СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Bhasin, Manoj$<.>)

Общее количество найденных документов : 5
Показаны документы с 1 по 5

РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 05.11-04К1.54

Bhasin, Manoj.
Prediction of CTL epitopes using QM, SVM and ANN techniques? [Text] / Manoj Bhasin, G. P.S. Raghava // Vaccine. - 2004. - Vol. 22, N 23-24. - P3195-3204 . - ISSN 0264-410X
Перевод заглавия: Прогнозирование эпитопов для цитотоксических T-лимфоцитов с использованием технологий QM, SVM и ANN
Аннотация: Применили метод, основанный на количественном матриксе (QM), и техники машинного обучения, такие как Support Vector Machine (SVM) и Artificial Neural Network (ANN) для прогнозирования эпитопов для цитотоксических T-лимфоцитов (ЦТЛ), рестриктированных молекулами ГКГС класса I. Проанализировали 1137 экспериментально подтвержденных эпитопов ЦТЛ. Соответствие с QM, SVM и ANN составило 70,0, 72,2 и 75,2%, соответственно. Все использованные методы позволили дискриминировать между эпитопами и не эпитопами для ЦТЛ. Считают, что анализируемые методы использоваться для прогнозирования рестриктированных молекулами ГКГС класса I эпитопов для ЦТЛ. Индия, Inst. Microbial Technology, Chandrigarh. Библ. 34

ГРНТИ	34.43.29

ВИНИТИ 341.43.29.07
Рубрики: ЛИМФОЦИТЫ-T-ЦИТОТОКСИЧЕСКИЕ
МОЛЕКУЛЫ ГКГС КЛАССА I
ОЦЕНКА РАЗНЫМИ МЕТОДАМИ

Доп.точки доступа:
Raghava, G.P.S.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 06.02-04А3.560

Bhasin, Manoj.
PSLpred: Prediction of subcellular localization of bacterial proteins [Text] / Manoj Bhasin, Aarti Garg, G. P.S. Raghava // Bioinformatics. - 2005. - Vol. 21, N 10. - P2522-2524 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: PSLpred - сервер для предсказания внутриклеточной локализации бактериальных белков
Аннотация: Разработан сетевой сервер PSLpred (http://www.imtech.res.is), позволяющий предсказывать внутриклеточную локализацию бактериальных белков с общей точностью 91,2%. В PSLpred используется гибридный подход, объединяющий PSI-BLAST и три модуля SVM, и опирается на состав аминокислот, дипептидов и на физико-химические свойства. Предсказание цитоплазматических, внеклеточных белков, белков внутренней и наружной мембран и периплазматических белков имеет точность, соответственно, 90,7; 86,8; 90,3; 95,2 и 90,6%. Для 'ЭКВИВ'74% последовательностей точность предсказания достигала 98%. Запросы по адресу: raghava@imtech.res.in. Библ. 10

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: БЕЛОК
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ БЕЛКИ
ВНУТРИКЛЕТОЧНАЯ ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ПРЕДСКАЗАНИЕ
СЕТЕВОЙ СЕРВЕР PSLPRED
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Garg, Aarti; Raghava, G.P.S.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 06.07-04К1.51

Bhasin, Manoj.
Pcleavage: An SVM based method for prediction of consitiutive proteasome and immunoproteasome cleavage sites in antigenic sequences [Text] / Manoj Bhasin, G. P.S. Radhava // Nucl. Acids Res. - 2005. - Vol. 33, Web server issue. - PW202-W207 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Pcleavage. Метод, основанный на SVM, для прогноза конститутивных протеосомных и иммунопротеосомных сайтов расщепления в антигенных последовательностях
Аннотация: Дано описание нового метода, основанного на SVM (support vector machine), для прогноза конститутивных, а также иммунопротеосомных сайтов расщепления в антигенных последовательностях. Метод позволяет получить коэффициенты корреляции по Мэтью 0,54 и 0,43 по данным, полученным in vitro, и по лигандам главного комплекса гистосовместимости, соответственно, что совпадает с результативностью NetChop метода, который наиболее распространен в подобного рода исследованиях. На основании SVM метода разработан сетьевой сервер Pcleavage, который воспринимает белковые последовательности в стандартном формате и представляет результат в форме, пригодной для конкретной ситуации. Индия, Inst. Microbial. Technology, Chandigarh. Библ. 15

ГРНТИ	34.43.27

ВИНИТИ 341.43.27.15
Рубрики: АНТИГЕНЫ
МЕХАНИЗМЫ РАСЩЕПЛЕНИЯ
ОЦЕНКА
МАТЕМАТИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ

Доп.точки доступа:
Radhava, G.P.S.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 08.04-04К1.7

Bhasin, Manoj.
A hybrid approach for predicting promiscuous MHC class I restricted T cell epitopes [Text] / Manoj Bhasin, G. P.S. Raghava // J. Biosci. - 2007. - Vol. 32, N 1. - P31-42 . - ISSN 0250-5991
Перевод заглавия: Гибридный подход к предсказанию случайно распределенных Т-клеточных эпитопов, ограниченных по генам ГКГС класса I
Аннотация: Авт. разработали новый метод к предсказанию Т-клеточных эпитопов, ограниченных по генам ГКГС класса I путем комбинирования двух известных подходов - методов количественной матрицы и искусственной нейронной сети. Это позволило предсказать эпитопы для 67 аллелей ГКГС-I (ранее - для 47 аллелей), повысив точность предсказания на 6%. Результаты предсказания были проверены слепым методом на независимых данных; точность предсказания составила 92,8%. Метод позволил определять локализацию протеасомных разрывов и локализовать эпитопы в С-концевой части молекулы. Гибридный метод предсказания Т-эпитопов в настоящее время является наиболее эффективным. Индия, Inst. Microbial Technol., Chandighharh. Библ. 32

ГРНТИ	34.43.01

ВИНИТИ 341.43.01.77
Рубрики: ГКГС
КЛАСС I
АЛЛЕЛИ
РЕСТРИКЦИЯ
АНТИГЕНЫ
Т-КЛЕТОЧНЫЕ ЭПИТОПЫ
ПРЕДСКАЗАНИЕ
ГИБРИДНЫЙ МЕТОД
ЭФФЕКТИВНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Raghava, G.P.S.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI23) 14.08-04М2.104

Preliminary biomarkers for identification of human ascending thoracic aortic aneurysm [Text] / Kendra M. Black [et al.] // J. Amer. Heart Assoc. - 2013. - Vol. 2, N 6. - Pe000138 . - ISSN 2047-9980
Перевод заглавия: Предварительное исследование биомаркеров для идентификации аневризм восходящей грудной аорты (АВГА) человека
Аннотация: С помощью протеомного анализа в цельной крови (ПЦР в реальном времени) выявляли биомаркеры АВГА. Идентифицированы 3 транскрипционных маркера, повышенная экспрессия к-рых позволяла выявить 79,4% боьных с АВГА. Их чувствительность составляла 79%, а специфичность 100%

ГРНТИ	34.39.27

ВИНИТИ 341.39.27.07.47
Рубрики: КРОВЬ
БИОМАРКЕРЫ
АОРТА
АНЕВРИЗМЫ

Доп.точки доступа:
Black, Kendra M.; Masuzawa, Akihiro; Hagberg, Robert C.; Khabbaz, Kamal R.; Trovato, Mary E.; Rettagliati, Verna M.; Bhasin, Manoj K.; Dillon, Simon T.; Libermann, Towia A.; Toumpoulis, Ioannis K.; Levitsky, Sidney; McCully, James D.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска