СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ФАКТОР 'СИГМА'{54}<.>)

Общее количество найденных документов : 5
Показаны документы с 1 по 5

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.01-04Б2.271

Analysis of the architecture of the transcription factor 'сигма'{N} ('сигма'{54}) and its domains by circular dichroism [Text] / S. Missailidis [et al.] // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 24, N 3. - P653-664 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Анализ архитектуры фактора транскрипции 'сигма'{N} ('сигма'{54}) и его доменов [методом] кругового дихроизма
Аннотация: Методом кругового дихроизма (КД) изучена структура альтернативного фактора транскрипции 'сигма'{N} (I) из Klebsiella pneumoniae. I и его домены структурированы в отсутствие субъединиц миним. фермента РНК-полимеразы или промоторной ДНК. Анализ изменений КД при тепловой денатурации I обнаружил одновременную утрату вторичной и третичной структур с т-рой плавления 36'ГРАДУС'. Кривая плавления вторичной структуры является 2-стадийной со второй T[m]=85'ГРАДУС'. N-концевая обл.-I (0-I) с доменом активации и кислая 0-II не вносят вклад в 2-стадийное плавление, для к-рого требуется целостность С-концевого домена связывания с ДНК. Измерение pKb также показало, что С-концевая часть I, но не 0-I или 0-I+0-II, требуется для структурной целостности I при высоком pH. Измерение pK[a] позволило предположить, что 'альфа'-спиральные структуры I важны для установления элементов третичной структуры. Сигналы третичной структуры в ближней УФ-области спектра КД не требуют 0-I или 0-I+0-II, но сильно уменьшаются при укорачивании I с С-конца. Связывание с промоторной ДНК вызывает изменение конформации I, что позволяет оценить константу связывания (K[a]=9*10{-5} М). После связывания I промоторная ДНК находится в типичной В-конфигурации. Обсуждаются модульная доменная организация I, ф-ция С-концевого домена, коммуникация между доменами и ее роль в активации транскрипции. Великобритания, Biol. Dep., Imp. Coll. Sci., Technol. and Med., London, SW7 2BB. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ФАКТОРЫ ТРАНСКРИПЦИИ
ФАКТОР 'СИГМА'{54}
СТРУКТУРНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ
ДОМЕННАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ
КРУГОВОЙ ДИХРОИЗМ
KLEBSIELLA PNEUMONIAE (BACT.)

Доп.точки доступа:
Missailidis, S.; Cannon, W.V.; Drake, A.; Wang, X.Y.; Buck, M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.02-04Б2.214

Syed, Adeela.
Isolation and properties of enhancer-bypass mutants of sigma 54 [Text] / Adeela Syed, Jay D. Gralla // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 23, N 5. - P987-995 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Выделение и свойства обходящих энхансер мутантов 'сигма'{54}
Аннотация: Сконструирован обзор случайных мутаций в N-концевом домене фактора 'сигма'{54} (I) Escherichia coli. Получены 5 клонов, несущих мутантные I, не требующие ф-ции энхансера: они усиливают рост в условиях ограничения по N клеток, лишенных энхансерного белка NtrC. Секвенирование показало, что все мутации затрагивают 4 остатка Leu между положениями 25 и 31 в области I. Ни один из мутантов I не сохранил гидрофобности, присущей остаткам Leu. Мутантные I транскрибируют in vitro, не требуя связывания белка NtrC с энхансером или гидролиза АТФ, что подтверждает их фенотип in vivo. Предполагают, что очень маленький набор остатков Leu играет критическую роль в контроле ф-ции РНК-полимеразы, обеспечивая сильный ответ на физиологическую индукцию при участии таких энхансерных белков, как NtrC. США, Dep. Chem. and Biochem., Univ., California, Los Angeles, CA 90095-1569. Библ. 30

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК-ПОЛИМЕРАЗА
ФАКТОР 'СИГМА'{54}
МУТАГЕНЕЗ
МУТАНТЫ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ЭНХАНСЕР-НЕЗАВИСИМАЯ
ВЫДЕЛЕНИЕ
СВОЙСТВА
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Gralla, Jay D.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.196

Guo, Yuli.
Promoter opening via a DNA fork junction binding activity [Text] / Yuli Guo, Jay D. Gralla // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol. 95, N 20. - P11655-11660 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Открывание промотора за счет активности, связывающейся со стыковой вилкой ДНК
Аннотация: Открытые транскрипционные комплексы содержат 2 сегмента днДНК и 2 сегмента онДНК, на границах между к-рыми имеются "вилочные стыки" (ВС). С использованием холофермента РНК-полимеразы (I) Escherichia coli изучено узнавание I специфич. ВС, соответствующих бактериальным промоторам. Показано, что связывание зависит от последовательностей и структуры ДНК и узнает основания в положениях -11 и -12, к-рые являются 5'-границей между днДНК и онДНК в открытом комплексе. Промоторные мутации, понижающие скорость открывания промотора, уменьшают связывание с ВС. Активность, узнающая 5'-границу расплавленной ДНК, работает в сочетание с 2 активностями, к-рые порознь узнают 2 расплавленные нити. Активность в связывании с ВС принадлежит 'сигма'-факторам I: типичному бактериальному фактору 'сигма'{70} и альтернативному фактору 'сигма'{54}, к-рый отвечает на энхансеры и нуждается в АТФ. Высказано предположение, что открывание ДНК в промоторах катализируется связыванием с ВС. США, Dep. Chem. and Biochem., Univ. California, Los Angeles, CA 90095. Библ. 37

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПРОМОТОРЫ
ОТКРЫВАНИЕ
РНК-ПОЛИМЕРАЗА
ФАКТОР 'СИГМА'{70}
ФАКТОР 'СИГМА'{54}
СВЯЗЫВАНИЕ
ВИЛОЧНЫЕ СТЫКИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Gralla, Jay D.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.12-04Б2.165

Dworkin, Jonathan.
The PspA protein of Escherichia coli is a negative regulator of 'сигма'{54}-dependent transcription [Text] / Jonathan Dworkin, Goran Jovanovic, Peter Model // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 2. - P311-319 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Белок PspA Escherichia coli является негативным регулятором транскрипции, зависимой от 'сигма'{54}
Аннотация: Экспрессия генов эубактерий, транскрибируемых РНК-полимеразой, содержащей 'сигма'{54}, позитивно регулируется энхансер-связывающими белками (EBP). Эти белки связывают вышележащие активаторные последовательности и необходимы для инициации транскрипции 'сигма'{54}-зависимых промоторов. EBP становится функционально активным после фосфорилирования N-концевого регуляторного домена или связывания малых эффекторных молекул. EBP без этого домена, такие как PspF, активатор 'сигма'{54}-зависимого промотора pspA, конститутивно активны. Описаны свойства PspA Escherichia coli, который негативно регулирует промотор pspA, не связываясь непосредственно с ДНК. США, Lab. Genet., Rockefeller Univ., New York, NY 10021. Библ. 48

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ПРОМОТОР PSPA
РНК-ПОЛИМЕРАЗА
ФАКТОР 'СИГМА'{54}
НЕГАТИВНАЯ РЕГУЛЯЦИЯ
БЕЛОК
PSPA
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Jovanovic, Goran; Model, Peter

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.09-04Б2.168

Wigneshweraraj, Siva R.
Correlating protein footprinting with mutational analysis in the bacterial transcription factor 'сигма'{54} ('сигма'{N}) [Text] / Siva R. Wigneshweraraj, Paul Casaz, Martin Buck // Nucl. Acids Res. - 2002. - Vol. 30, N 4. - P1016-1028 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Корреляция [данных] футпринтинга белков и мутационного анализа бактериального фактора транскрипции 'сигма'{54} ('сигма'{N})
Аннотация: Футпринты энхансер-зависимого фактора 'сигма'{54}, связанного с кором РНК-полимеразы Escherichia coli, или формирующего закрытые промоторные комплексы, выявили экспонированные на поверхности потенциально функционально важные остатки 'сигма'{54}, расположенные между 'сигма'{54} и кором РНК-полимеразы (RNAP) или ДНК. Охарактеризованы мутанты с заменами аланина и глицина в некоторых из этих позиций. У некоторых мутантов выявлена повышенная способность к связыванию ДНК, что указывает на необходимость ограничения связывания промотора с голоферментом для нормального функционирования. Мутант F318A с заменой в ДНК-связывающем домене 'сигма'{54} характеризовался изменением взаимодействия с регуляторной областью промотора, участвующей в транскрипционном сайленсинге, и утратой способности подавлять транскрипцию in vitro. Мутанты с заменами в регуляторном районе I и в последовательности 'сигма'{54}, взаимодействующей с кором, не могли стабильно связываться с активатором в присутствии АДФ-алюминий фторида, аналога АТФ в переходном состоянии гидролиза. Предполагается, что интерфейс между 'сигма'{54} и кором RNAP функционально специализирован. Великобритания, Dep. Biol. Sci., Imperial Coll. Sci., Technol. Med., Sir Alexander Fleming Bld, London SW 2AZ. Библ. 43

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК-ПОЛИМЕРАЗА
ФАКТОР 'СИГМА'{54}
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ФУТПРИНТИНГ
КОРРЕЛЯЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Casaz, Paul; Buck, Martin

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска