СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ГЕНОМНЫЙ ОСТРОВ<.>)

Общее количество найденных документов : 8
Показаны документы с 1 по 8

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.06-04Б2.206

Dynamic analysis of a genomic island in Magnetospirillum sp. strain AMB-1 reveals how magnetosome synthesis developed [Text] / Yorikane Fukuda [et al.] // FEBS Lett. - 2006. - Vol. 580, N 3. - P801-812 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Динамический анализ геномного острова в Magnetospirillum sp. штамм AMB-1 выявил, как происходит синтез магнетосомы
Аннотация: В впервые описали структуру 96 т. п. н. района генома Magnetospirillum sp. штамм AMB-1, имеющего большое число генов синтеза магнетосомы. С помощью ПЦР-амплификации определили делецию этого района и кольцевой формы после эксцизии их хромосомы, что позволило выдвинуть предположение, что этот район подвергается латеральному переносу. Район имеет свойства геномного острова: низкое содержание ГЦ, локализация между двумя повторами и присутствие интегразы во фланкирующем районе первого повтора. Сравнительный геномный анализ выявил другие районы с высокой концентрацией ортологов в магнитных бактериях. Для синтеза магнетосомы, видимо, необходим не только данный район, но и другие ортологи, а также индивидуальные гены. Япония, Dep. of Biotechnology, Tokyo Univ. of Agriculture and Technoloty, 2-24-16 Koganei, Tokyo 1848588

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ОРГАНЕЛЛЫ
МАГНЕТОСОМА
БИОСИНТЕЗ
ГЕНЫ
ГЕНЫ БИОСИНТЕЗА МАГНЕТОСОМЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ЛАТЕРАЛЬНЫЙ ПЕРЕНОС
ГЕНОМНЫЙ ОСТРОВ
MAGNETOSPIRILLUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Fukuda, Yorikane; Okumura, Yoshiko; Takeyama, Haruko; Matsunaga, Tadashi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.03-04Б2.96

Spontaneous excision of the Salmonella enterica serovar enteritidis-species defective prophage-like element 'фи'SE14 [Text] / Carlos A. Santiviago [et al.] // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 8. - P2246-2254 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Спонтанное вырезание специфичного для Salmonella enterica серовар enteritidis дефектного профагоподобного элемента 'фи'SE14
Аннотация: Для выявления участков генома, специфичных для Salmonella enterica серовар enteritidis, было проведено биоинформатическое исследование, и путем сравнения последовательностей геномов 16 штаммов обнаружен геномный остров (GEI) размером 12.5 т.п.н. Этот GEI встроен в 5'-конец гена ydaO, фланкирован дефектными прямыми повторами attR и attL и содержит 21 ген, кодирующий белки, характерные для бактериофага. В геноме эталонного штамма NTCT13349 он рассматривается как дефектный бактериофаг SE14. Его генетическая структура и локализация консервативны в 99 из 103 изученных штаммов S. enteritidis, включая штаммы сравнения NTCT 13349 и LK5. В каждом штамме, несущем данный GEI, обнаружена внехромосомная циркулярная форма 'фи'SE14. Удалось обнаружить спонтанное вырезание 'фи'SE14, меченного кассетой Tet{R}. Так как 'фи'SE14 является нестабильным генетическим элементом, способным спонтанно вырезаться из хромосомы при обычном росте культуры. Обнаруженная нестабильность этого GEI ставит под сомнение возможность такого использования. Чили, Dep. de Bioquim. y Biol. Mol., Fac. de Ciencias Quim. y Farmac., Univ. de Chile, P.O. Box 174, Correo 22, Santiago. Библ. 53

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: ГЕНОМНЫЙ ОСТРОВ
CEI
СТРУКТУРА
МАРКЕРЫ
ПРОФАГОПОДОБНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
ВНЕХРОМАСОМНЫЕ 'РАДИКАЛ'SE14
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЭЛЕМЕНТЫ
СПОНТАННОЕ ВЫРЕЗАНИЕ
НЕСТАБИЛЬНОСТЬ
SALMONELLA ENTERICA (BACT.)
СЕРОВАР ENTERITIDIS

Доп.точки доступа:
Santiviago, Carlos A.; Blondel, Carlos J.; Quezada, Carolina P.; Silva, Cecilia A.; Tobar, Pia M.; Porwollik, Steffen; McClelland, Michael; Andrews-Polymenis, Helene L.; Toro, Cecilia S.; Zaldivar, Mercedes; Contreras, Ines

РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 11.03-04Б4.42

Spontaneous excision of the Salmonella enterica serovar enteritidis-species defective prophage-like element 'фи'SE14 [Text] / Carlos A. Santiviago [et al.] // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 8. - P2246-2254 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Спонтанное вырезание специфичного для Salmonella enterica серовар enteritidis дефектного профагоподобного элемента 'фи'SE14
Аннотация: Для выявления участков генома, специфичных для Salmonella enterica серовар enteritidis, было проведено биоинформатическое исследование, и путем сравнения последовательностей геномов 16 штаммов обнаружен геномный остров (GEI) размером 12.5 т.п.н. Этот GEI встроен в 5'-конец гена ydaO, фланкирован дефектными прямыми повторами attR и attL и содержит 21 ген, кодирующий белки, характерные для бактериофага. В геноме эталонного штамма NTCT13349 он рассматривается как дефектный бактериофаг SE14. Его генетическая структура и локализация консервативны в 99 из 103 изученных штаммов S. enteritidis, включая штаммы сравнения NTCT 13349 и LK5. В каждом штамме, несущем данный GEI, обнаружена внехромосомная циркулярная форма 'фи'SE14. Удалось обнаружить спонтанное вырезание 'фи'SE14, меченного кассетой Tet{R}. Так как 'фи'SE14 является нестабильным генетическим элементом, способным спонтанно вырезаться из хромосомы при обычном росте культуры. Обнаруженная нестабильность этого GEI ставит под сомнение возможность такого использования. Чили, Dep. de Bioquim. y Biol. Mol., Fac. de Ciencias Quim. y Farmac., Univ. de Chile, P.O. Box 174, Correo 22, Santiago. Библ. 53

ГРНТИ	76.03.43

ВИНИТИ 761.03.43.05.11
Рубрики: ГЕНОМНЫЙ ОСТРОВ
CEI
СТРУКТУРА
МАРКЕРЫ
ПРОФАГОПОДОБНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
ВНЕХРОМАСОМНЫЕ 'РАДИКАЛ'SE14
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЭЛЕМЕНТЫ
СПОНТАННОЕ ВЫРЕЗАНИЕ
НЕСТАБИЛЬНОСТЬ
SALMONELLA ENTERICA (BACT.)
СЕРОВАР ENTERITIDIS

Доп.точки доступа:
Santiviago, Carlos A.; Blondel, Carlos J.; Quezada, Carolina P.; Silva, Cecilia A.; Tobar, Pia M.; Porwollik, Steffen; McClelland, Michael; Andrews-Polymenis, Helene L.; Toro, Cecilia S.; Zaldivar, Mercedes; Contreras, Ines

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 12.01-04Б2.178

Genomic island TnSmu2 of Streptococcus mutans harbors a nonribosomal peptide synthetase-polyketide synthase gene cluster responsible for the biosynthesis of pigments involved in oxygen and H[2]O[2] tolerance [Text] / Chenggang Wu [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2010. - Vol. 76, N 17. - P5815-5826 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Геномный острoв TnSmu2 Streptococcus mutans несет генный кластер нерибосомной пептидсинтетазы-поликетидсинтазы, ответственный за биосинтез пигментов, причастный к толерантности к кислороду и H[2]O[2]
Аннотация: Микробное сообщество ротовой полости включает более 800 видов микробов, среди который особую роль в возникновении кариеса играет Streptococcus mutans. Геномный остров TnSmu2 Streptococcus mutans составляет более 2% генома. Показал, что TnSmu2 несет генный кластер, кодирующий нерибосомную пептидсинтетазы (NRPS), поликетидсинтазу и (PKS) сопутствующие белки и регуляторы. Последовательности этих генов и их геномная организация сильно отличаются среди различных штаммов S. mutans, но каждый TnSmu2 кодирует NRPS/PKS и белки. Изучение мутагенеза и регуляции генов в штаммах UA159, UA140 и NE4653 выявил оизменение пигментации, задержку роста при аэробных условиях и в присутствии Н[2]O[2]. Устанвоили, что TnSmu2 преобладает среди 95 клинич. изолятов S. mutans. США, College of Dentistry, The Univ.of Oklahoma City, Oklahoma 73104

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: STREPROCOCCUS MUTANS (BACT.)
ВОЗБУДИТЕЛЬ КАРИЕСА
ГЕНОМНЫЙ ОСТРОВ
TNSMU2
КОДИРОВАНИЕ
ГЕНЫ НЕРИБОСОМНОЙ ПЕПТИДСИНТЕТАЗЫ ФУНКЦИИ
ПИГМЕНТАЦИЯ
ТОЛЕРАНТНОСТЬ
КИСЛОРОД
H[2]O[2]

Доп.точки доступа:
Wu, Chenggang; Cichewicz, Robert; Li, Yihong; Liu, Jinman; Roe, Bruce; Ferretti, Joseph; Merritt, Justin; Qi, Fengxia

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 12.01-04Б4.178

Genomic island TnSmu2 of Streptococcus mutans harbors a nonribosomal peptide synthetase-polyketide synthase gene cluster responsible for the biosynthesis of pigments involved in oxygen and H[2]O[2] tolerance [Text] / Chenggang Wu [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2010. - Vol. 76, N 17. - P5815-5826 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Геномный острoв TnSmu2 Streptococcus mutans несет генный кластер нерибосомной пептидсинтетазы-поликетидсинтазы, ответственный за биосинтез пигментов, причастный к толерантности к кислороду и H[2]O[2]
Аннотация: Микробное сообщество ротовой полости включает более 800 видов микробов, среди который особую роль в возникновении кариеса играет Streptococcus mutans. Геномный остров TnSmu2 Streptococcus mutans составляет более 2% генома. Показал, что TnSmu2 несет генный кластер, кодирующий нерибосомную пептидсинтетазы (NRPS), поликетидсинтазу и (PKS) сопутствующие белки и регуляторы. Последовательности этих генов и их геномная организация сильно отличаются среди различных штаммов S. mutans, но каждый TnSmu2 кодирует NRPS/PKS и белки. Изучение мутагенеза и регуляции генов в штаммах UA159, UA140 и NE4653 выявил об изменение пигментации, задержку роста при аэробных условиях и в присутствии Н[2]O[2]. Установили, что TnSmu2 преобладает среди 95 клинич. изолятов S. mutans. США, College of Dentistry, The Univ.of Oklahoma City, Oklahoma 73104

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.19.11
Рубрики: STREPTOCOCCUS MUTANS (BACT.)
ВОЗБУДИТЕЛЬ КАРИЕСА
ГЕНОМНЫЙ ОСТРОВ
TNSMU2
КОДИРОВАНИЕ
ГЕНЫ НЕРИБОСОМНОЙ ПЕПТИДСИНТЕТАЗЫ ФУНКЦИИ
ПИГМЕНТАЦИЯ
ТОЛЕРАНТНОСТЬ
КИСЛОРОД
H[2]O[2]

Доп.точки доступа:
Wu, Chenggang; Cichewicz, Robert; Li, Yihong; Liu, Jinman; Roe, Bruce; Ferretti, Joseph; Merritt, Justin; Qi, Fengxia

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 12.03-04Б4.225

A unique arabinose 5-phosphate isomerase found within a genomic island associated with the uropathogenicity of Escherichia coli CFT073 [Text] / Joshua A. Mosberg [et al.] // J. Bacteriol. - 2011. - Vol. 193, N 12. - P2981-2988 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Уникальная арабинозо-5-фосфат-изомераза, обнаруженная в пределах геномного острова, связанного с уропатогенностью, у Escherichia coli CFT073
Аннотация: У уропатогенной Escherichia coli CFT073 геномный остров PaI-metV необходим для успешной колонизации этим штаммом почек мышей. Делеция генов с3405-с3410 из этого острова приводит к тому, что мутантный штамм не может конкурировать со штаммом CFT073 дикого типа при одновременном трансуретральном введении в мышей, и не может независимо колонизировать почки мышей. Анализ генов с3405-с3410 показал, что они составляют оперон, участвующий в поглощении и утилизации неизвестного углевода. Этот оперон отсутствует у E. coli K12, но обнаружен у нек-рых патогенных штаммов E. coli и Shigella boydii. Оказалось, что ген с3406 кодирует белок, гомологичный изомеразному домену арабинозо-5-фосфат-изомеразы, но последовательность, кодирующая тандемные цистатионин-бета-синтазные домены, характерные для арабинозо-5-фосфат-изомераз E. coli, в этом гене не обнаружена. США (Woodard R.W.) Dep. of Med. Chem., Univ. of Michigan, Ann Arbor, MI 48109-1065. Библ. 26

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.25.11
Рубрики: АРАБИНОЗО-5-ФОСФАТ-ИЗОМЕРАЗА
ОБНАРУЖЕНИЕ
ГЕНОМНЫЙ ОСТРОВ
PA1-METV
ГЕН С3406
ФУНКЦИИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
УРОПАТОГЕННЫЙ ШТАММ
КОЛОНИЗАЦИЯ
ПОЧКИ МЫШЕЙ

Доп.точки доступа:
Mosberg, Joshua A.; Yep, Alejandra; Meredith, Timothy C.; Smith, Sara; Wang, Pan-Fen; Holler, Tod P.; Mobley, Harry L.T.; Woodard, Ronald W.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 12.04-04Б4.156

ClbP is a prototype of a peptidase subgroup involved in biosynthesis of nonribosomal peptides [Text] / Damien Dubois [et al.] // J. Biol. Chem. - 2011. - Vol. 286, N 41. - P35562-35570 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: ClbP-прототип пептидазной подгруппы участвует в биосинтезе нерибосомных пептидов
Аннотация: Геномный остров pks Escherichia coli кодирует синтазы поликетидного (РК) и нерибосомного пептида (NRP), участвующие в сборке гибридного колибактина, индуцирующего двунитевые разрывы ДНК в эукариотических клетках. В механизме, кодируемом pks, задействован атипичный белок ClbP. При изучении его кристаллической структуры выявили серин-активный сайт и оригинальные структурные свойства, совместимые с пептидазной активностью, обнаруженной при биохимических исследованиях. Идентифицировали in silico 10 гомологов ClbP в геномных островах NTP родственных бактериальных видов. Все протестированные гомологи комплементировали clbP-дефектный мутант E. coli. Следовательно, ClbP-прототип нового подсемейства экстрацитоплазматических пептидаз, участвующих в созревании NRP. Франция, Laboratoire de Bacteriologie Cliniaue, Centre Hospitalier de Clermont-Ferrand, Clermont-Ferand F-63003

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.21.07.99
Рубрики: ГЕНОМНЫЙ ОСТРОВ
РКS
КОДИРОВАНИЕ СИНТЕЗА ПОЛИКЕТИДНОГО РК
БЕЛОК
АТИПИЧНЫЙ
СLBP
ГОМОЛОГИ
ПЕПТИДАЗЫ
НЕРИБОСОМНЫЙ ПЕПТИД NRP
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Dubois, Damien; Baron, Olivier; Cougnoux, Antony; Delmas, Julien; Pradel, Nathalie; Boury, Michele; Bouchon, Bernadette; Bringer, Marie-Agnes; Nougayrede, Jean-Philippe; Oswald, Eric; Bonnet, Richard

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.03-04Б2.145

Identification of a perchlorate reduction genomic island with novel regulatory and metabolic genes [Text] / Ryan A. Melnyk [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2011. - Vol. 77, N 20. - P7401-7404 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Идентификация геномного острова редукции перхлората с новыми генами регуляции и метаболизма
Аннотация: Провели сравнительный анализ геномов четырех диссимиляционных перхлорат-редуцирующих бактерий и выявили геномный остров, ассоциированный с редукцией перхлората. Помимо охарактеризованных генов метаболизма для перхлорат-редуктазы и хлориддисмутазы, остров содержит множественные не охарактеризованные консервативные гены, возможно, участвующие в транспорте электронов и регуляции. США, Dep. of Plant and Microbial Biology, Univ. of California, Berkeley, Berkeley, California

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМ
ДИССИМИЛЯЦИОННЫЕ ПЕРХЛОРАТ-РЕДУЦИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ
ГЕНОМНЫЙ ОСТРОВ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ГЕНЫ ПЕРХЛОРАТА
ГЕНЫ МЕТАБОЛИЗМА ХЛОРИДДИСМУТАЗА
ГЕНЫ ТРАНСПОРТА ЭЛЕКТРОНОВ
ГЕНЫ РЕГУЛЯЦИИ

Доп.точки доступа:
Melnyk, Ryan A.; Engelbkrektson, Anna; Clark, Iain C.; Carlson, Hans K.; Byrne-Bailey, Kathy; Coates, John D.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска