СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=CYTOPHAGA<.>)

Общее количество найденных документов : 208
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.11-04Б2.50

5S Ribosomal ribonucleic acid sequences in Bacteroides and Fusobacterium: evolutionary relationships within these genera and among eubacteria in general [Text] / den Eynde H. Van [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1989. - Vol. 39, N 1. - P78-84 . - ISSN 0020-7713
Перевод заглавия: Последовательности [нуклеотидов] в 5S рибосомальной рибонуклеиновой кислоте у Bacteroides и Fusobacterium: эволюционные взаимоотношения между этими родами и среди эубактерий в целом
Аннотация: Определена последовательность нуклеотидов в 5S рРНК у Bacteroides fragilis, B. thetaiotaomicron, B. capillosus, B. veroralis, Porphyromonas gingivalis, Anaerorhabdus furcosus, Fusobacterium nucleatus, F. mortiferum, F. varium. Построены дендрограммы, отражающие положение кластера Bacteroides- Cytophaga - Fusobacterium (I) в системе прокариот, а также взаимоотношения внутри I. Обнаруженные закономерности в целом согласуются с результатами анализа 16S рРНК у этих микроорганизмов, но имеются и некоторые расхождения. Так, по данным анализа 5S рРНК, бактерии р. Bacteroides обладают наибольшим сродством к р. Cytophaga, а не к р. Fusobacterium, как предполагали ранее. Неожиданным рез-том оказалось включение в I видов Chlorobium limicola и Streptococcus lactis var. cremoris. Обсуждаются проблемы таксономии рр. Bacteroides и Fusobacterium. Библ. 40. Бельгия, Dep. Biochem., Univ. Antwerpen (UIA), В-2610 Antwerp.

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03 + 341.27.15.09
Рубрики: BACTEROIDES (BACT.)
FUSOBACTERIUM (BACT.)
ЭВОЛЮЦИОННЫЕ ВЗАИМООТНОШЕНИЯ
CYTOPHAGA (BACT.)
ТАКСОНОМИЯ
ЭУБАКТЕРИИ
РРНК
РРНК 5S
РРНК 16S
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ НУКЛЕОТИДОВ
ГОМОЛОГИИ
CHLOROBIUM LIMICOLA (BACT.)
STREPTOCOCCUS LACTIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Van, den Eynde H.; De, Baere R.; Shah, H.N.; Gharbia, S.E.; Fox, G.E.; Michalik, J.Van de Peer Y.; De, Wachter R.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 89.11-04Б4.193

5S ribosomal ribonucleic acid sequences in Bacteroides and Fusobacterium: Evolutionary relationships within these genera and among eubacteria in general [Text] / den Eynde Hilde Van [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1989. - Vol. 39, N 1. - P78-84 . - ISSN 0020-7713
Перевод заглавия: Последовательности [нуклеотидов] в 5s рибосомальной рибонуклеиновой кислоте у Bacteroides и Fusobacterium: эволюционные взаимоотношения между этими родами и среди эубактерий в целом
Аннотация: Определена последовательность нуклеотидов в 5 S рРНК У Bacteroides fragilis, B. thetaiotaomicron, B. capillosus, B. veroralis, Porphysomonas gingivalis, Anaerorhadus furcosus, Fusobacterium nucleatus, F. mortiferum F. varium. Построены дендрограммы, отражающие положение полученного кластера Bacteroides-Cytophaga-Fusobacterium (I) в системе прокариот, а также взаимоотношения внутри I. Обнаруженные закономерности в целом согласуются с результатами анализа 16 spРНК у этих микроорганизмов, но имеются и некоторые расхождения. Так, по данным анализа 5S SpРНК, бактерии р. Bacteroides обладают наибольшим сродством к р. Cytophaga, а не к р. Fusobacterium, как предполагали ранее. Неожиданным результатом оказалось включение в I видов Chlorobium limicola и Streptococcus lactis var. cremoris. Обсуждаются проблемы таксономии рр. Bacteroides и Fusobacterium. Ил. 2. Табл. 1. Библ. 40. Бельгия, Univ. Antwerpen.

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.15
Рубрики: BACTEROIDES (BACT.)
FUSOBACTERIUM (BACT.)
CYTOPHAGA (BACT.)
СИСТЕМАТИКА
ТАКСОНОМИЯ
ПРОКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
Van, den Eynde Hilde; De, Baere Raymond; Shah, H.N.; Gharbia, S.E.; Fox, G.E.; Michalik, J.; Van, de Peer Y.; De, Wachter Rupert

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 93.08-04Б4.195

Al-Harbi, A. H.
The immune response of turbot, Scophthalmus maximus (L.) to lipopolysaccharide from a fishpathogenic Cytophaga-like bacterium [Text] / A. H. Al-Harbi, B. Austin // J. Fish Diseases. - 1992. - Vol. 15, N 5. - P449-452 . - ISSN 0140-7775
Перевод заглавия: Иммунный ответ у палтуса, Scophthalmus maximus к липополисахариду Cytophaga-подобных бактерий, патогенных для рыб
Аннотация: Исследовали влияние ЛПС, полученных от изолятов Cytophaga-подобных бактерий (ЦПБ), патогенных для рыб, на протективный иммунный ответ у палтусов. Рыбы поддерживались в условиях аквариума морской воды при аэрации, т-ре 16-18'ГРАДУС' С на специальной диете. ЦПБ были высеяны от б-ных рыб, культуру поддерживали на сердечно-мозговом агаре и пересевали каждые 2-3 недели. ЛПС экстрагировали из ЦПБ и использовали для иммунизации палтусов. Группам рыб, по 20 шт в каждой вводили ЛПС в/бр в дозе 0,2 мг один раз, дважды или трижды с интервалом в 7 дней в объеме 0,1 мл забуференного фосфатами физиол. р-ра (ЗФР). Аналогичная схема была использована для введения ЛПС в смеси полным или неполным адъювантом. Фрейнда (ПАФ, НАФ). Контрольная группа рыб получала только ЗФР. С помощью РПГА с эритроцитами барана определяли агглютинирующую способность Св, а также кожной и кишечной слизи иммунных и неиммунных рыб. Максим. титр обнаружен в Св после 3-х инфекции ЛПС в ЗФР (1:16 384), тогда как в группе получавших ЛПС с ПАФ он был 1:4096, а ЛПС с НАФ - всего 1:512. Максим. титр АТ в слизи выявлен после одной инъекции ЛПС. Рез-ты показали, что многоразовые инъекции ЛПС в ЗФР вызывали более сильный иммунный ответ, чем введение ЛПС в ЗФР или с адъювантом один или два раза. Табл. 3. Библ. 16. Великобритания, Heriot-Watt Univ., Edinburgh.

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.21.07.07
Рубрики: CYTOPHAGA (BACT.)
CYTOPHAGA-ПОДОБНЫЕ БАКТЕРИИ
ПАТОГЕННОСТЬ
ЛИПОПОЛИСАХАРИДЫ
ИММУНОГЕННОСТЬ
ПРОТЕКТИВНЫЕ СВОЙСТВА
РЫБЫ
ПАЛТУС
АНТИТЕЛА

Доп.точки доступа:
Austin, B.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 09.09-04А2.45

Alonso, Cecilia.
Roseobacter and SAR11 dominate microbial glucose uptake in coastal North Sea waters [Text] / Cecilia Alonso, Jakob Pernthaler // Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 11. - P2022-2030 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Преобладание Roseobacter и SAR11 в поглощении глюкозы в прибрежных водах Северного моря
Аннотация: Бактериальные сообщества в прибрежных пелагических местообитаниях подвержены выраженным временным и пространственным флюктуациям в доступности мономерных субстратов. Мало известно о р-ции отдельных бактериальных групп на такую вариабельность. В данной работе изучали поглощение глюкозы (Г) в разных конц-иях (0,1-100 нМ) бактериями, относящимися к Roseobacter, SAR11, гамма-протеобактериям и Cytophaga-Flavobacteria в прибрежных водах Северного моря поздней зимой и в течение весеннего цветения фитопланктона, в к-ром преобладал Phaeocystis sp. (март и май 2004 г., соответственно). И фракция ассимилирующих Г бактериальных клеток, и скорость поглощения субстрата на активную клетку были выше в мае. Соответствующие вклады изученных групп всех ассимилирующих Г бактерий были связаны с конц-ией субстрата. Большинство бактериальных клеток, поглощающих Г в более низких конц-иях, были членами кладов Roseobacter и SAR11. В оба временных момента исследований две группы формировали примерно равные фракции бактерий, ассимилирующих Г. Это обусловлено малой популяцией высоко активных клеток Roseobacter и высоким обилием бактерий SAR11 с низкими кол-вами поглощающих Г клеток. Напротив, пропорция активных клеток из линии родства Cytophoga-Flavobacteria существенно увеличивалась при более высоких уровнях доступного субстрата. Определение типов поглощения субстрата в зависимости от конц-ии может помочь лучше понять существование различных экофизиологических ниш популяций бактериопланктона. Швейцария, Limnological Station Kilchberg, Univ. of Zurich. E-mail: pernthaler@limnol.unizh.ch

ГРНТИ	34.35.33

ВИНИТИ 341.35.33.37.37.33.11
Рубрики: БАКТЕРИАЛЬНЫЕ СООБЩЕСТВА
ROSEOBACTER (BACT.)
CYTOPHAGA (BACT.)
FLAVOBACTERIA (BACT.)
ПРЕОБЛАДАНИЕ
БАКТЕРИОПЛАНКТОН
ГЛЮКОЗА
ПОГЛОЩЕНИЕ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
ПРИБРЕЖНЫЕ МЕСТООБИТАНИЯ

Доп.точки доступа:
Pernthaler, Jakob

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.04-04Б4.121

Alonso, Cecilia.
Roseobacter and SAR11 dominate microbial glucose uptake in coastal North Sea waters [Text] / Cecilia Alonso, Jakob Pernthaler // Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 11. - P2022-2030 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Преобладание Roseobacter и SAR11 в поглощении глюкозы в прибрежных водах Северного моря
Аннотация: Бактериальные сообщества в прибрежных пелагических местообитаниях подвержены выраженным временным и пространственным флюктуациям в доступности мономерных субстратов. Мало известно о р-ции отдельных бактериальных групп на такую вариабельность. В данной работе изучали поглощение глюкозы (Г) в разных конц-иях (0,1-100 нМ) бактериями, относящимися к Roseobacter, SAR11, гамма-протеобактериям и Cytophaga-Flavobacteria в прибрежных водах Северного моря поздней зимой и в течение весеннего цветения фитопланктона, в к-ром преобладал Phaeocystis sp. (март и май 2004 г., соответственно). И фракция ассимилирующих Г бактериальных клеток, и скорость поглощения субстрата на активную клетку были выше в мае. Соответствующие вклады изученных групп всех ассимилирующих Г бактерий были связаны с конц-ией субстрата. Большинство бактериальных клеток, поглощающих Г в более низких конц-иях, были членами кладов Roseobacter и SAR11. В оба временных момента исследований две группы формировали примерно равные фракции бактерий, ассимилирующих Г. Это обусловлено малой популяцией высоко активных клеток Roseobacter и высоким обилием бактерий SAR11 с низкими кол-вами поглощающих Г клеток. Напротив, пропорция активных клеток из линии родства Cytophoga-Flavobacteria существенно увеличивалась при более высоких уровнях доступного субстрата. Определение типов поглощения субстрата в зависимости от конц-ии может помочь лучше понять существование различных экофизиологических ниш популяций бактериопланктона. Швейцария, Limnological Station Kilchberg, Univ. of Zurich. E-mail: pernthaler@limnol.unizh.ch

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.02
Рубрики: БАКТЕРИАЛЬНЫЕ СООБЩЕСТВА
ROSEOBACTER (BACT.)
CYTOPHAGA (BACT.)
FLAVOBACTERIA (BACT.)
ПРЕОБЛАДАНИЕ
БАКТЕРИОПЛАНКТОН
ГЛЮКОЗА
ПОГЛОЩЕНИЕ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
ПРИБРЕЖНЫЕ МЕСТООБИТАНИЯ

Доп.точки доступа:
Pernthaler, Jakob

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.09-04Б2.97

Alonso, Cecilia.
Roseobacter and SAR11 dominate microbial glucose uptake in coastal North Sea waters [Text] / Cecilia Alonso, Jakob Pernthaler // Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 11. - P2022-2030 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Преобладание Roseobacter и SAR11 в поглощении глюкозы в прибрежных водах Северного моря
Аннотация: Бактериальные сообщества в прибрежных пелагических местообитаниях подвержены выраженным временным и пространственным флюктуациям в доступности мономерных субстратов. Мало известно о р-ции отдельных бактериальных групп на такую вариабельность. В данной работе изучали поглощение глюкозы (Г) в разных конц-иях (0,1-100 нМ) бактериями, относящимися к Roseobacter, SAR11, гамма-протеобактериям и Cytophaga-Flavobacteria в прибрежных водах Северного моря поздней зимой и в течение весеннего цветения фитопланктона, в к-ром преобладал Phaeocystis sp. (март и май 2004 г., соответственно). И фракция ассимилирующих Г бактериальных клеток, и скорость поглощения субстрата на активную клетку были выше в мае. Соответствующие вклады изученных групп всех ассимилирующих Г бактерий были связаны с конц-ией субстрата. Большинство бактериальных клеток, поглощающих Г в более низких конц-иях, были членами кладов Roseobacter и SAR11. В оба временных момента исследований две группы формировали примерно равные фракции бактерий, ассимилирующих Г. Это обусловлено малой популяцией высоко активных клеток Roseobacter и высоким обилием бактерий SAR11 с низкими кол-вами поглощающих Г клеток. Напротив, пропорция активных клеток из линии родства Cytophoga-Flavobacteria существенно увеличивалась при более высоких уровнях доступного субстрата. Определение типов поглощения субстрата в зависимости от конц-ии может помочь лучше понять существование различных экофизиологических ниш популяций бактериопланктона. Швейцария, Limnological Station Kilchberg, Univ. of Zurich. E-mail: pernthaler@limnol.unizh.ch

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: БАКТЕРИАЛЬНЫЕ СООБЩЕСТВА
ROSEOBACTER (BACT.)
CYTOPHAGA (BACT.)
FLAVOBACTERIA (BACT.)
ПРЕОБЛАДАНИЕ
БАКТЕРИОПЛАНКТОН
ГЛЮКОЗА
ПОГЛОЩЕНИЕ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
ПРИБРЕЖНЫЕ МЕСТООБИТАНИЯ

Доп.точки доступа:
Pernthaler, Jakob

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.15Д

Amann, Rudolf.
Die 'бета'-Untereinheit der ATP-Synthase als phylogenetischer Market bei den Eubacterien [Text] : diss : Дис. на соиск. учен. степ.Dokt. Naturwiss / Rudolf Amann ; Fak. Chem., Biol. und Geowiss. Techn. Univ. Munchen. - Biol. und Geowiss. Techn. Univ. Munchen, 1988. - 123 с. : ил.
Перевод заглавия: 'бета'-субъединица АТФазы как филогенетический маркер у эубактерий
Аннотация: Протонная АТФаза (I) состоит из двух частиц, F[1] и F[0]. F[1], легкоизвлекаемая с сохранением нативной четвертичной структуры и функции, состоит из субъединиц (II), расположенных гексагонально. Приведен обзор данных о генетике I. 'бета'-II, входящая в состав F[1], выполняет ферментативную функцию, имеет наиболее консервативную первичную структуру изо всех II и поэтому подходит в кач-ве филогенетического маркера для эубактерий. В работе клонированы и секвенированы гены 'бета'-II из Bacteroides fragilis, Cytophaga lytica, Flavobacterium ferrugineum, "Taxerbacter ocellatus", Propionigenium modestum, Enterobacter aerogenes. Полученные нуклеотидные последовательности подтверждают консервативность 'бета'-II. Выведенные первичные структуры сравнены с последовательностями 'бета'-II из др. эубактерий, а также из хлоропластов табака и митохондрий сердца быка и выстроены в ряды. Миним. гомология найдена для пары В. fragilis и хлоропласты табака, макс. - для пары Е. aerogenes i E. coli. Определены пороговые значения гомологии 'бета'-II одной и той же и различных филогенетических линий. В Na+-переносящей I из P. modestum не обнаружено специфических отклонений. Состав кодонов для 'бета'-II хорошо коррелирует с содержанием ГЦ пар, но не обнаруживает генной или групповой специфичности. По определенным аминокислотным последовательностям построено филогенетическое древо, согласующееся с данными по последовательностям 16SРНК. Гены 'бета'-II из B. fragilis, C. lytica, F. ferrugineum и "T. ocellatus" отличались двумя характерными инсерционными последовательностями. Эти результаты дают основание для объединения Cytophaga и Flavobacterium с Bacteroides в единой линии развития.

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.07 + 341.27.21.02.21
Рубрики: ЭУБАКТЕРИИ
ФИЛОГЕНИЯ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ МАРКЕР
АТФАЗА
СУБЪЕДИНИЦА*БЕТА-
КОНСЕРВАТИВНОСТЬ
ГОМОЛОГИЯ
КЛОНИРОВАНИЕ ГЕНА
СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНА
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 70
BACTERIOIDES (BACT.)
CYTOPHAGA (BACT.)
FLAVOBACTERIUM (BACT)

Доп.точки доступа:
Fak. Chem., Biol. und Geowiss. Techn. Univ. Munchen
Свободных экз. нет

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 89.12-04Б4.144Д

Amann, Rudolf.
Die 'бета'-Untereinheit der ATP-Synthase als phylogenetischer Market bei den Eubakterien [Text] : diss : Дис. на соиск. учен. степ.Dokt. Naturwiss. / Rudolf Amann ; Fak. Chem., Biol. und Geowiss. Techn. Univ. Munchen. - Biol. und Geowiss. Techn. Univ. Munchen, 1988. - 123 с. : ил.
Перевод заглавия: 'бета'-субъединица АТФазы как филогенетический маркер у эубактерий
Аннотация: Протонная АТФаза (I) состоит из двух частиц, F[1] и F[0], F[1], легко извлекаемая с сохранением нативной четвертичной структуры и функции, состоит из субъединиц (II), расположенных гексагонально. Приведен обзор данных о генетике I. 'бета'-II, входящая в состав F[1], выполняет ферментативную функцию, имеет наиболее консервативную первичную структуру изо всех II и поэтому подходит в кач-ве филогенетического маркера для эубактерий. В работе клонированы и секвенированы гены 'бета'-II из Bacteroides fragilis, Cytophaga lytica, Flavobacterium ferrugineum, "Taxeobacter ocellatus", Propionigenium modestum, Enterobacter aerogenes. Полученные нуклеотидные последовательности подтверждают консервативность 'бета'-II. Выведенные первичные структуры сравнены с последовательностями 'бета'-II из др. эубактерий, а также из хлоропластов табака и митохондрий сердца быка и выстроены в ряды. Миним. гомология найдена для пары B. fragilis и хлоропласты табака, макс. - для пары E. aerogenes и E. coli. Определены пороговые значения гомологии 'бета'-II одной и той же и различных филогенетических линий. В Na+переносящей I из P. modestum не обнаружено специфических отклонений. Состав кодонов для 'бета'-II хорошо коррелирует с содержанием ГЦ пар, но не обнаруживает генной или групповой специфичности. По определенным аминокислотным последовательностям построено филогенетическое древо, согласующееся с данными по последовательностями 16 S РНК. Гены 'бета'-II из B. fragilis, C. lytica, F. ferrugineum и "T. ocellatus" отличались двумя характерными инсерционными последовательностями. Эти результаты дают основание для объединения Cytophaga и Flavobacterium с Bacteroides в единой линии развития.

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.02
Рубрики: ЭУБАКТЕРИИ
ФИЛОГЕНИЯ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ МАРКЕР
АТФАЗА
СУБЪЕДИНИЦА*БЕТА-
КОНСЕРВАТИВНОСТЬ
ГОМОЛОГИЯ
КЛОНИРОВАНИЕ ГЕНА
СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНА
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 70
BACTEROIDES (BACT.)
CYTOPHAGA (BACT.)
FLAVOBACTERIUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Fak. Chem., Biol. und Geowiss. Techn. Univ. Munchen
Свободных экз. нет

РЖ ВИНИТИ 68 (BI13) 98.06-04Б3.177

Analysis of bacterial communithy structure in bulk soil by in situ hybridization [Text] / Boris Zarda [et al.] // Arch. Microbiol. - 1997. - Vol. 168, N 3. - P185-192 . - ISSN 0302-8933
Перевод заглавия: Анализ структуры бактериального сообщества в почвенной массе методом гибридизации in situ
Аннотация: Гибридизацией in situ с флуоресцентно меченными (Cy3-меченными) РНК-олигонуклеотидными зондами проанализирована структура бактериального сообщества. Почву подготавливали для анализа обработкой этанолом или параформальдегидом после гомогенизации образцов почвы в 0,1% пирофосфате и обработки УЗ умеренной интенсивности. Бактериальный зонд Eub338 позволял выявить в фиксированных этанолом и параформальдегидом 37'+-'7% и 41'+-'8% клеток, окрашиваемых 4',6-диамидино-2-фенилиндолом. Отмечено, что после 7 месяцев хранения обнаруживаемость бактерий возрастала за счет протеобактерий. Приблизительно половину бактерий, выявляемых зондом Eub338, можно отнести к основным филогенетическим группам: альфа, бета, гамма и дельта-подгруппам протеобактерий, грамположительным бактериям с высоким содержанием Г+Ц в ДНК, бактериям кластера Cytophaga - Flavobacterium и планктомицетам. Преобладают члены альфа-подгруппы протеобактерий (44'+-'16*10{8} клеток в 1 г сухой почвы) и планктомицеты (32'+-'12*10{8} клеток в 1 г сухой почвы). Значение последних в почве еще неясно. Швейцария, Swiss Federal Inst. Technol. (ETH Zurich), Inst. Terrestrial Ecology, Soil Biol., CH-8952 Schlieren. Библ. 59

ГРНТИ	68.03.07

ВИНИТИ 681.03.07.02
Рубрики: ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫЕ ЗОНДЫ
РНК-ЗОНДЫ
ГИБРИДИЗАЦИЯ IN SITU
БАКТЕРИАЛЬНЫЙ ЗОНД EUB338
ПОЧВА
БАКТЕРИАЛЬНОЕ СООБЩЕСТВО
СТРУКТУРА
АНАЛИЗ
ПЛАНКТОМИЦЕТЫ
CYTOPHAGA - FLAVOBACTERIUM КЛАСТЕР
ПРОТЕОБАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Zarda, Boris; Hahn, Dittmar; Chatzinotas, Antonis; Schonhuber, Wilhelm; Neef, Alexander; Amann, Rudolf I.; Zeyer, Josef

10.

РЖ ВИНИТИ 68 (BI02) 98.08-04В8.171

Analysis of bacterial communithy structure in bulk soil by in situ hybridization [Text] / Boris Zarda [et al.] // Arch. Microbiol. - 1997. - Vol. 168, N 3. - P185-192 . - ISSN 0302-8933
Перевод заглавия: Анализ структуры бактериального сообщества в почвенной массе методом гибридизации in situ
Аннотация: Гибридизацией in situ с флуоресцентно меченными (Cy3-меченными) РНК-олигонуклеотидными зондами проанализирована структура бактериального сообщества. Почву подготавливали для анализа обработкой этанолом или параформальдегидом после гомогенизации образцов почвы в 0,1% пирофосфате и обработки УЗ умеренной интенсивности. Бактериальный зонд Eub338 позволял выявить в фиксированных этанолом и параформальдегидом 37'+-'7% и 41'+-'8% клеток, окрашиваемых 4',6-диамидино-2-фенилиндолом. Отмечено, что после 7 месяцев хранения обнаруживаемость бактерий возрастала за счет протеобактерий. Приблизительно половину бактерий, выявляемых зондом Eub338, можно отнести к основным филогенетическим группам: альфа, бета, гамма и дельта-подгруппам протеобактерий, грамположительным бактериям с высоким содержанием Г+Ц в ДНК, бактериям кластера Cytophaga - Flavobacterium и планктомицетам. Преобладают члены альфа-подгруппы протеобактерий (44'+-'16*10{8} клеток в 1 г сухой почвы) и планктомицеты (32'+-'12*10{8} клеток в 1 г сухой почвы). Значение последних в почве еще неясно. Швейцария, Swiss Federal Inst. Technol. (ETH Zurich), Inst. Terrestrial Ecology, Soil Biol., CH-8952 Schlieren. Библ. 59

ГРНТИ	68.05.45

ВИНИТИ 681.05.45.13
Рубрики: ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫЕ ЗОНДЫ
РНК-ЗОНДЫ
ГИБРИДИЗАЦИЯ IN SITU
БАКТЕРИАЛЬНЫЙ ЗОНД EUB338
ПОЧВА
БАКТЕРИАЛЬНОЕ СООБЩЕСТВО
СТРУКТУРА
АНАЛИЗ
ПЛАНКТОМИЦЕТЫ
CYTOPHAGA - FLAVOBACTERIUM КЛАСТЕР
ПРОТЕОБАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Zarda, Boris; Hahn, Dittmar; Chatzinotas, Antonis; Schonhuber, Wilhelm; Neef, Alexander; Amann, Rudolf I.; Zeyer, Josef

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.07-04Б2.246

Analysis of bacterial communithy structure in bulk soil by in situ hybridization [Text] / Boris Zarda [et al.] // Arch. Microbiol. - 1997. - Vol. 168, N 3. - P185-192 . - ISSN 0302-8933
Перевод заглавия: Анализ структуры бактериального сообщества в почвенной массе методом гибридизации in situ
Аннотация: Гибридизацией in situ с флуоресцентно меченными (Cy3-меченными) РНК-олигонуклеотидными зондами проанализирована структура бактериального сообщества. Почву подготавливали для анализа обработкой этанолом или параформальдегидом после гомогенизации образцов почвы в 0,1% пирофосфате и обработки УЗ умеренной интенсивности. Бактериальный зонд Eub338 позволял выявить в фиксированных этанолом и параформальдегидом 37'+-'7% и 41'+-'8% клеток, окрашиваемых 4',6-диамидино-2-фенилиндолом. Отмечено, что после 7 месяцев хранения обнаруживаемость бактерий возрастала за счет протеобактерий. Приблизительно половину бактерий, выявляемых зондом Eub338, можно отнести к основным филогенетическим группам: альфа, бета, гамма и дельта-подгруппам протеобактерий, грамположительным бактериям с высоким содержанием Г+Ц в ДНК, бактериям кластера Cytophaga - Flavobacterium и планктомицетам. Преобладают члены альфа-подгруппы протеобактерий (44'+-'16*10{8} клеток в 1 г сухой почвы) и планктомицеты (32'+-'12*10{8} клеток в 1 г сухой почвы). Значение последних в почве еще неясно. Швейцария, Swiss Federal Inst. Technol. (ETH Zurich), Inst. Terrestrial Ecology, Soil Biol., CH-8952 Schlieren. Библ. 59

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.11
Рубрики: ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫЕ ЗОНДЫ
РНК-ЗОНДЫ
ГИБРИДИЗАЦИЯ IN SITU
БАКТЕРИАЛЬНЫЙ ЗОНД EUB338
ПОЧВА
БАКТЕРИАЛЬНОЕ СООБЩЕСТВО
СТРУКТУРА
АНАЛИЗ
ПЛАНКТОМИЦЕТЫ
CYTOPHAGA - FLAVOBACTERIUM КЛАСТЕР
ПРОТЕОБАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Zarda, Boris; Hahn, Dittmar; Chatzinotas, Antonis; Schonhuber, Wilhelm; Neef, Alexander; Amann, Rudolf I.; Zeyer, Josef

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.02-04Б2.165

arfI and arfII, two genes encoding 'альфа'-L-arabinofuranosidases in Cytophaga xylanolytica [Text] / Kwi S. Kim [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 1998. - Vol. 64, N 5. - P1919-1923 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Два гена, arfI и arfII, кодирующие 'альфа'-L-арабинофуранозидазу у Cytophaga xylanolytica
Аннотация: Удалось клонировать и секвенировать гены arfI и arfII, кодирующие 2 субъединицы арабинофуранозидазы I Cytophaga xylanolytica. Продукты обоих клонированных генов способны высвобождать арабинозу из арабинана и арабиноксилана. Аминокислотные последовательности субъединиц ArfI и ArfII содержат определенное кол-во районов, идентичных друг другу и районам в гомологичных белках Bacillus ovatus, Bacillus subtilis и Clostridium stercorarium. США, (Breznak J. A.) Dep. of Microbiol. and Center for Microb. Ecol., Michigan State Univ., East Lansing, MI 48824-1101. Библ. 10

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: CYTOPHAGA XYLANOLYTICA (BACT.)
ГЕНЫ
ГЕН ARFI
ГЕН ARFII
ГЕНЫ 'АЛЬФА'-L-АРАБИНОФУРАНОЗИДАЗЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ГОМОЛОГИЯ

Доп.точки доступа:
Kim, Kwi S.; Lilburn, Timothy G.; Renner, Michael J.; Breznak, John A.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 94.08-04Б2.101

Artursson, E.
A phosphatidylinositol-specific phospholipase C from Cytophaga: production, purification, and properties [Text] / E. Artursson, G. Puu // Can. J. Microbiol. - 1992. - Vol. 38, N 12. - P1334-1337 . - ISSN 0008-4166
Перевод заглавия: Фосфатидилинозитол-специфическая фосфолипаза C из Cytophaga: синтез, выделение и свойства
Аннотация: Внеклеточная фосфатидилинозитол-специфическая фосфолипаза С (I) была выделена из Cytophaga sp. NCMB 1314. Оптимизированы условия роста Cytophaga sp. и продукции I, разработана схема ее очистки. Фермент характеризовался небольшой мол. массой, его активность не зависела от наличия ионов металлов. I имела сравнительно низкую кажущуюся К 0,2 мМ для фосфатидилинозитола, и не стимулировалась дезоксихолатом. I способствует высвобождению щелочной фосфатазы из почек крыс и холинэстеразы из мышечных тканей камболы, но не ацетилхолинэстеразы из интактных крысиных или свиных эритроцитов. Швеция, Nat. Defence Res. Establishment, Div. of Biomedicine, S-90182 Umea.

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: CYTOPHAGA SP. (FUNGI)
ШТАММ NCMB 1314
ФЕРМЕНТЫ
ФОСФОЛИПАЗА С
ФОСФАТИДИЛИНОЗИТОЛ-ЗАВИСИМАЯ ФОСФОЛИПАЗА
БИОСИНТЕЗ
ВЫДЕЛЕНИЕ
СВОЙСТВА
БИОЛОГИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Puu, G.

14.

РЖ ВИНИТИ 68 (BI13) 09.08-04Б3.196

Becker, Phoenix.
Characterization of bacteria associated with lobster shell disease [Text] : тез. [General Scientific Meetings of the Marine Biological Laboratory, Woods Hole, Mass., 9-10 Aug., 2004] / Phoenix Becker, Roxanna Smolowitz // Biol. Bull. - 2004. - Vol. 207, N 2. - P171 . - ISSN 0006-3185
Перевод заглавия: Характеристика бактерий, ассоциированных с болезнью раковин омаров
Аннотация: Болезнь раковин омаров (LSD) - условия, к-рое влияет на наружные три слоя щитка омаров, и в результате сильно повреждается наружный скелет. Считают, что возбудитель LSD - хитинолитические бактерии. В настоящее время бактерии, ассоциированные с LSD в р-оне Новой Англии, были идентифицированы на основании последовательностей 16S рДНК. Американские омары, Homarus americanus, с LSD были собраны в штатах Род-Айленд, Коннектикут, Массачусетс и Мэн. Бактерии были выделены из повреждений и по-отдельности культивировались. Геномная ДНК была экстрагирована из бактерий, и использованы 2 праймера для амплификации сегмента ('ЭКВИВ'1500 п. н.) 16S рДНК. Отдельные фракции были клонированы и секвенированы. Последовательности идентифицированы на основании гомологии последовательностей с помощью NCBI's BLAST сервера. Большинство идентифицированных бактерий принадлежали к группам Cytophaga - Flavobacter и 'альфа'-Proteobacteria. Др. идентифицированные бактерии включали представителей рр. Oceanobacillus, Staphylococcus и Vibrio. Рез-ты показывают, что могут быть специфические геопространственные типы распределения для определенных выделенных бактерий. Напр., большинство видов Cellulophaga обнаружены в штате Мэн, а виды Oceanobacillus - в омарах из Род-Айленда. Эти данные означают, что бактериальные виды, принадлежащие к группам Cytophaga-Flavobacter и 'альфа'-Proteobacteria, наиболее вероятно являются возбудителями LSD, т. к. почти все собранные образцы содержали бактерии, родственные этим группам. США, Marine Biol. Lab., Woods Hole, MA

ГРНТИ	68.03.07

ВИНИТИ 681.03.07.21
Рубрики: ХИТИНОЛИТИЧЕСКИЕ БАКТЕРИИ
БОЛЕЗНЬ РАКОВИН ОМАРОВ
CYTOPHAGA (BACT.)
FLAVOBACTER (BACT.)
'АЛЬФА'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
OCEANOBACILLUS (BACT.)
CELLULOPHAGA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Smolowitz, Roxanna

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.06-04Б2.181

Becker, Phoenix.
Characterization of bacteria associated with lobster shell disease [Text] : тез. [General Scientific Meetings of the Marine Biological Laboratory, Woods Hole, Mass., 9-10 Aug., 2004] / Phoenix Becker, Roxanna Smolowitz // Biol. Bull. - 2004. - Vol. 207, N 2. - P171 . - ISSN 0006-3185
Перевод заглавия: Характеристика бактерий, ассоциированных с болезнью раковин омаров
Аннотация: Болезнь раковин омаров (LSD) - условия, к-рое влияет на наружные три слоя щитка омаров, и в результате сильно повреждается наружный скелет. Считают, что возбудитель LSD - хитинолитические бактерии. В настоящее время бактерии, ассоциированные с LSD в р-оне Новой Англии, были идентифицированы на основании последовательностей 16S рДНК. Американские омары, Homarus americanus, с LSD были собраны в штатах Род-Айленд, Коннектикут, Массачусетс и Мэн. Бактерии были выделены из повреждений и по-отдельности культивировались. Геномная ДНК была экстрагирована из бактерий, и использованы 2 праймера для амплификации сегмента ('ЭКВИВ'1500 п. н.) 16S рДНК. Отдельные фракции были клонированы и секвенированы. Последовательности идентифицированы на основании гомологии последовательностей с помощью NCBI's BLAST сервера. Большинство идентифицированных бактерий принадлежали к группам Cytophaga - Flavobacter и 'альфа'-Proteobacteria. Др. идентифицированные бактерии включали представителей рр. Oceanobacillus, Staphylococcus и Vibrio. Рез-ты показывают, что могут быть специфические геопространственные типы распределения для определенных выделенных бактерий. Напр., большинство видов Cellulophaga обнаружены в штате Мэн, а виды Oceanobacillus - в омарах из Род-Айленда. Эти данные означают, что бактериальные виды, принадлежащие к группам Cytophaga-Flavobacter и 'альфа'-Proteobacteria, наиболее вероятно являются возбудителями LSD, т. к. почти все собранные образцы содержали бактерии, родственные этим группам. США, Marine Biol. Lab., Woods Hole, MA

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.17
Рубрики: ХИТИНОЛИТИЧЕСКИЕ БАКТЕРИИ
БОЛЕЗНЬ РАКОВИН ОМАРОВ
CYTOPHAGA (BACT.)
FLAVOBACTER (BACT.)
'АЛЬФА'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
OCEANOBACILLUS (BACT.)
CELLULOPHAGA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Smolowitz, Roxanna

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 04.09-04Б3.18

Bermandet, Jean-Francois.
International Committee on Systematics of Prokaryotes. Subcommittee on the taxonomy of Flavobacterium- and Cytophaga-like bacteria. Minutes of the meetings, 30 July 2002, Paris [Text] / Jean-Francois Bermandet // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2004. - Vol. 54, N 1. - P285-287 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Международный комитет по систематике прокариот. Подкомитет по таксономии Flavobacterium- и Cytophaga-подобных бактерий. Протокол совещаний 30 июля 2002, Париж, Франция
Аннотация: Сессия 1. Закрытое совещание. В протоколе указано время и место проведения совещания, имена председателя и присутствовавших лиц, основные вопросы повестки дня, изменения в составе комитета, планы на будущее. Сессия 2. Открытое совещание. Обсуждались вопросы таксономии бактерий группы Flavobacterium-Cytophaga, минимальные стандарты для описания таксонов Flavobacteriaceae, вопросы таксономии бактерий филума Bacterioidetes и их отражение в готовящемся к публикации 2-м издании Определителя Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (http:dx.doi.org/10/1007/bergeysoutline200210)

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: ПРОКАРИОТЫ
СИСТЕМАТИКА
FLAVOBACTERIUM (BACT.)
CYTOPHAGA (BACT.)

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.08-04Б2.20

Bermandet, Jean-Francois.
International Committee on Systematics of Prokaryotes. Subcommittee on the taxonomy of Flavobacterium- and Cytophaga-like bacteria. Minutes of the meetings, 30 July 2002, Paris [Text] / Jean-Francois Bermandet // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2004. - Vol. 54, N 1. - P285-287 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Международный комитет по систематике прокариот. Подкомитет по таксономии Flavobacterium- и Cytophaga-подобных бактерий. Протокол совещаний 30 июля 2002, Париж, Франция
Аннотация: Сессия 1. Закрытое совещание. В протоколе указано время и место проведения совещания, имена председателя и присутствовавших лиц, основные вопросы повестки дня, изменения в составе комитета, планы на будущее. Сессия 2. Открытое совещание. Обсуждались вопросы таксономии бактерий группы Flavobacterium-Cytophaga, минимальные стандарты для описания таксонов Flavobacteriaceae, вопросы таксономии бактерий филума Bacterioidetes и их отражение в готовящемся к публикации 2-м издании Определителя Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (http:dx.doi.org/10/1007/bergeysoutline200210)

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: ПРОКАРИОТЫ
СИСТЕМАТИКА
FLAVOBACTERIUM (BACT.)
CYTOPHAGA (BACT.)

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 92.02-04Б2.180

Bohn, J. R.
Fragmentation of heparin by enzymes from newly isolated microorganisms [Text] / J. R. Bohn, M. K. Otto, K. D. Kulbe // Arzneim.-forsch. - 1991. - Vol. 41, N 4. - P456-460 . - ISSN 0004-4172
Перевод заглавия: Фрагментация гепарина ферментами из вновь выделенных микроорганизмов
Аннотация: Из образцов почвы и воды Европы, Азии и Австралии выделен ряд микроорганизмов, разрушающих гепарин (I) - высокосульфатированный анионный гликозаминогликан. Наиболее активный штамм идентифицирован как Cytophaga, однако он отличается от известного штамма C. heparina морфологией клеток, метаболизмом сахаров и типом усвоения I. Новый штамм синтезирует ряд ферментов: экзо- и эндолиазу, сульфатазу, экзогидролазу, к-рые катализируют расщепление I до фрагментов с низкой мол. массой. Библ. 17. ФРГ, Fraunhofer-Inst. fur Grenzflachen- und Bioverfahrenstechnik, Abteilung Technische Biochemie, Stuttgart.

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.13
Рубрики: CYTOPHAGA (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ
ГЕПАРИН
БИОДЕГРАДАЦИЯ
ФЕРМЕНТЫ

Доп.точки доступа:
Otto, M.K.; Kulbe, K.D.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.08-04Б2.110

Bruns, Alke.
In situ detection of bacteria in continuous-flow cultures of seawater sediment suspensions with fluorescently labelled rRNA-directed oligonucleotide probes [Text] / Alke Bruns, Luise Berthe-Corti // Microbiology. - 1998. - Vol. 144, N 10. - P2783-2790 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Обнаружение in situ бактерий в непрерывно-проточных культурах суспензий морских донных отложений флуоресцентно меченными рРНК-олигонуклеотидными зондами
Аннотация: Получены данные, подтверждающие эффективность применения гибридизации in situ в определении структуры природных популяций, растущих в суспензиях донных отложений. Культуры выращивались как обогатительные, с увеличивающимися скоростями разбавления, с гексадеканом в качестве единственного источника углерода. Общее кол-во клеток оценивалось путем подсчета клеток, окрашенных 4,6-диамидино-2-фенилиндолом (ДАФИ). Для определения состава бактериальной популяции использованы олигонуклеотидные зонды для эубактерий, Cytophaga/Flavobacteria и для четырех подклассов протеобактерий ('альфа', 'бета', 'гамма' и 'дельта'). С помощью зонда EUB338 можно обнаружить около 40-80% окрашенных ДАФИ клеток. Можно также выявить сдвиг в составе природной бактериальной популяции при увеличении скорости разбавления в непрерывной культуре от больших кол-в Cytophaga/Flavobacteria к большим кол-вам членов 'гамма'-протеобактерий. Германия, Fachbereich Biol., C.v.O. Univ. Oldenburg, PO Box 2503, D-26111 Oldenburg. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: ГИБРИДИЗАЦИЯ IN SITU
ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫЕ ЗОНДЫ
РРНК-ЗОНДЫ
ФЛУОРЕСЦЕНТНАЯ МЕТКА
ДОННЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ
МОРСКИЕ ОТЛОЖЕНИЯ
ОБНАРУЖЕНИЕ БАКТЕРИЙ
ПРОТЕОБАКТЕРИИ
CYTOPHAGA
FLAVOBACTERIUM

Доп.точки доступа:
Berthe-Corti, Luise

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 99.08-04Б3.34

Bruns, Alke.
In situ detection of bacteria in continuous-flow cultures of seawater sediment suspensions with fluorescently labelled rRNA-directed oligonucleotide probes [Text] / Alke Bruns, Luise Berthe-Corti // Microbiology. - 1998. - Vol. 144, N 10. - P2783-2790 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Обнаружение in situ бактерий в непрерывно-проточных культурах суспензий морских донных отложений флуоресцентно меченными рРНК-олигонуклеотидными зондами
Аннотация: Получены данные, подтверждающие эффективность применения гибридизации in situ в определении структуры природных популяций, растущих в суспензиях донных отложений. Культуры выращивались как обогатительные, с увеличивающимися скоростями разбавления, с гексадеканом в качестве единственного источника углерода. Общее кол-во клеток оценивалось путем подсчета клеток, окрашенных 4,6-диамидино-2-фенилиндолом (ДАФИ). Для определения состава бактериальной популяции использованы олигонуклеотидные зонды для эубактерий, Cytophaga/Flavobacteria и для четырех подклассов протеобактерий ('альфа', 'бета', 'гамма' и 'дельта'). С помощью зонда EUB338 можно обнаружить около 40-80% окрашенных ДАФИ клеток. Можно также выявить сдвиг в составе природной бактериальной популяции при увеличении скорости разбавления в непрерывной культуре от больших кол-в Cytophaga/Flavobacteria к большим кол-вам членов 'гамма'-протеобактерий. Германия, Fachbereich Biol., C.v.O. Univ. Oldenburg, PO Box 2503, D-26111 Oldenburg. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.07.09
Рубрики: ГИБРИДИЗАЦИЯ IN SITU
ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫЕ ЗОНДЫ
РРНК-ЗОНДЫ
ФЛУОРЕСЦЕНТНАЯ МЕТКА
ДОННЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ
МОРСКИЕ ОТЛОЖЕНИЯ
ОБНАРУЖЕНИЕ БАКТЕРИЙ
ПРОТЕОБАКТЕРИИ
CYTOPHAGA
FLAVOBACTERIUM

Доп.точки доступа:
Berthe-Corti, Luise

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска