Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ<.>)
Общее количество найденных документов : 56
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-56 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.04-04Б2.147

   
    Responses to nutrient starvation in Pseudomonas putida KT2442: Analysis of general cross-protection, cell shape, and macromolecular content [Text] / Michael Givskov [et al.] // J. Bacteriol. - 1994. - Vol. 176, N 1. - P7-14 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Реакции на голодание по питательным веществам у Pseudomonas putida KT2442: анализ общей перекрестной защиты, формы клеток, содержания макромолекул
Аннотация: Исследована физиология Pseudomonas putida КТ 2442 в отношении роста и голодания по углероду. Во время перехода от роста к его прекращению клетки меняют форму от цилиндрической до сферической; изменения сопровождаются сокращением размера клеток, содержания ДНК, рибосом и синтеза белка. Развивается картина общей перекрестной защиты, позволяющей клеткам переживать стрессы окружающей среды (высокую и низкую т-ру, высокую осмолярность, действие растворителей, окисляющих агентов). Культуры почти полностью жизнеспособны в течение 1 месяца голодания (по С, N, многим параметрам) и считается, что они находятся в активном бодрствующем состоянии. Напротив, шт. КТ2442 не выживает в условиях голодания по сульфату и фосфату. Дания, Dep. Microbiol., Techn. Univ. Denmark, DK-2800 Lyngby. Библ. 34.
ГРНТИ  
34.27.19
ВИНИТИ 341.27.19.13.07
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ШТАММ КТ 2442
ГОЛОДАНИЕ
ГОЛОДАНИЕ ПО ПИТАТЕЛЬНЫМ ВЕЩЕСТВАМ
РЕАКЦИИ
ОБЩАЯ СИСТЕМА ЗАЩИТЫ
ФОРМА КЛЕТОК
БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ

Доп.точки доступа:
Givskov, Michael; Eberl, Leo; Mller, Sren; Poulsen, Lars Kongsbak; Molin, Sren
2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 95.06-04Б3.1

   
    Responses to nutrient starvation in Pseudomonas putida KT2442: Analysis of general cross-protection, cell shape, and macromolecular content [Text] / Michael Givskov [et al.] // J. Bacteriol. - 1994. - Vol. 176, N 1. - P7-14 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Реакции на голодание по питательным веществам у Pseudomonas putida KT 2442: анализ общей перекрестной защиты, формы клеток, содержания макромолекул
Аннотация: Исследована физиология Pseudomonas putida KT 2442 в отношении роста и голодания по углероду. Во время перехода от роста к его прекращению клетки меняют форму от цилиндрической до сферической; изменения сопровождаются сокращением размера клеток, содержания ДНК, рибосом и синтеза белка. Развивается картина общей перекрестной защиты, позволяющей клеткам переживать стрессы окружающей среды (высокую и низкую т-ру, высокую осмолярность, действие растворителей, окисляющих агентов). Культуры почти полностью жизнеспособны в течение 1 месяца голодания (по C, N, многим параметрам) и считается, что они находятся в активном бодрствующем состоянии. Напротив, шт. KT 2442 не выживает в условиях голодания по сульфату и фосфату. Дания, Dep. Microbiol., Techn. Univ. Denmark, DK-2800 Lyngby. Библ. 34
ГРНТИ  
34.27.39
ВИНИТИ 341.27.39.02
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA
ШТАММ KT 2442
ГОЛОДАНИЕ ПО ПИТАТЕЛЬНЫМ ВЕЩЕСТВАМ
РЕАКЦИИ
ОБЩАЯ СИСТЕМА ЗАЩИТЫ
ФОРМА КЛЕТОК
БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ

Доп.точки доступа:
Givskov, Michael; Eberl, Leo; Moller, Soren; Poulsen, Lars Kongsbak; Molin, Soren
3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI36) 98.01-04А4.381

   
    New software for the NMR determination of macromolecular structures and dynamics [Text] : abstr. Keystone Symp. Front. NMR Mol. Biol.-IV, Keystone, Colo, Apr. 3-9, 1995 / Martin Billeter [et al.] // J. Cell. Biochem. - 1995. - Sappl 21b. - P68 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Новое обеспечение для определения методом ЯМР структуры и динамики макромолекул
Аннотация: Предложены новые методы анализа спектральных характеристик ЯМР при установлении пространственной структуры и динамических свойств белков и нуклеиновых кислот. Метод XEASY позволяет проводить структурные расчеты, а OPAL - повышать разрешение полученной структуры и проводить исследования методами молекулярной динамики. На примере исследования системы гомеодомен Autp-ДНК-вода продемонстрированы возможности предложенных методов в установлении динамических аспектов взаимодействия белок-ДНК. Швейцария, Inst. Mol. Biophys., ETH-Honggerberg, CH-8093 Zurich
ГРНТИ  
34.49.33
ВИНИТИ 341.49.33.15.17
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
БЕЛОК
ДНК
ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА
ДИНАМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
СПЕКТРАЛЬНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ ЯМР
МЕТОДЫ АНАЛИЗА
КОМПЬЮТЕРНЫЕ ПРОГРАММЫ

Доп.точки доступа:
Billeter, Martin; Bartels, Christian; Guntert, Peter; Luginbuhl, Peter; Wuthrich, Kurt
4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 98.02-04Я6.12

   
    New software for the NMR determination of macromolecular structures and dynamics [Text] : abstr. Keystone Symp. Front. NMR Mol. Biol.-IV, Keystone, Colo, Apr. 3-9, 1995 / Martin Billeter [et al.] // J. Cell. Biochem. - 1995. - Sappl 21b. - P68 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Новое обеспечение для определения методом ЯМР структуры и динамики макромолекул
Аннотация: Предложены новые методы анализа спектральных характеристик ЯМР при установлении пространственной структуры и динамических свойств белков и нуклеиновых кислот. Метод XEASY позволяет проводить структурные расчеты, а OPAL - повышать разрешение полученной структуры и проводить исследования методами молекулярной динамики. На примере исследования системы гомеодомен Autp-ДНК-вода продемонстрированы возможности предложенных методов в установлении динамических аспектов взаимодействия белок-ДНК. Швейцария, Inst. Mol. Biophys., ETH-Honggerberg, CH-8093 Zurich
ГРНТИ  
34.19.05
ВИНИТИ 341.19.05.99
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
БЕЛОК
ДНК
ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА
ДИНАМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
СПЕКТРАЛЬНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ ЯМР
МЕТОДЫ АНАЛИЗА
КОМПЬЮТЕРНЫЕ ПРОГРАММЫ

Доп.точки доступа:
Billeter, Martin; Bartels, Christian; Guntert, Peter; Luginbuhl, Peter; Wuthrich, Kurt
5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 98.03-04Я6.7

   
    Biomagresbank [Text] : abstr. Keystone Symp. Front. NMR Mol. Biol.-IV, Keystone, Colo, Apr. 3-9, 1995 / Eldon L. Ulrich [et al.] // J. Cell. Biochem. - 1995. - Sappl 21b. - P77 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: БиоМагРезБанк
Аннотация: Назначение БиоМагРезБанка (BioMagResBank, BMRB) заключается в сборе динамических, структурных, кинетических и термодинамических характеристик биологических макромолекул, полученных методами ЯМР. Специфические данные будут включать параметры порядка, значения времен T[1] и T[2], локальные и общие времена вращательной корреляции, химические сдвиги сигналов, констант спин-спинового взаимодействия, координат атомов, значений pK[a] ионогенных групп. США, Dep. Biochem., Univ. Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706
ГРНТИ  
34.19.01
ВИНИТИ 341.19.01.99
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
БАНК ДАННЫХ
СТРУКТУРА
КИНЕТИЧЕСКИЕ И ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ
ЯМР

Доп.точки доступа:
Ulrich, Eldon L.; Livny, Miron; Ioannids, Yannis; Mortezaj-Zanjani, Clara; Klimowicz, Amy; Markley, John L.
6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 99.10-04А3.327

   
    A wide-bandpass multilayer monochromator for biological small-angle scattering and fiber diffraction studies [Text] / Hiro Tsuruta [et al.] // J. Appl. Crystallogr. - 1998. - Vol. 31, N 5. - P672-682 . - ISSN 0021-8898
Перевод заглавия: Широкополосный многослойный монохроматор для малоуглового рассеяния и дифракции на волокнах в биологических исследованиях
Аннотация: Сконструированный широкополосный монохроматор рентгеновских лучей из синхротронного излучения, построенный на паре синтетических многослойных микроструктур, обеспечивает на выходе поток, на 2 порядка величины более мощный, чем обычный монохроматор на сдвоенном кремниевом кристалле. Это не сопровождается увеличением фонового излучения. Увеличенный поток позволяет проводить кинетические измерения рассеяния в увеличенном диапазоне углов. США, Stanford Synchrotron Rad. Lab., SLAC, Stanford Univ., POB 4349, MS 69, Stanford, CA 94309-0210. Библ. 37
ГРНТИ  
34.57.15
ВИНИТИ 341.57.15.37
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
ИССЛЕДОВАНИЕ СТРУКТУРЫ
МАЛОУГЛОВОЕ РАССЕЯНИЕ РЕНТГЕНОВСКИХ ЛУЧЕЙ
ДИФРАКЦИЯ НА ВОЛОКНАХ
ШИРОКОПОЛОСНЫЙ МНОГОСЛОЙНЫЙ МОНОХРОМАТОР

Доп.точки доступа:
Tsuruta, Hiro; Brennan, Sean; Rek, Zofia U.; Irving, Thomas C.; Tompkins, W.H.; Hodgson, Keith O.
7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 00.02-04А3.2

    Dewey, Gregory T.
    The thermodynamics of biomolecular sequences [Text] : pap. Int. Workshop "Math. Nonlin. Biophys.", Zakopane, May 9-16, 1998 / Gregory T. Dewey // Cell. and Mol. Biol. Lett. - 1999. - Vol. 4, N 1. - P7-18 . - ISSN 1425-8153
Перевод заглавия: Термодинамика последовательностей биологических макромолекул
Аннотация: Представлен метод статистико-механического расчета биополимеров, в к-ром в качестве внутренней координаты служит информация, содержащаяся в последовательности. Метод позволяет оценить вклад информации последовательности в термодинамическую энтропию. В интегральном представлении каноническую функцию разделения можно представить как произведение интеграла пути конфигурации полимера на интеграл пути блуждания последовательности. В большинстве биополимеров состав последовательности влияет на потенциальную энергию взаимодействия между субъединицами. Следовательно два интеграла пути неразделимы, но "взаимодействуют" через зависимый от последовательности конфигурационный потенциал. В систему можно ввести биологические ограничения, эффективно вводящие внешний потенциал. Белки и РНК являются идеальными "полимерами", т. к. в них блуждание последовательности осуществляется в более, чем в 3 измерениях. Чтобы показать, что последовательность содержит структурную информацию можно использовать марковскую природу блуждания. Наличие структурной информации является результатом размерности блуждания последовательности и не обязательно следствием биологической оптимизации системы. США, Dep. Chem. & Biochem., Univ. Denver, Denver, CO 80208-2436. Библ. 15
ГРНТИ  
34.55.15
ВИНИТИ 341.55.15.09
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ТЕРМОДИНАМИКА
МЕТОД СТАТИСТИКО-МЕХАНИЧЕСКОГО РАСЧЕТА
8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI24) 00.07-04М3.1

   
    Cognitive enhancers and PI turnover-phospholipase C systems in the brain [Text] / M. Katsura [et al.] // Neurochem. and Psychopharmacol. Approaches Cogn. Enhancers. - Kyoto, 1995. - P44
Перевод заглавия: BAliBASE - контрольная база данных выравниваний последовательностей для оценки программ множественного выравнивания
Аннотация: Представлена база данных BAliBASE уточненных экспериментатором высококачественных множественных выравниваний, классифицированных по длине, сходству и наличию инсерций и дополнений на C- и N-концах коровых блоков консервативных белковых последовательностей. BAliBASE может служить в качестве стандарта для оценки точности программ множественных выравниваний. BAliBASE доступна в интернете по адресу: "http://www-igbmc.u-strasbg.fr/BioInfo/BAliBASE/index.html". Франция, Inst. Genet. & Biol. Mol. & Cell., BP 163, 67404 Illkirch Cedex. Библ. 18
ГРНТИ  
34.39.15
ВИНИТИ 341.39.15.02
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
МНОЖЕСТВЕННЫЕ ВЫРАВНИВАНИЯ
КОМПЬЮТЕРНЫЕ ПРОГРАММЫ
БАЗА ДАННЫХ BALIBASE
БАЗЫ ДАННЫХ
ПРОГРАММЫ

Доп.точки доступа:
Katsura, M.; Iino, T.; Xu, J.; Ohkuma, S.; Kuriyama, K.
9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.04-04А3.718

    Reichert, Jan.
    The IMB Jena Image Library of Biological Macromolecules: 2002 update [Text] / Jan Reichert, Jurgen Suhnel // Nucl. Acids Res. - 2002. - Vol. 30, N 1. - P253-254 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Библиотека изображений биологических макромолекул Института молекулярной биотехнологии в Иене. Выпуск 2002 года
Аннотация: Библиотека изображений биологических макромолекул Института молекулярной биотехнологии в Иене (http://www.imb-jena.de/IMAGE.html) содержит информацию о пространственной структуре биополимеров с особым вниманием к визуализации и анализу структур. Содержится также информация об архитектуре биополимеров. В последнее время были введены база данных о функциональных центрах и средства анализа, позволяющие идентифицировать остатки и молекулы воды, окружающие гетерокомпоненты или центры. Краткие описания методов рентгеноструктурного анализа, ЯМР и Фурье-ИК-спектроскопии, используемые для определения структуры, дополнены информацией о методе КД. Германия, Biocomputing Grp, Inst. Mol. Biotechnol., PF 100813, 07708 Jena. Библ. 8
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА
ВИЗУАЛИЗАЦИЯ
БАЗОВАЯ БИБЛИОТЕКА ИЗОБРАЖЕНИЙ
ИНСТИТУТ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОТЕХНОЛОГИИ
ВЫПУСК 2002 Г.
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Suhnel, Jurgen
10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.05-04А3.659

    Kleinjung, Jens.
    Parallelized multiple alignment [Text] / Jens Kleinjung, Nigel Douglas, Jaap Heringa // Bioinformatics. - 2002. - Vol. 18, N 9. - P1270-1271 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Параллелизованное множественное сопоставление
Аннотация: Сопоставление очень большого числа последовательностей требует очень большое время расчета, которое можно значительно уменьшить, распределив части сопоставляемого массива между несколькими процессорами. Для осуществления этого создана программа множественных сопоставлений Praline. Проверка показала, что параллелизованный расчет на 25 процессорах в 10 раз уменьшает общее время расчета. Пример программы для параллелизованного попарного сопоставления имеется по адресу: http://mathbio.nimr.mrc.ac.uk/'ЭКВИВ' jklein/tools/mpicode. Необходимый для этого пакет программ интерфейса передачи сообщений MPICH доступен по адресу: http://www.unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich. Великобритания, Div. Math. Biol., Nat. Inst. Med. Res., Mill Hill, London NW7 1AA. Библ. 8
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
МНОЖЕСТВЕННОЕ СОПОСТАВЛЕНИЕ
ПАРАЛЛЕЛИЗОВАННЫЙ РАСЧЕТ
КОМПЬЮТЕРНЫЕ ПРОГРАММЫ
АДРЕСА В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Douglas, Nigel; Heringa, Jaap
11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.11-04А3.711

   
    BioEditor - simplifying macromolecular structure annotation [Text] / Peng Yang [et al.] // Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 7. - P897-898 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: BioEditor - программа, упрощающая аннотирование макромолекулярных структур
Аннотация: BioEditor - это программа, позволяющая исследователям и преподавателям подготавливать и представлять аннотации, содержащие форматированный текст, графики, данные о последовательностях и интерактивные изображения молекулярных структур. Предполагается, что BioEditor перекрывают разрыв между представлением в статьях в печатных журналах и в формате интернета. BioEditor доступен по адресу: http.//bioeditor.sdsc.edu. США, San Diego Supercomp. Ctr., Univ. California, San Diego, La Jolla, CA 92093-0505. Библ. 9
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА
АННОТИРОВАНИЕ
КОМПЬЮТЕРНАЯ ПРОГРАММА BIOEDITOR
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Yang, Peng; Craig, Paul A.; Goodsell, David; Bourne, Philip E.
12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.11-04А3.730

   
    The European Bioinformatics Institute's data resources [Text] / Catherine Brooksbank [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 1. - P43-50 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Ресурсы данных Европейского института биоинформатики
Аннотация: Европейский институт биоинформатики (EBI) поддерживает 6 основных баз данных, хранящих информацию о последовательностях ДНК (EMBL-Bank), последовательностях белков (SWISS-PROT и TrEMBL), структуре белков (MSD), целых геномах (Ensembl) и экспрессии генов (ArrayExpress). Разработан ряд средств, которые не только облегчают помещение и поиск биологической информации, но и позволяют пользователям осуществлять поиск взаимосвязей между разными видами информации. Все базы данных и средства доступны на сайте http://www.ebi.ac.uk. Великобритания, EMBL-European Bioinformatics Inst., Wellcome Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 1SD. Библ. 35
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
БЕЛОК
ДНК
ГЕНОМЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СТРУКТУРА
БАЗЫ ДАННЫХ
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ
ЕВРОПЕЙСКИЙ ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ

Доп.точки доступа:
Brooksbank, Catherine; Camon, Evelyn; Harris, Midori A.; Magrane, Michele; Martin, Maria Jesus; Mulder, Nicola; O'Donovan, Claire; Parkinson, Helen; Tuli, Mary Ann; Apweiler, Rolf
13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.11-04А3.736

    Pruitt, Kim D.
    NCBI reference sequence project: Update and current status [Text] / Kim D. Pruitt, Tatiana Tatusova, Donna R. Maglott // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 1. - P34-37 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Проект референтных последовательностей Национального центра биотехнологической информации (NCBI). Пополнение и текущее состояние
Аннотация: Целью проекта референтных последовательностей RefSeq является создание единой невырожденной всеобъемлющей коллекции данных о природных молекулах биологического происхождения. Последовательности нуклеиновых кислот и белков в этой коллекции хранятся в явном виде. В идеале предполагается, что для каждого хорошо изученного организма будут приведены все типы молекул, но на начальном этапе эта база данных прагматически содержит только те молекулы и организмы, которые наиболее легко идентифицировать. Поэтому для разных организмов сейчас имеется различное количество информации. Более того, для некоторых организмов, когда секвенирование генома еще не завершено, приводятся предварительные данные. Дополнительная информация о проекте RefSeq имеется по адресу: http://www.ncbi.nih.gov/RefSeq/. США, NCBI, Nat. Library Med., NIH, Bethesda, MD 20894. Библ. 8
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ
БЕЛКИ
РЕФЕРЕНТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ПРОЕКТ REFSEQ
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ
НАЦИОНАЛЬНЫЙ ЦЕНТР БИОТЕХНОЛОГИЧЕСКОЙ ИНФОРМАЦИИ

Доп.точки доступа:
Tatusova, Tatiana; Maglott, Donna R.
14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.12-04А3.475

   
    Zerg: A very fast BLAST parser library [Text] / Apua C. M. Paquola [et al.] // Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 8. - P1035-1036 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Zerg - библиотека очень быстрых синтаксических редакторов BLAST
Аннотация: Zerg (http://bioinfo.iq.usp.br/zerg) - это библиотека подпрограмм, которые грамматически редактируют выходные данные всех программ BLAST (Blastn, Blastp, Blastx, Tblastn и Tblastx). Библиотека оптимизирована по скорости действия и особенно полезна для крупномасштабного анализа геномов. Проверка показала, что Zerg действует на два порядка величины быстрее, чем другие, широко распространенные редакторы BLAST. Бразилия, Dep. Bioqu'иота'm., Inst. Qu'иота'm., Univ. Sao Paulo, 05508-900 Sao Paulo, SP. Библ. 4
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
ДНК
БЕЛКИ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ПРОГРАММЫ BLAST
ГРАММАТИЧЕСКОЕ РЕДАКТИРОВАНИЕ
БИБЛИОТЕКА ZERG
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Paquola, Apua C.M.; Machado, Abimael A.; Reis, Eduardo M.; da, Silva Aline M.; Verjovski-Almeida, Sergio
15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.01-04А3.875

    Huang, Xiaoqiu.
    A generalized global alignment algorithm [Text] / Xiaoqiu Huang, Kun-Mao Chao // Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 2. - P228-233 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Обобщенный алгоритм глобального сопоставления последовательностей
Аннотация: Гомологичные последовательности иногда совпадают лишь в отдельных областях и имеют намного меньшее глобальное сходство, если различающиеся области намного длиннее сходных. Предложен обобщенный алгоритм глобального сопоставления последовательностей с прерывистыми сходными областями, разделенными различающимися участками. Определена обобщенная модель глобального сопоставления таких последовательностей. Алгоритм с динамическим программированием рассчитывает оптимальное общее сопоставление за время, пропорциональное произведению длин последовательностей, и требует объем памяти, пропорциональный сумме длин последовательностей. Алгоритм реализован в программе GAP3 (http://bioinformatics.iastate.edu/aat/align/align.html). Обобщенная модель опробована на последовательностях и ДНК, и белков. США, Dep. Comp. Sci., Iowa St. Univ., Ames, IA 50011-1040. Библ. 23
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
ДНК
БЕЛКИ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ГЛОБАЛЬНОЕ СОПОСТАВЛЕНИЕ
КОМПЬЮТЕРНАЯ ПРОГРАММА GAP3
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Chao, Kun-Mao
16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.02-04А3.615

    Thompson, J. D.
    RASCAL: Rapid scanning and correction of multiple sequence alignments [Text] / J. D. Thompson, J. C. Thierry, O. Poch // Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 9. - P1155-1161 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: RASCAL - быстрое сканирование и исправление множественных сопоставлений последовательностей
Аннотация: Многие программы могут вносить ошибки в создаваемые множественные сопоставления последовательностей. Большинство методов исправления таких ошибок используют итеративные стратегии. Предложен альтернативный метод RASCAL (ftp://ftp-igbmc.u-strasbg.fr/pub/RASCAL), основанный на знаниях. Сопоставление делится горизонтально и вертикально, образуя "решетку", в которой определяются правильно сопоставленные области. Затем в наименее достоверные области вносятся исправления. Точность и достоверность действия RASCAL проверяли на сопоставлениях базы данных BAliBASE, на 946 сопоставлениях из базы данных ProDom (качество повысилось на 68%) и на сопоставлении 695 полных последовательностей белков ядерных рецепторов. Франция, Lab. Biol. & Genomique Struct., Inst. Genet. & Biol. Mol. & Cell., BP 10142, 67404 Illkirch Cedex. Библ. 26
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
МНОЖЕСТВЕННОЕ СОПОСТАВЛЕНИЕ
БЫСТРОЕ СКАНИРОВАНИЕ
ИСПРАВЛЕНИЕ ОШИБОК
КОМПЬЮТЕРНАЯ ПРОГРАММА RASCAL
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Thierry, J.C.; Poch, O.
17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.03-04А3.425

   
    WU-Blast2 server at the European Bioinformatics Institute [Text] / Rodrigo Lopesz [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 13. - P3795-3798 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Сервер Европейского института биоинформатики WU-Blast2
Аннотация: Программы WU-BLAST (http://blast.wustl.edu) обеспечивают быстрый, гибкий и достоверный поиск сходства последовательностей в биологических базах данных. Сервер WU-Blast2 (http://www.ebi.ac.uk/blast2/) предоставляет эти же возможности, но в усиленном и расширенном виде. Великобритания, European Bioinformatics Inst., Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge, CB10 1SD. Библ. 22
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СХОДСТВО
ПОИСК
ПРОГРАММЫ WU-BLAST
СЕРВЕР WU-BLAST2
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Lopesz, Rodrigo; Silventoinen, Ville; Robinson, Stephen; Kibria, Asif; Gish, Warren
18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.03-04А3.429

   
    SEM (Symmetry Equivalent Molecules): A web-based GUI to generate and visualize the macromolecules [Text] / A. S.Z. Hussain [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 13. - P3356-3558 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: SEM (Symmetry Equivalent Molecules) - сетевой графический интерфейс для пользователей, создающий и визуализирующий изображения макромолекул
Аннотация: SEM (http://dicsoft2.physics.iisc.ernet.in/sem/ или http://144.16.71.11/sem/) - это графический интерфейс, создающий изображения симметрически эквивалентных молекул белков и нуклеиновых кислот. Кроме того, программа обеспечивает вывод трехмерных координат макромолекул. Для визуализации референтных (вводимых) и симметрически эквивалентных молекул используется программа RasMol. Программа написана на языке CGI/Perl и может быть связана с любыми кристаллическими структурами PDB. Индия, Bioinformatics Ctr., Supercomputer Education & Res. Ctr., Ind. Inst. Sci., Bangalore 560012. Библ. 9
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
БЕЛКИ
НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ
СИММЕТРИЧЕСКИ ЭКВИВАЛЕНТНЫЕ МОЛЕКУЛЫ
ВИЗУАЛИЗАЦИЯ
ГРАФИЧЕСКИЙ ИНТЕРФЕЙС SEM
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Hussain, A.S.Z.; Kumar, Ch.Kiran; Rajesh, C.K.; Sheik, S.S.; Sekar, K.
19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.03-04А3.466

   
    Swiss EMBnet node web server [Text] / Laurent Falquet [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 13. - P3782-3783 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Сетевой сервер швейцарского узла EMBnet
Аннотация: EMBnet - это объединение сотрудничающих групп биоинформатики, расположенных главным образом в Европе (http://www.embnet.org). Каждая из групп представлена "узлом", ответственным за поддержание локальных служб для пользователей, например в сферах образования, обучения программного обеспечения, распределения баз данных, технической поддержки, службы помощи. Среди этих услуг имеется сетевой портал со связями и доступом к локально созданным компьютерным программам. Сетевой портал швейцарского узла EMBnet (http://www.ch.embnet.org) содержит различные средства анализа последовательностей и другие программы. Швейцария, Swiss Inst. Bioinformatics, 1066 Epalinges, Lausanne. Библ. 21
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
АНАЛИЗ
БИОИНФОРМАТИКА
ГРУППЫ EMBNET
ШВЕЙЦАРСКИЙ УЗЕЛ
СЕТЕВОЙ СЕРВЕР
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Falquet, Laurent; Bordoli, Lorenza; Ioannidis, Vassilios; Pagni, Marco; Jongeneel, C.Victor
20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.03-04А3.467

    Ramu, Chenna.
    SIRW: A web server for ther Simple indexing and Retrieval System that combines sequence motif searches with keyword searches [Text] / Chenna Ramu // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 13. - P3771-3774 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: SIRW - сетевой сервер для простой системы индексации и поиска, сочетающий поиск по мотивам последовательности с поиском по ключевым словам
Аннотация: SIRW (http://sirw.embl.de/) - это сетевой сервер, позволяющий анализировать структуру и индексировать различные базы данных. Кроме того, SIRW создает среду для анализа последовательностей (т. е. поисков по шаблонам мотивов), отобранных поиском по ключевым словам. Германия, EMBL, PF 10.2209, 69012 Heidelberg. Библ. 17
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
БЕЛКИ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СТРУКТУРА
АНАЛИЗ БАЗ ДАННЫХ
СИСТЕМА ИНДЕКСАЦИИ/ПОИСКА
СЕТЕВОЙ СЕРВЕР SIRW
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ
 1-20    21-40   41-56 
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)