Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>A=Beja, Oded$<.>)
Общее количество найденных документов : 10
Показаны документы с 1 по 10
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI50) 95.01-04И2.029

    Beja, Oded.
    Karyotype analysis of the monogenetic trypanosomatid Leptomonas collosoma [Text] / Oded Beja, Dov Schwartz, Shulamit Michaeli // Mol. and Biochem. Parasitol. - 1994. - Vol. 66, N 1. - P71-81 . - ISSN 0166-6851
Перевод заглавия: Анализ кариотипа моногенетической трипаносоматиды Leptomonas collosoma
Аннотация: Осуществлен анализ кариотипа L. collosoma, основанный на выделении хромосом этого жгутиконосца посредством модифицированного метода гель-ЭФ в 1%-ной агарозе (система CHEF-DR11 фирмы Bio-Rad). Выявлены участки хромосом, соответствующие генам, кодирующим 5 РНК (SL, U6, 5S, 7SL и rRNA), а также 2 генам, кодирующим протеины HSP83 и 'альфа'-тубулин. Все эти гены локализованы, по меньшей мере, в 2 хромосомах, размеры к-рых отличаются друг от друга в пределах 100-500 кб, что свидетельствует о диплоидности изучаемого организма. Суммарные размеры выделенных хромосом составили приблизительно 62 мб, в то время как размер генома L. collosoma был оценен приблизительно в 80 мб. В связи с этим предполагается, что некоторые из гомологичных хромосом могут отличаться друг от друга по своим размерам. Проведенный анализ облегчает изучение функций отдельных генов, а также оценку генетической стабильности организма. Израиль, Dept. Membrane Res. and Biophysics, The Weizmann Inst. Sci., Rehovot 76100. Библ. 45.
ГРНТИ  
34.33.23
ВИНИТИ 341.33.23.15.13.99.02
Рубрики: LEPTOMONAS COLLOSOMA (PROT.)
ГЕНЫ
ХРОМОСОМЫ
КАРИОТИПЫ
СТРУКТУРА
РАЗМЕРЫ

Доп.точки доступа:
Schwartz, Dov; Michaeli, Shulamit
2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 03.04-04А2.41

   
    Unsuspected diversity among marine aerobic anoxygenic phototrophs [Text] / Oded Beja [et al.] // Nature. - 2002. - Vol. 415, N 6872. - P630-633 . - ISSN 0028-0836
Перевод заглавия: Неучтенное разнообразие среди морских аэробных аноксигенных фототрофов
Аннотация: Аэробные аноксигенные фототрофные бактерии, содержащие бактериохлорофилл a(Bcla) требуют кислород как для роста, так и для синтеза Bcla. Эти бактерии широко распространены в морском планктоне, они отвечают за 5% океанского поверхностного фотосинтеза и составляют 11% всего микробного сообщества. Планктонные аноксигенные фототрофы относили к немногочисленным группам внутри 'альфа'-подкласса протеобактерий (Proteobacteria). В данной работе провели филогенетический геномный анализ содержания генов фотосинтеза и организации оперона в природных морских бактериях. Эти кластеры генов фотосинтеза включали некоторые ранее не наблюдаемые в морской среде гены, похожие на таковые у протеобактерий 'бета'-подкласса. Эти гены фотосинтеза были широко распространены в морском планктоне и активно экспрессировались, свидетельствуя о способности к фотосинтезу у вновь идентифицированных фототрофов. Таким, образом, планктонные бактериальные сообщества не являются однородными, а содержат много фотосинтетически активных бактериальных групп, включая некоторые не относящиеся к известным и культивируемым типам. США, Monterey Bay Aquarium Research Inst., Moss Landing, California 95039-0628. Библ. 25
ГРНТИ  
34.35.33
ВИНИТИ 341.35.33.37.37.33.11
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ ФОТОСИНТЕЗА
КЛАСТЕРЫ ГЕНОВ
ОПЕРОНЫ
ПРОТОТРОФЫ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ ГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ
ПЛАНКТОННЫЕ БАКТЕРИАЛЬНЫЕ СООБЩЕСТВА
PROTEOBACTERIA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Beja, Oded; Suzuki, Marcelino T.; Heidelberg, John F.; Nelson, William C.; Preston, Christina M.; Hamada, Tohru; Eisen, Jonathan A.; Fraser, Claire M.; DeLong, Edward F.
3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.04-04Б2.140

   
    Unsuspected diversity among marine aerobic anoxygenic phototrophs [Text] / Oded Beja [et al.] // Nature. - 2002. - Vol. 415, N 6872. - P630-633 . - ISSN 0028-0836
Перевод заглавия: Неучтенное разнообразие среди морских аэробных аноксигенных прототрофов
Аннотация: Аэробные аноксигенные прототрофные бактерии, содержащие бактериохлорофилл a(Bcla) требуют кислород как для роста, так и для синтеза Bcla. Эти бактерии широко распространены в морском планктоне, они отвечают за 5% океанского поверхностного фотосинтеза и составляют 11% всего микробного сообщества. Планктонные аноксигенные прототрофы относили к немногочисленным группам внутри 'альфа'-подкласса протеобактерий (Proteobacteria). В данной работе провели филогенетический геномный анализ содержания генов фотосинтеза и организации оперона в природных морских бактериях. Эти кластеры генов фотосинтеза включали некоторые ранее не наблюдаемые в морской среде гены, похожие на таковые у протеобактерий 'бета'-подкласса. Эти гены фотосинтеза были широко распространены в морском планктоне и активно экспрессировались, свидетельствуя о способности к фотосинтезу у вновь идентифицированных прототрофов. Таким, образом, планктонные бактериальные сообщества не являются однородными, а содержат много фотосинтетически активных бактериальных групп, включая некоторые не относящиеся к известным и культивируемым типам. США, Monterey Bay Aquarium Research Inst., Moss Landing, California 95039-0628. Библ. 25
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ ФОТОСИНТЕЗА
КЛАСТЕРЫ ГЕНОВ
ОПЕРОНЫ
ПРОТОТРОФЫ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ ГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ
ПЛАНКТОННЫЕ БАКТЕРИАЛЬНЫЕ СООБЩЕСТВА
PROTEOBACTERIA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Beja, Oded; Suzuki, Marcelino T.; Heidelberg, John F.; Nelson, William C.; Preston, Christina M.; Hamada, Tohru; Eisen, Jonathan A.; Fraser, Claire M.; DeLong, Edward F.
4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.08-04Б2.78

   
    Isolation and characterization of Erythrobacter sp. strains from the upper ocean [Text] / Michal Koblizek [et al.] // Arch. Microbiol. - 2003. - Vol. 180, N 5. - P327-338 . - ISSN 0302-8933
Перевод заглавия: Выделение и свойства штаммов Erythrobacter sp. из верхних слоев океана
Аннотация: Было выделено 7 штаммов морских аэробных аноксигенных фототрофов, принадлежащих к роду Erythrobacter. Изучены их физиологические и биохимические свойства. Определены последовательности генов 16S-рДНК и pufM, морфологические особенности, субстратная специфичность, состав пигментов и липидов. Все штаммы обладали функциональными реакционными центрами типа 2, содержащими бактериохлорофилл a, включенный в светопоглощающий комплекс 1, осуществляющий фотосинтез. Штаммы содержали большой набор каротиноидов, но лишь некоторые из них переносили энергию к реакционным центрам. Все изоляты были факультативными фотогетеротрофами. Для роста им были необходимы органические C-субстраты. Кроме того, значительная часть их обменных потребностей обеспечивалась фотосинтезом
ГРНТИ  
34.27.23
ВИНИТИ 341.27.23.09 + 341.27.17.09.07.07.07
Рубрики: ERYTHROBACTER (BACT.)
ФАКУЛЬТАТИВНЫЕ ФОТОГЕТЕРОТРОФЫ
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ОКЕАНИЧЕСКОЙ СРЕДЫ
ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ
ФОТОСИНТЕЗ

Доп.точки доступа:
Koblizek, Michal; Beja, Oded; Bidigare, Robert R.; Christensen, Stephanie; Benitez-Nelson, Bryan; Vetriani, Costantino; Kolber, Marcin K.; Falkowski, Paul G.; Kolber, Zbigniew S.
5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 05.11-04Б3.180

   
    Isolation and characterization of Erythrobacter sp. strains from the upper ocean [Text] / Michal Koblizek [et al.] // Arch. Microbiol. - 2003. - Vol. 180, N 5. - P327-338 . - ISSN 0302-8933
Перевод заглавия: Выделение и свойства штаммов Erythrobacter sp. из верхних слоев океана
Аннотация: Было выделено 7 штаммов морских аэробных аноксигенных фототрофов, принадлежащих к роду Erythrobacter. Изучены их физиологические и биохимические свойства. Определены последовательности генов 16S-рДНК и pufM, морфологические особенности, субстратная специфичность, состав пигментов и липидов. Все штаммы обладали функциональными реакционными центрами типа 2, содержащими бактериохлорофилл a, включенный в светопоглощающий комплекс 1, осуществляющий фотосинтез. Штаммы содержали большой набор каротиноидов, но лишь некоторые из них переносили энергию к реакционным центрам. Все изоляты были факультативными фотогетеротрофами. Для роста им были необходимы органические C-субстраты. Кроме того, значительная часть их обменных потребностей обеспечивалась фотосинтезом
ГРНТИ  
34.27.39
ВИНИТИ 341.27.39.21
Рубрики: ERYTHROBACTER (BACT.)
ФАКУЛЬТАТИВНЫЕ ФОТОГЕТЕРОТРОФЫ
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ОКЕАНИЧЕСКОЙ СРЕДЫ
ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ
ФОТОСИНТЕЗ

Доп.точки доступа:
Koblizek, Michal; Beja, Oded; Bidigare, Robert R.; Christensen, Stephanie; Benitez-Nelson, Bryan; Vetriani, Costantino; Kolber, Marcin K.; Falkowski, Paul G.; Kolber, Zbigniew S.
6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.10-04Б2.260

    Yutin, Natalya.
    Putative novel photosynthetic reaction centre organizations in marine aerobic anoxygenic photosynthetic bacteria: Insights from metagenomics and environmental genomics [Text] / Natalya Yutin, Oded Beja // Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 7, N 12. - P2027-2033 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Предполагаемые новые [варианты] организации фотосинтетических реакционных центров у морских аэробных аноксигенных фотосинтетических бактерий: предсказания исходя из метагеномики и естественной геномики
Аннотация: Фотосинтетические коровые комплексы аноксигенных бактерий состоят из реакционных центров, окруженных свето-собирающими комплексами. Структурные белки фотосинтетических комплексов закодированы в опероне puf. У морских аэробных аноксигенных фотосинтезирующих бактерий обнаружена отличная от известных организация оперона puf, следствием чего могут быть различия и в структуре коровых комплексов. В геномах этих бактерий в составе оперона puf следом за геном pufM обнаружено еще несколько генов, названные гены pufX. Ранее гены pufX были обнаружены в штаммах Rhodobacter, осуществляющих анаэробный фотосинтез. Филогенетический анализ белков PufM культивируемых и некультивируемых бактерий показал, что PufM из оперонов, содержащих новые гены pufX группируются со штаммами Rhodobacter, а не со штаммами Roseobacter. Израиль, Dep. Biol., Technion-Israel Inst. Technology, Haifa 32000
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ФОТОСИНТЕЗ
ФОТОСИНТЕТИЧЕСКИЕ КОМПЛЕКСЫ
РЕАКЦИОННЫЕ ЦЕНТРЫ
ГЕНЫ
PUF ОПЕРОН
ОРГАНИЗАЦИЯ
ГЕНОМИКА
RHODOBACTER (BACT.)

Доп.точки доступа:
Beja, Oded
7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.11-04Б2.103

   
    Molecular diversity among marine picophytoplankton as revealed by psbA analyses [Text] / Gil Zeidner [et al.] // Environ. Microbiol. - 2003. - Vol. 5, N 3. - P212-216 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Молекулярное разнообразие среди морского пикофитопланктона по данным анализа psbA
Аннотация: Сообщается о молекулярном анализе консервативного фотосинтетического гена psbA (кодирующего белок D1 реакционного центра фотосистемы II) в кач-ве индикатора разнообразия морского оксигенного пикофитопланктона в природной среде. Гены psbA оказались хорошими индикаторами широкого разнообразия фотосинтетических морских групп микроорганизмов, включая новые группы цианобактерий и эукариотических водорослей. С применением библиотек бактериальных искусственных хромосом удалось найти корреляции генов psbA с рРНК малой субъединицы и, следовательно, подтвердить филогенетическую принадлежность
ГРНТИ  
34.27.23
ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: ПИКОФИТОПЛАНКТОН
МОРСКОЙ ПИКОФИТОПЛАНКТОН
МОЛЕКУЛЯРНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ
ГЕНЫ
PSBA
ФОТОСИНТЕЗИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Zeidner, Gil; Preston, Christina M.; DeLong, Edward F.; Massana, Ramon; Post, Anton F.; Scanlan, David J.; Beja, Oded
8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.02-04Б2.68

   
    Different SAR86 subgroups harbour divergent proteorhodopsins [Text] / Gazalah Sabehi [et al.] // Environ. Microbiol. - 2004. - Vol. 6, N 9. - P903-910 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Различные подгруппы SAR86, имеющие дивергентные протеородопсины
Аннотация: Протеородопсины (ПР) - бактериальные фотоактивные протонные помпы - изначально обнаружены у некультивируемых морских 'гамма'-протеобактерий группы SAR86, а позднее - и у 'альфа'-протеобактерий. Сообщается об анализе больших фрагментов генома различных подгрупп группы SAR86, выделенных из природных популяций бактериопланктона прибрежных вод Красного моря и открытых вод Тихого океана. Сравнение последовательностей было выполнено на больших искусственных бактериальных хромосомах, несущих гены рРНК и ПР и полученных из различных подгрупп SAR86. Рез-ты анализа указывают на присутствие различных типов последовательностей внутри одной и той же подгруппы рРНК SAR86. Данные свидетельствуют о том, что распределение особых типов ПР необязательно коррелирует с филогенетическим родством, установленным по высоко консервативным генам (рРНК). Дальнейший анализ районов генома, фланкирующих ПР, обнаружил потенциальные пути синтеза ретиналя - хромофора ПР, необходимого для образования функционально активного белка
ГРНТИ  
34.27.23
ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: ПРОТЕОРОДОПСИНЫ
ОБНАРУЖЕНИЕ
'ГАММА'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
ГРУППА SAR86
ФРАГМЕНТЫ ГЕНОМА
БАКТЕРИОПЛАНКТОН
МОРЯ

Доп.точки доступа:
Sabehi, Gazalah; Beja, Oded; Suzuki, Marcelino T.; Preston, Christina M.; DeLong, Edward F.
9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.06-04Б2.41

   
    Novel proteorhodopsin variants from the Mediterranean and Red Seas [Text] / Gazalah Sabehi [et al.] // Environ. Microbiol. - 2003. - Vol. 5, N 10. - P842-849 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Новые варианты протеородопсина из Средиземного и Красного морей
Аннотация: Протеородопсины (I), распространенные ретинилиденовые фотоактивные протонные насосы, были недавно обнаружены в широко распространенной некультивируемой бактериальной группе SAR 86 в поверхностных океанических водах. Чтобы изучить разнообразие I, были получены дегенеративные наборы праймеров I на основании геномной последовательности I, берущей начало из космидной библиотеки Антарктики. Новые варианты I были идентифицированы в образцах из Красного моря, к-рые были больше всего похожи на первоначальные, адсорбирующие зеленый свет I, обнаруженные в заливе Монтерей в Калифорнии. В отличие от I, адсорбирующих зеленый свет, однако, эти новые варианты содержали глутаминовый остаток в положении 105, тот же самый сайт, к-рый, как недавно установлено, контролирует спектральную настройку в I, встречающихся в природе. Различные варианты I были также найдены в Средиземном море. Эти I формировали новые и отличающиеся группы I. Филогенетические анализы показали, что некоторые новые варианты очень отличались от ранее описанных I и формировали рано эволюционно ответвившиеся группы, обнаруженные пока среди морских I. Существование этих варьирующих последовательностей I предполагает, что этот класс белков подвергся существенной эволюции. Эти варианты могут представлять функционально дивергентные паралогичные гены, полученные от одних и тех же или похожих видов, или ортологичные I, к-рые распространены среди дивергентных планктонных микробных таксонов
ГРНТИ  
34.27.23
ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: ПРОТЕОРОДОПСИНЫ
ОБНАРУЖЕНИЕ
НЕКУЛЬТИВИРУЕМАЯ БАКТЕРИАЛЬНАЯ ГРУППА SAR 86
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
ПОВЕРХНОСТНЫЕ ОКЕАНИЧЕСКИЕ ВОДЫ
ПРОТОННЫЕ НАСОСЫ
БЕЛКОВАЯ ПРИРОДА
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

Доп.точки доступа:
Sabehi, Gazalah; Massana, Ramon; Bielawski, Joseph P.; Rosenberg, Mira; DeLong, Edward F.; Beja, Oded
10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.09-04Б2.116

   
    Assessing diversity and biogeography of aerobic anoxygenic phototrophic bacteria in surface waters of the Atlantic and Pacific Oceans using the Global Ocean Sampling expedition metagenomes [Text] / Natalya Yutin [et al.] // Environ. Microbiol. - 2007. - Vol. 9, N 6. - P1464-1475 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Оценка разнообразия и биогеографии аэробных аноксигенных фототрофных бактерий в поверхностных водах Атлантического и Тихого океанов используя метагеномы глобальной океанической экспедиции проб
Аннотация: Предполагается, что аэробные аноксигенные фототрофные бактерии (ААФБ) играю значительную роль в глобальных океанических круговоротах углерода и энергии. Однако обилие, пространственное распределение, разнообразие и потенциальное экологическое значение этих микроорганизмов до сих пор мало понятны. В работе представлены метагеномные данные из глобальной океанической экспедиции, свидетельствующие о том, что в разных районах океана ААФБ распространены неравномерно. Более того, сообщества с ААФБ в прибрежных водах и в открытом океане существенно различаются. Полученные рез-ты согласуются с предположением, что популяции морских ААФБ являются сложными и динамическими структурами, составляющими важную фракцию в сообществах бактериопланктона в различных участках океана. Израиль, Israel Inst. of Technology, Haifa 32000. E-mail: suzuki@cbl.umces.edu
ГРНТИ  
34.27.23
ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: ФОТОТРОФНЫЕ БАКТЕРИИ
АЭРОБНЫЕ АНОКСИГЕННЫЕ ФОТОТРОФЫ
РАЗНООБРАЗИЕ
УЧАСТИЕ В ГЛОБАЛЬНОМ КРУГОВОРОТЕ УГЛЕРОДА
МЕТАГЕНОМНЫЕ ДАННЫЕ
ДИНАМИКА СТРУКТУР
ОКЕАНЫ
ПОВЕРХНОСТНЫЕ ВОДЫ

Доп.точки доступа:
Yutin, Natalya; Suzuki, Marcelino T.; Teeling, Hanno; Weber, Marc; Venter, J.Craig; Rusch, Douglas B.; Beja, Oded
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)