versutus. ORF 1 кодирует белок инициации репликации Rep (47,2 кД), который имеет существенное сходство с белками, кодируемыми плазмидами QpHI и QpDV из Coxiella burnetii и репликационным белкaм, кодируемым плазмидой pPS 10 из Pseudomonas syringae. ORF 2, локализованная в противоположной транскрипционной ориентации по отношению к ORF 1, кодировала предполагаемый белок, который имеет сходство с семейством АТФаз, участвующих в плазмидном делении. Наблюдали самое высокое сходство с гомологичными белками (RepA), кодируемыми rep ABC семейством репликонов, обнаруженными в нескольких плазмидах Agrobacterium, Rhizobium и Paracoccus spp. Предсказанный продукт ORF 3 был сходен с AcoR, Nif и Ntr C транскрипционными активаторами. Детерминанта строгой несовместимости (inc) была локализована между ORF 1 (rep) и ORF 2 (parA). Ориджин репликации pTAV 400 содержит короткую А-Т богатую область и несколько неполных палиндромных последовательностей. Эксперименты по излечиванию продемонстрировали, что мегаплазмида несет гены, необходимые для роста в минимальной среде и может, следовательно, регистрироваться как минихромосома. Обнаружили, что мегаплазмиды pTAV 3 из P. versutus uw 1 и PKLM 2 из Paracoccus pantotrophus DSM 11073 несут близкородственные репликоны несовместимости. Показали, что плазмида pOR 16 (содержащая oriV из pTAV 3, клонированный в плазмиде pABW 1, которая не реплицируется в Paracoccus spp.) может быть trans активирована не только pTAV 3, но также pKLW 2. Используя pOR 16, продемонстрировали, что репликационные системы родственные pTAV 3 также представлены в репликонах Paracoccus alcaliphilus JCM 7364, Paracoccus thicyanatus JAM 12816 и Paracoccus methylylutens DM 12. Польша, Dep. of Bacterial Genetics, Inst. of Microbiology, Warsaw Univ., Miaznikowa 1, 02-096 Warsaw. Библ. 48

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: МЕГАПЛАЗМИДА PTAV3
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
БЕЛОК ИНИЦИАЦИИ РЕПЛИКАЦИИ REP
БЛОК АТФАЗ
ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ АКТИВАТОР
ПЛАЗМИДА POR16
ПЛАЗМИДА PKLM
ХАРАКТЕРИСТИКА
PARACOCCUS VERSUTUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Bartosik, Dariusz; Baj, Jadwiga; Bartosik, Aneta A.; Wlodarczyk, Miroslawa

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.02-04Б2.149

Bartosik, Dariusz.
Identification of the partitioning site within the repABC-type replicon of the composite Paracoccus versutus plasmid pTAV1 [Text] / Dariusz Bartosik, Michal Szymanik, Edyta Wysocka // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 21. - P6234-6243 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Идентификация сайта распределения в репликоне типа repABC составной плазмиды pTAV1 Paracoccus versutus
Аннотация: Для идентификации сайта распределения минирепликона pTAV320 составной плазмиды pTAV1 Paracoccus versutus, относящейся к семейству репликонов repABC, методом ПЦР амплифицированы 2 детерминанта последовательности: inc1 в межгенной области repB-repC и inc2 с 3'-стороны от repC - и использованы вместе с очищенным белком RepB (I) для анализа методом сдвига ЭФ-подвижности. I связывается только с inc2 и образует 2 комплекса зависящим от конц-ии I образом. Область inc2 содержит 2 повторяющиеся последовательности длиной 14 п. н. (R1 и R2), разрушение к-рых полностью устраняет способность связывать I. Области R1 и R2 гомологичны повторам репликона repABC плазмиды pPAN1 P. pantotrophus DSM 82.5 и центромерным последовательностям хромосомы Bacillus subtilis. Избыток I дестабилизирует содержащие inc2 плазмиды в Escherichia coli. С другой стороны, область inc2 может стабилизировать другой нестабильный репликон у P. versutus при доставке I и RepA в транс-положении. Польша, Dep. Bacterial Genet., Inst. Microbiol., Warsaw Univ., 02-096 Warsaw. Библ. 43

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДА PTAV320
РЕПЛИКАЦИЯ
РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
МЕХАНИЗМ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
САЙТ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
БЕЛОК
БЕЛОК РЕПЛИКАЦИИ REPB
ФУНКЦИЯ
PARACOCCUS VERSUTUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Szymanik, Michal; Wysocka, Edyta

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.03-04Б2.156

Bartosik, Dariusz.
Identification and characterization of transposable elements of Paracoccus pantotrophus [Text] / Dariusz Bartosik, Marta Sochacka, Jadwiga Baj // J. Bacteriol. - 2003. - Vol. 185, N 13. - P3753-3763 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Идентификация и характеристика транспозибельных элементов Paracoccus pantotrophus
Аннотация: Исследовали разнообразие и распределение остатков транспозибельных элементов в различных штаммах (DSM 11072, DSM 11073, DSM 65 и LMD 82,5) почвенной бактерии Paracoccus pantotrophus ('альфа'-Proteobacteria). С помощью челночного вектора pMEC1 идентифицировали несколько новых инсерционных последовательностей (IS) и транспозонов (Tn), секвенировали их и провели сравнительный анализ, позволивший охарактеризовать гены транспозазы, терминальные инвертированные повторы и классифицировать IS и Tn по семействам. Частота транспозиции этих элементов варьировала от 10{-6} до 10{-3} в зависимости от штамма. Проанализировали число копий, локализацию и распределение этих элементов в P. pantotrophus, P. denitrificans, P. methylutens, P. solventivorans, и P. versutus, что позволило разделить элементы на общие для паракокков и штаммо-специфичные. Поскольку ранее был описан только один элемент (IS1248 P. denitrificans), вновь обнаруженные элементы могут послужить новым генетическим инструментом для изучения паракокков. Польша, Wfrsaw Univ., Inst. of Microbiol., Dep. of Bacterial Genetics, 02-096 Warsaw. Библ. 17

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: ПОЧВЕННЫЕ БАКТЕРИИ
ГЕНОМ
СТРУКТУРА
ТРАНСПОЗОНЫ
ИНСЕРЦИОННЫЕ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
PARACCOCUS PANTOTROPHUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Sochacka, Marta; Baj, Jadwiga

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.12-04Б2.182

Identification of a transposable genomic island of Paracoccus pantotrophus DSM 11072 by its transposition to a novel entrapment vector pMMB2 [Text] / Malgorzata Mikosa [et al.] // Microbiology. - 2006. - Vol. 152, N 4. - P1063-1073 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Идентификация транспозибельного геномного острова Paracoccus pantrorophus DSM 11072 путем транспозиции нового провоцирующего вектора pMMB2
Аннотация: Использовали новый челночный провоцирующий вектор pMMB2 для идентификации большого транспозибельного элемента TnPpa1 Paracoccus pantotrophus DSM 11072. Показали, что TnPPa1 имеет сложную структуру с различно ориентированными копиями транспозона Tn3434, локализованными на обоих концах. Основной район содержит большой набор генов, продукты которых имеют сходство с интермедиатами цикла Кребса, транспортерами, регуляторами транскрипции и другими белками. 4,2 т.п.н. сегмент ДНК TnPpa1 гомологичен району хромосомы cll Rhodobacter sphaeroides 2.4.1. TnpPa1 ограничен прямыми повторами размером 5 п.н. и локализован внутри большого репликона pWKS5 в геноме DSM 11072. В геноме хозяина обнаружили спонтанную инверсию корового района TnPpa1. Установили, что TnPpa1 представлен исключительно внутри DSM 11072, что свидетельствует о возможности его приобретения путем латерального переноса. Польша, Dep. of Bact. Genetics, Inst. of Microbiol., Warsaw Univ. Miecnikowa 1, 02-096 Warsaw. Библ. 28

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМ
СТРУКТУРА
ТРАНСПОЗОНЫ
ТРАНСПОЗИБЕЛЬНЫЙ ЭЛЕМЕНТ TNPPA1
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ВЕКТОРЫ
ПРОВОЦИРУЮЩИЙ ВЕКТОР РММВ2
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
PARACOCCUS PANTOTROPHUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Mikosa, Malgorzata; Sochacka-Pietal, Marta; Baj, Jadwiga; Bartosik, Dariusz

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.03-04Б2.174

Szuplewska, Magdalena.
Identification of a mosaic transposable element of Paracoccus marcusii composed of insertion sequence ISPmar4 (ISAs1 family) and an IS1247a-driven transposable module (TMo) [Text] / Magdalena Szuplewska, Dariusz Bartosik // FEMS Microbiol. Lett. - 2009. - Vol. 292, N 2. - P216-221 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Идентификация мозаичного транспозирующегося элемента Paracoccus marcusii, состоящего из инсерционной последовательности ISPmar4 (семейство ISAs1) и транспозирующегося модуля, управляемого [последовательностью] IS1247a (TMo)
Аннотация: У продуцента каротеноидов Paracoccus marcusii OS22 в плазмиде на основе гена sacB клонирован мозаичный транспозирующийся элемент, составленный из инсерционной последовательности ISPmar4 (семейство ISAs1) и функционального транспозирующегося модуля (TMo), образованного из копии инсерционной последовательности IS1247a (семейство IS1380). Данный TMo, кроме последовательности IS1247a, содержит 3'-концевой участок предположительного гена 'альфа'/'бета'-гидролазы, экспрессия которого может начинаться с промотора P[2] последовательности IS1247a. Выявление такого мозаичного элемента показывает, что при транспозиции TMo могут превращать инсерционную последовательность в более сложный элемент, похожий на простой транспозон. Польша [Bartosik D.], Dep. of Bac. Genet., Inst. of Microbiol., Univ. of Warsaw, Miecznikowa 102-096 Warsaw

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ТРАНСПОЗИРУЮЩИЙ ЭЛЕМЕНТ
СОСТАВ
СЕМЕЙСТВО IS1380
ТРАНСПОЗИЦИЯ
ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ ТРАНСПОЗИРУЮЩИЙ МОДУЛЬ
ПРЕВРАЩЕНИЕ
ТРАНСПОЗОН
PARACOCCUS MARCUSII (BACT.)
ПРОДУЦЕНТ КАРОТЕНОИДОВ

Доп.точки доступа:
Bartosik, Dariusz

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска