СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Coolen, Marco J. L.$<.>)

Общее количество найденных документов : 15
Показаны документы с 1 по 15

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.11-04Б2.133

Coolen, Marco J. L.
Analysis of subfossil molecular remains of purpe sulfur bacterial in a lake sediment [Text] / Marco J. L. Coolen, Jorg Overman // Appl. and Environ. Microbiol. - 1998. - Vol. 64, N 11. - P4513-4521 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Анализ субископаемых молекулярных останков пурпурных серных бактерий в озерном осадке
Аннотация: Обнаружены молекулярные останки пурпурных серных бактерий (ПСБ). В осадках, имеющих возраст до 11 000 лет, найдены каротеноидокенон (I) и бактериофеофитин a. I специфичен для нескольких видов Chromatiaceae, включая Amoebobacter purpureus, преобладающих в современном хемоклинном бактериальном сообществе озера. С набором праймеров, специфичных для Chromatiaceae, из различных глубин осадка амплифицированы последовательности гена рРНК 16S для 4 разных видов Chromatiaceae. Одна из последовательностей из образца возрастом 9100 лет на 99,2% идентичен гену рРНК 16S изолята A. purpureus ML1 из хемоклина. С праймерами, специфичными для A. purpureus ML1, и до т-блот-гибридизацией продуктов ПЦР предел обнаружения ДНК A. purpureus ML1 понижен до 0,004% валовой ДНК сообщества. Этим методом ДНК изолята обнаружена в 7 из 10 слоев осадка. Это показало, что A. purpureus ML1 является одним из членов древнего сообщества СПБ. Конц-ии ДНК A. purpureus и I в осадке не коррелируют друг с другом: в субископаемых слоях осадка отношение конц-ий ДНК и I гораздо меньше (2,7*10{-6}), чем в целых клетках (1,4). Это показало, что скорость деградации для ДНК гораздо выше, чем для углеводородных компонентов клетки, даже при очень высокой конц-ии сульфида в аноксич. условиях в озере Махони. Германия, Inst. for Chem. and Biol. Marine Environ., Univ. Oldenburg, D-26111 Oldenburg. Библ. 51

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ПУРПУРНЫЕ СЕРНЫЕ БАКТЕРИИ
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ОСТАНКИ
СОЛЕНОЕ ОЗЕРО МАХОНИ
КАНАДА
ГЕНЫ
ГЕНЫ РРНК 16S
АМПЛИФИКАЦИЯ
ИДЕНТИЧНОСТЬ
ГЕН РРНК 16S
ИЗОЛЯТ AMOEBOBACTER PURPUREUS
ШТАММ ML1

Доп.точки доступа:
Overman, Jorg

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.11-04Б2.159

Coolen, Marco J. L.
Functional exoenzymes as indicators of metabolically active bacteria in 124,000-year-old sapropel layers of the eastern mediterranean sea [Text] / Marco J. L. Coolen, Jorg Overmann // Appl. and Environ. Microbiol. - 2000. - Vol. 66, N 6. - P2589-2598 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Функциональные экзоферменты как индикаторы метаболически активных бактерий в 124 000-летних отложениях сапропеля на востоке Средиземного моря
Аннотация: Слои сапропеля содержали до 1,5*10{8} бактериальных клеток в 1 см{3}, тогда как в промежуточных слоях находилось в 10 раз меньше бактерий. В сапропелях при определении активности экзоферментов с флуоресцентно меченными аналогами субстратов сильно мешало поглощение возникающих в результате ферментативного отщепления флуорофоров (4-метилумбеллиферона и 7-амино-4-метилкумарина) частицами в отложениях. Поскольку все способы экстракции сорбированных флуорофоров оказались неподходящими для сапропелевых частиц, авторы ввели способ коррекции, основанный на измерениях равновесных изотерм связывания обоих соединений. С применением этого подхода удалось определить высокие уровни активности аминопептидазы и щелочной фосфатазы даже в отложениях сапропеля 124 000-летней давности, а активность 'бета'-глюкозидазы во всех слоях оказалась низкой. Высокая сорбционная способность частиц сапропеля проявлялась не только в отношении флуорофоров, но и ДНК. Германия (Overmann J.), Paleomicrobiology Group, Inst. For the Chem. and Biol. of the Marine Environment, Univ. Oldenburg, D-26111 Oldenburg, E-mail: j.overmann@icbm.de Fax: 49-441-798-3583. Библ. 66

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.13
Рубрики: САПРОПЕЛИ
ДРЕВНИЕ ОТЛОЖЕНИЯ
БАКТЕРИИ
ЭКЗОФЕРМЕНТЫ
МЕТАБОЛИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ
ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ СУБСТРАТЫ
ФЛУОРОФОРЫ
СОРБЦИЯ

Доп.точки доступа:
Overmann, Jorg

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 01.11-04Б3.205

Coolen, Marco J. L.
Functional exoenzymes as indicators of metabolically active bacteria in 124,000-year-old sapropel layers of the eastern mediterranean sea [Text] / Marco J. L. Coolen, Jorg Overmann // Appl. and Environ. Microbiol. - 2000. - Vol. 66, N 6. - P2589-2598 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Функциональные экзоферменты как индикаторы метаболически активных бактерий в 124 000-летних отложениях сапропеля на востоке Средиземного моря
Аннотация: Слои сапропеля содержали до 1,5*10{8} бактериальных клеток в 1 см{3}, тогда как в промежуточных слоях находилось в 10 раз меньше бактерий. В сапропелях при определении активности экзоферментов с флуоресцентно меченными аналогами субстратов сильно мешало поглощение возникающих в результате ферментативного отщепления флуорофоров (4-метилумбеллиферона и 7-амино-4-метилкумарина) частицами в отложениях. Поскольку все способы экстракции сорбированных флуорофоров оказались неподходящими для сапропелевых частиц, авторы ввели способ коррекции, основанный на измерениях равновесных изотерм связывания обоих соединений. С применением этого подхода удалось определить высокие уровни активности аминопептидазы и щелочной фосфатазы даже в отложениях сапропеля 124 000-летней давности, а активность 'бета'-глюкозидазы во всех слоях оказалась низкой. Высокая сорбционная способность частиц сапропеля проявлялась не только в отношении флуорофоров, но и ДНК. Германия (Overmann J.), Paleomicrobiology Group, Inst. For the Chem. and Biol. of the Marine Environment, Univ. Oldenburg, D-26111 Oldenburg, E-mail: j.overmann@icbm.de Fax: 49-441-798-3583. Библ. 66

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.23
Рубрики: САПРОПЕЛИ
ДРЕВНИЕ ОТЛОЖЕНИЯ
БАКТЕРИИ
ЭКЗОФЕРМЕНТЫ
МЕТАБОЛИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ
ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ СУБСТРАТЫ
ФЛУОРОФОРЫ
СОРБЦИЯ

Доп.точки доступа:
Overmann, Jorg

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 02.12-04Б3.141

Ongoing modification of Mediterranean Pleistocene sapropels mediated by prokaryotes [Text] / Marco J. L. Coolen [et al.] // Science. - 2002. - Vol. 296, N 5577. - P2407-2410 . - ISSN 0036-8075
Перевод заглавия: Происходящие непрерывно изменения в плейстоценовых сапропелях Средиземного моря, опосредованные прокариотами
Аннотация: В богатых органикой осадках позднего плейстоцена (сапропели) восточного Средиземноморья обитают неизвестные хемоорганотрофные, метаболически активные прокариоты. Сапропели были обследованы с помощью окрашивания акридиновым оранжевым с последующей флуоресцентной микроскопией. По сравнению с бедными C промежуточными слоями, сапропели были населены большим кол-вом микробных клеток. Их отличала высокая активность экзогидролаз ('бета'-глюкозидаз, аминопептидаз и щелочных фосфатаз). Использование равномерно меченной D-[{14}C]-глюкозы выявило повышенную скорость ее деградации. Подтвердилось происхождение микробных C-субстратов из сапропельных слоев возрастом в 217 000 лет. Анализ гена 16S-рРНК показал, что на долю некультивируемых зеленых несерных бактерий приходится до 70% всей микробной биомассы. Crenarchaeota составляли около 16% микробиоты. Был обнаружен медленный, но заметный оборот глюкозы. Подчеркиваются современные изменения состава сапропелей под действием метаболически активных зеленых несерных бактерий и Crenarchaeota. Германия, Inst. for Chem. & Biol. of the Marine Environment, Univ. of Oldenburg [E-mail:J.overmann@LRZ.uni-muenchen.de]. Библ. 25

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.17.02
Рубрики: ПРОКАРИОТЫ
ХЕМООРГАНОТРОФНЫЕ ПРОКАРИОТЫ
ОБНАРУЖЕНИЕ В САПРОПЕЛЯХ
ЗЕЛЕНЫЕ НЕСЕРНЫЕ БАКТЕРИИ
CRENARCHAEOTA (ARCHAEA)
ОБОРОТ ГЛЮКОЗЫ
АКТИВНОСТЬ ЭКЗОГИДРОЛАЗ

Доп.точки доступа:
Coolen, Marco J.L.; Cypionka, Heribert; Sass, Andrea M.; Sass, Henrik; Overmann, Jorg

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.01-04Б2.208

Ongoing modification of Mediterranean Pleistocene sapropels mediated by prokaryotes [Text] / Marco J. L. Coolen [et al.] // Science. - 2002. - Vol. 296, N 5577. - P2407-2410 . - ISSN 0036-8075
Перевод заглавия: Происходящие непрерывно изменения в плейстоценовых сапропелях Средиземного моря, опосредованные прокариотами
Аннотация: В богатых органикой осадках позднего плейстоцена (сапропели) восточного Средиземноморья обитают неизвестные хемоорганотрофные, метаболически активные прокариоты. Сапропели были обследованы с помощью окрашивания акридиновым оранжевым с последующей флуоресцентной микроскопией. По сравнению с бедными C промежуточными слоями, сапропели были населены большим кол-вом микробных клеток. Их отличала высокая активность экзогидролаз ('бета'-глюкозидаз, аминопептидаз и щелочных фосфатаз). Использование равномерно меченной D-[{14}C]-глюкозы выявило повышенную скорость ее деградации. Подтвердилось происхождение микробных C-субстратов из сапропельных слоев возрастом в 217 000 лет. Анализ гена 16S-рРНК показал, что на долю некультивируемых зеленых несерных бактерий приходится до 70% всей микробной биомассы. Crenarchaeota составляли около 16% микробиоты. Был обнаружен медленный, но заметный оборот глюкозы. Подчеркиваются современные изменения состава сапропелей под действием метаболически активных зеленых несерных бактерий и Crenarchaeota. Германия, Inst. for Chem. & Biol. of the Marine Environment, Univ. of Oldenburg [E-mail:J.overmann@LRZ.uni-muenchen.de]. Библ. 25

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.13
Рубрики: ПРОКАРИОТЫ
ХЕМООРГАНОТРОФНЫЕ ПРОКАРИОТЫ
ОБНАРУЖЕНИЕ В САПРОПЕЛЯХ
ЗЕЛЕНЫЕ НЕСЕРНЫЕ БАКТЕРИИ
CRENARCHAEOTA (ARCHAEA)
ОБОРОТ ГЛЮКОЗЫ
АКТИВНОСТЬ ЭКЗОГИДРОЛАЗ

Доп.точки доступа:
Coolen, Marco J.L.; Cypionka, Heribert; Sass, Andrea M.; Sass, Henrik; Overmann, Jorg

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.07-04Б2.50

Aerobic and anaerobic methanotrophis in the Black Sea water column [Text] / Carsden J. Schubert [et al.] // Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 10. - P1844-1856 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Аэробные и анаэробные метанотрофы в водяном столбе Черного моря
Аннотация: Установлено, что аэр. метанотрофы типа I ответственны за окисление метана в оксическом водяном столбе и ANME-1 и ANME-2 - родственные организмы - за анаэр. окисление метана. Распространение метанотрофов типа I в аноксической зоне означает, что неактивные клетки поселяются в более глубоких водах. Молекулярные и биомаркерные рез-ты показывают, что существует четкое различие между распространением ANME-1 и ANME-2 - близкими линиями родства, т. е. первые ответственны за анаэр. окисление метана в водяном столбе 600 м глубиной, а вторые - за этот процесс в аноксическом водяном столбе 'ЭКВИВ'600 м глубиной

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: МЕТАНОТРОФНЫЕ БАКТЕРИИ
АЭРОБНЫЕ МЕТАНОТРОФЫ
АНАЭРОБНЫЕ МЕТАНОТРОФЫ
РАСПРОСТРАНЕНИЕ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ

Доп.точки доступа:
Schubert, Carsden J.; Coolen, Marco J.L.; Neretin, Le N.; Schippers, Axel; Abbas, Ben; Durisch-Kaiser, Edith; Wehrli, Bernhard; Hopmans, Ellen C.; Damste, Jaap S.Sinninghe; Wakeham, Stuart; Kuypers, Marcel M.M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 08.01-04Б3.136

Aerobic and anaerobic methanotrophis in the Black Sea water column [Text] / Carsden J. Schubert [et al.] // Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 10. - P1844-1856 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Аэробные и анаэробные метанотрофы в водяном столбе Черного моря
Аннотация: Установлено, что аэр. метанотрофы типа I ответственны за окисление метана в оксическом водяном столбе и ANME-1 и ANME-2 - родственные организмы - за анаэр. окисление метана. Распространение метанотрофов типа I в аноксической зоне означает, что неактивные клетки поселяются в более глубоких водах. Молекулярные и биомаркерные рез-ты показывают, что существует четкое различие между распространением ANME-1 и ANME-2 - близкими линиями родства, т. е. первые ответственны за анаэр. окисление метана в водяном столбе 600 м глубиной, а вторые - за этот процесс в аноксическом водяном столбе 'ЭКВИВ'600 м глубиной

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.21
Рубрики: МЕТАНОТРОФНЫЕ БАКТЕРИИ
АЭРОБНЫЕ МЕТАНОТРОФЫ
АНАЭРОБНЫЕ МЕТАНОТРОФЫ
РАСПРОСТРАНЕНИЕ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ

Доп.точки доступа:
Schubert, Carsden J.; Coolen, Marco J.L.; Neretin, Le N.; Schippers, Axel; Abbas, Ben; Durisch-Kaiser, Edith; Wehrli, Bernhard; Hopmans, Ellen C.; Damste, Jaap S.Sinninghe; Wakeham, Stuart; Kuypers, Marcel M.M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.06-04Б2.150

Coolen, Marco J. L.
217 000-year-old DNA sequences of green sulfur bacteria in Mediterranean sapropels and their implications for the reconstruction of the paleoenvironment [Text] / Marco J. L. Coolen, Jorg Overmann // Environ. Microbiol. - 2007. - Vol. 9, N 1. - P238-249 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Последовательности ДНК зеленых серных бактерий 217 000-летней давности в средиземноморских сапропелях и их применение для палеонтологических реконструкций
Аннотация: Глубоководные донные отложения восточного средиземноморья содержат множество органических богатых углеродом слоев, т. наз. сапропелей. В этих слоях обнаружен каротиноид изорениератен. Поскольку он специфичен для облигатно анаэробных фототрофных зеленых серных бактерий (ЗСБ), его присутствие может служить свидетельством существования обширных водяных столбов с аноксигенными условиями в древнем средиземмноморье. Для ЗСБ характерны три каротиноида (изорениератен, 'бета'-изорениератен и хлоробактен), к-рые, однако, не позволяют различить 'ЭКВИВ'80 известных филотипов. Чтобы сделать более детальную реконструкцию палеоэкологических условий, проведен поиск ископаемых последовательностей 16S рРНК ЗСБ с применением методологии, пригодной для древних ДНК. Из сапропелей 217 000-летней давности можно амплифицировать последовательности длиной 540 п. н. Такие последовательности были выделены и из бедных углеродом промежуточных слоев отложений, откладывающихся по времена, когда водные столбы были полностью кислородными. Неожиданным оказалось то, что все последовательности 16S рРНК группировались с пресноводными или солоноватыми, а не морскими типами ЗСБ. Возможно, молекулярные останки ЗСБ происходят из популяций, которые процветали в прилегающих районах или эстуариях на побережье, а не из пелагических популяций. Германия (J. Overmann), Section Microbiol., Ludwig-Maximilians-Univ. Munchen, D-80638 Munchen. E-mail: j.overmann@lrz.uni-muenchen.de. Fax: (+49)89 2180 6125

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.13 + 341.27.23.09
Рубрики: ЗЕЛЕНЫЕ СЕРНЫЕ БАКТЕРИИ
ДРЕВНИЕ САПРОПЕЛИ
ДНК
ВЫДЕЛЕНИЕ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
ДОННЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Overmann, Jorg

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 08.11-04А2.57

Variations in spatial and temporal distribution of Archaea in the North Sea in relation to environmental variables [Text] / Lydie Herfort [et al.] // FEMS Microbiol. Ecol. - 2007. - Vol. 62, N 3. - P242-257 . - ISSN 0168-6496
Перевод заглавия: Изменения в пространственном и временном распределении Archaea в Северном море в зависимости от изменений в окружающей среде
Аннотация: Изучали пространственное и временное распределение пелагических Archaea в юж. части Северного моря с помощью рРНК гибридизации, секвенирования и количественного определения 16S рРНК, анализа мембранных липидов и физ., хим. и биол. параметров окружающей среды, чтобы определить факторы, влияющие на биогеографию архей. Наблюдалась четкая временная изменчивость, причем морские Crenarchaeota (группа I. 1a) были относительно более многочисленны зимой, а Euryarchaeota доминировали в архейном сообществе весной и летом. Также были очевидны пространственные различия в латеральном распределении Crenarchaeota. В действительности их обилие положительно коррелировало с кол-вом копий гена, кодирующего 'альфа'-субъединицу аммоний-монооксигеназы кренархеот и с конц-иями аммиака, нитрата, нитрита и фосфора. Это означает, что большинство Crenarchaeota в Северном море - нитрификаторы, и что их распределение определяется конц-иями питательных компонентов. Однако, Crenarchaeota не были обильными, когда в большей части фитопланктона доминировали водоросли. Предполагается, что вместе с конц-ией питательных компонентов, биомасса фитопланктона и структура сообщества могут предсказать обилие кренархеот в юж. части Северного моря. Численность эвриархеот положительно коррелировала с конц-иями хлорофилла a, но не со структурой фитопланктонного сообщества. Так или иначе, это связано с возможностью Euryarchaota осуществлять аэробную аноксигенную фототрофию, но заметный сезонный тип распределения Crenarchaeota и Euryarchaeota означает, что они занимают различные экологические ниши. США, Environ. and Biomolecular Systems. OGI School of Sci. and Engineering, Oregon Health a. Sci. Univ., Beaverton, OR 97006. E-mail: Herfortl@ebs.ogi.edu

ГРНТИ	34.35.33

ВИНИТИ 341.35.33.37.37.33.11
Рубрики: CRENARCHAEOTA (ARCH.)
EURYARCHAEOTA (ARCH.)
ПРОСТРАНСТВЕННОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
СЕЗОННОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
МОРСКИЕ СРЕДЫ

Доп.точки доступа:
Herfort, Lydie; Schouten, Stefan; Abbas, Ben; Veldhuis, Marcel J.W.; Coolen, Marco J.L.; Wuchter, Cornelia; Boon, Jan P.; Herndl, Gerhard J.; Sinninghe, Damste Jaap S.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.11-04Б2.86

Variations in spatial and temporal distribution of Archaea in the North Sea in relation to environmental variables [Text] / Lydie Herfort [et al.] // FEMS Microbiol. Ecol. - 2007. - Vol. 62, N 3. - P242-257 . - ISSN 0168-6496
Перевод заглавия: Изменения в пространственном и временном распределении Archaea в Северном море в зависимости от изменений в окружающей среде
Аннотация: Изучали пространственное и временное распределение пелагических Archaea в юж. части Северного моря с помощью рРНК гибридизации, секвенирования и количественного определения 16S рРНК, анализа мембранных липидов и физ., хим. и биол. параметров окружающей среды, чтобы определить факторы, влияющие на биогеографию архей. Наблюдалась четкая временная изменчивость, причем морские Crenarchaeota (группа I. 1a) были относительно более многочисленны зимой, а Euryarchaeota доминировали в архейном сообществе весной и летом. Также были очевидны пространственные различия в латеральном распределении Crenarchaeota. В действительности их обилие положительно коррелировало с кол-вом копий гена, кодирующего 'альфа'-субъединицу аммоний-монооксигеназы кренархеот и с конц-иями аммиака, нитрата, нитрита и фосфора. Это означает, что большинство Crenarchaeota в Северном море - нитрификаторы, и что их распределение определяется конц-иями питательных компонентов. Однако, Crenarchaeota не были обильными, когда в большей части фитопланктона доминировали водоросли. Предполагается, что вместе с конц-ией питательных компонентов, биомасса фитопланктона и структура сообщества могут предсказать обилие кренархеот в юж. части Северного моря. Численность эвриархеот положительно коррелировала с конц-иями хлорофилла a, но не со структурой фитопланктонного сообщества. Так или иначе, это связано с возможностью Euryarchaota осуществлять аэробную аноксигенную фототрофию, но заметный сезонный тип распределения Crenarchaeota и Euryarchaeota означает, что они занимают различные экологические ниши. США, Environ. and Biomolecular Systems. OGI School of Sci. and Engineering, Oregon Health a. Sci. Univ., Beaverton, OR 97006. E-mail: Herfortl@ebs.ogi.edu

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: CRENARCHAEOTA (ARCH.)
EURYARCHAEOTA (ARCH.)
ПРОСТРАНСТВЕННОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
СЕЗОННОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
МОРСКИЕ СРЕДЫ

Доп.точки доступа:
Herfort, Lydie; Schouten, Stefan; Abbas, Ben; Veldhuis, Marcel J.W.; Coolen, Marco J.L.; Wuchter, Cornelia; Boon, Jan P.; Herndl, Gerhard J.; Sinninghe, Damste Jaap S.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.02-04Б2.124

Sources for sedimentary bacteriohopanepolyols as revealed by 16S rDNA stratigraphy [Text] / Marco J. L. Coolen [et al.] // Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 10, N 7. - P1783-1803 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Источники осадочных гопанеполиолов бактерий в сочетании со стратиграфией на основе 16S-рРНК
Аннотация: Бактериогапоноиды - это широко распространенные липидные биомаркеры в летописи осадков. Источниками этих липидов являются многие аэр. и анаэр. бактерии, но использование этих биомаркеров как показателей экологических изменений порой осложнено. Для уточняющего обследования биологических образцов гопанеполиолов бактерий (ГПБ) времен голоцена использовали анализ сохранившихся в осадках 16S рРНК. Обследование проводили в стратифицированных непрерывно накапливаемых сульфидных осадках послеледникового оз. Ace (в Антарктике). Анализировали набор сохранившихся ГПБ. Они обнаруживали разнообразие структурных форм, состав к-рых отличался по вертикали осадков, отражая изменения в популяциях бактерий, вызванных крупными изменениями в солености озера. Состав устойчивых изотопов в молекулах гопанолов, образовавшихся из ГПБ после их расщепления надйодной к-той, показал, что некоторые из низ были существенно обеднены по {13}C, что указывало на их метанотрофное происхождение. Используя чувствительные молекулярные приемы, показали, что метанотрофные бактерии I- и II-типа (соответственно Methylomonas и Methylocystis) были уникальны в кач-ве обитателей старейших из осадков этого озера (возраста 9400 лет). Количественный анализ законсервированных остатков ДНК показал, что метанотрофы I-типа, включая метанотрофов-симбионтов, обитавших на жабрах моллюсков из глубоководных холодных высачиваний метана, давали 35-аминоГПБ (т.е. аминопентол, -тетрол и -триолы). После отделения озера 'ЭКВИВ'3000 лет назад один представитель метанотрофов I-типа "метанотрофного кластера жаберных симбионтов" оставался наиболее вероятным источником аминотетрола и триола. В старейших из озерных осадков был обнаружен филотип Synechococcus, родственный пелагическим пресноводным штаммам. Очевидно, он и был источником метилированного ГПБ (2-Me-ГПБ). Заключается, что одновременное использование современных геохимических и палеогеномных подходов обогащает наши знания о биогехимических процессах, происходивших в голоцене в оз. Ace. Нидерланды, Dep. of Marine Orgnic Biogeochemistry, NIOZ Royal Netherlands Inst. for Sea Res., PO Box 59, 1790 AB Den Burg (Texel), (E-mail: mcoolen@whoi.edu)

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.13 + 341.27.23.09
Рубрики: ГАПОНЕПОЛИОЛЫ
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ГАПОНЕПОЛИОЛЫ ВРЕМЕН ГОЛОЦЕНА
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ
ОЗЕРА
ПОСЛЕЛЕДНИКОВОЕ ОЗЕРО
СУЛЬФИДНЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ
МЕТАНОТРОФНЫЕ БАКТЕРИИ
SYNECHOCOCCUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Coolen, Marco J.L.; Talbot, Helen M.; Abbas, Ben A.; Ward, Christopher; Shouten, Stefan; Volkman, John K.; Damste, Jaap S.Sinninghe

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 09.06-04Б3.158

Coolen, Marco J. L.
217 000-year-old DNA sequences of green sulfur bacteria in Mediterranean sapropels and their implications for the reconstruction of the paleoenvironment [Text] / Marco J. L. Coolen, Jorg Overmann // Environ. Microbiol. - 2007. - Vol. 9, N 1. - P238-249 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Последовательности ДНК зеленых серных бактерий 217 000-летней давности в средиземноморских сапропелях и их применение для палеонтологических реконструкций
Аннотация: Глубоководные донные отложения восточного средиземноморья содержат множество органических богатых углеродом слоев, т. наз. сапропелей. В этих слоях обнаружен каротиноид изорениератен. Поскольку он специфичен для облигатно анаэробных фототрофных зеленых серных бактерий (ЗСБ), его присутствие может служить свидетельством существования обширных водяных столбов с аноксигенными условиями в древнем средиземмноморье. Для ЗСБ характерны три каротиноида (изорениератен, 'бета'-изорениератен и хлоробактен), к-рые, однако, не позволяют различить 'ЭКВИВ'80 известных филотипов. Чтобы сделать более детальную реконструкцию палеоэкологических условий, проведен поиск ископаемых последовательностей 16S рРНК ЗСБ с применением методологии, пригодной для древних ДНК. Из сапропелей 217 000-летней давности можно амплифицировать последовательности длиной 540 п. н. Такие последовательности были выделены и из бедных углеродом промежуточных слоев отложений, откладывающихся по времена, когда водные столбы были полностью кислородными. Неожиданным оказалось то, что все последовательности 16S рРНК группировались с пресноводными или солоноватыми, а не морскими типами ЗСБ. Возможно, молекулярные останки ЗСБ происходят из популяций, которые процветали в прилегающих районах или эстуариях на побережье, а не из пелагических популяций. Германия (J. Overmann), Section Microbiol., Ludwig-Maximilians-Univ. Munchen, D-80638 Munchen. E-mail: j.overmann@lrz.uni-muenchen.de. Fax: (+49)89 2180 6125

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.23
Рубрики: ЗЕЛЕНЫЕ СЕРНЫЕ БАКТЕРИИ
ДРЕВНИЕ САПРОПЕЛИ
ДНК
ВЫДЕЛЕНИЕ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
ДОННЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Overmann, Jorg

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 13.08-04А2.23

Surce-specific variability in post-depositional DNA preservation with potential implications for DNA based paleoecological records [Text] / Arjan C. Boere [et al.] // Org. Geochem. - 2011. - Vol. 42, N 10. - P1216-1225 . - ISSN 0146-6380
Перевод заглавия: Связанная со специфичностью источника изменчивость сохранности пост-депозиционной ДНК в связи с потенциальным использованием в палеоэкологических исследованиях на базе ДНК
Аннотация: Сравнили степень сохранности ископаемой ДНК планктонных видов разного клеточного строения в 2700-летнем осадке в антарктическом фьорде Эллис. Объем сохранившихся малых субъединиц рибосомной ДНК (SSU-рДНК, 'ЭКВИВ'500 пар оснований) динофлагеллят (скорее внутриклеточной, чем внутрицистовой), поддающийся PCR-амплификации, снижался до 5 порядков величины с глубиной и возрастом осадка. В противоположность этому, сходным по размеру SSU рДНК диатомей (гл. обр. Chaetoceros) уменьшались лишь 10-кратно в ходе 2700-летнего отложения. Размер природно разрушаемых фрагментов, слишком малых для PCR-тестов, был наибольшим у динофлагеллят и наименьшим - у фотосинтезирующих зеленых сульфобактерий (GSB). Обсуждаются возможные причины изменчивости сохранности ДНК у разных групп планктона

ГРНТИ	34.35.33

ВИНИТИ 341.35.33.01.05
Рубрики: ДОННЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ
ВОЗРАСТ
ПЛАНКТОННЫЕ ОРГАНИЗМЫ
ДНК
СОХРАННОСТЬ
ПАЛЕОЭКОЛОГИЯ
ФЬОРД ЭЛЛИС
АНТАРКТИКА

Доп.точки доступа:
Boere, Arjan C.; Damste, Jaap S.Sinninghe; Rijpstra, W.Iren C.; Volkman, John K.; Coolen, Marco J.L.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 14.12-04А2.37

Evolution of the plankton paleome in the Black Sea from the Deglacial to Anthropocene [Text] / Marco J. L. Coolen [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2013. - Vol. 110, N 21. - P8609-8614 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Эволюция палеома планктона в Черном море от дегляциации до антропоцена
Аннотация: Для реконструкции состава планктона Черного моря за последние 11400 лет использованы остатки ДНК в донных отложениях. Из 2710 видов 150 реагировали на 4 стадии экол. изменений с позднего ледникового периода до голоцена. Около 9000 г. до н.э. имелись пресноводные водоросли, но присутствовали и неопределенные морские таксоны. На осолонение в середине голоцена сильно реагировали динофлагелляты, Cercozoa, Eustigmatophyceae и Haptophyta. Соленость быстро выросла примерно 5000 лет назад, после чего появились морские грибы и копеподы. Около 2500 лет назад некоторое опреснение привело к сукцессии динофлагеллят, диатомовых и хризофитов. США, Marine Chemistry and Geochemistry Dept., Woods Hole Oceanographic Inst., Woods Hole, MA 02543. E-mail:mcoolen@whol.edu. Ил.3. Библ. 48

ГРНТИ	34.35.33

ВИНИТИ 341.35.33.37.37.33.02
Рубрики: ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
МОРЯ
ПЛАНКТОН
ПАЛЕОРЕКОНСТРУКЦИИ

Доп.точки доступа:
Coolen, Marco J.L.; Orsi, William D.; Balkema, Cherel; Quince, Christopher; Harris, Keith; Sylva, Sean P.; Filipova-Marinova, Mariana; Giosan, Liviu

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI17) 15.03-04И1.53

Evolution of the plankton paleome in the Black Sea from the Deglacial to Anthropocene [Text] / Marco J. L. Coolen [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2013. - Vol. 110, N 21. - P8609-8614 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Эволюция палеома планктона в Черном море от дегляциации до антропоцена
Аннотация: Для реконструкции состава планктона Черного моря за последние 11400 лет использованы остатки ДНК в донных отложениях. Из 2710 видов 150 реагировали на 4 стадии экол. изменений с позднего ледникового периода до голоцена. Около 9000 г. до н.э. имелись пресноводные водоросли, но присутствовали и неопределенные морские таксоны. На осолонение в середине голоцена сильно реагировали динофлагелляты, Cercozoa, Eustigmatophyceae и Haptophyta. Соленость быстро выросла примерно 5000 лет назад, после чего появились морские грибы и копеподы. Около 2500 лет назад некоторое опреснение привело к сукцессии динофлагеллят, диатомовых и хризофитов. США, Marine Chemistry and Geochemistry Dept., Woods Hole Oceanographic Inst., Woods Hole, MA 02543. E-mail:mcoolen@whol.edu. Ил.3. Библ. 48

ГРНТИ	34.33.15

ВИНИТИ 341.33.15.02
Рубрики: ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
МОРЯ
ПЛАНКТОН
ПАЛЕОРЕКОНСТРУКЦИИ

Доп.точки доступа:
Coolen, Marco J.L.; Orsi, William D.; Balkema, Cherel; Quince, Christopher; Harris, Keith; Sylva, Sean P.; Filipova-Marinova, Mariana; Giosan, Liviu

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска