СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ОШИБОЧНОЕ ВКЛЮЧЕНИЕ<.>)

Общее количество найденных документов : 4
Показаны документы с 1 по 4

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.226

Kubori, Tomoko.
Physical interference between Escherichia coli RNA polymerase molecules transcribing in tandem enhances abortive synthesis and misincorporation [Text] / Tomoko Kubori, Nobuo Shimamoto // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 13. - P2640-2647 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Физическая интерференция между молекулами РНК-полимеразы Escherichia coli, транскрибирующими тандемно, усиливает абортивный синтез и ошибочное включение
Аннотация: Инициация транскрипции сопровождается итеративным синтезом и освобождением коротких транскриптов. Найдено, что молярное отношение количеств РНК-полимеразы Escherichia coli (I) и матрицы критично для количества и распределения абортивных продуктов, синтезированных I на нескольких промоторах. При высоком отношении абортивный синтез транскриптов длиной 4-8 н. усиливается на промоторе 'лямбда'P[R]. Удаление излишка I непосредственно перед инициацией с помощью промывки иммобилизированных транскриптов уменьшает этот эффект. При высоком отношении усиливается синтез неожиданного транскрипта длиной 6 н. (II), когда I задерживается в положении +32, но не в положении +73. II содержит ошибочно включенные основания в положениях 5 и 6, вероятно, вызванные проскальзыванием. Футпринтинг радикалами OH{.} комплекса I, задержанного в положении +32, в присутствии I показал, что несколько молекул I тандемно связано с одной и той же матрицей ДНК. Эти данные позволяют предположить, что: 1) когда молекулы I тандемно транскрибируют одну и ту же ДНК, преходящие столкновения усиливают абортивный синтез отстающей молекулой I; 2) когда передняя молекула I, задерживаясь в начале транскрибируемой области, блокирует движение следующей молекулы I, последняя может вызывать ошибочное включение в результате синтеза с проскальзыванием. Япония, Structural Biol. Center, Nat. Inst. of Genetics, Mishima Shizuoka 411. Библ. 41

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ЭЛОНГАЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РНК-ПОЛИМЕРАЗА
ТАНДЕМНАЯ ТРАНСКРИПЦИЯ
ФИЗИЧЕСКАЯ ИНТЕРФЕРЕНЦИЯ
АБОРТИВНЫЙ СИНТЕЗ
ОШИБОЧНОЕ ВКЛЮЧЕНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Shimamoto, Nobuo

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.03-04Б2.232

Huang, Jianbin.
Misincorporation by wild-type and mutant T7 RNA polymerases: Identification of interactions thar reduce misincorporation rates by stabilizing the catalytically incompetent open conformation [Text] / Jianbin Huang, Luis G. Brieba, Rui Sousa // Biochemistry. - 2000. - Vol. 39, N 38. - P11571-11580 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Ошибочное включение нормальной и мутантными РНК-полимеразами фага Т7: идентификация взаимодействий, понижающих частоту ошибочного включения за счет стабилизации каталитически некомпетентной открытой конформации
Аннотация: РНК-полимераза (I) фага Т7 проявляет сильную селекцию против включения неправильных нуклеотидов и имеет среднюю частоту ошибок 5*10{-5}. РНК с ошибочным основанием на 3'-конце элонгируется гораздо медленнее, чем РНК с правильно спаренным с матрицей 3'-концом. Даже ошибочные пары, находящиеся на расстоянии 1-2 н. от 3'-конца РНК, замедляют элонгацию при правильно спаренном основании на 3'-конце. В элонгирующих комплексах I не обнаружена эндогенная (3''-'5')-экзонуклеазная активность. Пирофосфоролиз также не вносит вклад в коррекцию ошибок включения. Таким образом точность I фага Т7, в отличие от других I, зависит только от дискриминации против включения ошибочного нуклеотида, а не от коррекции после неправильного включения. Изучены также св-ва 45 точечных мутантов I фага Т7. Замена Н784А, затрагивающая остаток I, контактирующий с 3'-парой оснований РНК-матрица, усиливает ошибочное включение и элонгацию ошибочных пар, а замены остатков G640, F644 и G645 увеличивают только ошибочное включение. Последние 3 остатка I взаимодействуют с матричным основанием ДНК и с соседним 5'-основанием. Мутации этих остатков I устраняют также паузы во время освобождения промотора. С использованием кристаллич. структуры транскрибирующего комплекса I показано, что эти мутации ограничивают скорость ошибочного включения, стабилизируя каталитически некомпетентную конформацию I. США, Dep. Biochem., Univ. Texas Hlth. Scio. Ctr., San Antonio, TX 78284-7760. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ T7
СИНТЕЗ
ФЕРМЕНТЫ
РНК-ПОЛИМЕРАЗА ФАГА T7
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
НЕПРАВИЛЬНЫЕ НУКЛЕОТИДЫ
ОШИБОЧНОЕ ВКЛЮЧЕНИЕ
ПОНИЖЕНИЕ
ОТКРЫТАЯ КОНФОРМАЦИЯ
СТАБИЛИЗАЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Brieba, Luis G.; Sousa, Rui

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 14.11-04Б4.93

Reversion of a fungal genetic code alteration links proteome instability with genomic and phenotypic diversification [Text] / Ana R. Bezerra [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2013. - Vol. 110, N 27. - P11079-11084 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Реверсия изменения генетического кода грибов сопрягает нестабильность протеома с геномным и фенотипическим разнообразием

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.09
Рубрики: РНК ТРАНСПОРТНАЯ
CUG-САЙТЫ
ОСТАТОК LEU
ОШИБОЧНОЕ ВКЛЮЧЕНИЕ
КОДОНЫ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
CANDIDA ALBICANS (FUNGI)

Доп.точки доступа:
Bezerra, Ana R.; Simoes, Joao; Lee, Wanseon; Rung, Johan; Weil, Tobias; Gut, Ivo G.; Gut, Marta; Bayes, Monica; Rizzetto, Lisa; Cavalieri, Duccio; Giovannini, Gliria; Bozza, Silvia

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.337

Ruiz-Rubio, Manuel.
On the possible role of cytosine deamination in delayed photoreversal mutagenesis targeted at thymine-cytosine dimers in E. coli [Text] / Manuel Ruiz-Rubio, Richard Bockrath // Mutat. Res. - 1989. - Vol. 210, N 1. - P93-102 . - ISSN 0027-5107
Перевод заглавия: О возможной роли дезаминирования цитозина в задержанном фотореверсионном мутагенезе с мишенью на тиминцитозиновых димерах у E. coli
Аннотация: Исследована роль дезаминирования Т-С-пар в задержанном фотореверсионном мутагенезе Escherichia coli, рассматриваемом как показатель этапа ошибочного включения нуклеотидов при мишенном мутагенезе. Альтернативная модель дезаминирования предполагает наличие механизма дезаминирования Т-С к Т-U и репликации ДНК через U после фотореактивации. В пользу такой модели могла бы свидетельствовать специфичность образования транзиций С- Т, ведущих к супрессорным мутациям по тРНК{l}{y}, в сайтах, где мишенями мутагенеза служат димера Т-С. Получены данные, противоречащие модели дезаминирования. Измерение активности урацил-ДНК-гликозилазы по ограничению эффективности высева фага Т5, содержащего урацил-замещенную ДНК, не выявило изменений, к-рые могли бы свидетельствовать о возможности мутаций по U в ДНК. Кроме того, кинетика задержанного фотореверсионного мутагенеза не изменялась в случае, если УФ-облученные клетки выдерживали 2 ч в буфере при 41'ГРАДУС', т. е. в условиях, ведущих к дезаминированию Т-С с образованием Т-U. При использовании двойных мутантов umuDC ung, дефектных по SOS-мутагенезу и урацил-ДНК-гликозилазе, выявлено, что объем дезаминирования Т-С, достаточный для появления пар T-U в критическом сайте мутации, существенно больше, чем частота мутагенеза, связанного с задержанной фотореактивацией. Расчеты показывают, что модель дезаминирования была бы реальной, если бы имелся оптимальный интервал времени в 30-130 мин после УФ-облучения для эффективного восстановления репликации ДНК после фотореактивации. Отмечается, что полученные данные, хотя и свидетельствуют против модели дезаминирования, однако не служат в пользу модели ошибочного включения. Ил. 4. Табл. 2. Библ. 33. США, Indiana Univ. School of Medicine, Indianapolis, IN 46223.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.09
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
МУТАГЕНЕЗ САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКИЙ
МИШЕНИ Т-Ц-ПАРЫ
ТИМИН
ДЕЗАМИНИРОВАНИЕ
РОЛЬ В
НУКЛЕОТИДЫ
ОШИБОЧНОЕ ВКЛЮЧЕНИЕ
ФОТОРЕАКТИВАЦИЯ
РЕПЛИКАЦИЯ
ФОТОРЕВЕРСИОННЫЙ МУТАГЕНЕЗ

Доп.точки доступа:
Bockrath, Richard

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска