СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=CTNDOT<.>)

Общее количество найденных документов : 5
Показаны документы с 1 по 5

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.07-04Б2.238

Identification of genes required for excision of CTnDOT, a Bacteroides conjugative transposon [Text] / Qi Cheng [et al.] // Mol. Microbiol. - 2001. - Vol. 41, N 3. - P625-632 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Идентификация генов, необходимых для эксцизии CTnDOT, конъюгативного транспозона Bacteroides
Аннотация: Идентифицирован ген exc, необходимый для эксцизии (ЭК) конъюгативного транспозона CTnDOT Bacteroides. Ген int CTnDOT входит в семейство рекомбиназ, как и интеграза грамположительного конъюгативного транспозона Tn916. Ген exc локализован на 155 т. п. н. от гена int, расположенного на конце элемента 65 т. п. н. Ген exc вместе с регуляторными генами rteA, rteB и rteC необходимы для ЭК мини-формы CTnDOT, которая содержит только концы элемента и ген int. Др. открытая рамка того же оперона, расположенная выше exc, orf3, не важна для ЭК и не имеет значительного сходства с аминокислотными последовательностями белков, представленных в базах данных. Выведенная аминокислотная последовательность белка CTnDOT Exc сходна с последовательностями топоизомераз. Небольшая рамка, orf2, способная кодировать небольшой основной белок, сходный с белками Xis лямбда и Tn916, локализована сразу после гена int CtnDOT. Несмотря на сходство с белком Xis, orf2 не влияет на ЭК этого элемента. ЭК CTnDOT не зависит от места его интеграции, что также отличает его от Tn916. Т. обр., система ЭК CTnDOT Bacteroides отличается от систем др. транспозируемых элементов, включая транспозоны Bacteroides, мобилизуемые CTnDOT. США, Dep. Microbiol., Univ. Illinois, Urbana, IL 61801. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ТРАНСПОЗОНЫ
КОНЪЮГАТИВНЫЙ ТРАНСПОЗОН CTNDOT
ЭКСЦИЗИЯ
ГЕНЫ
ГЕН EXC
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
BACTEROIDES (BACT.)

Доп.точки доступа:
Cheng, Qi; Sutanto, Yuri; Shoemaker, Nadja B.; Gardner, Jeffrey; Salyers, Abigail A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.09-04Б2.108

Development of an in vitro integration assay for the Bacteroides conjugative transposon CTnDOT [Text] / Qi Cheng [et al.] // J. Bacteriol. - 2002. - Vol. 184, N 17. - P4829-4837 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Разработка in vitro методов интеграции для конъюгативного транспозона CTnDOT Bacteroides
Аннотация: Интегрированные самоперемещающиеся элементы, называемые конъюгативными транспозонами (CTns), отвечают за перенос генов устойчивости к антибиотикам во многих видах бактерий. Один из наиболее охарактеризованных элементов - Baсteroides CTnDOT. Разработали систему in vitro, в которой плазмида, несущая присоединившиеся концы CTnDOT, интегрируется в плазмиду, несущую сайт-мишень для CTnDOT. Для этого клонировали His-меченую версию гена интегразы и показали его активность in vivo. Белок очистили и добавили в реакционную смесь, содержащую присоединившиеся концы кольцевой формы CTnDOT и плазмиду, несущую сайт-мишень. Продемонстрировали интеграцию, которая стимулировалась экстрактом Bacteroides или очищенным фактором интеграции E. coli. Полученные результаты привели к заключению, что именно кольцевая форма CTnDOT интегрируется в сайт-мишень, а факторы хозяина участвуют в процессе интеграции. США, Dep. of Microbiology, Univ. of Illinois, Urbana, Illinois 61801. Библ. 25

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: ТРАНСПОЗОНЫ
КОНЪЮГАТИВНЫЕ
CTNS
CTNDOT
ИНТЕГРАЦИЯ
ПЛАЗМИДА
САЙТ-МИШЕНЬ
ГЕН ИНТЕГРАЗЫ
BACTEROIDES

Доп.точки доступа:
Cheng, Qi; Wesslund, Neil; Shoemaker, Nadja B.; Salyers, Abigail A.; Gardner, Jeffrey F.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.10-04Б2.212

Characterization of Exc, a novel protein required for the excision of Bacteroides conjugative transposon [Text] / Yuri Sutanto [et al.] // Mol. Microbiol. - 2002. - Vol. 46, N 5. - P1239-1246 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Характеристика Exc, нового белка, необходимого для эксцизии конъюгативного транспозона Bacteroides
Аннотация: Недавно показали, что ген exc необходим для эксцизии конъюгативного транспозона Bacteroides CTnDOT из хромосомы. Укороченная аминокислотная последовательность Exc имела небольшое сходство с ДНК-топоизомеразой III, ферментом релаксации суперспирали ДНК. Возник вопрос, является ли белок Exc топоизомеразой, или топоизомеразная активность участвует в процессе эксцизии. В данной работе показали, что белок Exc не имеет топоизомеразной активности in vitro. Exc релаксирует суперскрученную ДНК, содержит консервативный тирозин в активном сайте и нуждается в ионах магния для релаксационной активности. Мутация в каталитическом тирозине Exc приводила к утрате способности к релаксации in vitro, но не меняла способность белка к эксцизии in vivo. Результат свидетельствует, что эксцизия CTnDOT не связана с топоизомеразной активностью Exc in vivo. США, Dep. of Microbiology, Univ. of Illinois, Urbana, Illinois 61801. Библ. 31

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: ТРАНСПОЗОНЫ
КОНЪЮГАТИВНЫЙ CTNDOT
ЭКСЦИЗИЯ
ХРОМОСОМА
ГЕНЫ
ГЕН ЭКСЦИЗИИ EXC
ФУНКЦИИ
БЕЛОК
БЕЛОК EXC
ТОПОИЗОМЕРАЗНАЯ АКТИВНОСТЬ IN VIVO
ОТСУТСТВИЕ
BACTEROIDES (BACT.)

Доп.точки доступа:
Sutanto, Yuri; Shoemaker, Nadja B.; Gardner, Jeffrey F.; Salyers, Abigail A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.10-04Б4.40

Characterization of Exc, a novel protein required for the excision of Bacteroides conjugative transposon [Text] / Yuri Sutanto [et al.] // Mol. Microbiol. - 2002. - Vol. 46, N 5. - P1239-1246 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Характеристика Exc, нового белка, необходимого для эксцизии конъюгативного транспозона Bacteroides
Аннотация: Недавно показали, что ген exc необходим для эксцизии конъюгативного транспозона Bacteroides CTnDOT из хромосомы. Укороченная аминокислотная последовательность Exc имела небольшое сходство с ДНК-топоизомеразой III, ферментом релаксации суперспирали ДНК. Возник вопрос, является ли белок Exc топоизомеразой, или топоизомеразная активность участвует в процессе эксцизии. В данной работе показали, что белок Exc не имеет топоизомеразной активности in vitro. Exc релаксирует суперскрученную ДНК, содержит консервативный тирозин в активном сайте и нуждается в ионах магния для релаксационной активности. Мутация в каталитическом тирозине Exc приводила к утрате способности к релаксации in vitro, но не меняла способность белка к эксцизии in vivo. Результат свидетельствует, что эксцизия CTnDOT не связана с топоизомеразной активностью Exc in vivo. США, Dep. of Microbiology, Univ. of Illinois, Urbana, Illinois 61801. Библ. 31

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.11
Рубрики: ТРАНСПОЗОНЫ
КОНЪЮГАТИВНЫЙ CTNDOT
ЭКСЦИЗИЯ
ХРОМОСОМА
ГЕНЫ
ГЕН ЭКСЦИЗИИ EXC
ФУНКЦИИ
БЕЛОК
БЕЛОК EXC
ТОПОИЗОМЕРАЗНАЯ АКТИВНОСТЬ IN VIVO
ОТСУТСТВИЕ
BACTEROIDES (BACT.)

Доп.точки доступа:
Sutanto, Yuri; Shoemaker, Nadja B.; Gardner, Jeffrey F.; Salyers, Abigail A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.05-04Б2.199

DiChiara, Jeanne M.
In vitro analysis of sequence requirements for the excision reaction of the Bacteroides conjugative transposon, CTnDOT [Text] / Jeanne M. DiChiara, Abigail A. Salyers, Jeffrey F. Gardner // Mol. Microbiol. - 2005. - Vol. 56, N 4. - P1035-1048 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Анализ in vitro последовательностей, необходимых для эксцизии конъюгативного транспозона Bacteroides CTnDOT
Аннотация: Конъюгативный транспозон Bacteroides CTnDOT (CTn) инициирует свой перенос путем эксцизии для образования кольцевых интермедиатов. Показали, что этот процесс включает необычные интермедиаты ДНК с коротким районом гетерологии и несколькими CTn-кодируемыми белками. С помощью вновь разработанного эксцизионного метода in vitro локализовали сайты attL на концах интегративного элемента, размером 153 п. н., и attR, размером 179 п. н. Эксцизия CTnDOT включает надрезы, продуцирующие 5 п. н. последовательности на конце CTn, образующие район гетерологии в эксцизионном кольцевом интермедиате. Сайт - направленный мутагенез удаляет районы гетерологии, не влияя на эксцизию. Таким образом, гетерология не имеет существенного значения. Выявили 6 п. н. сайт в attR, который важен для эксцизии. Мутации в аналогичном районе attL не влияли на эксцизию. Район внутри attL, необходимый для эксцизии, выявили при помощи введения малых инсерций, накладывающихся на взаимодействия белков и ДНК. Подобные инсерции в attR не оказывали значительного влияния на эксцизию. Полученные результаты поддерживают гипотезу, что реакция эксцизии CTnDOT ассиметрична в отношении сайта связывания белков и вовлекает множественные взаимодействия белок-ДНК. США, Dep. of Microbiol., Univ. of Illinois, Urbana, IL 61801. Библ. 29

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: ТРАНСПОЗОНЫ
ТРАНСПОЗОН CTNDOT
ХАРАКТЕРИСТИКА
ИНТЕГРАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
САЙТЫ ИНТЕГРАЦИИ ATTL, ATTR
СТРУКТУРА
ФУНКЦИИ
BACTEROIDES (BACT.)

Доп.точки доступа:
Salyers, Abigail A.; Gardner, Jeffrey F.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска