СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ<.>)

Общее количество найденных документов : 21
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-21

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.07-04Б2.33

Клеваник, А. В.
Теоретическое исследование низкотемпературных оптических спектров реакционных центров Rhodopseudomonas viridis [Текст] / А. В. Клеваник, А. Я. Шкуропатов, В. А. Шувалов // Биол. мембраны. - 1994. - Т. 11, N 4. - С. 357-370 . - ISSN 0233-4755
Аннотация: В рамках теории мини-экситонов рассчитаны оптические спектры реакционных центров (РЦ) фотосинтезирующих бактерий Rhodopseudomonas viridis. Проведенный анализ показал, что опубликованные ранее расчеты оптических спектров РЦ этих бактерий, основанные на известной кристаллографической структурной модели РЦ, не воспроизводят достаточно детально относительное распределение дипольных сил оптических переходов, наблюдаемое в низкотемпературных спектрах поглощения. Значительно лучшее согласие экспериментальных и теоретических низкотемпературных (1,7 К) оптических спектров РЦ Rps. viridis достигнуто в результате изменений (по отношению к кристаллографическим) координат фотоактивного бактериофеофитина H[L] и " сопутствующих" бактериохлорофиллов B[L] и B[м]. Введенные смещения хромофоров H[L], B[L] и B[м] привели к увеличению значений интегралов перекрывания волновых функций первичного донора электрона и бактериохлорофилла B[L], а последнего с бактериофеофитином H[L], что может свидетельствовать о более оптимальном (с точки зрения процесса разделения зарядов) положении хромофоров в РЦ Rps. viridis. Россия, Ин-т почвоведения и фотосинтеза РАН, Пущино Московской обл. Библ. 40

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.07
Рубрики: РЕАКЦИОННЫЕ ЦЕНТРЫ
ОПТИЧЕСКИЕ СПЕКТРЫ
НИЗКОТЕМПЕРАТУРНЫЕ
МАТЕМАТИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ
БАКТЕРИОХЛОРОФИЛЛЫ
БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
RHODOPSEUDOMONAS VIRIDIS

Доп.точки доступа:
Шкуропатов, А.Я.; Шувалов, В.А.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.08-04Б2.35

Kerfeld, Cheryl A.
Purification and characterization of the peripheral antenna of the purple-sulfur bacterium Chromatium purpuratum: Evidence of an unusual pigment-protein composition [Text] / Cheryl A. Kerfeld, Todd O. Yeates, J.Philip Thornber // Biochemistry. - 1994. - Vol. 33, N 8. - P2178-2184 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Очистка и характеристика периферической антенны пурпурной-серной бактерии Chromatium purpuratum. Доказательство необычного пигмент-белкового состава
Аннотация: Из пурпурной-серной бактерии C. purpuratum выделены и охарактеризованы периферические антенны, состоящие по данным ЭФ в ПААГ, содержащем ДДС Na, из 6 субъединиц, N-концевой анализ субъединиц показал, что они могут иметь дополнительный участок связывания бактериохлорофилла, локализованный вне трансмембранного домена, а также дополнительные участки связывания пигментов. КД- и секвенс-анализы структуры комплекса содержит значительное кол-во 'бета'-структур и 'альфа'-спиралей. Каротеноид-белковый комплекс этой бактерии включает 3 белка и каротеноид, близко связанные с периферической антенной. Анализ вторичной и четвертичной структуры говорит о значительном отличии структуры комплекса антенны от светособирающих комплексов других пурпурных фотосинтетических бактерий. Библ. 43. США, Dep. Biol. and Chem. and Biochem. Univ. California, Los Angeles, California 90024

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.07.07
Рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
СТРУКТУРА
ОСОБЕННОСТИ
CHROMATIUM PURPURATUM

Доп.точки доступа:
Yeates, Todd O.; Thornber, J.Philip

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.11-04Б2.41

Реконструкция пурпурных мембран из делипидированного бактериородопсина с использованием эндогенных и экзогенных липидов. Влияние структурных и внешних факторов [Текст] / О. Ю. Половникова [и др.] // Биол. мембраны. - 1995. - Т. 12, N 3. - С. 260-278 . - ISSN 0233-4755
Аннотация: Изучено влияние липидного окружения и внешних факторов (температуры и ионной силы водной среды) на формирование двумерных белковых кристаллов в реконструированных мембранах из делипидированного бактериородопсина. В качестве липидной составляющей были использованы суммарная фракция полярных липидов клеток Halobacterium halobium, яичный фосфатидилхолин (ФХ) и дипальмитоилфосфатидилхолин (ДПФХ). Реконструкцию проводили при соотношениях липид/белок, максимально близких к нативному. Для исследования свойств полученных мембранных препаратов использовали абсорбционную спектроскопию, КД в видимой области, электронную микроскопию (замораживание-скалывание) и ДСК. Показано, что в зависимости от природы липида и соотношения липид/белок бактериородопсин дает различные модификации мембран, отличающиеся по характеру и типу упаковки белковых молекул. Кристаллическую структуру бактериородопсина можно получить в условиях реконструкции путем включения белка в бислой эндогенных липидов при нативном соотношении липид/белок, равном 0,33/1, и при низкой конц-ии NaCl. При избытке эндогенных липидов для регенерации требуется присутствие соли в высокой конц-ии (3,5-4 М NaCl) или нагревание до 40-45'ГРАДУС' С. В случае ФХ высокоупорядоченную структуру белка можно получить только в присутствии NaCl в высокой конц-ии. В присутствии эндогенных липидов олигомеры бактериородопсина упаковываются в гексагональную решетку p3 симметрии, тогда как в системе, содержащей яичный фосфатидилхолин, белок упорядочивается в виде орторомбической решетки р22[1]2[1] симметрии. Вероятно, процессы упорядочивания белка в плоскости мембраны в определенной степени могут зависеть от электростатического поверхностного потенциала и/или диэлектрической проницаемости примембранного слоя, которые определяются тонким балансом электростатических взаимодействий на поверхности мембраны между белком, полярными головками липидных молекул и ионами электролитов, присутствующих в омывающей мембрану водной среде. Россия, ин-т теор. и эксп. биофизики РАН, г. Пущино Московской обл. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.09.29
Рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ПУРПУРНЫЕ МЕМБРАНЫ
МЕМБРАНЫ БАКТЕРИАЛЬНЫЕ
ЛИПИДЫ
ИОННАЯ СИЛА РАСТВОРА
ТЕМПЕРАТУРА

Доп.точки доступа:
Половникова, О.Ю.; Симонова, Т.Н.; Тараховский, Ю.С.; Никонова, Т.Н.; Суханов, С.В.; Дубачев, Г.Э.; Боровягин, В.Л.; Василенко, И.А.; Барсуков, Л.И.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.11-04Б2.43

Rotational orientation of transmembrane 'альфа'-helices in bacteriorhodopsin. A neutron diffraction study [Text] / Fadel A. Samatey [et al.] // J. Mol. Biol. - 1994. - Vol. 236, N 4. - P1093-1104 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Вращательная ориентация трансмембранных 'альфа'-спиралей в бактериородопсине. Изучение с помощью дифракции нейтронов
Аннотация: The rotational orientation of the seven transmembrane 'альфа'-helices (A-G) in bacteriorhodopsin has been investigated by neutron diffraction. The current model of bacteriorhodopsin is based on an electron density map obtained by high-resolution electron microscopy (EM). Assigning helix rotational positions in the EM model depended on fitting large side-chains, mainly aromatic residues, into bulges in the electron density map. For helix D, which contains no aromatic residues, the EM map is more difficult to interpret. For helices A and B, whose position and orientation had been determined previously by neutron diffraction, the positions defined by AM agree within experimental error with these earlier conclusions. The orientation of all seven helices has been examined by using meutron diffraction on bacteriorhodopsin samples with specifically deuterated valine, leucine and tryptophan residues. Experimental peak intensities were compared to those predicted for an extensive set of structural models. The models were generated by (1) rotating all helices around their axis; (2) moving deuterated residues in the extramembrane loops about their probable positions and changing the weight of their contribution to the neutron diffraction pattern; (3) allowing deuterated side-chains to change their conformation. The analysis confirmed exactly the positions previously determined for helices A and B. For an optimal fit to the data to be obrained, the other five helices, including helix D, must lie either at or within 20'ГРАДУС' of their position in the current EM model. The complementarity of medium-resolution EM, neutron diffraction and model building for the structural study of integral membrane proteins is discussed. Франция, Inst. Laue-Langevin, BP 156X, avenue des Martyrs F-38042 Grenoble. Библ. 41

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.09.29
Рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ТРАНСМЕМБРАННЫЕ АЛЬФА-СПИРАЛИ
МЕТОД ДИФРАКЦИИ НЕЙТРОНОВ

Доп.точки доступа:
Samatey, Fadel A.; Zaccai, Giuseppe; Engelman, Donald M.; Etchebest, Catherine; Popot, Jean-Luc

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 95.11-04А3.91

100kHz optical multi-channel analyzer [Text] / P. D. Smith [et al.] // Biophys. J. - 1994. - Vol. 66, N 2. - P376 . - ISSN 0006-3495
Перевод заглавия: 100-кГц оптический многоканальный анализатор
Аннотация: An optical multi-channel analyzer capable of recording spectra at sampling rates up to 100 kHz has been designed, constructed, and applied to studying the kinetic reaction mechanisms associated with cytochrome oxidase and bacteriorhodopsin. The instrument features a massively parallel approach in which each photosensing element of the detector has a dedicated amplifier, integrator, and data buffer. 92 such elements are divided in two separate arrays, each of which sits at the focal plane of a 1/4 m Ebert monochromator. Both monochromators may be tuned to cover independent, 130 nm wide, regions of the spectrum from 350 nm to 900 nm with a dispersion of 2.6 nm per element. Each element has 12 bit resolution with an electronic dark count of +/-1 count. A total of 1024 reads from a single experiment can be made with intervals from 10us to several seconds. США, NCRR, DCRT, and NHLBJ, NJH, Bethesda, MD 20892

ГРНТИ	34.57.15

ВИНИТИ 341.57.15.37
Рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
МУЛЬТИКАНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗАТОР
МЕТОДЫ

Доп.точки доступа:
Smith, P.D.; Cole, J.; Friauf, W.S.; Frederickson, H.; Hendler, R.W.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.12-04Б2.71

Реконструкция пурпурных мембран из делипидированного бактериородопсина с использованием эндогенных и экзогенных липидов. Влияние структурных и внешних факторов [Текст] / О. Ю. Половникова [и др.] // Биол. мембраны. - 1995. - Т. 12, N 3. - С. 260-278 . - ISSN 0233-4755
Аннотация: Изучено влияние липидного окружения и внешних факторов (температуры и ионной силы водной среды) на формирование двумерных белковых кристаллов в реконструированных мембранах из делипидированного бактериородопсина. В качестве липидной составляющей были использованы суммарная фракция полярных липидов клеток Halobacterium halobium, яичный фосфатидилхолин (ФХ) и дипальмитоилфосфатидилхолин (ДПФХ). Реконструкцию проводили при соотношениях липид/белок, максимально близких к нативному. Для исследования свойств полученных мембранных препаратов использовали абсорбционную спектроскопию, КД в видимой области, электронную микроскопию (замораживание-скалывание) и ДСК. Показано, что в зависимости от природы липида и соотношения липид/белок бактериородопсин дает различные модификации мембран, отличающиеся по характеру и типу упаковки белковых молекул. Кристаллическую структуру бактериородопсина можно получить в условиях реконструкции путем включения белка в бислой эндогенных липидов при нативном соотношении липид/белок, равном 0,33/1, и при низкой конц-ии NaCl. При избытке эндогенных липидов для регенерации требуется присутствие соли в высокой конц-ии (3,5-4 М NaCl) или нагревание до 40-45'ГРАДУС' С. В случае ФХ высокоупорядоченную структуру белка можно получить только в присутствии NaCl в высокой конц-ии. В присутствии эндогенных липидов олигомеры бактериородопсина упаковываются в гексагональную решетку p3 симметрии, тогда как в системе, содержащей яичный фосфатидилхолин, белок упорядочивается в виде орторомбической решетки р22[1]2[1] симметрии. Вероятно, процессы упорядочивания белка в плоскости мембраны в определенной степени могут зависеть от электростатического поверхностного потенциала и/или диэлектрической проницаемости примембранного слоя, которые определяются тонким балансом электростатических взаимодействий на поверхности мембраны между белком, полярными головками липидных молекул и ионами электролитов, присутствующих в омывающей мембрану водной среде. Россия, ин-т теор. и эксп. биофизики РАН, г. Пущино Московской обл. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.17

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.12-04Б2.73

Rotational orientation of transmembrane 'альфа'-helices in bacteriorhodopsin. A neutron diffraction study [Text] / Fadel A. Samatey [et al.] // J. Mol. Biol. - 1994. - Vol. 236, N 4. - P1093-1104 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Вращательная ориентация трансмембранных 'альфа'-спиралей в бактериородопсине. Изучение с помощью дифракции нейтронов
Аннотация: The rotational orientation of the seven transmembrane 'альфа'-helices (A-G) in bacteriorhodopsin has been investigated by neutron diffraction. The current model of bacteriorhodopsin is based on an electron density map obtained by high-resolution electron microscopy (EM). Assigning helix rotational positions in the EM model depended on fitting large side-chains, mainly aromatic residues, into bulges in the electron density map. For helix D, which contains no aromatic residues, the EM map is more difficult to interpret. For helices A and B, whose position and orientation had been determined previously by neutron diffraction, the positions defined by AM agree within experimental error with these earlier conclusions. The orientation of all seven helices has been examined by using meutron diffraction on bacteriorhodopsin samples with specifically deuterated valine, leucine and tryptophan residues. Experimental peak intensities were compared to those predicted for an extensive set of structural models. The models were generated by (1) rotating all helices around their axis; (2) moving deuterated residues in the extramembrane loops about their probable positions and changing the weight of their contribution to the neutron diffraction pattern; (3) allowing deuterated side-chains to change their conformation. The analysis confirmed exactly the positions previously determined for helices A and B. For an optimal fit to the data to be obrained, the other five helices, including helix D, must lie either at or within 20'ГРАДУС' of their position in the current EM model. The complementarity of medium-resolution EM, neutron diffraction and model building for the structural study of integral membrane proteins is discussed. Франция, Inst. Laue-Langevin, BP 156X, avenue des Martyrs F-38042 Grenoble. Библ. 41

ГРНТИ	34.27.17

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 96.05-04Б3.96

Yao, Baoli.
Фотобиомолекулярное устройство бактериородопсина и его ультрабыстрый процесс [Text] / Baoli Yao, Dalun Xu // Shengwuhuaxue yu shengwuwuli jinzhan = Progr. Biochem. and Biophys. - 1995. - Vol. 22, N 2. - С. 117-121 . - ISSN 1000-3282

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.25
Рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ФОТОБИОМОЛЕКУЛЯРНОЕ УСТРОЙСТВО

Доп.точки доступа:
Xu, Dalun

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.01-04Б2.66

Charge motions studied in the bacteriorhodolpsin mutants D85N and D212N [Text] / Csilla Gergely [et al.] // J. Photochem. and Photobiol. B. - 1995. - Vol. 27, N 1. - P27-32 . - ISSN 1011-1344
Перевод заглавия: Перемещения заряда у мутантных бактериородопсинов D85N и D212N
Аннотация: Исследованы сигналы фотоэлектрического ответа мутантных бактериородопсинов D85N и D212N, экспрессируемых в Halobacterium halobium. Пурпурные мембраны, содержащие только мутантный белок, были ориентированы и иммобилизованы в полиакриламидном теле. Изменения спектра поглощения и сигналы электрического ответа определяли после возбуждения лазером, позволяющим прослеживать перемещения в белке зарядов в процессе фотоцикла. Сигналы анализировали на основе последовательной модели с обратимыми реакциями для фотоцикла у мутантов D85N и D212N. Установлена относительная электрогенность L-интермедиатов. Полученные результаты подтверждают наличие конформационных изменений при фотоцикле у этих мутантных бактериородопсинов. Румыния, Dep. Bioph., Univ. Med., Pharm., Bucharest. Библ. 34

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.09.29
Рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
МУТАНТНЫЕ
ЗАРЯДЫ
ФОТОЦИКЛ
HALOBACTERIUM HALOBIUM

Доп.точки доступа:
Gergely, Csilla; Ganea, Constanta; Szaraz, Sandor; Varo, Gyorgy

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.01-04Б2.67

Radionov, Alexey N.
Cooperative phenomena in the photocycle of D96N mutant bacteriorhodopsin [Text] / Alexey N. Radionov, Andrey D. Kaulen // FEBS Lett. - 1995. - Vol. 377, N 3. - P330-332 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Кооперативный феномен в фотоцикле мутанта бактериородопсина Д96N
Аннотация: Распад интермедиата М в фотоцикле мутанта бактериородопсина Д96N не зависит от интенсивности света. Добавление азида ускоряло распад М, который кинетически отличался от распада N. Повышение интенсивности света замедляло распад М и значительно ускоряло распад N. Полученные данные подтверждают высказанное ранее предположение о том, что появление медленного интермедиата М в фотоцикле бактериородопсина дикого типа при высокой интенсивности света обусловлено дестабилизацией интермедиата N, что ускоряет р-ции N'-' М и N'-' бактериородопсин. Библ. 19

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.09.29
Рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
МУТАНТ Д96N
ФОТОЦИКЛ

Доп.точки доступа:
Kaulen, Andrey D.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.01-04Б2.68

Control of the integral membrane proton pump, bacteriorhodopsin, by purple membrane lipids of Halobacterium halobium [Text] / Anup K. MUkhopadhyay [et al.] // Biochemistry. - 1996. - Vol. 35, N 28. - P9245-9252 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Контроль интегральной мембранной протонной помпы, бактериородопсина, липидами пурпурных мембран Halobacterium halobium
Аннотация: Описаны условия, важные для реконструкции нативных пурпурных мембран и восстановления фотоцикла после действия на пурпурные мембраны тритона X-100. С использованием циркулярного дихроизма и спектроскопии в УФ- и видимой области показано, что тритон X-100 может разрушать как вторичную структуру бактериородопсина, так и его способность образовывать тримеры. В то время как изменение конформации белка может быть восстановлено только липидами, образование тримеров и восстановление нормального фотоцикла идет при наличии липидов и высокой конц-ии соли. США, Lab. Cell Biol., Nat. Heart, Lung, and Blood Inst., Nat. Inst. Health, Bethesda, Maryland 20892. Библ. 19

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.09.29
Рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ТРАНСПОРТ ВОДОРОДА
ЛИПИДЫ
ПУРПУРНЫЕ МЕМБРАНЫ

Доп.точки доступа:
MUkhopadhyay, Anup K.; Dracheva, Swetlana; Bose, Salil; Hendeler, Richard W.

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 97.07-04Б3.7

Shibata, Akira.
Бактериородопсин как биосенсор и его чувствительность к анестетикам [Text] / Akira Shibata // Bitamin = Vitamins. - 1996. - Vol. 70, N 8. - С. 359-367 . - ISSN 0006-386X

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.07.07
Рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
БИОСЕНСОРЫ
АНЕСТЕТИКИ
ВЛИЯНИЕ

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.09-04Б2.35

Радионов, А. Н.
Сравнение действия ингибиторов на распад интермедиата М при фотоцикле бактериородопсина дикого типа и мутанта D96N [Текст] / А. Н. Радионов, А. Д. Каулен // Биохимия. - 1996. - Т. 61, N 9. - С. 1539-1553 . - ISSN 0320-9725
Аннотация: Изучено влияние в-в, замедляющих распад интермедиата М в фотоцикле бактериородопсина дикого типа, на распад интермедиата М у мутанта D96N. Обработка пурпурных мембран как дикого типа, так и мутанта глутаровым альдегидом или LuCl[3] вызывает появление двух фракций бактериородопсина, различающихся по скорости распада интермедиата М. У этих фракций в обработанных глутаровым альдегидом мембранах дикого типа распад интермедиата М замедлен в 10 и 70 раз. В присутствии LuCl[3] распад М замедляется в 150 и 3000 раз. В то же время глутаровый альдегид и LuCl[3] почти не влияют на распад М у подобных фракций мутанта. Однако оба агента резко ингибируют ускорение распада М, вызываемое азидом, при этом не влияя на линейный характер зависимости скорости распада М от конц-ии азида. Эффективность ускоряющего действия азида для двух фракций в присутствии глутарового альдегида уменьшается в 11 и 140 раз, а в присутствии LuCl[3] - в 200 и 1600 раз. Увеличение содержания в среде глицерина или сахарозы вызывает замедление распада М как у бактериородопсина дикого типа, так и у регистрируемого в присутствии азида распада М мутанта. Предложена схема фотоцикла, согласно которой существует равновесие между двумя формами интермедиата М, различающимися по проницаемости для молекул азидоводорода и, вероятно, молекул воды. Россия, Ин-т ФХБ, МГУ, Москва. Библ. 42

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.09.29
Рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ФОТОЦИКЛ
ПРОТОННЫЙ ТРАНСПОРТ
ПУРПУРНЫЕ МЕМБРАНЫ
HALOBACTERIUM SALINARIUM

Доп.точки доступа:
Каулен, А.Д.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.09-04Б2.36

Spectrally silent transitions in the bacteriorhodopsin photocycle [Text] / I. Chizhov [et al.] // Biophys. J. - 1996. - Vol. 71, N 5. - P2329-2345 . - ISSN 0006-3495
Перевод заглавия: Спектрально незаметные переходы в фотоцикле бактериородопсина
Аннотация: Проведен анализ кинетики фотоцикла бактериородопсина (БР) при т-рах от 0 до 40'ГРАДУС'С в диапазоне длин волн 330-730 нм. Показано, что существует, по крайней мере восемь экспоненциальных компонентов, необходимых для описания фотоцикла БР, пять из которых (K, L, M, N и O) имеют четкие спектральные различия, а константы скоростей у трех спектрально неразличимы. Германия, Max-Planck-Inst fur Molec. Physiol., Rheinlanddamm 201, 44139 Dortmund. Библ. 33

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.09.29
Рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ФОТОЦИКЛ
КИНЕТИКА

Доп.точки доступа:
Chizhov, I.; Chernavskii, D.S.; Engelhard, M.; Mueller, K.-H.; Zubov, B.V.; Hess, B.

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.07-04Б2.51

Ultraviolet resonance raman spects of Trp-182 and Trp-189 in basteriorhodopsin: Novel information on the structure of Trp-182 and its steric interaction with retinal [Text] / Shinji Hashimoto [et al.] // Biochemistry. - 1997. - Vol. 36, N 39. - P11583-11590 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Ультрафиолетовые резонансные рамановские спектры Trp182 и Trp189 в бактериородопсине. Новая информация о структуре Trp182 и его стерическом взаимодействии с ретиналем
Аннотация: Путем вычитания резонансных рамановских спектров (возбуждение при 244 нм) мутантов W182F и W189F из спектра бактериородопсина дикого типа получены спектры остатков Trp182 и Trp189. Торсионные углы 'хи'{2,1} вокруг связи C'бета'-C3 равен '+-'93'ГРАДУС' у Trp182 и '+-'100'ГРАДУС' у Trp189. Оба остатка имеют H-связи умеренной силы между индольной NH-группой и акцепторами водорода. Гидрофобность особенно высока вокруг Trp182. Структура и окружение Trp189, но не Trp182, согласуются с моделью, полученной из данных дифракции электронов [Grigorieff N. et al. "J. Mol. Biol.", 1996, 259, 393-421]. Для согласования структуры Trp182 с моделью он должен быть развернут вокруг C'бета'-C3 на 60'ГРАДУС' в сторону ретиналя и иметь м-лу воды в H-связи с NH. Спектр свидетельствует о необычайно сильном стерическом отталкивании между индольной группировкой и 9- и 13-метильными группами ретиналя, что должно дестабилизировать 13-цис-изомер ретиналя. Япония, Pharm. Inst., Tohoku Univ., Aobayama, Sendai 980-77. Библ. 51

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.09.29
Рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
УФ РЕЗОНАНСНЫЕ РАМАНОВСКИЕ СПЕКТРЫ
МУТАНТЫ W182F И W189F

Доп.точки доступа:
Hashimoto, Shinji; Obata, Kohki; Takeuchi, Hideo; Needleman, Richard; Lanyi, Janos K.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 03.09-04А2.30

DeLong, Edward.
Mille milliards de mille microbes [Text] / Edward DeLong // Recherche. - 2002. - N 355. - P54-58 . - ISSN 0029-5671
Перевод заглавия: Тысяча миллиардов тысяч микробов
Аннотация: В статье научно-популярного характера обсуждаются наиболее сенсационные открытия морской микробиологии последних десятилетий. Одна из них - обнаружение в 80-х годах 20 века пикопланктонных фотосинтезирующих микроорганизмов - Synechococcus и Prochlorococcus. Это открытие значительно изменило наши представления о трофической цепи в океане, выявив большое значение цианобактерий в первичной популяции. Обнаружено также значительное разнообразие экотипов у представителей р. Prochlorococcus, к-рые, в частности, различаются по соотношению разных хлорофиллов, чувствительности к свету и др. особенностям. Отмечается также значение бактериофагов в регуляции численности бактериопланктона. Еще одно яркое открытие - обнаружение планктонных архебактерий, численность к-рых в воде океана оказалась очень высокой. В пробах ДНК из морской воды обнаружены гены, кодирующие синтез светочувствительных белков семейства родопсинов. Это может свидетельствовать о значительном вкладе бактериородопсина в фотосинтез океана

ГРНТИ	34.35.33

ВИНИТИ 341.35.33.37.37.33.11
Рубрики: SYNECHOCOCCUS (BACT.)
PROCHLOROCOCCUS (BACT.)
ОБНАРУЖЕНИЕ
БАКТЕРИОПЛАНКТОН
РЕГУЛЯЦИЯ ЧИСЛЕННОСТИ БАКТЕРИОФАГОМ
АРХЕИ
ПЛАНКТОННЫЕ АРХЕИ
БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.09-04Б2.13

DeLong, Edward.
Mille milliards de mille microbes [Text] / Edward DeLong // Recherche. - 2002. - N 355. - P54-58 . - ISSN 0029-5671
Перевод заглавия: Тысяча миллиардов тысяч микробов
Аннотация: В статье научно-популярного характера обсуждаются наиболее сенсационные открытия морской микробиологии последних десятилетий. Одна из них - обнаружение в 80-х годах 20 века пикопланктонных фотосинтезирующих микроорганизмов - Synechococcus и Prochlorococcus. Это открытие значительно изменило наши представления о трофической цепи в океане, выявив большое значение цианобактерий в первичной популяции. Обнаружено также значительное разнообразие экотипов у представителей р. Prochlorococcus, к-рые, в частности, различаются по соотношению разных хлорофиллов, чувствительности к свету и др. особенностям. Отмечается также значение бактериофагов в регуляции численности бактериопланктона. Еще одно яркое открытие - обнаружение планктонных архебактерий, численность к-рых в воде океана оказалась очень высокой. В пробах ДНК из морской воды обнаружены гены, кодирующие синтез светочувствительных белков семейства родопсинов. Это может свидетельствовать о значительном вкладе бактериородопсина в фотосинтез океана

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: SYNECHOCOCCUS (BACT.)
PROCHLOROCOCCUS (BACT.)
ОБНАРУЖЕНИЕ
БАКТЕРИОПЛАНКТОН
РЕГУЛЯЦИЯ ЧИСЛЕННОСТИ БАКТЕРИОФАГОМ
АРХЕИ
ПЛАНКТОННЫЕ АРХЕИ
БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 03.09-04Б3.87

DeLong, Edward.
Mille milliards de mille microbes [Text] / Edward DeLong // Recherche. - 2002. - N 355. - P54-58 . - ISSN 0029-5671
Перевод заглавия: Тысяча миллиардов тысяч микробов
Аннотация: В статье научно-популярного характера обсуждаются наиболее сенсационные открытия морской микробиологии последних десятилетий. Одна из них - обнаружение в 80-х годах 20 века пикопланктонных фотосинтезирующих микроорганизмов - Synechococcus и Prochlorococcus. Это открытие значительно изменило наши представления о трофической цепи в океане, выявив большое значение цианобактерий в первичной популяции. Обнаружено также значительное разнообразие экотипов у представителей р. Prochlorococcus, к-рые, в частности, различаются по соотношению разных хлорофиллов, чувствительности к свету и др. особенностям. Отмечается также значение бактериофагов в регуляции численности бактериопланктона. Еще одно яркое открытие - обнаружение планктонных архебактерий, численность к-рых в воде океана оказалась очень высокой. В пробах ДНК из морской воды обнаружены гены, кодирующие синтез светочувствительных белков семейства родопсинов. Это может свидетельствовать о значительном вкладе бактериородопсина в фотосинтез океана

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.21
Рубрики: SYNECHOCOCCUS (BACT.)
PROCHLOROCOCCUS (BACT.)
ОБНАРУЖЕНИЕ
БАКТЕРИОПЛАНКТОН
РЕГУЛЯЦИЯ ЧИСЛЕННОСТИ БАКТЕРИОФАГОМ
АРХЕИ
ПЛАНКТОННЫЕ АРХЕИ
БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.12-04Б2.265

Анализ неполной последовательности гена нового Br-белка [Text] / Xue-Wei Xu [et al.] // Yichuan = Hereditas. - 2004. - Vol. 26, N 3. - С. 343-348 . - ISSN 0253-9772
Аннотация: Из озера Aibi в Китае выделен штамм галофильного архаеона AB1. С помощью ПЦР были амплифицированы гены бактериородопсина (Br) и 16S рРНК и определена их нуклеотидная последовательность. На основе гомологий и филогенетического анализа последовательностей 16S рРНК предложено отнести новый штамм к роду Natronococcus. Показано, что Br штамма AB1 обладает типичной для бактериородопсинов трансмембранной гептаспинальной структурой. С другой стороны, при совмещении предсказанных аминокислотных последовательностей Br штамма AB1 с другими Br между ними выявлены четкие различия. Таким образом, Br штамма AB1 является новым членом семейства бактериородопсина. КНР, Coll. Life Sci., Zhejiang Univ., Hangzhou 310027. Библ. 22

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
ГАЛОФИЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ
ГЕНЫ
ГЕН 16S РРНК
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ГОМОЛОГИИ
БЕЛОК
БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ГЕН БАКТЕРИОРОДОПСИНА
КЛОНИРОВАНИЕ
АРХЕБАКТЕРИИ
ГАЛОФИЛЬНЫЙ АРХАЕОН AB1

Доп.точки доступа:
Xu, Xue-Wei; Wu, Min; Ruan, Hong; Huang, wei-Da; Tohty, Dilbar

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.07-04Б2.48

Diversity of bacteriorhodopsins in different hypersaline waters from a single Spanish saltern [Text] / R.Thane Papke [et al.] // Environ. Microbiol. - 2003. - Vol. 5, N 11. - P1039-1045 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Разнообразие бактериородопсинов в различных гиперсоленых водах из одной испанской солеварии
Аннотация: Родопсины галоархей - группа различных трансмембранных белков, преобразующих энергию света в движущую силу различных клеточных процессов. Два родопсина - бактериородопсин и галородопсин, являются H{+} и Cl{-}-насосами, соответственно, а еще два родопсина - сенсорные родопсины I и II - регулируют фототаксис. Бактериородопсин представляет особый интерес, поскольку он служит нехлорофильной основой фототрофности (т. е. преобразования энергии света в химическую). Однако, о разнообразии и распространении генов родопсина в условиях гиперсолености известно мало. В настоящей работе применен метод ПЦР образцов окружающей среды и техника клонирования для прямого обнаружения генов родопсина из прудов с различной соленостью, находящихся на территории завода по производству морской соли в Испании. Рез-ты указывают на обнаружение ранее неизвестных вариантов, включая и те, к-рые, как предполагалось ранее, являются генами бактериородопсина из некультивируемых бактерий, доминирующих в этих условиях. В некоторых случаях идентичные гены были открыты в кажущихся различными ареалах обитания, что подтверждает встречаемость галофильных архей в широком диапазоне конц-ий соли

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.09.29 + 341.27.23.09
Рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
РАЗНООБРАЗИЕ
АРХЕИ
ГАЛОАРХЕИ
СОЛЕВАРНИ

Доп.точки доступа:
Papke, R.Thane; Douady, Christophe J.; Doolittle, W.Ford; Rodriguez-Valera, Francisco

1-20 21-21

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска