СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Hu, Wen-Yuan$<.>)

Общее количество найденных документов : 3
Показаны документы с 1 по 3

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.07-04Б2.230

Hu, Wen-Yuan.
IS903 insertion specificity: A distinct preference for the F transfer operon [Text] / Wen-Yuan Hu, Keith M. Derbyshire // J. Biomol. Struct. and Dyn. - 1997. - Vol. 14, N 6. - P839-839 . - ISSN 0739-1102
Перевод заглавия: Инсерционная специфичность IS903: явно выраженное предпочтение оперона переноса F-плазмиды
Аннотация: Изучены независимые вставки IS-элемента IS903 в плазмиду рОХ38 (55 т. п. н.), являющуюся производным F-плазмиды. Показано, что сайты вставки сгруппированы в нескольких коротких областях (1,2-3,8 т. п. н.) области переноса tra и в лидерной области рядом с oriT. Не удалось идентифицировать консенсусную последовательность мишенного сайта (9. п. н.), но в фланговых областях длиной 10 п. н. обнаружено предпочитание некоторых нуклеотидов, симметрично расположенных относительно сайта инсерции. Региональная специфичность транспозиции IS903 отсутствует в неродственной конъюгативной плазмиде pUB307 - делец. варианте плазмиды RP1 группы IncP. Распределение вставок в pUB307 изменяется после введения в нее фрагмента traY-L (1,1 т. п. н.) tra-области F: 90% вставок картированы в этом фрагменте. Делеция блоков -35 и -10 промотора PtraY в этом фрагменте уменьшает число вставок IS903 на 40%. Т. обр. транскрипция с PtraY является дополнительным фактором, усиливающим использованием сегмента traY-L в качестве мишени для транспозиции. США, Dep. of Biomed. Sci., School of Public Health, Albany, NY 12206

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: ИНСЕРЦИОННЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
IS903
ИНСЕРЦИЯ
МИШЕНЬ
ПЛАЗМИДА F
ОБЛАСТЬ TRA
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Derbyshire, Keith M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.02-04Б2.199

Hu, Wen-Yuan.
Target choice and orientation preference of the insertion sequence IS903 [Text] / Wen-Yuan Hu, Keith M. Derbyshire // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 12. - P3039-3048 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Выбор мишени и предпочитание ориентации инсерционной последовательностью IS903
Аннотация: Для изучения предпочитаемых мишеней инсерц. элемента IS903 определены сайты интеграции для большого числа событий транспозиции в конъюгативную плазмиду pOX38 длиной 55 кД. Найдено, что все вставки сгруппированы в 4 разных маленьких областях, ассоциированных с конъюгативным переносом ДНК. В этих областях используется много разных сайтов вставки, но в некоторые из них IS903 встраивается более одного раза. Выравнивание сайтов интеграции не обнаружило консенсусной последовательности для дупликации мишени длиной 9 п. н., однако по обе стороны от мишени симметрично расположены предпочитаемые последовательности. Это согласуется с узнаванием мишени димером или мультимером транспоназы, к-рые специфично в отношении последовательности или структуры взаимодействуют в ДНК по обе стороны от мишени. При переносе одной из предполагаемых мишеней в др. конъюгативную плазмиду pUB307 она остается предпочитаемой мишенью. Изменение направления вегетативной репликации из oriV не влияет на ориентацию вставок IS903. Однако изменение направления репликации из области начала переноса oriT устраняет эффект ориентации. Это позволяет предположить, что конъюгац. перенос ДНК налагает на мишень полярность, узнаваемую IS903. США, Wadsworth Ctr., David Axelrod Inst., Albany, NY 12201-2002. Библ. 41

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: МИШЕНИ
ВЫБОР
ПРЕДПОЧИТАНИЕ ОРИЕНТАЦИИ
IS903
КОНЪЮГАТИВНАЯ ПЛАЗМИДА POX38

Доп.точки доступа:
Derbyshire, Keith M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.140

Anatomy of a preferred target site for the bacterial insertion sequence IS903 [Text] / Wen-Yuan Hu [et al.] // J. Mol. Biol. - 2001. - Vol. 306, N 3. - P403-416 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Анатомия предпочтительных сайтов-мишеней инсерционной последовательности IS903 бактерий
Аннотация: С использованием генетических и статистических подходов определены наиболее часто используемые сайты инсерции IS903 (84%). Показано, что лучшая мишень состоит из палиндрома длиной 21 п. н., расположенного в центре дуплицированной мишени из 9 п. н., образующейся при транспозиции. Мишень можно разделить на 4 компонента: фланкирующие последовательности из 5 п. н., наиболее важные участки, необходимые для сайт-специфической инсерции; палиндромный кор из 7 п. н., расположенный в дуплицированной мишени; динуклеотид, локализованный в месте контакта транспозон-мишень; локальный контекст ДНК. С использованием субстратов со множественными сайтами-мишенями показано, что IS903, вероятно, находит мишень посредством локального связывания-скольжения, но не длительного прохождения ДНК. США, Division Infectious Disease, Dep. Biomed. Sci., Sch. Public Hlth, SUNY @Albany, Albany, NY 12201. Библ. 53

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ДНК
ИНСЕРЦИОННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
JS903
САЙТЫ-МИШЕНИ
ПРЕДПОЧТИТЕЛЬНЫЕ
СТРУКТУРА
БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Hu, Wen-Yuan; Thompson, William; Lawrence, Charles E.; Derbyshire, Keith M.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска