Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>A=Van, de Peer Yves$<.>)
Общее количество найденных документов : 24
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-24 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.11-04Б2.88

   
    The nucleotide sequence of the small ribosomal subunit RNA on the yeast Candida albicans and the evolutionary position of the fungi among the eukaryotes [Text] / Lydia Hendriks [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 1989. - Vol. 12, N 3. - P223-229 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Нуклеотидная последовательность малых рибосомальных субъединиц РНК дрожжей Candida albicans и эволюционное положение грибов среди эукариот
Аннотация: Установлена полная последовательность рРНК у дрожжей С. albicans, к-рая состоит из 1788 нуклеотидов. К настоящему времени такие данные известны примерно для 60 организмов, к-рые использованы для построения филогенетического древа. Полученные рез-ты свидетельствуют о ранней дивергенции в процессе эволюции таких групп как споровики, амебы, миксомицеты, эвгленовые. Позднее в относительные краткие временные интервалы возникло разделение на группы, представляющие жгутиковые, животные, грибы и зеленые растерия, данные по C. albicans podtbervda[ф]t, to qti nesoberhennye drovvi prinadlevat k askomicetnym organizmam. Predlovena takve model[и] btorinoj struktury izuennoj RNK. [м]el[и]gi, Dep. Biochem., Univ. Antwerpen (UIA), В-2610 Antwerpen.
ГРНТИ  
34.27.15
ВИНИТИ 341.27.15.09
Рубрики: РРНК
МАЛЫЕ РИБОСОМАЛЬНЫЕ СУБЪЕДИНИЦЫ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
CANDIDA ALBICANS (FUNGI)
ЭВОЛЮЦИЯ
ЭВОЛЮЦИЯ ДРОЖЖЕЙ

Доп.точки доступа:
Hendriks, Lydia; Goris, Anne; Neefs, Jean-Marc; Van, de Peer Yves; Hennebert, Gregoire; Wachter, Rupert de

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.06-04Б2.50

   
    5S rRNA sequences of myxobacteria and radioresistant bacteria and implications for eubacterial evolution [Text] / den Eynde Hilde Van [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1990. - Vol. 40, N 4. - P399-404 . - ISSN 0020-7713
Перевод заглавия: Последовательность 5SрРНК у миксобактерий и радиорезистентных бактерий и значение для эволюции эубактерий
Аннотация: Определена последовательность нуклеотидов в 5S рРНК миксобактерий Cystobacter fuscus, Myxococcus coralloides, Sorangium cellulosum, Nannocystis exedens и радиорезистентных бактерий Deinococcus radiodurans и D. radiophilus. На основании полученных и имевшихся ранее данных построены дендрограммы, отражающие филогенетические взаимоотношения между ними. Отмечается, что бактерии р. Deinococcus образуют вместе с представителями р. Thermus 1 кластер, к-рый располагается на дендрограмме между 'альфа'- и 'бета'подгруппами класса Proteobacteria. Миксотрофные бактерии входят в состав 'дельта'-подгруппы Proteobacteria. Обсуждаются сходства и различия дендрограмм, построенных на основе 5S и 16S рРНК. Библ. 50. Бельгия, Dep. Biochemie, Univ. Antwerpen (UIA), В-2610 Antwerp.
ГРНТИ  
34.27.15
ВИНИТИ 341.27.15.09
Рубрики: МИКСОБАКТЕРИИ
РАДИОРЕЗИСТЕНТНЫЕ БАКТЕРИИ
ФИЛОГЕНИЯ
РРНК
РРНК 5S
РРНК 16S
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
DEINOCOCCUS (BACT.)
MYXOCOCCUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Van, den Eynde Hilde; Van, de Peer Yves; Vandenabeele, Hilde; Van, Bogaer Mark; De, Wachter Rupert

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI17) 91.04-04И1.59

   
    The 18S ribosomal RNA sequence of the sea anemone Anemonia sulcata and its efolutionary position among other eukaryotes [Text] / Lydia Hendriks Hendriks [et al.] // FEBS Lett. - 1990. - Vol. 269, N 2. - P445-449 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Последовательность рибосомной РНК оседающей при 18S, из актинии Anemonia sulcata и ее эволюционное положение среди других эукариот
Аннотация: Ген РНК малой субъединицы рибосомы актинии содержит 1799 нуклеотидов. Построена модель вторичной структуры этой РНК. Проведено сравнение со структурой соответствующей РНК зеленых растений, амеб, аскомицетов, динофлагеллят, инфузорий, споровиков и Metazoa. По этому признаку построено эволюционное древо. Актиния составляет на нем монофилетическую группу с Bilateria. Бельгия, Dep. Biochemie, Univ. Antwerpen (UIA), Universiteitsplein 1, В-2610 Antwerpen, Библ. 25.
ГРНТИ  
34.33.15
ВИНИТИ 341.33.15.15.15.11
Рубрики: КОРАЛЛОВЫЕ ПОЛИПЫ
ANEMONIA SULCATA (ANTH.)
РНК
СТРУКТУРА
ЭВОЛЮЦИЯ

Доп.точки доступа:
Hendriks, Lydia Hendriks; Van, de Peer Yves; Van, Herck Martine; Neefs, Jean-Marc; De, Wachter Rupert

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.11-04Б2.79

   
    5S rRNA sequences of representatives of the genera Chlorobium, Prosthecochloris, Thermomicrobium, Cytophaga, Flavobacterium, Flexibacter and Saprospira and a discussion of the evolution of eubacteria in general [Text] / den Eynde Hilde Van [et al.] // J. Gen. Microbiol. - 1990. - Vol. 136, N 1. - P11-18 . - ISSN 0022-1287
Перевод заглавия: Последовательность 5S рНК у представителей родов Chlorobium, Prostechochloris, Thermomicrobium, Cytophaga, Flavobacterium, Flexibacter и Saprospira и обсуждение эволюции бактерий в целом
Аннотация: Исследовали последовательность оснований в 5S рРНК у представителей Chlorobiaceae: Chlorobium limicola, Chlorobium phacobacteroides, Prostheccochloris aestuarii, у близкой к Chloroflexaceae бактерии Thermomicrobium roseum, а также видов Cytophaga aquatilis, c. heparina, C. jonsonii, Flavobacterium breve, Flexibacter sp. и Saprospira grandis, объединяемых на основании данных о 16S рРНК в т. наз. группу "Bacteroides - Cytophaga - Flavobacterium." (BCF). Построены дендрограммы, отражающие филогенетич. взаимоотношения между 282 бактериями, для к-рых известна последовательность 5S рРНК. Установлено, что зеленые серобактерии находятся в близком родстве друг с другом и входят в кластер с Bacteroides и Cytophaga aquatilis. Остальные представители группы BCF не являются членами ни этого, ни соседних кластеров. Подтверждено родство T. roseum и Chloroflexus aurantiacus. Библ. 41. Бельгия, Dep. Boichem., Univ. Antwerpen (UIA). В-2610 Antwerpen.
ГРНТИ  
34.27.15
ВИНИТИ 341.27.15.09
Рубрики: БАКТЕРИИ
ЭВОЛЮЦИЯ
РРНК
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ОСНОВАНИЙ 5S РРНК

Доп.точки доступа:
Van, den Eynde Hilde; Van, de Peer Yves; Perry, Jerome; D, Wachter Rupert

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 92.09-04Б2.036

   
    Phylogenetic relationships among ascomycetes and ascomycete-like yeasts as deduced from small ribosomal subunit RNA sequences [Text] / Lydia Hendriks [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 1992. - Vol. 15, N 1. - P98-104 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Филогенетические взаимосвязи между аскомицетами и аскомицетоподобными дрожжами [на основании сравнения] последовательностей РНК малых рибосомных субъединиц
Аннотация: Определена последовательность нуклеотидов рРНК малых субъединиц у типовых штаммов Debaryomyces hansenii, Pichia anomala, P. membranaefaciens, Schizosaccharomyces pombe, Zygosaccharomyces rouxii и Dekkera bruxellensis. С привлечением аналогичных данных еще по 14 видам грибов сконструировано эволюционное древо, где от аскомицетов наиболее удалены хитридиомицеты, а затем зигомицеты и далее базидиомицеты. Аскомицетные дрожжи образуют 5 основных линий, к-рые включают: 1) Schizosacch. pombe; 2) Clavispora lusitaniniae; 3) Dek. bruxellensis, P. membaranaefaciens, Issatchenkia orientalis; 4) Deb. hansenii, Candida albicans, C. tropicalis; 5) P. anomala, Kluyveromyces lactis, C. glabrata, Torulaspora delbrueckii, Saccharomyces cerevisiae и Zygosacch. rouxii. По большей части с таким группированием коррелирует тип преобладающего у дрожжей убихинона. Обращает внимание гетерогенность родов Candida и Pichia. Библ. 42. Бельгия, Dep. Biochemie, Univ. Antwerpen (UIA), 2610 Antwerpen.
ГРНТИ  
34.27.15
ВИНИТИ 341.27.15.07
Рубрики: ASCOMYCETES (FUNGI)
ДРОЖЖИ
АСКОМИЦЕТОПОДОБНЫЕ ДРОЖЖИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОТНОШЕНИЯ
РРНК
МАЛАЯ СУБЪЕДИНИЦА
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ РРНК
СРАВНЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Hendriks, Lydia; Goris, Anne; Van, de Peer Yves; Neefs, Jean-Marc; Vancanneyt, Marc; Kersters, Karel; Berny, Jean-Francois; Hennebert, Gregoire L.; De, Wachter Rupert

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 92.10-04В2.104

   
    Evolution of basidiomycetous yeasts as deduced from small ribosomal subunit RNA sequences [Text] / de Peer Yves Van [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 1992. - Vol. 15, N 2. - P250-258 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Эволюция базидиальных дрожжей, представленная на основании последовательностей РНК малой субъединицы рибосом
Аннотация: Определены нуклеотидные последовательности (НП) РНК малой субъединицы рибосом у Rhodosporidium toruloides (анаморфа Rhodotorula glutinis), Filobasidiella neoformans (анаморфа Cryptococcus neoformans) Trichosporon cutaneum, Bullera alba и Sporobolomyces roseus. Данные для Leucosporidium scottii (анаморфа Candida scottii) были опубликованы ранее (Hendriks et al., 1991). На основании матрицы расстояний для всех известных в настоящее время НП srРНК грибов (исключая оомицеты и миксомицеты) построено филогенетическое древо. Оно показывает, что аксомицеты и базидиомицеты представляют сестринские группы, вероятно происходящие от предка, близкого к зигомицетам и дивергировавшие около 840 млн лет назад. Базидиальные дрожжи четко подразделяются на две группы: одна объединяет виды, образующие телиоспоры, - R. toruloides и L. scottii, а также анаморфные дрожжи S. roseus, вторая - виды, не имеющие телиоспор (F. neoformans) и анаморфные виды B. alba и T. cutaneum. Эти группы различаются и по ряду других признаков: строению септы, наличию ксилозы в клеточной стенке, способности усваивать нитриты и инозит, особенностями вторичной структуры srРНК. Однако, такие признаки, как образование баллистоспор и тип убихинонов, варьируют в пределах этих групп. Бельгия, Dep. Biochemie, Univ. Antwerpen (UIA), 2610 Antwerpen. Ил. 2. Библ. 55.
ГРНТИ  
34.29.15
ВИНИТИ 341.29.15.17.02
Рубрики: ГРИБЫ
BASIDIOMYCETES (FUNGI)
ДРОЖЖИ
ЭВОЛЮЦИЯ
РНК
МАЛЫЕ СУБЪЕДИНИЦЫ
РИБОСОМЫ

Доп.точки доступа:
Van, de Peer Yves; Hendriks, Lydia; Goris, Anne; Neefs, Jean-Marc; Vancanneyt, Marc; Kersters, Karel; Berny, JeanFrancois; Hennebert, Gregoire L.; de, Wachter Rupert

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 94.06-04В2.093

   
    Evolutionary relationships among higher fungi inferred from small ribosomal subunit RNA sequence analysis [Text] / Annick Wilmotte [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 1993. - Vol. 16, N 3. - P436-444 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Эволюционные связи между высшими грибами, основанные на анализе последовательностей РНК малой субъединицы рибосом
Аннотация: Проведен анализ первичной структуры рРНК у 13 видов аскомицетов и базидиомицетных дрожжей Rhodotorula glutinis. Эти данные с привлечением аналогичных сведений еще по 71 виду грибов использованы для построения филогенетического древа. Полученные результаты подтверждают имеющиеся представления о ранней дивергенции зигомицетов и разделение высших грибов на аско- и базидиомицеты. Последние подразделяются на истинные базидиомицеты и устомицеты. Внутри эубазадиомицетов одну группу образуют Filobasidiella neoformans, Bulleromyces albus и Trichosporon cutaneum, другую - представители Aphyllophorales и Agaricales. Аскомицеты также подражделяются на эуаскомицеты и гемиаскомицеты. Однако, делящиеся дрожжи Schizosaccharomyces pombe согласно данным секвенирования рРНК не принадлежат гемиаскомицетам, а образуют четко отдельную группу, к-рая рано отделяется от аскомицетов. Отдельные группы представляют плектомицеты и пиреномицеты. Внутри гемиаскомицетов такие сем., как Dipodascaceae и Saccharomycetaceae, роды Pichia и Candida полифилетичны. Бельгия, Dep. Biochimie, Univ. Antweren (UIA), 2610 Antwerpen. Ил. 2. Табл. 1. Библ. 55.
ГРНТИ  
34.29.15
ВИНИТИ 341.29.15.17.02
Рубрики: ГРИБЫ
ЭВОЛЮЦИОННЫЕ СВЯЗИ
РИБОСОМАЛЬНАЯ РНК
АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Wilmotte, Annick; Van, de Peer Yves; Goris, Anne; Chapelle, Sabine; De, Baere Raymond; Nelissen, Bart; Neefs, Jean-Marc; Hennebert, Gregoire L.; Wachter, Rupert De

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 98.01-04А1.64

    Van, de Peer Yves.
    The evolution of Stramenopiles and Alveolates as derived by "substitution rate calibration" of small ribosomal subunit RNA [Text] / de Peer Yves Van, der Auwera Gert Van, Wachter Rupert De // J. Mol. Evol. - 1996. - Vol. 42, N 2. - P201-210 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: Анализ эволюции Stramenopilies и Alveolates по параметрам "стандартизованной частоты замен" в последовательностях малых субъединиц рибосомной РНК
Аннотация: Проведен компьютерный анализ 750 известных последовательностей малых рибосомных РНК - использованы известные модели оценки эволюционной значимости имеющейся по этим последовательностям дифференцировки. Объектами анализа являлись низшие эукариоты, представляющие протистов, грибы и водоросли и объединяемые в 2 условные внетаксономические группы: Alveolata - клетки содержат ассоциированные с мембранами пузырьки-"альвеолы" (инфузории, динофлагелляты, фораминиферы и др.) и Stramenopila (имеются 3-раздельные щетинки, ассоциированные со жгутиками или непосредственно с мембранами клеток, - оомицеты и некоторые др. грибы, диатомеи, феофиты, эумастигины, золотистые водоросли и др.). Предложена модифицированная модель, позволяющая по мнению авт., более объективно подходить к сравнению маркерных последовательностей рРНК - модификация метода связана с введением специфической "калибровки" частоты нуклеотидных замен. Отмечено. что именно после калибровки получающиеся филетические схемы в существенно большей степени согласуются с известными взглядами на эволюцию анализируемых групп. Полученные данные анализируются с точки зрения перспектив более полного (по всем основным группам эукариот) филогенетического анализа с помощью новой процедуры. Бельгия [R. De Wachter], Dept. Biochem., Univ. Antwerpen, Universiteitspl. 1, B-2610 Antwerpen. Библ. 30
ГРНТИ  
34.03.17
ВИНИТИ 341.03.17.27.02
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
РНК
РИБОСОМНАЯ
НИЗКОМОЛЕКУЛЯРНАЯ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ЗАМЕНЫ
ЧАСТОТА
НИЗШИЕ ЭУКАРИОТЫ
ГРУППА ALVEOLATES
ГРУППА STRAMENOPILES

Доп.точки доступа:
Van, der Auwera Gert; De, Wachter Rupert

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.04-04Б2.55

   
    The determination and comparison of the 16S rRNA gene sequences of species of the genus Pseudomonas (sensu stricto) and estimation of the natural intrageneric relationships [Text] / Edward R. B. Moore [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 1996. - Vol. 19, N 4. - P478-492 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Определение и сравнение последовательностей генов рРНК 16S видов рода Pseudomonas (sensu stricto) и оценка природных внутриродовых взаимоотношений
Аннотация: Определены почти полные нуклеотидные последовательности генов рРНК 16S 21 вида рода Pseudomonas sensu stricto, в т. ч. для нескольких штаммов у большинства видов. Сравнение последовательностей и кластерный анализ позволили установить порядок филогенетического ветвления и природные внутриродовые взаимоотношения. Не обнаружено заметной корреляции с данными, полученными с использованием стандартных фенотипических критериев, обычно применяемых для группировки видов. Обсуждается возможность использования последовательностей генов рРНК 16S, особенно их гипервариабельных областей, в кач-ве гнездовых маркеров идентификации и мишеней для разработки стратегий идентификации видов рода Pseudomonas. Германия, Dev. Microbiol., GBF Nat Res. Ctr for Biotechnol., D-38124 Braunschweig. Библ. 65
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.01
Рубрики: PSEUDOMONAS (SENSU STRICTO) (BACT.)
ФИЛОГЕНИЯ
ГЕНЫ
РНК РИБОСОМНАЯ 16S
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ГИПЕРВАРИАБЕЛЬНЫЕ ОБЛАСТИ
ВНУТРИРОДОВЫЕ ВЗАИМООТНОШЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Moore, Edward R.B.; Mau, Margit; Arnscheidt, Angelika; Bottger, Erik C.; Hutson, Roger A.; Collins, Mattew D.; Van, de Peer Yves; De, Watchter Rupert; Timmis, Kenneth N.

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 99.03-04А1.44

    Van, de Peer Yves.
    Evolutionary relationships among the eukaryotic crown taxa taking into account site-to-site rate variation in 18S rRNA [Text] / de Peer Yves Van, Wachter Rupert De // J. Mol. Evol. - 1997. - Vol. 45, N 6. - P619-630 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: [Анализ] эволюционных отношений между "верхушечными" таксонами эукариот с учетом межсайтовой скорости изменчивости 18S рРНК
Аннотация: В настоящее время определена структура 7000 малых субъединиц рРНК (18S). Построено бутстрэповское дерево для 500 нуклеотидных последовательностей 18S рРНК, в основном принадлежащих организмам, находящимся в филогенезе эукариот в положении т. н. "верхушек" (термин Knoll, 1992). Полученные данные указывают на то, что животные истинные грибы и хоанофлагелляты имеют общее происхождение; (BS90%); сестринскими являются группы страменопилий и альвеолят, (BS85%), в то время как альвеоляты, динофлагелляты и апикомплексии скорее всего составляют кластер с монофилетическим происхождением (BS95%). Очень тесную группу предположительно составляют страменопилии, гетероконтные водоросли, гипохитридиомицеты и оомицеты. Однако в ряде "верхушек" информативность последовательностей 18S рРНК недостаточна. Рассматривается возможность привлечения др. молекулярных маркеров филогении крупных таксонов эукариот. Бельгия, Dep. Biochem., Univ. Antwerpen, B-2610 Antwerpen. Библ. 87
ГРНТИ  
34.03.17
ВИНИТИ 341.03.17.27.02
Рубрики: ЭВОЛЮЦИЯ
ТАКСОНОМИЯ
РНК РИБОСОМНАЯ
18S Р/РНК
СКОРОСТЬ ЗАМЕН
БУТСТРЭПОВСКИЙ АНАЛИЗ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ДЕРЕВЬЯ
"ВЕРХУШЕЧНЫЕ" ТАКСОНЫ
ЭУКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
De, Wachter Rupert

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.05-04Б2.254

    De, Rijk Peter.
    Database on the structure of large ribosomal subunit RNA [Text] / Rijk Peter De, de Peer Yves Van, Wachter Rupert De // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 1. - P117-122 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: База данных о структуре РНК больших рибосомных субъединиц
Аннотация: Последняя версия базы данных (БД) о РНК больших рибосомных субъединиц содержит 429 выровненных последовательностей рРНК и информацию о их вторичной структуре. БД доступна через систему World Wide Web (http://rrna.uia.ac.be/) и через FTP. Сервер оборудован новым интерфейсом для запросов. Бельгия, Dept. Biochemil, Univ. Antwerpen, B-2610 Antwerpen. Библ. 22
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.07
Рубрики: БАЗЫ ДАННЫХ
РИБОСОМЫ
БОЛЬШИЕ СУБЪЕДИНИЦЫ
СТРУКТУРА
РРНК
ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Van, de Peer Yves; De, Wachter Rupert

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 97.12-04А1.67

    Van, de Peer Yves.
    Construction of evolutionary distance trees with TREECON for Windows: Accounting for variation in nucleotide substitution rate among sites [Text] / de Peer Yves Van, Wachter Rupert De // Comput. Appl. Biosci. - 1997. - Vol. 13, N 3. - P227-230 . - ISSN 0266-7061
Перевод заглавия: Построение деревьев эволюционных расстояний с помощью программы TREECON под Windows. Подсчет вариаций частоты замещений нуклеотидов в сайтах
Аннотация: Разработан пакет прикладных программ TREECON под Windows, предназначенный для оценки эволюционных расстояний между нуклеотидными последовательностями путем определения различий в частоте замещений между сайтами. Подробно описана реализация метода сравнения эволюционных деревьев, характеризующей необходимое число изменений для перехода от одного дерева к другому. Для иллюстрации приведен ряд примеров применения пакета TREECON, демонстрирующих его эффективность. Бельгия, Dep. of Biochemistry, Univ. of Antwerp, Universiteitsplein 1, B-2610 Antwerpen. Ил. 2. Библ. 12
ГРНТИ  
34.03.17
ВИНИТИ 341.03.17.27.02
Рубрики: ПРОГРАММЫ
ПАКЕТ ПРИКЛАДНЫХ ПРОГРАММ
TREECON
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
ЭВОЛЮЦИОННЫЕ РАССТОЯНИЯ

Доп.точки доступа:
De, Wachter Rupert

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 97.11-04А3.502

    Van, de Peer Yves.
    Construction of evolutionary distance trees with TREECON for Windows: Accounting for variation in nucleotide substitution rate among sites [Text] / de Peer Yves Van, Wachter Rupert De // Comput. Appl. Biosci. - 1997. - Vol. 13, N 3. - P227-230 . - ISSN 0266-7061
Перевод заглавия: Построение деревьев эволюционных расстояний с помощью программы TREECON под Windows. Подсчет вариаций частоты замещений нуклеотидов в сайтах
Аннотация: Разработан пакет прикладных программ TREECON под Windows, предназначенный для оценки эволюционных расстояний между нуклеотидными последовательностями путем определения различий в частоте замещений между сайтами. Подробно описана реализация метода сравнения эволюционных деревьев, характеризующей необходимое число изменений для перехода от одного дерева к другому. Для иллюстрации приведен ряд примеров применения пакета TREECON, демонстрирующих его эффективность. Бельгия, Dep. of Biochemistry, Univ. of Antwerp, Universiteitsplein 1, B-2610 Antwerpen. Ил. 2. Библ. 12
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: ПРОГРАММЫ
ПАКЕТ ПРИКЛАДНЫХ ПРОГРАММ
TREECON
ЭВОЛЮЦИОННЫЕ РАССТОЯНИЯ

Доп.точки доступа:
De, Wachter Rupert

14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI17) 02.10-04И1.2

    Van, de Peer Yves.
    Molecular evolution and the incorporation of site-to-site rate variation in distance tree construction methods [Text] : докл. [5 Benelux Congress of Zoology, Gent, 6-7 Nov., 1998] / de Peer Yves Van // Belg. J. Zool. - 1999. - Vol. 129, N 1. - P5-15 . - ISSN 0777-6276
Перевод заглавия: Молекулярная эволюция и включение значений изменчивости между сайтами в методы построения древ по степени близости
Аннотация: Обсуждается построение эволюционных деревьев по мол. данным о строении рибосомной РНК (малой субъединицы) и ошибки, вносимые различиями в разных сайтах молекулы. Бельгия, Dep. of Biochem., Univ. of Antwerp, Universiteitsplein 1, B-2610 Antwerpen. Ил. 3. Библ. 39
ГРНТИ  
34.33.02
ВИНИТИ 341.33.02.11
Рубрики: ЖИВОТНЫЕ
ЭВОЛЮЦИЯ
МЕТОДЫ

15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 03.05-04Я6.48

   
    Comparative analysis of more than 3000 sequences reveals the existence of two pseudoknots in area V4 of eukaryotic small subunit ribosomal RNA [Text] / Jan Wuyts [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2000. - Vol. 28, N 23. - P4698-4708 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Сравнительным анализом более 3000 последовательностей обнаружено существование двух псевдоузлов в V4 области РНК малой субъединицы эукариотической рибосомы
Аннотация: Вторичная структура V4, наибольшей вариабельной области рРНК малой субчастицы эукариотической рибосомы, исследована сравнительным анализом 3253 последовательностей рРНК животных, растений, грибов и простейших. У большинства эукариот вторичная структура данной области состоит из 11 спиралей и содержит два псевдоузла. В одном из псевдоузлов обнаружен обмен основаниями между черешками шпилек среди таксонов. Данная область также содержит три точки потенциальных инсерций, составляющих дополнительные шпильки или разветвленные структуры в рРНК многих таксонов. Бельгия, Dep. Biochem., Univ. Antwerpen, B 2610 Antwerpen. Библ. 30
ГРНТИ  
34.19.17
ВИНИТИ 341.19.17.07.15
Рубрики: РНК
РРНК
ВАРИАБЕЛЬНАЯ ОБЛАСТЬ V4
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ
ДВА ПСЕВДОУЗЛА
МАЛАЯ СУБЪЕДИНИЦА
РИБОСОМЫ
ЭУКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
Wuyts, Jan; De, Rijk Peter; van, de Peer Yves; Pison, Greet; Rousseeuw, Peter; De, Wachter Rupert

16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.08-04А3.598

   
    Wanda: A database of duplicated fish genes [Text] / de Peer Yves Van [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2002. - Vol. 30, N 1. - P109-112 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Wanda: база данных дуплицированных генов рыб
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БАЗЫ ДАННЫХ
WANDA
ГЕНЫ
ДУПЛИКАЦИИ
РЫБЫ

Доп.точки доступа:
Van, de Peer Yves; Taylor, John S.; Joseph, Jayabalan; Meyer, Axel

17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 03.08-04И4.47

   
    Wanda: A database of duplicated fish genes [Text] / de Peer Yves Van [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2002. - Vol. 30, N 1. - P109-112 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Wanda: база данных дуплицированных генов рыб
ГРНТИ  
34.33.33
ВИНИТИ 341.33.33.10
Рубрики: БАЗЫ ДАННЫХ
WANDA
ГЕНЫ
ДУПЛИКАЦИИ
РЫБЫ

Доп.точки доступа:
Van, de Peer Yves; Taylor, John S.; Joseph, Jayabalan; Meyer, Axel

18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 06.10-04И4.51

   
    Dealing with saturation at the amino acid level: A case study based on anciently duplicated zebrafish genes [Text] / de Peer Yves Van [et al.] // Gene. - 2002. - Vol. 295, N 2. - P205-211 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Изучение насыщения на уровне аминокислот: случай, связанный с дуплицированными в древности генами полосатого данио
Аннотация: Рыбы с лучистыми плавниками (Actinopterygii) по-видимому имеют по 2 копии многих генов тетрапод (Sarcopterygii). Существуют разные теории происхождении этих дупликаций: увеличение скорости дупликаций отдельных генов у рыб, возникновение дупликаций у общего предка Actinopterygii при полном удвоении генома, утрата тетраподами большего числа генов по сравнению с рыбами после дупликаций у общего предшественника. Проводили проверку этих теорий путем филогенетической реконструкции. Разработан Java-подход для визуализации степени насыщения аминок-тными последовательностями. Дискриминация между частыми и редкими замещениями основана на матрицах вероятности замещений (например, PAM и BLOSUM). После обсчета деревьев без учета фракции насыщенных сайтов, большинство дупликаций у рыб представляет родственные последовательности. Бельгия, Dep. Plant Syst. Biol., Flanders Interuniv. Inst. Biotech., Gent Univ. K. L. Ledeganckstraat 35, B-9000 Gent
ГРНТИ  
34.33.33
ВИНИТИ 341.33.33.10
Рубрики: ЭВОЛЮЦИЯ
ГЕНЫ
ДУПЛИКАЦИИ
РЫБЫ
ПОЛОСАТЫЙ ДАНИО

Доп.точки доступа:
Van, de Peer Yves; Frickey, Tancred; Taylor, John S.; Meyer, Axel

19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI16) 03.09-04В3.176

   
    The hidden duplication past of Arabidopsis thaliana [Text] / Cedric Simillion [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2002. - Vol. 99, N 21. - P13627-13632 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Неизвестное прошлое дупликаций из арабидопсиса
Аннотация: Анализ генома арабидопсиса свидетельствует о наличии дупликаций (Дп) части или всего генома в ходе эволюции. Показано, что сильно дегенерировавшие Дп, которые невозможно распознать прямым сравнением сегментов ввиду разной потери генов, все же можно определить косвенным сравнением. Если учесть такие т. наз. замаскированные Дп, можно обнаружить многие гомологичные участки генома в 5-8 копиях. Это указывает на существование не более 3 циклов геномных Дп у арабидопсиса. Бельгия, Ghent Univ., B-9000 Ghent; yvdp@gengeup.rug.ac.be. Библ. 31
ГРНТИ  
34.31.27
ВИНИТИ 341.31.27.19
Рубрики: ГЕНОМ
ДУПЛИКАЦИИ
ЭВОЛЮЦИЯ
АРАБИДОПСИС

Доп.точки доступа:
Simillion, Cedric; Vandepoele, Klaas; Van, Montagu Marc C.E.; Zabeau, Marc; Van, de Peer Yves

20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 05.01-04А3.851

    Rombauts, Stephane.
    AFLPinSilico, simulating AFLP fingeprints [Text] / Stephane Rombauts, de Peer Yves Van, Pierre Rouze // Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 6. - P776-777 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: AFLPinSilico: симуляция отпечатков AFLP
Аннотация: Помехой отпечатков для метода полиморфизма длины амплифицированных фрагментов (AFLP) является сложность корреляции различных фрагментов с их ДНК-последовательностью AFLPinSilico (http://www.psb.rug.ac.be/bioinformatics/AFLPinSilico.html) стимулирует эксперименты по AFLP на кДНК или геномных последовательностях. Бельгия, Dep. Plant Systems Biol., Flanders Interuniv. Inst. for Biotech. (VIB), K. L. Ledeganckstraat 35, Gent 9000. Библ. 4
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.09.99
Рубрики: КОМПЬЮТЕРНЫЕ МЕТОДЫ
AFLPINSILICO
ДНК
ПОЛИМОРФИЗМ ДЛИНЫ АМПЛИФИЦИРОВАННЫХ ФРАГМЕНТОВ
ФИНЧЕРПРИНТЫ
ИМИТАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Van, de Peer Yves; Rouze, Pierre
 1-20    21-24 
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)