Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ПРОМОТОР PU<.>)
Общее количество найденных документов : 5
Показаны документы с 1 по 5
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.04-04Б2.142

   

    Single amino acids changes in the signal receptor domain of XylR resulted in mutants that stimulate transcription in the absence of effectors [Text] / Asuncion Delgado [et al.] // J. Biol. Chem. - 1995. - Vol. 270, N 10. - P5144-5150 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Единичные аминокислотные замены в сигнальном домене рецептора XylR приводят [к появлению] мутантов, которые стимулируют транскрипцию в отсутствие эффекторов
Аннотация: Pseudomonas putida, несущая плазмиду TOL способна расти на толуоле за счет его окисления по 2 путям. При реализации одного из них белок XylR активируется эффекторами и стимулирует транскрипцию с промотора Pu оперона верхнего пути и промотора Ps гена xylS. С помощью мутагенеза N'-метил-N'-нитро-N-нитрозогуанидином выделили 2 клона с аллелями xylR, кодирующими регуляторы XylRD135N и XylRP85S, способные стимулировать транскрипцию без эффекторов. Они содержат замены Asp[135]'-'Asn и Pro[85]'-'Ser соотв. в N-домене, к-рый вероятно участвует в узнавании эффекторов. Высокий базальный уровень транскрипции с промотора Pu, опосредованный обоими мутантными белками, еще более увеличивается в присутствии o- и p-нитротолуола, подобный эффект у промотора Ps отсутствует. У XylRP85S профиль узнаваемых эффектов совпадает с белком дикого типа, а XylRD135N узнает в кач-ве эффектора также и m-нитротолуол (у XylR дикого типа - ингибитор). Транскрипция с промотора Pu, активируемая белком XylR и его мутантными вариантами, нуждается в сохранении 3 белков промотора - сайта связывания 'сигма'{54} -12/-24, сайта IHF -40/-70 и UAS -120/-180. Присутствие фактора 'сигма'{54} обязательно и для активации промотора Pu мутантами. Обсуждают связь конформационных изменений с появлением у мутантов независимости от эффекторов. Испания, Estacion Exptl Zaidin, E-18008 Granada. Библ. 41
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ

РЕЦЕПТОРЫ

РЕЦЕПТОР XYLR

СИГНАЛЬНЫЙ ДОМЕН

АКТИВАТОРНЫЕ ФУНКЦИИ

ЕДИНИЧНЫЕ МУТАЦИИ

ОТСУТСТВИЕ ЗАВИСИМОСТИ ОТ ЭФФЕКТОРОВ

ТОЛУОЛ

УТИЛИЗАЦИЯ

ПРОМОТОР PU

ПЛАЗМИДА TOL

PSEUDOMONAS PUTIDA


Доп.точки доступа:
Delgado, Asuncion; Salto, Rafael; Marques, Silvia; Ramos, Juan L.


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.02-04Б2.103

    Perez-Martin, Jose.

    VTR expression cassettes for engineering conditional phenotypes in Pseudomonas: Activity of the Pu promoter of the TOL plasmid under limiting concentrations of the Xy1R activator protein [Text] / Jose Perez-Martin, Lorenzo Victor De // Gene. - 1996. - Vol. 172, N 1. - P81-86 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Кассеты экспрессии VTR для создания условного фенотипа у Pseudomonas: активность промотора Pu плазмиды TOL в условиях ограниченной концентрации активаторного белка XylR
Аннотация: Разработан метод конструирования штаммов Pseudomonas putida и родственных бактерий, к-рые транскрибируют специфические гены, встроенные в их хромосому в ответ на индуктор lac-оперона (ИПТГ). Метод основан на использовании т. н. кассет экспрессии VTR. VTR - это 3 небольших NotI-фрагмента ДНК (1,98 т. п. н.), к-рые включают ген lacI{q} и гибридный trp/lac-промотор Ptrc, к-рые обеспечивают оптим. инициацию трансляции с расположенного следом ATG-кодона и содержат полилинкер в 3 рамках считывания. Метод позволяет встраивать в хромосому условно экспрессируемые гены с помощью переноса с использованием векторов на основе мини-транспозона Tn5. Систему использовали для изучения влияния внутриклеточной конц-ии регулятора TOL-плазмиды pWWO-XylR на экспоненциальное подавление промотора оперона Pu. Повышение конц-ии XylR приводило к более интенсивной индукции оперона, однако в условиях быстрого роста клеток промотор Pu был неактивен независимо от конц-ии XylR. Испания, Ctr. Nac. Biotecnol., CSIC, Campus de Cantoblanco, 28049 Madrid. Библ. 22
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
КОНСТРУИРОВАНИЕ ШТАММОВ

МЕТОДЫ

КАССЕТЫ ЭКСПРЕССИИ

VTR-КАССЕТЫ

ПЛАЗМИДА TOL

ПРОМОТОР PU

АКТИВНОСТЬ

БЕЛОК-АКТИВАТОР XYLR

СОДЕРЖАНИЕ


Доп.точки доступа:
De, Lorenzo Victor


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.252

    Perez-Martin, Jose.

    Coactivation in vitro of the 'сигма'{54}-dependent promoter Pu of the TOL plasmid of Pseudomonas putida by HU and the mammalian HMG-1 protein [Text] / Jose Perez-Martin, Lorenzo Victor de // J. Bacteriol. - 1997. - Vol. 179, N 8. - P2757-2760 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Коактивация in vitro зависящего от 'сигма'{54} промотора Pu плазмиды TOL Pseudomonas putida белком HU и белком HMG-1 млекопитающих
Аннотация: Изучен механизм, позволяющий гистоноподобному белку HU (I) заменять хозяйский фактор интеграции IHF (II) в коактивации 'сигма'{54}-зависимого промотора Pu плазмиды TOL у Pseudomonas putida. С использованием предактивированной формы белка-коактиватора XylR показано, что функциональная замена II на I, обнаруженная in vivo, может быть воспроизведена in vitro с очищенными белками. Более того, II можно заменить негистоновый белок HMG-1 млекопитающих или характеристический изгиб ДНК. По-видимому 2 разных механизма (образование сайт-специфического статического изгиба ДНК или общее увеличение гибкости промоторной области) вызывают один и тот же структурный эффект в стимуляции транскрипции с промотора Pu. Испания, Centro Nacional de Biotechnol., Campus de Cantoblanco, 28049 Madrid. Библ. 41
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ПРОМОТОР PU

'СИГМА'{54}-ЗАВИСИМЫЙ

КОАКТИВАЦИЯ

БЕЛОК

ГИСТОНОПОДОБНЫЙ HU

ЗАМЕНА ХОЗЯЙСКОГО ФАКТОРА ИНТЕГРАЦИИ

ПЛАЗМИДЫ

ПЛАЗМИДА TOL

PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)


Доп.точки доступа:
de, Lorenzo Victor


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.07-04Б2.231

    Cases, Ildefonso.

    The IIA{Ntr} (PtsN) protein of Pseudomonas putida mediates the C source inhibition of the 'сигма'{54}-dependent Pu promoter of the TOL plasmid [Text] / Ildefonso Cases, Jose Perez-Martin, Lorenzo Victor de // J. Biol. Chem. - 1999. - Vol. 274, N 22. - P15562-15568 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Белок IIA{Ntr} (PtsN) Pseudomonas putida опосредует ингибирование источником С зависящего от 'сигма'{54} промотора Pu плазмиды TOL
Аннотация: Изучено влияние кластера генов, смежного с геном rpoN фактора 'сигма'{54} Pseudomonas putida, на регуляцию источниками С промотора Pu верхнего оперона плазмиды TOL, участвующего в катаболизме толуола. Эта область содержит 4 гена, 2 из которых (ptsN и ptsO) кодируют белки, похожие на компоненты фосфоенолпируват:сахарфосфотрансферазной системы. Сконструированы разрушения этих генов неполярной вставкой и изучено влияние мутаций на экспрессию репортерского гена с промотора Pu. Разрушения генов ORF102, ORF284 и ptsO не вызывают заметного фенотипа. Разрушение гена ptsN, кодирующего белок IIA{Ntr} (PtsN), устраняет чувствительность промотора Pu к репрессии глюкозой, но не влияет на скорости потребления глюкозы и глюконата. Замена H68D в консервативном фосфоакцепторном сайте IIA{Ntr} приводит к нечувствительности Pu к присутствию или отсутствию глюкозы. Эти данные подтвердили существование пути корегуляции некоторых зависящих от 'сигма'{54} промоторов, в котором ключевую роль играет белок IIA{Ntr}. Испания, Ctr. Nac. Biotecnol., CSIC, Madrid 28049. Библ. 54
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПРОМОТОРЫ
ПРОМОТОР PU

ЗАВИСЯЩИЙ ОТ 'СИГМА'{54}

РЕГУЛЯЦИЯ

ГЛЮКОЗА

БЕЛОК PTSN

PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)


Доп.точки доступа:
Perez-Martin, Jose; de, Lorenzo Victor


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.02-04Б2.312

    Carmona, Manuel.

    Recruitment of RNA polymerase is a rate-limiting step for the activation of the 'сигма'{54} promoter Pu of Pseudomonas putida [Text] / Manuel Carmona, Lorenzo Victor de, Giovanni Betoni // J. Biol. Chem. - 1999. - Vol. 274, N 47. - P33790-33794 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Вербовка РНК-полимеразы является лимитирующей скорость стадией активации зависящего от 'сигма'{54} промотора Pu Pseudomonas putida
Аннотация: Активность зависящего от 'сигма'{54} (I) промотора Pu Pseudomonas putida изучена in vitro с матрицей ДНК, не имеющей 5'-активаторных последовательностей. В этом случае РНК-полимераза (II) может активироваться связывающимся с энхансером белком XylR (III) только из раствора. Хотя в этой системе отсутствует путь активации транскрипции за счет выпетливания ДНК хозяйским фактором IHF (IV), он стимулирует активность промотора. Позитивный эффект IV наблюдается не только с III из раствора, но и с другими зависящими от I активаторами (NtrC и NifA). Стимуляцию транскрипции вызывает также белок HU (V), неспецифически связывающийся с ДНК. Стимуляция транскрипции в отсутствие энхансера обусловлена вербовкой I, т. е. повышением эффективности образования закрытого комплекса, вызванной связыванием IV или V. Таким образом, при лимитирующих конц-иях II опосредованное факторами связывание II с Pu вводит в систему кинетич. контрольную точку, предотвращающую опосредованное III образование открытого комплекса. Испания, Dep. Microbial Biotechnol., Ctr. Nac. Biotechnol., CSIC, Cantoblanco, 28049 Madrid. Библ. 34
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПРОМОТОРЫ
ПРОМОТОР PU

СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ

АКТИВАЦИЯ

ЛИМИТИРУЮЩАЯ СТАДИЯ

РНК-ПОЛИМЕРАЗА

СВЯЗЫВАНИЕ

PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)


Доп.точки доступа:
de, Lorenzo Victor; Betoni, Giovanni


 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)