СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Saito, Rintaro$<.>)

Общее количество найденных документов : 4
Показаны документы с 1 по 4

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.04-04Б2.226

Saito, Rintaro.
On negative selection against ATG triplets near start codons in eukaryotic and prokaryotic genomes [Text] / Rintaro Saito, Masaru Tomita // J. Mol. Evol. - 1999. - Vol. 48, N 2. - P213-217 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: О негативной селекции против триплетов ATG вблизи стартовых кодонов в эукариотических и прокариотических геномах
Аннотация: Подвергнута систематическому анализу частота триплетов ATG в геномах разных видов. Найдено, что она достоверно понижена вокруг стартовых кодонов у про- и эукариот. У эукариот частота ATG с 5'-стороны понижена сильнее, чем с 3'-стороны. У прокариот понижение частоты ATG менее заметно и более симметрично относительно стартового кодона. Рассчитаны также расстояния между стартовым кодоном и ближайшим 5'-триплетом ATG. Оно больше у высших организмов, чем у прокариотов. Япония, Lab. for Bioinformatics, Keiv Univ., Fujisawa, Kanagawa 252-8520. Библ. 16

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
КОДОН ATG
НЕГАТИВНАЯ СЕЛЕКЦИЯ
СТАРТОВЫЕ КОДОНЫ
ГЕНОМ ПРОКАРИОТИЧЕСКИЙ
ГЕНОМ ЭУКАРИОТИЧЕСКИЙ

Доп.точки доступа:
Tomita, Masaru

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.02-04Б2.159

Saito, Rintaro.
Computer analyses of complete genomes suggest that some archaebacteria employ both eukaryotic and eubacterial mechanisms in translation initiation [Text] / Rintaro Saito, Masaru Tomita // Gene. - 1999. - Vol. 238, N 1. - P79-83 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Компьютерный анализ полных геномов указывает на то, что некоторые архебактерии используют и эукариотические, и эубактериальные механизмы инициации трансляции
Аннотация: Ранее показали, что в эукариотических геномах нуклеотидные последовательности, предшествующие стартовым кодонам трансляции, обеднены ATG-триплетами, что, вероятно, связано со сканирующим механизмом инициации трансляции и негативным отбором таких кодонов. У эукариот рибосомы сразу связываются с последовательностью Шайна-Далгарно (SD), расположенной перед стартовым ATG, и отсутствует негативный отбор предшествующих ATG. Анализ ATG-триплетов в архебактериальных геномах показал, что характер их распределения у Methanococcus jannaschii и Pyrococcus herikoshii сходен с распределением у эукариот. С др. стороны, ранее показано, что у этих архей есть SD-подобные последовательности, комплементарные 3'-концевым участкам 16S рРНК. Предполагают, что механизм инициации трансляции у архей носит комбинированный характер: их рибосомы сканируют мРНК с 5'- к 3'-концу, а затем 16S рРНК связывается с SD-подобными последовательностями 5'-нетранслируемой области. Япония, Lab. Bioinformatics, Keio Univ., Endo 5322, Fujisawa, Kanagawa 252-8520. Библ. 21

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
МЕХАНИЗМЫ
ГЕНОМ АРХЕЕВ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ
METHANOCOCCUS JANNASCHII (ARCH.)
PYROCOCCUS HERIKOSHII (ARCH.)

Доп.точки доступа:
Tomita, Masaru

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.09-04Б2.191

Computer analysis of potential stem structures of rRNA operons in various procaryote genomes [Text] : докл.[International Symposium "Evolution 2000" dedicated to the memory of Dr.Susumu Ohno, Tokyo, March 5-7, 2000] / Rintaro Saito [et al.] // Gene. - 2000. - Vol. 259, N 1-2. - P217-222 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Компьютерный анализ потенциальных шпилечных структур оперонов рРНК в различных прокариотических геномах
Аннотация: Предпринят компьютерный анализ потенциальных шпилечных структур оперонов рРНК в геномах 12 археев и 3 археев. Систематически рассчитаны свободные энергии структур, к-рые могут образовываться при отжиге последовательностей на 5'-конце или 3'-конце рРНК 16S и 23S. Полученные данные показали, что у большинства видов рРНК образует шпилечных структуры на обоих концах. Эти шпильки очень стабильны у некоторых видов, напр. у Aquifex aeolicus. С др. стороны, некоторые рРНК, напр. у Deinococcus radiodurans, не образуют стабильные шпилечные структуры. Это позволило предположить, что у таких видов в процессинге рРНК не участвует механизм нацеливания РНКазы III, описанный для Escherichia coli. Япония, Lab. for Bioinformatics, Keyo Univ., Fujisaws, Kanagawa 252-8520. Библ. 13

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОНЫ РРНК
СТРУКТУРА
КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ
ШПИЛЕЧНЫЕ СТРУКТУРЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
AGUIFEX AEOLICUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Saito, Rintaro; Ozawa, Yousuke; Kuzuno, Naoki; Tomita, Masaru

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.02-04А3.13

Saito, Rintaro.
Construction of reliable protein-protein interaction networks with a new interaction generality measure [Text] / Rintaro Saito, Harukazu Suzuki, Yoshihide Hayashizaki // Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 6. - P756-763 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Построение достоверных сетей белок-белковых взаимодействий с использованием новой меры общности взаимодействий
Аннотация: Новые методы скрининга выявили много данных о белок-белковых взаимодействиях (ББВ), несущих биологически важную информацию о таких характеристиках, как функции неохарактеризованных белков, существовании неизвестных ранее белковых комплексов, новых путях трансдукции сигнала. Однако экспериментальные данные о ББВ содержат немало ошибочных результатов. Это требует развития новых расчетных методов оценки достоверности каждого предполагаемого ББВ. Предложена новая мера "общности взаимодействия" IG2, позволяющая оценивать достоверность ББВ на основании лишь топологических свойств структуры сетей их взаимодействий. На примере ББВ в дрожжах показано, что достоверные ББВ имеют значения IG2, значительно более низкие, чем менее достоверные взаимодействия. Это означает, что величину IG2 можно использовать для оценки и отбора данных о ББВ для построения достоверных сетей ББВ. Данные о ББВ, использованные в этой работе, и соответствующие значения IG2 доступны по адресу: http://genome.gsc.riken.go.jp. Япония, Inst. Adv. Biosci., Keio Univ., 14-1 Baba-cho, Tsuruoka, Yamagata 997-0035. Библ. 36

ГРНТИ	34.55.15

ВИНИТИ 341.55.15.09
Рубрики: БЕЛОК
МЕЖБЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ДОСТОВЕРНЫЕ СЕТИ
ПОСТРОЕНИЕ
АНАЛИЗ
НОВАЯ МЕРА ОБЩНОСТИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Suzuki, Harukazu; Hayashizaki, Yoshihide

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска