Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ТРАНСКРИПТОМНЫЕ<.>)
Общее количество найденных документов : 9
Показаны документы с 1 по 9
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI16) 08.10-04В3.86

   

    Rapid transcriptome changes induced by cytosolic Ca{2+} transients reveal ABRE-related sequences as Ca{2+}-responsive cis elements in Arabidopsis [Text] / Boaz Kaplan [et al.] // Plant Cell. - 2006. - Vol. 18, N 10. - P2733-2748 . - ISSN 1040-4651
Перевод заглавия: Быстрые транскриптомные изменения, вызываемые временными состояниями цитозольного Ca{2+}, выявляют ABRE-связанные последовательности как Ca{2+}-респонсивные цис-элементы у Arabidopsis
Аннотация: В интактных проростках A. thaliana генерировали специфичные цитозольные Ca-сигналы в связи с ранними транскриптомными изменениями с последующим биоинформационным анализом ответственных за них генов. Цитозольный Ca-сигнал, вызываемый антагонистами кальмодулина и блокируемый лантанидами, характеризовали с использованием эквориновой люминометрии и фотонных изображений. Анализ транскриптомных изменений выявил 230 реагирующих на Ca генов, 162 из к-рых активировались, а 68 ингибировались, включая известные раннестрессовые гены и гены неизвестной функции. Выявили высокосущественную встречаемость консенсусной последовательности из 2 АБК-специфичных цис-элементов: АБК-респонсивного ABRE и его парного элемента ([C/A]ACGCG[T/C/A]). Тетрамер цис-элемента ABRE важен для транскрипционной активации в ответ на действие цитозольных Ca{2+}-сигналов. Как минимум, для некоторых специфичных Ca{2+}-состояний структурных комбинаций ABRE функционируют как Ca{2+}-респонсивные цис-элементы. Израиль, Dep. of Plant Sci., Weizmann Inst. of Sci., Rehovot 76100. Библ. 66
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.31.21.15.13
Рубрики: КАЛЬЦИЙ
СИГНАЛЫ

ЦИТОЗОЛЬ

ТРАНСКРИПТОМНЫЕ ИЗМЕНЕНИЯ

ABRE-СВЯЗАННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

ARABIDOPSIS THALIANA

ГЕНЫ


Доп.точки доступа:
Kaplan, Boaz; Davydov, Olga; Knight, Heather; Galon, Yael; Knight, Marc R.; Fluhr, Robert; Fromm, Hillel


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI16) 08.12-04В3.5

   

    Transcriptomic footprints disclose specificity of reactive oxygen species signaling in Arabidopsis [Text] / Ilya Gadjev [et al.] // Plant Physiol. - 2006. - Vol. 141, N 2. - P436-445 . - ISSN 0032-0889
Перевод заглавия: Транскриптомные отпечатки раскрывают специфичность сигналинга посредством активных форм кислорода у арабидопсиса
Аннотация: Активные формы кислорода (АФК) являются ключевыми участниками в регуляции развития растений, стрессовых реакций и программируемой клеточной смерти. Показано, что в зависимости от типа АФК, или места его субклеточного образования, запускаются различные биохимические, физиологические и молекулярные реакции. Транскриптомные данные, полученные из экспериментов по определению микроупорядоченности, связанной с АФК, использовали для оценки специфичности АФК-запускаемой экспрессии транскриптов. Сравнивали данные, полученные при экзогенной обработке вызывающими окислительный стресс агентами, а также из мутантных и трансгенных растений, в к-рых нарушена активность индивидуальных антиоксидантных ферментов. В целом просматривали обилие почти 26 000 транскриптов Arabidopsis thaliana в ответ на разные АФК. Из всего кол-ва выявлено 8056, 5312 и 3925 транскриптов, к-рые показывали соответственно 3-, 4- и 5-кратное изменение экспрессии. Вдобавок к маркерным транскриптам, к-рые специфически регулируются H[2]O[2], супероксидом или синглетным кислородом, несколько транскриптов были идентифицированы как общие маркеры реакции на окислительный стресс, поскольку их устойчивый уровень повышался не менее чем в 5 раз в большинстве экспериментов. Также оценивали характеристики экспрессии всех аннотированных факторов транскрипции и подразумеваемых новых кандидатных регуляторных транскриптов. Библ. 46
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.31.01.99
Рубрики: КИСЛОРОД
АКТИВНЫЕ ФОРМЫ

ARABIDOPSIS SP.

ТРАНСКРИПТОМНЫЕ ОТПЕЧАТКИ

ОКИСЛИТЕЛЬНЫЙ СТРЕСС


Доп.точки доступа:
Gadjev, Ilya; Vanderauwera, Sandy; Gechev, Tsanko S.; Laloi, Christophe; Minkov, Ivan N.; Shulaev, Vladimir; Apel, Klaus; Inze, Dirk; Mittler, Ron; Van, Breusegem Frank


3.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 08.12-04Н1.20

   

    Transcriptomic molecular markers for screening human colon cancer in stool and tissue [Text] / Farid E. Ahmed [et al.] // Cancer Genom. and Proteom. - 2007. - Vol. 4, N 1. - P1-20 . - ISSN 1109-6535
Перевод заглавия: Транскриптомные молекулярные маркеры для скриннинга рака толстой кишки человека [с использованием образцов] стула и ткани
Аннотация: Существует потребность в создании чувствительных специфических молекулярных маркеров для выявления изменений экспрессии генов в неинвазивных колоноцитах, присутствующих в стуле, и в аденомах-раке in situ толстой кишки. Количественный анализ экспрессии генов в таких образцах позволил выявить изменения экспрессии 10 генов - онкомаркеров на разных стадиях развития и прогрессии опухолей. Эти результаты создают основу для разработки методов ранней диагностики рака толстой кишки. США, Dep. Rad. Oncol., Leo W. Jenkins Cancer Ctr., Brody Sch. Med. at East Carolina Univ., Greenville, NC 27858. Библ. 107
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.29.49.03.05
Рубрики: РАК ТОЛСТОЙ КИШКИ
РАННЯЯ ДИАГНОСТИКА

МАРКЕРЫ

ТРАНСКРИПТОМНЫЕ

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

ИЗМЕНЕНИЯ


Доп.точки доступа:
Ahmed, Farid E.; Vos, Paul; James, Stephanie; Lysle, Donald T.; Allison, Ron R.; Flake, Gordon; Sinar, Dennis R.; Naziri, Wade; Marcuard, Stefan P.; Pennington, Rodney


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 11.02-04Б1.86

   

    Transcriptome changes in Culex quinquefasciatus (Diptera: Culicidae) salivary glands during West Nile virus infection [Text] / Yvette A. Girard [et al.] // J. Med. Entomol. - 2010. - Vol. 47, N 3. - P421-435 . - ISSN 0022-2585
Перевод заглавия: Транскриптомные изменения в слюнных железах у комаров Culex quinquefasciatus в течение инфекции, [вызванной] вирусом Западного Нила
Аннотация: Анализ микрочипов определил снижение уровня транскрипции ингибитора апоптозного гена IAP-1 и количество 11 транскриптов белков слюнных желез. Уровень транскрипции для эндонуклеазы и некоторых белков семейства D7 также снижен. Инфекця вирусом Западного Нила влияет на транскрипцию в тканях беспозвоночных хозяев, что оказывает влияние на реплицирующийся вирус, индуцируя защитные реакции хозяина. США, E-mail:lyricb@iastate.edu
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.17.28
Рубрики: CULEX QUINQUEFASCIATUS (DIPT.)
СЛЮННЫЕ ЖЕЛЕЗЫ

ТРАНСКРИПТОМНЫЕ ИЗМЕНЕНИЯ

ВИРУС ЗАПАДНОГО НИЛА


Доп.точки доступа:
Girard, Yvette A.; Mayhew, George F.; Fuchs, Jeremy F.; Li, Huarong; Schneider, Bradley S.; McGee, Charles E.; Rocheleau, Thomas A.; Helmy, Hanan; Christensen, Bruce M.; Higgs, Stephen; Bartholomay, Lyric C.


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI21) 11.02-04И2.185

   

    Transcriptome changes in Culex quinquefasciatus (Diptera: Culicidae) salivary glands during West Nile virus infection [Text] / Yvette A. Girard [et al.] // J. Med. Entomol. - 2010. - Vol. 47, N 3. - P421-435 . - ISSN 0022-2585
Перевод заглавия: Транскриптомные изменения в слюнных железах у комаров Culex quinquefasciatus в течение инфекции, [вызванной] вирусом Западного Нила
Аннотация: Анализ микрочипов определил снижение уровня транскрипции ингибитора апоптозного гена IAP-1 и количество 11 транскриптов белков слюнных желез. Уровень транскрипции для эндонуклеазы и некоторых белков семейства D7 также снижен. Инфекця вирусом Западного Нила влияет на транскрипцию в тканях беспозвоночных хозяев, что оказывает влияние на реплицирующийся вирус, индуцируя защитные реакции хозяина. США, E-mail:lyricb@iastate.edu
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.33.23.19.07.17.09.09.13
Рубрики: CULEX QUINQUEFASCIATUS (DIPT.)
СЛЮННЫЕ ЖЕЛЕЗЫ

ТРАНСКРИПТОМНЫЕ ИЗМЕНЕНИЯ

ВИРУС ЗАПАДНОГО НИЛА


Доп.точки доступа:
Girard, Yvette A.; Mayhew, George F.; Fuchs, Jeremy F.; Li, Huarong; Schneider, Bradley S.; McGee, Charles E.; Rocheleau, Thomas A.; Helmy, Hanan; Christensen, Bruce M.; Higgs, Stephen; Bartholomay, Lyric C.


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 12.01-04М1.143

    Алексеев, Д. Г.

    Анализ транскриптомных данных в модели гипоксии стволовых клеток [Текст] / Д. Г. Алексеев // 6 Московский международный конгресс "Биотехнология: состояние и перспективы развития", Москва, 21-25 марта, 2011. - М., 2011. - Ч.2. - С. 398 . - ISBN 5-7237-0372-2
Аннотация: Исследование гипоксии в культуре стволовых клеток показало сильные изменения в транскрипционном профиле клеток при недостатке кислорода. Кроме стандартных HIF опосредованных генов, измененная экспрессия наблюдается для множества генов гликолиза, клеточного цикла или апоптоза. Использование биоинформационных подходов для анализа экспрессируемых генов позволяет обобщить более 100 генов в одну сеть и изучать чувствительность клетки к недостатку кислорода, а также предположить модель регуляции генов за счет каскадов и неспецифических транскрипционных факторов. Создание сложной генной сети на основе данных по коэкспрессии, данных по совстречаемости генов в публикациях, данных из баз данных по метаболическим путям, данных об экспериментах по белок-белковому взаимодействию, расположению в одних оперонах позволяет строить комплексные биологические гипотезы, проверка которых возможно приведет к открытию новых механизмов клеточной реакции на кислородное голодание. Россия, НИИ ФХМ ФМБА РФ, Москва@
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.19.21.07
Рубрики: СТВОЛОВЫЕ КЛЕТКИ
ГИПОКСИЯ

ТРАНСКРИПТОМНЫЕ ДАННЫЕ

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

ГЕННЫЕ СЕТИ

ПРОТЕОМ

БИОИНФОРМАТИКА



7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 12.11-04И4.247

   

    Hepatic transcriptomic and metabolomic responses in the Stickleback (Gasterosteus aculeatus) exposed to ethinyl-estradiol [Text] / Ioanna Katsiadaki [et al.] // Aquat. Toxicol. - 2010. - Vol. 97, N 3. - P174-187 . - ISSN 0166-445X
Перевод заглавия: Транскриптомные и метаболомные реакции у трехиглых колюшек (Gasterosteus aculeatus) при воздействии этинилэстрадиола
Аннотация: Содержание самцов трехиглых колюшек на протяжении 4 дн. в присутствии этинилэстрадиола (0,1-100 нг/л) вызывало повышение в сыворотке содержания вителлогенина и хориогенинов в пороговой конц-ии 32 и 10 нг/л соотв. Методом полимеразной цепной реакции показана индукция транскрипционной активности генов этих белков. Различия в индуцибельности вителлогенина и хориогенинов при воздействии этинилэстрадиола отражают их участие в формировании желтка и хориона в процессе оогенеза у рыб
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.33.33.27.29
Рубрики: КОЛЮШКИ
GASTEROSTEUS ACULEATUS (PISCES)

ТРАНСКРИПТОМНЫЕ И МЕТАБОЛОМНЫЕ РЕАКЦИИ

ЭТИНИЛЭСТРАДИОЛ


Доп.точки доступа:
Katsiadaki, Ioanna; Williams, Tim D.; Ball, Jonathan S.; Bean, Tim P.; Sanders, Matthew B.; Wu, Huifeng; Santos, Eduarda M.; Brown, Margaret M.; Baker, Paul; Ortega, Fernando


8.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI40) 14.09-04М7.51

   

    Внутриопухолевая морфологическая гетерогенность рака молочной железы как привлекательная модель для применения высокопроизводительных геномных и транскриптомных технологий, изучения филогении опухоли и поиска маркеров заболевания [Текст] / Е. В. Денисов [и др.] // Тезисы Международной конференции "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", Новосибирск, 21-25 июля, 2013. - Б.м., 2013. - С. 76 . - ISBN 978-5-9904865-1-5
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.03.49.43.25.19
Рубрики: РАК МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
ВНУТРИОПУХОЛЕВАЯ ГЕТЕРОГЕННОСТЬ

МОРФОЛОГИЯ

ОПУХОЛЕВЫЕ МАРКЕРЫ

ТРАНСКРИПТОМНЫЕ

ЧЕЛОВЕК


Доп.точки доступа:
Денисов, Е.В.; Геращенко, Т.С.; Завьялова, М.В.; Литвяков, Н.В.; Вторушин, С.В.; Перельмутер, В.М.; Чердынцева, Н.В.


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 16.07-04И4.161

    Logan, Cheryl A.

    Transcriptomic responses to environmental temperature in eurythermal and stenothermal fishes [Text] / Cheryl A. Logan, Bradley A. Buckley // J. Exp. Biol. - 2015. - Vol. 218, N 12. - P1915-1924 . - ISSN 0022-0949
Перевод заглавия: Транскриптомные реакции на окружающую температуру у эвритермных и стенотермных рыб
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.33.33.25.09
Рубрики: РЫБЫ
ТРАНСКРИПТОМНЫЕ РЕАКЦИИ

ОКРУЖАЮЩАЯ ТЕМПЕРАТУРА

ЭВРИТЕРМНОСТЬ

СТЕНОТЕРМНОСТЬ


Доп.точки доступа:
Buckley, Bradley A.


 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)